Heatmap: Cluster_217 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-3.05 3.57 0.66 - - - 1.0 0.96 3.15 1.67 -3.02 - -0.39 -1.8 -0.78 0.25 0.06 - - - - - - - - 1.05 - - - 0.58 0.45 -2.87 -0.88 -2.11 - -2.01 -2.1 0.62 - -0.87 0.37 -0.37 0.1 -3.08 -2.69 0.05 -0.27 -0.36
-1.9 3.82 1.2 0.56 -5.59 - - - 3.82 - - - - - -5.81 3.31 2.02 -1.69 - - - - - -4.35 - 0.38 - - - -7.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.34 1.3 2.37 - - - - 3.52 - - - - - -4.19 0.53 1.86 - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.02 - - - - - - - - - - - 4.76 2.56 - - - - - - - - 3.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.83 3.06 1.99 - - - - 3.24 - - - - - - - 2.64 -0.12 - - - - - - - 2.27 - - - -4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.04 3.76 -0.55 1.89 -2.35 -3.7 -0.7 -1.87 3.25 -1.9 -2.07 -2.91 - -2.29 -0.01 0.54 1.71 -1.07 -0.78 -2.53 -2.84 -1.6 - -2.42 -3.33 2.14 -3.13 - -2.62 -1.34 -0.48 -1.51 -5.66 -2.79 -3.37 -4.77 - -0.13 -4.07 -1.92 -1.06 -2.8 -0.59 - -3.16 -0.08 -2.11 -1.52
0.64 2.48 2.16 0.17 -2.47 - - - 3.16 - - - - - -5.15 3.53 2.3 1.03 - - - - - -2.32 -1.78 2.26 -3.71 - -2.27 -4.58 - - - - 0.87 - - -2.9 - - - - - - - - - -
0.98 3.18 - - - - - - - - - - - - -2.21 1.49 3.03 1.77 - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.25 2.02 0.96 - - - - 4.01 - - - - - - 3.35 1.78 - - - - - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.92 - - - - - - 3.39 -0.5 0.18 0.02 1.31 - -2.82 - 2.54 1.77 - - - 0.31 - - 1.61 - - - - -1.01 - 0.15 -1.69 - - - 0.87 - - 1.05 0.68 - - - - 1.44 - -0.29
- 3.45 - - - - - - - - - - - - -2.55 3.17 3.08 - - - - - - - - 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.33 1.91 - - - - - - - - - - -2.37 3.96 1.74 - - - - - - 0.5 - 4.46 - - - -1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.49 0.68 0.85 - - - - 0.0 - - - - -3.14 4.14 3.6 1.84 - - - - - - - 2.85 - - - -2.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.7 2.93 1.87 1.34 -2.02 - - - 2.05 - - - - - - 3.43 3.18 -1.04 - - - - - -1.87 - 1.43 - - - -5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.49 - - - - - - 3.44 - - - - - -0.93 - - - - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.77 - 1.0 - - - - 3.93 - - - - - - - -0.66 0.42 - - - - - - - 0.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.85 0.96 2.1 - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.28 0.29 2.71 - - - - 0.62 - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.24 1.83 - 0.2 1.06 2.64 1.84 3.12 - - - - - -5.35 3.15 -0.58 -0.86 - - - -2.57 0.64 -1.22 - -0.71 - - - -3.34 - - - -3.92 - - - - - - - - - - - -2.71 - -3.73
- 3.59 0.76 0.22 -1.71 0.56 -1.94 - 3.69 - - - - - - 0.55 2.23 -0.81 - - - - - -0.36 - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.1 0.08 0.45 - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.64 - -0.51 - - - 2.43 - - - - - - 4.06 3.37 -0.95 - - - - - - - 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.48 2.97 -1.79 -1.11 -2.66 - -0.32 0.37 2.55 -1.97 -1.44 - -3.34 -3.66 -2.6 3.18 1.1 -0.31 - - - -3.1 - - -1.36 1.39 -1.6 -3.02 -2.07 -1.59 -2.02 -2.76 - -2.61 - - -10.28 0.44 -2.71 - - -2.35 - - -2.96 -1.46 -3.57 -2.64
- 2.31 2.14 -0.54 - - - - 3.27 - - - - - -3.77 2.87 3.02 0.61 - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.2 - 2.05 -0.24 - - - - - - - - - - 2.17 1.05 1.4 - - - - - 2.29 - 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.44 2.03 2.01 0.28 -0.81 - - - 3.8 - - - - - -4.4 3.54 2.83 -0.33 - - - - - - - 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.27 - -0.67 - - - - 3.84 - - - - - - 3.41 0.62 -3.1 - - - - - - - 0.5 - - - -5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.71 1.19 -0.18 - - - - 3.12 - - - - - -4.0 - 2.58 - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.56 2.56 -3.28 -0.91 -2.11 0.11 0.73 0.34 2.96 -0.8 -2.95 -2.46 -1.77 -1.67 -2.46 -1.47 0.4 -1.43 - -2.27 -4.67 -3.67 - -2.19 -2.18 -0.62 -2.35 1.45 0.92 0.07 -0.14 -1.61 -0.08 1.27 -1.11 1.39 0.2 0.59 -0.63 -0.55 -3.49 -1.63 -1.32 0.28 -1.18 0.67 1.0 -0.8
- - 2.07 - - - - - 3.43 - - - - - - 3.92 3.09 - - - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.04 1.44 1.14 -1.82 0.18 1.06 - 3.75 - - - - - -2.17 -0.21 2.58 -0.84 - -0.59 - -0.72 - - - 3.16 - - - -3.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.35 -1.6 - -2.08 1.12 1.65 -0.15 1.59 -2.93 -1.97 - -2.42 -1.82 -2.98 3.94 0.74 0.8 -0.85 -1.84 - -1.59 - -0.84 -0.81 2.76 - -1.87 - -3.0 -1.33 - -3.03 - -1.81 -1.0 -1.41 - - -1.59 -0.04 - - - - -0.11 - -
0.11 4.17 0.06 1.38 1.57 -2.01 1.58 2.03 2.54 -1.42 - -4.07 - - -3.88 0.82 1.67 -1.25 - - - - - - -2.12 1.41 -2.65 - - -4.34 -3.39 - - - - - - - - - - -2.57 - - - - - -
- 3.97 3.29 - 1.88 - - - 3.87 - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.72 - - - 0.63 - - - - - - - - - - 4.9 - - - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.34 -3.65 - -0.81 - - - 2.46 - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.85 0.67 -0.15 -0.95 -1.95 0.66 1.83 - -1.91 0.14 -0.23 -0.84 -1.79 -2.0 3.04 0.8 0.84 - -1.37 - 1.51 - -1.18 0.39 2.54 0.44 - -0.88 -2.13 -3.67 -1.37 -2.55 -2.98 - - - -0.97 -2.26 - -2.43 -2.77 -0.9 -0.4 -2.84 -1.19 - -0.56
- - 0.44 2.81 - - - - 3.5 - - - - - - 3.24 - - - - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.61 - - - - - - - - - - - - 3.92 3.63 - - - - - - - - 4.22 - - - -2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.69 1.26 2.46 - - - - 2.28 - - - - - - 2.02 0.69 -1.92 - - - - - -1.81 - 1.69 - - - -5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.95 - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.15 0.26 0.99 - - - - 3.8 -0.73 - - - - - - 2.39 1.74 - - - - - - - 1.75 - - - -3.33 -1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.65 1.44 -0.41 0.57 -2.37 -1.33 0.71 0.09 2.89 -1.68 -1.76 -1.06 -1.59 -2.38 -1.05 -0.74 1.69 1.42 1.16 0.46 1.12 0.01 -2.91 -2.81 -0.03 2.9 -1.57 -1.78 0.33 0.39 -2.46 -2.92 -2.91 -1.36 -2.75 -4.35 -2.36 -2.08 -4.5 -2.03 -1.87 -1.37 -1.76 -1.92 -2.13 -2.39 -1.35 -0.67
1.38 3.62 0.94 0.26 -2.89 - - - 4.05 - - - - - -4.54 2.22 2.11 -1.44 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.97 3.7 0.81 0.6 -2.98 -1.43 0.57 0.01 1.6 1.33 -1.66 -0.18 1.29 -0.29 0.23 - -0.13 -2.39 - - - - - -2.25 - 2.01 -4.78 - -3.56 -1.05 -0.3 -4.54 -4.82 -4.56 - -3.41 - 1.56 - -0.31 -0.2 -0.11 -1.17 - -4.75 1.05 -4.31 -1.02
- 3.44 2.83 - - - - - - - - - - - -1.57 - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.32 - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.24 1.62 2.09 -2.46 - - - - - - - - - -2.75 0.93 2.76 -0.37 - - - - - - -1.75 3.47 -1.65 - - -2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.0
- 3.37 2.18 2.75 -0.42 - - - - - - - - - -3.37 - 2.67 1.05 - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.5 3.15 - - - - - - - - - - -2.91 - 2.71 0.51 - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.67 - 0.46 0.76 - - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 0.89 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.53
- 2.68 -1.97 1.02 -5.56 -3.61 - - 2.85 - - - - - -6.27 - 0.25 1.74 0.8 -1.57 -2.61 1.28 - -0.13 0.44 4.34 -2.35 - - -7.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.75 1.26 3.11 - - - - 3.81 - - - - - - - 2.85 -0.32 - - - - - - - 0.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.08 -1.96 2.29 -0.85 -1.62 1.11 -0.06 - - - - - - -4.8 4.6 1.9 -0.78 - - - - - - - 2.96 -2.65 - - -5.49 - - - - - - - - - - - -2.21 - - - - - -
- 4.05 1.31 1.16 - - - - - - - - - - -4.31 - 2.65 1.75 -0.02 -1.01 - 0.86 - 0.85 - 3.56 - - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.53 2.89 -1.11 1.69 -0.74 1.01 2.06 0.8 3.69 -2.06 -0.59 -0.94 -1.45 -1.8 -1.69 -1.01 -0.34 -2.32 -2.38 -4.14 -4.11 -4.16 -1.73 -5.16 -2.17 -0.25 -1.42 0.24 -3.22 -1.12 -1.87 -0.99 -2.0 -1.83 -1.59 -1.77 -2.45 -2.2 -3.61 -1.37 -1.26 -2.37 -3.4 -1.67 -2.76 -2.0 -1.84 -1.88
- 3.78 - 0.08 - - - - 3.65 - - - - - - 3.49 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.16 1.61 - - - - - - - - - - - 4.73 1.54 - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.6 0.07 - - - - - 2.78 - - - - - - 3.22 3.57 - - 1.72 - - - - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.56 2.45 -1.37 1.71 -0.02 -2.27 0.95 0.72 0.23 -1.17 0.03 -1.86 -0.72 -1.03 -1.72 3.08 1.77 0.02 -3.36 - - -3.47 - -0.43 -2.15 3.25 -2.65 - - -1.81 -0.09 -2.17 -4.17 - - - -2.92 -1.09 - -1.18 -1.3 -1.13 -1.39 -4.9 - -1.11 -2.83 -2.26
- 4.72 -0.44 0.14 - - - - 2.98 - - - - - -3.59 2.41 1.39 -0.28 - - - - - -2.33 - 1.51 - - - -4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.62 -0.09 1.61 - - - - 3.09 - - - - - - 2.26 3.21 - - - - - - - - 3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.55 3.54 0.87 0.09 -1.46 -3.4 0.46 0.22 1.95 0.9 -2.64 -1.73 0.96 -0.41 -0.2 -1.98 1.28 -0.26 -3.02 -4.72 -0.77 -1.07 - -1.38 -5.07 3.23 - - -4.5 -1.99 -1.09 -2.74 -4.85 - - - -5.23 0.4 - -2.27 -0.31 -0.54 -2.62 -3.98 -5.52 0.47 -4.08 -2.57
- 2.88 1.02 - -2.07 - - - 3.89 -2.74 - - - -0.93 - 2.41 1.23 -2.64 - - - - - - -1.85 0.7 - - -0.71 -1.05 -2.05 - -0.02 -0.86 - -0.64 0.67 1.88 - - - - - -1.58 - 1.23 0.71 -
- 4.52 -0.16 - - - -2.55 - 3.76 -1.36 - -2.96 - - -6.87 0.5 1.15 -2.65 0.03 -2.24 0.04 -2.29 - -0.74 - -1.1 - - - -3.86 -3.28 - - - - - -2.53 0.25 - - - - - -3.09 - -0.28 - -4.13
- 4.76 - - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.98 -1.76 -1.78 -1.27 0.16 1.8 2.02 3.58 0.61 - - -1.28 -2.4 -1.14 - -0.45 -3.33 - - - -2.2 - - - 0.03 - 2.28 -0.02 -0.26 0.12 - -0.99 -0.85 -4.55 0.29 -0.4 -2.96 -2.66 -1.54 - -4.17 -3.91 -0.55 - -2.86 2.34 -1.82
- 4.41 - -0.62 - - - - 4.21 - - - - - - - - -1.05 - - - - 2.15 - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.4 3.16 - - - - - - - 2.31 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.67 2.0 1.44 - - - - 3.87 - - - - - -4.62 0.17 -0.55 2.66 - -0.29 - - - 1.15 - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.55 - -
- - - - 1.84 - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.07 - - - - - - - - - - 4.51 2.71 - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.61 2.02 2.46 - - - - 2.61 - - - - - -4.76 2.38 3.45 -1.75 - - - - - -1.67 - 1.77 - - - -7.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.09 3.38 0.06 1.19 - - - - - - - - - - -4.88 4.07 1.21 - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.23 - - - - - - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.