Heatmap: Cluster_150 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_17080V3.1	0.11	0.05	-0.02	-2.11	0.92	-0.85	-0.4	-0.54	-0.19	-0.12	-0.89	-0.81	-0.17	0.23	0.35	0.16	0.65	-0.62	0.37	0.71	0.82	0.65	-0.91	-1.58	0.15	-0.61	0.2	-0.4	0.56	-0.01	-0.4	-1.4	-0.07	0.18	0.14	-0.74	-0.47	0.07	-0.83	0.3	0.78	0.62	0.71	-0.08	-0.48	0.1	-0.51	0.13
Pp3c10_5670V3.1	-1.98	-1.3	-0.7	-1.67	1.46	0.07	-0.2	-0.07	-2.13	0.35	-0.68	-0.81	0.33	0.35	-0.4	-2.33	-0.77	-1.84	0.53	1.52	1.52	1.09	-4.34	-1.31	0.5	-1.38	-0.44	-0.14	-0.46	-0.41	0.29	0.13	0.24	0.32	-0.6	0.23	0.1	0.15	-0.17	0.09	0.02	-0.19	0.16	0.36	-0.17	0.1	0.45	-0.47
Pp3c11_10650V3.1	-1.2	-0.02	-0.35	-1.12	-1.1	-0.8	-1.07	-0.73	-0.14	-0.22	-0.56	-0.26	-1.14	-1.25	1.02	0.3	1.05	0.07	0.65	1.58	1.43	0.69	0.34	-0.44	0.69	-0.75	0.02	-0.63	-1.0	0.06	-0.61	-0.68	-0.05	-0.47	-1.61	-1.08	-0.56	-0.16	-1.11	0.2	0.52	0.27	0.45	0.08	-0.23	-0.1	-0.17	0.76
Pp3c11_15000V3.1	-1.49	-2.12	-1.1	-1.48	-1.01	-1.84	-3.21	-4.41	-2.93	0.59	-0.63	-0.6	-0.23	-0.99	1.07	-0.74	0.27	-0.82	0.18	0.82	0.96	0.77	-	-1.51	0.71	-1.43	0.66	0.34	0.41	0.54	0.22	-0.05	0.44	0.41	0.82	0.07	0.22	0.01	-0.54	0.42	0.46	-0.13	0.67	0.64	0.15	0.12	0.26	0.77
Pp3c11_19180V3.1	-1.51	-1.3	-0.6	-2.42	-0.24	-0.09	0.52	0.6	-1.52	0.44	-0.36	-0.4	0.08	0.52	0.28	-0.42	-0.28	-0.52	0.41	0.67	0.6	0.26	0.76	-2.01	0.36	-1.23	-0.1	-0.52	-0.32	-0.29	-0.24	-0.37	0.26	0.19	0.57	0.23	-0.28	-0.0	0.11	0.28	0.53	0.43	0.62	0.09	0.11	-0.05	-0.09	-0.3
Pp3c11_24600V3.1	-0.07	0.37	0.59	-1.13	0.21	-0.45	-0.63	-0.57	-0.54	-0.02	-2.12	-2.01	0.01	-0.1	0.12	-0.6	1.23	0.56	0.66	0.85	0.56	0.38	1.25	-0.35	0.36	0.53	0.02	-0.76	-0.54	-0.3	-0.67	-1.35	-0.15	-0.3	-1.31	-0.92	0.06	0.33	-0.66	0.05	-0.06	0.06	0.31	0.02	0.19	0.36	-0.82	-0.18
Pp3c11_25530V3.1	-1.1	-1.18	-0.72	-3.44	0.6	-0.56	-0.44	-0.31	-1.1	0.08	0.45	0.65	-0.18	-0.12	1.17	-1.57	-0.68	-1.24	0.03	0.92	1.2	0.3	-1.89	-1.68	1.2	-1.07	1.79	-0.87	-0.89	0.42	-0.8	-0.45	-0.32	-0.92	-0.68	-0.82	-0.63	-0.46	-1.32	0.25	1.22	0.67	0.64	-0.39	-0.24	-0.64	-0.83	1.01
Pp3c11_2830V3.1	-0.58	-1.19	-1.68	-2.74	0.27	0.19	0.22	0.12	-1.13	-0.06	-0.08	0.02	-0.5	-1.45	0.35	-0.33	-0.72	-0.59	-0.43	0.19	0.4	-0.09	-2.24	0.01	0.57	-1.03	0.33	0.33	0.42	0.25	0.7	-0.28	0.32	0.06	0.51	0.34	0.49	0.17	-0.8	0.13	0.42	-0.21	0.41	0.5	0.2	0.27	0.11	0.72
Pp3c12_12310V3.1	-0.93	-0.68	0.15	-0.57	-1.38	-2.03	-3.3	-3.85	-1.29	0.34	-1.11	-1.45	-0.51	-1.04	0.56	-0.47	0.01	-1.71	0.48	0.33	-0.06	0.49	-3.3	-1.55	-0.17	-2.51	-1.62	1.14	1.24	0.74	0.61	-1.36	0.67	1.26	0.18	0.9	0.6	-0.23	0.44	0.82	-0.49	-0.27	0.76	0.6	0.47	-0.41	1.04	-0.56
Pp3c12_1830V3.1	-1.7	-0.58	-0.07	-1.13	-0.11	-0.86	-0.0	-0.18	-1.59	0.54	1.07	0.97	0.21	-0.35	0.24	-1.61	-0.65	-1.07	0.42	0.74	0.54	0.3	-0.41	0.21	0.88	-1.52	0.72	-0.04	-0.1	-0.23	0.16	0.52	0.05	-0.04	-0.9	-0.74	0.33	-0.08	-0.95	0.26	0.35	0.15	0.26	-0.21	-0.17	-0.07	-0.13	-0.27
Pp3c12_18890V3.1	-2.07	-0.57	-0.54	-1.99	-0.0	-0.46	-1.03	-1.5	-0.61	0.38	-0.78	-0.91	0.27	-0.18	0.36	-1.08	0.51	0.07	0.5	0.61	0.96	1.06	-3.31	-2.02	0.12	-0.2	-0.56	0.13	0.19	-0.15	0.12	0.34	0.28	0.65	0.27	0.25	0.22	-0.01	0.48	0.37	-0.23	-0.47	0.29	0.3	0.1	0.1	0.53	0.17
Pp3c12_24710V3.1	0.19	-0.18	0.01	-1.82	1.41	-0.4	0.23	0.14	-0.19	-0.09	-2.14	-1.61	-0.26	0.12	0.93	0.32	0.11	-0.23	0.24	0.83	1.06	0.67	-0.91	-0.71	-0.03	-0.64	-0.52	0.01	0.06	0.15	-0.51	-1.51	-0.17	-0.06	0.48	0.03	-0.14	0.27	-0.32	-0.18	-0.14	-0.35	-0.09	-0.37	-0.32	0.19	-0.76	0.4
Pp3c13_13363V3.1	-3.04	-2.0	-1.29	-0.55	-0.46	-0.83	-3.23	-2.31	-3.48	0.66	0.12	-0.08	-0.22	-0.93	0.75	-1.75	0.0	-1.01	0.38	0.65	0.39	0.48	-3.72	-0.25	0.6	-1.79	0.19	0.35	0.85	0.5	0.31	0.44	0.75	0.48	-0.44	0.66	0.34	-0.43	-0.4	0.04	0.01	-0.24	0.61	0.52	0.36	-0.47	0.63	1.19
Pp3c13_23560V3.1	-1.9	-1.04	-0.47	-2.75	-2.28	-0.22	0.08	-0.14	-1.14	0.38	0.68	0.65	0.03	-0.73	0.32	-1.6	-0.44	-1.46	0.69	0.96	0.86	0.42	-0.34	0.91	0.71	-1.07	1.1	0.21	-0.73	-0.11	0.1	0.27	0.08	-0.11	-0.57	0.38	0.2	-0.02	-0.65	-0.06	-0.33	-0.63	0.24	0.24	-0.14	-0.0	0.28	-0.13
Pp3c13_24210V3.1	-1.24	-0.83	-0.28	-2.67	0.9	1.26	0.55	0.34	-6.68	-0.15	-2.35	-2.02	-0.04	0.02	-0.76	-0.64	-0.19	-0.95	0.84	1.3	1.69	1.17	-1.08	-0.11	0.99	-1.46	0.31	0.02	-2.0	-0.95	-0.02	-0.03	0.03	0.38	-1.5	0.31	0.11	-0.66	-0.18	-0.27	-0.11	-0.35	-0.29	0.13	-0.13	-0.56	-0.1	0.17
Pp3c14_15250V3.1	-0.84	-0.04	0.17	-1.5	1.07	-0.98	-1.14	-0.67	-0.4	0.28	-1.22	-1.09	-0.19	-1.2	0.37	-0.11	0.82	0.42	0.87	0.86	1.26	1.44	0.39	0.47	0.09	-0.96	-0.57	-0.44	-0.57	-0.07	-0.28	-0.98	-0.09	-0.01	-0.85	-0.93	-0.59	0.35	-1.47	0.2	-0.45	-0.79	0.36	0.26	0.19	0.34	-0.4	-0.0
Pp3c14_16050V3.1	0.9	0.38	-0.42	-0.04	-3.41	-1.12	0.25	0.02	0.37	0.09	-0.04	0.36	-0.23	-0.47	0.76	0.37	-0.86	-1.15	0.29	0.89	0.5	-0.43	-1.53	-0.25	0.96	-0.69	1.32	-0.76	-0.14	0.22	-0.39	-0.7	-0.41	-0.51	0.45	-0.94	-0.99	-0.22	-1.24	-0.14	0.55	0.57	0.37	-0.51	-0.56	-0.29	-0.2	0.4
Pp3c14_17403V3.1	-	-0.94	-1.7	-5.85	0.65	0.35	-0.58	-0.98	-32.31	0.02	-2.64	-4.05	-0.46	-0.61	-0.21	1.47	0.47	-0.7	0.5	1.22	1.22	1.63	-26.72	-1.47	1.07	-2.5	-1.48	-0.32	-0.42	-0.29	-0.06	-1.92	0.36	0.25	-1.09	-1.1	-0.02	0.83	-0.53	0.79	0.13	0.4	0.65	0.69	0.39	0.82	0.13	-0.37
Pp3c14_24540V3.1	-0.58	0.35	0.21	-0.41	-4.42	-3.14	-1.19	-0.74	-0.89	-0.02	-1.15	-0.9	-0.22	-0.6	0.03	-0.47	0.58	-0.16	1.51	1.35	1.26	0.86	-0.19	-1.71	0.16	-1.17	-0.03	-0.1	-0.05	0.05	-0.21	-0.29	-0.05	0.12	-0.05	-0.13	-0.21	0.46	-0.43	0.15	0.07	0.02	0.32	0.24	-0.22	0.54	-0.07	0.05
Pp3c14_26240V3.1	-2.59	0.29	-0.05	-1.45	-0.17	0.02	-0.66	-0.54	-0.92	0.42	-1.92	-2.19	0.4	0.27	-0.24	-0.45	0.94	-0.01	1.09	0.99	0.67	0.91	-2.86	-1.12	0.25	-0.52	-0.23	0.06	-0.66	-0.2	0.15	-0.45	0.22	0.32	-0.89	-0.17	0.03	0.48	0.08	0.23	-0.06	0.15	0.42	0.23	0.07	0.45	0.15	-0.38
Pp3c14_6110V3.1	-2.66	-1.79	-6.65	-4.43	0.22	-1.24	-1.52	-1.58	-3.77	1.05	-5.52	-4.64	0.38	-0.18	-1.28	-1.81	-0.78	-2.53	0.88	1.99	2.17	1.86	-	-1.2	0.59	-3.37	-1.51	-0.28	-2.59	-1.05	0.49	-2.02	-0.35	-0.07	-3.58	-0.96	-0.56	-0.13	-0.05	0.89	1.05	1.07	1.62	0.27	-0.73	-0.07	1.53	-1.94
Pp3c15_1410V3.1	-0.23	-0.62	-0.01	-0.38	-1.34	-1.02	-2.18	-1.78	0.12	0.36	-4.16	-3.39	-0.38	-1.42	0.5	-0.85	-0.42	-0.24	0.47	0.15	0.11	0.18	1.19	-1.02	-0.51	-0.59	-1.21	1.22	0.12	0.8	0.24	0.26	0.25	0.91	-0.59	0.62	0.39	0.3	0.24	0.1	-2.27	-1.76	0.02	0.91	0.13	0.34	1.12	0.37
Pp3c15_20620V3.1	-0.19	0.18	0.48	-0.28	-1.78	-0.66	-0.76	-0.41	-1.35	-0.18	-0.59	-0.36	-0.29	-0.68	-0.16	-0.27	0.4	0.09	0.57	0.79	0.52	0.39	-0.51	-1.06	-0.29	-0.87	-0.47	0.05	0.28	0.26	-0.12	-0.02	0.15	0.23	-0.32	-0.08	-0.03	0.26	0.05	0.39	0.29	0.38	0.4	0.64	0.24	0.28	0.21	0.16
Pp3c15_23780V3.1	0.1	-0.47	-0.45	-2.51	1.04	-0.32	-0.29	-0.11	-0.08	-0.26	-4.39	-3.99	-1.11	-0.78	-0.11	0.0	0.98	-0.25	0.87	1.32	2.12	1.21	1.18	-1.96	0.13	-1.31	-1.82	0.07	-1.05	0.05	-0.4	-1.88	0.13	-0.01	-0.79	-0.71	-0.39	-0.08	-0.67	0.0	-0.37	-0.46	0.46	0.05	0.06	-0.12	-0.32	-0.23
Pp3c15_5150V3.1	-1.11	-1.19	-0.29	-1.34	1.15	-0.14	-0.6	-0.09	-0.68	-0.82	-0.16	0.12	-0.98	-1.66	-1.19	1.32	0.65	-1.18	1.92	1.43	0.74	1.05	-2.35	-2.73	0.71	-1.1	1.28	0.53	-0.23	-0.43	-0.32	-0.5	-0.53	-0.06	-0.02	-0.21	0.04	-0.03	-1.27	-0.21	-1.16	-1.54	-0.48	0.18	-0.76	0.03	0.07	-1.05
Pp3c16_10320V3.1	-1.9	-0.3	-0.23	-1.05	-3.78	-1.76	-3.19	-4.27	-1.64	0.62	-0.52	-0.25	-1.02	-2.04	0.44	-0.48	0.69	-0.06	0.33	0.87	0.63	0.62	-4.39	-0.76	1.39	-0.81	0.88	0.51	0.25	0.65	0.94	0.48	0.28	0.24	0.09	-0.27	0.36	0.5	-1.31	-0.21	-0.26	-0.79	0.14	-0.29	-0.46	0.57	0.66	0.63
Pp3c16_6460V3.1	-1.27	-2.98	-8.95	-5.17	-2.64	-2.05	-2.29	-2.94	-2.34	0.43	-3.18	-3.09	1.09	0.51	0.41	-1.65	-4.61	-6.03	-5.49	-5.77	-5.91	-3.54	-8.68	-7.72	-4.07	-4.01	-4.07	1.6	0.86	0.81	1.48	-1.51	0.84	0.67	0.65	0.27	1.53	0.15	0.85	1.37	1.54	0.89	1.33	0.81	1.07	0.24	-0.07	0.83
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Pp3c7_10150V3.1	-0.93	-1.17	-0.95	-2.43	-3.31	-1.31	-2.86	-2.31	-1.98	0.48	-0.76	-0.72	-0.35	-0.64	0.59	-0.44	-0.01	-0.18	0.66	1.23	1.38	0.76	-1.29	-0.91	0.58	-1.68	0.4	-0.0	-0.23	0.21	0.12	-0.45	0.38	0.13	-0.16	-0.37	0.0	0.65	-0.82	0.61	0.51	0.32	0.91	0.5	0.21	0.72	0.04	0.53
Pp3c7_15200V3.1	-1.81	-1.29	-1.39	-3.28	-0.55	0.83	-0.3	-0.69	-1.26	-0.15	-2.42	-1.69	-1.6	-2.7	0.79	-2.42	-1.02	-1.24	0.13	0.88	0.61	-0.17	0.56	-0.3	0.09	-2.07	0.34	1.41	-0.85	0.91	0.03	0.18	0.16	0.64	0.26	1.18	-0.21	-0.38	-0.28	0.13	-1.31	-2.16	0.28	0.97	-0.14	-0.28	1.39	1.32
Pp3c7_19554V3.1	-1.43	-0.59	-1.53	-3.69	2.04	1.11	0.46	0.52	-1.16	-0.7	-1.97	-1.9	-1.79	-2.58	-0.51	-0.72	0.29	-0.07	1.77	1.97	0.84	0.46	-	0.88	1.32	-0.67	1.08	0.73	-1.76	-0.29	-0.57	-0.92	-0.16	-1.88	-4.13	-3.61	-1.67	0.61	-4.15	0.19	-1.91	-1.86	-0.82	-0.12	-1.05	0.72	-0.04	-0.2
Pp3c7_25000V3.1	-1.62	-0.58	0.72	0.2	-1.16	-1.54	-2.37	-2.67	-1.63	0.21	-0.27	-0.83	0.27	-0.36	-0.16	-0.94	0.29	-0.36	1.6	1.78	1.3	1.34	-4.65	0.71	0.37	-0.97	-0.42	-0.25	0.37	-0.34	0.12	-0.13	0.18	0.38	0.15	0.27	-0.1	-0.42	-0.69	-0.09	-0.67	-0.71	-0.12	-0.42	-0.73	-0.4	0.03	-0.18
Pp3c7_6850V3.1	0.08	0.04	-0.23	-3.29	-0.63	0.39	1.23	1.07	0.01	0.86	-0.85	-0.81	0.14	1.22	0.99	-1.44	-0.41	-1.15	0.41	0.64	0.99	0.64	2.27	-0.29	-0.97	-1.41	-0.34	-0.14	0.75	-0.96	-0.16	-0.56	-0.56	-0.85	-0.62	-1.26	-0.76	-0.03	-1.78	-1.42	-1.33	-1.11	-0.35	-0.97	-0.82	0.03	-1.06	-1.19
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Pp3c8_1267V3.1	-5.35	-1.17	-1.34	-1.7	1.33	1.57	0.33	0.35	-	-0.79	-1.77	-1.56	-1.62	-2.88	-3.35	-0.19	-0.27	-1.71	1.83	1.74	1.05	1.65	-	-0.13	1.26	-2.72	0.62	-0.22	-0.17	-0.81	0.22	-0.35	0.23	-0.1	-1.62	-1.74	0.29	0.59	-0.73	-0.12	-1.04	-0.79	-0.11	0.21	-0.16	0.29	0.05	-1.39
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Pp3c8_5730V3.1	-0.79	-0.68	-1.36	-0.3	0.33	-0.34	-0.27	-0.32	-0.92	0.11	-0.37	-0.16	0.12	0.21	0.5	-0.91	-0.24	-0.61	-0.17	0.08	-0.1	-0.18	-0.21	-1.55	0.02	-0.59	-0.39	0.29	0.47	0.14	0.15	0.03	0.23	0.26	0.32	0.26	0.45	0.36	0.12	0.39	0.27	0.09	0.44	0.35	0.16	0.32	0.26	0.45
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Pp3s128_50V3.1	-1.72	-2.08	-3.02	-4.98	1.4	-0.25	-0.85	-1.17	-1.61	-0.16	0.1	0.28	-0.37	-0.2	0.98	-1.74	-0.89	-2.42	0.19	0.48	0.47	-0.17	-0.51	-2.92	-0.04	-1.64	0.07	0.61	0.64	0.38	-0.17	0.05	0.41	0.38	0.44	0.18	0.28	-0.26	-0.5	0.36	0.66	0.1	0.74	0.27	0.27	-0.22	0.12	1.34
Pp3s355_20V3.1	-0.52	-0.13	-1.0	-2.16	-5.98	-4.62	-2.34	-2.13	-0.55	1.1	0.01	-0.25	0.01	-0.57	1.07	-0.2	-0.32	-1.33	0.82	1.84	1.87	0.89	-1.95	-1.49	1.25	-3.13	0.13	-1.11	-0.64	-0.07	0.61	0.67	-0.63	-0.51	-0.19	-1.22	-0.82	-0.34	-1.23	-0.04	0.71	0.16	0.3	0.02	-0.05	-0.22	0.39	-0.15
Pp3s62_10V3.1	-5.53	-4.26	-4.02	-8.74	1.6	-4.81	-5.02	-6.94	-6.34	0.46	0.76	0.22	0.08	-0.13	0.86	-4.36	-3.2	-3.34	-0.9	-0.55	0.35	0.14	-	-1.4	0.94	-3.62	1.18	0.94	1.06	0.48	0.54	0.43	0.7	0.53	1.0	1.09	0.77	-0.3	-0.67	-0.27	0.07	-0.84	0.2	0.2	0.25	-0.19	0.1	0.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.