Heatmap: Cluster_280 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.64 -1.49 -1.3 -4.4 -1.59 -0.37 0.15 0.22 -2.6 0.82 0.64 0.65 1.26 1.21 0.54 -0.63 -0.3 -0.71 -1.17 0.54 1.12 1.13 -2.28 -2.1 1.32 2.02 1.02 -1.94 -1.54 -0.77 -0.3 0.07 -0.73 -0.84 -2.32 -1.63 -0.12 -0.06 -1.9 -0.2 0.27 0.39 -0.17 -0.74 -1.54 -0.1 -0.78 0.0
-0.91 -2.87 -3.6 - -1.05 -0.9 -0.01 -0.9 -1.73 0.79 -2.11 -2.2 1.04 0.81 1.26 -1.59 -1.45 -3.47 0.2 -1.03 -0.78 -0.47 -6.7 -2.47 -0.42 -0.15 0.96 0.94 0.36 0.38 1.02 0.82 0.36 0.46 -0.49 0.37 1.57 -0.19 -0.49 0.92 -0.06 -0.84 0.22 0.26 0.45 -0.46 -0.22 1.16
-0.57 -0.25 -0.0 -0.93 -0.05 -0.22 0.52 0.34 0.17 0.19 -0.44 -0.63 0.41 -0.19 0.0 -0.63 0.06 0.04 -0.8 -0.45 -0.63 -0.43 -2.98 -1.21 0.25 0.64 0.39 0.19 0.49 -0.07 0.77 -0.08 0.22 0.15 0.02 -0.1 0.87 0.38 -0.33 -0.05 0.06 -0.03 -0.13 0.03 -0.13 0.41 0.11 0.05
-0.83 -0.33 -0.72 0.62 -0.13 0.59 0.57 0.74 0.14 0.11 0.63 0.67 0.87 -0.38 0.01 -1.41 -0.7 0.85 -0.61 -0.79 -0.36 -0.46 -3.26 0.46 0.95 1.07 1.1 -0.35 -0.29 -0.56 0.64 1.1 -0.62 -1.0 -0.61 -0.37 0.27 0.06 -1.99 -0.82 -0.43 -0.97 -1.01 -1.05 -1.42 0.09 -0.99 0.01
0.04 -0.73 -1.34 -3.15 0.23 -0.5 -0.59 -0.87 -0.42 0.49 -0.36 -0.51 1.02 0.86 0.83 -1.04 -0.07 -0.03 -0.78 -0.07 -0.37 0.41 -0.5 -1.91 0.87 0.19 -0.22 -0.85 -0.03 0.05 0.13 0.69 -0.12 -0.37 -0.21 -0.19 0.51 0.01 -0.5 0.23 0.77 0.52 0.46 0.41 0.09 -0.01 -0.92 0.27
-0.57 -0.52 -1.47 -0.89 0.83 0.31 0.34 -0.05 -0.99 0.17 -1.17 -1.31 0.55 0.24 -0.25 -0.79 -0.31 -0.42 -0.63 -0.29 -0.14 0.17 -2.86 -2.5 0.54 -0.19 0.06 0.73 -0.1 -0.05 0.62 -0.64 0.44 0.47 0.83 0.24 0.61 0.41 0.26 -0.14 0.12 -0.04 0.28 -0.23 0.03 0.51 0.01 0.3
-0.62 -1.27 -0.46 -2.5 -0.38 -0.6 -0.44 -0.23 -0.25 0.62 0.04 -0.06 0.62 0.25 0.19 -1.7 -0.32 0.07 -0.78 -0.42 -0.36 -0.33 -3.52 -1.09 0.79 0.19 0.59 0.24 -0.16 0.11 0.3 0.41 0.53 0.4 0.12 0.65 0.41 0.51 -0.12 0.17 0.22 0.1 0.11 -0.01 0.27 0.52 0.03 -0.16
-1.27 -2.05 -1.61 -3.33 -1.88 -0.95 -0.46 -0.36 -0.77 0.67 0.06 -0.01 0.98 0.98 0.36 -1.3 -0.54 -0.79 -0.55 -0.71 -0.89 -0.42 -3.25 -1.59 0.18 0.2 -0.13 0.31 0.86 -0.08 0.58 0.63 0.46 0.07 -0.38 0.45 0.71 0.4 -0.03 0.31 0.59 0.5 0.21 0.31 0.6 0.51 0.2 0.15
-0.31 -0.64 -1.45 -2.38 -2.81 0.15 -0.32 0.08 0.26 1.21 -0.36 -0.15 0.97 -0.31 -0.23 -0.4 0.03 0.33 -1.51 -0.78 -1.21 -0.82 -5.94 -1.7 0.39 1.59 -0.36 0.72 0.78 0.15 1.06 0.01 0.07 -0.05 0.12 1.0 0.41 0.94 -1.41 0.04 -0.7 -0.92 -0.32 -1.3 -1.12 0.82 -0.89 0.33
-1.88 -0.99 -0.4 -0.46 0.2 -0.5 -0.08 -0.21 -0.45 0.46 0.4 0.34 0.32 -0.74 0.4 -1.9 -0.47 0.11 -1.44 -0.13 -0.45 -0.01 -2.74 -1.05 0.85 0.05 0.87 0.53 0.47 -0.05 0.35 0.45 0.17 0.03 -0.83 -0.08 0.75 0.23 -0.58 0.11 0.0 -0.03 0.29 0.4 0.39 0.18 0.41 -0.27
0.3 1.1 0.62 -1.29 -1.79 -0.9 -0.08 0.38 -0.35 0.35 0.44 0.14 0.06 -0.97 -0.19 -1.66 0.24 -0.82 -1.25 -0.81 -1.57 -1.32 -4.08 -2.04 -1.25 0.73 -0.79 0.62 0.4 0.6 1.03 0.78 -0.03 0.28 1.2 0.26 0.84 0.63 -0.99 0.09 -0.29 -0.61 -0.26 -0.52 -0.99 0.64 -0.34 0.4
-1.34 -0.68 -1.99 -2.11 -1.96 -0.45 -0.18 -0.36 -0.81 0.83 -0.04 -0.06 1.13 0.69 0.41 -1.2 -0.59 -0.65 -1.12 -0.94 -0.69 -0.19 -3.08 -2.08 -0.13 0.17 -0.5 0.03 -0.17 0.17 0.51 0.31 0.62 0.42 0.73 -0.04 0.73 0.84 0.04 0.19 0.31 0.47 0.26 0.12 0.3 0.94 0.11 0.22
-1.08 -1.23 -0.8 -3.21 -1.2 -0.09 0.09 0.01 -1.0 1.07 -0.74 -0.89 1.33 0.81 0.54 -1.76 -0.1 0.16 -0.65 -0.57 -0.88 -0.24 -3.84 -1.19 0.71 1.65 0.08 -0.2 -0.15 0.25 0.41 -0.64 -0.11 -0.15 -0.03 0.04 0.24 0.52 -0.89 0.09 0.77 0.54 0.12 -0.26 -0.72 0.46 -0.19 0.25
-1.29 -0.49 -0.82 -3.98 0.63 0.28 0.45 -0.2 -1.03 0.21 -2.3 -2.63 -0.17 -0.94 -0.4 -1.06 -0.6 -0.37 -0.41 -0.19 0.27 0.14 -0.63 -1.52 0.4 -0.88 0.75 1.14 0.07 0.02 0.72 -0.61 0.65 1.11 0.87 0.52 0.85 -0.0 0.49 -0.1 -0.28 -0.65 0.24 -0.12 0.13 0.09 0.35 -0.02
-3.39 -2.2 -2.31 -1.64 -0.5 0.03 -0.29 -0.21 -1.43 1.07 0.03 -0.23 0.9 0.08 0.85 -2.09 -0.38 -1.01 -2.19 -2.03 -2.58 -0.89 -5.2 -2.01 1.38 1.03 0.85 0.03 0.52 0.05 0.45 0.13 -0.08 -0.11 0.57 -0.45 0.33 0.56 -0.61 -0.4 0.89 1.02 0.06 -0.04 -0.17 0.66 0.53 0.38
-0.93 -1.05 -0.6 -1.19 0.77 0.84 0.21 0.7 -0.76 0.35 -3.38 -3.81 0.8 0.61 0.01 0.37 -0.16 -0.08 -1.22 -0.28 0.36 0.13 -4.22 -2.15 0.43 -0.65 -0.89 -0.04 -0.2 0.08 0.33 -0.94 0.14 0.62 0.52 0.82 0.3 0.59 -0.7 -0.18 0.59 0.43 0.05 -0.64 -0.2 0.48 -0.47 0.56
-0.8 -0.88 0.03 -4.56 -2.09 0.24 0.04 0.85 -1.03 0.77 -2.42 -1.63 0.58 0.94 -0.12 - 1.09 -0.04 1.26 -0.48 0.56 0.5 -3.36 -2.59 0.73 0.58 -0.81 -0.72 -0.44 -0.15 0.86 -1.04 -0.47 -0.2 -0.66 0.32 0.31 1.39 -1.59 -0.41 0.59 0.15 -0.11 -0.93 -1.79 1.21 -1.06 0.41
-12.4 -5.18 -4.56 -6.23 -4.68 -2.88 -2.56 -2.58 -3.12 1.46 -2.58 -3.68 1.58 0.42 0.98 -8.84 -1.39 -1.61 -5.58 -4.26 -3.9 -0.91 -6.09 -3.73 1.38 1.25 1.45 0.61 0.0 0.31 1.45 -1.17 1.16 0.83 -0.06 1.75 1.5 -0.34 0.76 -1.05 -1.69 -1.52 -0.48 -0.54 0.65 -0.19 0.55 0.83
-1.3 -1.11 -0.92 -1.54 -1.04 -0.04 -1.06 -1.04 -1.54 0.51 0.47 0.08 1.04 0.96 0.09 -0.65 0.48 0.07 -1.17 -0.95 -1.31 -0.31 -4.53 -1.73 0.74 1.44 0.52 -0.2 0.37 -0.41 0.44 0.38 0.09 -0.27 0.82 -0.36 0.5 0.2 -0.23 -0.27 0.75 0.72 0.05 -0.24 -0.46 0.24 -0.13 -0.23
-1.68 -1.69 -2.77 -2.52 -1.13 -1.15 -1.47 -1.15 -1.47 1.08 -1.39 -1.42 1.36 1.51 0.83 -2.73 0.18 0.09 -0.33 0.05 -0.62 -0.15 -2.52 -0.94 1.02 1.16 0.52 -0.77 -2.09 -0.21 0.03 -0.12 0.09 -0.59 -2.32 -1.05 0.57 0.78 -0.26 0.18 1.15 1.01 0.69 0.08 0.18 0.74 -0.11 -0.07
-1.56 -1.05 -0.65 -3.15 -0.33 -0.77 -0.83 -1.22 -0.83 0.72 -1.06 -1.02 1.03 0.77 0.47 -1.4 0.17 0.23 0.05 0.01 -0.24 0.08 -2.86 -1.35 0.42 1.01 -0.12 0.44 -0.31 -0.15 0.37 0.3 0.08 -0.19 -1.07 -0.45 0.79 0.77 -0.28 0.15 0.57 0.48 0.38 0.18 0.03 0.77 0.19 0.07
-0.95 -0.99 -1.95 -3.77 0.03 -0.69 -0.68 -0.59 -1.03 0.55 -0.13 -0.24 1.09 0.98 0.85 -2.02 -0.3 -0.48 -0.53 -0.68 -0.49 -0.09 -0.87 -0.66 1.05 1.29 0.74 -1.03 -0.95 -0.35 0.05 -0.5 0.04 -0.23 -0.64 -0.37 0.19 -0.14 0.04 0.38 1.07 0.84 0.65 0.39 0.04 -0.09 -0.09 0.11
-0.27 0.07 0.76 -0.19 -1.2 0.46 0.36 0.55 -0.49 0.49 0.18 -0.17 0.7 0.03 -0.01 0.13 -0.02 -0.49 0.46 0.15 -0.15 -0.15 -1.3 -2.22 0.55 -0.09 0.72 -0.23 0.03 -0.26 -0.01 0.93 -0.14 0.01 -0.81 -0.3 0.13 0.47 -0.84 -0.43 -0.39 -0.27 -0.29 -0.41 -0.82 0.34 -0.24 -0.1
-0.38 -1.11 -1.61 -3.21 -0.6 -1.16 -1.75 -1.63 -1.45 0.74 -3.13 -3.61 1.61 1.38 0.51 -1.75 -1.97 -1.06 -2.18 -1.88 -2.04 -1.54 -4.96 -3.3 0.05 -0.46 -0.42 0.09 0.46 0.08 1.14 -0.34 0.9 -0.15 1.17 -0.11 1.59 0.77 -0.48 0.04 1.21 0.71 0.45 0.23 0.67 0.93 -0.67 0.01
-1.82 -1.13 -1.35 -2.0 -0.54 -0.52 -0.8 -0.77 -0.55 0.65 0.46 0.14 0.97 0.66 0.14 -2.2 -1.03 0.14 -1.42 -0.97 -0.92 -0.47 -4.65 -0.73 0.91 0.85 0.83 -0.19 0.83 -0.06 0.75 0.32 0.16 0.1 0.33 0.35 0.3 0.52 -0.11 0.17 0.44 0.35 0.05 -0.07 -0.54 0.65 0.2 -0.54
1.21 -2.45 -0.77 -1.8 -2.03 -0.25 1.11 1.34 -0.24 0.4 -0.79 - 1.32 0.14 -0.64 -1.3 -0.41 0.62 - -2.16 -3.97 -1.39 -1.33 -1.39 0.01 2.54 0.06 0.97 -1.34 -0.28 0.3 -0.12 -1.02 -0.65 1.81 -1.18 0.26 0.56 -1.25 -0.5 -1.11 -1.23 -1.36 -1.32 -1.22 0.64 -0.69 0.48
-1.23 -2.38 -1.27 -3.1 0.2 0.42 -0.08 -0.19 -2.19 0.87 -0.11 -0.35 0.96 0.18 0.41 -1.38 -0.42 -0.76 -1.11 -0.3 -0.25 -0.06 -3.92 -1.65 0.64 0.97 0.66 0.23 0.25 0.09 0.73 0.68 0.23 0.11 -0.02 -0.12 0.73 0.41 -0.78 -0.06 0.21 -0.01 0.11 0.11 -0.1 0.4 0.2 0.02
-1.42 -1.93 -1.62 -2.46 0.1 0.51 0.12 0.62 -2.17 0.65 -0.02 -0.32 0.96 1.43 0.63 -2.28 -0.5 -0.85 -0.85 -0.69 -1.3 -0.52 -3.22 -1.74 0.44 0.3 0.3 -0.76 0.07 -0.01 0.41 0.91 0.52 -0.35 -1.17 -0.67 0.52 0.1 -0.42 0.32 0.9 0.76 0.35 0.23 0.42 0.26 -0.36 0.04
0.26 -0.04 -0.06 -2.53 -0.19 0.31 0.25 0.43 -0.15 0.46 -0.5 -0.5 0.61 -0.03 0.06 -0.29 0.73 -0.08 0.17 0.08 -0.33 -0.15 -2.01 -1.37 0.22 1.16 -0.33 0.26 0.56 -0.09 0.51 -0.22 -0.13 -0.33 0.37 -0.17 0.35 0.58 -1.18 -0.41 -0.15 -0.16 -0.22 -0.82 -0.77 0.51 -0.42 -0.07
0.26 0.35 0.5 -1.79 -1.0 0.04 0.25 -0.09 0.7 0.2 -0.7 -0.85 0.46 -0.13 -0.14 -1.25 0.96 0.25 0.24 0.42 0.2 0.18 -3.15 -1.5 -0.32 0.13 -0.57 -0.1 0.36 -0.0 0.17 0.16 -0.25 0.13 0.04 -0.38 0.22 0.56 -0.48 -0.14 0.14 -0.01 0.01 -0.16 -0.47 0.61 -0.47 0.28
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-1.8 -0.27 0.05 -1.66 -0.1 0.56 0.96 0.95 -0.7 0.64 -0.75 -0.72 0.9 -0.01 0.26 -1.11 0.12 0.37 -0.33 -0.58 -0.94 -0.45 -2.75 -1.13 1.12 1.17 0.87 0.91 0.22 -0.96 -0.02 -0.84 -0.52 -0.72 -0.0 -0.06 0.32 0.87 -0.66 -0.12 -0.69 -0.87 -0.0 -0.96 -1.14 0.82 -0.49 -0.35
-4.59 -1.47 -4.24 -2.48 -1.94 -0.79 0.43 0.18 -0.46 1.02 -0.5 -0.48 0.52 0.09 0.8 -2.19 -0.64 -2.24 -0.17 -0.53 -1.34 -1.87 -4.93 -3.8 -0.42 0.75 0.31 0.59 0.12 0.4 1.15 0.42 0.31 -0.06 0.5 -0.36 0.93 1.37 -0.78 0.22 -0.0 0.21 0.21 -0.04 -0.18 1.4 0.56 0.18
-1.44 -0.26 1.18 -1.43 -0.58 0.27 0.68 0.43 0.32 0.32 0.05 0.11 1.46 0.23 0.03 -0.91 0.5 0.03 0.6 0.18 -0.25 0.13 -3.91 -1.06 0.1 0.1 0.05 -0.3 -0.55 -0.24 0.01 0.67 -0.33 -0.29 -0.05 -0.49 0.08 0.44 -1.11 -0.17 -0.47 -0.0 -0.58 -0.75 -0.63 0.29 -0.61 -0.0
-3.51 -1.97 -2.68 -4.35 -1.77 -1.23 -0.63 -1.01 -1.92 1.17 -1.15 -1.29 1.07 0.25 1.22 -3.68 -0.77 -1.37 -2.18 -1.69 -2.68 -2.43 -5.03 1.2 0.45 0.57 1.07 0.54 -0.32 0.44 1.6 0.45 1.08 0.17 -0.05 0.8 1.44 0.26 -0.79 -0.36 -0.47 -0.52 -0.32 -0.61 0.25 0.15 0.48 0.68
-0.78 -0.24 -0.42 -2.85 -0.6 0.22 0.7 0.79 0.67 0.69 -1.12 -1.22 1.02 0.62 0.65 -0.81 -0.41 0.74 -0.75 -0.96 -1.65 -1.13 -0.96 -1.34 0.15 1.63 0.02 0.39 -0.26 -0.09 0.34 -0.82 -0.36 -0.53 -0.17 -0.86 0.91 1.06 -1.19 -0.51 -0.29 -0.08 -0.21 -1.05 -1.02 0.97 -1.14 0.4
-7.78 0.17 0.66 -3.1 -0.73 0.28 0.04 0.23 -0.2 0.78 -0.37 -0.08 0.49 -0.58 0.87 -3.26 -0.01 0.76 -0.81 -0.83 -0.54 0.39 -0.33 -0.85 1.13 1.33 0.78 0.45 -0.77 -0.11 0.05 -0.08 -0.29 -0.2 0.24 0.57 0.35 0.41 -1.15 -0.69 -1.02 -1.14 -0.67 -0.38 -0.94 0.31 -0.23 0.49
-1.51 -1.67 -1.89 -2.49 0.67 0.11 -0.09 -0.18 -1.24 -0.07 -1.57 -1.43 0.25 0.23 -0.0 -1.41 -1.19 -1.17 -0.16 0.31 0.24 -0.37 0.34 -2.94 0.38 -1.25 1.2 0.53 0.05 0.33 0.6 -0.57 0.2 0.17 0.65 0.25 0.69 0.27 -0.05 0.39 0.73 -0.13 0.49 0.23 0.09 0.45 -0.08 0.69

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.