Heatmap: Cluster_122 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g128870.3.1 (Solyc00g128870.3)
1.02 0.41 -0.11 -1.62 -0.56 -0.37 1.91 -1.15 -0.1 0.32 0.92 0.69 0.62 0.41 -0.19 -0.23 -0.1 -9.69 -9.88 0.43 0.92 -0.58 -0.54 -0.61 -0.56 -0.23 -0.68 -0.73 -0.72 -0.77 -0.59 -0.37 -0.54 0.26
Solyc01g005820.3.1 (Solyc01g005820.3)
-0.83 0.65 -0.23 -0.06 1.09 -0.21 1.5 -0.33 0.41 -0.65 0.5 0.47 0.58 0.5 -0.62 -0.7 -0.81 -7.19 -7.45 -0.46 0.21 0.03 0.08 -0.06 -0.27 -0.27 -0.05 -0.11 -0.26 -0.02 0.13 -0.23 -1.24 0.32
Solyc01g008970.3.1 (Solyc01g008970.3)
-0.47 0.58 -1.09 -0.86 -0.31 0.05 1.67 -0.44 -0.68 0.15 1.4 1.06 1.33 1.36 -0.47 -0.87 -0.72 -6.92 -7.11 -0.38 0.38 -0.53 -0.46 -0.55 -0.62 -0.06 -0.43 -0.54 -0.53 -0.57 -0.35 -0.4 -1.2 0.04
Solyc01g057760.3.1 (Solyc01g057760.3)
0.61 0.38 -0.71 -0.64 -0.05 -0.37 1.75 -0.46 -0.07 -0.16 0.82 0.43 1.23 0.91 -0.69 -0.89 -0.82 -10.83 -10.45 -0.35 -0.0 -0.25 -0.07 -0.12 -0.49 -0.08 0.0 -0.03 -0.33 -0.2 -0.04 -0.26 -2.13 0.42
Solyc01g058450.3.1 (Solyc01g058450.3)
0.27 0.12 -0.64 -0.85 -0.17 -0.34 1.42 -0.4 0.58 -0.04 0.24 0.06 0.53 0.4 -0.22 -0.37 -0.3 -4.88 -7.45 -0.15 -0.37 0.16 0.19 0.13 -0.2 0.25 0.37 0.22 -0.07 0.17 0.31 0.13 -1.44 0.19
Solyc01g073920.3.1 (Solyc01g073920.3)
0.28 0.43 -0.84 -0.57 -1.35 -0.51 1.81 -0.31 0.32 -0.42 0.91 0.13 0.75 0.49 -0.31 -0.76 -0.77 -3.85 -3.54 -0.57 -0.03 0.17 0.48 0.22 -0.14 -0.51 0.35 0.19 -0.06 0.09 0.36 -0.43 -1.48 -0.19
Solyc01g090420.3.1 (Solyc01g090420.3)
-0.08 -0.08 0.01 -0.33 -0.46 0.11 1.85 -0.07 0.27 0.16 0.09 -0.18 0.61 0.3 0.31 0.12 0.05 -3.25 -2.63 -0.68 -0.12 -0.21 -0.12 -0.25 -0.43 0.29 0.19 0.04 -0.11 -0.17 0.04 -0.27 -1.43 -0.07
Solyc01g094540.3.1 (Solyc01g094540.3)
0.13 0.64 -1.03 -0.99 -1.19 -0.73 2.18 0.04 -0.04 -1.03 0.46 0.5 0.71 0.77 -1.39 -2.01 -1.92 -8.0 -7.45 -0.68 -0.42 0.16 0.42 0.27 0.09 -0.03 0.2 0.24 -0.1 0.17 0.29 -0.23 -0.37 -0.08
Solyc01g104470.3.1 (Solyc01g104470.3)
-0.31 1.13 -1.25 -0.88 0.66 0.18 1.98 -0.89 -0.84 0.96 0.85 -0.07 0.77 0.46 -0.57 -1.36 -1.38 -9.85 -9.55 0.33 0.18 -0.44 -1.2 -0.74 -0.25 0.41 -0.96 -0.6 0.0 -0.47 -0.53 0.38 -1.15 0.49
Solyc01g104480.3.1 (Solyc01g104480.3)
0.65 0.29 -0.95 -0.61 0.37 0.1 1.37 -0.31 0.19 0.07 0.65 0.14 1.11 0.71 -0.07 -0.15 -0.08 -5.88 -5.39 -0.82 -0.85 -0.26 0.06 -0.15 -0.45 -0.08 -0.06 -0.18 -0.24 -0.2 -0.06 -0.27 -1.22 0.52
Solyc01g104840.3.1 (Solyc01g104840.3)
-0.51 0.77 0.03 0.17 -0.49 -0.27 1.6 -0.15 -0.09 -0.35 0.7 0.52 0.78 0.55 -0.55 -1.02 -1.04 -5.19 -3.87 0.25 0.93 -0.3 -0.24 -0.25 -0.19 -0.29 -0.05 -0.2 -0.32 -0.28 -0.2 -0.13 -0.51 0.04
Solyc01g108330.2.1 (Solyc01g108330.2)
-0.56 -0.14 0.75 -1.77 1.04 0.06 2.35 0.31 0.13 -0.78 0.08 -1.67 0.54 -0.88 -0.87 -1.22 -1.53 -5.32 - -4.15 -0.39 0.84 -0.0 0.37 0.29 - 0.11 0.24 -0.04 0.59 0.75 0.38 -4.01 -0.45
Solyc02g021560.3.1 (Solyc02g021560.3)
0.45 0.75 -0.56 -0.65 -1.66 -0.38 1.77 0.02 0.3 -0.43 0.35 -0.43 0.6 0.37 -0.22 -0.76 -0.52 -6.12 -6.95 -0.72 -0.49 0.0 0.23 0.01 -0.21 -0.3 0.37 0.14 0.02 0.01 0.2 -0.1 0.39 0.23
Solyc02g032120.3.1 (Solyc02g032120.3)
0.25 0.06 -1.17 -0.9 -0.96 -0.45 1.84 -0.94 0.44 0.53 0.52 -0.17 1.48 0.88 0.68 0.67 0.79 -5.18 -5.94 -0.36 -0.35 -0.66 -1.01 -1.05 -1.22 0.24 -0.04 -0.18 -0.51 -0.29 -0.3 -0.45 -1.91 -0.45
Solyc02g063130.3.1 (Solyc02g063130.3)
0.52 0.36 0.29 0.28 -0.82 -0.6 1.31 -0.24 0.07 -0.39 0.34 0.26 0.46 0.33 -0.28 -0.54 -0.48 -9.19 -12.02 -0.13 -0.26 0.13 0.22 0.15 0.05 -0.12 0.13 0.04 -0.05 0.11 0.1 -0.11 -0.76 0.39
Solyc02g068750.1.1 (Solyc02g068750.1)
0.55 0.53 -0.46 -0.86 -0.59 -0.1 1.37 -0.04 0.32 -0.57 0.54 0.3 1.04 0.61 -0.92 -1.31 -1.23 -6.05 -5.91 -0.22 -0.33 -0.13 0.1 -0.01 -0.27 -0.57 0.24 0.04 -0.25 -0.06 0.05 -0.51 0.87 0.46
Solyc02g069790.3.1 (Solyc02g069790.3)
0.3 0.13 -0.1 -0.13 -0.43 -0.4 1.17 -0.64 0.21 -0.22 0.88 0.85 1.28 1.16 -0.23 -0.62 -0.53 -3.28 -4.15 -0.06 0.57 -0.33 -0.51 -0.4 -0.53 -0.18 -0.24 -0.26 -0.41 -0.28 -0.19 -0.29 -1.61 0.29
Solyc02g071180.3.1 (Solyc02g071180.3)
0.16 1.09 -0.67 -0.13 -0.42 -0.6 1.39 -0.21 0.75 -0.3 0.07 -0.25 0.61 0.55 0.47 0.06 0.14 -7.37 -8.98 -0.52 -0.83 -0.19 0.04 -0.21 -0.47 -0.14 0.32 -0.01 -0.37 -0.05 0.1 -0.23 -0.66 0.26
Solyc02g080150.2.1 (Solyc02g080150.2)
0.09 1.47 -0.65 -0.07 -0.6 -0.37 1.5 -0.12 0.1 -0.0 0.74 0.44 0.99 0.8 -0.36 -0.58 -0.39 -5.01 -5.03 -1.21 -0.94 -0.21 0.64 0.04 -0.35 -1.48 0.38 -0.08 -0.35 -0.34 0.02 -0.64 -0.31 -1.08
Solyc02g081620.3.1 (Solyc02g081620.3)
0.03 0.37 -0.51 -0.21 -0.62 -0.62 1.59 -0.3 0.7 0.33 0.36 -0.23 1.09 0.62 0.04 -0.0 0.09 -4.87 -5.96 -0.73 -0.61 -0.07 -0.01 -0.11 -0.51 0.53 0.09 0.04 -0.15 -0.03 0.18 -0.18 -2.66 -0.42
Solyc02g083800.3.1 (Solyc02g083800.3)
-0.3 0.72 -0.33 0.25 -1.93 -1.3 2.19 -0.99 -0.28 -0.31 1.47 0.7 1.13 0.97 -0.68 -0.98 -0.89 -3.37 -4.55 0.21 0.5 -0.67 -0.38 -0.59 -0.72 -0.42 -0.23 -0.32 -0.42 -0.63 -0.32 -0.73 -1.41 0.05
Solyc02g085833.1.1 (Solyc02g085833.1)
0.17 0.44 0.42 0.26 -0.93 -0.88 1.16 -0.37 -0.26 -0.42 0.2 -0.26 0.67 0.36 0.5 0.56 0.36 -4.06 -4.24 -0.35 -0.55 0.01 -0.0 -0.09 -0.16 -0.18 0.29 0.11 -0.0 0.13 0.15 0.01 -0.73 -0.19
Solyc02g088110.3.1 (Solyc02g088110.3)
0.29 0.15 -0.27 -0.42 -1.53 -0.62 1.36 -0.53 0.4 -0.46 -0.0 0.12 0.5 0.5 -0.36 -0.53 -0.66 -6.54 -6.04 0.78 0.72 0.07 0.07 -0.02 -0.0 0.11 0.15 0.0 -0.08 0.16 0.15 0.21 -1.05 0.4
Solyc02g091190.3.1 (Solyc02g091190.3)
0.51 0.6 0.21 0.08 -0.53 -0.69 1.63 -0.61 -0.49 -0.07 0.88 0.68 1.2 1.02 -0.16 -0.48 -0.38 -7.37 -6.72 -0.29 -0.13 -0.4 -0.32 -0.45 -0.49 -0.02 -0.15 -0.27 -0.31 -0.33 -0.27 -0.26 -1.55 -0.14
Solyc03g005680.3.1 (Solyc03g005680.3)
-0.97 0.74 -0.72 -0.42 -0.51 -0.22 1.52 -0.28 -0.05 -0.31 0.9 0.05 0.93 0.44 -0.57 -1.16 -1.1 -4.85 -3.84 -0.44 0.33 0.01 0.41 0.34 -0.01 -0.3 0.5 0.35 0.05 0.04 0.23 -0.28 -1.52 0.09
Solyc03g082367.1.1 (Solyc03g082367.1)
0.06 0.25 -0.49 -0.48 0.87 -0.01 1.81 -0.55 0.29 0.76 0.53 -0.03 0.31 0.03 -0.38 -0.39 -0.26 -4.71 -6.62 -0.55 -1.43 0.07 -0.2 -0.18 -0.27 0.21 -0.03 -0.01 0.03 -0.08 0.05 0.31 -1.27 -0.25
Solyc03g096090.3.1 (Solyc03g096090.3)
0.61 0.46 -0.49 -1.52 -0.69 -0.31 2.45 -0.51 0.75 -0.27 0.53 0.24 1.37 0.95 -0.84 -1.28 -1.21 - - -1.72 -0.67 -0.23 0.22 -0.25 -0.87 -1.24 0.28 -0.19 -0.76 -0.2 0.17 -0.55 -2.52 0.1
Solyc03g119130.3.1 (Solyc03g119130.3)
0.09 -0.01 -0.78 -0.08 -0.56 -0.54 1.39 0.0 0.59 -1.08 0.65 0.7 0.77 1.07 -0.41 -0.79 -0.86 -9.76 -9.49 -0.23 -0.21 -0.02 0.24 -0.02 -0.46 -0.29 0.46 0.22 -0.12 0.04 0.4 -0.34 -0.95 0.02
Solyc03g120760.3.1 (Solyc03g120760.3)
0.38 -0.42 -0.86 -0.47 -0.06 -0.74 1.56 -0.75 0.28 -0.2 0.7 0.62 1.25 1.2 -0.15 -0.57 -0.29 -6.98 -9.02 -1.92 -0.55 -0.0 0.31 0.06 -0.34 -0.88 0.56 0.32 0.11 0.08 0.16 -0.42 -2.24 -0.4
Solyc04g009170.2.1 (Solyc04g009170.2)
0.47 0.79 -0.18 0.27 0.11 -0.03 2.33 -0.17 0.61 -0.3 0.31 0.04 0.78 0.66 0.06 -0.43 -0.46 -4.93 -4.71 -2.53 -1.38 -0.79 -0.08 -0.44 -0.55 -4.18 0.27 -0.01 0.08 -0.67 -0.31 -1.03 -1.12 0.16
Solyc04g074040.3.1 (Solyc04g074040.3)
0.2 0.6 -0.57 -0.27 0.51 0.21 1.47 -0.04 0.18 -0.15 0.53 0.86 0.84 0.72 -0.59 -0.59 -0.64 -7.48 -6.02 -0.15 -0.39 -0.23 -0.19 -0.34 -0.45 -0.16 0.02 -0.2 -0.28 -0.27 -0.24 -0.38 -0.47 0.11
Solyc04g074980.3.1 (Solyc04g074980.3)
0.03 -0.32 -0.12 0.55 0.05 -0.85 1.52 -0.81 0.13 0.5 0.51 -0.12 0.08 -0.21 0.12 0.12 -0.05 -5.41 -4.27 -1.77 -1.13 -0.1 0.31 -0.04 -0.42 -0.59 0.74 0.6 0.18 0.29 0.29 -0.15 -2.12 0.64
Solyc04g075000.1.1 (Solyc04g075000.1)
-0.22 1.46 -0.76 -0.85 0.54 -1.27 2.84 -0.58 0.46 -1.14 1.52 0.69 -2.39 -2.09 -2.11 -3.73 -3.52 -7.83 -9.2 -1.13 -0.27 0.11 0.6 0.77 0.33 -3.59 -0.64 -0.7 -0.69 -0.71 -0.09 -1.08 -3.12 0.55
Solyc04g082470.2.1 (Solyc04g082470.2)
-0.34 0.8 -0.95 -0.36 -1.9 -0.88 1.89 -0.67 -0.43 -0.27 1.02 0.6 1.33 0.87 -0.38 -0.71 -0.62 -5.55 -4.35 0.4 0.57 -0.52 -0.42 -0.5 -0.63 0.49 -0.3 -0.35 -0.35 -0.44 -0.33 -0.55 -0.15 -0.05
Solyc05g009600.3.1 (Solyc05g009600.3)
0.02 0.47 -0.11 0.97 -1.21 -0.46 1.13 -0.09 0.1 -0.37 -0.13 -0.25 -0.07 -0.12 0.21 0.02 0.04 -4.12 -3.95 -0.36 -0.37 0.21 -0.05 0.06 -0.2 0.05 0.29 0.31 0.11 0.37 0.4 0.09 -0.25 -0.05
Solyc05g013700.3.1 (Solyc05g013700.3)
-0.4 0.04 -0.44 0.42 0.61 -0.16 1.64 -0.7 -0.22 -0.34 0.6 0.55 0.94 0.85 -0.29 -0.73 -0.63 -3.05 -2.56 0.01 0.38 -0.38 0.08 -0.1 -0.46 -0.46 0.05 -0.06 -0.14 -0.36 -0.18 -0.56 -2.27 0.39
Solyc05g015500.3.1 (Solyc05g015500.3)
0.49 -0.09 -0.36 -0.85 0.59 -0.19 1.66 -0.86 -0.26 0.48 0.74 -0.17 0.68 0.27 -0.82 -1.18 -1.06 -3.53 -3.71 0.21 -0.18 0.03 -0.24 -0.12 -0.14 0.61 -0.13 0.0 0.1 0.02 0.06 0.39 -1.23 -0.08
Solyc05g018340.3.1 (Solyc05g018340.3)
0.03 0.47 -0.43 0.03 0.1 -0.2 1.9 -0.14 0.33 -0.69 0.85 0.94 0.96 1.01 -0.71 -0.96 -0.92 -3.79 -2.81 -0.39 -0.34 -0.34 -0.24 -0.35 -0.54 -0.65 -0.13 -0.2 -0.4 -0.3 -0.12 -0.59 -1.35 0.25
Solyc05g049950.3.1 (Solyc05g049950.3)
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Solyc05g054920.3.1 (Solyc05g054920.3)
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Solyc05g056100.3.1 (Solyc05g056100.3)
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Solyc06g005860.2.1 (Solyc06g005860.2)
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Solyc06g008860.3.1 (Solyc06g008860.3)
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Solyc06g035430.3.1 (Solyc06g035430.3)
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Solyc06g061000.3.1 (Solyc06g061000.3)
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Solyc06g062850.3.1 (Solyc06g062850.3)
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Solyc06g072040.1.1 (Solyc06g072040.1)
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Solyc07g054850.3.1 (Solyc07g054850.3)
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Solyc07g065690.3.1 (Solyc07g065690.3)
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Solyc08g044280.1.1 (Solyc08g044280.1)
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Solyc08g067040.3.1 (Solyc08g067040.3)
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Solyc09g011360.3.1 (Solyc09g011360.3)
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0.16 1.21 -1.36 -0.31 0.05 -0.55 2.23 0.15 1.14 -1.76 -0.46 0.06 -0.09 1.03 -2.1 -4.42 -3.26 -5.7 -7.5 -4.37 -1.23 0.11 0.71 0.11 -0.39 -2.93 0.9 0.37 -0.03 0.24 0.63 -0.65 -2.31 0.38
Solyc11g040370.2.1 (Solyc11g040370.2)
0.4 0.58 -0.68 -0.49 -0.22 -0.31 1.25 -0.5 0.53 -0.38 0.71 0.4 0.88 0.63 -0.08 -0.24 -0.2 -5.97 -5.84 -0.2 -0.13 -0.14 -0.1 -0.15 -0.4 0.1 -0.03 -0.06 -0.24 -0.1 0.09 -0.11 -1.56 0.53
Solyc11g068740.2.1 (Solyc11g068740.2)
0.65 0.61 -0.48 0.59 -0.54 -0.18 2.19 -0.38 0.49 -0.52 0.54 -0.02 -0.81 -0.01 -0.43 -0.86 -0.78 -4.73 -3.6 -0.07 -0.16 -0.3 0.0 -0.18 -0.33 -0.35 0.22 -0.05 -0.18 -0.22 0.04 -0.3 -0.63 0.27
Solyc11g069460.2.1 (Solyc11g069460.2)
0.72 -0.84 -0.42 -0.93 -0.1 0.01 2.13 -0.02 0.96 -1.07 0.99 1.12 1.11 1.12 -1.24 -1.93 -1.78 -11.03 -11.76 -1.52 -0.52 -0.6 0.48 -0.2 -0.83 -1.27 -0.36 -0.68 -1.06 -0.83 -0.2 -1.39 -0.92 1.1
Solyc12g009030.2.1 (Solyc12g009030.2)
0.71 0.56 -0.41 -0.52 -1.15 -0.17 1.39 0.22 0.04 -0.5 -0.24 -0.34 -0.21 -0.13 0.14 -0.21 -0.26 -4.05 -4.55 -0.57 -0.3 0.21 0.24 0.15 0.1 -0.63 0.51 0.29 0.14 0.39 0.44 0.02 -0.11 0.3
Solyc12g014210.2.1 (Solyc12g014210.2)
-0.58 0.74 -0.22 -0.4 1.06 0.19 2.19 -0.15 -0.35 -0.14 0.43 -0.16 0.42 0.27 -0.66 -1.12 -0.99 -8.77 -11.13 -0.57 0.09 -0.3 0.04 -0.15 -0.45 -0.43 0.25 -0.02 -0.28 -0.21 -0.06 -0.39 -0.27 -0.12
Solyc12g014230.2.1 (Solyc12g014230.2)
-0.27 1.63 -0.86 -0.84 -0.95 -0.81 1.78 -0.45 0.02 -0.97 1.15 0.89 1.47 1.24 -1.46 -2.4 -2.14 -4.56 -3.79 -0.04 0.98 -0.64 -0.38 -0.6 -0.81 -1.28 -0.11 -0.32 -0.38 -0.52 -0.3 -0.7 -1.08 -0.02
Solyc12g035650.2.1 (Solyc12g035650.2)
0.23 0.82 -0.44 -0.4 0.08 -0.17 1.54 -0.05 0.28 -0.73 0.62 0.64 0.56 0.77 -0.88 -1.55 -1.34 -6.63 -7.25 -1.0 -0.29 0.19 0.25 0.23 -0.01 -1.17 0.45 0.34 0.11 0.26 0.38 -0.15 -2.58 -0.27
Solyc12g087970.2.1 (Solyc12g087970.2)
0.12 -0.66 -0.12 -0.23 0.54 -0.32 1.57 -0.64 0.26 -0.28 0.3 0.14 0.38 0.36 -0.2 -0.23 -0.33 -9.0 -9.81 -0.36 0.16 0.03 0.03 -0.0 -0.25 0.21 0.42 0.19 -0.1 0.23 0.3 -0.04 -1.83 0.25
Solyc12g095960.2.1 (Solyc12g095960.2)
0.16 0.39 -0.63 -0.63 -1.24 -0.74 1.98 -0.42 -0.03 0.03 0.69 0.1 0.99 0.7 -0.42 -0.83 -0.67 -7.92 -8.4 -0.11 0.51 -0.13 -0.23 -0.18 -0.39 0.27 -0.04 -0.05 -0.14 -0.13 0.04 0.0 -0.69 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.