Heatmap: Cluster_161 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g099580.2.1 (Solyc00g099580.2)
-5.44 - - - 0.17 0.17 0.2 0.89 2.78 0.52 -0.17 -1.39 0.72 0.41 -1.03 -2.59 -2.26 - - -5.5 -1.98 -0.03 1.98 0.44 -1.17 -2.68 1.24 0.61 0.49 -0.59 0.72 -3.17 -1.29 -4.91
Solyc00g117450.2.1 (Solyc00g117450.2)
0.82 - -5.29 - 3.11 1.97 3.0 -0.02 2.83 0.9 - -2.35 -6.65 -4.41 - - -5.01 - - - - - - -6.39 -7.19 - - -7.25 - -5.63 -5.19 - -0.47 -0.64
Solyc01g007200.2.1 (Solyc01g007200.2)
-6.17 -1.18 -1.36 -4.93 -3.04 -2.88 2.7 -2.37 1.02 0.57 -0.5 -1.06 2.99 2.13 -1.84 -2.56 -2.95 - - -4.07 -0.51 -1.83 -2.95 -2.23 -2.1 -0.22 0.72 0.44 0.5 -0.87 -0.53 -1.5 -3.82 -5.23
Solyc01g066640.2.1 (Solyc01g066640.2)
-2.42 0.55 -1.45 -0.25 -1.9 -1.62 1.73 -1.05 1.68 -0.2 0.93 1.94 0.31 0.45 -1.55 -3.27 -3.63 - - -2.8 -1.26 0.61 1.29 1.22 0.64 -2.46 -0.32 -0.37 -0.5 -0.74 0.37 -1.93 -1.3 -1.47
Solyc01g067040.2.1 (Solyc01g067040.2)
- -5.52 - - -2.86 -2.61 2.22 -3.64 2.08 0.67 0.67 0.17 1.76 1.32 -0.0 -2.65 -1.1 - - - - -0.03 0.68 0.23 -1.34 - 1.43 1.03 0.4 0.11 0.57 -2.98 - -
Solyc01g090460.3.1 (Solyc01g090460.3)
-1.78 -1.5 -2.75 -2.27 2.09 -0.1 2.56 -1.49 -0.24 -2.51 -0.72 -0.47 1.75 2.02 -4.75 -7.67 -7.22 -4.01 - -1.57 -0.48 -0.13 -2.27 -0.92 -0.8 -1.42 -0.46 0.19 0.65 0.14 -0.09 0.45 -2.94 0.07
Solyc01g091380.3.1 (Solyc01g091380.3)
0.1 -2.81 -2.28 -3.66 1.04 -0.04 1.13 -0.32 1.58 -0.39 0.01 0.38 0.99 1.15 -0.23 -0.57 -0.66 -4.32 -7.43 -1.94 -0.53 0.18 -0.06 -0.12 -0.49 -0.61 0.64 0.37 -0.07 0.39 0.59 -0.18 -3.38 0.11
Solyc01g100310.2.1 (Solyc01g100310.2)
-1.58 0.06 -1.57 0.62 0.08 -2.29 1.5 -1.26 1.24 -1.42 0.13 -0.03 -0.22 -0.16 0.08 0.63 0.17 -9.75 -12.41 0.09 0.09 0.24 -0.23 0.19 0.17 -0.89 0.7 0.68 0.42 0.48 0.54 -0.25 -3.8 -0.61
Solyc01g109270.3.1 (Solyc01g109270.3)
-0.05 1.44 - -3.93 2.02 -0.66 2.19 1.74 2.58 -0.26 1.02 -1.36 -6.37 -6.09 -0.3 -2.43 -3.46 - - - - -3.34 -0.31 -1.48 -2.97 - -1.31 -2.74 -3.94 -2.09 -0.13 - -2.57 1.98
Solyc02g030460.2.1 (Solyc02g030460.2)
-3.8 0.05 -2.91 -2.08 -0.69 -1.99 4.05 -0.32 3.32 -0.67 -3.0 0.12 0.36 -0.16 -3.58 - - - -9.82 - - - -4.82 -6.26 -6.72 - -8.88 -8.54 -4.42 -7.77 -4.69 - -7.44 -3.42
Solyc02g036460.3.1 (Solyc02g036460.3)
-0.48 0.08 -1.95 -1.58 0.06 -0.43 0.98 -0.04 0.95 -0.08 1.42 0.73 0.33 0.23 -1.95 -3.85 -3.07 -5.95 -4.54 -1.31 -0.95 0.34 0.66 0.43 -0.18 -0.02 1.01 0.5 0.18 0.72 0.76 -0.15 -2.59 -0.35
Solyc02g067550.1.1 (Solyc02g067550.1)
-1.02 -2.62 -1.94 -2.61 2.73 0.98 1.47 0.62 1.02 0.05 0.99 0.39 0.66 0.13 -1.1 -2.16 -2.04 - -4.72 0.39 0.96 -1.15 -1.4 -1.43 -2.11 -1.05 -1.69 -1.33 -1.63 -0.44 -1.16 -1.15 -2.19 0.95
Solyc02g078130.3.1 (Solyc02g078130.3)
1.18 -0.95 0.66 -1.63 3.47 0.68 0.13 0.54 2.88 -0.23 -1.35 0.15 - - -4.86 - -8.18 - - - -4.59 -3.58 -1.17 -2.5 -4.3 - -4.03 -4.98 -4.0 -5.3 -2.5 -2.82 -2.06 1.48
Solyc02g080260.3.1 (Solyc02g080260.3)
-8.66 - -9.17 - 0.06 -0.34 3.2 0.79 0.97 -0.19 0.3 -0.49 0.93 0.53 2.01 -0.2 -0.22 - - -5.17 -2.78 -1.96 -0.37 -1.65 -2.63 -2.59 0.32 0.48 0.32 -1.07 -0.76 -2.96 -1.42 -6.22
Solyc02g090480.3.1 (Solyc02g090480.3)
-1.57 1.26 -1.73 -1.1 -0.14 -0.8 0.88 -0.49 0.89 -0.44 0.58 0.99 0.69 1.03 -0.06 -1.3 -1.41 -5.16 -4.88 -5.72 -2.22 0.23 0.59 0.26 -0.49 -5.39 1.17 0.79 0.29 0.78 0.93 -0.33 -3.79 -1.43
Solyc02g093935.1.1 (Solyc02g093935.1)
-0.91 -0.31 -2.45 -3.71 -0.45 -0.36 1.73 -1.07 1.0 -0.42 0.16 0.17 0.09 0.57 -1.5 -3.78 -3.07 -2.55 -3.09 -3.22 -0.93 0.68 1.06 1.0 0.43 -2.34 1.67 0.8 0.05 0.71 0.84 -0.09 -3.83 -1.05
Solyc03g005960.3.1 (Solyc03g005960.3)
0.44 - -7.05 -8.49 3.7 0.95 0.84 0.7 2.75 -0.09 -2.11 -0.88 -5.25 -7.58 -3.75 -8.71 -7.89 - -7.87 -4.82 -3.85 -0.45 -0.57 -0.9 -1.77 -6.11 -2.13 -2.12 -3.05 -0.56 -0.15 -1.41 -3.71 -0.36
Solyc03g025820.2.1 (Solyc03g025820.2)
-1.15 0.37 -1.86 -0.33 -1.41 -1.29 2.17 0.51 2.13 -0.94 0.22 -0.3 0.14 0.64 -0.92 -2.39 -2.15 -1.96 -0.91 -2.99 -0.93 -0.03 0.58 0.36 -0.29 -4.29 0.64 0.77 0.32 -0.11 0.32 -0.45 -5.81 -1.06
Solyc03g031760.3.1 (Solyc03g031760.3)
-1.72 - -2.8 -5.02 0.52 0.39 2.24 1.26 2.17 0.53 0.42 -0.54 0.95 0.78 -0.82 -3.15 -2.38 - - -4.9 -0.87 -0.37 1.4 -0.07 -1.58 -3.17 0.72 0.08 -0.18 -1.44 0.29 -3.57 -1.43 -2.75
Solyc03g033680.1.1 (Solyc03g033680.1)
-0.3 - -3.78 - -0.4 1.18 4.3 -0.38 2.55 0.68 -3.48 -3.68 -4.73 - - - - - - - - -3.21 - -3.55 -5.71 - -4.86 -6.26 - - -3.81 - 0.13 -0.85
Solyc03g034395.1.1 (Solyc03g034395.1)
-1.35 -4.17 -5.73 -4.91 -0.6 -0.0 1.77 -1.64 1.58 1.21 2.08 1.31 1.43 1.11 -4.19 -4.2 -3.61 -3.76 -3.39 -1.06 0.01 -1.36 0.9 0.4 -0.11 -0.34 0.24 -0.24 -0.47 -2.08 -1.11 -1.95 -3.47 -1.61
Solyc03g063355.1.1 (Solyc03g063355.1)
-0.18 0.51 -0.51 -0.7 0.26 -0.16 -0.08 -0.16 0.52 0.01 1.0 1.02 1.21 1.07 0.43 0.3 0.37 -6.89 -7.45 -0.51 -0.0 -0.45 -0.35 -0.46 -0.62 0.25 -0.45 -0.61 -0.53 -0.49 -0.34 -0.37 -3.43 0.5
Solyc03g078055.1.1 (Solyc03g078055.1)
0.48 0.04 -1.18 -0.24 -0.8 -0.37 0.29 -0.43 0.68 0.35 0.86 0.55 1.46 1.04 0.88 0.71 0.46 -3.39 -2.72 -0.57 0.26 -0.39 -0.63 -0.49 -0.77 0.05 -0.81 -0.53 -0.71 -0.46 -0.5 -0.47 -4.02 0.28
Solyc03g096093.1.1 (Solyc03g096093.1)
-0.83 0.46 0.62 -1.57 -2.9 -1.15 2.47 -1.39 1.54 -0.44 -0.65 -0.73 0.16 -0.11 0.01 -1.19 -0.85 -4.98 - -1.42 1.01 0.28 0.43 0.05 -0.25 -2.24 0.51 0.1 -0.43 0.07 0.32 -0.3 -1.31 -0.13
Solyc03g114120.3.1 (Solyc03g114120.3)
-0.01 -1.75 -3.69 -2.13 -1.32 -1.13 1.57 -1.59 0.13 0.51 1.18 0.58 2.18 1.9 0.3 0.01 -0.0 -8.82 -10.4 -1.81 -0.46 -0.45 -0.96 -0.94 -1.28 -0.89 0.08 -0.22 -0.35 -0.24 0.07 -0.37 -0.73 -0.45
Solyc03g116970.2.1 (Solyc03g116970.2)
0.43 -1.91 -3.94 -4.74 -0.78 -0.58 1.89 -4.13 1.72 1.89 1.27 0.0 2.83 1.62 -6.14 -5.11 -4.99 -7.55 -6.91 -3.5 -2.09 -5.52 -0.03 -1.47 -2.71 0.3 0.71 -0.45 -1.25 -6.67 -4.77 -6.85 - -0.58
Solyc03g116975.1.1 (Solyc03g116975.1)
-0.88 -1.31 -4.59 -3.81 -2.26 -1.13 2.32 -4.25 1.64 2.11 1.18 -0.07 2.81 1.31 -4.12 - -4.39 -6.78 -7.66 -1.99 -2.37 - 0.25 -1.22 -3.07 0.35 0.89 -0.15 -1.16 -4.58 - -6.23 - -1.82
Solyc03g121550.3.1 (Solyc03g121550.3)
-0.59 0.01 -3.66 -1.89 -1.34 -1.75 1.83 -2.05 0.94 1.05 1.14 -0.01 1.87 1.22 0.47 0.0 0.24 - - -5.32 -0.93 -0.39 0.4 -0.2 -0.83 -2.13 0.13 0.02 0.33 -0.34 -0.24 -0.13 -3.14 -1.24
Solyc04g015540.1.1 (Solyc04g015540.1)
1.14 0.2 -0.79 -4.06 2.43 -0.09 1.06 -0.35 1.55 -0.62 -0.95 -1.24 1.26 -0.41 -1.88 -4.25 -2.8 - - - -4.44 -0.54 -0.99 -1.53 -1.62 - 1.04 0.74 -0.12 0.42 0.39 -1.57 -3.11 1.59
Solyc04g016290.3.1 (Solyc04g016290.3)
-2.73 -6.23 -6.92 -6.15 -0.36 0.02 1.38 -0.16 1.72 -0.23 0.06 0.36 2.37 2.0 -1.97 -3.53 -2.81 -5.58 -4.46 -4.39 -0.33 -0.02 0.14 -0.12 -0.8 -1.23 0.73 0.28 -0.1 0.16 0.57 -0.28 -4.02 -2.44
Solyc04g039870.2.1 (Solyc04g039870.2)
-0.75 - - - 3.3 -0.82 -1.44 1.85 3.79 0.99 - 0.9 - - -1.4 - -1.76 - - - - -2.76 - -3.75 -2.38 - - -4.1 -3.52 - - - -3.32 -
Solyc04g054800.3.1 (Solyc04g054800.3)
-3.63 -4.24 -3.43 -5.92 -1.16 -2.72 3.06 -2.88 0.6 -0.44 0.02 -0.76 1.25 0.56 2.36 1.46 1.52 - -10.23 -6.58 -4.39 -1.51 -2.04 -1.9 -1.84 -7.15 0.82 0.15 -0.68 -0.83 -0.82 -1.55 -6.7 -4.35
Solyc04g079990.3.1 (Solyc04g079990.3)
-1.24 -1.24 -0.44 -2.02 -0.34 0.2 1.06 0.8 2.0 -0.19 -1.27 -0.4 0.3 1.17 -2.09 -3.84 -3.87 -9.41 - -4.49 -1.07 0.22 0.57 0.28 -0.42 -7.56 1.75 0.75 0.07 0.39 0.86 -0.47 -1.79 0.17
Solyc04g081235.1.1 (Solyc04g081235.1)
-0.12 -0.05 -1.87 -5.88 -1.51 -2.06 2.25 -1.35 0.86 0.39 -0.4 -1.85 3.1 2.32 -4.26 -6.22 -5.39 - - -0.47 -0.25 -2.43 -2.24 -2.49 -3.0 0.38 -0.22 -0.27 -0.33 -1.39 -1.5 -2.29 -5.43 0.34
Solyc04g082110.3.1 (Solyc04g082110.3)
0.25 -3.81 -0.76 -1.87 1.8 0.53 1.18 0.61 1.88 0.7 -0.5 -0.28 0.28 0.37 0.39 -1.24 -0.49 -9.94 -9.65 -4.15 -1.77 -0.04 -0.53 -0.71 -1.32 -4.13 -0.0 -0.18 -0.48 0.25 0.2 -0.03 -1.03 0.91
Solyc05g012280.3.1 (Solyc05g012280.3)
2.36 -6.48 - -7.4 2.58 -2.3 1.63 -0.11 -0.2 -2.74 -2.72 -2.85 -5.2 -8.46 -3.9 -2.53 2.64 -7.37 - -6.57 -1.56 -0.14 -1.32 -1.0 -1.13 - -2.08 -1.71 -0.49 0.23 -0.3 1.21 -4.0 1.39
Solyc05g013000.2.1 (Solyc05g013000.2)
- - - - - 0.85 2.43 -0.05 1.98 - - - - - - - - 0.23 - - - - - - - - - -2.84 - - - - - 4.36
Solyc05g014710.3.1 (Solyc05g014710.3)
-2.18 1.14 -4.05 0.83 -0.67 -0.15 0.61 -1.0 1.66 -1.62 -0.44 1.63 0.62 1.05 -2.41 -8.74 -5.8 - - -5.88 -2.16 0.39 1.36 0.48 -0.77 -5.94 0.57 0.85 0.5 0.02 1.13 -0.89 -5.95 -1.03
Solyc05g048830.3.1 (Solyc05g048830.3)
-2.83 -6.49 - - -0.3 -0.4 2.52 -1.16 1.87 0.82 1.6 0.66 1.73 0.86 0.09 -2.0 -1.05 -0.55 -4.78 -1.29 -0.42 -0.56 -0.04 -0.55 -1.39 0.16 -1.97 -1.81 -1.71 -1.59 0.39 -2.93 -0.56 -3.37
Solyc06g005560.3.1 (Solyc06g005560.3)
2.22 -3.46 -1.66 -3.89 1.43 0.2 1.37 1.32 1.86 -0.27 -1.26 -1.4 -5.77 -5.55 -2.22 -4.4 -4.17 - - -5.31 -3.83 -0.07 0.8 0.02 -1.44 -8.06 -1.5 -1.74 -1.92 -0.11 0.3 -0.59 0.37 2.35
Solyc06g005980.3.1 (Solyc06g005980.3)
-5.28 1.99 -6.18 -4.27 0.33 1.13 3.36 0.96 2.18 0.92 -0.73 -0.96 0.44 -0.14 -0.22 -2.88 -1.08 -6.91 - - -2.52 -1.66 -1.07 -0.21 -2.46 -4.89 -3.5 -2.7 -2.93 -3.01 -2.4 -4.99 -2.3 -4.75
Solyc06g007640.3.1 (Solyc06g007640.3)
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Solyc06g051300.3.1 (Solyc06g051300.3)
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Solyc06g054145.1.1 (Solyc06g054145.1)
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Solyc06g072310.3.1 (Solyc06g072310.3)
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Solyc06g075640.2.1 (Solyc06g075640.2)
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Solyc06g082350.3.1 (Solyc06g082350.3)
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Solyc07g021650.2.1 (Solyc07g021650.2)
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Solyc07g032260.3.1 (Solyc07g032260.3)
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Solyc07g041640.3.1 (Solyc07g041640.3)
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Solyc07g054630.3.1 (Solyc07g054630.3)
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Solyc07g054890.1.1 (Solyc07g054890.1)
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Solyc07g055880.1.1 (Solyc07g055880.1)
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Solyc08g015770.3.1 (Solyc08g015770.3)
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Solyc08g076025.1.1 (Solyc08g076025.1)
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Solyc08g076370.3.1 (Solyc08g076370.3)
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Solyc08g078520.3.1 (Solyc08g078520.3)
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Solyc09g082500.3.1 (Solyc09g082500.3)
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Solyc10g005610.2.1 (Solyc10g005610.2)
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Solyc11g032120.2.1 (Solyc11g032120.2)
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Solyc11g044940.1.1 (Solyc11g044940.1)
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Solyc11g045100.2.1 (Solyc11g045100.2)
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1.02 - - - 1.15 -0.21 3.16 - 3.99 0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.21 - - - - - - 0.9
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Solyc12g035190.2.1 (Solyc12g035190.2)
-5.44 -5.46 -2.61 -6.24 -0.15 -0.16 2.27 0.63 2.02 1.05 1.43 0.4 1.57 0.66 -0.63 -2.45 -1.43 - - -3.08 -2.79 -0.69 1.15 0.58 -0.35 -1.47 0.28 -0.41 -0.77 -1.65 -0.37 -3.01 -2.43 -5.73
Solyc12g038510.2.1 (Solyc12g038510.2)
- - -6.62 -6.97 -3.58 -4.25 -2.21 -3.91 3.71 1.75 2.05 1.05 -3.35 - -6.2 - - - - 0.15 0.46 0.61 -0.48 0.45 0.31 -0.17 -7.68 -2.21 -1.5 -1.01 0.22 -1.73 - -7.04
Solyc12g088410.2.1 (Solyc12g088410.2)
-0.6 -0.98 -5.24 -6.45 -4.79 -2.15 2.31 -3.42 1.22 0.05 1.47 -0.17 2.5 1.8 -1.57 -2.43 -1.81 - - -1.66 -1.95 -1.06 -0.87 -1.23 -1.15 -0.85 0.97 0.38 0.64 -0.43 -0.22 -1.1 -3.59 -0.98
Solyc12g088510.1.1 (Solyc12g088510.1)
- - - - - 4.46 -2.74 - 2.03 0.46 - - - - -1.58 - - 1.16 -2.4 - - - -1.95 - - - - - - - - - 1.59 -1.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.