Heatmap: Cluster_304 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g008320.3.1 (Solyc01g008320.3)
-0.88 0.85 -0.35 1.34 -0.08 -0.14 -0.42 0.6 0.13 -0.9 -0.96 -0.57 -0.83 -0.4 0.58 0.02 -0.05 -2.76 -4.46 -0.46 -0.33 0.31 0.17 0.48 0.47 0.09 0.43 0.39 0.61 0.32 0.27 -0.01 -1.38 -0.59
Solyc01g008700.3.1 (Solyc01g008700.3)
-1.01 -0.05 -1.43 -1.12 -1.29 -0.09 0.2 0.52 0.71 -0.08 -0.25 -0.29 0.1 -0.03 -0.08 -0.41 -0.27 -8.14 -6.03 1.96 -1.33 0.02 0.05 -0.08 -0.37 1.9 0.36 0.06 -0.34 0.23 0.39 -0.24 -1.72 -1.33
Solyc01g068450.3.1 (Solyc01g068450.3)
-0.47 0.74 -0.06 -0.24 0.47 -0.14 -0.3 -0.77 -0.03 -0.22 0.37 -0.03 0.98 0.46 0.08 -0.07 -0.03 -2.61 -1.96 0.58 0.77 -0.6 -0.77 -0.54 -0.32 1.54 -0.39 -0.38 -0.12 -0.46 -0.42 0.1 -2.46 0.28
Solyc01g096270.3.1 (Solyc01g096270.3)
0.23 0.63 0.17 0.78 -1.57 -0.77 0.2 -1.16 0.19 -0.01 0.14 0.05 0.14 -0.15 0.45 0.48 0.57 -5.81 -6.54 0.4 -0.54 -0.13 0.4 -0.02 0.05 0.61 0.24 -0.14 0.19 -0.14 -0.06 -0.01 -0.43 -0.43
Solyc01g099730.3.1 (Solyc01g099730.3)
0.23 0.17 -0.13 -0.29 -0.81 -0.64 -0.01 -0.82 0.4 0.14 -0.16 -0.65 0.09 -0.17 0.5 0.27 -0.01 -6.71 -6.95 0.37 -0.09 0.28 -0.18 0.16 0.2 1.17 -0.01 0.26 0.39 0.26 0.25 0.65 -2.57 0.25
Solyc01g100840.3.1 (Solyc01g100840.3)
0.06 0.41 0.46 1.17 -1.13 -0.47 -0.07 0.03 -0.12 0.09 -0.45 -0.29 -0.66 -0.53 0.38 0.21 0.24 -3.46 -2.64 -0.26 -0.77 0.2 0.43 0.31 0.39 0.38 0.27 0.19 0.29 0.08 0.23 0.41 -1.6 -0.19
Solyc02g021550.3.1 (Solyc02g021550.3)
0.11 0.51 -0.41 0.21 0.0 -0.33 -0.11 -0.47 0.53 0.2 0.1 -0.1 0.43 0.09 0.33 0.22 0.15 -4.22 -3.37 0.32 0.16 -0.08 -0.16 -0.05 -0.04 0.46 0.09 0.09 0.13 0.03 0.07 0.17 -0.72 -0.13
Solyc02g031980.3.1 (Solyc02g031980.3)
0.22 -0.02 -0.12 -0.46 0.0 0.15 -0.54 -0.66 -0.1 0.82 0.28 0.2 1.07 0.79 1.11 0.81 0.79 -4.62 -3.38 0.51 0.59 -0.65 -0.97 -1.01 -0.87 0.88 -0.85 -0.97 -0.38 -0.86 -0.65 -0.1 -2.98 0.05
Solyc02g063070.3.1 (Solyc02g063070.3)
0.02 0.68 0.12 0.43 -0.24 -0.53 -0.16 -0.47 -0.36 -0.32 0.2 0.36 0.35 0.13 -0.79 -1.07 -0.99 -8.43 -7.06 0.33 0.15 0.28 0.16 0.25 0.27 0.5 0.39 0.41 0.4 0.32 0.24 0.24 -0.27 -0.08
Solyc02g068500.3.1 (Solyc02g068500.3)
0.18 1.13 0.26 0.59 -0.14 -0.01 0.05 0.2 -0.15 -0.77 -0.72 -0.69 -0.78 -0.56 0.26 -0.11 -0.22 -7.4 -8.18 0.09 -0.59 0.24 0.0 0.07 0.22 0.33 0.34 0.34 0.23 0.4 0.26 0.23 -0.25 0.4
Solyc02g078900.3.1 (Solyc02g078900.3)
-0.03 -0.31 0.63 0.88 -1.04 -1.39 -0.59 -2.23 -0.9 0.05 -0.37 0.2 -0.21 0.62 0.1 0.33 0.59 -4.23 -4.29 -0.26 -0.03 -0.08 0.75 0.47 0.27 0.16 0.2 0.06 -0.18 -0.1 -0.15 -0.27 -4.63 1.73
Solyc02g091100.3.1 (Solyc02g091100.3)
0.3 -1.89 -0.06 -1.85 0.03 -0.35 -1.81 -1.52 -1.08 -0.08 -0.67 -0.31 -0.76 -0.36 -0.73 -0.63 -0.26 -5.82 -5.64 0.96 1.49 0.14 -0.5 0.07 0.69 1.4 -0.07 0.33 0.62 0.26 -0.03 0.87 -0.89 1.22
Solyc03g025950.3.1 (Solyc03g025950.3)
-0.1 -1.88 0.42 -0.56 -0.21 -0.14 -0.18 -1.43 0.07 0.77 0.05 -0.1 -0.0 0.09 0.21 0.3 0.42 - -10.93 0.62 -0.49 -0.23 0.17 0.0 -0.02 1.24 0.28 0.16 0.31 -0.17 -0.1 -0.06 -0.13 0.46
Solyc03g033320.3.1 (Solyc03g033320.3)
-0.75 0.11 0.51 1.09 -0.66 -0.87 -0.26 -0.34 -0.9 0.08 -0.53 -0.52 0.04 0.05 0.57 0.38 0.46 -1.64 -2.28 -0.46 -0.24 0.11 -0.04 0.23 0.53 0.1 0.38 0.58 0.77 0.16 0.04 0.24 -2.22 -0.19
Solyc03g115025.1.1 (Solyc03g115025.1)
0.38 1.98 0.14 0.89 -1.61 -0.7 -0.65 -0.32 -1.17 -1.01 0.58 0.79 0.22 0.49 -0.37 -0.78 -0.98 -6.25 -10.68 -1.71 -2.51 -0.1 0.17 0.1 0.14 0.26 0.41 0.25 0.17 -0.02 0.17 -0.18 0.24 0.11
Solyc04g008590.3.1 (Solyc04g008590.3)
-0.21 0.62 -0.35 1.16 -0.41 -0.48 -0.34 -0.06 0.62 -0.43 -1.19 -1.47 -1.42 -1.25 1.29 0.81 0.91 -1.63 -2.03 -0.49 -1.12 0.09 -0.13 0.62 0.65 -0.43 -0.03 0.15 0.32 0.06 0.03 -0.38 -0.54 -0.04
Solyc04g012180.3.1 (Solyc04g012180.3)
0.02 -0.33 0.12 0.76 0.59 -0.05 -0.16 -0.38 -0.08 -0.54 -0.3 -0.02 -0.27 -0.21 -0.33 -0.56 -0.63 -6.67 -4.91 0.43 -0.02 0.17 0.02 0.19 0.22 0.91 0.17 0.23 0.26 0.31 0.25 0.37 -0.86 0.65
Solyc04g024420.3.1 (Solyc04g024420.3)
0.2 0.82 -0.15 0.47 -0.14 -0.45 0.58 -0.58 -0.14 -0.33 -0.86 -0.52 -0.18 -0.31 -0.13 -0.39 -0.48 -0.32 -1.13 -0.18 -1.44 0.21 0.02 0.27 0.52 -0.53 0.34 0.59 0.85 0.19 0.22 0.53 -2.84 0.58
Solyc04g081740.3.1 (Solyc04g081740.3)
-0.24 1.45 0.31 1.19 -0.25 -0.45 0.24 -0.18 -0.75 -0.54 0.1 -0.15 -0.03 0.11 -0.51 -0.71 -0.66 -1.6 -1.77 0.03 -0.28 0.13 0.34 0.32 0.16 0.37 -0.04 -0.02 -0.07 0.1 0.16 0.09 -1.46 -0.05
Solyc05g009290.3.1 (Solyc05g009290.3)
-0.3 0.64 -0.05 -0.16 0.08 -0.02 -0.34 -0.25 0.03 -0.24 0.24 0.21 0.53 0.5 -0.15 -0.03 -0.04 -7.37 -6.73 0.24 -0.25 -0.04 0.08 0.14 0.26 0.48 0.1 0.13 0.35 -0.03 -0.01 0.33 -1.35 0.41
Solyc05g010660.3.1 (Solyc05g010660.3)
-1.54 -0.33 -1.75 -2.32 0.18 0.52 0.42 1.18 -0.16 -0.78 -0.46 -0.4 -0.2 -0.08 -0.95 -1.52 -1.73 -8.64 -8.48 0.24 -0.04 0.61 1.04 0.92 0.66 -0.01 1.16 0.86 0.46 0.52 0.42 0.21 -1.66 -1.43
Solyc05g026310.3.1 (Solyc05g026310.3)
-0.42 0.13 -0.34 0.33 -1.1 -0.87 0.9 -0.05 0.24 0.05 -0.81 -0.98 -0.35 -0.53 0.27 0.2 -0.01 -1.54 -1.87 0.19 -1.14 0.39 0.41 0.35 0.17 0.27 0.74 0.66 0.66 0.38 0.36 0.07 -0.71 -0.72
Solyc05g053780.3.1 (Solyc05g053780.3)
0.31 1.6 -0.26 0.04 -1.46 -0.74 -0.18 -0.25 -0.76 -0.32 0.46 0.04 0.05 -0.37 -1.08 -1.76 -1.6 -5.41 -5.43 0.41 -0.14 0.22 0.28 0.4 0.46 0.86 0.28 0.25 0.27 0.21 0.19 0.46 -0.12 0.14
Solyc05g056490.3.1 (Solyc05g056490.3)
0.52 0.95 0.49 0.14 -1.39 -0.25 0.16 0.09 -0.11 -0.56 -0.89 -1.18 -0.34 -0.61 0.33 0.13 0.17 -7.17 -9.36 -0.15 -1.45 0.32 0.2 0.19 0.17 0.49 0.52 0.52 0.4 0.45 0.47 0.22 -0.64 0.15
Solyc06g060260.3.1 (Solyc06g060260.3)
-0.24 1.12 0.71 0.91 -0.02 0.12 -0.29 0.55 0.02 -0.97 -0.81 -0.72 -1.0 -0.89 -1.18 -1.66 -1.42 -8.07 -8.82 -0.13 -0.9 0.48 0.39 0.6 0.74 -0.02 0.52 0.54 0.41 0.46 0.44 0.46 -1.2 0.22
Solyc06g062940.3.1 (Solyc06g062940.3)
0.13 0.33 0.11 0.76 -1.36 -0.85 0.5 -0.27 0.2 -0.01 -0.19 -0.24 -0.15 -0.17 0.46 0.51 0.39 -3.21 -3.46 0.24 -0.6 0.13 0.19 0.2 0.27 -0.34 0.19 0.15 0.19 0.14 0.27 0.16 -0.68 0.08
Solyc06g066295.1.1 (Solyc06g066295.1)
0.18 0.42 -0.44 -0.22 -0.65 -0.53 0.4 -0.69 -0.98 -0.23 -0.8 -1.02 -1.3 -0.88 -1.03 -0.71 -0.56 -5.79 -6.77 0.27 0.66 0.56 0.84 0.84 0.92 0.64 0.69 0.51 0.43 0.32 0.38 0.69 -1.18 0.23
Solyc06g067960.3.1 (Solyc06g067960.3)
0.6 1.29 0.54 0.6 -2.02 -0.62 -0.25 0.02 0.34 -0.28 -0.7 -0.5 -0.97 -0.69 0.37 0.13 0.21 -3.4 -4.57 -0.48 -1.62 0.41 0.36 0.24 0.27 0.01 0.42 0.3 0.19 0.47 0.54 0.32 -1.3 -0.22
Solyc06g071260.3.1 (Solyc06g071260.3)
0.05 1.05 0.45 0.49 -1.49 -0.72 -0.22 -0.04 0.02 -0.68 0.43 0.74 0.36 0.29 0.61 -0.07 -0.15 -1.21 -2.24 0.03 -0.48 -0.08 -0.12 -0.1 0.01 -0.05 0.05 -0.04 0.02 -0.16 0.16 0.06 -0.67 -0.1
Solyc07g052420.3.1 (Solyc07g052420.3)
0.48 0.76 0.36 0.42 -0.11 -0.37 -0.63 -1.01 -0.56 -0.3 0.03 0.02 -0.04 -0.26 0.07 0.33 0.34 -5.77 -7.51 0.86 -0.07 -0.1 0.19 0.04 0.12 1.05 0.11 -0.06 -0.06 -0.15 -0.03 -0.01 -0.81 0.06
Solyc07g056500.3.1 (Solyc07g056500.3)
0.38 -3.27 -0.44 -4.27 0.19 0.0 -6.59 -3.87 -0.51 1.52 -1.7 0.31 -1.87 -1.04 -0.82 -0.76 -0.05 - - -0.58 -0.61 0.71 0.59 -0.0 -0.01 -0.11 -0.62 -0.09 1.07 0.81 0.73 1.47 -3.82 2.1
Solyc07g062880.3.1 (Solyc07g062880.3)
-0.49 -1.21 -0.98 -1.29 -0.18 -0.63 -0.06 -0.54 0.1 -0.01 0.19 0.46 0.27 0.05 -0.04 0.12 -0.01 -5.02 -6.02 0.49 0.72 0.51 0.35 0.37 0.39 0.09 0.33 0.35 0.36 0.34 0.48 0.71 -1.58 -0.01
Solyc08g022120.3.1 (Solyc08g022120.3)
0.68 -0.28 -0.89 -0.02 0.64 -0.67 -1.07 -1.22 0.32 0.03 0.65 0.53 1.02 0.47 0.15 0.1 -0.05 -3.16 -3.07 0.32 0.18 -0.21 -0.71 -0.33 0.12 0.64 -0.57 -0.29 0.01 -0.08 -0.16 0.56 -2.07 0.62
Solyc09g007170.3.1 (Solyc09g007170.3)
-0.19 0.85 0.94 1.17 -0.81 -0.42 0.42 -0.22 -0.4 -0.21 -0.24 -0.24 -0.65 -0.67 -0.23 -0.45 -0.41 -0.68 -0.84 -0.25 -0.32 0.18 0.19 0.25 0.33 0.15 -0.22 -0.05 0.07 0.23 0.18 0.32 -1.07 0.22
Solyc09g013080.3.1 (Solyc09g013080.3)
-0.81 0.55 -0.92 0.89 -0.36 0.02 -0.97 0.46 -0.06 -0.44 -0.57 -0.42 -0.67 -0.5 0.59 0.27 0.19 -4.79 -4.66 -0.34 -0.23 0.44 0.38 0.66 0.54 0.21 0.44 0.42 0.52 0.41 0.36 0.2 -1.48 -0.36
Solyc09g031680.2.1 (Solyc09g031680.2)
-0.27 0.11 -0.23 1.22 -2.21 -0.69 -0.09 -0.1 0.01 -0.01 -0.85 -1.05 -0.51 -0.82 0.33 -0.05 0.01 -1.81 -1.52 -0.39 -0.78 0.6 0.35 0.71 0.65 -0.14 0.54 0.59 0.44 0.6 0.6 0.52 -1.71 -0.54
Solyc09g061310.3.1 (Solyc09g061310.3)
0.16 -0.26 0.35 0.31 0.0 -1.19 1.01 -1.32 0.06 -0.13 -1.74 -0.61 -1.53 -0.11 0.22 0.53 0.34 -2.26 -1.67 0.08 -0.97 0.44 0.54 0.54 0.39 0.71 0.2 0.18 0.02 0.36 -0.22 0.02 -1.51 0.59
Solyc10g007200.3.1 (Solyc10g007200.3)
-0.65 -0.17 -0.06 1.05 0.63 -0.73 -0.21 -0.45 0.0 -0.07 -0.71 -1.08 -0.73 -0.88 0.49 0.1 0.06 -7.83 -9.21 -0.18 -0.37 0.47 0.41 0.71 0.8 0.3 0.41 0.54 0.57 0.38 0.32 0.27 -1.45 -0.68
Solyc10g077030.2.1 (Solyc10g077030.2)
0.04 1.01 0.78 1.23 -0.2 -0.57 0.35 -0.57 -0.1 -0.5 -0.15 -0.07 0.13 0.13 0.37 0.28 0.27 -7.95 -9.52 0.35 0.13 -0.32 -0.53 -0.29 0.02 -0.04 -0.21 -0.05 0.23 -0.34 -0.36 0.25 -1.75 0.33
Solyc11g011780.2.1 (Solyc11g011780.2)
0.46 -0.47 1.31 -0.49 0.62 0.22 -3.08 -2.96 -1.63 0.07 -1.45 0.16 -1.28 0.36 -0.87 -0.01 -0.03 -1.37 -1.68 0.65 0.13 -0.25 -0.57 -0.1 0.1 1.08 -1.26 -0.55 -0.11 -0.4 -0.72 -0.01 -0.9 2.26
Solyc11g040390.2.1 (Solyc11g040390.2)
-0.36 1.0 -0.19 -0.07 -0.51 -0.37 0.34 0.14 -0.16 -0.24 -0.42 -0.52 -0.48 -0.68 -0.32 -0.52 -0.59 -5.8 -5.12 -0.34 -1.13 0.73 0.49 0.56 0.46 0.31 0.61 0.66 0.44 0.71 0.69 0.51 -1.65 -0.07
Solyc11g066450.2.1 (Solyc11g066450.2)
-0.6 -0.18 -0.42 -0.3 0.3 -0.54 -0.15 -0.83 0.57 0.2 0.5 0.18 0.89 0.31 -0.45 -0.26 -0.52 -1.87 -1.06 0.28 0.5 0.15 0.08 0.11 0.15 0.28 0.27 0.15 0.13 0.3 0.27 0.21 -1.22 -0.74
Solyc11g071330.2.1 (Solyc11g071330.2)
-0.13 0.67 0.26 0.19 -1.24 -0.97 0.82 -0.15 -0.11 -0.28 -0.27 -0.32 -0.33 -0.24 -0.13 -0.15 0.02 0.26 -0.3 -0.52 -1.05 -0.06 0.79 0.52 0.3 -0.57 0.77 0.48 0.15 0.14 0.08 -0.31 -1.52 -0.06
Solyc12g006830.2.1 (Solyc12g006830.2)
-1.25 -0.23 -1.47 -0.32 0.6 -0.26 0.59 -0.56 -0.3 -0.94 0.06 0.58 0.28 0.04 -0.01 -0.26 -0.39 -5.63 -6.94 0.76 0.66 0.2 -0.01 0.01 0.21 0.05 0.61 0.52 0.76 0.43 0.43 0.5 -1.62 -0.73
Solyc12g009410.2.1 (Solyc12g009410.2)
-0.36 0.04 -1.18 0.88 -0.12 -0.18 -0.48 -0.01 -0.1 -0.08 -1.05 -1.24 -1.13 -0.94 1.56 1.29 1.22 -6.57 -6.34 -0.65 -1.11 0.1 -0.27 0.33 0.23 -0.1 -0.01 0.23 0.52 0.16 0.14 0.05 -0.58 -0.01
Solyc12g088420.2.1 (Solyc12g088420.2)
-0.12 0.33 0.02 -0.2 -1.85 -0.7 -0.79 0.12 0.25 -0.32 -0.35 -0.69 0.03 -0.32 0.95 0.72 0.79 -9.25 -10.89 0.42 -1.4 0.39 0.76 0.59 0.31 0.43 0.51 0.24 0.06 0.13 0.45 -0.14 -1.34 -0.63
Solyc12g098830.2.1 (Solyc12g098830.2)
-0.95 0.35 -1.01 -1.01 -0.16 0.31 0.34 0.79 -0.17 -0.32 0.26 -0.14 0.24 -0.02 -0.28 -0.74 -0.76 -6.79 -6.86 -0.05 0.04 0.43 0.36 0.43 0.36 1.19 0.45 0.46 0.31 0.48 0.41 0.22 -2.17 -1.13
Solyc12g099110.2.1 (Solyc12g099110.2)
-1.01 0.8 -0.27 0.6 -0.84 -0.3 0.47 0.54 -0.32 -0.7 -1.48 -1.25 -1.01 -1.25 -0.35 -0.82 -0.61 -5.51 -7.97 -0.19 -1.1 0.89 0.84 0.88 0.83 0.19 0.66 0.63 0.52 0.74 0.75 0.62 -2.2 -0.61
Solyc12g099700.2.1 (Solyc12g099700.2)
-0.61 0.75 -0.01 0.47 -1.08 -0.4 0.09 0.41 0.2 -0.74 -0.45 -0.44 -0.84 -0.78 0.43 0.25 0.1 -4.37 -3.9 -0.09 -0.33 0.45 0.44 0.63 0.56 -0.03 0.35 0.45 0.44 0.4 0.42 0.23 -0.96 -0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.