Heatmap: Cluster_15 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g006500.3.1 (Solyc01g006500.3)
-0.86 -0.44 -0.72 -1.14 0.95 1.23 0.37 0.59 -0.22 0.56 -0.16 0.33 0.54 0.46 0.7 0.67 0.55 -3.9 -4.32 -0.52 -0.43 -0.26 -0.02 -0.33 -0.51 0.44 0.02 -0.25 -0.3 -0.23 0.03 -0.38 -2.1 -0.33
Solyc01g007850.2.1 (Solyc01g007850.2)
-0.86 0.41 -0.71 -1.57 -0.14 0.51 0.92 0.97 0.46 1.07 -0.05 -0.68 0.37 -0.2 0.03 0.15 0.07 -8.68 - -0.43 -0.13 -0.02 0.04 -0.06 -0.4 1.13 0.35 0.11 -0.04 -0.18 0.03 -0.17 -2.41 -0.51
Solyc01g007880.3.1 (Solyc01g007880.3)
-1.15 -0.56 -1.17 -1.61 0.45 0.26 0.7 0.28 0.02 0.49 0.72 0.47 0.86 0.47 0.15 0.06 -0.06 -5.72 -3.46 -0.66 -0.29 0.46 -0.18 0.13 -0.06 -0.8 0.17 0.32 0.14 0.42 0.56 0.36 -1.68 -0.78
Solyc01g080300.3.1 (Solyc01g080300.3)
-0.43 -0.71 -1.6 -1.36 -0.73 0.14 0.61 0.61 0.53 0.26 -0.23 -0.59 0.05 -0.51 0.12 -0.09 -0.14 -4.8 -5.53 0.07 -0.38 0.53 0.35 0.42 0.15 0.52 0.7 0.68 0.46 0.49 0.68 0.43 -1.95 -0.63
Solyc01g081320.3.1 (Solyc01g081320.3)
-1.65 -0.31 -1.32 -1.12 -0.85 0.22 0.8 1.03 0.11 1.02 0.02 -0.31 0.68 0.18 0.59 0.37 0.26 -6.36 -6.92 -1.88 -0.04 0.21 0.57 0.34 -0.11 -0.19 0.67 0.33 0.1 0.06 0.38 -0.05 -2.87 -0.98
Solyc01g088170.4.1 (Solyc01g088170.4)
0.14 -1.64 -0.86 -2.42 1.0 0.58 0.76 0.38 0.24 -0.09 -0.12 -0.54 -0.14 -0.33 0.33 0.62 0.54 - - -0.37 -0.67 0.33 0.22 0.2 -0.05 0.4 0.32 0.15 -0.27 0.33 0.52 0.14 -2.61 0.34
Solyc01g090880.3.1 (Solyc01g090880.3)
-1.61 -0.57 -2.09 -1.35 1.21 1.24 0.81 0.83 0.28 0.83 0.44 0.11 0.73 0.3 0.19 -0.46 -0.35 -5.22 -5.2 -0.98 -0.42 0.0 -0.27 -0.11 -0.0 -0.67 -0.05 -0.08 -0.15 0.0 0.1 0.29 -0.08 -1.12
Solyc01g103950.3.1 (Solyc01g103950.3)
-0.63 -0.92 -0.99 -1.21 -0.76 0.33 0.94 0.69 -0.28 0.27 -0.52 -0.62 0.26 0.17 0.55 0.68 0.46 -10.55 - -1.05 -0.7 0.48 0.18 0.28 0.23 -0.5 0.47 0.55 0.32 0.51 0.49 0.45 -1.02 -0.2
Solyc01g105020.3.1 (Solyc01g105020.3)
-0.47 -0.65 -0.54 -0.8 -0.13 0.15 0.33 1.19 0.8 -0.3 -0.69 -1.07 -0.75 -0.83 -0.72 -1.19 -1.6 -9.87 -9.81 -2.37 -1.25 0.65 0.42 0.48 0.09 -2.03 1.34 1.19 0.66 1.14 1.05 0.27 -0.79 -0.06
Solyc01g105990.3.1 (Solyc01g105990.3)
-0.35 -0.69 -0.93 -1.33 0.66 1.17 0.58 0.57 0.49 0.45 0.29 0.43 0.6 0.43 0.67 0.61 0.61 -6.9 -5.61 -0.47 -0.12 -0.27 -0.2 -0.22 -0.57 0.21 -0.14 -0.27 -0.41 -0.44 -0.09 -0.41 -1.87 -0.42
Solyc01g110190.3.1 (Solyc01g110190.3)
-1.14 -0.02 0.25 -1.2 0.19 0.93 2.04 0.85 1.62 0.01 -0.47 0.06 -0.74 0.42 -0.18 -1.99 -1.54 - -9.53 -3.84 -2.53 0.31 1.01 0.71 -0.09 -2.34 0.47 0.12 -0.56 -0.27 0.46 -1.35 -3.37 -0.76
Solyc02g068700.3.1 (Solyc02g068700.3)
0.1 -0.04 -0.69 -0.38 0.34 0.31 0.05 0.72 0.31 -0.36 -0.83 -0.82 -1.5 -1.2 -0.25 -0.59 -0.51 -9.46 -10.21 -0.85 -1.69 0.73 0.34 0.46 0.58 -1.52 0.65 0.65 0.42 0.96 0.81 0.7 0.9 -0.82
Solyc02g071260.3.1 (Solyc02g071260.3)
-1.09 -0.66 -2.46 -2.68 -0.01 0.47 1.03 0.33 1.14 0.47 -0.52 -0.55 -0.0 -0.38 0.45 0.0 0.12 - - -3.49 -0.51 0.68 0.78 0.74 0.35 -3.37 0.66 0.55 0.24 0.59 0.77 0.29 -1.66 -0.78
Solyc02g077680.3.1 (Solyc02g077680.3)
-1.26 -0.83 -1.84 -1.1 -0.16 0.47 0.72 0.43 0.14 -0.05 -0.07 -0.49 0.11 -0.31 0.47 -0.23 -0.08 -7.93 -7.48 -0.57 -0.19 0.58 0.33 0.44 0.4 -0.05 0.64 0.71 0.51 0.73 0.66 0.79 -2.84 -0.93
Solyc02g079270.3.1 (Solyc02g079270.3)
1.22 0.26 0.02 0.22 -0.0 0.65 0.71 1.55 0.5 1.52 -2.15 -3.43 -0.37 -1.49 0.84 0.6 0.78 0.2 1.13 -2.37 -3.05 -1.55 -1.65 -1.93 -2.66 -3.55 -0.31 -0.82 -1.65 -0.7 -0.99 -0.65 -0.2 0.34
Solyc02g079273.1.1 (Solyc02g079273.1)
0.18 0.37 0.29 0.31 0.69 1.16 0.88 1.43 0.06 0.77 -1.22 -2.27 0.51 -0.29 0.75 0.6 0.51 0.33 0.99 -2.76 -0.81 -1.57 -1.85 -2.11 -3.12 -1.64 -0.75 -1.26 -2.01 -1.17 -1.19 -0.84 0.2 0.45
Solyc02g079277.1.1 (Solyc02g079277.1)
0.6 0.7 0.54 0.29 -0.24 0.78 0.07 1.24 -0.3 0.29 -2.42 -3.13 -0.13 -0.39 0.92 1.27 0.87 0.96 0.97 -1.75 -0.27 -1.28 -1.99 -2.63 -2.65 -0.85 -0.72 -1.06 -2.19 -0.49 -1.01 -0.69 0.28 0.18
Solyc02g092310.3.1 (Solyc02g092310.3)
-0.9 -1.2 -1.19 -2.47 1.0 1.42 0.72 1.01 0.34 0.57 0.33 0.21 1.3 0.79 0.68 0.25 0.1 -5.62 -6.79 -1.91 -1.16 -0.37 -0.14 -0.45 -1.15 -0.02 0.38 -0.11 -0.51 -0.38 0.07 -0.73 -1.55 -0.78
Solyc02g093080.3.1 (Solyc02g093080.3)
-1.04 -4.96 -2.85 -4.19 0.98 0.73 -0.07 -0.21 0.25 0.43 -0.83 -1.54 0.42 -0.41 0.89 1.51 1.14 -8.67 -10.6 -1.12 -1.01 0.75 -0.19 0.27 0.46 -1.57 -0.22 0.36 0.51 0.65 0.6 0.72 -2.45 -1.06
Solyc02g093970.3.1 (Solyc02g093970.3)
0.68 -0.27 -0.61 0.11 0.83 0.13 0.65 0.69 0.8 -0.11 -0.21 -0.05 -0.7 -1.13 -0.11 -1.33 -0.7 - - -3.17 -2.05 0.33 0.82 0.5 -0.31 -2.48 1.19 1.06 0.34 0.4 0.51 -0.44 -0.84 -0.26
Solyc02g093975.1.1 (Solyc02g093975.1)
0.54 -0.27 0.08 0.29 0.68 0.2 1.43 0.98 0.15 0.09 0.51 0.68 -0.13 -0.59 0.11 -1.24 -0.54 - - -3.85 -1.41 0.07 0.37 0.13 -0.69 -2.72 0.79 0.62 -0.11 -0.07 0.26 -0.85 -0.85 -0.06
Solyc03g006870.3.1 (Solyc03g006870.3)
-1.59 -0.63 -3.34 -1.3 -0.67 0.98 -2.05 1.71 -0.54 -1.22 -2.29 -2.3 -3.21 -3.52 -1.09 -1.49 -1.12 -7.0 -7.77 -4.46 -2.68 1.64 -0.27 0.6 1.12 -4.85 0.38 0.72 0.6 1.82 1.51 1.89 -0.39 -2.13
Solyc03g007070.3.1 (Solyc03g007070.3)
-0.37 -0.13 -0.55 -0.42 0.12 0.46 0.6 0.15 0.38 -0.08 0.54 0.37 1.26 0.83 -0.16 -0.4 -0.46 -2.45 -0.68 0.1 0.3 -0.3 -0.34 -0.41 -0.51 0.27 -0.04 -0.26 -0.35 -0.29 -0.2 -0.29 -0.3 -0.03
Solyc03g097000.3.1 (Solyc03g097000.3)
-0.91 -0.46 -1.59 -1.88 0.41 0.82 0.96 0.86 0.09 0.37 0.1 -0.21 0.65 -0.03 -0.04 -0.59 -0.66 - - 0.05 0.6 0.09 0.07 0.08 -0.19 0.82 0.36 0.28 0.02 0.17 0.33 0.13 -2.1 -0.79
Solyc03g097130.3.1 (Solyc03g097130.3)
-0.11 -1.01 -0.42 -0.29 0.29 0.79 0.07 0.52 0.19 0.47 -0.03 -0.33 0.05 -0.33 0.66 0.85 0.74 -6.18 -5.71 -0.57 -0.22 0.16 -0.14 0.01 -0.11 0.31 -0.05 -0.02 -0.08 0.17 0.24 0.16 -1.17 -0.22
Solyc03g111700.3.1 (Solyc03g111700.3)
-3.84 -11.67 -8.11 - 0.75 0.66 -1.3 -0.19 0.83 0.64 -0.7 -1.37 -0.48 -1.56 1.66 2.37 1.71 -10.11 -11.07 -1.42 -1.2 0.22 -0.61 -0.11 0.32 -1.58 -0.24 -0.02 -0.03 0.35 0.15 0.56 -1.08 -3.66
Solyc03g116800.3.1 (Solyc03g116800.3)
-0.92 -1.6 -0.63 -1.06 -0.17 0.54 -0.4 1.31 -0.16 -0.83 -0.79 -0.73 -1.16 -0.97 -0.34 -0.31 -0.61 -5.47 -5.32 -1.5 -1.19 0.71 0.56 0.66 0.86 -2.03 0.86 1.05 0.88 1.07 0.86 0.47 0.8 -2.13
Solyc03g124060.3.1 (Solyc03g124060.3)
-0.41 -1.14 -0.84 -0.55 0.96 1.13 0.19 0.68 -0.01 0.22 -0.6 -0.97 -0.21 -0.63 0.44 0.47 0.39 -1.79 -1.83 -0.63 -0.64 0.34 0.1 0.24 0.26 0.16 0.15 0.16 0.12 0.33 0.26 0.22 -1.16 -0.53
Solyc04g051870.2.1 (Solyc04g051870.2)
-0.1 -1.27 -1.29 -1.14 -0.26 0.6 1.5 0.11 0.31 0.91 1.0 0.92 0.74 0.65 0.01 -0.17 -0.55 -6.84 -4.92 -0.43 0.41 -0.12 -0.18 -0.14 -0.39 -0.17 -0.29 -0.42 -0.35 -0.48 -0.17 -0.23 -0.9 -0.19
Solyc04g063270.1.1 (Solyc04g063270.1)
-1.1 0.51 -2.05 -1.74 0.52 1.0 1.19 0.67 -0.24 0.3 1.08 0.76 0.93 0.69 -1.25 -1.56 -1.68 -5.01 -5.25 -0.68 0.2 -0.04 -0.22 -0.15 -0.34 -0.2 0.43 0.36 0.02 -0.25 0.09 0.16 -1.29 -1.0
Solyc04g072775.1.1 (Solyc04g072775.1)
-1.04 -0.27 -0.9 -1.9 -0.25 0.64 0.37 0.82 0.01 0.5 -0.33 -1.15 0.17 -0.66 -0.15 -0.45 -0.42 1.49 -4.01 -0.61 -0.93 0.55 -0.02 0.12 0.11 -0.62 0.31 0.47 0.25 0.74 0.65 0.53 -1.5 -1.18
Solyc05g006170.3.1 (Solyc05g006170.3)
-1.24 0.2 -1.09 -1.06 0.25 0.55 0.52 1.48 -0.23 0.04 -0.16 -0.6 -0.23 -0.48 -0.81 -1.62 -1.58 -11.65 -9.74 -0.44 0.0 0.63 0.5 0.58 0.54 0.16 0.7 0.57 0.29 0.67 0.63 0.46 -1.39 -1.44
Solyc05g013200.1.1 (Solyc05g013200.1)
-0.79 0.81 -1.01 -0.74 -0.51 0.28 0.12 0.78 0.43 0.19 0.08 -0.58 0.2 -0.19 -0.18 -0.2 -0.3 -5.62 -9.21 -0.69 -0.05 0.56 -0.02 0.13 -0.27 0.21 0.52 0.48 0.2 0.58 0.71 0.76 -2.28 -0.19
Solyc05g013280.3.1 (Solyc05g013280.3)
0.33 -0.99 -0.75 -1.22 0.46 0.68 0.65 0.42 0.12 0.33 0.34 -0.39 0.2 -0.59 0.51 0.47 0.34 -9.15 - -1.62 -0.67 0.39 0.42 0.33 -0.06 -0.18 0.45 0.23 -0.18 0.17 0.39 0.22 -2.17 0.17
Solyc05g041530.3.1 (Solyc05g041530.3)
-0.92 -1.97 -1.89 -2.65 1.49 1.45 0.34 0.98 0.17 0.14 -0.22 -0.48 -0.32 -0.82 -1.35 -1.71 -1.56 -7.15 -8.25 -0.39 -0.04 0.58 0.01 0.23 0.23 -1.69 1.04 0.98 0.67 0.71 0.73 0.19 -1.52 -1.05
Solyc05g050940.3.1 (Solyc05g050940.3)
-1.41 -0.51 -0.28 -0.88 -0.87 0.23 1.28 0.96 0.27 0.01 -0.17 -0.27 -0.25 -0.47 -0.06 -0.45 -0.42 -10.24 -10.04 -0.15 -0.37 0.59 0.33 0.4 0.35 0.14 0.43 0.43 0.2 0.7 0.71 0.45 -1.04 -1.22
Solyc05g053200.2.1 (Solyc05g053200.2)
-0.84 -2.61 -1.84 -2.59 -0.16 0.17 0.88 -0.25 0.75 0.04 -0.23 -0.44 0.05 -0.05 0.22 0.31 0.09 -5.13 -5.2 -0.64 -0.13 0.83 0.09 0.37 0.34 0.23 0.21 0.44 0.49 0.51 0.87 1.0 -1.68 -0.49
Solyc05g054680.1.1 (Solyc05g054680.1)
-1.34 0.69 -3.41 0.07 1.16 0.69 0.9 1.01 0.23 -0.26 0.25 -0.79 -0.4 -0.85 0.5 -0.54 -0.97 - - -3.61 -0.64 0.23 0.51 0.44 -0.08 -1.75 0.83 0.68 0.3 0.4 0.37 -0.43 -0.47 -0.32
Solyc05g056520.3.1 (Solyc05g056520.3)
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Solyc06g066620.3.1 (Solyc06g066620.3)
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Solyc06g068740.3.1 (Solyc06g068740.3)
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Solyc07g007650.2.1 (Solyc07g007650.2)
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Solyc07g014590.3.1 (Solyc07g014590.3)
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Solyc07g042313.1.1 (Solyc07g042313.1)
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Solyc07g062120.3.1 (Solyc07g062120.3)
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Solyc07g062610.3.1 (Solyc07g062610.3)
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Solyc09g064240.3.1 (Solyc09g064240.3)
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Solyc09g064430.3.1 (Solyc09g064430.3)
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Solyc09g065155.1.1 (Solyc09g065155.1)
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Solyc09g065160.3.1 (Solyc09g065160.3)
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Solyc09g072900.3.1 (Solyc09g072900.3)
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Solyc09g074100.3.1 (Solyc09g074100.3)
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Solyc12g042177.1.1 (Solyc12g042177.1)
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Solyc12g055940.2.1 (Solyc12g055940.2)
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Solyc12g088710.2.1 (Solyc12g088710.2)
-7.76 -1.58 -4.53 -1.0 2.11 1.71 -2.57 1.34 0.0 -0.51 -4.07 -4.02 - - -0.8 -0.72 -0.48 - - -3.9 -1.56 1.28 0.95 1.04 1.12 - 0.44 0.74 0.67 0.73 0.84 0.73 -1.51 -4.41
Solyc12g088750.2.1 (Solyc12g088750.2)
-0.35 -1.14 -0.57 -0.9 0.89 0.91 1.44 0.57 0.66 0.02 0.44 0.15 0.45 -0.04 0.28 -0.33 -0.37 - -12.25 -2.82 -1.05 0.11 0.43 0.13 -0.23 -2.73 0.28 -0.02 -0.39 0.1 0.2 -0.75 0.04 0.58

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.