Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_25280V3.1	-1.91	4.48	3.57	-1.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.11	-1.15	2.93	0.08	-	-	-	-	-	-	-	2.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_4170V3.1	-	5.36	0.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_690V3.1	-	5.31	-	0.76	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_17990V3.1	-	4.46	-0.34	1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.13	2.4	2.53	-0.64	-	-	-	-	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_21080V3.1	-	4.16	-1.59	-0.29	-1.55	-2.31	-2.81	-0.7	1.81	-0.82	-	-3.23	-0.27	-1.79	-2.51	0.95	2.17	1.45	-	-	-0.64	-2.93	-	0.74	-3.45	2.33	-	-	-	-1.03	-1.42	-1.13	-	-	-	-	-	0.41	-	-	-0.24	-0.4	-3.07	-	-	0.21	-	-
Pp3c11_26900V3.1	-	4.61	2.49	1.49	1.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.23	-	2.56	-0.22	-1.81	-	-	-	-	-	-	2.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_8090V3.1	-1.52	4.78	2.11	-	-2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.58	1.16	2.85	-1.1	-	-	-	-	-	-	-	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_1890V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_20270V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_3360V3.1	-	4.6	0.66	-	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	-2.74	1.75	1.01	0.42	-	-	-	-	-	1.26	-	3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_12470V3.1	-	5.06	-0.84	2.61	-	-	-	-	-0.04	-	0.8	-	-	-	-	0.38	1.0	-	-	-	-	-	-	-	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_25800V3.1	-	4.36	-0.59	-0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.07	3.44	2.99	1.01	-	-	-	-	-	1.58	-	1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_12570V3.1	1.61	5.07	1.64	-0.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.57	-	2.07	-	-	-	-	-	-	0.75	-	0.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_12590V3.1	-	4.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16	1.9	-	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_15370V3.1	-	5.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_16730V3.1	-	5.34	2.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_21760V3.1	-	4.72	0.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.04	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_25280V3.1	-	4.63	1.18	2.28	-	-	-	-	0.55	-	-	-	-	-	-	-	2.13	2.19	-	-	-	-	-	-	-	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_8780V3.1	-	4.72	-	2.07	-0.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.47	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	2.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_12990V3.1	-	4.37	2.61	0.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.19	-	-	-	-	3.31	-	-	2.53	0.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_15030V3.1	-	5.09	-3.03	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	-2.5	-4.03	-	-	-	-	-	-	1.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_15110V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_19450V3.1	-	4.51	-	-	-	-	-	1.23	-	-	-	-	-	-	-3.52	-	3.49	1.9	-	-	-	-	-	2.06	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_3160V3.1	-	4.28	-	0.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.52	2.74	-	-	-	-	-	-	-	-	3.9	-	-	-	-3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_18650V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_19290V3.1	-	4.07	-0.42	-0.38	-	1.03	0.98	2.04	-	-1.41	-	-	-	-0.36	-3.12	-	2.28	-1.53	-	-	-	-	-	-	-	2.66	-	0.98	-	-1.72	-1.42	-	-	0.4	-	-	-	0.15	-	-0.44	-	-	-0.95	-1.23	-	-	1.04	-
Pp3c19_3370V3.1	-	5.16	2.97	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_13950V3.1	-	5.33	-	-	2.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_18690V3.1	-	5.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	1.26	-	-	-	-	-	-	-	2.16	1.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_18840V3.1	-	5.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	1.26	-	-	-	-	-	-	-	2.16	1.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_3310V3.1	1.59	4.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.6	-	-	-	-	-	-	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_3200V3.1	-	5.25	-	-	1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_3440V3.1	-	5.11	0.39	-0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.45	-	-	0.55	-	-	-	-	-	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_2770V3.1	-	4.71	1.26	2.17	2.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.15	-	2.11	1.68	-	-	-	-	-	-	-	0.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_11519V3.1	-	4.96	-	-0.5	-1.16	-	1.04	1.29	-	-	-	-	-	-	-	0.46	3.08	0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.87
Pp3c24_12420V3.1	-	5.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.75	-	-	-
Pp3c24_13380V3.1	-	5.33	-0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_14150V3.1	-	4.69	1.61	1.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.29	-	2.97	-	-	-	-	-	-	2.29	-	1.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_7200V3.1	-	4.72	3.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.92	-	-	-	-	-	-	1.71	-	2.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_10820V3.1	-	5.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.19	-	-	-	-	-	-	-	-	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_220V3.1	-	5.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.83
Pp3c25_5930V3.1	-	4.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_7130V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_13120V3.1	-	4.38	-1.17	1.18	-	-	-1.61	-1.71	-0.26	-	-	-	-	-	-3.21	2.16	3.49	-	-3.45	-	-	-	-	-	-	2.79	-	-	-	-2.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.79
Pp3c2_17840V3.1	-1.4	4.83	2.58	-	-0.49	-	-	-	-	-1.99	-	-	-	-	-4.52	1.84	-1.51	-	-	-	-	-	-	2.33	-1.9	1.5	-	-	-	-4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_32350V3.1	-	5.01	1.23	-	0.59	-	-	-	1.79	-	-	-	-	-	-2.41	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_21450V3.1	-	5.28	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_22790V3.1	-	5.09	-	0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	0.81	0.23	-	-	-	-	-	-	-	1.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_2970V3.1	-	5.22	0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	-0.0	-	-	-	-	-	-	-	-0.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12
Pp3c3_3030V3.1	-	4.93	-	-	-	-	-	-	2.56	-	-	-	-	-	-	2.38	2.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_30880V3.1	-	5.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.95	-	2.68	-	-	-	-	-	-	-	-	2.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_35940V3.1	-	4.97	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-	-	-	-	3.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24040V3.1	-	5.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_20750V3.1	-1.28	4.71	2.26	1.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-	-	3.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_7700V3.1	-	4.49	-	2.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.35	-	2.05	-	-	-	-	-	-	-	3.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_12047V3.1	-	5.45	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_13250V3.1	-	4.6	-	0.37	-0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.41	1.78	-	-	-	-	-	-	3.39	-	-	1.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_13260V3.1	-	4.48	-	1.76	-0.52	-	-	2.68	-	-	-	-	-	-	-4.5	2.95	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	-	-0.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_28610V3.1	-	4.83	-	2.18	-0.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	2.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_3740V3.1	-	4.47	3.03	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.97	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_17080V3.1	-	4.39	-1.31	-1.64	0.82	-	-	-	-0.84	-	-	-	-	-	-5.18	-	2.04	2.65	-	-	-	-	-	0.06	-	3.64	-	-	-	-4.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_23570V3.1	-	5.33	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.1	-	-0.99	-	-	-	-	-	-	-	-	0.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_25170V3.1	-	4.2	-	-	0.79	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-	3.39	2.67	-	-	-	-	-	-	-	-	2.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_25950V3.1	-	4.79	-1.08	1.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.13	2.8	-0.75	-	-	-	-	-	-	-	2.42	-	-	-1.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_4610V3.1	-	5.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_9850V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.