Heatmap: Cluster_310 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
1.55 4.98 1.91 31.65 76.08 24.55 18.26 16.69 6.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 6.16 3.17 0.37 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.08 0.0 2.56 0.0 0.03 0.14 0.06 0.04 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.05 0.02
0.0 3.92 1.73 21.84 40.6 23.43 10.86 12.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.04 1.18 3.28 3.51 0.63 0.0 0.0 0.31 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.08 0.0 36.04 109.06 71.0 34.53 24.76 3.06 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.88 0.49 0.17 0.14 0.07 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.41 1.01 9.89 12.29 12.04 6.98 5.5 0.29 0.06 0.28 0.38 0.05 0.01 0.05 0.06 0.21 0.59 0.73 0.35 0.11 0.18 0.33 0.44 0.6 0.28 0.27 0.03 0.05 0.05 0.03 0.1 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.18 0.04 0.0 0.03 0.06 0.01 0.08 0.0 0.08 0.02 0.04
1.91 0.0 0.02 109.08 304.44 89.88 50.33 35.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.28 0.14 0.13 42.99 126.78 31.33 31.82 19.63 3.24 0.07 0.09 0.0 0.08 0.03 0.01 0.0 0.56 0.0 0.16 0.22 0.12 0.06 0.0 0.0 0.08 0.18 0.0 0.0 0.05 0.16 0.06 0.06 0.04 0.12 0.0 0.0 0.04 0.2 0.04 0.07 0.0 0.0 0.11 0.02 0.09 0.24 0.03 0.02
4.25 2.24 7.24 48.97 88.15 33.45 19.93 13.17 7.04 5.85 0.08 0.01 2.85 1.53 6.11 1.64 7.14 4.52 9.51 9.32 6.6 7.67 0.66 4.14 7.07 7.08 3.16 0.05 0.0 0.03 0.48 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.02 0.37 0.02 0.04 0.51 0.22 0.02 1.48 0.13 0.01
0.09 0.48 0.05 5.26 10.36 6.01 2.77 1.69 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.09 0.48 0.05 5.26 10.36 6.01 2.77 1.69 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.29 0.04 0.92 10.99 28.37 27.87 9.81 11.69 1.61 1.55 0.0 0.0 0.29 0.13 0.81 0.0 0.11 0.01 0.04 0.11 0.0 0.14 0.0 0.05 0.0 0.26 0.0 0.04 0.16 0.21 0.06 0.0 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 1.2 0.0 0.32 0.25 1.05 0.76 0.01 0.01 1.09 0.06 0.24
0.94 0.1 0.93 45.41 54.65 31.63 16.47 20.26 3.82 0.49 0.67 0.71 0.29 0.09 0.53 0.3 0.46 0.98 0.99 0.45 0.58 0.69 0.22 2.94 0.65 0.12 0.15 0.04 0.13 0.15 0.13 0.15 0.09 0.1 0.05 0.09 0.07 0.3 0.08 0.21 0.21 0.06 0.14 0.23 0.05 0.25 0.07 0.21
0.38 0.66 0.2 25.2 49.76 32.03 23.05 21.82 5.86 0.36 0.71 0.57 0.34 0.14 0.45 0.1 0.38 2.52 0.62 1.43 1.1 2.78 0.88 2.67 5.81 13.9 4.79 0.11 0.16 0.66 0.18 0.86 0.23 0.28 0.11 0.05 0.11 1.01 0.09 0.43 0.83 0.31 0.3 0.62 0.14 0.94 0.32 0.46
3.85 5.38 15.67 67.05 106.31 62.4 43.31 43.29 10.38 9.42 2.93 2.0 6.42 4.46 5.79 12.08 11.86 7.2 7.17 13.76 4.26 4.47 0.97 1.67 8.65 2.89 10.72 15.37 9.88 6.42 18.59 18.92 7.18 6.09 5.8 7.12 16.39 10.4 2.19 6.12 3.32 2.35 4.13 3.9 2.98 10.64 4.24 6.38
0.44 1.05 0.34 43.69 82.73 25.91 15.63 12.41 0.67 4.53 0.65 0.38 3.66 1.82 3.68 0.0 1.2 1.8 0.59 1.28 2.26 2.47 3.25 2.56 3.74 4.22 1.5 1.35 1.01 1.88 3.62 1.93 3.27 2.15 1.0 2.67 4.35 1.65 1.27 3.18 4.74 2.12 2.09 3.2 2.15 1.38 3.54 4.32
4.43 0.6 0.9 71.19 137.1 88.52 42.71 46.48 2.6 3.43 0.13 0.07 3.09 1.7 3.42 3.71 1.39 2.34 2.14 2.24 3.19 3.08 2.06 3.92 2.87 2.14 1.82 2.2 0.79 1.8 3.47 1.93 1.92 1.3 0.5 2.98 1.97 3.14 0.79 1.36 1.36 1.12 2.13 1.1 1.08 2.75 1.34 1.7
0.0 0.77 0.11 34.75 47.71 21.76 13.03 9.95 1.5 0.1 0.0 0.0 0.07 0.13 0.01 0.23 1.53 0.5 0.0 0.31 0.0 0.69 0.0 0.06 0.08 0.25 0.06 0.14 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.73 0.0 0.12 0.0 0.1 0.17 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02
1.57 1.38 0.88 26.86 87.76 22.4 13.94 11.79 3.5 2.1 0.05 0.03 1.12 0.28 1.65 0.43 1.08 15.91 3.08 1.36 0.6 5.48 0.44 1.31 2.46 2.32 1.14 0.39 0.72 1.57 0.59 2.08 0.63 0.9 0.47 0.29 0.48 7.27 0.48 2.63 3.34 6.93 3.09 1.76 0.74 6.69 2.4 1.22
1.36 4.41 5.34 19.58 44.26 17.17 13.74 9.57 6.05 2.09 0.05 0.08 1.03 0.46 1.65 4.96 5.57 0.08 3.59 2.08 0.52 0.1 8.4 0.01 0.25 0.5 0.96 0.29 0.18 0.71 0.56 0.11 0.3 0.14 0.13 0.29 0.15 2.03 0.3 1.29 0.04 0.17 2.93 1.89 0.43 2.12 0.88 0.08
0.76 0.0 0.64 55.32 136.48 40.89 43.81 37.01 2.22 1.79 1.78 1.0 0.62 0.07 0.61 0.05 0.22 1.33 1.04 0.29 0.08 0.1 0.27 2.14 8.16 8.19 40.75 5.69 3.15 5.6 14.74 4.34 4.42 3.17 0.67 1.81 8.21 12.89 0.91 3.38 1.43 1.7 3.5 1.55 1.58 12.51 3.47 3.66
0.32 0.0 0.12 26.75 67.34 17.7 12.06 12.31 2.18 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.09 0.02 0.18 0.07 0.48 0.1 0.24 0.16 0.14 0.0 0.07 0.11 0.05 0.05 0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.13 0.16 0.11
0.0 0.0 0.05 29.83 44.15 15.39 19.29 8.74 4.65 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.75 5.77 5.56 57.5 54.59 20.62 23.32 20.66 6.3 4.58 0.42 0.4 1.97 0.84 2.84 0.66 5.41 4.65 6.16 6.71 5.78 4.56 3.33 2.71 3.85 1.27 2.24 3.72 1.02 3.03 4.17 3.9 3.51 2.89 0.52 2.51 4.01 4.63 1.0 2.94 1.26 1.45 3.39 2.72 2.21 4.77 3.09 2.32
0.15 0.15 5.62 76.55 121.88 87.48 42.8 39.87 3.2 0.39 0.0 0.01 0.11 0.06 0.09 0.01 0.87 0.06 1.42 1.06 0.34 0.5 3.37 2.64 0.24 0.17 0.08 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.57 0.01 0.09 0.06 0.17 0.07 0.09 0.01 0.51 0.13 0.08
1.3 2.76 6.46 21.97 40.15 21.13 14.88 13.89 0.92 0.54 0.34 0.27 0.4 0.17 0.21 0.18 1.33 2.47 1.92 2.67 2.06 2.21 0.26 3.86 4.1 0.53 1.29 2.57 0.6 1.11 3.08 2.06 1.47 1.57 0.33 1.36 2.52 1.07 0.75 0.63 0.56 0.47 0.54 0.92 0.68 1.17 1.25 1.49
0.0 0.0 0.0 8.25 19.27 12.92 2.8 2.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.52 1.58 16.99 30.62 26.03 16.35 13.49 1.43 0.45 0.05 0.08 0.41 0.1 0.53 0.09 0.72 2.36 2.12 1.64 0.95 0.7 0.73 0.52 0.67 0.28 0.3 0.27 0.17 0.66 0.51 0.24 0.48 0.64 0.07 0.17 0.45 0.24 0.12 0.15 0.16 0.05 0.25 0.13 0.48 0.26 0.08 0.33
2.33 2.58 1.55 104.77 172.35 86.92 72.86 57.39 19.62 0.38 0.03 0.08 0.46 0.28 0.19 1.7 0.89 8.49 2.69 1.94 1.61 1.41 0.09 0.83 9.72 0.42 1.07 0.11 0.33 0.14 0.18 0.2 0.07 0.11 0.03 0.01 0.08 0.23 0.05 0.3 0.23 0.27 0.13 0.16 0.12 0.28 0.05 0.3
0.01 0.06 0.31 17.92 34.2 16.58 11.94 13.61 2.46 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 1.03 0.1 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.6 0.0 0.06 0.1 0.0 0.18 0.07 0.05 0.13 0.02 0.02 0.09 0.03 0.04 0.0 0.29 0.04 0.02 0.03 0.04 0.09 0.03 0.07 0.3 0.04 0.14
2.22 1.05 0.62 18.66 28.73 30.92 24.29 11.44 1.47 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.09 0.7 1.44 1.46 1.53 1.19 1.08 0.0 0.47 7.13 3.61 2.19 0.07 0.1 0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01
0.62 3.74 6.54 108.62 261.4 116.36 71.69 53.31 5.63 0.74 0.09 0.06 0.82 0.18 0.56 4.05 2.42 4.44 3.77 5.09 3.57 4.0 2.88 3.8 11.35 4.44 14.27 1.8 0.03 0.11 0.43 0.05 0.07 0.02 0.01 0.05 0.11 0.73 0.04 0.16 0.06 0.06 0.24 0.2 0.07 0.38 0.33 0.19
1.47 2.62 3.96 45.5 79.6 48.71 38.4 31.84 2.59 0.15 0.0 0.0 0.07 0.05 0.03 0.0 1.65 2.48 0.79 4.03 3.26 4.3 0.22 1.72 3.46 1.32 1.2 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.37 0.0 0.05 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.26 0.01 0.0
0.55 9.79 9.63 77.23 192.78 140.59 78.2 57.98 4.26 0.0 0.06 0.0 0.17 0.08 0.02 0.69 0.0 0.0 0.3 1.67 0.06 0.0 0.0 3.33 0.08 0.64 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.09 0.0
0.0 1.31 0.03 28.98 65.01 31.62 16.19 12.26 2.47 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.36 0.03 0.38 0.22 0.15 0.11 0.07 0.02 0.11 0.16 0.0 0.03 0.22 0.06 0.05 0.0 0.06 0.09 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.0 0.17 0.05 0.06 0.05 0.03 0.03
1.72 0.0 0.58 115.14 228.95 81.7 42.71 38.64 5.68 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.28 0.37 0.0 0.0 0.03 0.16 0.05 0.03 0.2 0.16 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
3.52 10.12 19.46 46.62 58.64 60.03 30.41 31.7 8.58 1.22 0.11 0.06 0.54 0.16 1.73 2.02 6.15 3.06 2.89 5.28 4.02 4.62 2.21 3.1 2.28 0.16 0.12 1.94 1.3 0.37 0.36 0.14 0.25 0.53 0.16 0.57 0.58 0.46 0.4 0.36 0.12 0.1 0.25 1.85 0.31 0.56 0.67 0.53
22.88 23.87 38.52 95.57 221.14 83.64 66.28 63.25 21.04 28.2 8.78 9.99 29.85 32.95 28.29 20.22 36.6 18.47 46.56 51.1 53.92 39.71 36.19 17.25 24.39 16.78 22.81 25.61 17.1 24.92 21.46 22.38 30.85 31.2 22.55 25.55 22.9 26.84 27.51 33.88 34.94 37.07 37.65 29.96 32.35 27.12 26.78 29.11
0.0 0.0 0.0 24.16 37.7 41.22 13.91 18.32 0.54 0.04 0.03 0.0 0.03 0.0 0.03 0.65 0.05 0.0 0.08 0.05 0.0 0.05 0.0 0.93 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 0.05 0.27 0.21 0.14 0.0 0.03 0.05 0.04 0.04
0.84 1.53 1.03 79.54 138.62 78.48 52.56 50.78 6.12 0.33 0.22 0.36 0.03 0.03 0.15 1.04 0.61 0.66 0.69 0.54 0.92 0.36 0.02 1.65 0.82 0.09 0.15 2.03 3.17 2.13 2.26 0.65 4.01 1.88 0.21 6.36 2.92 0.29 0.57 0.02 0.0 0.0 0.05 0.82 1.35 0.27 3.61 1.08
0.83 0.49 0.43 62.63 114.56 65.65 40.57 34.3 5.23 0.05 0.06 0.02 0.08 0.0 0.03 0.45 0.92 0.07 0.27 0.21 0.06 0.01 0.13 0.63 0.04 0.12 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.05 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.05 0.03 0.01 0.01 0.06 0.0 0.01 0.08 0.02
2.4 0.0 0.3 35.67 64.4 16.09 13.74 13.7 2.72 0.52 0.84 0.93 0.55 0.25 0.52 0.06 0.05 0.04 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.13 0.08 0.51 0.23 0.41 0.34 0.5 0.06 0.02 1.0 0.24 0.29 0.06 0.2 0.04 0.18 0.39 0.33 0.21 0.21 0.29 0.1
0.28 1.98 3.89 22.94 71.81 23.88 15.57 12.67 2.88 0.26 0.02 0.02 0.12 0.03 0.15 0.28 1.22 1.18 2.17 1.7 1.18 1.86 1.13 1.02 4.89 1.78 9.56 0.11 0.05 0.1 0.03 0.03 0.08 0.1 0.0 0.05 0.15 0.19 0.06 0.1 0.03 0.07 0.14 0.16 0.1 0.14 0.31 0.18
3.15 3.03 8.87 23.97 38.43 16.34 10.79 10.63 3.03 2.04 0.27 0.31 0.97 0.28 1.67 0.58 0.88 0.87 1.51 1.12 1.07 0.84 0.06 0.18 4.9 0.8 7.09 3.19 2.34 1.85 2.58 3.18 3.09 2.29 1.96 3.93 4.95 2.97 0.86 1.28 0.68 0.79 0.96 1.96 1.27 2.62 3.37 4.19
0.15 6.28 10.15 75.22 116.37 104.97 60.22 64.54 2.06 0.48 0.0 0.02 0.31 0.11 0.1 0.74 1.48 4.78 2.38 2.39 2.72 4.91 1.22 3.21 7.1 0.57 1.91 0.17 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.55 0.02 0.13 0.0 0.0 0.15 0.07 0.0 0.4 0.03 0.0
0.1 0.18 0.44 7.83 20.2 11.8 5.3 8.69 1.55 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.05 0.16 0.64 0.16 0.5 0.79 0.59 0.58 0.19 3.6 2.37 0.1 0.19 0.0 0.0 0.02 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.23
0.0 1.04 0.44 42.92 116.42 32.45 15.02 16.81 1.43 1.66 0.0 0.11 0.29 0.04 0.31 2.03 0.77 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.09 0.39 0.07 0.35 0.0 0.06 0.1 0.0 0.1 0.04 0.0 0.36 0.05 0.14 0.11 0.0 0.0 0.04 0.04 0.45 0.0 0.37 2.48 0.02
8.58 4.78 3.76 45.18 90.23 21.31 27.6 24.47 2.46 2.35 0.26 0.32 1.52 1.37 2.55 1.89 2.34 1.88 0.85 2.28 3.42 3.15 1.26 0.62 2.59 1.09 1.86 0.98 1.07 1.31 1.2 0.66 0.86 1.07 0.21 0.71 1.18 1.83 0.29 1.27 1.92 1.75 1.46 0.82 0.58 2.0 0.51 2.9
3.39 2.69 0.72 61.22 152.5 41.65 31.34 39.16 5.95 1.34 0.0 0.0 1.25 0.86 1.6 2.68 2.22 2.26 0.21 1.07 3.55 15.15 0.24 0.68 2.18 1.54 0.38 0.0 0.02 0.03 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.51 0.07 0.15 0.0 0.21 0.38 0.39 0.05 0.37 0.04 0.04
0.0 0.0 0.11 37.12 94.22 43.67 22.57 19.76 1.72 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.06 0.0 0.09 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)