Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-2.25 -1.55 -0.32 -4.97 1.57 -0.27 -0.84 -0.81 -0.47 -0.23 0.19 0.1 -0.34 -0.68 -0.52 -1.62 -0.46 -1.43 0.65 0.49 0.19 -0.19 1.6 -2.5 -0.11 -1.61 0.64 0.16 -1.73 0.02 -0.55 0.31 0.42 0.22 -0.9 0.21 -0.3 0.03 -0.14 0.56 0.19 -0.08 0.7 0.52 0.45 0.09 0.67 0.5
-2.53 -1.39 -0.88 -2.02 -2.25 -0.59 -0.07 -0.03 -1.67 -0.63 -0.38 -0.23 -1.19 -2.14 0.02 -2.32 0.83 -0.69 0.42 0.82 1.43 1.1 2.45 -0.62 1.02 -2.68 0.46 -0.96 -0.41 -0.17 -0.45 -0.53 -0.01 -0.34 1.88 0.07 -1.84 -0.6 -1.54 0.02 -0.52 -0.78 0.25 0.11 -0.12 -0.58 -0.34 0.1
-1.23 -0.86 -0.93 -3.31 1.04 0.39 0.13 0.06 -0.51 0.3 -0.85 -0.8 -0.39 -1.42 0.45 -0.34 -0.04 -1.01 0.9 1.15 1.22 0.66 2.06 -1.96 0.43 -1.52 0.25 -0.51 -0.71 -0.35 -0.08 -0.07 0.12 -0.55 -1.9 -0.21 -0.31 0.01 -1.37 0.24 -0.22 -0.62 0.45 0.01 -0.11 -0.09 -0.26 -0.18
-0.77 -0.52 -1.29 -2.9 0.68 0.65 0.97 0.96 -0.25 -0.08 -0.84 -0.35 -0.54 -0.69 0.23 -1.13 -0.27 -1.2 0.67 0.93 0.68 0.1 1.65 -1.86 0.08 -1.79 -0.03 -0.06 -0.93 -0.2 -0.18 -0.35 0.1 -0.27 -1.08 -0.76 -0.64 0.26 -1.11 0.44 0.44 -0.1 0.61 -0.14 -0.02 0.28 0.07 0.33
-0.41 0.41 0.69 0.48 2.23 1.15 0.58 0.64 -0.33 -1.98 -0.03 0.01 -3.61 -4.46 -2.07 -1.84 1.29 -1.46 0.78 0.95 1.33 1.04 2.88 -5.8 -1.03 -3.93 -3.07 -2.63 -0.1 -1.44 -2.71 -3.64 -1.84 -2.16 2.24 -2.39 -4.07 -1.59 -3.8 -1.69 -3.93 -3.71 -0.98 -1.71 -1.61 -1.52 -1.0 -2.42
-1.06 -0.54 -0.75 -2.13 0.26 -1.05 -1.43 -1.32 -0.41 -0.09 -0.07 0.09 -0.74 -0.63 -0.03 -1.13 0.03 -0.59 0.76 0.91 0.53 0.08 1.49 -2.31 0.27 -1.72 0.38 0.34 -0.84 0.2 -0.47 0.2 0.42 0.35 -0.04 -0.45 -0.33 0.31 -0.18 0.3 0.29 -0.13 0.53 0.23 0.53 0.44 0.32 0.54
-0.51 -1.21 -0.25 -2.92 1.6 0.5 -0.06 0.09 -1.48 -0.31 -1.21 -1.29 -0.83 -0.6 -0.25 -0.17 0.13 -1.13 0.73 0.87 0.72 0.63 1.3 -0.35 -0.13 -1.78 -0.74 -0.16 -1.29 0.06 -0.69 -0.89 0.14 0.29 -0.92 -0.88 -0.81 -0.02 -0.2 0.65 0.58 0.68 0.64 0.41 0.36 0.03 0.25 -0.31
-0.76 -0.24 -1.01 -1.99 0.45 0.64 0.38 0.5 -0.17 -0.54 -1.01 -1.07 -0.72 -1.76 0.06 -0.84 0.93 -0.91 0.52 0.78 0.54 0.26 2.64 -1.59 -0.03 -1.67 0.36 0.04 -0.21 -0.32 -0.52 -0.12 -0.03 -0.15 -0.85 0.12 -0.06 -0.27 -1.1 -0.11 -0.53 -1.07 0.07 -0.05 -0.36 -0.22 -0.2 0.01
-2.61 -1.83 -0.09 -1.45 0.27 -0.02 0.97 1.0 -0.15 0.12 -0.03 0.07 -0.49 -1.46 -0.41 -2.7 -1.66 -1.46 0.11 0.3 0.13 -0.25 1.18 -2.88 0.51 -1.57 0.24 0.57 0.77 0.06 0.3 0.26 0.26 0.33 -0.25 0.29 0.28 0.2 -0.47 0.2 0.07 -0.29 0.09 0.21 -0.15 0.11 0.24 0.22
-2.45 -0.98 -0.51 -3.08 1.74 0.91 0.64 0.49 -0.24 0.08 -2.61 -2.67 -0.7 -1.06 -0.18 -1.65 -0.33 -0.96 0.65 0.54 0.73 0.39 1.78 -2.32 0.52 -1.42 -0.58 0.09 -0.54 -0.0 0.21 -0.19 0.08 -0.21 -1.16 -0.1 -0.14 0.22 -0.33 -0.1 -0.14 -0.16 0.29 0.34 0.05 -0.04 0.41 -0.22
-0.69 -1.26 -1.64 -2.88 1.19 -0.07 -0.78 -0.34 -1.09 0.04 -0.67 -0.59 -0.65 -2.04 0.37 -1.12 -0.3 -1.13 -0.06 0.16 0.38 -0.18 2.41 1.15 0.49 -0.79 1.2 -0.28 -0.8 0.13 -0.07 0.13 0.1 -0.53 -0.55 -0.3 0.12 0.14 -1.84 -0.08 -0.02 -1.12 0.39 0.01 -0.52 0.15 -0.33 0.65
-1.15 -0.49 0.36 0.07 -0.23 -0.68 -0.2 -0.34 -1.13 -0.56 -0.12 -0.08 -0.81 -1.06 -0.63 -1.7 0.41 -1.26 1.28 0.84 1.16 0.75 1.73 -0.02 0.46 -1.71 0.31 -0.56 -0.04 -0.3 -0.6 -0.54 -0.24 -0.04 1.92 0.27 -1.03 -0.58 -0.67 -0.32 -0.58 -0.5 -0.14 -0.53 -0.32 -0.48 -0.31 -0.42
-0.45 0.12 0.39 -0.29 0.07 0.9 0.25 0.42 -0.02 0.25 -1.04 -0.99 -0.13 -0.13 0.24 -0.32 0.53 -0.25 0.87 1.02 0.89 0.64 0.73 -0.89 -0.09 -0.34 -0.02 0.01 -0.63 -0.34 -0.08 -0.18 -0.31 -0.07 -0.61 -0.54 -0.15 0.03 -0.5 -0.41 -0.54 -0.66 -0.25 -0.48 -0.69 -0.04 -0.24 0.17
-1.66 -0.51 0.45 -0.57 0.92 0.02 0.55 0.17 -1.17 0.12 0.18 0.29 -0.26 -1.14 -0.03 -0.95 0.17 -0.54 0.29 0.3 0.51 0.16 1.62 0.51 0.75 -0.62 0.62 -0.17 -0.62 -0.47 -0.08 -0.19 -0.14 -0.23 1.18 -0.01 -0.36 -0.36 -1.16 -0.58 -0.78 -0.98 -0.34 -0.4 -0.64 -0.44 -0.21 -0.14
-0.4 -0.27 -1.07 -2.42 1.98 -0.15 -0.48 -0.36 -0.4 0.19 -1.06 -0.84 -0.4 0.23 0.09 -0.27 0.32 -0.87 0.79 1.36 1.06 0.43 1.53 -1.33 -0.6 -1.73 -1.6 -0.56 -0.62 -0.09 -0.91 -0.23 0.26 -0.22 -1.18 -0.94 -0.81 0.18 -0.71 0.17 0.35 0.13 0.57 -0.47 0.37 0.17 -0.78 -0.23
-0.13 0.43 -0.03 -2.31 1.7 -0.5 -0.35 -0.3 -0.18 -0.38 -1.42 -1.39 -0.91 -0.1 0.01 0.33 0.65 -0.01 1.17 1.64 1.22 0.67 1.3 -0.73 -0.02 -1.12 -0.33 -0.48 -0.89 -0.57 -1.01 -1.14 -0.41 -0.56 -1.02 -1.36 -0.94 -0.12 -0.72 -0.08 0.62 0.4 0.21 -0.6 -0.22 -0.12 -1.42 -0.51
-1.03 -0.96 -0.99 -2.46 1.23 0.2 -0.2 0.12 -0.74 -0.12 -0.56 -0.47 -0.02 0.13 0.14 -1.8 -0.82 -1.18 0.26 0.45 0.17 -0.11 1.34 -0.82 0.12 -1.36 0.4 0.22 -0.15 0.06 -0.11 0.11 0.16 0.01 -0.31 -0.05 0.2 0.15 -0.56 0.44 0.5 0.12 0.62 0.15 0.39 0.18 -0.28 0.32
-2.2 -0.84 -0.59 -2.13 1.78 -0.22 -1.49 -1.49 -1.75 -0.39 -0.51 -0.45 -0.32 0.21 -0.08 -1.18 0.68 -0.88 0.94 0.88 0.65 0.44 2.03 0.4 0.05 -1.96 0.12 -0.41 -1.13 -0.21 -0.79 -0.54 0.01 -0.31 -0.21 -0.56 -0.56 -0.24 -0.64 0.38 0.25 0.14 0.6 0.09 0.08 -0.21 -0.26 0.1
-0.24 -0.14 -0.27 -2.72 1.56 0.24 0.4 0.07 -0.49 -0.14 -0.11 -0.05 0.03 -0.49 -0.1 -1.4 -0.09 -0.48 0.38 0.38 0.39 0.1 1.15 -1.84 -0.13 -1.17 -0.02 -0.19 -0.09 -0.28 0.05 -0.04 0.15 -0.01 -1.11 -0.2 0.22 0.11 -0.45 0.1 0.08 -0.04 0.23 0.24 0.16 0.16 -0.08 0.0
-0.03 -1.16 -0.15 -5.49 1.25 0.81 -0.45 0.99 0.63 1.29 -6.63 -8.46 0.99 -1.62 1.76 -1.49 1.8 -3.5 3.02 2.44 1.42 0.48 1.65 -7.11 -3.28 -3.58 -7.57 -8.07 - -5.99 -2.25 -7.33 -6.83 - - - -7.14 -0.34 -5.31 -1.18 - -3.6 0.56 -1.39 -4.05 -0.7 -3.55 -7.56
0.09 0.36 0.35 -1.77 1.42 0.98 0.89 0.7 0.25 -0.68 -1.01 -0.96 -0.64 -0.88 -0.67 0.64 0.63 -0.18 0.72 0.63 0.46 0.45 0.84 -0.29 0.01 0.06 -1.02 0.08 -0.4 -0.28 -0.55 -0.48 -0.37 -0.09 -0.31 -0.99 -0.29 -0.41 -0.68 -0.51 -0.72 -0.49 -0.28 -0.42 -0.36 -0.45 -0.25 0.07
0.33 -0.62 -1.43 -3.21 1.28 1.68 1.23 1.28 0.26 0.68 -5.46 -4.16 0.24 -1.23 1.51 -2.15 1.1 -2.46 2.77 0.55 -1.36 -1.63 2.1 1.32 -3.22 -3.35 -6.39 -1.82 -2.68 -1.19 -1.67 -3.18 -1.53 -1.67 -4.1 -3.55 -1.75 -0.28 -2.57 0.32 -1.91 -1.61 0.71 -0.46 -1.66 -0.41 -1.09 -2.66
-2.33 -0.49 0.17 -3.3 1.23 0.25 0.3 0.26 -0.96 -0.17 -3.01 -3.4 -0.67 -1.48 0.02 -1.16 0.88 -0.53 1.06 0.96 1.69 1.74 1.15 -0.04 0.59 -1.0 0.05 0.41 -0.35 -0.43 -0.07 -1.97 -0.32 -0.01 -1.99 -0.01 -0.08 -0.03 -0.62 -0.01 -0.79 -0.74 -0.05 -0.48 -0.81 -0.09 -0.93 -0.15
-1.09 -1.39 -0.31 -3.09 1.38 0.08 -0.04 0.22 -1.33 0.13 -2.05 -1.87 -0.43 -1.16 -0.13 -1.98 0.54 -0.17 0.85 0.98 0.49 0.26 1.63 -1.22 0.39 -0.8 0.44 0.01 -0.96 -0.14 0.1 -0.22 0.23 -0.01 -3.53 -0.24 0.36 0.57 -0.53 0.21 -0.66 -0.73 0.28 0.41 -0.01 0.62 0.04 0.2
-1.13 -0.32 0.35 -1.97 1.17 0.33 0.01 0.37 -1.55 0.3 -2.67 -2.69 0.26 0.14 0.6 -1.21 1.37 -0.16 1.24 1.17 1.18 0.98 1.12 0.57 -0.23 -0.16 -0.61 -0.56 -1.56 -1.03 -0.81 -0.54 -0.49 -0.44 -2.23 -0.53 -0.91 -0.38 -0.18 -0.19 -0.27 0.01 -0.04 -0.01 -0.21 -0.59 -0.58 -0.48
-0.44 -0.29 0.51 -2.35 1.33 0.24 0.51 0.2 0.01 0.2 -0.88 -0.75 -0.18 0.03 0.52 -0.12 0.52 -0.65 1.01 1.16 1.09 0.27 1.74 -0.37 -0.15 -0.91 -0.52 -1.09 -0.76 -0.67 -0.73 -1.07 -0.53 -0.57 -1.3 -0.87 -0.8 -0.2 -0.43 0.02 -0.12 -0.3 0.29 -0.15 -0.4 -0.33 -0.61 -0.44
-0.57 0.1 0.02 -1.23 0.58 0.97 0.61 0.6 -0.31 -0.01 -0.46 -0.35 -0.52 -0.67 -0.17 -0.56 -0.14 -0.09 0.6 0.81 0.72 0.59 1.16 -0.29 0.59 -0.57 -0.22 0.11 -0.59 -0.08 -0.04 -0.44 -0.34 -0.14 0.36 -0.85 -0.33 -0.0 -0.82 -0.59 -0.33 -0.51 -0.28 -0.46 -0.81 0.09 -0.14 0.26
-1.75 -0.16 0.74 0.25 0.74 0.22 -0.25 -0.76 -0.02 1.05 -7.86 -8.57 -0.49 -2.09 1.31 -2.85 2.58 -3.76 3.16 2.2 -0.06 -2.19 2.48 1.44 -2.98 -5.78 - -8.14 - -6.23 -2.29 -10.17 -7.73 - - - - 0.3 -6.0 -1.91 - -9.83 -1.47 -0.85 -5.05 -0.02 -2.26 -
-1.13 -1.08 -0.43 -2.75 1.48 0.39 -0.0 0.04 0.02 -0.39 -0.18 -0.03 -0.67 -1.5 -0.06 -0.41 0.36 -0.35 0.7 0.63 0.65 0.35 2.04 -1.68 0.59 -0.32 1.02 0.62 -0.21 -0.3 -0.42 -0.21 -0.17 -0.02 -0.87 -0.19 -0.23 -0.74 -0.71 -0.59 -0.84 -1.3 -0.4 -0.51 -0.3 -0.67 -0.45 0.5
-1.88 -1.4 -2.46 -3.06 -3.38 0.18 0.83 0.71 -1.2 -0.13 -0.21 0.21 -1.01 -1.13 0.36 -1.58 -1.65 -2.1 0.89 1.7 0.91 -0.48 2.32 -2.78 0.48 -2.34 0.84 -0.52 -0.05 0.08 -0.23 0.21 0.47 -0.04 0.42 -0.14 -0.05 -0.35 -1.06 -0.19 -0.4 -0.39 -0.32 -0.09 0.02 -0.47 -0.37 0.54
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-1.57 -1.03 -0.69 0.42 1.31 0.25 0.1 -0.06 -1.24 0.08 0.02 -0.07 -0.16 -1.28 -0.03 -1.97 -0.44 -0.97 0.74 0.51 0.47 0.12 1.56 0.07 0.31 -0.86 0.42 0.44 -0.93 -0.1 -0.14 0.01 0.03 0.13 -0.91 0.1 0.14 0.07 -0.61 -0.25 -0.77 -0.83 0.03 0.11 -0.21 0.01 0.42 0.07
-1.16 -0.04 0.26 -1.02 1.36 -0.34 -0.45 -0.22 -0.99 -0.03 0.54 0.58 0.07 -0.3 -0.15 -0.26 0.11 -0.42 0.27 0.56 0.53 0.38 1.19 -0.95 0.46 -0.43 0.46 -0.36 -0.19 -0.34 -0.35 -0.15 -0.24 -0.39 -0.65 -0.68 -0.01 0.01 -0.76 -0.1 0.03 0.08 0.18 -0.06 -0.27 0.02 -0.27 -0.01
0.03 -0.47 -0.55 -2.13 -2.72 0.52 1.07 1.06 -0.44 -0.48 0.29 0.46 -0.83 -1.13 -0.38 -0.48 -0.46 -1.06 0.28 -0.05 -0.32 -0.51 2.07 1.74 -1.15 -0.68 -0.52 0.12 -1.44 0.55 -0.5 0.39 0.05 0.08 -0.83 -0.38 -0.81 -0.22 -0.97 -0.09 -0.41 -0.67 0.11 0.03 0.13 -0.22 -0.26 0.37
-1.97 -0.63 -1.69 -2.0 1.33 0.81 1.38 1.21 -0.69 0.43 -2.2 -1.98 -0.67 -1.91 0.46 -0.12 -0.01 -1.32 1.05 1.2 0.96 -0.17 1.13 -1.8 -0.89 -2.34 -0.9 0.34 -0.92 0.07 0.61 -0.34 0.16 -0.03 -1.54 -0.09 0.26 0.28 -1.42 -0.5 -0.06 -0.75 0.11 -0.3 -0.7 0.28 -0.15 0.22
-0.31 -0.22 -0.57 -0.63 0.81 0.4 0.53 0.05 -0.54 0.36 -0.66 -0.44 -0.06 -1.23 0.44 0.58 0.1 -0.29 0.36 0.77 0.38 0.15 1.15 -0.89 0.54 -0.7 0.58 -0.04 -0.57 -0.08 0.13 -0.04 -0.08 -0.28 -0.89 -0.06 -0.09 0.44 -1.28 -0.44 -0.54 -0.96 -0.14 -0.24 -0.49 0.4 -0.34 0.13
-0.97 -0.59 -0.1 -2.18 1.84 -0.5 0.69 0.48 -0.38 0.19 -2.51 -2.17 -0.81 -1.28 0.03 -0.16 0.24 -0.08 0.87 1.54 1.17 0.97 0.35 0.3 0.31 -1.29 -1.27 0.14 -1.35 -0.37 -0.17 -1.13 -0.24 0.03 -2.07 -0.56 -0.57 0.59 -1.29 0.03 -0.39 -0.12 0.19 -0.16 -0.29 0.62 -0.06 -1.07
-0.76 -0.89 -0.99 -1.2 1.56 -0.06 -0.26 -0.28 -0.76 -0.29 -2.2 -2.11 -0.58 -0.89 -0.32 -0.94 0.4 -0.76 1.07 1.05 0.66 0.13 1.95 -1.67 -0.46 -1.45 -0.75 0.57 -0.68 0.04 0.04 -0.5 0.52 0.39 -1.58 0.61 0.63 -0.1 -0.35 0.18 -0.31 -0.47 -0.1 -0.04 -0.11 -0.03 0.02 0.16
-1.47 -0.57 -1.01 -1.61 1.16 -0.01 0.02 -0.08 -0.9 0.19 -1.29 -1.49 -0.46 -0.41 0.34 -0.37 0.02 -0.56 0.85 1.42 1.31 1.01 1.19 -0.32 0.33 -1.43 -0.07 -0.38 -0.52 -0.18 -0.1 -0.57 0.11 -0.09 -1.25 -0.89 -0.2 0.24 -1.07 0.27 0.15 -0.08 0.34 -0.16 -0.27 0.26 -0.38 0.01
0.06 0.67 0.38 -2.71 1.32 1.1 0.42 0.64 0.54 0.01 -0.97 -1.02 -0.72 -2.4 -0.31 0.28 0.22 -0.82 1.07 0.85 0.71 0.31 1.02 -2.83 0.27 -1.02 -0.01 0.6 -1.02 -0.21 -0.23 0.15 -0.26 -0.25 -0.13 -0.27 -0.29 0.0 -1.47 -0.76 -1.71 -2.4 -0.5 -0.19 -0.52 0.1 -0.32 0.07
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.