Heatmap: Cluster_144 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g057210.3.1 (Solyc01g057210.3)
0.07 -1.82 -1.41 -2.29 0.51 0.53 0.81 0.07 0.58 0.05 -1.23 -0.53 -1.19 -1.16 0.77 1.08 0.8 -5.08 -4.11 -1.19 -1.38 0.43 0.71 0.65 0.67 -0.49 0.04 0.18 0.35 0.04 0.27 0.2 -0.69 0.16
Solyc01g068130.3.1 (Solyc01g068130.3)
-1.25 -0.51 -0.92 -0.85 -2.07 -0.77 -0.4 0.11 -0.15 0.52 0.69 -0.47 0.82 0.86 1.27 1.65 1.83 - -10.31 -1.25 -0.09 -0.24 -0.22 0.09 0.13 -4.56 -0.32 -0.34 -0.69 -0.12 -0.0 0.04 -0.19 -1.05
Solyc01g087250.3.1 (Solyc01g087250.3)
0.35 -1.42 -0.67 -1.7 0.31 0.67 0.42 -0.06 0.77 0.28 -0.15 -0.31 0.33 0.05 -0.17 -0.77 -0.67 -4.28 -4.71 -2.09 -1.03 0.57 0.31 0.3 0.24 -0.45 0.55 0.48 0.53 0.61 0.65 0.67 -2.12 0.46
Solyc01g091550.3.1 (Solyc01g091550.3)
0.18 -0.93 -0.67 -0.41 -0.66 0.01 0.65 0.15 0.4 0.28 -0.43 -0.45 -0.83 -1.27 0.64 0.74 0.74 -1.63 -1.02 -0.34 -0.69 0.34 0.08 0.22 0.35 -0.0 0.29 0.28 0.33 0.33 0.3 0.3 -0.9 -0.29
Solyc01g098500.3.1 (Solyc01g098500.3)
-0.31 -2.61 -0.58 -2.04 -1.86 1.23 -2.08 0.88 1.0 1.15 -3.29 -3.68 -4.65 -4.79 -2.4 -2.52 -2.83 -8.44 -12.27 -0.87 0.1 1.37 0.63 1.02 0.99 -0.11 0.83 0.57 0.32 0.83 1.19 0.21 -1.75 0.78
Solyc01g098560.3.1 (Solyc01g098560.3)
-0.85 -2.46 -0.57 -0.26 0.98 0.29 0.54 -0.23 0.26 0.06 -0.96 0.04 -0.43 -0.22 -1.5 -1.39 -1.38 - - -0.8 -1.12 0.63 1.62 0.67 0.17 -0.22 0.65 0.68 0.55 0.49 0.76 0.63 -1.16 -0.41
Solyc01g100610.3.1 (Solyc01g100610.3)
-0.33 -0.33 -1.44 -1.41 -0.51 0.24 1.12 0.25 0.19 -0.43 -0.01 0.04 0.2 0.16 -0.06 0.19 -0.18 -9.64 -10.65 -0.18 -0.4 0.57 0.59 0.51 0.39 -0.13 0.53 0.45 0.43 0.45 0.52 0.3 -1.83 -0.93
Solyc01g103430.3.1 (Solyc01g103430.3)
-0.29 -2.43 -2.68 -2.48 -0.45 -0.06 -0.51 -1.18 0.45 0.19 0.48 -0.36 0.28 -0.45 0.98 0.62 0.56 -9.1 -9.87 -0.86 0.21 0.59 0.4 0.71 0.69 -0.58 0.26 0.66 0.74 0.39 0.38 0.67 -2.12 -0.19
Solyc01g107250.3.1 (Solyc01g107250.3)
0.31 -0.71 -3.39 -3.1 0.48 0.16 0.42 -0.17 1.33 0.38 -0.21 0.11 -0.79 -0.0 0.12 -0.44 -0.05 -9.06 -11.4 -1.03 -0.51 0.21 0.76 0.82 0.53 -0.5 0.23 -0.02 0.06 0.05 0.52 0.2 0.02 0.34
Solyc01g111600.3.1 (Solyc01g111600.3)
-0.6 -0.5 -0.74 -0.99 -0.62 -0.13 0.92 0.16 0.2 0.59 -0.28 0.61 0.12 0.08 1.34 1.31 1.3 -11.27 -12.25 -0.5 -0.47 0.04 -0.15 -0.06 -0.41 -1.09 -0.47 -0.25 -0.56 0.05 0.3 -0.61 -0.59 -0.03
Solyc02g055467.1.1 (Solyc02g055467.1)
0.13 -1.5 -1.11 -0.89 0.78 0.89 0.37 1.07 -0.02 0.6 -0.06 -0.34 0.32 -0.18 0.03 -0.66 -0.38 -3.54 -3.3 -0.64 -0.59 0.5 0.2 0.01 0.01 0.31 0.2 0.15 -0.03 0.44 0.39 0.31 -3.07 0.25
Solyc02g064640.3.1 (Solyc02g064640.3)
-0.93 -0.44 -0.18 -0.51 0.26 0.61 0.54 0.26 0.3 0.3 -1.16 -0.6 -0.52 -0.86 0.29 0.42 0.25 -0.4 -1.54 -1.14 -0.6 0.37 0.53 0.43 0.36 -0.38 0.44 0.31 0.19 0.28 0.49 0.09 -0.53 -0.41
Solyc02g067960.2.1 (Solyc02g067960.2)
0.03 0.48 -0.32 -0.39 -0.94 0.31 0.3 0.38 0.19 0.43 0.07 -0.37 0.41 0.2 0.62 0.6 0.51 -7.25 -7.9 -0.53 -0.53 0.03 -0.23 -0.2 -0.33 -0.15 0.15 0.14 -0.18 0.17 0.22 0.15 0.05 0.14
Solyc02g078750.3.1 (Solyc02g078750.3)
-1.06 -2.32 -3.13 -2.06 -0.32 0.44 -0.87 -0.35 1.35 0.78 0.08 0.07 -1.11 -0.6 -0.76 -0.64 -0.98 -5.1 -4.08 -0.55 -0.59 0.52 1.39 0.92 0.02 -0.2 1.51 0.95 0.35 0.57 1.03 -0.53 -2.72 -0.89
Solyc02g083980.3.1 (Solyc02g083980.3)
-0.83 -0.91 -1.42 -1.5 0.11 1.08 1.13 0.99 0.86 1.34 0.28 0.02 -0.41 -1.0 -0.22 -0.46 -0.6 -8.43 - -0.79 -0.71 0.22 0.43 0.04 -0.19 0.34 0.54 -0.17 -0.52 0.0 0.53 0.14 -1.63 -0.09
Solyc02g092920.3.1 (Solyc02g092920.3)
0.47 -1.72 -0.45 -0.83 0.74 0.44 0.31 -0.39 0.43 0.27 0.04 -0.24 0.18 0.29 -0.38 -0.57 -0.49 -4.61 -4.85 -0.99 -0.18 0.55 0.42 0.45 0.38 -0.19 0.23 0.35 0.11 0.46 0.43 0.4 -1.76 0.46
Solyc02g093440.3.1 (Solyc02g093440.3)
0.01 0.26 -1.27 0.85 -0.54 -0.48 0.13 0.03 0.51 0.32 0.15 -0.45 0.13 -0.44 0.81 0.5 0.58 -1.57 -1.02 -2.08 -0.83 0.19 0.41 0.3 0.13 -2.08 0.26 0.21 0.17 0.21 0.33 0.2 -0.69 -0.45
Solyc02g094060.3.1 (Solyc02g094060.3)
-0.04 - -4.21 -6.79 0.57 0.18 0.66 -0.76 -0.86 -0.83 1.47 1.95 -0.62 -2.29 -1.43 -0.48 -0.37 - - -2.59 -1.02 0.85 1.84 1.13 0.36 -3.45 0.64 0.16 0.03 0.05 0.61 -1.07 -0.44 -0.63
Solyc03g006740.2.1 (Solyc03g006740.2)
-1.41 - -1.1 - -0.93 0.55 -1.59 0.02 -0.23 1.84 -2.07 -2.1 -2.61 - -4.86 - - - - -1.28 -1.87 1.26 1.13 2.34 2.47 -1.02 -2.39 0.84 0.73 -0.05 -0.49 0.61 -2.74 0.38
Solyc03g006760.3.1 (Solyc03g006760.3)
1.72 - -2.02 - -1.04 0.44 0.14 -0.43 -0.66 0.78 -0.73 -1.81 -1.68 -3.42 - - -6.11 - - -0.68 0.85 0.79 0.69 1.88 2.21 0.55 -2.0 0.23 0.53 -0.62 -0.55 -0.25 -2.12 1.2
Solyc03g019650.3.1 (Solyc03g019650.3)
-2.18 -5.04 -4.57 -4.8 -1.4 0.15 -0.78 -0.96 -0.65 0.38 -0.56 -0.36 0.18 -0.35 -0.22 -0.85 -0.5 -7.71 -9.16 -0.17 0.69 1.27 -0.46 0.27 0.25 0.67 0.41 0.93 0.54 1.65 1.73 1.29 -1.98 -2.46
Solyc03g026110.3.1 (Solyc03g026110.3)
-0.39 -2.08 -1.21 -2.21 0.58 0.38 0.0 0.56 0.72 -1.08 -0.49 -0.24 -0.36 -0.4 -0.55 -1.34 -1.39 -6.79 -6.49 -0.1 0.4 0.6 0.64 0.78 0.42 -0.2 0.95 0.93 0.34 0.81 0.73 0.58 -0.54 -1.24
Solyc03g026150.3.1 (Solyc03g026150.3)
-0.06 -1.41 -0.41 -0.26 0.27 0.15 -0.24 -0.04 0.44 0.44 -0.74 -1.01 2.07 1.13 0.33 0.03 0.3 -4.97 -8.9 -2.73 -0.86 0.08 -0.1 -0.11 0.06 -3.05 0.15 0.07 0.08 0.09 -0.01 0.43 -1.32 0.47
Solyc03g113790.3.1 (Solyc03g113790.3)
0.3 -0.3 0.56 1.27 -1.25 -0.31 0.18 0.01 0.39 -0.02 -0.56 -0.58 -0.43 -0.62 0.72 0.31 0.53 -1.36 -6.14 -1.65 -0.39 0.4 0.44 0.44 0.26 -1.34 0.1 0.14 0.03 0.37 0.3 0.12 -1.02 -0.1
Solyc03g115590.3.1 (Solyc03g115590.3)
0.27 -0.92 0.19 0.19 0.37 0.25 -0.02 -0.21 0.03 0.28 0.13 0.03 0.51 0.22 0.98 0.56 0.61 -4.97 -4.77 -0.61 -0.07 -0.08 0.02 -0.23 -0.61 -0.57 -0.0 -0.08 -0.05 0.11 0.26 -0.02 -1.62 0.52
Solyc03g119080.4.1 (Solyc03g119080.4)
-0.58 -5.82 -3.24 -3.93 0.36 0.75 -2.38 0.49 -0.28 0.14 0.55 -0.48 -0.27 -1.24 -2.99 -4.22 -3.62 -10.71 -9.81 -1.28 -1.86 1.23 1.31 1.03 1.12 -1.87 0.89 0.52 -0.03 1.49 1.32 1.4 -1.22 -1.63
Solyc03g120450.3.1 (Solyc03g120450.3)
-0.33 -0.0 0.41 -0.02 -0.34 0.5 -0.08 0.63 0.11 0.35 0.81 0.67 -0.13 0.08 -0.41 -0.19 0.36 -3.75 -3.96 -3.67 -1.34 0.06 -0.38 -0.29 -0.26 -2.69 0.85 0.68 0.68 0.47 0.35 0.54 -0.94 -0.45
Solyc04g008730.3.1 (Solyc04g008730.3)
-1.2 -1.35 -0.34 0.83 1.6 0.44 -0.47 0.84 0.04 0.74 0.64 0.41 -0.72 -0.88 0.96 0.21 1.64 -7.02 -5.65 -2.81 -1.21 0.18 -0.02 0.17 -0.05 -2.86 -0.25 -0.23 -0.66 0.19 0.42 -0.78 -2.89 -1.75
Solyc04g009740.3.1 (Solyc04g009740.3)
0.61 -1.75 -0.62 -0.45 0.5 0.1 0.11 -0.32 0.11 0.25 0.14 -0.33 0.63 -0.16 0.38 0.09 0.07 -6.36 -7.64 -0.86 0.16 0.38 -0.02 0.21 0.28 -0.14 0.02 0.3 0.37 0.37 0.29 0.52 -1.84 0.45
Solyc04g015560.3.1 (Solyc04g015560.3)
-1.45 -1.02 -2.27 -0.68 0.11 -0.05 -1.95 -0.22 -0.44 0.31 0.5 -0.95 1.09 0.7 1.06 0.82 1.51 -6.19 -6.0 -1.97 0.33 0.03 -1.23 -0.58 -0.75 -0.88 0.92 0.88 0.53 0.69 0.82 0.09 -4.31 -1.69
Solyc04g015850.2.1 (Solyc04g015850.2)
-1.02 -0.87 0.8 -0.65 1.53 0.65 -1.12 0.17 0.95 -0.81 -1.18 -2.39 -3.86 -4.44 0.2 -1.37 -1.32 - -9.78 -1.33 0.59 0.91 0.21 0.78 1.09 -3.43 -1.91 -1.02 -0.62 0.42 0.14 1.29 1.2 0.91
Solyc04g025990.3.1 (Solyc04g025990.3)
-0.02 -1.21 0.35 0.0 -0.52 0.28 0.08 0.13 0.4 -0.15 0.48 0.26 0.63 0.25 -0.33 -0.64 -0.47 -9.18 -10.75 -1.75 -0.5 0.25 1.4 0.73 0.4 -1.57 0.72 0.26 -0.1 0.11 0.47 -0.25 -1.41 -0.09
Solyc04g082740.3.1 (Solyc04g082740.3)
-0.42 0.29 -1.66 -2.77 1.29 1.8 1.31 1.37 0.9 0.42 -0.25 -0.86 0.3 -0.15 -1.52 -2.44 -2.54 - -9.83 -1.13 -0.0 -0.47 -0.1 -0.46 -0.52 -2.07 0.51 0.0 -0.25 0.11 0.12 0.07 -0.57 0.29
Solyc05g015843.1.1 (Solyc05g015843.1)
-2.94 -0.83 -0.71 -2.79 -0.61 -2.05 2.67 -2.46 3.62 -1.91 1.0 0.36 -2.98 -0.98 0.33 - -3.4 - - -1.6 - -0.14 0.19 -0.33 -1.43 - -1.32 -1.46 -3.46 -0.97 0.44 - - -0.06
Solyc05g049900.3.1 (Solyc05g049900.3)
0.77 -0.64 -1.49 -1.6 -0.3 0.55 0.61 0.1 0.45 0.28 0.41 -0.01 0.24 -0.4 0.63 0.66 0.37 - -10.65 -0.63 0.52 0.04 -0.18 -0.08 0.01 -0.21 -0.0 0.08 0.1 0.05 0.11 0.24 -0.4 -0.24
Solyc05g053240.3.1 (Solyc05g053240.3)
-0.17 -1.36 -1.7 -1.06 -0.86 0.15 0.08 -0.68 0.83 0.92 0.61 0.02 0.49 0.15 0.54 0.3 0.34 -10.94 - -1.55 -0.27 0.38 0.41 0.43 0.28 -0.36 0.34 0.3 0.12 0.4 0.46 0.51 -2.12 -0.23
Solyc05g054710.3.1 (Solyc05g054710.3)
0.59 -1.32 1.27 0.67 -0.44 -0.31 -0.36 -0.42 -0.29 -0.27 -0.11 -0.11 -0.43 -0.77 -0.77 -0.9 -0.69 -11.72 -11.67 -1.11 -0.66 0.86 0.39 0.47 0.5 -0.31 0.08 0.48 0.38 0.88 0.86 0.67 -1.08 0.2
Solyc05g054760.3.1 (Solyc05g054760.3)
-1.08 -5.77 -2.85 -5.62 0.61 0.2 -0.55 -0.53 0.28 0.7 0.25 0.71 0.56 -0.22 -0.27 -0.9 -0.76 -10.21 -13.63 -2.3 -0.93 0.57 1.57 0.66 0.3 -1.78 0.97 0.33 0.29 0.71 0.88 0.36 0.03 -0.25
Solyc06g007680.2.1 (Solyc06g007680.2)
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Solyc06g009190.3.1 (Solyc06g009190.3)
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Solyc06g069635.1.1 (Solyc06g069635.1)
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Solyc06g073110.3.1 (Solyc06g073110.3)
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Solyc07g007670.3.1 (Solyc07g007670.3)
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-0.83 -0.14 -0.75 -0.61 -0.14 -0.08 0.89 0.04 0.01 -0.35 0.53 0.58 0.69 0.61 -0.21 -1.07 -0.66 -1.49 -1.03 -0.37 0.55 0.25 0.05 0.09 0.08 -0.47 0.24 0.1 0.12 0.33 0.37 0.22 -0.67 -0.18
Solyc12g089060.2.1 (Solyc12g089060.2)
-0.12 -1.07 -0.09 -0.35 -0.79 -0.06 1.12 -0.16 0.66 0.17 0.36 -0.35 1.14 0.51 0.17 -0.05 -0.0 - -9.58 -0.69 0.31 -0.07 -0.0 -0.07 -0.09 0.02 -0.04 -0.03 -0.06 0.1 0.26 0.22 -0.61 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.