Heatmap: Cluster_65 (HCCA cluster)

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(Showing raw values)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g009560.1.1 (Solyc01g009560.1)
0.06 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
Solyc01g009580.2.1 (Solyc01g009580.2)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.25 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.01 0.07 0.32 0.35 3.6 0.0 3.87
Solyc01g011353.1.1 (Solyc01g011353.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.2 0.56 0.0 0.0 0.2 0.19 0.43 0.42 1.08 0.0 0.0
Solyc01g011357.1.1 (Solyc01g011357.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.68 0.0 0.06 1.22 0.0 0.0 0.16 0.36 0.14 0.2 1.52 0.0 0.0
Solyc01g016450.1.1 (Solyc01g016450.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.17 0.36 0.21 0.6 0.0 0.0
Solyc01g065505.1.1 (Solyc01g065505.1)
0.04 0.0 0.06 0.0 0.81 0.11 0.0 0.09 0.6 0.59 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.28 0.09 0.04 0.03 0.06 0.04 1.21 0.04 0.16 0.35 0.0 0.1 0.15 0.2 1.12 0.72 3.07 0.07 0.13
Solyc01g065960.2.1 (Solyc01g065960.2)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 2.66 2.35 0.63 2.69 3.55 0.21 1.51 1.26 1.71 2.75 2.1 8.15 0.0 0.4
Solyc01g066910.3.1 (Solyc01g066910.3)
705.06 6.23 69.48 7.21 14.59 15.25 170.55 3.91 444.26 16.37 17.26 51.01 32.67 56.52 1.68 0.09 1.36 0.0 0.0 0.11 0.3 334.19 196.89 187.8 225.39 0.0 123.78 166.23 156.21 422.4 403.52 615.31 14.75 174.59
Solyc01g087540.3.1 (Solyc01g087540.3)
112.27 34.05 9.79 12.6 29.56 33.04 47.83 60.85 39.2 14.9 42.75 54.48 36.61 61.4 5.1 2.14 1.63 0.0 0.0 3.86 50.55 193.34 119.66 133.74 141.81 2.22 139.2 141.42 133.31 207.3 193.67 230.56 119.89 192.16
Solyc01g088130.2.1 (Solyc01g088130.2)
2.71 2.94 0.44 0.73 2.18 2.35 3.55 1.82 1.28 1.82 5.3 5.34 5.92 4.44 0.85 1.24 0.76 0.03 0.04 2.32 2.55 2.75 2.4 2.32 3.11 1.89 2.21 2.98 2.76 3.61 3.45 3.68 1.5 1.32
Solyc01g091455.1.1 (Solyc01g091455.1)
70.42 21.98 7.45 33.93 3.72 10.11 16.2 11.63 24.86 14.43 10.51 9.69 13.23 11.92 15.56 11.78 13.05 1.27 2.06 8.48 4.63 33.5 26.31 34.7 24.11 22.22 27.1 34.74 28.24 29.75 30.89 27.34 2.09 25.2
Solyc01g098720.3.1 (Solyc01g098720.3)
12.79 0.09 0.3 0.89 1.86 1.01 1.26 1.96 15.11 3.8 0.39 0.85 0.02 0.78 4.61 0.04 0.19 0.0 0.0 0.52 1.13 13.11 4.09 8.05 7.46 0.0 6.28 6.63 3.98 14.83 17.26 14.44 0.07 1.81
Solyc01g104850.3.1 (Solyc01g104850.3)
2.3 22.86 17.44 15.52 0.81 0.41 0.0 1.33 1.5 1.36 0.05 0.01 2.34 1.79 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.29 8.78 23.51 0.02 3.67 10.45 1.77 0.16 5.7 10.5 24.44 20.54 117.9 0.48 0.92
Solyc01g107280.3.1 (Solyc01g107280.3)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 1.28 1.29 0.24 0.0 0.0 0.0 0.41 0.28 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0 0.36 0.71 0.0 0.12 0.28 0.65 1.39 1.81 5.44 0.0 0.0
Solyc01g109390.3.1 (Solyc01g109390.3)
2247.58 97.1 239.3 136.27 5.95 0.03 83.74 0.13 1.58 2.64 39.23 243.06 6.21 46.04 2.85 7.02 4.33 0.49 0.41 0.23 0.13 2591.82 193.34 827.1 959.08 0.0 429.45 963.48 998.6 3138.41 2962.8 3171.77 0.12 336.63
Solyc01g110647.1.1 (Solyc01g110647.1)
0.17 0.1 0.25 0.1 4.29 0.17 0.14 1.07 0.4 1.05 0.22 0.06 0.12 1.25 1.62 0.34 0.22 0.0 0.01 0.05 0.16 7.48 0.0 2.02 5.59 0.0 0.0 4.85 7.82 13.25 9.13 14.74 1.83 0.38
Solyc01g111690.3.1 (Solyc01g111690.3)
94.56 52.24 47.34 82.57 30.52 21.63 22.74 28.04 29.21 30.2 18.68 20.37 13.17 19.08 35.69 30.07 31.29 0.66 0.26 15.84 16.9 47.36 31.44 37.82 38.53 20.64 27.51 34.11 32.23 50.4 49.79 49.28 11.33 35.24
Solyc01g111810.3.1 (Solyc01g111810.3)
15.59 17.74 4.02 6.19 9.4 14.92 10.19 11.18 10.16 7.79 14.46 15.07 18.92 18.36 3.99 2.05 3.14 0.08 0.23 11.26 14.4 11.75 7.32 10.39 12.87 10.1 12.46 13.98 16.94 11.78 11.18 17.57 6.26 7.73
Solyc02g071940.1.1 (Solyc02g071940.1)
13.55 29.33 16.08 36.25 11.78 15.42 18.33 19.53 15.13 13.47 6.21 10.13 6.8 9.76 18.19 9.48 7.52 0.04 0.06 4.04 3.7 28.71 26.0 29.61 29.9 9.1 34.64 34.17 34.24 31.38 31.82 29.54 46.19 11.19
Solyc02g078380.3.1 (Solyc02g078380.3)
62.68 1.71 8.65 3.63 52.45 21.3 24.78 4.84 16.11 80.55 11.3 26.68 38.37 53.4 6.0 1.08 2.12 0.17 0.07 51.51 81.97 164.62 12.23 50.09 91.54 108.05 24.8 69.0 184.89 161.44 124.67 629.9 4.9 32.33
Solyc02g079080.2.1 (Solyc02g079080.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 1.17 0.94 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 4.33 0.0 1.27 2.21 0.31 0.19 1.47 2.07 4.13 4.15 4.09 0.0 0.04
Solyc02g082900.3.1 (Solyc02g082900.3)
170.01 22.79 111.78 31.19 11.68 42.21 5.27 7.36 17.21 74.12 57.49 34.94 263.26 174.98 69.29 61.99 73.17 2.73 1.2 6.6 24.48 242.52 14.57 90.05 242.81 14.69 172.93 255.88 287.57 363.02 250.27 827.11 5.03 121.82
Solyc02g087470.3.1 (Solyc02g087470.3)
6.2 1.07 4.11 3.02 3.55 2.49 1.9 1.61 3.55 2.69 0.86 0.96 1.26 0.85 2.77 2.56 2.35 0.0 0.0 2.26 0.5 6.54 5.47 7.6 6.78 2.71 6.38 7.81 8.15 7.26 8.09 7.8 2.63 7.85
Solyc02g087660.3.1 (Solyc02g087660.3)
0.04 0.11 0.05 0.03 0.08 0.09 0.23 0.09 0.92 0.56 0.42 0.17 0.11 0.09 0.76 0.49 0.23 0.0 0.0 0.09 0.17 1.03 0.43 0.79 0.56 0.03 0.92 0.8 0.56 1.47 1.1 2.33 0.0 0.14
Solyc02g088360.1.1 (Solyc02g088360.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 1.24 0.07 0.19 0.29 0.35 0.38 0.42 0.33 0.81 0.5 0.69 0.0 0.0
Solyc02g088370.1.1 (Solyc02g088370.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 0.0 0.19 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.56 1.3 0.08 0.44 0.74 0.0 0.77 0.88 0.48 1.15 0.88 1.62 0.0 0.0
Solyc02g089250.3.1 (Solyc02g089250.3)
1011.97 6.83 166.04 30.35 247.97 130.28 24.13 87.73 232.19 104.0 145.74 153.77 112.3 139.97 19.88 1.14 1.73 0.0 0.01 1.16 1.44 1018.78 606.82 751.74 804.13 0.11 866.67 715.32 545.97 1147.64 953.45 1392.34 30.96 348.72
Solyc02g091345.1.1 (Solyc02g091345.1)
35.98 10.72 8.42 8.29 2.07 6.57 11.73 8.73 11.53 4.87 8.07 6.62 5.62 8.07 13.69 11.26 9.51 0.02 0.05 4.26 2.54 16.52 11.53 14.24 14.58 4.74 15.95 16.54 15.04 16.85 17.87 16.78 4.58 11.91
Solyc02g091737.1.1 (Solyc02g091737.1)
0.29 0.36 0.19 0.19 0.68 0.36 0.25 0.12 1.88 1.68 0.69 0.79 1.79 1.62 0.2 0.13 0.26 0.69 0.06 0.41 0.69 2.26 1.46 1.42 1.08 0.1 2.78 2.77 1.48 2.75 2.63 2.61 0.04 0.28
Solyc02g091770.2.1 (Solyc02g091770.2)
0.43 0.36 0.33 0.17 0.47 0.55 0.66 0.14 2.52 2.34 0.76 0.77 1.57 1.27 0.4 0.11 0.29 0.97 0.05 0.25 0.8 2.6 1.8 1.67 1.38 0.33 4.35 3.3 2.19 3.64 3.32 3.67 0.02 0.39
Solyc02g093500.3.1 (Solyc02g093500.3)
1.13 0.21 0.02 0.09 6.3 0.82 1.28 0.35 0.93 0.54 0.67 0.25 0.28 0.0 0.1 0.0 0.06 0.01 0.0 2.15 2.31 2.41 0.22 0.83 1.56 4.16 0.62 1.17 1.39 2.34 1.9 5.59 0.0 1.43
Solyc03g006090.2.1 (Solyc03g006090.2)
6.62 19.43 2.25 4.98 1.82 5.66 4.08 7.36 2.03 7.12 6.8 6.46 3.87 3.78 3.64 1.46 2.01 0.09 0.14 1.33 1.93 11.7 7.21 7.55 10.4 2.6 7.78 8.73 11.38 11.85 14.35 14.73 4.64 4.92
Solyc03g006210.2.1 (Solyc03g006210.2)
0.19 0.0 0.22 0.0 0.47 0.55 0.0 0.05 0.17 0.05 0.19 0.09 0.05 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.91 4.03 0.49 1.08 1.37 0.0 0.7 1.37 1.93 9.5 6.5 5.12 0.24 0.11
Solyc03g025690.3.1 (Solyc03g025690.3)
27.46 31.37 4.78 7.85 16.95 16.23 9.66 14.54 6.72 8.67 11.18 11.33 10.82 11.84 3.77 2.52 3.08 0.05 0.05 3.83 2.87 16.56 9.19 10.53 12.46 6.43 14.2 13.83 15.44 16.39 17.73 19.95 2.75 5.0
Solyc03g046260.2.1 (Solyc03g046260.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.45 0.0 0.85 1.88 0.0 0.01 0.8 1.06 3.38 3.29 3.39 0.0 0.12
Solyc03g113850.1.1 (Solyc03g113850.1)
1.0 0.01 0.82 1.65 2.41 0.19 1.39 0.03 3.53 2.21 8.5 2.36 0.43 0.72 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.68 2.57 0.13 1.02 1.71 0.3 1.17 2.06 2.34 3.8 2.82 7.23 0.09 5.71
Solyc03g115800.1.1 (Solyc03g115800.1)
0.46 1.49 0.19 0.16 0.16 0.42 0.32 0.51 0.21 0.05 0.91 0.85 0.81 0.77 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.25 0.46 0.41 0.33 0.41 0.36 0.3 0.54 0.58 0.5 0.4 0.43 0.47 0.14 0.37
Solyc03g115880.1.1 (Solyc03g115880.1)
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Solyc03g118945.1.1 (Solyc03g118945.1)
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Solyc03g118947.1.1 (Solyc03g118947.1)
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Solyc03g118960.2.1 (Solyc03g118960.2)
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Solyc04g005920.1.1 (Solyc04g005920.1)
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Solyc04g008230.3.1 (Solyc04g008230.3)
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Solyc04g008760.2.1 (Solyc04g008760.2)
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Solyc04g011950.1.1 (Solyc04g011950.1)
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Solyc04g071920.2.1 (Solyc04g071920.2)
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Solyc04g077410.3.1 (Solyc04g077410.3)
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Solyc05g005170.3.1 (Solyc05g005170.3)
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Solyc05g018564.1.1 (Solyc05g018564.1)
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Solyc05g021145.1.1 (Solyc05g021145.1)
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Solyc05g045705.1.1 (Solyc05g045705.1)
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Solyc06g066180.3.1 (Solyc06g066180.3)
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Solyc06g071610.2.1 (Solyc06g071610.2)
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Solyc06g083860.2.1 (Solyc06g083860.2)
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Solyc06g084240.2.1 (Solyc06g084240.2)
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Solyc07g007770.2.1 (Solyc07g007770.2)
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Solyc07g042100.3.1 (Solyc07g042100.3)
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Solyc12g042530.2.1 (Solyc12g042530.2)
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Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)