Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.36 4.64 1.38 1.88 -0.65 - 0.66 - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - -3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.92 - - -0.49 - - - - -0.18 - - - 0.64 -1.54 - 3.48 - - - - - - - - 2.75 - - 0.08 -0.21 - 0.33 - - - - - 1.04 1.17 2.01 - - - - - - - -
1.54 4.3 2.02 2.32 -1.32 - -0.82 - 1.58 - - - - - - - 3.08 -1.23 - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.93 2.01 - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.57 0.98 1.24 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.8 0.68 2.05 - - - - -0.98 - - - - - - 3.18 1.54 -0.34 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 - - - - - - - - - - - - - - 1.5 - - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.74 - 0.36 0.46 - - - - -1.32 - - - - -4.5 - 2.67 2.52 - - - - - 1.27 -0.28 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.17 4.28 2.33 -0.22 -0.87 -1.32 0.4 0.56 -1.81 -1.31 - - - - -3.73 2.83 1.18 -2.17 -4.77 -2.01 - - - -2.94 - 2.52 -3.02 - - -3.63 -2.67 -3.22 -3.36 - - - - -3.19 - -2.68 -2.69 - -2.77 - - -3.22 -1.84 -
- 5.06 2.06 - - - - 1.78 - - - - - - - - 1.58 - - 0.58 - - - - - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.66 4.69 1.71 1.98 0.33 - - - - - - - - - - 0.21 1.13 - - - - - - 0.07 -1.21 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.66 4.69 1.71 1.98 0.33 - - - - - - - - - - 0.21 1.13 - - - - - - 0.07 -1.21 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.49 4.33 -0.6 2.22 1.76 -1.32 -0.86 - -1.18 - -2.07 - - - -1.34 - -1.97 -2.65 -0.82 - - - 1.96 - - -0.9 -0.82 - -0.65 -1.15 -0.57 -1.17 - -1.3 - -0.35 - -0.54 -0.4 - 0.02 -0.73 0.04 0.71 -2.32 - - 0.24
- 4.07 3.32 0.74 3.04 - - - - - - - - - - - 2.1 - - - - - - -0.52 -0.89 2.43 -1.38 - - -4.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.86 1.89 - -0.18 0.56 - - - -1.36 - -0.36 - 0.39 -3.19 - 2.42 -0.78 - 0.06 - - - 0.06 0.01 - - - - - - - - - - - - 0.34 - - - - - - - - - -
- 4.64 -0.71 1.75 -1.22 - - - 1.13 - - - - - - 0.48 3.36 - - - - - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.81 2.6 - - - - - - - - - - - - 3.67 - - - - - - - - - 0.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.1 1.52 - - - - - - -1.6 - - -3.13 - -7.04 1.99 1.72 - - - - - - -2.24 - -0.35 - - -0.76 -3.45 - - -3.68 -1.4 - -2.83 -0.94 - - - - - -2.32 - - - - -4.41
- 4.53 - 1.57 - - - - 0.58 - - - - - - 2.68 2.75 -1.02 - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.81 2.48 - - - - - - - 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.02 - 1.06 - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.71 0.53 - - - - - - - - - - - - 2.84 2.88 0.54 - - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.74 4.79 1.52 2.62 - - - - - - - - 0.53 - - - 1.68 - - - - - - - - 0.64 -0.65 - - - - - - - - - - 1.47 - - - - - - - - - -
- 4.78 - 3.34 - - - - - - - - - - - - 2.14 - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.72 - - - - - - 1.77 - - - - - -2.51 2.47 3.42 - - - - - - - - 0.88 - - - -3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.99 2.82 - - - - - 1.91 - - - - - - - 1.45 -0.66 - - - - - - - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.76 2.74 2.84 1.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.99 2.25 2.57 - - 1.51 - - - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.44 2.75 2.45 1.62 - - - - - - - - - - - 2.41 2.44 - - - - - 1.6 - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.02 2.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.93 0.04 0.0 -4.68 - - - - - - - - - -7.72 2.97 1.85 -1.97 - - - - - - - 1.93 - - - -6.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.93 0.04 0.0 -4.68 - - - - - - - - - -7.72 2.97 1.85 -1.97 - - - - - - - 1.93 - - - -6.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.48 2.93 0.91 - - 0.4 - - -0.54 1.78 2.07 - - -0.15 - 3.17 - - - - - - - - 2.88 - - - -1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.92 - - -0.24 - - - - -1.09 - - - - - - 3.08 0.76 - - - - - 0.33 - 1.84 - - -0.67 - - -0.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.46 3.27 0.3 - - - - 0.82 - - - - - -3.55 3.46 2.48 - - - - - - - - 2.72 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.06 2.09 - - - - - - - - - - - - 1.11 1.78 - - - - - - -0.48 - 2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.2 - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.62 - -0.65 - - - - - - - - - - - 2.54 2.97 - - - - - - - 0.71 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.32 3.33 - 0.33 - - - - 0.71 - - 2.44 - - - 1.42 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.27 - - - 3.28 - - - - - - - 1.29 - -
- 4.78 - 2.52 - - - - - - - - - - -3.44 - 2.61 -0.78 - - - - - -0.42 - 2.84 - - - -3.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.09 3.09 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.02 1.32 1.34 -1.06 1.66 - - - - - - - - - - 0.37 0.91 - - - - - - 0.2 0.23 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.41 - - - - -
- 5.03 - 3.42 - - - - - - - - - - - 0.63 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.61 - - - - - - - - - - - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.33 2.05 -1.67 -1.96 - -1.68 - - - - - - - - -1.21 -0.54 - - -1.78 - - - -2.67 - 0.12 - - - -6.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.12 - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.88 1.55 1.98 0.15 - - - 1.03 - - - - - -2.87 - 3.39 - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.59 4.71 - 0.97 - - - - - - - - - - - 0.31 3.61 - - - - - - -0.15 - 2.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 0.11 - - - - - - - - - - - - 3.0 1.17 - - - - - - - - 0.71 - - - -1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.82 0.81 -0.05 -0.7 - - - - - - - - - - 2.0 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.98 1.3 1.41 - 0.32 0.91 - - - - - - - -2.87 - 0.82 - - - - 0.71 - - - 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.62 1.41 - -3.39 -0.43 1.01 -0.84 - -2.77 -2.3 -1.01 - - -2.83 - 1.6 -2.88 - - - - - -2.04 -2.01 1.33 - 0.09 -1.0 -1.54 -1.98 - -0.21 -0.82 -1.22 -0.04 - -0.72 -0.63 -2.4 - - - 0.99 - -1.31 0.05 -2.05
- 4.26 1.68 - -2.3 - - 0.13 - -1.93 -0.19 0.41 -0.64 - -3.12 -0.61 2.45 - - 1.04 1.11 -1.2 - -0.75 0.14 1.54 -0.6 - 0.45 -2.6 - - - - -1.5 - - 0.05 - -0.82 - -1.0 - -0.39 -1.57 - - -
- 4.67 4.08 - - - - - - 0.51 - - - - -1.93 - - - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.82 1.65 - 0.25 - - - - - - - - - - - 2.29 - - - - - - - - 3.04 - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.85 4.67 0.29 -1.93 0.77 - - - - - - - - - -1.58 3.13 2.12 0.48 - -0.59 - - - - - 0.97 - - - -3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - 0.32 - - - - - - - - - - -3.36 2.95 1.9 - - - - - - 0.9 - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.28 4.72 0.62 -0.91 - - - - 0.14 - - - - - - 2.07 2.81 -2.8 - - - - - -2.1 - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - - - - - - 0.11 - - - - - -4.26 2.78 2.11 - - - - - - - - 2.08 - - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.4 2.01 0.71 0.3 - 0.58 - - - - - - - -4.84 1.58 2.24 0.7 2.79 1.77 - 0.41 - - -1.1 2.78 - - - -4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.52 -
- 4.56 - - - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.75 2.81 2.01 -1.34 0.18 - 2.27 - -3.8 - -2.8 - - - - -0.17 -1.22 - -2.08 - - - -2.38 - 0.37 - - - -4.74 - -2.67 - - -2.85 - - - - - - - - - - - - -3.49
- 4.95 1.21 - -3.96 - - - - - - - - - -5.33 3.46 1.03 - - - - - - -2.29 - 0.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.54 2.71 2.38 -0.03 -0.79 -0.35 -0.26 0.02 1.67 -1.34 -0.67 - -2.84 - -1.18 0.47 2.37 0.45 - -3.26 -1.38 -2.19 -0.29 2.47 0.01 1.81 -1.55 -3.25 -2.35 -1.13 -1.62 -0.8 -1.78 -1.08 -3.73 -1.07 -0.82 -1.23 -2.58 -2.62 - - -2.25 -3.8 -2.18 -1.09 -2.17 -1.14
- 4.6 - 1.05 - - - - - - - - - - - - 3.43 0.8 - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.67 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - 3.45 - - - - - - - - - -
- 4.76 - - - - - - - - - - - - -1.52 - 3.33 1.63 - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.61 4.59 -2.12 1.71 -0.2 - -0.54 -1.33 0.13 0.41 - - -0.99 -2.51 -1.92 - 1.99 -0.53 - - - - - - -2.58 2.99 - - - -1.33 -0.72 - - - - - - -1.6 - -1.55 - - -2.79 - - - -2.59 -2.66
- 5.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.23 - 2.48 - - - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.0 4.37 -0.53 0.8 1.18 -0.02 - - - - - - - - -4.11 2.72 2.57 -1.58 - - - - - - - 2.94 -0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.5 4.2 1.54 1.79 -3.14 - -3.87 - -0.46 - - - - - -4.36 2.37 2.91 -0.5 -3.87 - - - - -2.5 - 2.55 - - - -5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.39 2.99 - -0.56 - - - - - 0.55 - - - -3.95 - 2.94 - - - - - - - - 2.73 - 0.69 0.36 -1.6 - - -0.13 - 0.24 - - 0.6 - - 1.92 - 0.41 - - - - 0.09
1.57 4.62 3.39 - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - 1.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.4 3.39 - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - -1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.17 4.99 2.98 1.83 - - - - - - - - - - -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 2.29 0.78 - 0.7 - - - - - - - - - - 0.41 - - 1.08 - - - - - - - - - - - -0.23 - - - - - - - - - - - - - -0.06 - -
- 4.86 1.97 -0.29 -2.32 -1.37 -0.51 0.02 - - - - - - - -0.13 2.65 - - - - - - -1.77 - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.48 2.44 0.67 1.17 - - - - - - - - - -5.59 3.0 1.78 - - - - - - - - 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.27 - -0.48 -2.64 - -0.06 -2.28 -1.17 - 2.32 2.08 - - -5.13 - 2.65 0.1 - - - - - - 1.13 2.35 0.75 - - -2.86 - - - - - - - -2.11 - - - -2.48 - - - - - -
0.08 3.98 1.74 1.57 -3.41 - -4.47 - 2.3 - - - - - -4.66 2.92 2.74 -0.68 - - - - - -1.04 - 2.14 - - - -5.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.42
- 4.2 2.0 - 2.02 - 2.68 - 1.82 - - - - - -1.32 - 3.37 - - - - - - - - - - - - -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.85 0.71 0.32 -0.93 - - - - - - - - - -3.75 3.64 0.59 - - - - - - - - 0.73 - - - -5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.62 4.73 1.8 - - 1.48 - - - - - - - - - - 2.45 - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.6 - - -
- 5.0 4.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.69 - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - 2.25 - 2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.41 4.48 0.44 0.65 -0.79 - - - 0.95 - - - - - - 2.19 2.68 - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 1.36 - - - - - 0.84 - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.61 - -0.11 - - - 0.34 - -0.67 - -0.81 - - -2.7 1.48 -0.48 -2.06 - - - - - - -1.86 3.97 -1.75 - - -3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.08 - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.01 2.2 - - - - - - - - - - - -1.21 - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.65 - 3.23 - - - - - - - - - - - -0.05 3.15 - - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.73 4.28 0.03 2.46 - - -1.51 - - - 1.96 2.26 - - -6.85 1.87 2.22 -3.31 - - - - - -2.14 - 2.0 - - - - - -1.9 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.1 2.36 1.21 - - - - - - - - - - -2.62 - 3.69 - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.82 0.12 - - - - - - - - - - - - -0.22 0.62 -1.92 - - - - - -1.81 - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.