Heatmap: Cluster_165 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g009080.3.1 (Solyc00g009080.3)
0.27 1.36 -0.1 0.33 -1.0 -0.62 -0.96 0.27 0.06 -0.34 -0.15 0.04 -0.73 -0.79 -1.0 -1.51 -1.66 -6.39 -7.37 -1.29 -1.09 0.72 0.79 0.67 0.54 -2.02 0.88 0.7 0.66 0.7 0.85 0.51 -0.65 -0.06
Solyc01g007140.3.1 (Solyc01g007140.3)
0.18 2.26 0.33 -0.11 -1.72 -0.72 0.28 -0.06 0.14 -0.32 0.82 0.18 0.85 0.42 -0.56 -1.52 -1.4 -6.42 -4.81 -1.59 -0.77 -0.07 0.11 -0.08 -0.51 -0.35 0.41 0.28 0.18 0.0 0.23 -0.05 -3.43 0.14
Solyc01g007250.3.1 (Solyc01g007250.3)
0.1 2.23 0.6 0.49 -1.6 -0.69 -0.26 0.07 0.11 -0.7 0.59 0.51 0.81 0.77 -0.57 -0.76 -1.14 -4.35 -4.27 -0.33 0.01 -0.33 -0.22 -0.33 -0.47 -0.24 -0.1 -0.21 -0.13 -0.16 -0.2 -0.21 -1.48 0.08
Solyc01g007910.3.1 (Solyc01g007910.3)
0.63 1.17 1.64 1.86 -1.35 -1.14 -0.13 -0.49 -0.5 -0.95 -0.01 0.15 -0.34 -0.21 -0.77 -1.21 -1.02 -2.89 -2.71 -0.14 0.1 -0.08 0.2 0.15 0.15 -0.68 -0.07 -0.19 -0.26 -0.14 -0.18 -0.23 -1.41 0.69
Solyc01g008290.3.1 (Solyc01g008290.3)
0.14 2.55 0.5 1.11 -0.44 -0.12 0.9 0.59 -0.69 -1.2 0.01 0.15 0.22 0.13 -0.86 -1.45 -1.26 -5.57 -6.99 -1.83 -0.98 -0.43 -0.01 -0.35 -0.94 -0.43 0.02 -0.07 -0.13 -0.33 -0.11 -0.53 -1.45 0.48
Solyc01g008340.3.1 (Solyc01g008340.3)
-0.02 1.77 -0.17 1.06 -1.86 -1.68 -0.13 -0.91 0.01 -1.37 0.38 0.29 0.47 0.28 -0.99 -1.87 -1.79 -8.92 -9.18 -0.26 0.21 0.04 0.81 0.52 0.29 -0.84 0.8 0.46 0.33 0.12 0.27 -0.02 -3.18 0.3
Solyc01g008370.3.1 (Solyc01g008370.3)
0.55 0.85 0.27 0.77 -1.1 -0.41 1.05 -0.5 -0.05 -0.1 0.16 0.13 0.11 0.39 -0.2 -0.58 -0.48 -6.66 -6.48 -0.33 -1.0 0.0 0.04 -0.05 -0.04 -0.13 0.33 0.18 0.16 0.15 0.25 0.16 -1.34 0.65
Solyc01g011000.3.1 (Solyc01g011000.3)
0.88 1.98 -0.43 0.84 -1.17 -0.45 0.2 0.2 -0.04 -0.58 0.36 -0.02 0.09 -0.29 -0.64 -0.8 -0.81 -4.19 -4.51 0.12 -0.7 -0.21 -0.02 -0.13 -0.24 -0.01 0.28 -0.07 -0.17 -0.13 -0.04 -0.28 0.23 0.35
Solyc01g011340.3.1 (Solyc01g011340.3)
0.02 -0.13 0.7 1.12 -0.35 -0.31 0.26 -0.35 0.18 -0.12 -0.68 -0.8 -0.41 -0.8 0.24 0.19 0.23 -2.02 -3.23 -0.44 -1.2 0.37 0.08 0.26 0.31 -0.02 0.29 0.43 0.22 0.45 0.42 0.3 -1.63 0.43
Solyc01g066690.3.1 (Solyc01g066690.3)
0.28 0.96 0.09 0.62 0.16 -0.27 0.5 -0.14 -0.27 -0.68 -0.06 0.19 -0.3 -0.21 -0.78 -1.21 -1.11 -4.37 -3.04 -0.14 -0.21 0.29 0.53 0.46 0.41 0.08 0.45 0.3 0.17 0.22 0.26 0.11 -1.41 0.46
Solyc01g068240.3.1 (Solyc01g068240.3)
0.27 1.57 -0.03 0.13 -0.94 -0.33 0.97 0.32 0.14 -0.22 -0.11 -0.83 -0.16 -0.62 0.13 -0.17 -0.15 -6.84 -8.53 -0.08 -0.57 0.07 0.12 0.04 -0.08 -0.19 0.2 0.25 0.27 0.1 0.24 0.05 -1.11 0.53
Solyc01g080140.3.1 (Solyc01g080140.3)
0.61 0.31 0.32 1.16 -0.26 -0.11 0.84 0.28 0.29 -0.45 -0.38 -0.01 -0.83 -0.54 -0.07 -0.36 -0.38 -5.79 -6.6 -0.6 -1.65 0.12 0.53 0.31 0.09 -0.2 0.59 0.29 0.02 0.25 0.39 -0.19 -1.26 0.36
Solyc01g080530.3.1 (Solyc01g080530.3)
0.27 -0.46 1.52 1.45 -0.01 -0.55 -0.04 -0.65 0.12 -0.3 -0.82 -0.76 -0.12 -0.39 -0.0 -0.34 -0.51 -4.3 -4.56 -1.29 -0.83 0.36 0.25 0.41 0.35 -1.4 0.42 0.34 0.28 0.5 0.43 0.36 -1.46 0.27
Solyc01g081520.3.1 (Solyc01g081520.3)
0.18 1.28 -0.33 0.62 -0.04 -0.32 0.04 -0.21 0.09 -0.64 0.24 0.15 0.5 0.36 0.21 -0.48 -0.45 -5.8 -6.53 -0.54 -0.08 0.26 0.27 0.21 0.08 -0.36 0.26 0.21 0.1 0.23 0.34 0.17 -2.69 -0.11
Solyc01g086740.3.1 (Solyc01g086740.3)
-0.07 1.4 -0.78 -0.26 -0.01 -0.16 0.95 -0.13 -0.04 -0.11 0.33 0.15 0.68 0.46 -0.32 -0.61 -0.59 -4.48 -4.28 -0.22 0.14 -0.12 0.22 0.18 0.05 0.21 0.16 0.21 0.05 -0.06 -0.14 -0.14 -2.54 0.23
Solyc01g087880.3.1 (Solyc01g087880.3)
0.72 2.02 0.55 0.45 -1.55 -0.78 -0.87 0.12 -0.11 -1.26 0.42 0.65 0.26 0.28 -0.61 -0.93 -0.92 -7.02 -7.66 -0.18 0.67 -0.02 -0.03 -0.13 0.04 -1.29 -0.17 -0.22 -0.14 0.02 0.12 -0.02 -0.63 0.42
Solyc01g088370.3.1 (Solyc01g088370.3)
-0.61 1.59 -0.03 0.57 0.42 -0.03 0.34 0.06 -0.2 -0.43 0.45 0.54 0.43 0.67 -0.26 -0.56 -0.59 -6.46 -7.0 -0.51 -0.14 -0.18 0.12 -0.01 -0.19 -0.13 0.17 0.0 -0.17 -0.13 -0.08 -0.29 -1.42 0.31
Solyc01g088650.3.1 (Solyc01g088650.3)
1.13 -0.13 -0.12 1.05 -1.53 -0.75 -0.37 -0.94 -0.67 -0.39 0.31 0.1 0.16 0.29 0.41 -0.33 -0.24 -4.66 -3.91 -0.54 0.55 0.18 0.33 0.11 0.02 -0.15 0.46 0.37 0.35 0.11 0.13 0.13 -2.4 0.68
Solyc01g090990.3.1 (Solyc01g090990.3)
0.09 0.6 0.82 1.57 -0.55 -1.11 0.03 -0.58 0.15 -0.26 0.3 0.22 0.05 0.12 0.02 -0.21 -0.05 -2.94 -4.12 -1.34 -0.7 0.03 -0.07 0.03 -0.02 -1.13 0.59 0.48 0.04 0.42 0.31 -0.07 -1.82 0.23
Solyc01g091650.3.1 (Solyc01g091650.3)
0.42 0.67 -0.17 0.46 0.43 0.08 0.56 -0.23 0.1 -0.31 -0.31 -0.26 0.27 0.16 -0.36 -0.51 -0.46 -2.88 -3.1 -0.55 -0.24 -0.01 0.28 0.24 0.16 -0.14 0.36 0.31 0.27 0.13 0.1 0.04 -1.17 0.53
Solyc01g097640.3.1 (Solyc01g097640.3)
0.16 1.66 -0.68 -0.64 -0.12 -0.74 0.69 -0.29 -0.15 -0.88 1.12 0.75 1.12 1.09 -1.3 -2.56 -2.58 - - -1.04 0.37 -0.08 0.36 0.18 -0.38 -0.62 0.25 0.16 -0.15 -0.09 0.16 -0.28 -3.1 0.46
Solyc01g097740.3.1 (Solyc01g097740.3)
-0.09 0.92 0.23 1.51 -0.01 -0.29 0.03 -0.16 0.22 -0.58 0.16 0.59 0.27 0.56 0.07 -0.35 -0.26 -5.35 -5.11 -0.84 -0.65 -0.26 0.17 0.04 -0.27 -0.43 0.15 -0.01 -0.2 -0.04 0.03 -0.24 -1.61 0.74
Solyc01g098030.3.1 (Solyc01g098030.3)
0.3 1.07 -0.7 0.19 -0.43 -0.27 0.59 -0.43 0.11 0.03 0.77 0.57 0.97 0.58 -0.47 -1.02 -0.85 -4.06 -3.08 -0.21 0.48 0.03 -0.11 -0.12 -0.26 -0.28 -0.11 -0.08 -0.12 0.06 0.06 0.34 -0.71 -0.2
Solyc01g098630.3.1 (Solyc01g098630.3)
-0.42 1.73 -0.36 0.53 -1.2 -0.38 -0.57 -0.04 -1.07 -1.04 0.32 0.49 0.47 0.33 -1.44 -2.64 -3.06 -7.72 -8.08 -0.85 -0.19 0.72 0.11 0.4 0.44 -0.26 0.5 0.68 0.52 0.78 0.64 0.74 -1.37 -1.06
Solyc01g098870.3.1 (Solyc01g098870.3)
-0.07 0.91 -0.4 0.62 -0.27 -0.29 0.34 0.13 -0.13 -0.33 0.31 0.18 0.2 0.15 -0.26 -0.6 -0.56 -3.31 -2.67 -0.52 -0.38 0.18 0.38 0.41 0.21 0.31 0.28 0.24 0.04 0.18 0.25 0.07 -1.06 0.26
Solyc01g099760.3.1 (Solyc01g099760.3)
0.98 0.56 0.08 0.55 -0.1 -0.19 0.26 -0.73 -0.01 -0.45 0.07 0.14 0.24 0.33 -0.23 -0.41 -0.33 -6.26 -5.73 -0.08 -0.1 -0.06 0.01 -0.05 -0.04 0.32 0.22 0.09 0.11 -0.03 0.02 0.12 -1.03 0.82
Solyc01g103510.3.1 (Solyc01g103510.3)
-0.37 1.97 0.69 1.11 -0.78 -0.53 0.74 0.81 -0.2 -1.27 1.01 1.08 0.06 0.14 -0.74 -2.17 -1.81 -7.74 -8.79 -2.43 -1.7 -0.56 0.88 0.45 -0.5 -2.19 0.28 -0.29 -0.74 -0.7 -0.07 -0.99 -0.72 0.6
Solyc01g104920.3.1 (Solyc01g104920.3)
0.26 0.68 0.24 1.25 -0.97 -0.8 -0.18 -0.29 0.11 -0.48 -0.54 0.01 -0.85 -0.12 -0.0 -0.46 -0.25 -2.24 -1.4 -0.15 0.01 0.29 0.39 0.45 0.36 -0.7 0.4 0.32 0.3 0.36 0.31 0.29 -1.58 0.22
Solyc01g106260.3.1 (Solyc01g106260.3)
-0.38 1.69 -0.06 0.34 0.54 -0.37 0.95 -0.43 -0.23 -1.26 0.44 0.07 0.7 0.83 -0.86 -1.54 -1.61 -4.53 -4.88 -0.37 0.16 -0.17 0.13 0.04 -0.24 -0.57 0.4 0.22 -0.15 -0.02 0.07 -0.4 -1.23 0.55
Solyc01g107550.3.1 (Solyc01g107550.3)
0.85 0.39 0.38 0.63 -0.77 -0.09 -0.43 -0.38 0.12 0.17 -0.47 -0.81 -0.67 -1.26 -0.08 0.43 0.33 -5.7 -6.83 -0.33 -0.93 0.38 0.36 0.27 0.42 0.36 0.1 0.23 0.34 0.32 0.34 0.59 -0.91 0.12
Solyc01g107600.3.1 (Solyc01g107600.3)
0.58 0.14 0.49 1.45 -0.84 -0.79 -0.17 -0.64 0.95 -0.37 0.12 0.24 0.31 0.18 0.29 0.17 0.02 -2.73 -2.06 -0.44 0.08 -0.03 0.1 0.1 -0.1 -0.61 0.07 -0.04 -0.16 -0.08 0.03 -0.28 -1.89 0.03
Solyc01g107630.3.1 (Solyc01g107630.3)
0.27 1.06 -0.71 -0.73 -0.34 -0.48 0.46 -0.28 0.57 -0.62 0.25 -0.31 0.15 -0.09 -0.09 -0.27 -0.24 -7.46 -4.36 -0.86 -0.95 0.25 0.62 0.45 0.12 -0.11 0.81 0.59 0.2 0.21 0.38 0.07 -1.67 0.63
Solyc01g109410.3.1 (Solyc01g109410.3)
0.54 0.46 0.25 1.51 -0.92 -0.81 -0.31 -0.43 -0.05 -0.24 -0.52 -0.55 -0.4 -0.46 0.37 -0.09 -0.09 -4.9 -4.57 -0.44 -0.84 0.4 0.43 0.37 0.18 -0.05 0.39 0.41 0.44 0.37 0.4 0.31 -1.7 0.08
Solyc01g109940.3.1 (Solyc01g109940.3)
0.33 0.58 0.38 0.75 -0.96 -0.42 0.71 -0.46 -0.08 -0.51 -0.44 -0.09 -0.15 0.1 0.08 -0.02 0.04 -6.42 -7.47 -0.05 -0.36 0.07 0.15 0.14 0.18 0.02 0.35 0.28 0.24 0.13 0.19 0.13 -0.86 0.63
Solyc01g111450.3.1 (Solyc01g111450.3)
0.74 0.79 0.3 0.68 -0.67 -0.46 0.62 -0.16 -0.2 -0.93 -0.06 0.37 -0.05 0.32 -0.26 -0.61 -0.57 -5.87 -6.78 -0.37 -0.62 0.3 0.05 0.15 0.17 -0.34 0.06 0.26 0.21 0.35 0.43 0.14 -0.6 0.52
Solyc01g111710.3.1 (Solyc01g111710.3)
0.72 0.71 0.13 0.79 -0.93 -0.41 0.44 -0.4 -0.38 -0.67 0.15 0.24 0.28 0.53 0.22 -0.18 -0.17 -7.12 -8.04 -0.09 -0.24 -0.03 -0.1 -0.09 -0.15 0.27 0.05 0.05 -0.02 0.05 0.13 -0.05 -0.3 0.59
Solyc01g112020.3.1 (Solyc01g112020.3)
-0.99 1.71 0.03 0.47 -1.14 -0.82 0.73 -0.04 -0.16 -0.55 0.18 0.22 0.28 0.54 0.06 -0.67 -0.71 -2.8 -3.26 -0.78 -0.8 0.26 0.4 0.25 0.02 -0.39 0.48 0.31 0.25 0.23 0.42 0.06 -1.95 -0.31
Solyc02g005350.3.1 (Solyc02g005350.3)
0.48 0.69 0.45 0.73 -0.56 -0.75 0.5 -0.39 0.07 -0.72 0.39 0.51 0.29 0.35 -0.32 -0.55 -0.42 -6.08 -6.89 0.07 -0.27 0.09 0.11 0.21 0.25 -0.27 0.27 0.26 0.15 0.1 0.12 -0.04 -1.58 0.23
Solyc02g023970.3.1 (Solyc02g023970.3)
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Solyc02g062530.3.1 (Solyc02g062530.3)
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Solyc02g065300.1.1 (Solyc02g065300.1)
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Solyc03g118610.3.1 (Solyc03g118610.3)
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Solyc03g118910.1.1 (Solyc03g118910.1)
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Solyc03g119170.3.1 (Solyc03g119170.3)
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Solyc03g120080.3.1 (Solyc03g120080.3)
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Solyc04g008790.1.1 (Solyc04g008790.1)
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Solyc04g079380.1.1 (Solyc04g079380.1)
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Solyc05g012390.3.1 (Solyc05g012390.3)
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Solyc05g013820.3.1 (Solyc05g013820.3)
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Solyc05g014130.3.1 (Solyc05g014130.3)
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Solyc05g018570.3.1 (Solyc05g018570.3)
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Solyc05g023710.3.1 (Solyc05g023710.3)
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Solyc05g026540.3.1 (Solyc05g026540.3)
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Solyc05g050600.3.1 (Solyc05g050600.3)
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Solyc05g051690.3.1 (Solyc05g051690.3)
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Solyc05g052480.3.1 (Solyc05g052480.3)
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Solyc05g052780.3.1 (Solyc05g052780.3)
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Solyc05g053140.3.1 (Solyc05g053140.3)
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Solyc06g008700.3.1 (Solyc06g008700.3)
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Solyc06g061150.3.1 (Solyc06g061150.3)
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Solyc07g006960.3.1 (Solyc07g006960.3)
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Solyc07g008350.3.1 (Solyc07g008350.3)
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Solyc07g008840.3.1 (Solyc07g008840.3)
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Solyc07g008860.3.1 (Solyc07g008860.3)
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Solyc07g008940.3.1 (Solyc07g008940.3)
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Solyc07g008950.3.1 (Solyc07g008950.3)
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Solyc07g009320.3.1 (Solyc07g009320.3)
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Solyc07g039200.3.1 (Solyc07g039200.3)
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Solyc07g041930.3.1 (Solyc07g041930.3)
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Solyc07g047790.3.1 (Solyc07g047790.3)
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Solyc08g068330.3.1 (Solyc08g068330.3)
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Solyc09g089670.3.1 (Solyc09g089670.3)
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Solyc10g005280.1.1 (Solyc10g005280.1)
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Solyc10g005560.3.1 (Solyc10g005560.3)
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Solyc10g005660.3.1 (Solyc10g005660.3)
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Solyc10g006020.3.1 (Solyc10g006020.3)
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1.01 -0.58 1.1 0.9 -0.08 -1.05 -0.03 -0.78 -0.25 -0.46 -0.69 -0.93 -0.21 -0.28 0.2 0.2 0.19 -11.82 -10.72 -0.4 -0.49 0.27 -0.01 0.28 0.12 -0.42 0.16 0.35 0.13 0.42 0.43 0.22 -0.71 0.88
Solyc12g055740.2.1 (Solyc12g055740.2)
0.81 0.53 0.36 1.14 -0.62 -0.65 0.12 -0.87 0.09 -0.32 0.35 -0.0 0.23 -0.09 -0.28 -0.75 -0.47 - -12.0 -1.14 0.03 0.31 -0.01 0.16 -0.03 -0.07 0.25 0.28 0.14 0.43 0.46 0.37 -2.17 0.58
Solyc12g056120.1.1 (Solyc12g056120.1)
0.68 0.24 1.6 0.48 0.41 -0.3 -0.05 -1.08 -0.24 0.16 0.4 -0.2 0.62 0.15 0.01 -0.19 -0.23 -4.13 -2.97 -0.34 0.08 -0.3 -0.07 -0.14 -0.27 -1.05 0.07 -0.08 0.03 -0.32 -0.24 -0.28 -1.91 0.93
Solyc12g095820.2.1 (Solyc12g095820.2)
1.16 1.06 0.04 1.95 -0.69 -1.08 -0.65 -0.27 0.44 -0.38 -0.94 -1.25 -0.76 -1.02 -0.04 -0.13 -0.31 -3.21 -3.31 -1.35 -1.11 0.29 0.48 0.46 0.35 -0.53 0.2 0.09 0.09 0.21 0.35 0.06 -2.11 0.45
Solyc12g099470.2.1 (Solyc12g099470.2)
0.28 1.12 -0.03 0.37 0.15 -0.12 0.74 -0.17 0.25 -0.78 -0.43 -0.43 -0.02 -0.21 -0.16 -0.48 -0.34 -5.76 -4.97 -0.51 -0.8 0.25 0.3 0.25 0.13 -0.09 0.45 0.37 0.3 0.36 0.32 0.15 -0.9 0.28
Solyc12g100130.1.1 (Solyc12g100130.1)
0.42 -0.2 1.0 0.98 -0.8 -0.73 0.32 -0.32 0.08 -0.6 0.1 -0.17 -0.01 -0.26 -0.11 -0.58 -0.4 -7.91 -8.83 -0.44 -0.08 0.25 0.49 0.44 0.25 -0.45 0.48 0.42 0.29 0.21 0.28 -0.09 -0.85 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.