Heatmap: Cluster_150 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101401 (PACid_15403026)
0.53 0.54 0.65 0.57 0.42 0.56 0.67 0.38 0.46 0.63 0.5 0.52 0.09 0.03 0.02 0.14 1.0 0.6 0.64 0.27 0.08 0.35 0.13 0.14 0.14 0.22 0.25 0.5 0.71 0.73 0.5 0.26
Smo107369 (PACid_15420044)
0.46 0.6 0.68 0.62 0.58 0.67 0.56 0.39 0.5 0.43 0.45 0.37 0.08 0.06 0.05 0.11 1.0 0.98 0.39 0.01 0.03 0.0 0.73 0.37 0.13 0.13 0.16 0.22 0.61 0.66 0.63 0.62
Smo108537 (PACid_15402081)
0.5 0.5 0.52 0.48 0.46 0.48 0.53 0.41 0.48 0.54 0.51 0.47 0.21 0.41 0.34 0.27 0.73 0.4 0.35 0.15 0.06 0.26 1.0 0.74 0.02 0.28 0.58 0.76 0.84 0.82 0.6 0.59
Smo111270 (PACid_15408895)
0.46 0.54 0.5 0.5 0.48 0.45 0.47 0.3 0.44 0.41 0.41 0.38 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.74 0.21 0.02 0.01 0.01 0.3 0.15 0.05 0.08 0.11 0.16 0.58 0.65 0.56 0.4
Smo111388 (PACid_15409707)
0.45 0.74 0.97 0.85 0.82 0.85 0.7 0.52 0.57 0.69 0.58 0.48 0.08 0.29 0.51 0.17 1.0 0.86 0.23 0.37 0.37 0.54 0.9 0.46 0.2 0.31 0.33 0.43 0.58 0.65 0.29 0.26
Smo113883 (PACid_15419387)
0.47 0.5 0.48 0.52 0.51 0.65 0.52 0.25 0.41 0.33 0.35 0.33 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.95 0.05 0.0 0.03 0.0 0.43 0.07 0.02 0.04 0.25 0.32 0.53 0.54 0.12 0.07
Smo121275 (PACid_15416177)
0.87 0.78 0.63 0.6 0.56 0.54 0.42 0.46 0.49 0.46 0.59 0.51 0.06 0.15 0.14 0.11 0.98 0.53 0.26 0.11 0.04 0.09 0.94 0.61 0.29 0.13 0.68 0.65 0.92 1.0 0.4 0.42
Smo13019 (PACid_15405213)
0.79 0.82 0.92 0.74 0.65 0.71 0.75 0.46 0.65 0.65 0.68 0.53 0.37 0.45 0.1 0.58 1.0 0.96 0.57 0.0 0.05 0.15 0.77 0.39 0.15 0.13 0.25 0.35 0.71 0.76 0.49 0.39
Smo138695 (PACid_15402256)
0.96 0.7 0.92 0.63 0.24 0.37 0.34 0.55 0.56 0.63 0.59 0.77 0.01 0.0 0.0 0.02 0.7 0.41 0.46 0.09 0.39 0.02 0.29 0.17 0.55 0.39 0.74 1.0 0.67 0.65 0.45 0.33
Smo146861 (PACid_15404982)
0.95 1.0 0.78 0.58 0.43 0.47 0.51 0.47 0.47 0.44 0.5 0.61 0.04 0.12 0.08 0.09 0.85 0.71 0.29 0.17 0.23 0.16 0.52 0.38 0.33 0.17 0.63 0.76 0.75 0.77 0.62 0.32
Smo164091 (PACid_15407448)
0.82 1.0 0.83 0.7 0.67 0.72 0.7 0.37 0.39 0.28 0.27 0.38 0.12 0.67 0.46 0.28 0.72 0.5 0.54 0.12 0.45 0.01 0.62 0.41 0.33 0.17 0.33 0.64 0.5 0.53 0.24 0.17
Smo173020 (PACid_15411726)
0.7 0.73 0.87 0.99 0.96 1.0 0.92 0.78 0.68 0.57 0.6 0.59 0.47 0.72 0.89 0.57 0.77 0.66 0.74 0.12 0.34 0.31 0.58 0.46 0.49 0.61 0.96 0.97 0.67 0.68 0.47 0.34
Smo174517 (PACid_15418417)
0.39 0.54 0.58 0.56 0.45 0.48 0.46 0.34 0.38 0.34 0.37 0.34 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.84 0.06 0.05 0.02 0.38 0.18 0.08 0.12 0.07 0.25 0.3 0.51 0.51 0.31 0.36
Smo182303 (PACid_15418218)
0.4 0.76 0.86 0.72 0.73 0.81 0.58 0.34 0.49 0.39 0.4 0.27 0.13 0.47 0.0 0.22 0.62 1.0 0.33 0.12 0.15 0.01 0.83 0.52 0.23 0.07 0.24 0.32 0.44 0.5 0.27 0.29
Smo232013 (PACid_15416503)
0.83 0.97 0.91 0.67 0.74 0.73 0.5 0.4 0.5 0.35 0.45 0.38 0.09 0.44 0.46 0.18 1.0 0.88 0.46 0.03 0.0 0.01 0.6 0.61 0.24 0.17 0.39 0.53 0.58 0.75 0.26 0.2
Smo232422 (PACid_15419648)
0.43 0.6 0.54 0.51 0.7 0.5 0.46 0.31 0.46 0.37 0.42 0.36 0.04 0.08 0.09 0.06 1.0 0.54 0.13 0.29 0.11 0.27 0.13 0.07 0.06 0.11 0.23 0.28 0.59 0.63 0.44 0.46
Smo232963 (PACid_15423456)
0.89 0.84 1.0 0.74 0.4 0.4 0.36 0.62 0.57 0.7 0.84 0.89 0.04 0.02 0.04 0.1 0.6 0.01 0.29 0.37 0.48 0.0 0.19 0.08 0.59 0.56 0.43 0.56 0.66 0.54 0.25 0.13
Smo23881 (PACid_15418765)
0.66 0.86 0.91 0.87 0.99 1.0 0.78 0.8 0.67 0.67 0.76 0.61 0.31 0.4 0.31 0.24 0.65 0.94 0.68 0.01 0.16 0.07 0.5 0.38 0.15 0.18 0.42 0.54 0.71 0.88 0.68 0.74
Smo270557 (PACid_15421028)
0.38 0.45 0.57 0.68 0.83 0.8 0.67 0.66 0.53 0.47 0.49 0.42 0.21 0.2 0.19 0.37 1.0 0.57 0.84 0.15 0.44 0.22 0.74 0.59 0.96 0.45 0.82 0.78 0.91 0.94 0.56 0.54
Smo271409 (PACid_15423016)
0.45 0.48 0.6 0.55 0.52 0.58 0.56 0.52 0.51 0.42 0.48 0.42 0.76 0.44 0.35 0.3 0.69 0.47 0.3 0.07 0.14 0.14 1.0 0.71 0.25 0.16 0.64 0.65 0.68 0.79 0.49 0.42
Smo3012 (PACid_15409740)
0.57 0.74 0.63 0.61 0.83 1.0 0.75 0.73 0.64 0.5 0.5 0.47 0.34 0.24 0.48 0.29 0.87 1.0 0.62 0.08 0.33 0.18 0.52 0.45 0.53 0.14 0.6 0.62 0.69 0.74 0.62 0.68
Smo402598 (PACid_15405142)
0.27 0.35 0.47 0.51 0.48 0.54 0.59 0.36 0.51 0.41 0.41 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.85 0.07 0.01 0.01 0.0 0.15 0.02 0.25 0.02 0.29 0.4 0.57 0.66 0.43 0.28
Smo407081 (PACid_15416042)
0.36 0.48 0.55 0.54 0.65 0.64 0.48 0.39 0.49 0.41 0.55 0.34 0.01 0.0 0.0 0.02 1.0 0.57 0.04 0.03 0.02 0.0 0.11 0.02 0.17 0.08 0.14 0.28 0.43 0.55 0.49 0.32
Smo407495 (PACid_15419124)
0.71 0.59 0.79 0.54 0.5 0.42 0.17 0.15 0.3 0.31 0.45 0.47 0.12 0.3 0.17 0.13 1.0 0.71 0.05 0.01 0.04 0.01 0.68 0.2 0.07 0.06 0.22 0.29 0.57 0.51 0.35 0.22
Smo409212 (PACid_15423095)
0.44 0.62 0.99 1.0 0.81 0.89 0.93 0.6 0.61 0.57 0.52 0.44 0.15 0.02 0.1 0.27 0.4 0.42 0.54 0.15 0.38 0.34 0.36 0.47 0.31 0.1 0.19 0.3 0.43 0.4 0.32 0.23
Smo411132 (PACid_15406254)
0.38 0.53 0.58 0.59 0.62 0.59 0.56 0.34 0.37 0.3 0.29 0.28 0.11 0.06 0.1 0.1 1.0 0.61 0.4 0.15 0.05 0.19 0.25 0.12 0.15 0.17 0.19 0.25 0.43 0.53 0.22 0.15
Smo411673 (PACid_15410256)
0.35 0.52 0.51 0.5 0.52 0.54 0.59 0.33 0.48 0.34 0.38 0.34 0.05 0.11 0.27 0.09 1.0 0.61 0.18 0.01 0.01 0.03 0.07 0.08 0.12 0.19 0.26 0.33 0.58 0.75 0.29 0.15
Smo412299 (PACid_15410154)
0.63 0.67 0.79 0.89 0.79 0.85 0.62 0.62 0.58 0.61 0.56 0.66 0.16 0.1 0.01 0.2 0.52 0.68 1.0 0.04 0.23 0.0 0.88 0.55 0.2 0.4 0.55 0.59 0.74 0.75 0.61 0.65
Smo412497 (PACid_15411697)
0.45 0.54 0.67 0.68 0.76 0.63 0.75 0.49 0.69 0.6 0.68 0.52 0.22 0.07 0.07 0.21 1.0 0.8 0.49 0.01 0.01 0.0 0.3 0.14 0.03 0.27 0.21 0.4 0.73 0.79 0.61 0.53
Smo413483 (PACid_15414665)
0.68 0.66 0.66 0.69 0.79 1.0 0.68 0.61 0.57 0.53 0.48 0.56 0.44 0.4 0.59 0.55 0.54 0.44 0.63 0.0 0.33 0.1 0.47 0.48 0.08 0.4 0.75 0.84 0.43 0.42 0.28 0.23
Smo413591 (PACid_15415425)
0.69 0.95 1.0 0.8 0.7 0.81 0.59 0.53 0.65 0.62 0.55 0.59 0.47 0.34 0.48 0.34 0.76 0.84 0.13 0.28 0.45 0.21 0.95 0.38 0.08 0.14 0.16 0.2 0.54 0.52 0.35 0.32
Smo416857 (PACid_15403871)
0.28 0.56 0.63 0.7 0.88 1.0 0.45 0.27 0.38 0.21 0.19 0.14 0.03 0.01 0.01 0.04 0.74 0.34 0.31 0.0 0.12 0.01 0.85 0.37 0.98 0.2 0.82 0.71 0.55 0.64 0.21 0.26
Smo419575 (PACid_15410552)
0.78 0.54 0.44 0.32 0.35 0.37 0.13 0.17 0.21 0.28 0.31 0.3 0.04 0.09 0.15 0.03 1.0 0.62 0.03 0.09 0.11 0.06 0.05 0.03 0.07 0.02 0.19 0.14 0.22 0.21 0.2 0.14
Smo420481 (PACid_15413013)
0.57 0.6 0.66 0.58 0.55 0.48 0.53 0.37 0.43 0.39 0.51 0.43 0.6 0.06 0.36 0.31 0.52 0.29 0.11 0.0 0.0 0.09 1.0 0.3 0.04 0.16 0.2 0.3 0.38 0.38 0.29 0.28
Smo424499 (PACid_15402327)
0.53 0.4 0.36 0.29 0.14 0.18 0.21 0.25 0.39 0.37 0.44 0.59 0.01 0.04 0.06 0.02 0.54 0.23 0.14 0.02 0.05 0.0 1.0 0.74 0.17 0.29 0.12 0.12 0.62 0.6 0.34 0.24
Smo431283 (PACid_15421433)
0.62 0.46 0.57 0.41 0.43 0.54 0.37 0.34 0.43 0.42 0.48 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.62 0.03 0.0 0.09 0.0 0.08 0.01 0.05 0.01 0.22 0.23 0.48 0.48 0.65 0.5
Smo437973 (PACid_15422000)
0.44 0.62 1.0 0.84 0.76 0.68 0.56 0.44 0.61 0.53 0.55 0.34 0.1 0.05 0.0 0.09 0.41 0.61 0.25 0.09 0.14 0.0 0.84 0.54 0.3 0.06 0.55 0.48 0.36 0.51 0.29 0.43
Smo438165 (PACid_15418947)
0.79 0.86 0.75 0.71 0.96 0.94 0.82 0.76 0.66 0.55 0.61 0.53 0.31 0.59 0.43 0.53 0.93 1.0 0.82 0.18 0.33 0.36 0.61 0.63 0.54 0.29 0.71 0.67 0.84 0.85 0.8 0.87
Smo439136 (PACid_15421638)
0.32 0.41 0.47 0.5 0.42 0.43 0.62 0.4 0.61 0.44 0.48 0.36 0.01 0.01 0.01 0.01 0.58 0.73 0.06 0.12 0.05 0.1 0.72 0.97 0.2 0.04 0.4 0.33 0.54 0.67 0.63 1.0
Smo439556 (PACid_15402485)
0.52 0.82 1.0 0.93 0.85 0.87 0.96 0.63 0.67 0.62 0.46 0.51 0.21 0.33 0.54 0.39 0.71 0.39 0.76 0.44 0.39 0.36 0.5 0.37 0.42 0.27 0.36 0.47 0.66 0.7 0.39 0.42
Smo440934 (PACid_15408706)
0.48 0.56 0.61 0.62 0.68 0.74 0.48 0.34 0.44 0.39 0.37 0.3 0.13 0.09 0.14 0.21 1.0 0.53 0.64 0.01 0.12 0.0 0.54 0.46 0.39 0.24 0.47 0.67 0.52 0.51 0.14 0.15
Smo441321 (PACid_15406972)
0.87 0.88 0.79 0.76 0.81 0.72 0.61 0.5 0.67 0.63 0.59 0.5 0.3 0.28 0.12 0.5 0.62 0.53 0.25 0.28 0.14 0.36 1.0 0.85 0.25 0.23 0.42 0.55 0.6 0.64 0.47 0.51
Smo446012 (PACid_15419357)
0.69 1.0 0.89 0.79 0.74 0.72 0.85 0.55 0.54 0.56 0.49 0.46 0.22 0.31 0.19 0.44 0.89 0.49 0.5 0.08 0.15 0.01 0.62 0.33 0.27 0.36 0.56 1.0 0.82 0.85 0.14 0.12
Smo56696 (PACid_15402894)
0.51 0.71 0.76 0.74 0.95 1.0 0.96 0.93 0.78 0.71 0.59 0.68 0.32 0.2 0.21 0.77 0.72 0.77 0.96 0.14 0.08 0.0 0.71 0.48 0.26 0.32 0.46 0.78 0.81 0.74 0.54 0.67
Smo64201 (PACid_15423277)
0.78 0.93 0.81 0.62 0.64 0.71 0.53 0.44 0.68 0.62 0.5 0.43 0.58 0.47 0.01 0.52 0.54 0.69 0.3 0.01 0.09 0.0 1.0 0.58 0.02 0.15 0.2 0.3 0.38 0.41 0.35 0.33
Smo72363 (PACid_15403208)
0.34 0.4 0.31 0.39 0.47 0.55 0.61 0.83 1.0 0.54 0.76 0.45 0.23 0.14 0.34 0.26 0.4 0.56 0.43 0.05 0.04 0.52 0.47 0.48 0.09 0.34 0.4 0.36 0.52 0.46 0.43 0.43
Smo74259 (PACid_15408281)
0.47 0.58 0.67 0.64 0.63 0.76 0.55 0.46 0.39 0.3 0.36 0.33 0.27 0.37 0.44 0.36 0.7 0.6 0.41 0.42 0.33 0.45 0.4 0.37 0.93 0.3 0.83 1.0 0.52 0.55 0.17 0.17
Smo78556 (PACid_15422235)
0.95 0.96 0.96 0.93 0.94 0.83 0.65 0.52 0.74 0.58 0.73 0.62 0.35 0.62 0.14 0.57 0.78 0.69 0.81 0.25 0.21 0.06 1.0 0.78 0.27 0.77 0.74 0.9 0.78 0.86 0.61 0.64
Smo80725 (PACid_15407492)
0.62 0.66 0.62 0.57 0.61 0.62 0.69 0.54 0.8 0.8 0.82 0.78 0.01 0.0 0.0 0.09 1.0 0.86 0.28 0.69 0.16 0.77 0.15 0.11 0.16 0.6 0.33 0.38 0.5 0.52 0.85 0.68
Smo81583 (PACid_15409139)
0.52 0.68 0.75 0.75 0.76 0.62 0.29 0.42 0.58 0.66 0.7 0.66 0.08 0.12 0.19 0.09 1.0 0.74 0.08 0.01 0.04 0.0 0.59 0.12 0.05 0.12 0.21 0.25 0.72 0.66 0.38 0.41
Smo85319 (PACid_15419169)
0.49 0.46 0.46 0.52 0.48 0.44 0.48 0.45 0.67 0.6 0.63 0.59 0.04 0.02 0.05 0.04 1.0 0.66 0.15 0.26 0.15 0.39 0.09 0.07 0.25 0.44 0.32 0.33 0.44 0.45 0.72 0.73
Smo86219 (PACid_15421217)
0.81 0.75 0.79 0.74 0.72 0.73 0.74 0.72 0.77 0.81 0.83 0.76 0.21 0.43 0.29 0.27 0.8 0.53 0.33 0.66 0.52 0.24 1.0 0.79 0.48 0.36 0.66 0.82 0.86 0.9 0.57 0.54
Smo89101 (PACid_15406889)
0.44 0.33 0.38 0.52 0.58 0.6 0.53 0.67 0.98 0.9 0.81 0.51 0.13 0.23 0.29 0.24 0.48 0.44 0.28 0.03 0.14 0.53 1.0 0.74 0.22 0.15 0.58 0.55 0.76 0.87 0.51 0.67
Smo90062 (PACid_15409542)
0.3 0.37 0.38 0.4 0.54 0.39 0.37 0.34 0.47 0.37 0.35 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.7 0.14 0.0 0.15 0.01 0.2 0.06 0.1 0.12 0.23 0.19 0.47 0.38 0.45 0.31
Smo90332 (PACid_15411817)
0.83 0.79 0.57 0.45 0.41 0.48 0.31 0.46 0.61 0.51 0.57 0.54 0.04 0.03 0.03 0.05 1.0 0.8 0.07 0.01 0.73 0.03 0.15 0.04 0.24 0.02 0.09 0.12 0.58 0.42 0.25 0.25
Smo98264 (PACid_15412163)
0.92 0.97 0.93 0.89 0.94 0.98 0.84 0.8 0.67 0.59 0.61 0.59 0.5 0.58 0.65 0.62 0.76 0.66 0.9 0.09 0.43 0.08 0.67 0.61 0.42 0.58 0.99 1.0 0.68 0.72 0.37 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)