Heatmap: Cluster_205 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.49 -0.93 0.7 -0.82 1.53 1.28 0.95 0.83 -0.76 0.01 -2.69 -2.47 -0.62 -1.97 -0.17 -1.1 -0.62 -0.13 0.5 0.72 0.62 0.44 0.91 1.03 0.47 -1.23 0.25 0.13 -1.22 -0.44 -0.04 -0.37 -0.28 -0.17 -0.94 0.26 -0.13 -0.02 -0.96 -0.35 -0.85 -1.03 -0.29 0.07 -0.73 -0.03 -0.13 -0.24
-0.72 -0.14 0.69 -0.17 1.26 1.13 0.65 1.15 -0.34 -0.02 -2.49 -2.45 -0.32 -1.16 -0.24 -0.54 -0.19 0.04 0.71 0.81 0.97 0.86 0.12 1.46 0.24 -0.13 -0.87 -0.38 -1.69 -0.46 0.02 -0.89 -0.04 -0.43 -2.14 -0.33 0.17 -0.2 -1.07 -0.36 -0.93 -0.87 -0.28 -0.44 -0.23 -0.22 -0.33 -0.62
-2.65 -2.5 -0.96 -0.14 2.06 1.09 1.04 0.88 -0.94 -0.06 -0.64 -0.54 -0.29 -1.11 -0.3 -1.77 -0.95 -1.04 -1.11 -0.85 -1.23 -0.57 -2.83 1.35 0.48 -1.63 0.04 0.45 0.68 -0.05 0.35 0.18 0.49 0.31 -1.5 0.47 0.57 0.02 -0.29 -0.37 -0.48 -0.41 -0.01 -0.24 -0.31 -0.03 0.07 0.4
-2.16 0.03 1.38 -1.11 2.7 1.02 0.63 0.76 -0.74 -0.99 -2.55 -2.41 -1.09 -1.57 -1.07 -1.43 0.12 0.99 1.62 1.22 0.76 0.43 0.61 2.47 1.24 -1.96 -0.84 -4.99 -3.69 -2.25 -2.24 -5.21 -3.3 -5.73 -6.77 -3.84 -3.69 -0.36 -4.53 -1.11 0.3 0.15 -0.09 -2.14 -3.82 -0.32 -1.67 -2.27
-0.7 -0.08 0.47 -2.83 1.4 1.32 1.23 1.32 -0.63 -0.38 -1.58 -1.42 -0.83 -2.21 -0.7 -0.64 0.95 -0.24 0.67 0.99 0.86 0.33 -0.17 1.03 0.24 -1.29 -0.22 0.12 -0.27 -0.68 -0.14 -0.71 -0.45 -0.46 -0.3 -0.31 -0.09 -0.01 -1.14 -0.57 -0.97 -1.34 -0.16 -0.17 -0.89 -0.09 0.02 -0.78
-0.98 -0.19 0.11 1.05 1.64 1.02 0.84 0.8 0.09 -0.37 -0.88 -0.91 -0.41 -1.54 -0.48 -2.27 -0.46 -0.64 -0.19 0.08 0.15 0.04 -1.43 1.28 0.19 -1.3 -0.19 0.05 -0.36 -0.24 0.34 -0.43 -0.03 -0.1 0.03 -0.26 -0.02 -0.13 -0.84 -0.2 -0.07 -0.4 -0.05 0.18 -0.07 -0.15 -0.09 -0.22
-1.17 -1.89 -0.69 -0.97 1.67 1.19 0.87 0.94 -1.53 0.22 -2.9 -2.89 0.2 -0.39 0.32 -1.49 -0.48 -1.02 0.25 0.41 0.62 0.16 -1.4 0.95 0.34 -0.67 0.23 0.42 -1.01 -0.09 0.12 -0.34 0.21 0.09 -1.31 0.18 0.52 0.2 -0.61 -0.11 -0.41 -0.63 0.08 -0.03 -0.12 0.2 -0.12 -0.13
-1.3 -0.13 1.14 -0.03 1.94 0.95 0.69 0.64 0.14 0.2 -0.81 -0.85 0.22 -1.52 0.11 -1.73 0.1 -0.06 0.44 0.79 0.73 0.58 -3.75 2.06 1.02 0.29 0.98 -0.89 -2.18 -0.97 -0.24 -0.75 -1.26 -1.46 -3.84 -1.72 -0.54 -0.01 -2.2 -0.85 -1.17 -1.5 -0.87 -0.8 -1.6 0.03 -1.11 -1.09
-0.6 -0.23 0.38 -1.71 2.06 1.31 0.49 0.68 -0.74 -0.03 -1.01 -1.15 -0.45 -1.62 -0.18 -0.29 0.54 0.09 0.33 1.15 0.72 0.53 -2.61 0.09 0.58 -0.37 0.12 -0.53 -0.62 -0.41 -0.32 -0.13 -0.22 -0.36 -0.67 -0.41 -0.12 -0.06 -1.4 -0.31 -0.58 -1.06 0.03 -0.06 -0.47 0.01 -0.39 -0.36
-1.14 -0.5 0.4 1.46 1.79 0.82 1.05 1.06 -0.45 -0.27 -0.93 -1.2 -0.36 -0.58 -0.57 -0.1 -0.24 -0.02 -0.06 -0.41 -0.3 0.05 -1.38 1.16 0.27 -0.04 -0.4 0.1 0.61 -0.3 0.2 -0.73 -0.6 -0.22 -0.42 -0.29 -0.35 -0.04 -0.67 -0.71 -0.71 -0.62 -0.58 -0.63 -0.88 0.02 -0.44 -0.42
-3.18 -2.06 -2.31 0.86 2.06 1.99 1.39 1.87 -2.92 -0.14 -3.19 -3.49 -0.89 -2.93 0.52 -1.93 -4.56 -4.29 -4.38 -3.1 -1.68 -2.36 -6.26 1.67 1.82 -2.17 1.29 0.24 -0.69 -0.09 -0.18 -1.23 0.24 -0.54 -3.07 -0.02 0.03 -0.37 -1.29 -0.27 -1.61 -1.44 -1.76 1.58 0.18 -0.49 -0.04 -0.7
-1.86 -2.03 -0.46 -0.54 1.89 1.35 1.05 0.9 -2.08 0.45 -1.17 -1.42 0.21 -0.69 0.25 -1.09 -1.06 -1.24 0.03 0.31 0.63 0.38 -2.07 0.64 0.37 -1.14 0.23 -0.13 -1.15 -0.48 0.02 0.42 0.42 -0.11 -0.66 0.59 0.36 0.12 -0.85 -0.45 -0.52 -0.93 -0.21 -0.27 0.14 0.1 -0.22 -0.26
-0.29 0.18 0.63 -0.75 1.62 0.33 -0.04 0.12 -0.35 -0.06 -0.71 -0.53 -0.06 -0.71 -0.1 -0.29 0.53 0.53 0.19 0.42 0.72 0.4 -1.8 1.74 0.72 -0.05 0.38 -0.55 -1.28 -0.69 -0.46 -0.16 -0.42 -0.49 -1.22 -0.6 -0.16 0.09 -1.25 -0.26 -0.28 -0.47 -0.29 -0.34 -0.64 0.12 -0.71 -0.58
0.56 0.43 1.56 -0.5 -0.85 0.57 0.5 0.69 -1.48 0.22 -2.66 -1.73 0.66 0.6 -0.0 -0.46 0.57 0.78 1.07 0.57 -0.21 -1.11 -2.12 2.29 1.25 1.95 0.74 -1.2 -1.66 -1.68 -0.42 -1.06 -1.66 -1.82 -6.92 -1.65 -1.23 0.0 -2.1 -0.65 -1.74 -2.04 -1.68 -1.83 -2.06 0.28 -2.69 -1.93
-1.57 -0.14 0.62 -3.0 1.04 0.44 0.43 1.23 -1.9 -0.06 -0.36 -0.63 -0.2 -0.74 -0.4 -1.2 0.71 -0.35 0.89 0.78 0.63 0.34 0.62 0.63 0.49 -0.65 0.58 -0.27 -1.11 -0.43 -0.19 -0.09 -0.19 -0.19 -1.27 -0.59 -0.15 0.12 -0.92 -0.16 -0.1 -0.36 -0.16 -0.05 -0.32 0.18 -0.07 -0.55
0.74 1.63 1.72 -2.86 2.59 2.07 1.85 1.34 0.43 0.2 -4.55 -4.47 -0.67 -1.91 0.23 -1.02 0.28 -1.61 0.86 0.15 -0.17 -1.47 0.1 2.43 -1.98 -2.42 -5.17 -4.7 -2.97 -3.06 -1.55 -6.26 -2.89 -3.31 -4.48 -4.45 -2.05 -0.6 -2.93 -0.57 -4.9 -3.78 0.33 -0.98 -2.07 -0.82 -1.97 -3.7
-1.17 -4.28 0.05 -0.36 3.06 1.64 1.63 2.1 0.48 -3.39 -9.69 -8.54 -4.47 -4.56 -3.22 -1.51 -0.32 0.99 0.22 1.13 1.71 1.2 -0.13 3.11 0.61 -2.61 -5.34 -3.97 -5.22 -4.75 -3.75 -5.84 -4.05 -4.02 -8.09 -4.25 -3.13 -1.2 -5.77 -3.53 -3.53 -5.44 -4.37 -4.59 -3.28 -1.28 -5.32 -4.64
-0.13 -0.46 0.88 -2.11 0.88 0.48 1.03 1.08 0.02 0.11 -1.27 -1.07 -0.15 -0.27 0.26 -1.11 0.18 0.08 0.3 0.41 0.51 0.64 0.5 0.63 0.4 0.09 -0.18 -0.04 -0.46 -0.25 -0.26 -0.82 -0.28 -0.49 -1.67 -0.79 -0.37 0.01 -0.52 -0.24 -0.7 -0.69 0.03 0.06 -0.19 0.0 -0.23 -0.27
-0.43 -0.2 -0.15 -0.9 1.37 1.16 1.43 1.01 -0.3 0.09 -0.4 -0.25 -0.05 -0.47 0.11 -0.74 0.12 -0.5 0.19 0.34 0.07 -0.29 0.1 0.59 0.12 -0.26 -0.04 0.16 -0.4 -0.32 0.03 -0.1 -0.26 -0.51 -0.6 -0.17 0.11 -0.07 -1.11 -0.43 -0.64 -0.83 -0.2 -0.42 -0.59 -0.09 -0.27 -0.27
-1.35 -0.96 -0.19 0.41 2.0 1.55 1.2 1.13 -1.68 0.24 -1.63 -1.99 -0.4 -2.07 -0.09 -1.08 -0.23 -0.41 -0.13 0.27 0.25 -0.0 -0.6 1.4 0.66 -0.6 0.39 0.18 -0.97 -0.44 0.53 0.08 -0.19 -0.18 -1.22 -0.12 0.38 -0.39 -1.44 -0.84 -0.88 -1.38 -0.56 -0.57 -1.14 -0.46 -0.05 -0.32
0.59 1.1 1.71 -0.29 3.0 1.52 1.31 1.45 1.03 -0.49 -6.38 -6.78 -1.04 -2.63 -0.7 -1.48 0.41 -0.05 0.17 0.5 0.93 0.78 -0.97 1.69 -0.57 -2.79 -2.4 -1.41 -3.56 -1.79 -1.11 -2.34 -1.45 -1.36 -4.26 -2.41 -1.53 -0.86 -2.34 -1.33 -3.21 -2.91 -0.71 -1.37 -1.65 -0.85 -1.68 -1.94
-0.63 -0.96 0.21 1.03 1.49 0.57 0.52 0.67 -0.26 0.06 -1.69 -1.52 -0.41 -1.84 -0.19 -0.16 0.66 -0.0 0.36 0.58 0.25 0.24 -0.23 1.53 0.02 -0.91 -0.62 -0.21 0.11 -0.03 -0.14 -0.42 -0.14 -0.25 -1.67 -0.53 0.0 0.21 -1.19 -0.42 -1.12 -1.01 -0.2 -0.06 -0.48 0.2 -0.06 -0.02
-1.17 -1.36 -0.36 -2.22 1.4 0.72 -0.02 0.28 -0.84 0.82 -2.31 -2.04 0.57 -0.14 0.19 -1.47 0.07 0.15 0.47 0.74 1.04 0.89 -0.99 0.87 1.11 -0.36 0.05 -0.24 -0.85 -0.19 0.28 -0.17 0.0 -0.31 0.12 -0.43 0.33 0.42 -1.59 -0.56 -0.68 -0.89 -0.14 -0.85 -0.63 0.36 -0.69 -0.29
-0.31 -0.19 0.53 -0.73 0.24 1.08 1.67 1.45 -0.36 0.44 -1.42 -1.39 -1.2 -3.4 -0.25 -0.56 0.38 -0.56 0.65 1.04 1.03 0.51 0.31 1.04 0.56 -0.83 -0.03 -0.26 -1.16 -0.56 0.21 0.16 -0.3 -0.56 -1.85 -0.35 0.04 -0.15 -1.9 -1.17 -1.77 -2.41 -0.36 -0.17 -1.58 -0.08 0.19 -0.42
0.16 0.06 -0.02 -0.3 1.38 0.56 -0.19 0.02 -0.64 0.1 -0.27 -0.2 0.6 0.22 -0.07 0.11 -0.48 0.51 -0.44 -0.35 -0.5 0.0 -0.32 1.83 1.16 0.62 0.31 -0.69 -0.86 -0.66 -0.33 -0.71 -0.62 -0.92 -0.93 -1.17 -0.13 0.25 -1.31 -0.44 0.06 -0.13 0.11 -0.57 -0.71 0.23 -1.15 -0.63
-1.05 -0.87 0.58 0.4 1.88 2.53 2.24 2.24 -0.6 -0.62 -2.17 -2.45 -1.35 -2.86 -0.89 -2.59 0.51 -0.46 0.64 1.0 1.2 1.08 -0.77 1.31 1.41 -0.4 1.72 -4.62 -4.94 -2.72 -4.48 -3.24 -4.69 -4.95 -6.21 -5.77 -5.06 -2.27 -5.47 -2.4 -2.2 -2.27 -1.95 -3.22 -4.74 -2.11 -3.48 -1.68
-1.28 -0.66 0.25 -0.86 1.53 1.28 1.22 1.18 -0.47 0.0 -0.12 0.08 -0.29 -1.87 0.14 -1.09 -0.29 -0.11 0.25 0.24 0.03 0.17 -0.71 2.27 0.86 0.09 0.48 -0.47 -0.98 -0.63 -0.18 -0.46 -0.71 -0.66 -0.67 -0.49 -0.23 -0.24 -1.58 -1.18 -1.23 -1.54 -0.85 -0.79 -1.36 -0.4 -0.53 -0.48
-6.26 0.11 0.51 -0.34 0.21 0.8 0.76 0.28 -2.32 0.92 -4.4 -5.84 0.39 -0.6 0.23 -2.91 0.29 -0.39 0.63 1.2 0.35 0.32 0.68 -0.49 -0.09 -0.89 -0.35 -0.04 -0.54 -0.24 0.79 -0.39 0.08 0.37 -1.33 -0.21 0.23 0.8 -0.31 -0.21 -1.96 -1.77 -0.29 0.04 -0.93 0.87 0.66 -0.01
-0.24 -0.94 0.59 -1.97 0.7 1.2 1.16 1.46 -0.7 -0.02 -2.61 -2.76 -1.27 -2.98 -0.38 -1.07 -0.33 -0.91 0.46 0.32 -0.07 -0.27 -1.24 1.59 0.02 -1.77 -0.36 0.75 -0.1 0.11 0.61 -0.07 0.33 0.09 -0.03 0.3 0.73 0.5 -1.47 -0.47 -1.58 -1.99 -0.21 -0.15 -0.8 0.4 0.07 -0.24
-0.72 0.59 1.8 -0.26 2.06 2.21 1.97 2.18 0.24 0.54 -3.99 -3.95 -1.34 -2.69 -0.02 -3.08 -0.51 0.73 0.74 0.27 0.38 1.16 -2.19 1.45 1.05 -1.97 0.36 -0.06 -2.61 -3.39 -2.06 -3.72 -4.24 -3.59 -3.54 -3.64 -3.21 -0.6 -4.4 -2.38 -4.4 -3.87 -1.52 -2.67 -3.79 -0.7 -2.91 -1.82
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-0.87 -0.47 0.88 0.08 1.2 1.74 1.68 1.56 -0.13 -0.19 -1.12 -1.42 -1.05 -2.24 0.05 -0.93 -0.21 -0.57 0.32 0.88 0.94 0.62 -1.49 1.49 0.59 -0.2 0.87 -0.55 -1.09 -0.93 -0.35 -0.78 -0.79 -0.69 -1.49 -0.22 -0.43 -0.86 -1.3 -1.1 -1.15 -1.59 -0.63 -0.92 -1.25 -0.95 -1.16 -0.44
-0.46 -1.05 -0.15 -2.15 1.46 0.63 0.65 0.51 0.16 0.41 -1.8 -2.11 0.31 -0.51 0.07 -0.29 -0.14 -0.44 0.24 0.59 0.62 0.5 -1.69 1.05 0.13 -0.67 -0.14 -0.06 -0.12 -0.31 -0.03 0.16 0.21 0.08 -0.65 -0.17 0.55 -0.25 -0.81 0.1 -0.46 -0.6 0.14 0.02 -0.03 -0.28 -0.22 -0.52
-2.05 -2.41 -0.92 0.69 1.86 0.94 0.85 0.56 -1.39 0.64 -0.52 -0.67 0.01 -0.7 0.26 -2.59 -1.24 -0.76 -0.47 -0.56 -0.93 -0.44 -3.37 2.0 0.34 -1.35 0.44 0.04 0.57 -0.05 0.19 -0.05 -0.07 -0.04 -2.04 -0.42 0.53 -0.05 -0.73 -0.44 -0.17 -0.38 -0.06 -0.0 -0.68 -0.01 0.26 -0.17
-1.18 -0.08 0.21 -1.73 0.32 1.27 1.21 1.41 -1.45 -0.01 -0.84 -0.67 -0.32 -1.0 -0.19 -0.93 0.33 -0.7 0.15 1.12 1.11 0.25 -0.82 0.99 0.25 -0.49 0.13 0.17 -0.52 -0.64 0.03 -0.39 -0.14 -0.03 0.05 0.44 -0.09 0.06 -0.86 -0.6 -0.9 -1.09 -0.53 -0.5 -0.64 0.04 -0.32 -0.7
-0.19 -0.74 -0.07 -1.03 1.56 0.83 0.7 0.77 -0.47 0.65 -1.78 -1.88 -0.16 -2.13 0.29 -0.95 0.16 -0.06 0.98 0.91 0.96 0.84 -1.74 0.83 0.8 -0.68 -0.13 0.12 -1.29 -0.4 0.27 -0.16 -0.14 -0.45 -1.87 -0.33 0.57 0.41 -1.5 -0.68 -1.38 -1.61 -0.35 -0.54 -0.8 0.45 -0.48 -0.78
-0.84 -1.23 -0.37 -3.11 1.08 0.61 0.46 0.35 -0.51 0.21 -0.62 -0.77 -0.18 -0.77 0.16 -0.87 -0.74 -1.91 0.79 0.9 0.96 0.37 -0.11 0.9 0.35 -1.11 0.36 -0.1 0.34 -0.12 0.06 -0.12 -0.04 0.08 0.52 0.04 -0.08 -0.17 -0.55 -0.12 -0.12 -0.4 0.22 -0.22 -0.28 -0.22 -0.61 0.07
0.89 1.72 1.14 -0.61 3.0 1.28 1.16 1.21 0.82 -1.45 -3.95 -3.96 -1.05 -1.75 -1.58 1.27 0.19 1.21 -0.02 0.79 1.14 1.0 -1.46 2.48 0.33 -0.29 -1.8 - - -6.63 -5.14 -7.33 -9.4 -11.9 -11.85 -11.47 -9.63 -3.35 -9.0 -4.15 -6.59 -7.07 -2.83 -4.33 -7.63 -3.44 -5.27 -9.39
-0.49 -1.41 0.42 0.22 1.95 1.17 1.43 1.24 -0.87 0.71 -2.16 -2.27 -0.57 -1.25 -0.13 -0.6 -0.31 -0.71 0.79 0.65 0.38 -0.63 -1.28 1.43 -0.02 -1.47 -0.73 -0.04 -1.21 -0.14 -0.18 -0.62 -0.57 -0.31 -2.1 -1.56 -0.5 -0.25 -0.75 -0.07 -0.06 -0.19 0.11 0.02 -0.77 -0.26 0.28 -0.54
-1.02 -0.12 -0.26 -0.56 1.91 1.52 1.07 1.11 -1.61 0.12 -1.62 -1.73 0.12 -0.24 -0.47 -0.91 0.68 -0.2 0.71 1.07 0.69 0.35 -1.53 -1.12 0.73 -0.66 0.04 -0.8 -0.74 -0.7 0.15 -0.52 -0.23 -0.62 -1.29 -0.73 0.18 -0.1 -1.03 -0.33 -0.33 -0.47 0.0 -0.44 -0.47 -0.18 -0.49 -0.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.