Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.39 -1.03 -0.75 -2.09 1.01 0.92 1.2 0.97 -1.1 0.29 -0.22 -0.11 0.48 -0.78 0.15 -1.09 -0.79 -1.44 -0.3 -0.46 -0.7 -0.69 -3.71 -3.75 -0.51 -1.24 -1.11 0.65 0.19 0.31 0.95 -0.95 -0.01 -0.23 0.37 0.91 0.65 0.63 -0.71 0.08 0.75 0.24 -0.09 -0.4 -0.54 0.53 0.46 0.46
-0.75 -1.24 -0.25 -1.56 0.63 0.07 0.29 0.06 -0.55 0.27 -0.28 -0.21 0.44 0.3 0.3 -0.83 0.07 -0.51 0.15 0.02 0.15 0.23 -0.71 -0.03 -0.1 -0.35 -0.55 0.06 0.51 0.07 0.38 -0.17 0.34 0.17 0.13 0.78 0.12 -0.05 -0.02 0.01 -0.18 -0.47 0.04 0.03 -0.16 -0.01 0.13 0.31
- -2.56 -0.98 -0.04 -1.65 0.27 -0.12 -1.03 -2.61 1.16 -1.54 -0.06 0.01 -1.05 1.83 - -1.64 -2.22 -2.44 -2.63 -1.95 -1.47 - - -0.05 -1.06 0.34 1.01 1.2 0.56 1.28 -0.2 0.43 0.29 -4.01 2.47 -0.37 0.03 0.18 1.02 -1.1 -1.06 -0.83 1.62 -1.98 -0.2 0.95 -0.73
-3.94 -2.4 -2.19 -3.3 -1.27 -0.01 0.79 0.3 -3.13 0.89 0.87 0.95 0.61 -0.21 1.61 -2.53 -3.0 -1.71 -0.82 -0.51 -0.38 -0.05 -3.95 -2.76 1.07 -1.14 1.61 -0.04 0.35 -0.09 0.43 0.18 0.03 -0.19 0.17 0.9 0.15 -0.32 -0.54 0.16 0.33 -0.09 0.44 -0.01 -1.47 -0.47 0.54 0.14
-1.83 -1.81 -1.73 -2.36 -0.34 0.32 0.53 0.43 -1.69 0.77 0.85 0.81 -0.4 -2.01 0.99 -2.61 -1.71 -2.19 -0.22 0.29 -0.72 -1.14 -1.55 0.17 0.46 -0.74 0.69 0.77 0.81 -0.08 1.29 1.25 0.35 -0.5 -1.4 1.78 0.41 0.23 -1.56 -1.25 -1.8 -2.19 -1.0 0.1 -1.54 0.12 0.95 -0.07
-5.68 -6.39 -6.56 -7.13 -2.29 -1.75 -2.32 -2.94 -5.42 1.02 -0.82 -1.49 0.36 -0.43 1.45 -2.24 -2.93 -5.93 -0.73 -1.01 -2.19 -3.03 -3.0 -6.81 -0.91 -1.05 1.76 0.33 0.02 0.54 0.87 0.96 1.15 0.06 -0.58 0.96 1.41 0.37 0.37 0.14 1.18 0.46 0.46 0.68 0.35 -0.01 1.51 0.69
-1.25 -0.75 0.07 0.21 1.15 0.33 0.17 -0.07 -0.62 1.21 -2.17 -1.98 -0.5 -1.7 1.27 -2.14 -0.24 0.01 -0.04 0.21 0.08 -0.07 -3.7 0.93 0.4 -0.01 -0.21 0.55 -1.02 0.15 1.24 -0.15 0.04 -0.01 -2.58 1.04 -0.04 -0.07 -0.77 0.09 -1.71 -1.99 -0.85 0.29 -1.64 -0.19 1.4 -0.57
-4.08 -3.89 -7.51 -5.68 -2.51 -1.04 -1.9 -2.46 -3.92 0.86 -2.79 -2.63 0.38 -0.18 1.58 -2.26 -5.47 -3.65 -4.56 -2.65 -2.46 -1.82 -5.01 -5.2 -2.88 -2.61 -3.44 1.27 2.57 0.95 1.39 -1.01 0.71 0.24 0.51 3.62 0.62 -1.01 0.02 -0.71 -4.25 -6.28 -1.69 0.43 -2.12 -1.15 -0.29 0.2
-1.62 -1.64 -2.25 -3.34 -0.86 -0.05 -0.19 -0.13 -1.48 1.13 -0.28 -0.3 0.94 0.14 0.62 -1.39 -1.43 -1.24 -0.95 -0.34 -0.73 -0.7 -2.23 -1.04 0.68 -0.29 1.45 0.33 0.22 0.4 1.46 0.65 0.31 -0.39 -0.37 0.58 0.64 0.43 -1.03 0.01 -0.09 -0.11 -0.07 -0.04 -0.56 0.3 0.84 0.28
-2.84 -1.82 -0.73 -1.85 -0.61 0.5 0.82 0.44 -2.22 0.88 -0.51 -0.54 1.34 0.21 0.73 -1.61 -0.98 -1.19 -0.71 -0.29 -0.41 -0.42 -2.7 -1.02 0.72 0.01 0.8 0.27 0.49 0.08 1.18 0.21 0.33 -0.24 0.67 1.3 0.93 -0.43 -0.58 -0.46 -0.77 -1.51 -0.48 -0.19 -1.35 -0.56 0.58 0.12
-2.53 -1.77 -0.87 -2.88 -0.0 -0.25 -0.18 -0.43 -1.93 1.09 -1.43 -1.67 0.86 0.67 1.18 -2.01 -0.72 -0.89 0.87 0.74 1.06 1.08 -1.66 -1.47 1.32 -0.07 1.33 -0.74 -1.54 0.09 0.11 0.37 -0.52 -0.81 -2.89 -0.04 -1.35 -0.25 -0.89 0.1 -0.07 0.15 0.42 0.19 -0.38 -0.39 0.62 0.76
-1.38 -0.99 0.35 -0.93 0.35 0.49 1.0 1.18 -0.62 0.55 -0.06 -0.07 0.14 -0.78 0.38 -0.91 -0.33 -0.59 -0.32 -0.05 -0.76 -1.27 -0.89 -0.54 0.01 -0.34 -0.46 0.4 0.38 0.16 0.94 -0.0 0.31 -0.09 -0.15 1.2 0.41 0.56 -0.99 -0.55 -0.52 -0.59 -0.52 -0.57 -0.79 0.48 0.0 0.16
-1.07 -1.09 -0.76 -0.9 0.69 1.21 1.04 0.9 -0.49 0.43 -0.66 -0.71 0.4 -0.28 0.82 -1.39 -1.31 -1.08 -0.93 -0.59 -0.48 -0.37 -2.57 -0.67 0.23 -1.57 0.09 0.06 -0.16 0.22 0.7 -0.05 0.57 0.25 -0.95 0.76 0.61 -0.33 -0.48 0.53 -0.07 -0.27 0.46 0.28 0.14 -0.5 0.62 -0.4
- - -4.3 2.22 0.46 0.84 -1.25 0.03 - 1.27 1.89 1.07 -1.72 -0.03 1.88 - -0.85 -0.56 0.7 -2.1 - -1.79 -1.25 - -0.33 -0.67 -0.83 -1.11 -0.95 0.56 0.96 1.22 -0.28 0.36 - -0.79 -0.52 0.22 -0.16 -0.25 0.09 0.31 -1.27 -2.31 -0.61 0.38 -0.27 -0.0
-1.29 -0.83 0.49 -1.26 0.31 1.08 1.13 1.01 -0.36 0.5 -0.1 -0.1 0.47 -0.76 0.47 -1.72 -0.05 -0.22 0.59 0.43 0.43 0.26 -1.55 -0.87 0.82 0.2 0.53 0.04 -0.65 -0.12 0.48 -0.09 -0.25 -0.4 -0.91 1.02 -0.21 0.0 -1.39 -0.7 -1.24 -1.37 -0.8 -0.8 -1.21 0.0 -0.01 0.16
0.01 -0.21 -0.55 -1.77 0.68 0.24 0.2 -0.2 -1.51 0.38 -1.39 -1.24 0.37 -0.33 0.86 -0.79 -0.23 -0.16 -0.27 0.12 0.28 0.39 -0.87 1.09 0.94 -0.17 0.85 0.22 -0.34 -0.12 0.15 -0.89 0.01 -0.13 -0.6 0.91 -0.09 -0.1 -0.2 -0.19 -0.28 -0.47 0.07 -0.01 -0.73 -0.17 0.3 0.03
-3.07 -1.14 -2.05 0.27 2.16 1.02 0.07 0.56 -1.24 1.83 -0.92 -1.0 -0.09 -1.45 1.83 -4.04 -2.43 -6.37 -1.37 -1.17 -2.71 -3.79 -7.64 -1.66 -3.22 -4.58 -3.26 1.32 1.03 0.32 0.93 -0.63 0.48 -0.67 -3.35 2.25 0.16 -0.96 -0.38 -2.99 -3.3 -4.49 -2.52 0.5 -2.91 -1.25 2.1 -0.19
-0.9 -0.63 -0.68 1.09 0.24 0.7 1.09 0.93 -0.39 0.43 -2.4 -2.58 -0.34 -1.39 0.45 -0.46 0.67 -0.74 -0.03 -0.63 -1.07 -0.7 -2.13 -1.86 -0.01 -0.13 -0.91 0.29 0.89 0.62 0.82 0.13 -0.26 0.36 0.36 0.66 -0.71 0.56 -0.41 -0.09 -1.66 -1.13 -0.49 0.45 -1.06 0.52 0.69 0.06
-4.97 -1.28 -0.71 -1.08 1.08 1.27 0.42 0.62 -0.67 0.49 -1.51 -0.93 -2.74 -3.49 1.1 -1.94 -0.89 0.01 -0.13 -0.63 -0.63 -0.45 -2.34 -0.25 -0.09 -1.16 0.03 0.46 -0.74 1.09 -0.77 1.02 -0.28 0.01 -0.9 1.12 -1.98 1.02 -1.05 -0.28 -3.19 -1.79 -1.02 1.75 -0.87 1.06 1.65 -0.47
-2.92 -2.78 -4.25 -5.19 -2.06 -0.66 -0.53 -0.66 -2.78 1.34 -1.95 -1.87 1.19 1.05 0.46 -0.86 -1.75 -3.42 -1.46 -0.97 -0.83 -1.01 0.09 -3.36 -0.08 0.68 -0.38 1.04 -0.28 0.21 1.23 0.7 0.67 0.52 -0.58 0.71 0.72 1.21 -0.51 -0.34 -0.82 0.01 0.21 -0.04 0.08 1.18 1.14 0.18
-2.51 -1.46 -0.19 -1.22 1.53 0.68 0.8 0.67 -2.02 0.27 -1.34 -1.36 0.22 -0.58 0.39 -2.36 -1.88 -1.59 -0.83 0.35 0.76 0.45 -1.46 -0.75 0.28 -1.58 0.68 0.18 -0.49 0.2 0.63 0.3 0.03 -0.26 -0.57 2.2 -0.62 -0.59 -0.64 -0.47 0.06 -0.03 -0.58 0.4 -1.5 -0.78 0.6 0.17
-1.43 -1.67 -0.79 -2.39 -2.24 -0.53 -0.62 -1.72 -1.32 -2.62 1.04 0.97 -1.0 -2.09 0.13 -0.76 -0.51 -0.09 -0.09 -0.38 0.44 0.75 -2.16 -1.09 -0.03 1.22 -0.79 1.08 0.69 0.02 0.4 -0.03 0.69 0.32 1.56 1.72 0.72 -4.03 0.99 -0.45 -2.0 -2.18 -0.74 -1.03 0.23 -4.32 1.11 0.26
-1.39 -1.32 -0.65 -2.07 1.14 -0.0 0.02 0.06 -1.22 0.94 -3.16 -2.86 0.13 -0.4 1.29 -1.76 -1.28 -1.57 -1.71 -0.5 0.1 0.39 -1.09 -1.94 0.1 -0.82 -0.84 0.23 -1.75 0.22 0.64 -0.39 0.3 0.26 -2.48 1.02 0.11 0.22 0.01 0.31 0.74 0.91 0.15 1.21 0.12 0.1 1.34 0.14
-1.7 -1.1 -1.25 -2.38 1.08 1.11 1.35 1.32 -2.22 0.45 -2.3 -2.45 0.25 -0.77 0.42 -1.12 -0.3 -1.34 0.21 0.26 0.22 0.0 -0.1 -2.34 -0.11 -0.76 -0.28 0.28 -0.9 -0.04 1.07 -0.18 0.49 0.17 -0.8 1.01 0.66 0.09 -0.32 0.14 -0.94 -1.25 -0.01 -0.0 -0.44 0.25 0.47 -0.13
- - -1.86 -1.83 - -0.78 - - - -3.63 -1.19 -2.57 -1.76 -1.2 -1.3 - -0.46 - - -3.6 - -3.34 - - -4.24 -0.49 -2.6 -2.03 1.83 0.16 0.01 -2.88 1.08 1.19 -1.74 2.7 2.37 - 1.53 -0.36 -0.77 -1.19 -1.27 3.38 -0.6 -3.38 0.53 1.59
-0.35 -0.55 -0.8 -1.32 0.07 0.56 0.58 -0.07 0.64 -0.21 0.63 0.53 -0.15 -0.5 0.41 0.81 -0.46 -0.29 -0.82 -1.61 -1.22 -0.65 -2.8 -1.94 -0.03 0.4 0.03 0.02 -0.42 -0.05 0.45 1.15 0.14 -0.12 1.72 1.2 0.05 -1.24 -0.17 -0.57 -1.32 -1.23 -0.57 0.1 -0.43 -1.35 0.64 0.04
-1.06 -1.04 -1.24 -0.88 1.61 1.3 1.31 1.14 -0.48 0.84 -1.44 -1.56 0.01 -0.94 0.58 -1.64 -1.4 -1.82 -0.99 -0.75 -0.43 -0.51 -2.48 -3.97 0.03 -0.96 0.68 0.43 0.73 0.22 1.25 -0.23 0.15 0.11 0.32 0.67 0.75 -0.01 -1.03 -0.37 -1.59 -1.75 -0.35 0.3 -1.42 -0.06 0.68 -0.41
-2.43 -0.91 -0.61 -2.14 -0.53 -0.78 -1.51 -1.56 -1.05 0.05 -1.73 -1.49 -0.05 -1.43 1.68 -1.78 -1.0 -0.47 -0.37 -0.56 -0.42 0.67 -3.69 -1.09 -0.99 -0.72 -1.89 0.92 -0.59 0.56 0.52 0.21 0.33 0.46 -2.41 2.3 0.43 -1.19 0.67 0.51 -3.37 -3.68 -0.48 1.92 -0.5 -1.71 2.15 0.24
-4.91 -4.76 -3.23 -5.62 -3.9 1.46 1.41 1.5 -1.54 1.11 -0.14 0.19 0.24 -0.52 0.84 - -1.85 -2.29 -1.59 -0.76 -1.23 -0.83 -5.8 -4.21 0.15 -1.4 -0.02 1.21 -1.38 0.37 1.64 0.51 0.85 0.4 -1.86 0.83 1.43 0.2 -0.59 0.1 -0.91 -1.66 -0.09 -0.27 -0.46 -0.08 0.8 0.04
-0.65 -1.0 -0.88 -0.38 1.54 0.03 0.21 -0.14 -1.03 0.23 -2.07 -1.97 -0.43 -0.94 0.55 -1.32 -1.06 -0.42 -1.32 -0.81 0.06 0.07 -1.67 0.97 1.51 -0.97 0.26 -0.27 -0.24 -0.03 -0.1 -0.66 0.12 0.02 -1.77 0.97 -0.79 -0.15 -0.15 0.31 0.78 0.49 0.46 1.1 -0.18 -0.13 0.68 -0.06
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-1.69 -0.87 -1.74 -4.08 -1.4 -0.8 -1.1 -0.96 -0.5 0.96 1.42 1.6 0.6 -0.55 1.45 -1.41 -0.96 -1.45 -1.37 -0.94 -0.14 -0.58 -1.55 -2.99 -0.73 -0.83 -0.58 0.36 -0.89 0.18 0.14 0.86 0.08 0.04 -0.18 2.22 -0.06 0.15 0.62 0.03 -4.19 -2.79 -0.25 0.86 0.04 0.1 0.71 -0.33
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-2.99 -1.05 -0.4 -2.51 -0.86 -0.14 0.93 -1.43 -7.17 0.77 0.91 0.8 0.4 -0.04 0.91 0.21 0.18 -0.51 -0.79 0.04 -0.47 0.35 -5.14 -1.92 0.72 -0.26 0.54 0.09 -0.91 -0.32 0.66 0.21 0.1 -0.11 2.04 1.66 0.56 -0.92 -0.95 -0.97 -0.57 -0.73 -0.68 -0.97 -2.58 -1.32 -0.2 0.14
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-2.34 -3.92 -0.52 -3.85 -0.32 1.61 1.07 0.71 -1.98 0.46 1.28 0.86 0.01 -1.21 1.37 -3.2 -1.91 -1.79 -0.96 -0.2 -0.29 -0.26 -2.72 -3.76 0.84 -1.27 0.94 0.04 -0.36 0.08 1.67 0.01 0.58 -0.07 -4.18 1.99 -0.27 -1.91 0.17 -0.29 -5.21 -6.16 -1.89 0.06 -1.55 -2.17 1.25 -0.77
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-1.72 -2.27 -1.09 -1.83 0.26 0.95 0.65 0.63 -1.04 0.79 0.97 0.81 0.73 0.28 0.96 -2.09 -2.01 -0.95 -0.83 -0.55 -0.73 -0.54 -3.08 -0.18 0.68 -0.88 0.97 0.06 -0.33 -0.02 0.26 0.53 0.37 -0.14 -0.08 0.9 0.51 -0.37 -1.03 0.1 -0.01 -0.56 0.08 -0.11 -0.35 -0.48 -0.1 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.