Heatmap: Cluster_199 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.97 -2.17 -2.21 -3.58 0.84 0.38 -0.31 -0.11 -0.28 1.23 -4.53 -4.73 1.35 0.79 1.18 0.47 -0.2 -1.18 -1.01 -0.99 0.12 0.16 -3.43 2.13 -1.34 -2.04 -2.75 -1.81 -1.07 -0.24 1.24 -2.29 0.1 0.26 -2.54 -1.64 0.72 0.51 0.12 0.01 0.6 0.17 0.68 -0.06 -0.24 0.49 -0.34 -0.26
-2.3 -2.01 -0.28 -2.11 0.54 0.18 0.48 0.06 -1.1 1.04 -0.16 -0.59 0.29 -1.12 0.43 -2.37 -1.69 -0.6 -1.44 -1.66 -1.26 -0.67 -4.69 2.59 -0.24 -2.45 -1.98 -1.45 1.19 0.36 0.29 0.23 0.66 0.3 -0.3 0.44 0.32 1.1 -1.07 -0.26 -0.56 -0.21 0.13 -1.39 -0.15 1.12 0.43 -0.55
-2.31 -2.56 -3.15 -5.56 -0.68 -1.17 -0.88 -0.34 -2.47 0.48 -2.37 -2.26 -0.02 -0.39 1.02 -1.48 -1.45 -1.32 0.5 0.56 0.46 0.33 0.03 1.78 0.05 -2.17 0.13 0.43 -0.15 0.28 0.57 -1.0 0.46 0.16 -0.16 0.7 0.5 0.56 -0.69 0.47 0.6 0.22 0.69 0.34 0.13 0.47 0.17 0.43
0.78 0.44 -1.28 -1.82 -0.92 -0.44 -0.55 -0.38 0.56 0.53 -1.22 -1.48 0.7 0.18 0.49 0.07 -0.14 -0.25 -1.03 -0.79 -0.97 -1.01 -1.29 1.9 -0.45 0.53 -1.14 -0.43 0.15 -0.28 0.24 0.31 0.62 0.34 0.55 -0.27 0.78 0.26 -0.24 -0.07 -2.18 -2.03 -0.0 -0.37 0.95 0.36 -0.21 -0.35
-0.46 -1.95 -1.47 -2.96 -1.07 0.68 -1.24 -0.42 -0.07 1.07 -2.65 -2.7 -0.55 -0.94 1.14 - -1.33 -0.49 -2.88 -0.65 -0.9 -0.63 -4.1 2.47 -0.11 -0.4 -0.13 0.35 -1.48 0.03 0.6 0.48 0.27 0.53 -1.52 0.64 0.92 1.06 -0.43 0.17 -0.48 -0.43 -0.69 1.24 -0.27 0.97 0.13 -0.02
-2.15 -1.57 -1.29 -2.43 -0.08 0.16 0.62 -0.13 -1.81 0.34 1.32 1.12 0.61 0.18 0.35 -2.34 -0.9 -0.26 -1.34 -0.64 -0.68 -0.36 -3.78 2.37 1.01 0.79 1.25 -0.25 -0.77 -0.54 0.07 0.35 -0.19 -0.42 -1.54 -0.46 0.35 -0.17 -0.82 -0.38 0.05 -0.47 -0.54 -0.52 -0.47 -0.16 -0.63 -0.4
-1.08 -1.17 -1.61 -1.99 -0.02 -0.09 0.3 0.39 -2.13 0.64 0.73 0.72 0.38 -0.57 0.54 -0.97 -0.83 -0.68 -0.58 -0.34 -0.54 -0.01 -3.76 1.89 0.34 0.64 0.15 0.02 -0.34 -0.02 0.3 0.32 0.04 0.09 0.27 0.13 0.29 0.21 -0.64 -0.34 -0.35 -0.32 -0.24 -0.17 -0.59 0.14 0.3 0.24
-2.93 -0.5 0.19 -1.67 0.6 0.53 1.25 0.7 -0.49 0.8 -3.67 -3.4 0.38 -0.57 0.86 -0.32 0.2 -0.88 -1.36 0.45 0.03 0.32 -2.56 1.2 0.48 0.28 1.63 -0.45 -1.35 -0.77 0.2 -0.63 -0.52 -1.1 -2.01 -0.51 0.13 0.63 -1.62 -0.06 -0.62 -0.67 0.39 0.42 -1.55 0.59 0.64 -0.44
-2.0 -0.79 -0.75 -2.38 0.44 -0.27 -0.54 -0.69 -1.53 0.28 0.16 -0.03 0.07 -0.59 0.11 -2.62 -0.64 -0.15 0.26 0.04 -0.26 0.19 -0.26 1.55 0.66 -0.46 0.24 0.1 0.24 0.04 0.43 0.09 0.25 -0.18 -1.08 0.02 0.2 0.45 -0.07 -0.0 0.16 0.08 0.23 0.36 -0.02 0.46 0.57 0.12
-1.21 -0.51 -0.7 -2.04 0.92 -0.66 -0.59 -0.77 -0.27 0.26 0.53 0.47 -0.19 -0.77 0.07 -0.16 -0.21 -0.49 -0.04 0.19 0.34 0.3 -0.72 1.69 0.73 -0.5 0.49 -0.18 -0.36 0.14 0.15 -0.17 0.24 -0.09 -0.64 -0.31 0.09 0.09 -0.73 0.03 -0.02 -0.04 0.21 0.02 0.04 0.14 -0.05 -0.18
-1.99 -0.99 -5.14 -5.36 0.45 1.36 2.0 1.51 -0.5 1.43 -3.37 -2.65 1.84 2.05 1.68 -3.52 -1.22 -2.42 -0.93 -1.51 -2.5 -1.44 -3.1 2.63 0.5 -0.06 2.48 -2.47 -1.96 -2.45 -2.22 -6.87 -1.7 -2.32 -4.54 -2.95 -1.55 0.0 -3.01 -1.9 -4.37 -4.06 -0.81 -1.96 -2.14 -0.28 -4.41 -2.58
- -5.22 -2.33 -1.4 -0.01 0.64 0.84 0.8 -5.77 1.05 -3.3 -1.15 1.44 1.72 1.15 - -0.25 -0.86 -3.92 -2.48 -2.2 -0.85 -0.83 3.02 1.44 -0.18 3.59 -3.14 -2.67 -3.98 -1.71 - -1.13 -1.87 -4.39 -3.3 -1.49 -1.8 -2.79 -2.33 -4.5 -5.22 -1.31 -1.9 -2.31 -2.98 -5.51 -2.84
-0.4 -0.53 -0.39 0.61 -0.52 -0.07 -0.57 -0.64 -0.76 0.75 0.2 0.16 0.95 0.93 0.38 -0.29 -0.47 -0.09 -0.22 -0.49 -0.5 -0.09 -2.99 0.74 0.77 0.24 2.29 -0.86 -0.71 -0.6 -0.6 0.09 -0.29 -0.61 -0.24 -0.82 -0.07 0.31 -1.05 0.03 -0.37 -0.37 0.28 -0.7 -0.49 0.27 -1.51 -0.81
-1.31 -1.88 -6.69 -4.5 -1.79 -1.32 -1.73 -2.39 -1.51 0.73 -2.01 -1.56 0.52 0.87 0.66 -2.3 -1.09 -1.12 -0.82 -0.26 0.21 -0.1 -3.61 2.26 1.21 -0.29 1.27 0.56 0.64 -0.24 0.32 0.23 0.66 0.26 -0.37 1.06 0.42 0.24 0.36 -0.67 -3.06 -2.37 -0.2 0.02 0.55 0.22 0.35 0.21
-1.53 -5.26 -2.18 -4.45 -2.83 -2.65 -3.45 -2.42 -4.66 0.65 -3.8 -3.17 0.74 0.39 0.54 -4.73 -1.33 -0.92 0.15 0.84 1.71 1.59 -5.49 3.36 0.9 1.12 2.71 -6.76 -6.26 -1.35 -3.99 -6.05 -5.21 -7.08 - - - 0.02 - -0.56 1.57 0.78 -0.12 -0.47 -3.36 -0.4 -3.42 -3.32
-3.89 -1.18 -1.34 -3.05 0.31 -0.43 -0.45 -0.87 -2.13 0.02 -1.24 -0.98 -0.62 -1.33 -0.28 -1.67 -0.85 -0.15 -0.45 -0.23 -0.3 -0.4 -1.86 2.26 1.38 -0.11 0.75 0.48 -0.46 0.1 0.86 -0.41 0.27 0.11 -0.18 0.32 0.25 0.18 -0.86 -0.02 0.78 0.67 0.16 0.11 -0.38 0.14 0.68 0.52
-2.52 -2.15 -1.98 -3.65 0.25 -0.37 -1.28 -1.26 -1.77 1.09 -4.18 -4.04 -0.27 -0.48 0.86 -3.37 -0.21 -1.97 -0.68 -0.32 0.14 0.48 -2.82 2.61 -0.04 -3.43 -2.1 0.31 -0.98 -0.17 0.67 -1.35 0.71 0.55 0.45 -0.01 0.54 1.13 0.49 0.62 -1.27 -1.55 0.52 0.64 0.72 1.13 0.36 -1.47
-0.94 -0.65 0.23 -0.19 0.59 -0.17 0.31 0.27 -0.27 0.56 -1.63 -1.75 -0.06 -1.35 0.29 -2.12 0.45 -0.26 -0.13 -0.02 -0.22 0.25 -3.14 1.94 0.2 0.6 -0.49 0.5 0.35 -0.05 0.47 -0.81 0.41 0.41 -1.58 0.26 0.76 -0.0 -0.37 -0.64 -0.88 -1.02 -0.34 -0.21 -0.09 0.05 0.14 0.06
-0.37 -0.55 -0.45 -1.25 0.9 0.31 0.55 0.33 -0.3 0.69 0.82 0.74 0.63 0.09 0.53 -0.26 -1.11 -0.39 -0.06 -0.05 -0.28 0.53 -2.9 0.92 0.64 0.04 0.45 -0.17 -1.02 -0.43 0.14 0.28 -0.2 -0.77 -0.84 -0.94 0.3 0.01 -1.61 -0.59 -0.1 -0.46 0.05 -0.16 -0.8 -0.04 -0.09 0.19
-0.23 -0.72 -0.49 -2.96 0.15 -0.81 -0.27 -0.24 -0.35 0.81 -4.04 -3.98 0.47 -0.12 0.72 -1.52 0.42 -0.01 0.08 0.21 -0.46 0.07 -3.3 1.48 -0.06 -0.41 -1.29 0.45 -0.29 0.26 0.82 -0.82 0.07 -0.31 -0.17 0.06 0.51 1.14 -0.92 0.15 0.32 0.13 0.19 -0.34 -0.33 1.09 -0.01 0.12
-3.44 -2.3 0.05 -2.05 -2.69 -1.84 -1.46 -0.83 -3.22 1.35 -2.17 -2.53 1.6 1.36 0.67 -3.8 -1.6 -1.87 -1.73 -1.22 -1.67 -1.01 -9.08 2.03 -1.07 -2.16 -1.96 -0.21 -1.12 0.27 0.35 -0.88 1.0 0.35 -0.66 -1.08 0.9 1.39 -0.35 0.72 1.12 0.49 0.84 0.16 0.54 1.44 -1.37 -0.15
-2.72 -2.59 -1.11 -2.1 0.23 0.47 0.23 0.3 -2.02 0.36 -0.78 -0.95 -0.07 -1.44 0.3 -2.39 -1.29 -0.9 -0.74 0.62 1.51 1.3 -2.69 2.56 1.18 0.86 0.77 -0.02 -0.31 -0.34 0.23 -0.07 -0.19 -0.46 -0.55 0.37 0.26 -0.45 -1.6 -0.77 -0.91 -1.16 -0.55 -0.51 -1.26 -0.61 -0.27 0.04
-3.4 0.07 -1.15 -2.49 -0.95 -0.45 0.84 0.09 -2.6 0.59 -4.41 -4.52 0.0 -0.05 0.07 -1.44 -1.24 -0.22 -1.84 -1.2 -0.69 -0.38 -1.51 1.98 -0.2 -0.39 -0.62 0.91 0.45 0.43 0.9 -0.04 0.51 0.5 -0.3 0.79 0.78 0.9 -0.46 0.13 0.05 0.14 -0.38 0.02 -0.46 0.83 0.12 0.36
-0.31 -3.33 -2.08 -1.21 1.53 -0.35 -1.16 -1.29 -1.51 1.36 -2.54 -2.88 1.24 0.99 0.96 -1.47 0.29 -0.97 0.7 0.6 0.89 1.51 -1.01 1.76 0.58 -0.31 -0.75 -0.62 -1.66 -1.1 -0.85 -1.71 -1.03 0.04 0.89 -2.09 -0.61 0.61 -0.08 -0.54 -1.39 -2.19 0.17 -0.94 -0.54 0.37 -0.59 0.08
-0.6 -2.04 -2.42 -4.34 -0.61 0.15 0.15 0.01 -0.77 0.98 -1.42 -1.51 -0.07 -1.41 0.36 -0.25 -0.66 0.1 -1.46 -0.18 -0.35 0.48 -2.65 1.91 0.59 0.3 -1.06 0.28 -0.01 0.46 0.93 0.94 0.32 0.05 -1.9 0.41 0.53 0.89 -1.22 -0.23 -0.46 -1.07 0.0 -0.06 -0.59 0.88 0.52 0.01
-1.38 -2.08 -3.33 -5.07 -1.06 -1.73 -0.77 -1.31 -2.29 0.06 -2.55 -2.84 1.14 0.45 1.1 -2.72 -0.57 -1.53 0.8 -0.05 -1.29 -0.69 -1.46 3.31 0.18 0.24 -0.78 -3.71 -2.02 -0.7 -0.08 -1.91 -0.55 -1.78 -2.91 -1.81 -0.01 -0.7 -0.46 0.46 1.4 1.15 0.84 1.09 -0.47 -0.77 0.49 0.47
-0.28 -0.98 -0.89 -2.81 0.05 -1.1 -1.14 -1.58 -0.69 0.05 -0.47 -0.22 -0.18 -0.05 -0.27 -2.21 -0.03 -0.19 0.31 0.34 0.56 0.48 -0.15 1.57 0.02 -0.36 0.17 0.26 -0.57 0.26 0.07 0.02 0.36 0.31 -1.3 0.16 -0.02 0.6 0.24 0.33 0.25 0.14 0.18 0.31 0.15 0.62 0.16 0.0
-1.51 -1.67 -4.1 -2.91 -0.18 -0.22 -0.65 -1.29 -1.73 0.97 -3.65 -3.44 0.16 -1.13 1.21 -0.66 0.62 -0.22 0.7 0.63 1.28 1.39 -3.91 2.47 0.84 0.64 1.74 -0.08 0.26 -0.95 0.2 -3.3 -0.56 -1.37 -0.79 -1.27 -0.12 -0.03 -1.18 -0.86 -2.19 -1.74 -0.04 -0.67 -0.96 0.06 0.26 -0.43
-1.42 -1.31 -0.86 -0.74 0.59 -0.23 0.1 -0.15 -0.29 0.34 0.89 0.86 0.19 -0.05 0.39 -0.83 -0.37 -0.62 -1.18 -0.31 -0.16 -0.03 -2.09 1.99 0.47 -0.11 -0.04 -0.51 0.07 0.12 -0.1 0.09 -0.01 -0.23 0.48 -0.73 -0.05 -0.13 -0.84 0.19 0.12 0.18 0.23 -0.15 -0.25 -0.14 -0.45 -0.05
-0.89 -0.5 -0.71 -1.13 1.05 0.26 -0.49 -0.27 -1.18 0.31 -2.92 -3.23 -0.11 -0.44 0.58 -1.49 0.38 1.25 -0.27 0.13 0.18 0.21 -1.07 2.19 0.95 0.54 1.49 -0.4 -1.2 -0.71 -0.09 -0.9 -0.24 -0.17 -1.7 -0.83 0.17 -0.15 -0.71 -0.25 0.25 -0.18 0.09 -0.32 -0.63 -0.16 -0.52 -0.38
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-3.3 -0.75 -0.11 -2.1 0.13 0.35 0.7 0.65 -0.49 0.16 0.47 0.44 -0.02 -0.73 0.1 -0.6 -0.15 -0.65 -0.57 0.01 -0.06 0.18 -1.55 1.8 1.09 0.23 0.19 -0.34 -0.07 -0.06 0.66 0.3 -0.34 -0.2 -0.29 0.1 -0.18 -0.21 -0.87 0.22 -0.12 -0.53 -0.57 -0.19 -0.81 -0.29 0.04 0.01
-2.11 -4.7 -4.83 -1.0 -2.03 -2.35 -2.53 -1.73 -1.75 1.06 -5.87 -6.36 0.03 -0.96 1.69 -4.79 -0.71 -0.77 0.68 0.27 -0.08 -1.26 -2.87 2.38 -0.51 -5.41 -3.22 0.4 -1.42 0.57 0.39 -3.22 1.1 0.78 -2.4 -0.5 0.1 1.31 -0.04 1.29 -0.02 -0.27 0.92 0.7 0.85 1.17 0.5 -1.32
-0.56 - -3.13 -4.26 0.73 0.94 -0.08 -0.97 -3.3 0.83 -6.26 - 0.6 -1.65 1.58 - 2.7 0.13 -0.83 -1.09 -3.55 1.05 - 3.16 2.43 1.82 2.21 -3.93 - -4.88 -2.77 -5.28 -7.18 -4.78 - - -5.99 -1.28 -4.58 -1.8 -3.96 -5.01 -1.19 -2.8 -6.16 -2.15 -3.12 -5.01
-0.07 0.07 -0.57 -3.58 0.58 0.19 0.99 0.28 0.21 0.84 -1.18 -1.2 0.72 0.35 0.51 -0.33 -0.68 -1.49 0.21 -0.11 0.12 -0.07 -2.56 0.46 0.46 -0.73 0.34 -0.46 -0.57 -0.37 0.22 -0.16 0.22 -0.14 -0.45 -0.42 0.45 0.29 -0.72 0.17 0.25 -0.03 0.32 0.26 -0.07 0.23 -0.15 -0.29
-4.14 -1.58 -1.81 -2.08 0.9 -0.2 -0.04 -0.48 -0.25 0.55 -0.93 -0.69 0.5 0.26 0.61 -0.61 -0.63 -0.49 -0.22 0.39 0.58 0.3 -1.12 1.69 0.88 -0.64 0.84 -0.28 -0.18 -0.03 0.07 0.17 0.08 -0.03 -1.15 -0.19 0.09 0.14 -0.34 -0.05 0.23 0.1 0.23 0.16 -0.17 0.08 -0.21 -0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.