Heatmap: Cluster_292 (HCCA cluster)

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(Showing raw values)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g007260.3.1 (Solyc01g007260.3)
4.95 4.5 5.16 2.63 5.56 3.23 0.8 0.9 1.57 3.49 2.88 1.93 0.85 0.26 2.78 2.73 2.84 0.0 0.0 0.09 0.37 1.06 0.88 0.88 0.55 0.07 1.17 0.63 0.24 1.32 1.45 1.51 0.31 12.09
Solyc01g068250.2.1 (Solyc01g068250.2)
8.41 3.8 6.27 3.58 4.26 2.19 2.27 7.07 8.48 2.22 2.41 3.16 0.47 1.9 1.2 0.29 0.26 0.0 0.0 0.5 0.84 2.79 6.07 3.38 1.42 0.1 10.03 4.28 2.05 3.78 6.42 1.95 0.42 16.21
Solyc01g079130.2.1 (Solyc01g079130.2)
4.63 1.81 29.64 2.91 0.29 0.01 0.04 0.06 12.68 1.41 0.01 0.03 0.01 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.02 0.17 0.04 0.0 0.33 0.51 0.22 0.36 0.41 0.15 0.01 4.2
Solyc01g080580.3.1 (Solyc01g080580.3)
5.07 0.0 0.63 0.0 18.52 2.66 9.41 4.15 1.21 1.0 0.31 0.34 0.89 0.13 0.84 0.24 0.26 0.0 0.0 0.05 0.04 0.91 0.92 1.18 0.54 0.17 0.85 0.68 0.25 0.86 0.92 1.25 0.94 12.47
Solyc01g091920.3.1 (Solyc01g091920.3)
6.61 10.29 9.03 2.98 6.23 3.98 0.74 3.11 3.97 4.55 1.6 0.62 0.33 0.16 1.78 2.1 1.56 0.0 0.0 0.0 0.08 1.53 1.6 1.37 0.75 0.05 1.19 1.86 2.09 2.56 2.53 2.07 1.8 22.25
Solyc01g096120.3.1 (Solyc01g096120.3)
17.25 0.03 20.77 15.28 10.05 3.83 9.5 3.29 2.37 3.2 0.06 3.11 0.13 0.02 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.32 0.37 0.41 0.41 0.26 0.06 0.11 0.18 0.18 0.4 0.68 0.23 1.43 32.83
Solyc01g104010.2.1 (Solyc01g104010.2)
3.76 5.44 20.46 8.32 9.9 3.71 5.9 2.82 1.81 1.07 0.95 0.66 0.04 0.37 0.67 0.36 0.93 0.02 0.0 0.14 0.23 0.34 0.44 0.41 0.48 0.99 0.37 0.36 0.27 0.67 0.92 0.57 1.09 16.67
Solyc02g069630.3.1 (Solyc02g069630.3)
20.96 7.99 20.56 20.89 11.21 8.32 26.47 14.23 9.58 5.05 2.68 6.3 5.18 6.19 3.53 2.23 2.47 0.0 0.0 0.06 0.64 10.07 8.53 7.82 4.34 0.2 25.5 12.82 8.0 13.82 20.71 7.7 2.16 54.66
Solyc02g077950.2.1 (Solyc02g077950.2)
22.59 6.76 7.59 12.04 11.5 8.65 11.39 5.83 15.01 12.61 2.06 2.16 1.96 1.37 15.85 13.57 8.85 0.0 0.0 0.8 1.06 9.41 4.69 5.38 5.52 2.36 9.47 6.99 5.4 12.72 11.69 12.6 6.31 56.08
Solyc02g091350.3.1 (Solyc02g091350.3)
17.22 2.36 12.5 1.64 15.96 12.42 13.83 10.6 6.64 4.65 1.72 1.25 2.17 2.45 6.06 5.28 3.94 0.0 0.0 0.62 1.21 2.51 1.73 1.86 1.75 1.83 3.84 3.58 2.51 3.37 2.85 2.89 8.09 13.4
Solyc02g092370.1.1 (Solyc02g092370.1)
30.93 12.47 28.44 12.42 31.86 8.05 9.87 7.83 11.85 4.28 2.94 3.65 2.21 1.73 2.61 2.32 1.82 0.01 0.01 0.3 1.18 3.51 3.72 2.66 1.52 0.73 4.04 3.11 1.62 6.11 5.32 3.91 1.22 54.06
Solyc03g005090.3.1 (Solyc03g005090.3)
12.49 4.83 36.19 3.49 20.63 16.4 40.06 12.41 9.13 10.81 3.69 2.2 5.72 5.23 7.22 6.54 8.5 0.02 0.02 1.48 5.45 7.41 3.8 5.27 6.77 11.6 8.8 9.03 7.2 8.77 8.09 8.57 7.48 17.04
Solyc03g095490.3.1 (Solyc03g095490.3)
22.51 3.23 31.16 12.2 52.54 16.43 26.5 25.26 35.87 11.8 10.0 10.0 2.02 4.91 9.89 2.97 4.26 0.02 0.0 0.67 3.29 17.5 19.65 14.32 9.57 0.12 18.15 10.71 5.98 21.49 22.96 18.8 6.71 106.61
Solyc03g112930.3.1 (Solyc03g112930.3)
4.81 0.1 9.43 4.11 7.85 4.35 0.57 4.64 7.39 4.18 1.76 1.87 0.19 0.14 0.41 0.18 0.23 0.0 0.0 0.04 0.5 3.58 2.01 2.71 1.67 0.03 2.21 1.48 1.09 5.0 4.05 5.65 1.49 13.71
Solyc03g114070.3.1 (Solyc03g114070.3)
34.99 34.18 83.99 49.69 41.33 53.85 105.76 51.9 60.49 33.08 59.49 30.8 107.64 80.58 54.35 36.19 44.46 0.19 0.24 12.4 9.87 15.89 17.42 13.71 9.08 17.02 36.78 35.48 21.79 22.74 25.3 14.42 33.46 64.18
Solyc03g119180.1.1 (Solyc03g119180.1)
24.53 0.22 10.58 3.01 179.29 7.9 0.03 7.19 2.45 4.21 0.99 0.51 0.22 0.05 0.58 0.74 0.38 0.0 0.0 0.04 0.11 3.24 0.88 1.7 2.53 0.0 0.25 0.93 0.86 2.04 2.2 4.06 1.48 68.63
Solyc03g119350.2.1 (Solyc03g119350.2)
1.1 5.44 1.38 0.31 0.84 0.47 0.37 0.81 2.36 0.21 0.07 0.08 0.09 0.23 0.59 0.03 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.33 0.4 0.15 0.0 0.25 0.15 0.35 0.08 0.22 0.13 0.05 4.77
Solyc04g008430.1.1 (Solyc04g008430.1)
14.95 0.58 7.54 7.04 17.98 3.67 0.21 2.29 2.02 2.0 0.35 1.06 0.03 0.07 0.45 0.1 0.23 0.0 0.0 0.11 0.67 0.53 0.6 0.57 0.43 0.17 0.45 0.43 0.22 0.95 0.95 0.96 1.01 22.55
Solyc04g009660.2.1 (Solyc04g009660.2)
4.06 0.0 5.6 0.34 8.39 0.52 0.0 0.45 0.62 0.84 0.33 0.1 0.0 0.0 1.06 0.8 0.82 0.0 0.0 0.06 0.31 0.96 0.11 0.4 0.5 0.0 0.2 0.37 0.29 1.18 0.99 2.14 0.05 9.39
Solyc04g015980.3.1 (Solyc04g015980.3)
5.45 0.1 3.11 0.37 5.95 0.82 0.43 0.87 0.8 1.63 2.35 0.89 0.22 0.15 2.35 1.47 3.15 0.07 0.04 0.22 0.68 2.8 0.91 1.47 1.36 0.25 0.93 1.4 1.19 3.72 2.88 6.7 0.36 11.72
Solyc04g080940.3.1 (Solyc04g080940.3)
140.25 20.58 257.51 159.58 155.95 24.64 33.84 78.46 80.33 38.35 35.77 15.42 0.66 0.57 23.55 9.05 12.95 0.0 0.0 1.29 14.32 103.24 42.36 46.21 35.0 0.1 40.92 42.21 25.43 160.87 127.63 165.48 30.27 212.09
Solyc04g081590.3.1 (Solyc04g081590.3)
18.32 0.07 14.63 0.59 29.02 9.3 48.29 13.01 9.21 9.83 4.48 4.3 10.53 9.56 2.91 2.19 1.87 0.0 0.0 7.02 3.37 6.11 8.08 5.15 3.33 1.44 29.38 17.42 7.65 10.62 10.37 7.8 8.22 125.08
Solyc05g009880.3.1 (Solyc05g009880.3)
32.4 9.69 57.12 27.79 33.06 21.92 3.29 19.84 23.08 21.28 7.85 5.65 1.02 0.53 7.5 5.91 4.76 0.0 0.0 0.29 1.51 6.63 17.97 8.94 5.31 0.01 5.47 4.32 2.11 8.46 9.72 6.03 4.34 85.85
Solyc05g010680.2.1 (Solyc05g010680.2)
7.5 1.33 31.36 8.21 23.54 3.26 0.07 7.31 4.5 1.65 0.54 0.94 1.19 0.4 1.27 0.46 0.44 0.0 0.04 0.03 0.44 4.07 2.93 2.41 1.65 0.24 2.45 1.96 1.35 5.12 5.2 4.92 0.62 18.62
Solyc05g050540.3.1 (Solyc05g050540.3)
4.96 0.59 4.73 1.14 5.26 2.25 1.37 6.63 6.43 2.2 1.42 0.67 2.13 0.71 0.98 0.77 0.55 0.01 0.0 0.54 0.73 1.73 2.89 1.54 0.9 0.77 1.42 1.22 0.61 2.53 2.5 1.08 4.05 9.97
Solyc05g052430.2.1 (Solyc05g052430.2)
5.43 5.61 4.12 6.27 1.18 1.78 3.64 3.32 2.49 3.0 2.33 1.76 4.87 3.35 2.26 1.83 3.85 0.11 0.13 1.18 1.38 2.95 4.35 3.39 2.73 1.08 3.77 3.15 2.34 3.01 3.43 2.19 1.63 7.55
Solyc05g055290.3.1 (Solyc05g055290.3)
15.58 11.22 12.04 3.65 7.21 0.56 0.67 1.94 3.95 1.54 0.15 0.29 0.08 0.01 0.3 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 5.73 3.67 3.3 2.3 0.08 4.56 2.84 1.43 8.8 8.24 8.68 0.06 32.3
Solyc05g056140.3.1 (Solyc05g056140.3)
26.28 12.68 10.4 4.36 40.81 13.36 30.21 14.6 13.6 10.6 10.91 8.83 23.94 16.29 6.93 3.45 4.12 0.0 0.01 2.61 2.93 6.26 6.48 5.32 3.45 3.56 6.34 5.29 4.33 7.89 8.16 4.74 15.4 55.56
Solyc06g066580.3.1 (Solyc06g066580.3)
30.74 1.37 40.05 13.86 10.03 5.21 7.41 5.19 13.24 10.75 2.0 1.7 1.95 1.01 3.05 3.75 3.58 0.0 0.0 1.95 3.58 11.83 3.21 5.47 5.25 0.64 7.48 7.1 4.4 18.26 14.47 22.48 0.7 69.3
Solyc06g069300.1.1 (Solyc06g069300.1)
9.67 0.48 3.01 0.11 18.35 4.72 5.64 5.83 5.74 5.54 3.85 3.23 2.04 1.06 3.1 1.72 1.79 0.0 0.0 0.13 1.22 2.59 2.58 1.96 1.4 0.0 2.61 2.05 1.11 4.09 3.2 3.33 0.92 38.06
Solyc06g071590.3.1 (Solyc06g071590.3)
13.65 7.59 12.13 25.22 14.69 2.02 2.58 2.51 4.45 1.75 1.23 1.52 0.17 0.23 1.94 1.56 1.16 0.0 0.0 0.39 0.49 1.06 1.97 1.87 1.31 0.38 1.95 1.88 1.46 1.85 2.08 1.38 0.17 13.28
Solyc06g075600.3.1 (Solyc06g075600.3)
5.77 0.5 8.78 6.51 12.99 1.34 0.08 0.92 3.53 1.93 1.04 1.65 0.09 0.1 0.89 1.39 0.63 0.01 0.0 0.32 1.57 2.91 1.96 2.66 2.76 0.0 2.69 2.36 1.64 4.65 3.39 4.78 0.2 18.49
Solyc06g076030.3.1 (Solyc06g076030.3)
5.85 2.57 7.02 6.21 4.72 2.9 0.72 2.52 5.58 3.17 1.15 1.73 0.2 0.38 2.03 1.42 1.5 0.0 0.0 0.77 1.75 2.1 1.88 1.39 1.2 0.56 1.23 0.95 0.72 2.22 2.47 3.75 0.76 25.85
Solyc07g005540.1.1 (Solyc07g005540.1)
12.76 5.04 11.82 9.21 14.97 12.94 17.56 15.25 8.57 3.69 5.87 2.66 13.78 11.24 1.31 0.26 0.52 0.0 0.0 0.08 1.12 1.48 3.76 1.7 0.8 0.08 5.16 2.61 1.47 2.2 3.25 0.88 4.76 36.76
Solyc07g006170.3.1 (Solyc07g006170.3)
6.79 0.83 5.19 0.55 0.71 3.2 7.7 3.66 4.06 2.97 4.96 1.84 4.32 2.66 1.55 0.75 1.01 0.0 0.0 0.2 0.21 0.53 0.96 0.76 0.37 0.0 2.11 1.03 0.69 0.46 1.04 0.28 1.8 1.99
Solyc07g007020.3.1 (Solyc07g007020.3)
5.4 0.64 7.18 2.57 13.35 5.89 1.09 4.05 12.81 1.58 0.86 0.72 0.35 0.18 4.28 0.71 1.27 0.0 0.0 0.28 0.51 3.61 1.12 1.48 0.98 0.11 1.58 1.05 1.01 2.97 4.28 4.05 1.09 23.24
Solyc08g013980.3.1 (Solyc08g013980.3)
9.71 3.93 30.19 17.29 9.66 3.44 2.87 2.95 10.66 6.97 3.78 3.45 2.14 0.96 5.24 6.01 4.99 0.24 0.0 1.87 5.27 4.1 2.36 2.83 2.37 2.53 5.87 5.87 5.65 6.79 5.27 7.84 0.59 17.9
Solyc08g066810.3.1 (Solyc08g066810.3)
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Solyc08g079120.2.1 (Solyc08g079120.2)
1.92 0.22 2.73 1.27 2.88 1.38 0.03 1.47 1.82 1.18 0.8 0.52 0.15 0.03 0.27 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.71 0.63 0.5 0.38 0.0 0.42 0.38 0.18 0.99 0.95 0.59 0.84 4.14
Solyc08g080890.3.1 (Solyc08g080890.3)
2.92 1.14 6.46 1.73 8.39 0.92 2.85 1.95 2.18 0.66 0.71 0.49 0.16 0.3 0.45 0.17 0.15 0.06 0.0 0.01 0.29 2.33 1.53 1.31 0.88 0.14 1.97 1.38 0.58 3.37 3.11 2.59 0.1 9.02
Solyc09g011170.3.1 (Solyc09g011170.3)
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Solyc09g018490.3.1 (Solyc09g018490.3)
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Solyc09g075630.1.1 (Solyc09g075630.1)
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Solyc09g075900.3.1 (Solyc09g075900.3)
10.56 12.22 6.57 2.99 33.02 17.66 0.33 25.78 31.09 20.39 12.32 10.13 1.87 1.46 8.07 1.77 1.69 0.0 0.0 0.0 0.27 12.89 26.43 12.28 5.75 0.0 9.09 6.75 3.08 20.38 20.32 9.27 6.22 50.06
Solyc09g091260.3.1 (Solyc09g091260.3)
15.75 12.28 21.79 14.8 7.07 4.24 3.29 5.18 5.32 11.62 4.89 2.92 3.36 1.72 7.73 5.22 8.92 0.04 0.02 0.45 1.53 4.58 4.83 4.29 2.76 0.44 6.49 5.07 3.74 6.48 6.25 5.69 1.48 33.32
Solyc10g009360.3.1 (Solyc10g009360.3)
10.39 0.06 26.85 16.79 3.33 0.98 0.41 2.38 4.65 2.08 2.68 4.36 0.35 0.47 0.28 0.02 0.05 0.12 0.11 0.04 0.15 1.31 1.06 0.9 0.48 0.0 0.59 0.69 0.49 1.67 2.1 1.55 0.27 22.96
Solyc10g083830.2.1 (Solyc10g083830.2)
40.53 54.66 13.07 14.12 12.63 8.93 18.28 17.3 14.66 15.9 14.53 9.73 26.05 13.59 8.51 7.56 9.72 0.03 0.0 5.87 2.65 13.61 13.23 10.68 8.34 11.0 7.22 8.32 8.47 12.44 14.05 14.38 1.46 31.47
Solyc11g012930.2.1 (Solyc11g012930.2)
60.53 0.0 145.28 2.45 233.44 49.49 0.09 20.77 17.48 82.99 2.29 0.45 0.15 0.01 13.81 13.69 30.26 0.02 0.0 22.96 42.6 36.63 2.8 12.22 12.93 28.57 5.9 13.5 21.76 49.82 36.44 106.29 24.76 190.99
Solyc11g071230.2.1 (Solyc11g071230.2)
11.73 5.94 3.27 4.1 2.82 2.63 12.92 5.45 6.3 3.1 4.23 4.06 3.42 2.69 1.81 0.93 1.47 0.0 0.0 0.93 1.6 6.21 6.38 4.89 3.55 1.6 5.06 4.4 3.73 5.16 6.44 5.52 1.75 7.33
Solyc11g072580.2.1 (Solyc11g072580.2)
5.42 0.14 14.68 6.49 5.88 2.97 1.23 8.6 4.4 1.44 0.41 0.31 0.06 0.06 0.73 0.07 0.09 0.0 0.0 0.02 0.03 1.65 2.1 1.34 0.96 0.01 0.89 0.78 0.35 2.39 2.77 2.31 2.91 18.96

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)