Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- 3.52 - 1.8 - - - - - - - - - - - 4.91 0.55 -0.44 - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.32 - - 2.45 - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.1 1.32 0.47 - - - - - - - - - - 4.97 1.88 -1.91 - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.31 - - - - - - 1.16 - - - - - - 3.84 1.05 -0.19 - - - - - 0.05 - 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.24 - - - - - -0.29 - - - - - - 4.82 2.5 - - - - - - - - 3.11 - - - -4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.46 2.21 - - - - - 3.28 - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.92 2.58 - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - 2.04 - - - -1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -2.39 - -1.92 - - - -1.87 1.69 - - -0.7 - -2.88 4.44 2.25 0.02 - - -0.39 -1.71 - - - 2.2 - - - -1.01 -2.85 0.37 - - - - - 2.05 - - 0.26 -1.48 - - - 1.3 - -
- - -1.71 0.67 1.32 - - - - - - - - - - 4.69 3.1 - - 0.04 - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.22 -0.44 - -0.84 - - - 3.55 - - - - - - 3.86 1.15 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.7 -0.69 1.48 - 0.18 1.07 -0.4 - 0.08 0.89 0.17 -0.06 0.17 -0.48 2.09 1.08 1.07 - - -2.29 -0.77 - -0.25 -0.98 0.98 -2.46 -1.6 -4.05 -0.47 -1.5 -3.8 -2.6 -2.28 -1.19 -1.06 -2.59 0.63 - -0.54 -1.58 -1.33 -1.49 -3.91 - 0.08 -2.43 -1.25
- 4.19 1.69 1.49 -1.44 2.14 - - - - - - - - - 2.36 3.25 0.07 - - - - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.61 - 0.6 -0.23 - - - - - - - - - - 3.47 3.05 - - - - - - - - 0.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.24 - - - - - - 2.86 - 1.38 2.39 - - - 3.68 0.49 -0.2 - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.24
- 2.29 2.91 - - - - - 3.39 - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - 1.87 - - - -2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.45 - -0.22 - - - - - - - - - - - 4.23 1.4 -0.06 - - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.93 - - - - - - - - - - - - 5.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.5 - - - - - - - - - - - - 5.13 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.97 2.01 -0.78 0.8 - - -0.52 - - - - - - - 4.43 2.09 -1.25 - - - - -0.06 0.77 - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.18 1.79 0.22 -0.71 - - - - - - - - - - - 0.38 0.39 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.37 - - - - - - - - - - - -1.5 5.0 - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.9 -2.87 0.35 - - -1.47 0.16 - - - - - - -6.26 4.34 0.77 -1.99 - - - - - - - 3.0 - - - -6.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.25 - - - - - 3.87 - - - - - - 4.7 1.47 0.34 - - - - - - - 1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.98 2.43 - - - - - - - - - - - - 4.78 1.54 - - - - - - - - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.18 - - - -0.14 - - - - - - - - - -1.85 5.3 1.59 - - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.71 -0.5 1.58 - - - - - - - - - - -5.03 4.64 2.52 - - - - - - - - -1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.93 - - - - -0.88 - - - - - - 5.11 1.81 0.96 - - - - - 1.06 - 2.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.53 -0.34 1.09 - - - - - - - - - - - 3.29 1.72 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.1 1.69 1.68 0.33 - 0.67 0.96 1.98 - - - - - -6.26 2.44 2.06 -2.84 - - - - - -1.67 - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.26 - - - - - - - - - - - - - - 1.48 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.35 - - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.85 -1.31 -8.19 - - - - 3.78 - - - - - - 4.75 2.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.38 - - - 3.58 - - - - - - 4.84 -0.95 - - - - - - 0.37 - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.06 -0.2 -1.86 -0.18 - - - - - - - - - - 4.82 3.44 - - - - - - - - 2.54 - - - -2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.05 0.35 0.43 0.4 0.78 -0.58 0.83 - -1.99 -1.52 - -2.73 -2.61 -2.34 3.65 0.96 1.05 - 0.02 -1.81 0.79 -0.07 -0.91 -1.04 -1.52 -0.95 -0.27 -0.78 -1.69 -1.33 -2.22 -1.45 -0.9 -2.14 -2.1 -2.5 -1.0 - -1.73 - -0.57 -1.11 -2.26 -0.18 -0.78 -3.0 -1.24
- 4.42 0.81 1.65 -0.04 - - - - - - - - - - 3.43 2.52 - - - - - - - - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.83 2.9 - - - - 3.5 - - - - - -4.25 3.93 2.12 1.18 - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.8 - 1.67 0.02 - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.08 - - - - - - - - - - - - 5.33 0.14 - - - - - - 0.25 - 0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.2 - - - 0.82 2.05 - - - - - - - - 4.46 0.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.28 2.57 0.57 - - - - - - - 0.58 - - - -2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.85 3.38 - - - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.2 3.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.38 0.12 - 0.32 - - - 0.08 - - - - - - 4.52 -0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.51 2.84 1.29 -0.62 -2.75 - - - 2.39 - - - - - -6.78 4.24 2.46 -0.55 - - - - - -1.35 - 2.43 - - - -3.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.8 0.33 - - - - - - - - - - - - 4.48 3.2 - - - - - - - - 0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.71 -0.74 0.04 - - 0.11 - 3.75 - - - - - - 4.27 -0.14 - - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.79 1.6 - - - - - - - - - - - - 4.72 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.43 0.82 -1.12 -2.79 - - - 4.01 - - - - - -7.29 4.67 1.17 -2.87 - - - - - - - 0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.2 3.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.16 0.61 - - - - - - - - - - - - 4.68 2.99 1.16 - - - - - - - 2.59 - - - -2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.26 1.36 0.01 - - - -1.95 1.39 - - - - - -5.31 4.45 2.48 -0.72 - - - - - - - 3.04 - - -2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.57
- 0.59 1.94 -0.01 0.44 - - - 3.02 -0.02 - 0.16 - - 0.14 4.62 0.79 1.32 - - - - - - - - - - - -3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.8 0.98 2.47 0.03 -2.31 - - - 1.66 - - - - - -4.94 4.47 2.13 -1.88 - - - - - -1.26 - 2.83 - - - -6.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.21 - 1.88 - - - - 3.92 - - - - - - 4.33 - - - - - - - - - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.82 1.27 1.43 -3.46 - - - -2.6 - - - - - -3.17 4.43 2.77 0.49 - - - - - -2.24 - 2.41 - - - -3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.1 - - - - - - - - - - 4.93 - 0.9 - - - - - 1.15 - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.42 - - - - - - 2.44 - - - - - -2.86 4.42 2.4 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.82 - - 1.62 - - - - - - - - 1.17 - 3.31 1.6 - - - - - - - - 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -1.35 5.37 2.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.76 3.19 1.87 - - - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.54 -0.11 - - - - - - - - - - - 4.93 3.05 - - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -1.59 5.19 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.3 -0.61 -1.59 - - - - -1.07 - - - - - -7.02 -1.3 0.85 -0.07 - - - - - - - 1.99 - - -3.44 -6.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.23 -2.16 1.12 2.06 -0.31 -0.4 -2.32 -2.15 3.42 -5.23 -2.58 - -4.48 - -4.88 3.81 2.32 0.61 -2.91 -3.02 -1.52 -1.04 - -0.95 -2.47 2.12 - -3.89 -1.96 -3.09 - - -6.03 -3.21 - -3.96 - -2.62 -3.49 -2.46 - - - -2.71 - -4.16 -3.67 -4.54
- 3.98 0.37 0.56 - - - 2.17 - - - 0.55 - - - 3.01 3.28 - - - - - - - - 2.44 - - - -2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.85 3.3 - - - - - - - - - - - -3.16 - 2.44 - - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.21 1.06 0.25 - - - - - - - - - - 4.74 2.22 0.63 - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.89 2.49 0.75 1.85 0.23 -1.44 1.51 0.7 2.8 - - -2.59 - - -6.36 3.73 2.77 -1.43 - - -3.04 - -2.85 -3.3 -3.59 1.51 - - - -5.64 - - - - - - - - - - - - - - - - -3.4 -
- 5.37 -1.15 - -1.55 - - 0.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - - - 0.01 - - - - - - - - - - - -1.88
- 2.51 - 1.95 - - - - - - - - - - - 5.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.11 - 2.01 - - - - 3.76 - - - - - - 3.56 1.19 - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.13 - - - - - - - 2.67 - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.3 2.37 1.37 0.05 - - - 3.24 - - - - - - 4.45 1.22 -3.34 - - - - - - - 1.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.19 1.99 - - - - - - - - - - - -5.4 4.02 2.4 - - - - - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.35 -1.86 - - 1.74 - 1.12 - -1.08 -1.21 - - - -4.09 - -0.04 -1.19 - - - - - - 2.08 2.84 2.97 - - -4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.96
- 2.05 -0.64 0.77 -2.54 - - - 2.18 - - - - - -4.7 4.62 2.08 - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.58 4.25 -0.27 0.57 -1.21 - -3.47 - 1.01 - - - - - -4.63 2.38 2.55 -2.02 - - - - - -1.97 - 2.65 - - - -6.04 - - - - - - - -2.62 - - - - - - - - - -
- - 2.43 0.62 -3.7 - - - 1.98 - - - - - -4.73 4.36 2.68 -0.3 - - - - - -1.36 - 3.13 - - - -2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.77 1.37 -0.33 - 1.87 - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - 1.79 1.83 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.33 0.3 - - 0.64 - 2.61 - -0.79 - - - - -1.54 3.41 2.47 - - - - - - 0.47 - 2.08 - - - -1.99 -0.59 - - - - - - 1.18 - - - - - 0.82 - - 0.08 -1.5
- - 0.11 -0.46 - - - - - - - - - - - 4.8 3.26 -1.3 - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.27 -1.15 -0.83 - - - - - - - - - - - 3.63 3.5 0.48 - - - - - - - 1.34 - - - -3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.85 2.04 - - - - - - - - - - - 5.23 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.28 -0.91 -1.44 - - - 3.81 - - - - - -4.48 4.83 0.53 - - - - - - - - -0.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.2 3.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.13 1.25 0.11 -1.19 - - - 1.57 - - - - - -4.21 - 2.51 - - - - - - - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.58 3.19 0.51 - - - - -1.7 - - - - - -5.92 -1.2 1.75 -1.5 - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -25.47 -0.48 0.68 - - - - 2.93 - - - - - - 3.95 3.2 0.87 - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.37 1.15 - - - - 1.84 - - - - - - 4.51 3.3 - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.94 0.31 -0.52 - - - - - - - - - - 4.99 - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.19 - - - - - - 1.12 - - - - - -3.47 - 1.76 0.17 - - - - - - - - - - - -2.34 - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - 1.5
- - 1.51 - - - - - - - - - - - - 4.97 3.15 -0.5 - - - - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.23 1.58 -1.67 0.25 -0.53 -1.26 - - - 1.15 2.34 - - - 2.52 - - - -0.37 - - 1.84 -0.94 -1.31 1.07 1.48 - - -4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 -
- 4.74 - 0.9 0.47 - - - - - - - - - -2.65 - 3.19 0.37 - - - - - - - 2.38 1.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.95 2.77 - - - - 2.42 - - - - - - 4.77 1.06 - - - - - - - - 1.07 - - - -1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.77 3.37 - 0.44 - - - - 3.47 - - - - - -3.23 3.49 0.78 - - - - - - - - 3.36 - - - -2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.22 - -0.76 - - - 3.58 - - - - - - 4.59 2.35 -1.35 - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.12 - - - - - - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.78 - 1.49 -1.73 - 1.58 - - - - - - - -4.64 4.94 2.32 - - - - - - -0.38 - 1.89 - - - -3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.89 1.89 - - - - 3.02 -2.84 - - -0.95 - - 4.9 1.34 - - - - - - - - 0.5 - - - -4.59 - - - - - - - 0.09 - - -1.86 - - - - - - -
- - - 1.61 - - - - - - - - - - - 4.98 2.79 - - - - - - 1.3 - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.4 2.39 -0.54 - - - - - - - - - -4.26 4.61 2.12 -1.45 - - - - - -0.02 - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.53 2.22 - - - - 3.22 - - - - - - 4.57 1.64 - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.25 - - - - - - - - - - - - 5.14 1.84 - - - - - - - - 2.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.73 - - - - - - - - - - - - - 4.75 2.92 - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.