Heatmap: Cluster_236 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- -2.88 -3.06 -1.44 -1.02 0.96 0.37 0.26 -1.33 1.04 -1.46 -1.83 0.15 -2.6 0.81 - -2.47 -1.74 -3.76 -0.7 -2.17 0.51 - -1.61 1.58 -2.45 0.57 1.2 1.02 0.09 1.41 0.82 0.81 0.28 1.53 2.02 1.63 -1.65 -1.7 -0.73 -1.46 -2.9 -0.57 -0.66 -1.36 -1.62 -0.31 0.2
-3.65 -2.16 -1.53 -2.14 0.77 0.98 0.17 0.25 -2.73 0.68 -2.03 -1.98 0.13 -1.09 1.1 -5.86 -3.68 -2.44 -2.23 -1.86 -1.68 -2.04 -3.79 -2.18 -0.64 -1.69 1.18 0.33 0.54 0.13 1.47 -1.44 1.55 0.93 1.45 2.25 1.78 -0.67 0.01 -0.75 -4.52 -5.38 -1.87 -0.22 0.55 -0.82 0.08 0.18
-1.53 -1.43 -0.33 -2.25 0.56 0.86 1.41 1.35 -1.35 0.22 0.86 0.9 -0.28 -1.76 -0.17 -2.0 -0.14 -0.79 0.29 0.36 0.38 0.22 -1.03 -1.58 0.45 -0.43 0.85 0.42 -0.1 -0.16 0.18 0.42 0.14 -0.04 -0.57 0.37 0.22 -0.2 -1.05 -0.57 -1.1 -1.43 -0.32 -0.09 -0.57 -0.35 0.23 0.05
-3.29 -1.0 -0.7 -1.48 0.63 1.2 0.83 0.93 -2.76 0.3 0.55 0.54 -0.35 -1.89 0.27 -1.62 -0.73 -0.66 -0.07 0.24 0.05 -0.13 -1.47 -0.39 0.65 -0.53 1.01 0.45 -0.04 0.22 0.29 0.73 0.2 0.18 -0.66 0.38 0.46 0.02 -0.69 -0.25 -0.85 -0.99 -0.39 -0.03 -0.44 -0.07 0.08 0.38
-0.18 -0.97 -0.63 1.06 0.96 1.23 1.64 1.3 -0.1 0.23 -3.41 -3.51 -0.02 -0.73 0.04 -1.52 -2.29 -0.7 -0.97 -0.85 -0.99 -1.11 -3.22 -0.37 0.35 -0.75 -0.36 0.9 0.25 0.08 0.66 0.48 0.09 0.03 -0.03 0.85 0.69 -0.01 -0.59 -0.43 -1.04 -1.11 -0.4 -0.33 -0.43 -0.1 0.38 -0.14
-0.92 -1.34 -0.38 -0.56 0.85 0.83 1.05 0.98 -1.05 0.43 0.24 0.29 -0.41 -2.3 0.16 -1.55 -1.34 -1.06 -0.43 0.01 0.08 -0.35 -2.59 -0.08 0.55 -0.85 0.55 0.59 0.4 0.09 0.34 0.66 0.32 0.13 -0.71 0.53 0.52 0.11 -0.79 -0.31 -1.08 -1.53 -0.06 0.28 -0.23 0.09 0.39 0.04
-0.0 -0.83 -0.31 -2.93 -0.68 0.88 1.06 1.08 -0.64 0.43 -0.14 -0.38 -0.73 -2.53 0.15 -1.45 -0.73 -0.79 0.07 0.51 0.62 0.22 -0.06 -1.97 0.73 -0.91 0.83 0.5 0.01 0.1 0.6 0.73 0.3 -0.03 -0.87 0.57 0.69 -0.11 -1.36 -0.63 -1.28 -1.71 -0.11 0.2 -0.73 -0.17 0.54 0.22
-1.78 -2.14 -1.31 -1.61 0.8 0.72 0.46 0.39 -1.92 0.25 -0.24 -0.21 -0.14 -1.5 0.37 -1.82 -1.38 -0.67 -0.46 -0.32 -0.03 -0.29 -1.78 -0.28 0.78 -1.12 0.59 0.65 -0.66 0.25 0.43 0.39 0.42 0.31 1.65 1.44 0.48 -0.26 -0.48 -0.54 -1.08 -1.34 -0.28 0.46 -0.2 -0.35 0.7 0.09
-0.61 -3.31 -0.71 -0.93 0.97 0.82 0.69 0.61 -3.78 0.72 -0.41 -0.45 0.09 -1.41 0.39 -4.92 -1.1 -1.29 -0.59 0.26 0.25 0.07 -3.61 -0.45 0.84 -1.04 0.83 0.63 0.34 0.28 0.7 0.7 0.32 -0.12 0.02 0.75 0.84 0.51 -0.91 -0.5 -0.69 -1.12 -0.24 -0.25 -1.01 0.2 0.16 0.37
-0.87 0.11 0.48 -2.5 0.13 0.66 1.41 1.5 -1.15 0.34 0.57 0.31 0.33 -0.47 -0.12 -1.31 -0.68 -1.08 -0.92 -0.21 -0.55 -0.85 -2.59 -2.6 -0.25 -0.67 0.25 0.5 0.13 -0.13 0.72 0.66 0.04 -0.02 0.68 0.62 0.69 0.39 -0.8 -0.53 -0.97 -1.05 -0.68 -0.51 -0.61 0.26 0.15 -0.14
-1.33 -1.33 0.14 -2.05 -0.21 -0.31 0.2 0.51 -0.81 0.66 -0.08 0.01 -0.17 -0.56 0.55 -1.63 -1.11 -1.06 -0.35 -0.16 -0.21 -0.27 -2.27 -1.95 -0.62 -1.35 -0.8 1.16 0.55 0.65 0.69 0.34 0.56 0.67 -0.24 1.06 0.43 0.2 0.15 -0.0 -1.0 -0.78 -0.28 0.69 0.07 0.07 1.25 0.06
-1.62 -1.17 -1.05 -3.3 0.14 0.65 0.93 0.76 -1.19 0.03 0.32 0.41 -0.43 -1.22 0.46 -2.69 -1.77 -1.11 -0.15 0.1 0.19 0.08 -0.9 0.0 0.6 -1.35 1.02 0.79 0.01 0.17 0.58 0.74 0.45 -0.08 0.23 0.77 0.7 -0.22 -0.95 -0.37 -0.78 -1.46 0.01 0.04 -0.36 -0.23 0.13 0.64
-0.43 -0.82 0.1 -2.21 0.79 1.2 1.53 1.49 -0.33 0.05 0.08 0.04 -1.36 -2.96 0.27 -1.63 -0.85 -1.08 0.34 0.8 0.29 -0.07 -0.28 -0.65 0.33 -1.55 0.7 0.61 -0.45 0.1 0.39 0.47 -0.0 -0.43 -1.25 1.0 -0.13 -0.41 -1.41 -0.88 -1.6 -2.13 -0.53 -0.08 -1.31 -0.48 0.55 0.33
-1.71 -1.47 -2.37 -2.29 -0.62 0.8 1.31 1.67 -1.83 0.59 -1.37 -1.46 -1.0 -1.7 0.62 -1.73 -1.91 -2.14 -0.84 -0.32 -0.33 -0.31 -1.59 -3.25 0.82 -1.16 1.65 1.01 0.93 0.02 1.17 0.21 0.61 0.34 0.01 0.9 1.01 -0.2 -1.07 -0.64 -0.98 -1.0 -0.17 0.04 -0.67 -0.25 0.29 -0.22
-2.16 -2.03 -2.01 -2.71 -0.38 0.78 1.53 1.5 -1.99 0.68 -0.2 -0.33 -0.85 -1.35 0.53 -1.97 -2.22 -2.3 -1.48 -0.81 -0.59 -0.49 -1.21 -0.54 0.68 -1.49 0.91 0.41 0.82 -0.09 1.03 0.69 0.5 0.26 1.59 0.81 0.89 -0.2 -0.97 -0.71 -0.89 -1.18 -0.21 -0.3 -0.72 -0.29 0.27 -0.17
-0.51 -1.33 -1.02 -1.64 0.45 0.91 1.54 1.52 -0.08 0.35 0.12 0.08 -1.08 -2.65 0.3 -1.37 -1.59 -1.24 -0.24 0.22 0.33 0.02 -1.22 -1.03 0.89 -0.54 1.14 0.19 -0.24 -0.03 0.38 0.79 0.15 -0.23 -1.12 0.09 0.47 0.29 -1.56 -0.87 -1.4 -1.89 -0.34 -0.07 -0.41 0.21 0.39 0.21
-1.39 -1.18 -0.72 -3.55 0.01 1.29 1.57 1.41 -0.51 0.24 0.29 0.07 -1.64 -3.93 0.11 -2.75 -0.17 -1.17 0.83 0.75 0.76 0.61 0.14 -2.33 1.09 -1.04 0.93 0.62 -0.91 -0.06 -0.02 0.74 -0.03 -0.23 -0.39 0.52 0.03 -0.41 -1.81 -1.32 -2.08 -2.88 -0.46 -0.17 -1.36 -0.42 0.57 0.04
-1.18 -0.78 0.35 0.83 1.5 1.91 1.19 1.36 -0.53 0.1 -0.14 -0.22 -1.49 -4.14 0.18 -2.02 -0.2 -0.68 -0.11 -0.04 -0.2 -0.25 -1.56 0.71 -0.06 -0.44 0.29 0.03 -0.59 0.14 0.37 1.22 -0.03 -0.49 -1.13 0.42 0.46 -0.31 -2.43 -1.84 -2.52 -3.51 -1.13 -0.64 -2.03 -0.33 0.04 0.22
-1.27 -0.98 -0.75 0.31 0.61 1.35 1.3 1.3 -0.98 0.16 -1.6 -1.67 0.12 -0.13 -0.11 -0.41 -0.01 -0.32 -0.05 0.14 0.17 0.19 -2.65 -0.68 0.52 -0.34 -0.11 0.22 0.03 -0.26 0.27 -0.42 -0.03 0.05 0.34 0.65 0.16 0.12 -0.51 -0.44 -0.18 -0.16 -0.37 -0.48 -0.56 0.14 -0.22 -0.25
-1.08 -0.68 0.18 -0.3 0.23 0.86 1.46 1.28 0.06 0.38 -0.28 -0.27 -1.05 -3.24 0.1 -0.34 -0.51 -0.74 0.39 0.24 0.21 -0.06 -0.29 -0.23 0.46 -0.7 0.35 0.6 -0.0 0.08 0.65 0.48 0.04 -0.16 -0.34 0.54 0.34 0.06 -1.53 -1.32 -2.02 -2.48 -0.98 -0.37 -1.53 -0.04 0.61 0.22
-0.51 -1.18 -0.63 -1.79 0.55 0.75 1.16 0.84 -0.98 0.57 0.15 -0.07 -0.11 -1.38 0.39 -1.32 -1.49 -1.64 -0.47 -0.27 -0.35 -0.57 -2.52 -3.06 0.41 -0.6 0.49 0.64 0.14 0.05 0.6 0.73 0.33 0.17 1.16 1.28 0.47 -0.1 -0.61 -0.65 -1.31 -1.77 -0.5 0.2 -0.37 -0.14 0.76 -0.23
-0.95 -0.77 -1.04 -3.42 -0.17 0.52 1.28 0.89 -0.77 0.89 -0.41 -0.5 0.34 -1.66 0.72 -1.83 -2.07 -1.56 -1.05 -0.85 -0.73 -0.96 -3.3 -3.37 0.49 -2.07 1.5 0.93 0.79 -0.08 0.88 0.67 0.51 -0.06 1.11 1.86 1.0 -0.18 -1.1 -1.12 -2.83 -3.11 -0.59 -0.58 -0.87 -0.27 0.04 -0.13
-0.79 -0.96 -0.45 -0.94 -0.03 0.43 1.14 0.98 -0.21 0.49 0.45 0.52 -0.51 -1.49 0.55 -1.59 -1.52 -1.08 -0.49 -0.12 -0.01 -0.21 -1.66 -0.94 0.86 -0.92 0.76 0.47 0.06 0.05 0.7 0.25 0.31 0.04 0.61 0.55 0.32 -0.06 -1.01 -0.27 -0.54 -0.85 -0.09 -0.1 -0.41 -0.13 0.29 -0.06
-0.36 -0.94 -0.08 0.39 1.07 0.8 1.6 1.11 0.19 0.48 -0.55 -0.49 0.26 -0.61 -0.01 -0.85 -1.26 -0.77 0.16 -0.1 0.28 0.23 -2.69 0.37 0.89 -1.11 0.29 0.1 -0.17 -0.54 0.49 -0.46 -0.01 -0.09 -0.5 0.66 0.14 0.16 -0.94 -0.98 -1.3 -1.36 -0.6 -0.62 -0.89 0.21 -0.2 -0.37
-2.34 -1.46 -1.55 -1.63 -1.39 0.12 0.85 0.71 -1.37 0.26 0.56 0.41 -0.4 -1.1 0.13 -1.48 -1.68 -1.91 -0.2 0.12 0.31 -0.22 -1.03 -2.97 0.82 -1.51 1.6 0.66 0.61 0.15 0.3 0.44 0.4 0.29 0.27 0.69 0.19 -0.3 -0.24 -0.03 -0.15 -0.61 0.17 0.1 -0.16 -0.2 0.52 0.6
-1.45 -1.22 -0.71 -3.06 -0.3 1.26 1.38 1.49 -1.15 0.3 -0.77 -0.69 -0.06 -1.24 0.5 -1.45 -0.91 -0.72 -0.26 0.19 -0.32 0.04 -0.78 0.01 1.07 -0.68 1.14 0.51 -0.68 -0.33 0.58 -0.13 0.06 -0.08 1.29 0.67 0.46 -0.01 -1.11 -0.69 -0.98 -1.53 -0.52 -0.51 -1.05 -0.12 -0.11 0.01
-1.49 -1.78 -1.22 -0.04 -1.23 1.47 1.75 1.59 -1.05 0.46 -0.52 -0.4 -0.56 -1.69 0.54 -3.41 -1.18 -0.74 - -2.19 -1.49 -1.03 -2.48 -1.31 0.82 -0.5 0.4 0.4 0.67 0.27 1.24 0.43 0.54 0.14 1.28 1.7 1.0 -1.12 -2.36 -1.04 -1.47 -0.96 -0.84 -1.39 -1.7 -0.89 0.25 0.03
-0.87 -1.02 -0.16 -2.63 -0.19 0.43 1.08 0.85 -0.32 0.65 -0.42 -0.45 0.1 -0.47 0.09 -1.12 -0.55 -0.9 -1.02 -0.05 -0.21 -0.13 -0.53 -0.27 0.72 -0.73 0.73 0.6 0.62 -0.07 0.82 0.44 0.43 0.08 0.41 0.78 0.71 -0.56 -0.91 -0.36 -0.37 -0.5 0.02 -0.44 -0.44 -0.58 -0.16 -0.04
-0.76 -0.14 0.57 0.52 0.48 1.19 1.61 1.64 -0.76 0.28 -2.41 -2.65 -0.37 -0.94 -0.22 -0.45 -0.22 -0.21 -0.31 0.27 0.14 -0.02 -2.42 -0.66 0.37 -1.18 -0.5 0.68 -0.49 -0.23 0.65 -0.17 0.12 0.02 -0.32 0.8 0.32 0.09 -0.84 -0.57 -1.12 -1.22 -0.58 -0.41 -0.6 -0.04 0.28 -0.64
-0.87 -0.52 -0.24 -4.03 -0.47 0.54 1.6 1.5 -1.03 0.4 0.86 0.93 -0.37 -1.56 -0.36 -1.77 -0.75 -1.28 0.32 0.3 0.42 -0.09 -0.39 -2.14 0.48 -1.37 0.78 0.04 -0.49 -0.27 -0.34 0.77 0.12 -0.19 0.13 0.31 0.0 -0.03 -0.94 0.0 -0.32 -0.76 0.09 -0.11 -0.71 0.01 0.12 -0.21
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-1.04 -0.18 -0.08 0.4 1.5 1.39 1.61 1.26 -0.68 0.01 -1.46 -1.33 -0.14 -0.71 -0.39 -0.61 -0.4 0.36 -0.07 0.35 0.1 0.04 -1.16 -1.32 1.16 0.28 0.22 0.05 -0.96 -0.31 0.16 -1.31 -0.67 -0.19 0.55 -0.0 -0.34 -0.09 -0.92 -0.85 -0.59 -0.98 -0.55 -0.95 -1.23 0.09 -0.32 -0.01
-1.91 -0.87 -0.64 1.28 1.2 1.58 1.83 1.77 0.19 0.55 -3.49 -4.11 0.21 -0.2 -0.14 -1.95 -0.99 -0.39 -0.05 -0.35 -1.41 -0.99 -1.43 -1.86 0.28 -0.26 -0.53 0.19 -0.28 -0.01 0.44 -1.08 0.53 0.84 -0.63 0.19 0.67 0.81 -1.24 -1.37 -2.56 -2.44 -1.48 -1.35 -0.52 0.65 -0.47 -0.83
-3.09 -2.17 -1.48 -3.22 -0.84 -0.2 0.1 -0.52 -1.01 0.93 -1.2 -0.89 -0.02 -1.65 0.93 -2.82 -1.87 -0.41 -0.59 -0.41 -0.53 -0.05 -3.79 -0.86 0.59 -1.17 -0.78 1.35 -0.03 0.5 1.27 1.1 0.55 0.59 1.92 1.81 0.96 -0.04 -0.37 -0.85 -4.35 -4.53 -1.05 -0.01 -0.52 -0.15 1.03 -0.29
-1.37 -1.25 -3.29 -3.95 -2.13 -0.63 0.67 0.76 -1.02 0.92 -0.48 -0.36 -0.47 -1.85 1.19 -2.06 -2.36 -2.21 -1.18 -1.12 -0.63 -1.22 -4.43 0.77 -0.38 -1.07 -0.54 1.19 -0.68 0.5 0.73 0.73 0.84 0.61 0.41 2.07 0.55 0.48 -0.37 -0.93 -2.99 -3.6 -1.07 0.49 0.14 0.36 1.55 0.43
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-0.95 0.02 0.68 1.04 1.27 1.29 1.21 0.81 -0.38 0.35 -1.53 -1.94 -0.62 -2.26 0.14 -2.36 -1.44 0.04 -0.67 -1.13 -0.59 0.09 -4.8 -0.1 0.21 -0.86 0.24 0.73 -0.24 -0.11 0.56 0.82 0.15 0.21 -1.12 0.67 0.79 0.29 -0.74 -0.81 -1.31 -1.91 -0.85 -0.17 -0.62 0.31 0.13 -0.29
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-0.41 0.06 0.09 -0.83 0.74 0.45 1.32 1.43 0.32 0.51 0.23 -0.23 -1.86 -2.72 0.41 -1.88 -0.71 -0.71 0.17 0.26 0.32 0.16 -1.17 -0.68 0.72 -0.62 0.73 0.23 -0.03 -0.03 0.41 0.63 0.15 -0.73 -0.42 0.47 0.49 -0.03 -2.21 -1.3 -1.58 -1.54 -0.76 -0.13 -1.4 -0.13 0.25 0.23
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.