Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00251380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.319)
1.0 0.79 0.92 0.32 0.14 0.11 0.1 0.03 0.11 0.11 0.19 0.14 0.24 0.6 0.41 0.34 0.11 0.1 0.12 0.39 0.15 0.12
AMTR_s00001p00268580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.424)
0.37 1.0 0.0 0.47 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.08 0.07 0.0 0.03 0.0 0.28 0.0 0.01 0.02 0.06 0.24
AMTR_s00001p00271850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.499)
1.0 0.48 0.8 0.45 0.29 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.15 0.7 0.02 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.08
AMTR_s00001p00272380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.522)
0.58 1.0 0.7 0.29 0.2 0.17 0.32 0.22 0.23 0.21 0.17 0.15 0.23 0.27 0.38 0.17 0.15 0.14 0.15 0.24 0.11 0.27
AMTR_s00002p00265060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.492)
0.73 1.0 0.0 0.4 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.34 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02
AMTR_s00003p00195190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.176)
1.0 0.59 0.71 0.12 0.25 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.07 0.11 0.76 0.53 0.08 0.03 0.13 0.08 0.22 0.06 0.09
AMTR_s00004p00084710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.68)
0.33 1.0 0.79 0.2 0.25 0.02 0.18 0.04 0.15 0.12 0.22 0.25 0.19 0.21 0.24 0.14 0.11 0.17 0.22 0.13 0.16 0.13
AMTR_s00005p00261220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.197)
0.5 1.0 0.0 0.27 0.19 0.0 0.03 0.05 0.04 0.03 0.18 0.22 0.25 0.19 0.17 0.28 0.19 0.19 0.16 0.13 0.25 0.18
AMTR_s00007p00213180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.196)
1.0 0.67 0.5 0.05 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.51 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.05
AMTR_s00007p00258170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.310)
0.67 0.54 0.41 0.37 0.01 0.01 0.01 0.02 0.18 0.14 0.08 0.09 0.06 1.0 0.13 0.01 0.03 0.04 0.04 0.31 0.02 0.04
AMTR_s00007p00268280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.391)
0.81 0.9 1.0 0.62 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.02 0.12 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
AMTR_s00009p00221230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.159)
1.0 0.76 0.64 0.22 0.15 0.01 0.0 0.07 0.1 0.11 0.12 0.11 0.13 0.18 0.13 0.04 0.11 0.13 0.13 0.38 0.05 0.22
AMTR_s00009p00239710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.208)
0.72 0.2 1.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
AMTR_s00009p00239740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.209)
1.0 0.27 0.89 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
AMTR_s00009p00268230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.418)
1.0 0.29 0.18 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.17 0.72 0.42 0.07 0.07 0.03 0.03 0.27 0.03 0.19
AMTR_s00012p00240140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.212)
0.5 0.01 0.27 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 0.06 0.06 0.07 1.0 0.16 0.08 0.07 0.04 0.02 0.27 0.02 0.06
AMTR_s00013p00178870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.102)
1.0 0.43 0.41 0.37 0.25 0.23 0.1 0.12 0.11 0.12 0.05 0.07 0.09 0.33 0.36 0.11 0.01 0.13 0.1 0.4 0.12 0.04
AMTR_s00017p00217930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.158)
0.14 1.0 0.45 0.37 0.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.17 0.1 0.1 0.17 0.09 0.03 0.04 0.09 0.14 0.04 0.15
AMTR_s00018p00031290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.6)
1.0 0.16 0.66 0.17 0.05 0.01 0.01 0.0 0.05 0.04 0.01 0.01 0.04 0.86 0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.01
1.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.92 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
AMTR_s00022p00043220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.22)
1.0 0.93 0.92 0.48 0.54 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.11 0.1 0.08 0.28 0.23 0.04 0.05 0.1 0.11 0.54 0.11 0.16
AMTR_s00022p00067280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.47)
0.91 1.0 0.39 0.07 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.93 0.47 0.01 0.0 0.0 0.01 0.17 0.01 0.01
AMTR_s00025p00226290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.321)
0.0 0.0 1.0 0.25 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.15 0.01 0.03 0.03 0.12 0.0 0.05 0.1 0.1 0.15
AMTR_s00027p00127290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.36)
0.57 1.0 0.44 0.1 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.24 0.05 0.02 0.04 0.0 0.04 0.04 0.04 0.43 0.23 0.07
AMTR_s00027p00143800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.45)
0.73 0.56 1.0 0.42 0.42 0.02 0.02 0.07 0.05 0.04 0.29 0.23 0.31 0.18 0.28 0.17 0.27 0.23 0.22 0.28 0.28 0.26
AMTR_s00029p00088380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.80)
0.64 0.32 1.0 0.83 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.19 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53
AMTR_s00030p00130440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.78)
0.92 0.37 0.48 0.07 0.24 0.02 0.03 0.05 0.07 0.06 0.1 0.13 0.14 1.0 0.48 0.05 0.03 0.02 0.02 0.1 0.02 0.14
AMTR_s00030p00199920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.137)
0.81 0.37 0.72 1.0 0.47 0.22 0.1 0.06 0.09 0.11 0.06 0.0 0.48 0.29 0.29 0.07 0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.28
AMTR_s00030p00215650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.161)
0.76 1.0 0.42 0.08 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.57 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.2 0.01 0.02
AMTR_s00030p00216100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.162)
0.62 1.0 0.73 0.06 0.19 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.55 0.18 0.0 0.0 0.01 0.03 0.5 0.02 0.07
AMTR_s00037p00035600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.10)
0.66 0.82 1.0 0.16 0.05 0.02 0.01 0.0 0.03 0.05 0.14 0.16 0.02 0.44 0.09 0.0 0.02 0.01 0.02 0.26 0.01 0.01
AMTR_s00039p00108090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.62)
0.0 0.0 1.0 0.13 0.1 0.05 0.04 0.0 0.03 0.06 0.01 0.05 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.15 0.01 0.01 0.1 0.0
AMTR_s00040p00052950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.25)
1.0 0.72 0.65 0.08 0.05 0.15 0.13 0.05 0.16 0.15 0.08 0.09 0.07 0.42 0.13 0.04 0.1 0.05 0.05 0.15 0.05 0.05
AMTR_s00041p00204540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.188)
1.0 0.46 0.84 0.37 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.2 0.28 0.29 0.19 0.13 0.39 0.24 0.31 0.34 0.16 0.18
AMTR_s00043p00200240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.61)
0.11 1.0 0.35 0.12 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.4 0.15 0.1 0.23 0.15 0.06 0.03 0.08 0.06 0.0 0.05
AMTR_s00053p00025460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.9)
1.0 0.67 0.54 0.02 0.14 0.03 0.2 0.01 0.25 0.21 0.06 0.07 0.27 0.93 0.23 0.02 0.07 0.06 0.09 0.24 0.03 0.21
AMTR_s00057p00042010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.20)
1.0 0.93 0.9 0.25 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.05 0.71 0.37 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01 0.03
AMTR_s00057p00164130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.160)
0.0 0.0 1.0 0.29 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00057p00209740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.255)
1.0 0.69 0.57 0.15 0.15 0.03 0.03 0.05 0.05 0.05 0.13 0.18 0.22 0.44 0.33 0.17 0.07 0.15 0.15 0.41 0.19 0.21
AMTR_s00058p00102600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.57)
0.68 0.41 1.0 0.04 0.05 0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 0.09 0.16 0.03 0.11 0.08 0.03 0.14 0.05 0.03 0.48 0.1 0.0
AMTR_s00059p00142910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.126)
0.51 1.0 0.51 0.54 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.33 0.38 0.3 0.25 0.28 0.37 0.16 0.18 0.5 0.2 0.25
AMTR_s00062p00010610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.1)
0.52 1.0 0.55 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.48 0.0 0.0
AMTR_s00063p00014550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.2)
0.43 0.32 1.0 0.48 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.24 0.18 0.22 0.18 0.22 0.16 0.13 0.16 0.24 0.1 0.13
AMTR_s00067p00139050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.126)
0.24 0.7 0.56 1.0 0.77 0.0 0.07 0.02 0.1 0.1 0.28 0.3 0.2 0.16 0.38 0.26 0.2 0.16 0.13 0.19 0.16 0.21
AMTR_s00068p00162650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.115)
0.2 0.73 0.57 1.0 0.26 0.02 0.03 0.14 0.09 0.11 0.5 0.52 0.66 0.31 0.46 0.35 0.67 0.23 0.17 0.31 0.0 0.32
AMTR_s00069p00097470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.61)
0.76 1.0 0.29 0.13 0.17 0.19 0.08 0.03 0.25 0.22 0.09 0.08 0.14 0.35 0.2 0.07 0.04 0.08 0.06 0.3 0.1 0.12
AMTR_s00069p00141520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.106)
1.0 0.74 0.56 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.4 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0
AMTR_s00077p00103150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.86)
0.0 0.97 0.22 1.0 0.5 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
AMTR_s00077p00103580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.87)
0.84 1.0 0.62 0.14 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.04 0.04 0.04 0.0 0.07 0.05 0.07 0.4 0.12 0.14
AMTR_s00077p00126790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.120)
0.21 1.0 0.17 0.24 0.57 0.01 0.27 0.25 0.33 0.26 0.35 0.38 0.43 0.38 0.27 0.29 0.37 0.4 0.25 0.44 0.21 0.43
AMTR_s00078p00164770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.152)
1.0 0.66 0.52 0.3 0.06 0.01 0.03 0.02 0.11 0.08 0.06 0.16 0.04 0.85 0.17 0.06 0.05 0.02 0.02 0.12 0.01 0.05
AMTR_s00079p00027120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.5)
1.0 0.62 0.81 0.13 0.14 0.17 0.0 0.02 0.01 0.01 0.11 0.12 0.22 0.87 0.68 0.17 0.04 0.03 0.08 0.1 0.04 0.15
AMTR_s00084p00178010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00084.48)
0.77 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03
AMTR_s00087p00071340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.19)
0.26 1.0 0.07 0.23 0.26 0.01 0.01 0.05 0.02 0.02 0.18 0.2 0.17 0.13 0.19 0.3 0.12 0.14 0.13 0.14 0.05 0.14
AMTR_s00092p00107280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.62)
1.0 0.37 0.2 0.09 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.54 0.17 0.01 0.01 0.0 0.0 0.36 0.0 0.02
AMTR_s00092p00134290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.99)
0.38 0.59 1.0 0.7 0.16 0.01 0.16 0.27 0.17 0.14 0.18 0.2 0.11 0.05 0.03 0.21 0.18 0.32 0.23 0.19 0.15 0.29
AMTR_s00095p00155590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.132)
0.0 0.0 1.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00096p00165210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.111)
0.93 0.52 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.01
AMTR_s00100p00110640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.33)
1.0 0.93 0.82 0.26 0.12 0.06 0.02 0.05 0.06 0.06 0.02 0.01 0.02 0.56 0.18 0.0 0.01 0.01 0.01 0.17 0.01 0.01
AMTR_s00103p00139710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.92)
1.0 0.63 0.5 0.33 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.06 0.46 0.24 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04
AMTR_s00107p00113580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.34)
0.84 1.0 0.73 0.14 0.24 0.11 0.13 0.24 0.34 0.24 0.25 0.26 0.2 0.3 0.24 0.22 0.41 0.32 0.21 0.36 0.28 0.33
AMTR_s00109p00081040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.63)
0.18 0.14 0.47 1.0 0.67 0.0 0.04 0.27 0.03 0.03 0.18 0.18 0.33 0.24 0.27 0.15 0.65 0.06 0.16 0.39 0.06 0.41
AMTR_s00109p00132480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.138)
0.42 0.67 0.72 1.0 0.78 0.01 0.13 0.14 0.06 0.07 0.26 0.21 0.21 0.18 0.24 0.08 0.44 0.11 0.12 0.11 0.04 0.25
AMTR_s00129p00061730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.34)
1.0 0.55 0.36 0.11 0.11 0.04 0.13 0.02 0.12 0.13 0.05 0.06 0.07 0.62 0.17 0.03 0.04 0.03 0.04 0.1 0.02 0.05
AMTR_s00129p00084140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.61)
0.82 1.0 0.8 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.23 0.18 0.47 0.23 0.1 0.19 0.15 0.14 0.2 0.06 0.17
AMTR_s00129p00104120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.83)
0.41 0.27 1.0 0.2 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.05 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.11
AMTR_s00130p00028330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.7)
1.0 0.38 0.72 0.26 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.28 0.31 0.03 0.04 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03
AMTR_s00131p00119200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.93)
1.0 0.47 0.26 0.1 0.36 0.12 0.07 0.07 0.09 0.11 0.04 0.03 0.23 0.93 0.43 0.01 0.07 0.01 0.0 0.1 0.0 0.04
AMTR_s00138p00053700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.24)
0.78 0.72 0.11 0.21 0.04 0.12 0.15 0.01 0.18 0.12 0.0 0.01 0.05 1.0 0.58 0.02 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.04
AMTR_s00177p00045340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00177.20)
1.0 0.65 0.45 0.39 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.1 0.14 0.2 0.02 0.11 0.15 0.14 0.51 0.02 0.06
AMTR_s00180p00053260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00180.30)
1.0 0.23 0.46 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.05 0.76 0.18 0.03 0.03 0.05 0.07 0.3 0.12 0.03
AMTR_s00234p00014000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00234.1)
0.9 1.0 0.65 0.32 0.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.04 0.06 0.14 0.1 0.04 0.01 0.01 0.03 0.41 0.0 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)