Heatmap: Cluster_175 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - - 3.16 - - - 2.27 - - - - - - - 3.63 1.91 - - - - - - - - 3.12 - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.11 0.53
- 2.15 2.62 1.36 -3.72 -2.45 -0.23 - 1.25 - - - - - -5.28 4.07 2.83 -0.52 - - - - - -0.66 - 2.59 - - - -5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.65 3.04 1.2 - - - - - - - - - - 4.28 2.29 - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.61 - - - - - - - - - - - 4.98 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.52 -0.39 2.45 - - - - - - - - - - - 4.67 2.22 1.37 - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.32 2.85 - - - - - - - - - - - 3.31 3.9 0.61 - 2.74 - - - 0.72 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.08 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.7 - - - - - - - - - - - 4.38 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.7 -0.6 2.38 2.89 -0.6 - - - 1.56 - - - - - -5.71 3.94 1.53 0.18 - - - - - -0.58 - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.1 2.36 -3.08 - -0.28 - - -1.66 -1.07 0.39 -0.21 -0.74 -0.98 3.69 2.65 1.06 - 0.03 0.62 -1.99 - -0.53 -1.9 0.75 - -0.26 1.12 -1.02 -0.55 - -1.35 - -2.29 - -0.62 0.39 - -0.2 -1.06 - -2.12 -1.5 - -24.28 - -1.84
- - -1.26 2.28 - - - - - - - - - - -3.2 5.07 1.4 -0.78 - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.7 - - - - - - - - - - - 5.09 2.9 0.01 - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.5 1.43 3.16 -1.35 - - - - - - - - - -5.92 4.58 2.54 -1.5 - - - - - - - 2.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.16 3.53 -0.08 - - - - - - - - - - 4.4 2.88 - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.63 -0.12 - 0.42 - - - - - - - - - -2.39 4.91 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.49 1.96 -0.66 -3.12 - - - 1.57 - - - - - - 4.43 2.02 0.3 - - - - - 0.03 - 2.78 - - - -3.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.59 2.02 -1.3 - -1.11 - - - - - - - - - - 5.22 0.66 -2.29 - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.97 - - - - - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.66 4.12 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.9 - 3.48 - - - - 2.85 - - - - - - 4.49 - - - - - - - - - 1.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.16 - - - - - 0.67 - - - - -2.37 3.61 3.09 2.9 - 1.87 - - - 2.18 1.31 0.32 - - - -1.93 - - - - - - - 0.5 - - - - - - - - - -
- - - -1.21 - - - - - - - - - - - 5.05 2.49 - - - - - - - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.82 - - - - - - - - - - 4.81 3.73 - - - - - - - - 1.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.05 0.46 2.91 - - - - - - - - - - -4.57 4.23 3.26 -1.43 - - - - - - - 2.61 - - - -15.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.95
- - - 1.94 - - - - - - - - - - - 5.4 -0.31 0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.44 0.28 2.12 - - - - -0.35 - - - - - - 4.7 2.21 1.87 - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.58 - - - - - - - - - - - 4.7 0.99 -0.11 - - - - - - - 3.7 - - - -3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -1.71 - 1.75 1.27 0.9 - - - - - - - 4.94 1.64 -2.14 - - - - - -0.98 - 2.1 - - -1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.08
1.95 2.44 1.93 1.52 -1.45 -6.76 -4.8 -3.56 0.84 -5.37 -8.21 -8.18 -7.1 -8.51 -2.86 3.4 2.56 0.55 -2.42 -1.82 -3.38 -4.43 -1.64 -0.59 -7.21 3.12 -7.84 -4.36 -8.88 -2.13 -5.72 -4.38 -5.55 -6.74 -0.92 -4.18 -4.65 -4.08 - -5.43 -7.4 - -6.13 -4.53 -5.93 -5.48 -4.69 -3.16
-0.68 1.94 0.62 1.92 -2.88 0.48 -0.18 -0.88 0.31 -3.64 -4.9 -2.11 -4.13 - -3.46 3.77 1.26 -2.62 -3.78 -0.55 -0.85 0.85 - - 3.18 -2.79 1.7 -4.81 -1.82 -3.22 -3.93 -4.06 -5.94 - -0.09 - - -4.5 - - -2.98 - -5.04 -4.32 - -4.06 - -6.36
- - - - -0.37 - - - - - - - - - -1.79 5.04 3.46 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.56 0.92 - - - - - - - - - - 4.93 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.26 1.67 0.95 -2.65 - - - 1.9 - - - - - - 4.55 1.6 0.02 - - - - - - - 2.75 - - - -4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.23 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.51 -0.11 - - - - 1.99 - - - - - - 4.76 3.32 - - - - - - - - 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.55 1.85 - - - - - - - - - - -2.38 5.0 2.09 - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.01 1.25 - - - - - - - - - - 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.01 2.2 -2.22 1.64 2.02 1.38 - -0.78 - -2.19 -0.67 -3.19 -0.02 3.02 2.25 1.6 - -1.33 - -0.69 -0.17 -0.29 -0.37 2.3 -0.46 -3.25 -0.02 -1.83 -2.9 -2.5 - -3.53 -1.68 -1.62 -2.78 -0.96 - -1.56 -1.39 - -1.42 - -3.38 -3.5 -3.28 -1.21
- - 1.74 -0.63 - - - - - - - - - - - 4.94 2.58 -0.06 - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - -0.49 - - - - - - - - - - - -
-0.66 0.17 1.0 2.97 0.67 1.26 1.41 -0.21 1.81 -3.85 -0.77 -1.21 - -4.73 -3.61 3.18 0.54 0.01 1.42 1.21 1.34 0.17 -0.79 -2.57 0.42 -0.99 -2.34 -2.43 -1.73 -1.14 - - - - -3.63 - -3.85 - - - - - -5.02 -4.39 - - - -4.45
- - 0.63 0.4 2.5 - - - - - - - - - -6.73 4.85 1.94 -0.15 - - - - - -3.17 - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.67 -1.02 -1.8 0.03 0.23 1.9 - -1.73 - - - -5.39 4.45 -2.78 - - - - - - - - - - -0.55 1.54 -1.37 -3.26 - -3.69 0.25 - - - - - - - -2.62 -2.79 - -2.22 - - -1.13
- - 1.45 2.73 - - - - - - - - - - - 4.34 3.06 -0.51 - - - - - - - 3.23 - - - -4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.2 -0.17 0.22 -0.28 -0.46 - -1.05 - - - - - - -4.22 4.96 1.88 -1.79 1.04 - - - - - - 1.41 - - - -3.25 - - - - - - - - - - -0.71 -1.05 - - - -1.21 - -
- - -2.12 1.46 - - - - - - - - - - - 5.41 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.39 - - - - - - - 0.33 - - - - 5.17 1.5 - - - - - - - - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.78 - - - - - - - - - - - 4.95 1.53 - - - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.26 -3.65 -0.26 2.99 -4.34 -0.88 2.26 -2.47 2.41 -3.04 -0.45 0.51 -3.04 -2.43 -2.04 4.17 0.95 -2.51 - -4.58 - -2.7 - - -2.22 -0.08 -1.51 -2.8 -1.09 -0.93 -4.25 - -3.81 -3.36 -0.29 - -4.57 - -4.17 -2.77 - -4.67 -2.25 -3.9 -2.17 -4.86 -3.05 -3.18
- - - - - - - - - 0.48 - - - - - 5.07 3.46 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.18 1.62 -3.04 - -2.71 -2.89 -1.1 - - - - - -7.06 5.19 1.25 -0.38 - - - - - -2.47 - 1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.06 - - - - - - - - - - - 4.93 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.17 - -0.92 1.15 1.39 - - - - - - - -4.1 4.79 1.67 - - 0.73 1.6 - - - - 0.49 0.9 - - - 0.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.21
- - - 1.11 - - - - - - - - - - -3.66 5.15 1.35 - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.92 3.44 0.13 0.31 -0.2 - - -1.05 - - -0.77 - -3.21 4.17 2.72 -1.03 - - - - - 0.13 - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.45 - -
- - 2.27 0.93 - - - - - - -1.11 -1.4 - - - 4.65 3.19 -1.82 - - - - -0.21 -0.98 - 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.56 2.18 1.53 -0.02 -2.86 - - -2.27 2.37 -2.2 - - - -3.29 -2.7 3.44 1.72 0.52 - - - - - 0.3 - 3.2 - - - -1.48 -2.72 - -1.79 -1.42 - -1.35 -2.38 0.05 - -2.54 - -1.9 - - -3.33 1.16 -1.55 -2.15
- - - 2.02 - - - - - - - - - - - 5.24 1.82 - - - - - - - - 1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.64 0.59 0.61 - - - - - - - - - - -4.8 5.02 3.01 -0.67 - - - - - - - 1.27 -0.65 - - -3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.59 -2.81 1.59 1.02 - - -2.3 -2.59 - - - - - - -4.42 4.94 2.27 -0.46 - -3.16 -0.98 - - - - 1.87 - - - -5.83 - -2.78 - - - - - - - - - - - - - -2.27 - -
- 1.2 0.78 1.29 0.07 0.87 -3.12 -0.55 - -4.11 -3.34 -3.49 -4.65 - -3.67 4.85 0.69 - 0.48 0.56 -2.34 - - - -0.34 -4.32 -1.83 - -3.56 -2.87 - - -2.48 0.16 -2.09 - - -4.34 -3.66 -3.83 - - -2.87 -3.1 -1.62 -3.86 -2.99 -3.36
- - - 2.53 - - - - - - - - - - - 4.58 3.5 - - - - - - 0.98 - - - - - -0.73 0.71 - - - - - - - - - - - - 1.48 - - - -
- - 1.75 - 1.6 - - - - - - - - - -2.22 5.06 2.8 - - - - - - - 0.02 - - - - -2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.05 1.02 - - - - - - - - - - 4.89 2.44 - - - - - - 0.58 - 0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.38 1.44 - - - - - - - - - - 4.83 2.54 - - - - - - - - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.33 1.66 1.64 - - - - 2.04 - - - - - -2.86 4.07 2.84 -1.3 - - - - - -0.03 - 2.83 - - - -5.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.39 1.28 2.9 - - - - 2.76 - - - - - -2.6 4.05 2.69 - - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.28 - -0.54 -0.84 -3.37 - - - 0.79 - - - - - -5.28 5.21 1.77 -0.86 - - - - - - - 1.88 - - - -4.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.86 - - - - - - - - - 5.18 1.35 - - - - - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.94 1.13 0.95 -0.06 -0.27 -0.65 -0.13 0.01 1.6 -2.25 -2.28 -1.87 -2.56 -1.43 -3.75 2.85 1.98 -0.43 1.1 -0.61 0.05 -0.9 1.0 0.28 -0.93 2.41 -1.36 -1.28 -2.53 -1.3 -1.81 -1.58 -2.13 -1.79 0.71 -1.42 -2.13 -2.11 -1.61 -2.23 -1.62 -1.13 -2.39 -1.79 -2.05 -1.86 -1.49 -1.73

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.