Heatmap: Cluster_235 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.08 0.06 0.3 0.01 0.5 0.23 0.21 0.14 0.09 0.1 0.0 0.0 0.06 0.03 0.16 0.06 0.33 0.03 1.0 0.73 0.54 0.47 0.81 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.12 0.04 0.1 0.03 0.1 0.05 0.06 0.14 0.21 0.12 0.08 0.02 0.0 0.0 0.06 0.04 0.05 0.12 0.06 0.07
0.0 0.06 1.0 0.1 0.34 0.17 0.35 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.03 0.64 0.25 0.27 0.31 0.77 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.52 0.0 0.18 0.25 0.24 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.4 0.03 1.0 0.26 0.39 0.44 0.48 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.12 1.0 0.03 0.13 0.42 0.36 0.39 0.23 0.09 0.0 0.0 0.09 0.06 0.04 0.19 0.2 0.18 0.45 0.27 0.49 0.33 0.53 0.06 0.07 0.05 0.0 0.02 0.01 0.03 0.05 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.16 0.01 0.02 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.12 0.01 0.03
0.16 0.26 1.0 0.03 0.05 0.43 0.5 0.22 0.14 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.16 0.29 0.01 0.09 0.08 0.11 0.04 0.7 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.04 0.01 0.0 0.08 0.0 0.02 0.12 0.06 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0
0.0 0.11 0.47 0.07 0.02 0.06 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.03 1.0 0.14 0.18 0.3 0.02 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.23 1.0 0.4 0.08 0.21 0.16 0.21 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.12 0.17 0.13 0.13 0.15 0.47 0.05 0.3 0.16 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.17 0.33 0.03 0.81 0.19 0.2 0.19 0.13 0.11 0.01 0.01 0.07 0.03 0.13 0.19 0.18 0.01 0.41 0.55 0.56 0.24 1.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.15 0.12 0.14 0.21 0.07 0.16 0.13 0.14 0.1 0.16 0.2 0.14 0.22 0.07 0.06 0.25 0.2 0.16 0.19 0.21 0.17
0.27 0.44 0.52 0.45 0.68 0.46 0.57 0.44 0.36 0.42 0.19 0.2 0.44 0.35 0.36 0.3 0.55 0.39 0.82 1.0 0.88 0.9 0.14 0.22 0.45 0.34 0.3 0.25 0.28 0.27 0.28 0.28 0.32 0.32 0.23 0.23 0.35 0.46 0.17 0.31 0.29 0.29 0.33 0.29 0.28 0.46 0.21 0.24
0.0 0.52 1.0 0.09 0.04 0.26 0.42 0.56 0.28 0.03 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.16 0.25 0.31 0.58 0.19 0.13 0.34 0.47 0.04 0.02 0.01 0.09 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.04 0.03 0.01
0.0 0.27 1.0 0.0 0.08 0.21 0.08 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 1.0 0.34 0.16 0.34 0.45 0.36 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01 0.01 0.35 0.12 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.06 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.45 0.61 1.0 0.27 0.19 0.2 0.19 0.19 0.41 0.25 0.1 0.09 0.27 0.17 0.17 0.34 0.94 0.91 0.93 0.91 1.0 0.83 0.75 0.66 0.62 0.27 0.53 0.19 0.17 0.22 0.23 0.23 0.2 0.22 0.13 0.14 0.17 0.4 0.12 0.26 0.19 0.2 0.31 0.25 0.17 0.41 0.24 0.2
0.12 0.25 0.5 0.24 1.0 0.52 0.42 0.53 0.19 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.2 0.4 0.26 0.74 0.55 0.55 0.81 0.54 0.55 0.36 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.01 0.11 0.05 0.01 0.03 0.04 0.0
0.13 0.13 0.21 0.02 1.0 0.37 0.31 0.26 0.13 0.14 0.01 0.01 0.09 0.03 0.21 0.2 0.22 0.01 0.65 0.91 0.88 0.43 0.74 0.01 0.09 0.02 0.01 0.3 0.12 0.12 0.21 0.04 0.15 0.16 0.23 0.13 0.19 0.08 0.13 0.21 0.03 0.03 0.33 0.2 0.13 0.08 0.17 0.13
0.18 0.31 0.7 0.11 0.13 0.1 0.17 0.22 0.23 0.07 0.02 0.03 0.11 0.06 0.08 0.24 1.0 0.63 0.89 0.98 0.96 0.55 0.29 0.24 0.65 0.1 0.26 0.03 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.05 0.02 0.03 0.02 0.04 0.09 0.03 0.02 0.06 0.02 0.02
0.12 0.24 0.88 0.04 0.75 0.33 0.28 0.26 0.26 0.06 0.37 0.36 0.04 0.02 0.07 0.04 0.62 0.37 1.0 0.79 0.81 0.91 0.78 0.28 0.26 0.02 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01
0.12 0.34 0.59 0.21 0.53 0.34 0.35 0.38 0.14 0.29 0.01 0.01 0.17 0.06 0.19 0.09 0.36 0.26 0.94 1.0 0.58 0.38 0.1 0.13 0.34 0.12 0.21 0.06 0.04 0.08 0.1 0.05 0.09 0.08 0.02 0.04 0.09 0.24 0.03 0.14 0.11 0.08 0.17 0.11 0.06 0.24 0.08 0.05
0.73 0.4 0.82 0.2 0.22 0.19 0.16 0.18 0.35 0.29 0.13 0.14 0.52 0.38 0.35 0.66 1.0 0.44 0.89 0.59 0.57 0.56 0.32 0.33 0.29 0.57 0.18 0.2 0.12 0.23 0.21 0.16 0.2 0.21 0.23 0.23 0.21 0.27 0.15 0.19 0.2 0.2 0.22 0.21 0.18 0.26 0.18 0.21
0.26 0.2 0.12 0.11 1.0 0.75 0.62 0.58 0.22 0.1 0.01 0.01 0.07 0.03 0.06 0.75 0.32 0.14 0.51 0.36 0.47 0.92 0.37 0.2 0.29 0.06 0.06 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.04 0.0 0.01 0.12 0.04 0.02 0.05 0.03 0.0
0.08 0.25 0.81 0.1 0.08 0.64 0.48 0.85 0.52 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.07 0.02 0.4 0.41 0.06 0.0 1.0 0.12 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03
0.52 0.63 0.99 0.4 0.33 0.41 0.38 0.39 0.72 0.23 0.11 0.14 0.25 0.16 0.23 0.42 1.0 0.37 0.84 0.69 0.71 0.6 0.39 0.57 0.26 0.26 0.2 0.24 0.15 0.24 0.18 0.23 0.2 0.22 0.13 0.16 0.2 0.29 0.15 0.23 0.15 0.15 0.25 0.23 0.21 0.31 0.19 0.26
0.24 0.13 0.27 0.06 0.41 0.44 0.24 0.2 0.06 0.23 0.0 0.0 0.12 0.04 0.18 0.04 0.54 0.12 1.0 0.76 0.28 0.17 0.02 0.11 0.52 0.07 0.05 0.01 0.01 0.03 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.01 0.05 0.12 0.02 0.09 0.01 0.03 0.18 0.06 0.02 0.11 0.03 0.01
0.02 0.09 0.32 0.01 0.22 0.19 0.16 0.13 0.03 0.13 0.01 0.01 0.07 0.02 0.09 0.11 0.24 0.13 1.0 0.5 0.19 0.09 0.04 0.07 0.29 0.04 0.07 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.03 0.1 0.01 0.06 0.01 0.02 0.08 0.03 0.02 0.1 0.02 0.03
0.11 0.11 0.57 0.0 0.03 0.04 0.03 0.07 0.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.14 0.16 1.0 0.13 0.12 0.15 0.25 0.0 0.16 0.43 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.12 0.5 0.2 0.0 0.12 0.71 0.21 0.0 0.04 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.2 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.06
0.18 0.26 0.98 0.13 0.3 0.53 0.46 0.4 0.2 0.17 0.01 0.0 0.1 0.05 0.09 0.01 1.0 0.72 0.85 0.91 0.84 0.56 0.34 0.39 0.53 0.09 0.17 0.21 0.04 0.09 0.09 0.04 0.08 0.14 0.08 0.04 0.1 0.27 0.05 0.08 0.04 0.12 0.11 0.11 0.06 0.24 0.13 0.05
0.57 0.67 1.0 0.39 0.18 0.46 0.28 0.28 0.92 0.18 0.15 0.15 0.22 0.16 0.23 0.74 0.71 0.51 0.66 0.62 0.63 0.59 0.66 0.22 0.29 0.32 0.19 0.4 0.2 0.3 0.24 0.34 0.24 0.32 0.22 0.21 0.32 0.3 0.21 0.26 0.13 0.14 0.27 0.3 0.23 0.32 0.29 0.32
0.12 0.09 0.41 0.03 0.59 0.2 0.25 0.18 0.14 0.15 0.01 0.0 0.09 0.03 0.13 0.0 0.49 0.1 1.0 0.67 0.43 0.28 0.43 0.12 0.15 0.06 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.01 0.03 0.11 0.04 0.02 0.05 0.05 0.01
0.19 0.37 0.7 0.24 1.0 0.99 0.95 1.0 0.31 0.13 0.0 0.0 0.06 0.01 0.1 0.17 0.58 0.43 0.97 0.51 0.57 0.62 0.46 0.64 0.24 0.02 0.01 0.08 0.02 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.07 0.02 0.03 0.0 0.01 0.09 0.05 0.02 0.07 0.06 0.02
0.13 0.27 0.74 0.14 0.34 0.54 0.36 0.59 0.24 0.07 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.11 0.37 0.33 0.37 1.0 0.77 0.53 0.83 0.43 0.35 0.08 0.02 0.12 0.04 0.06 0.02 0.02 0.04 0.05 0.01 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.02 0.03 0.06 0.04 0.03 0.05 0.07 0.05
0.0 0.24 1.0 0.03 0.12 0.09 0.06 0.09 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.08 0.28 0.1 0.67 0.26 0.36 0.21 0.77 0.07 0.08 0.05 0.0 0.14 0.12 0.07 0.01 0.07 0.1 0.19 0.03 0.09 0.05 0.09 0.1 0.15 0.05 0.08 0.11 0.09 0.2 0.18 0.12 0.09
0.5 0.43 1.0 0.36 0.07 0.59 0.56 0.49 0.71 0.15 0.05 0.06 0.11 0.06 0.09 0.5 0.63 0.47 0.74 0.61 0.6 0.37 0.56 0.18 0.18 0.16 0.04 0.28 0.24 0.2 0.21 0.12 0.15 0.26 0.2 0.12 0.19 0.27 0.13 0.15 0.04 0.06 0.13 0.18 0.14 0.26 0.21 0.14
0.54 0.55 0.83 0.29 0.26 0.37 0.31 0.35 0.65 0.2 0.05 0.04 0.24 0.15 0.15 0.61 1.0 0.37 0.79 0.54 0.55 0.5 0.4 0.53 0.14 0.19 0.06 0.14 0.11 0.14 0.15 0.06 0.12 0.15 0.09 0.1 0.14 0.27 0.08 0.18 0.08 0.1 0.24 0.16 0.11 0.26 0.14 0.12
0.33 0.11 0.34 0.03 0.0 0.16 0.03 0.06 0.59 0.35 0.16 0.07 0.28 0.21 0.15 0.0 0.29 0.65 1.0 0.39 0.14 0.22 0.03 0.22 0.3 0.61 0.26 0.07 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.02 0.06 0.02 0.23 0.02 0.06 0.02 0.02 0.06 0.09 0.01 0.18 0.04 0.01
0.38 0.46 0.62 0.13 0.04 0.1 0.04 0.08 0.49 0.13 0.13 0.16 0.05 0.07 0.02 0.23 0.59 0.05 1.0 0.05 0.0 0.0 0.17 0.27 0.12 0.24 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.06 0.04 0.0 0.07 0.12 0.14 0.0 0.03 0.0 0.02 0.05 0.0 0.05 0.14 0.05 0.03
0.56 0.52 0.68 0.13 0.07 0.21 0.29 0.27 0.45 0.23 0.06 0.07 0.34 0.22 0.22 0.41 1.0 0.47 0.49 0.46 0.42 0.41 0.33 0.47 0.2 0.27 0.09 0.16 0.16 0.19 0.15 0.15 0.17 0.2 0.19 0.17 0.18 0.28 0.14 0.2 0.13 0.14 0.21 0.19 0.18 0.29 0.14 0.16
0.17 0.35 0.88 0.12 0.26 0.35 0.33 0.28 0.47 0.2 0.02 0.03 0.16 0.13 0.17 0.35 1.0 0.68 0.72 0.56 0.57 0.56 0.55 0.59 0.37 0.28 0.35 0.19 0.1 0.22 0.15 0.12 0.21 0.22 0.1 0.16 0.16 0.34 0.15 0.26 0.16 0.21 0.23 0.22 0.2 0.32 0.18 0.19
0.32 0.42 0.73 0.15 0.39 0.4 0.42 0.44 0.45 0.11 0.28 0.33 0.14 0.12 0.08 0.39 0.47 0.3 0.73 0.65 0.54 0.38 1.0 0.3 0.35 0.13 0.41 0.04 0.06 0.09 0.06 0.3 0.05 0.05 0.06 0.04 0.05 0.09 0.03 0.1 0.11 0.08 0.12 0.09 0.07 0.09 0.06 0.1
0.19 0.33 1.0 0.11 0.07 0.26 0.69 0.55 0.74 0.08 0.01 0.0 0.04 0.01 0.1 0.09 0.69 0.21 0.87 0.48 0.37 0.3 0.98 0.05 0.06 0.03 0.01 0.1 0.07 0.02 0.04 0.0 0.07 0.03 0.03 0.11 0.11 0.1 0.03 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.06 0.05 0.01
0.01 0.06 0.63 0.0 0.01 0.09 0.1 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.56 1.0 0.17 0.06 0.18 0.28 0.08 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.29 1.0 0.35 0.15 0.18 0.09 0.47 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.05 0.17 0.24 0.17 0.1 0.04 0.13 0.01 0.08 0.13 0.18 0.07 0.1 0.02 0.04 0.06 0.07 0.03 0.04 0.02 0.05 0.05 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.07 0.04 0.03
0.0 0.47 0.6 0.03 0.02 0.03 0.14 0.02 0.32 0.12 0.0 0.01 0.1 0.07 0.06 0.03 0.42 0.72 1.0 0.43 0.15 0.27 0.14 0.21 0.23 0.23 0.14 0.23 0.04 0.14 0.1 0.28 0.08 0.1 0.03 0.05 0.06 0.15 0.07 0.25 0.17 0.1 0.09 0.23 0.14 0.22 0.16 0.19
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.28 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.82 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.02 0.04 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01
0.11 0.11 0.37 0.03 0.31 0.18 0.22 0.2 0.07 0.09 0.0 0.0 0.04 0.01 0.09 0.03 0.5 0.21 1.0 0.64 0.35 0.4 0.42 0.25 0.32 0.08 0.04 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.25 0.03 0.0
0.23 0.21 1.0 0.04 0.09 0.13 0.27 0.62 0.12 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.28 0.03 0.31 0.1 0.02 0.02 0.23 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.14 0.14 0.3 0.03 0.96 0.78 0.56 0.57 0.3 0.28 0.09 0.08 0.23 0.12 0.26 0.18 0.47 0.08 0.79 0.81 1.0 0.67 0.59 0.03 0.25 0.14 0.14 0.18 0.27 0.16 0.2 0.07 0.26 0.47 0.11 0.11 0.26 0.11 0.19 0.2 0.1 0.09 0.27 0.17 0.26 0.1 0.21 0.16
0.16 0.49 0.72 0.16 1.0 0.38 0.44 0.48 0.44 0.05 0.01 0.01 0.04 0.03 0.05 0.79 0.57 0.14 0.63 0.84 0.72 0.36 0.98 0.52 0.23 0.09 0.13 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.07 0.01 0.02 0.16 0.05 0.02 0.04 0.05 0.01
0.23 0.24 0.38 0.08 1.0 0.48 0.43 0.46 0.32 0.11 0.01 0.01 0.07 0.05 0.16 0.68 0.56 0.05 0.48 0.97 0.82 0.37 0.24 0.05 0.11 0.07 0.03 0.04 0.04 0.11 0.08 0.02 0.1 0.09 0.04 0.02 0.07 0.08 0.06 0.19 0.12 0.13 0.28 0.15 0.11 0.08 0.12 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)