Heatmap: Cluster_141 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g028810.3.1 (Solyc01g028810.3)
-1.81 -0.05 -1.74 -1.71 0.2 0.73 0.4 1.22 -0.39 -0.78 0.05 0.11 0.0 -0.02 -1.47 -2.08 -2.2 -9.28 -8.83 -0.32 -0.2 0.72 0.68 0.72 0.64 -0.45 0.95 0.78 0.48 0.7 0.58 0.52 -0.68 -1.57
Solyc01g058190.3.1 (Solyc01g058190.3)
-1.19 -1.03 -2.03 -3.11 0.82 1.53 -0.35 1.26 -0.02 -0.33 0.52 0.28 1.24 0.76 -0.52 -0.78 -0.75 - - 0.55 -0.44 -0.1 -0.29 -0.27 -0.38 0.32 0.29 0.02 -0.3 0.01 0.03 -0.23 0.47 -1.3
Solyc01g095740.3.1 (Solyc01g095740.3)
-0.72 0.99 -1.25 -1.33 -0.69 0.89 0.39 1.35 -0.05 -0.18 0.87 0.58 1.47 1.3 -0.62 -1.48 -1.52 -6.62 -5.36 -0.45 0.46 -0.26 -0.28 -0.22 -0.55 -0.87 0.04 -0.01 -0.41 -0.19 0.0 -0.47 -1.12 -0.34
Solyc01g097670.3.1 (Solyc01g097670.3)
-1.06 0.4 -1.05 -1.75 0.77 1.32 0.62 1.21 0.25 -1.16 0.6 0.38 0.38 0.71 -2.03 -3.7 -2.72 - - -0.07 0.36 0.26 0.02 0.01 -0.2 0.23 0.34 0.43 -0.04 0.19 0.47 -0.05 -2.08 -0.5
Solyc01g103450.3.1 (Solyc01g103450.3)
-1.0 -0.74 -1.23 -1.98 0.71 0.81 0.27 0.97 -0.32 -0.48 -0.36 -0.68 -0.06 -0.27 -0.83 -0.85 -1.1 -7.39 -7.89 0.03 -0.08 0.49 0.51 0.46 0.4 0.32 0.84 0.75 0.51 0.52 0.3 0.36 0.35 -0.91
Solyc02g062350.3.1 (Solyc02g062350.3)
-1.08 0.29 -0.78 -0.74 -0.68 0.96 -0.5 1.85 -0.13 -0.6 -0.78 -1.01 -1.3 -1.23 -0.75 -1.12 -1.19 -6.18 -4.86 -0.57 -1.54 0.64 0.51 0.51 0.41 -0.39 0.88 0.62 0.21 0.77 0.72 0.14 1.21 -1.24
Solyc02g070390.3.1 (Solyc02g070390.3)
-2.27 -1.11 -1.76 -2.83 0.89 1.76 -1.05 1.76 -0.02 -0.28 -0.42 -0.03 0.54 0.2 -0.96 -1.56 -1.28 -5.3 -4.39 0.6 -0.09 0.16 -0.25 -0.22 -0.38 1.06 0.41 0.23 0.01 0.25 0.44 0.06 -0.34 -1.66
Solyc02g081920.3.1 (Solyc02g081920.3)
-1.88 -0.72 -1.97 -2.58 0.5 1.43 0.7 1.93 0.33 -0.51 -0.48 -0.52 0.18 -0.1 -1.19 -2.49 -2.27 -5.7 -7.05 -0.93 -1.02 0.61 0.51 0.39 0.21 -1.18 0.9 0.56 0.39 0.49 0.79 0.28 -0.43 -2.06
Solyc02g082030.3.1 (Solyc02g082030.3)
-0.54 0.08 -0.69 -0.07 0.72 0.76 0.56 0.65 0.21 -0.26 -0.12 -0.05 0.06 -0.14 -0.36 -0.7 -0.71 -5.76 -7.55 -0.47 -0.41 0.51 0.2 0.32 0.23 -0.29 0.37 0.4 0.11 0.6 0.51 0.21 -0.63 -0.42
Solyc02g091640.3.1 (Solyc02g091640.3)
-1.34 -0.68 -1.54 -2.75 0.62 1.29 0.11 1.4 -0.01 -0.49 -0.29 -0.44 -0.01 -0.17 -1.31 -1.9 -2.2 -10.4 -11.98 -0.75 -0.45 0.8 0.4 0.55 0.47 -1.07 0.87 0.75 0.56 0.86 0.87 0.55 -0.68 -1.57
Solyc03g005180.1.1 (Solyc03g005180.1)
-0.18 1.19 -1.29 -0.33 -0.67 0.95 0.47 0.73 0.19 -0.41 1.12 0.87 0.92 0.7 -2.04 -2.1 -1.85 - -9.12 -1.77 -1.01 0.3 0.37 -0.01 -0.55 -0.92 0.56 0.12 -0.09 0.2 0.4 0.02 -1.8 0.11
Solyc03g007110.3.1 (Solyc03g007110.3)
-1.01 0.42 -1.09 -0.49 -0.41 1.08 -0.29 1.55 0.14 -1.18 -0.54 -0.39 -0.77 -0.45 -0.96 -1.5 -1.49 -6.46 -6.38 -0.39 -1.21 0.65 0.36 0.47 0.49 -0.23 0.67 0.57 0.45 0.74 0.7 0.6 0.49 -1.1
Solyc03g034190.3.1 (Solyc03g034190.3)
-1.58 -0.96 -1.38 -1.43 -0.15 0.99 -0.84 1.79 0.26 -0.93 -1.7 -1.51 -1.77 -1.79 -0.61 -0.95 -1.21 -6.16 -6.86 -0.98 -2.25 0.54 0.81 0.67 0.62 -0.64 1.3 0.92 0.53 0.58 0.74 -0.1 1.61 -1.92
Solyc03g095180.3.1 (Solyc03g095180.3)
-2.2 -0.27 -2.44 -2.23 1.09 1.46 -0.4 1.77 0.31 -1.56 -0.71 -0.44 -1.48 -1.58 -1.75 -3.27 -2.54 -9.9 -9.92 -1.91 -1.72 1.16 0.45 0.71 0.61 -1.91 0.97 0.76 0.24 1.2 1.23 0.66 -1.24 -2.28
Solyc03g111050.3.1 (Solyc03g111050.3)
-2.15 -1.01 -2.24 -3.59 1.01 1.82 -0.08 1.87 0.17 -0.11 0.43 -0.32 0.44 -0.1 -0.44 -0.42 -0.78 - - -1.96 -1.94 0.47 0.25 0.07 -0.33 -0.92 0.87 0.36 -0.17 0.48 0.64 -0.04 -0.76 -1.8
Solyc03g111210.3.1 (Solyc03g111210.3)
0.92 0.55 -1.04 0.06 0.93 1.06 0.82 0.74 -1.28 -0.73 0.42 -0.21 0.44 -0.08 -1.36 -1.67 -1.83 -5.73 -6.02 -1.02 -0.09 0.31 -0.19 -0.02 0.03 -0.52 0.45 0.41 0.18 0.31 0.35 0.17 -0.72 -0.3
Solyc03g115570.1.1 (Solyc03g115570.1)
-0.11 1.64 -1.39 0.04 0.02 0.6 0.67 0.26 -0.85 -0.17 0.93 0.53 0.56 0.88 -0.93 -1.88 -1.43 -1.96 -4.59 -0.66 -0.02 -0.25 -0.11 -0.42 -0.55 -0.62 0.37 0.0 -0.2 -0.06 0.48 -0.22 -1.27 0.49
Solyc03g120470.3.1 (Solyc03g120470.3)
-0.36 1.25 -0.64 -0.9 -0.62 0.25 0.97 0.79 -0.2 -0.64 0.79 0.18 1.29 0.84 -0.6 -1.1 -1.57 -4.56 -4.21 -0.49 -0.2 0.08 0.13 0.01 -0.27 -0.17 0.23 0.13 -0.09 0.08 0.19 -0.08 -1.65 -0.25
Solyc03g120670.3.1 (Solyc03g120670.3)
-0.52 -0.92 -0.82 -0.77 0.77 1.38 0.08 0.57 -0.11 -0.73 -0.8 -0.64 -0.74 -0.9 -0.2 -0.14 -0.37 -6.68 -7.69 -0.54 -1.07 0.46 0.42 0.49 0.52 -0.2 0.61 0.75 0.58 0.48 0.44 0.16 0.51 -0.43
Solyc03g123880.3.1 (Solyc03g123880.3)
-0.61 -0.63 -0.56 -0.55 -0.35 0.77 -0.35 1.67 0.01 -0.46 -0.82 -0.8 -0.54 -0.72 -0.23 -0.19 -0.42 -7.14 -5.86 -0.29 -1.58 0.56 0.35 0.41 0.28 -0.16 0.9 0.71 0.41 0.77 0.72 0.25 0.08 -1.21
Solyc04g008710.3.1 (Solyc04g008710.3)
-0.96 -0.01 -1.81 -1.31 0.4 0.97 -0.75 1.07 -0.55 -0.92 0.67 0.91 0.2 0.29 -1.55 -1.94 -2.06 -5.82 -6.45 0.26 0.0 0.43 0.04 0.25 0.59 -0.58 0.28 0.33 0.32 0.55 0.42 0.68 0.54 -1.37
Solyc04g009200.3.1 (Solyc04g009200.3)
-1.73 -2.65 -1.73 -2.08 0.56 1.28 -1.18 1.78 -0.48 -1.46 -1.87 -1.51 -1.37 -1.57 -1.82 -2.53 -2.38 -7.4 -7.46 -2.08 -1.72 0.94 0.59 0.7 0.5 -2.73 1.38 1.33 0.75 1.39 1.06 0.52 0.77 -1.55
Solyc04g009940.3.1 (Solyc04g009940.3)
-1.33 0.4 -0.94 -0.87 -0.77 0.76 -0.07 1.97 -0.16 -0.13 -1.11 -1.16 -1.4 -1.82 -0.14 -0.48 -0.44 -11.92 -11.04 -1.18 -1.48 0.69 0.46 0.6 0.53 -0.46 0.94 0.67 0.27 0.79 0.73 0.24 0.24 -1.37
Solyc04g054460.3.1 (Solyc04g054460.3)
-1.28 -0.68 -1.05 -1.17 1.01 0.98 -0.59 1.06 0.04 -0.78 -0.31 -0.07 -0.48 -0.48 -0.72 -0.82 -0.68 -6.54 -6.35 -0.2 -0.49 0.61 0.56 0.53 0.56 -0.48 0.84 0.64 0.45 0.72 0.71 0.5 -0.87 -1.02
Solyc04g082310.3.1 (Solyc04g082310.3)
-0.97 -0.26 -1.82 -1.72 -0.57 0.64 -0.45 1.49 0.22 -0.37 -0.63 -0.6 -0.29 -0.46 0.01 -0.43 -0.45 -8.43 -8.29 -0.9 -0.89 0.75 0.55 0.56 0.52 -0.71 0.9 0.78 0.44 0.93 0.75 0.45 -0.15 -1.09
Solyc05g006130.3.1 (Solyc05g006130.3)
-1.7 0.63 -1.01 -1.52 0.14 1.58 -0.01 1.43 -0.37 -0.98 0.19 0.47 0.82 0.91 -0.26 -0.99 -1.0 - - -1.46 -0.1 0.07 0.18 0.07 -0.08 -1.13 0.61 0.2 0.09 0.03 0.33 -0.22 -0.01 -1.16
Solyc05g006800.1.1 (Solyc05g006800.1)
-1.39 -0.46 -1.38 -1.79 1.3 1.06 0.7 1.18 -0.01 -0.06 -0.36 -0.13 0.01 0.03 -0.58 -1.09 -0.93 -3.66 -4.12 -0.14 -0.12 0.28 0.23 0.2 -0.02 0.25 0.55 0.44 0.29 0.24 0.38 0.1 -1.19 -0.48
Solyc05g012100.3.1 (Solyc05g012100.3)
-1.35 -0.03 -1.9 -2.07 0.25 1.57 0.41 1.64 0.1 -0.78 0.46 0.43 0.76 0.66 -1.19 -2.11 -2.15 -8.77 -8.75 -0.08 -0.44 0.15 0.24 0.13 -0.18 -0.25 0.55 0.21 -0.11 0.18 0.38 -0.19 -0.44 -0.77
Solyc05g056295.1.1 (Solyc05g056295.1)
-0.41 0.32 -1.67 0.52 -0.48 0.37 -0.29 1.42 0.28 -0.73 -0.89 -0.91 -1.26 -0.99 -0.09 -0.49 -0.51 -6.07 -4.87 -0.5 -1.65 0.56 0.56 0.66 0.45 -0.36 0.81 0.56 0.3 0.68 0.78 -0.01 0.46 -0.62
Solyc06g007760.3.1 (Solyc06g007760.3)
-4.2 -3.48 -2.07 -3.07 0.28 1.09 -1.49 1.72 0.19 -0.77 -0.96 -1.06 -1.04 -1.15 -0.51 -0.76 -0.88 -10.7 -11.61 -1.71 -1.93 0.89 0.44 0.6 0.48 -1.9 1.33 1.06 0.74 1.11 0.99 0.49 1.09 -3.32
Solyc06g071960.3.1 (Solyc06g071960.3)
-2.52 -1.2 -3.54 -2.54 0.25 1.24 -0.45 1.75 0.07 -1.16 -1.19 -0.45 -1.62 -1.24 -1.13 -1.65 -1.76 -7.19 -6.4 -2.42 -2.87 1.01 0.82 0.72 0.58 -2.45 1.1 0.84 0.41 1.13 1.13 0.43 1.25 -2.69
Solyc07g042250.3.1 (Solyc07g042250.3)
-1.48 0.69 -1.55 -0.89 -0.25 0.89 0.24 1.52 -0.25 -1.27 -0.25 0.35 -1.05 -0.43 -1.38 -1.98 -2.37 -8.37 -9.05 0.24 -1.13 0.63 0.78 0.64 0.5 -0.42 1.07 0.77 0.41 0.57 0.56 0.15 -0.21 -1.8
Solyc07g066470.3.1 (Solyc07g066470.3)
-2.14 -2.25 -0.73 -1.53 0.28 1.27 -0.87 1.85 -0.31 -1.49 -2.15 -1.56 -2.54 -2.03 -1.09 -1.91 -1.93 -7.0 -6.16 -0.35 -1.79 0.9 0.52 0.63 0.53 -0.4 1.18 0.94 0.39 1.17 0.95 0.39 1.21 -2.14
Solyc08g016170.3.1 (Solyc08g016170.3)
-1.1 0.56 -0.62 1.0 -1.25 0.52 -0.58 1.64 -0.66 -0.52 -1.07 -0.57 -1.46 -1.02 -0.11 -0.77 -0.67 -4.05 -2.59 -0.48 -0.86 0.54 0.61 0.76 0.68 -0.78 0.73 0.52 0.3 0.58 0.42 0.13 0.15 -0.78
Solyc08g062610.3.1 (Solyc08g062610.3)
-1.68 -1.5 -2.73 -3.41 1.69 1.49 -0.67 0.9 -0.22 -0.3 -0.45 0.09 0.1 -0.17 0.21 0.05 0.19 -7.78 -8.0 -0.18 -0.69 0.15 0.07 0.01 0.06 0.67 0.49 0.29 0.19 0.18 0.26 -0.15 0.29 -1.98
Solyc08g069030.3.1 (Solyc08g069030.3)
-0.89 -1.84 -0.17 -1.1 0.16 1.01 -0.85 1.32 -0.05 -0.43 -0.67 -0.24 -0.77 -0.46 -0.63 -0.81 -0.7 -8.61 -9.56 -0.6 -1.22 0.76 0.39 0.45 0.23 -0.48 1.0 0.84 0.42 1.04 0.87 0.63 -0.47 -0.6
Solyc08g079660.3.1 (Solyc08g079660.3)
-1.13 -0.02 -0.49 -0.52 -0.37 0.91 -0.99 1.73 -0.57 -0.95 -0.55 -0.31 -1.18 -0.86 -0.8 -1.22 -1.21 -4.99 -5.16 -0.52 -0.96 0.57 0.47 0.49 0.48 -0.35 0.93 0.63 0.33 0.71 0.72 0.18 1.16 -1.06
Solyc08g081170.3.1 (Solyc08g081170.3)
-1.48 -0.17 -1.38 -2.74 -0.15 1.36 0.59 1.74 -0.11 -0.25 0.58 -0.09 0.83 0.41 -1.13 -1.37 -1.08 - - 0.72 0.48 -0.13 -0.05 -0.08 -0.48 0.07 0.52 0.13 -0.55 -0.08 0.25 0.16 0.01 -2.42
Solyc09g005740.2.1 (Solyc09g005740.2)
-2.33 0.56 -1.69 -1.73 0.38 0.77 -0.33 0.9 -0.26 -1.07 0.48 0.24 0.0 -0.36 -1.89 -2.67 -2.56 -8.43 -9.45 -0.5 -0.02 0.47 0.5 0.51 0.24 -1.55 1.39 1.13 0.75 0.79 0.73 0.11 -0.16 -1.0
Solyc09g009400.3.1 (Solyc09g009400.3)
-1.22 0.14 -2.34 -2.09 0.85 1.22 0.79 0.71 -0.27 -0.86 0.76 0.71 0.94 0.85 -1.71 -2.37 -2.02 - - -0.42 -0.24 0.26 0.04 -0.04 -0.24 -0.81 0.82 0.53 0.18 0.4 0.71 0.18 -1.64 -1.27
Solyc10g005110.3.1 (Solyc10g005110.3)
-1.25 -2.11 -1.82 -1.85 0.05 1.37 -1.22 1.84 0.3 -0.37 -1.33 -1.08 -0.92 -1.1 -0.91 -1.11 -1.15 -9.12 -7.14 -0.93 -1.32 0.76 0.24 0.5 0.41 -1.27 1.03 0.97 0.55 1.04 0.84 0.49 0.88 -1.51
Solyc10g006290.3.1 (Solyc10g006290.3)
-0.82 0.44 -1.62 -0.85 -0.15 0.62 -0.22 1.02 -0.57 -0.44 -0.35 -0.45 -0.52 -0.66 -0.25 -0.58 -0.66 -7.34 -8.56 -0.33 -1.51 0.57 0.58 0.41 0.32 0.22 0.9 0.61 0.38 0.75 0.81 0.51 0.39 -0.41
Solyc10g039270.2.1 (Solyc10g039270.2)
-2.94 -3.44 -1.21 -1.25 0.7 1.32 -0.99 1.39 0.68 -0.23 -1.2 -0.71 -1.72 -1.61 0.02 -0.53 -0.44 -8.66 -9.04 -0.87 -1.38 1.13 0.27 0.59 0.69 -1.47 0.57 0.73 0.55 1.08 1.06 0.67 -0.53 -2.3
Solyc10g045310.2.1 (Solyc10g045310.2)
-2.03 -0.29 -2.15 -2.65 1.47 1.66 -0.23 1.94 -0.26 -0.18 -0.64 -0.76 -0.45 -0.7 -1.19 -2.03 -1.91 - - -2.11 -1.22 0.87 0.26 0.58 0.56 -1.7 0.63 0.55 0.21 0.76 0.8 0.53 -0.99 -2.46
Solyc10g081240.2.1 (Solyc10g081240.2)
-2.09 -0.21 -1.11 -1.54 1.2 1.68 -0.53 1.73 -1.07 -1.47 -0.69 -0.31 -0.84 -0.76 -1.46 -1.68 -2.02 -10.75 -10.78 -0.12 -0.89 0.31 0.6 0.45 0.33 0.15 0.93 0.48 0.11 0.34 0.39 -0.15 0.97 -1.04
Solyc11g008940.1.1 (Solyc11g008940.1)
-0.29 0.8 -1.36 -0.83 0.52 1.07 0.58 0.7 -0.42 -0.67 0.41 0.3 0.73 0.77 0.63 0.45 0.16 -8.63 -9.16 -0.32 -0.37 -0.34 -0.19 -0.38 -0.85 -0.23 0.39 0.11 -0.31 -0.26 -0.07 -0.54 -0.97 -0.15
Solyc11g066920.1.1 (Solyc11g066920.1)
-0.84 1.11 -1.42 -0.96 0.83 1.75 0.81 1.18 0.16 -1.25 0.78 1.03 0.74 0.99 -1.24 -2.21 -2.02 -4.71 -5.2 -0.86 -0.14 -0.37 -0.66 -0.72 -1.04 -1.84 0.27 -0.39 -0.62 -0.45 -0.02 -0.81 0.63 -0.68
Solyc11g069260.2.1 (Solyc11g069260.2)
-2.39 0.28 -1.9 -1.85 0.79 1.55 -0.4 1.23 0.1 -0.44 -0.51 -0.31 -0.96 -1.06 -1.39 -3.0 -1.95 -7.42 -9.38 -1.9 -2.02 0.93 0.3 0.49 0.79 -1.08 0.71 0.83 0.72 0.96 0.94 1.09 -0.57 -2.11
Solyc11g069790.2.1 (Solyc11g069790.2)
-1.03 -0.13 -1.81 -1.92 -0.86 0.61 0.66 1.75 -0.71 -0.61 0.05 -0.46 0.17 -0.37 -0.72 -0.97 -1.26 -8.88 -8.1 0.05 -0.62 0.53 0.89 0.55 0.35 -0.81 1.0 0.36 -0.03 0.49 0.45 -0.08 0.97 -1.59
Solyc11g071960.2.1 (Solyc11g071960.2)
-0.7 0.75 -1.44 -0.9 0.88 1.28 0.03 0.99 -1.17 -1.04 0.36 0.76 0.12 0.1 -2.06 -2.95 -1.89 -9.94 -10.88 -0.78 -0.49 0.67 0.34 0.32 0.38 -1.08 0.6 0.39 0.39 0.59 0.89 0.52 -2.0 -1.07
Solyc12g009250.2.1 (Solyc12g009250.2)
-1.19 -0.03 -1.55 -2.08 0.82 1.13 -0.12 1.45 -0.28 -1.15 -0.16 -0.05 -0.76 -0.47 -1.1 -1.56 -1.43 -10.62 -10.35 -0.8 -0.84 0.73 0.5 0.52 0.52 -1.56 1.06 0.73 0.47 0.82 0.81 0.53 -0.07 -1.59
Solyc12g098990.2.1 (Solyc12g098990.2)
-0.25 -0.84 -1.21 -0.92 0.98 1.07 0.04 0.75 0.01 -0.85 -0.02 0.09 -0.25 -0.16 -0.37 -0.96 -0.8 -6.91 -5.1 -1.6 -0.38 0.61 0.35 0.42 0.26 -1.88 1.01 0.61 0.36 0.67 0.69 0.42 -0.01 -0.83

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.