Heatmap: Cluster_172 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.36 -0.54 -0.36 -2.13 0.83 -0.95 -0.94 -0.99 -1.22 -0.16 -2.53 -2.31 -0.57 -1.56 -0.19 -0.1 0.81 -0.31 -0.07 -0.03 -0.48 -0.89 -2.05 -2.73 -1.22 -0.74 -1.3 1.56 0.26 0.8 0.48 0.55 0.78 0.76 0.97 0.79 1.07 0.66 0.18 -0.17 -1.26 -1.42 -0.31 0.77 0.08 0.61 0.82 -0.07
-1.6 -0.8 -0.62 -4.69 0.48 -0.46 -0.53 -0.61 -2.56 0.1 -0.56 -0.77 -0.34 -0.63 -0.07 -1.28 0.18 -0.83 0.22 0.39 -0.03 -0.14 0.11 -2.75 -0.05 -0.54 0.5 1.11 0.13 0.42 0.08 0.6 0.59 0.76 -0.14 0.58 0.47 0.18 0.14 0.32 -0.17 -0.5 0.27 0.57 0.4 0.21 0.61 0.45
-0.01 -0.26 -0.04 -1.74 -0.64 -1.27 -1.55 -1.98 -0.44 -0.1 -1.89 -1.77 -0.43 -0.19 -0.11 -0.56 0.43 0.17 0.15 -0.08 -0.13 -0.06 -0.62 0.55 -0.02 -0.63 -0.35 0.99 0.58 0.42 0.13 0.31 0.43 0.6 0.08 0.48 0.5 0.29 0.36 0.08 -0.66 -0.79 0.08 0.56 0.69 0.29 0.73 0.24
-2.24 -0.32 0.53 -0.68 1.24 0.1 -0.31 -0.46 -1.25 -0.47 -2.92 -3.13 -0.88 -1.58 -0.42 -2.32 0.55 -1.41 0.38 0.52 0.34 -0.25 1.03 -2.57 -0.99 -1.63 -1.44 1.13 0.52 0.64 0.39 0.1 0.48 0.73 -0.34 0.84 0.49 0.02 0.13 0.18 -1.4 -1.32 0.07 0.87 0.4 0.01 0.87 -0.03
0.16 -0.23 -0.23 -2.64 -1.37 -1.27 -1.78 -1.52 -0.81 -0.58 -3.75 -3.58 -0.68 -1.04 -0.15 -1.58 0.03 -1.23 0.35 0.1 0.46 -0.02 1.81 -2.21 -0.52 -1.7 0.69 0.87 0.32 0.63 0.42 -0.31 0.56 0.55 0.18 0.28 0.16 0.36 0.63 0.71 -0.91 -1.08 0.44 0.45 0.71 0.39 0.76 0.38
-0.91 -0.65 -1.15 -2.83 0.07 -2.19 -2.41 -2.87 -1.32 -0.02 -0.76 -0.77 -0.24 0.2 0.36 -0.52 -0.3 -0.96 -0.08 0.07 -0.01 -0.17 0.28 -2.23 -0.48 -1.2 -0.47 0.57 0.61 0.63 0.19 0.27 0.58 0.61 0.44 0.58 0.49 0.14 0.72 0.32 0.24 0.11 0.44 0.73 0.71 0.18 0.8 0.7
-1.2 -0.77 -0.52 -3.55 -0.43 -0.83 -0.82 -1.3 0.03 -0.19 -4.67 -4.95 -0.81 -1.0 -0.29 -3.31 0.81 -1.63 1.58 1.02 0.7 0.18 2.06 -3.19 -0.9 -0.71 -0.77 0.55 -2.1 0.72 -0.22 0.13 0.34 0.03 -3.37 -0.68 -0.52 0.38 -0.32 0.92 -1.04 -0.64 1.05 0.79 0.48 0.37 0.93 0.66
-1.05 -0.47 -0.12 -3.09 -1.08 -2.17 -2.1 -2.18 -1.02 -0.47 -2.43 -2.0 -0.21 0.23 -0.05 -1.68 -0.3 -0.72 -0.2 0.22 0.07 -0.36 1.26 -1.0 -0.42 -0.41 -0.71 1.14 0.69 1.01 0.39 -1.12 0.53 0.74 0.13 0.67 0.43 0.32 0.83 0.7 -0.69 -0.68 0.65 0.59 0.62 0.3 0.62 0.41
0.42 0.62 0.76 -3.69 0.16 0.47 0.63 0.66 -0.13 -0.67 -1.97 -1.63 -1.04 -1.64 -0.39 -4.49 1.2 0.07 0.99 0.89 0.7 0.37 1.01 -0.05 0.01 -0.77 -0.09 0.19 -1.23 -0.3 -1.07 -0.39 -0.13 -0.05 -0.92 -0.5 -0.86 0.08 -0.72 0.19 -0.46 -0.77 0.26 0.13 0.02 0.18 0.49 0.19
-1.59 0.35 0.49 -3.74 0.99 0.56 0.58 0.32 -0.14 -0.66 -3.79 -4.16 -1.32 -1.76 -0.93 -0.05 0.75 -1.11 0.26 0.57 0.7 -0.17 0.36 -2.04 -0.93 -1.86 -2.11 1.22 0.75 0.43 0.14 -0.15 0.37 0.76 0.06 -0.64 0.51 -0.05 0.28 0.11 -1.92 -2.18 0.48 0.54 0.63 -0.15 0.63 -0.14
-0.63 -0.84 -0.04 -3.83 -0.55 -1.07 -1.56 -1.74 -0.92 -0.45 -1.78 -1.32 -0.56 -0.42 -0.71 -0.62 0.96 0.25 0.59 0.31 0.04 0.7 1.34 -1.02 -0.93 -0.93 -0.69 0.74 -0.3 0.42 -0.25 0.92 0.41 -0.07 -0.15 1.13 -0.37 0.58 -0.05 -0.12 0.06 -0.39 -0.12 0.59 0.17 0.57 0.88 0.43
-0.49 -1.22 -0.13 -1.57 -1.52 -1.12 -2.09 -1.56 -1.21 0.61 -0.93 -0.94 0.28 -0.02 0.03 -0.44 0.53 -0.26 0.49 0.34 0.15 0.05 1.2 -1.63 -0.08 -0.62 -0.71 0.14 0.58 -0.18 -0.02 0.33 0.45 0.43 -0.46 -0.12 0.1 0.5 -0.23 0.43 0.42 0.7 0.59 0.45 0.36 0.41 0.17 0.02
-0.09 0.23 0.16 -0.3 -1.66 -0.58 -1.27 -1.02 -0.55 0.05 -1.05 -0.97 0.43 0.27 -0.29 -0.16 0.14 0.23 0.54 0.5 0.03 0.28 1.19 0.09 0.35 -0.95 -0.38 -0.52 0.02 -0.0 -0.18 -0.06 -0.16 0.09 0.13 -0.6 -0.45 0.26 -0.4 0.27 0.62 0.94 0.42 -0.09 -0.33 0.3 -0.07 -0.1
-1.87 -0.62 -1.85 -4.96 0.26 0.33 0.28 0.15 -2.64 -0.45 -0.35 -0.3 -1.02 -0.77 -0.16 -1.46 -0.08 -1.01 -0.52 -0.31 -0.7 -0.63 1.21 -1.96 0.12 -1.47 0.98 1.0 0.13 0.41 -0.24 0.47 0.47 0.86 -0.16 0.26 -0.0 -0.74 0.6 0.42 -0.75 -1.65 0.41 0.88 0.81 -0.53 1.34 0.59
-1.29 -0.5 0.72 -3.0 -1.33 -1.3 -1.8 -1.9 -1.62 -0.69 -2.64 -2.67 -0.69 0.17 -0.96 -1.55 -0.48 0.36 0.7 -0.21 -0.4 0.62 2.71 -0.68 -1.05 -2.27 -1.85 0.07 -0.89 0.25 -0.35 -0.05 0.47 0.37 -0.9 -0.58 -0.6 0.62 0.32 0.8 0.11 0.4 0.97 0.2 0.64 0.62 0.43 0.53
-1.56 -0.88 -0.11 -3.19 0.72 -0.94 -0.6 -0.61 -1.09 -0.11 -1.2 -1.03 -0.54 -0.52 0.08 -1.81 0.79 -1.39 0.61 0.81 0.59 -0.07 0.83 -1.68 -0.73 -1.42 -0.8 0.57 -0.2 0.25 -0.22 0.21 0.53 0.75 -0.82 0.25 0.14 0.04 0.59 0.68 -0.11 0.19 0.7 0.63 0.77 -0.0 0.52 0.01
-1.79 -1.1 0.51 -3.27 0.89 -0.9 -1.43 -1.63 -0.3 -0.36 -1.56 -1.47 -0.39 -0.21 -0.59 -2.58 0.63 -0.71 0.82 0.64 0.35 0.29 1.05 -2.1 -0.43 -1.11 -0.3 0.81 0.31 0.21 -0.21 0.29 0.47 0.76 -0.31 0.25 0.19 0.16 0.39 0.47 -0.45 -0.46 0.35 0.48 0.47 0.21 0.53 0.26
-1.33 -1.1 -1.12 -2.15 0.75 -0.43 -0.6 -0.55 -1.06 -0.35 0.02 -0.27 -0.82 -0.81 0.23 -0.53 -0.08 -0.43 -0.35 -0.01 -0.05 0.24 -0.33 -0.47 -0.09 -0.31 0.01 0.96 0.77 0.7 0.28 0.52 0.2 0.53 -0.51 -0.08 0.26 -0.35 -0.12 0.04 0.05 -0.25 0.14 0.69 0.17 -0.38 1.34 0.66
-0.41 -0.24 -0.72 -2.65 -1.37 -1.68 -1.9 -2.17 -0.43 0.09 -2.26 -2.28 -0.14 -0.25 0.36 -0.82 -0.15 0.18 -0.37 -0.27 0.0 0.3 1.85 -1.35 -0.74 -0.56 -1.36 0.51 0.14 0.59 0.22 -0.26 0.23 0.6 0.19 0.59 0.32 0.39 0.94 0.36 -0.77 -0.58 0.32 0.59 0.44 0.34 1.11 0.23
-0.81 -0.01 -0.01 -1.45 0.41 -1.54 -1.57 -1.66 -0.3 -0.32 -1.72 -1.81 -0.64 -1.24 -0.01 -0.46 0.5 -0.23 0.33 0.08 -0.14 -0.22 -0.19 -0.48 -1.1 -1.85 -1.61 1.21 0.55 0.66 0.35 0.24 0.77 0.81 0.18 0.83 0.57 0.15 -0.13 0.41 -0.7 -0.75 0.28 0.9 0.53 0.16 0.71 0.33
-0.54 -0.61 -0.85 -3.31 1.67 -0.57 -0.97 -1.07 -0.51 -0.26 -0.7 -0.88 -0.49 0.1 0.03 -1.22 -1.24 -1.46 -0.03 -0.04 -0.2 -0.14 -0.17 -1.41 -0.41 -1.98 -0.74 0.88 0.85 0.22 0.34 -0.01 0.67 0.67 0.66 0.41 0.5 -0.05 0.46 0.3 0.31 -0.1 0.5 0.13 0.66 0.02 0.08 0.45
-1.1 -0.64 -0.85 -3.6 0.22 -0.7 -1.08 -1.31 -0.74 0.0 -0.52 -0.57 -0.13 -1.15 -0.0 -0.38 0.33 -0.46 0.11 0.14 0.06 0.02 -0.1 -0.66 0.01 -0.54 -0.14 0.81 0.6 0.38 0.12 0.69 0.5 0.81 -0.21 0.77 0.49 -0.14 0.15 0.17 -0.62 -0.53 0.12 0.93 0.42 -0.17 0.96 0.05
-1.78 -0.75 0.05 -3.24 0.42 0.33 0.38 0.28 -1.08 -0.08 -1.61 -1.52 -0.19 -1.07 -0.32 -0.77 0.13 -1.41 0.81 0.51 0.43 0.1 0.43 -2.99 -0.65 -1.17 -0.52 1.15 0.36 0.2 0.12 0.56 0.55 0.97 0.51 0.89 0.58 0.0 -0.01 -0.22 -1.4 -1.63 -0.25 0.21 0.26 0.02 0.5 0.16
-0.28 0.19 0.39 -2.56 0.66 -0.57 -1.06 -0.69 -0.86 -0.1 -1.68 -1.79 -0.1 -0.01 -0.22 0.09 0.62 -0.1 0.41 0.19 0.04 -0.08 0.91 -1.16 -0.58 -0.43 -0.49 0.61 0.19 0.23 -0.08 0.02 0.32 0.46 -0.11 -0.41 0.24 0.06 0.18 0.37 -0.24 -0.23 0.56 0.36 0.48 0.11 0.37 -0.1
-1.67 -0.84 -0.95 -4.27 1.25 -0.57 -1.13 -1.4 -1.18 -0.41 -1.46 -1.55 -0.88 -1.45 -0.22 -2.04 -0.11 -1.4 0.09 0.16 0.1 -0.39 1.13 -2.27 -0.61 -2.16 0.11 0.93 0.57 0.45 -0.09 0.52 0.66 0.76 -0.47 0.47 0.11 0.16 0.49 0.92 -0.21 -0.56 0.83 0.7 0.85 0.2 0.92 0.35
-1.86 -0.81 -0.54 -3.4 0.74 -0.7 -0.76 -0.75 -2.01 -0.31 -0.61 -0.52 -0.07 -0.2 -0.33 -0.34 0.64 -0.94 -0.16 -0.02 -0.14 -0.51 0.95 -1.57 -0.58 -0.84 -0.1 0.93 0.41 0.28 0.04 0.43 0.39 0.76 0.26 0.57 0.39 0.47 0.19 0.37 -0.32 -0.46 0.4 0.62 0.33 0.46 0.37 0.19
-0.9 0.16 0.23 -2.33 -2.07 -1.67 -1.93 -1.91 -1.07 -0.08 -0.43 -0.35 -0.53 -0.76 -0.18 -0.22 0.9 0.38 -0.22 -0.23 -0.23 -0.11 -0.11 -1.12 -0.19 -0.68 -0.87 0.84 1.08 0.41 0.09 0.1 0.51 0.9 -0.38 0.6 0.46 -0.15 0.81 0.2 -0.41 -0.07 0.26 0.54 0.66 -0.15 0.79 0.17
-2.06 -1.07 -0.2 -1.34 0.64 -1.14 -1.98 -1.56 -0.81 0.08 -4.98 -5.8 -1.15 -1.71 0.29 -1.69 -0.43 -0.72 -0.89 -0.24 0.18 -0.31 0.67 -1.61 -0.63 -2.64 -1.77 1.02 0.46 0.67 0.24 -0.78 0.55 1.01 -0.19 0.81 0.86 0.02 0.99 0.63 0.52 0.06 0.31 1.43 0.5 -0.21 1.32 0.43
-4.36 -2.48 -1.46 -6.27 -0.86 -2.83 -3.05 -3.84 -1.57 -1.24 -1.01 -0.81 -1.39 -1.81 -1.54 -2.57 0.33 -2.84 1.07 0.71 0.29 -0.79 2.18 -5.18 0.55 -1.68 2.22 0.85 -1.17 0.45 0.45 0.34 0.14 0.38 0.12 0.01 -0.02 0.25 0.32 0.54 0.2 0.01 0.38 0.58 0.07 0.25 0.5 0.45
0.5 0.51 0.59 -2.08 0.34 -0.69 -0.94 -1.27 -1.59 -0.32 -1.03 -1.14 -0.4 -0.82 -0.47 -0.23 0.67 -0.06 0.85 0.65 0.77 0.47 1.65 -1.21 0.45 -0.07 0.47 -0.16 -1.34 0.01 -0.49 0.03 0.05 -0.0 -0.97 -0.14 -0.36 -0.17 -0.45 0.17 -0.1 -0.15 0.15 0.12 0.0 -0.11 0.14 0.33
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-1.16 -0.49 -1.02 -1.97 1.35 0.0 -0.19 -0.33 -0.96 -0.44 -0.59 -0.81 -1.7 -2.65 -0.44 -0.42 0.19 -1.0 0.52 0.57 0.13 0.04 1.07 -2.6 -0.37 -3.58 -0.83 0.47 1.0 0.34 0.19 0.27 0.57 0.63 0.17 0.32 0.14 0.09 -0.51 0.3 -0.46 -0.79 0.56 0.51 0.24 0.26 0.56 0.59
-1.75 -0.3 0.44 -3.4 0.43 -0.54 -1.06 -0.58 -1.88 -0.02 -1.68 -1.75 -0.35 -0.8 -0.47 -0.12 0.84 -0.34 1.05 0.59 0.59 0.55 1.67 -1.52 -0.49 -0.93 -0.35 -0.45 -1.24 0.2 -0.27 0.03 0.32 0.12 -2.49 -0.47 -0.19 0.47 -0.13 0.36 0.39 0.33 0.63 0.41 0.33 0.45 0.35 0.6
-0.79 -0.43 -0.0 -2.69 0.5 -0.07 -0.44 -0.12 -0.66 -0.14 -0.6 -0.66 -0.68 -1.86 -0.25 -0.34 0.54 -0.53 0.48 0.41 0.56 0.49 1.0 -1.58 -0.58 -1.15 -0.94 0.3 0.39 0.42 0.05 0.33 0.48 0.65 -0.1 0.36 -0.04 0.28 -0.29 0.21 -0.92 -0.64 0.26 0.27 0.71 0.3 0.36 0.25
-1.37 -0.48 -0.61 -2.63 -0.66 -0.61 -0.66 -0.67 -1.42 0.19 -1.16 -0.95 -0.89 -0.6 0.1 -0.4 0.04 -0.61 0.19 0.53 0.65 0.21 0.01 -1.0 -0.37 -1.39 -0.62 0.63 0.78 0.46 0.12 -0.09 0.63 0.45 0.07 0.7 -0.01 0.31 0.16 0.62 0.06 -0.02 0.4 0.93 0.28 0.34 0.76 0.19
-0.93 -0.76 0.46 -2.18 0.99 -0.53 -0.3 -0.67 -0.08 -0.26 -1.04 -1.06 -0.99 -1.57 -0.21 -0.57 0.97 0.0 0.76 0.54 0.49 0.23 -0.27 -1.38 -0.35 -0.79 -0.3 0.93 0.29 0.41 -0.13 0.14 0.28 0.54 0.02 0.37 0.0 0.17 -0.23 0.15 -0.61 -0.94 0.14 0.23 0.1 0.23 0.38 0.51
-0.23 0.2 0.39 -1.83 -1.37 -0.54 -0.75 -1.03 -0.55 0.09 -0.76 -0.9 -0.31 -0.2 -0.22 0.58 0.75 0.43 0.5 0.65 0.6 0.64 1.18 -0.63 0.2 -0.36 -0.2 -0.29 -0.47 -0.01 -0.47 -0.16 0.07 0.31 -0.73 -0.07 -0.56 0.28 -0.26 0.26 0.2 0.26 0.37 -0.05 0.0 0.26 -0.33 0.05
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-0.66 -0.73 -0.38 -1.32 -0.25 0.03 0.34 0.68 -0.5 -1.09 -4.54 -3.98 -2.06 -2.3 -1.19 -2.04 -0.53 -2.56 0.94 0.82 0.34 -1.0 1.46 -4.14 -0.11 -1.88 -1.02 1.24 -0.68 0.25 0.74 -2.01 0.92 0.59 -0.14 0.21 0.86 0.2 0.06 0.85 0.34 0.29 0.64 0.23 0.73 0.05 0.38 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.