Heatmap: Cluster_111 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102808 (PACid_15409084)
-0.03 -0.07 0.13 0.17 0.23 0.1 0.14 0.1 0.14 0.32 0.22 0.09 0.19 -0.57 0.08 0.3 -0.29 -0.73 0.53 -8.17 -7.76 -5.87 0.41 0.34 -4.62 0.88 0.63 0.64 0.16 0.07 0.03 0.11
Smo104901 (PACid_15415747)
-0.08 -0.12 -0.14 -0.15 -0.05 -0.07 -0.08 -0.06 -0.16 -0.19 -0.21 -0.27 0.61 0.25 0.35 0.93 -0.15 -0.68 0.64 - -8.43 - 0.24 0.26 -5.0 1.17 0.82 1.04 0.14 0.22 -0.53 -0.63
Smo111409 (PACid_15410367)
-0.08 0.07 -0.01 0.34 0.44 0.37 0.1 0.25 0.3 0.23 0.33 -0.14 -0.21 -0.47 0.08 0.31 -0.26 -0.08 0.48 -6.84 -5.61 -3.54 0.12 0.45 -1.23 0.77 0.66 0.85 -0.06 0.1 -1.04 -0.71
Smo114130 (PACid_15416880)
0.08 0.13 0.14 0.4 0.52 0.25 0.2 0.49 0.34 0.28 0.36 0.09 -0.05 -0.27 0.13 0.3 0.0 -1.08 0.29 -5.66 -4.25 - 0.13 0.01 -2.0 0.71 0.38 0.53 0.15 0.26 -0.3 -0.52
Smo123969 (PACid_15404898)
-0.03 -0.34 -0.56 -0.2 -0.37 -0.06 0.0 0.32 0.42 0.25 0.16 0.19 0.44 0.1 0.35 0.73 -0.83 -1.36 0.19 -0.25 -3.34 -4.09 -0.52 -0.16 -1.82 1.49 1.05 0.96 -0.31 -0.19 -0.82 -0.99
Smo130469 (PACid_15421828)
-0.28 -0.08 0.07 0.04 0.08 -0.06 0.12 0.28 0.45 0.33 0.46 0.21 -0.27 -0.56 -0.2 -0.03 0.27 -0.5 -0.0 -2.56 -5.27 -5.5 0.5 0.45 -1.33 0.91 0.56 0.78 0.17 0.26 -0.29 -0.3
Smo145922 (PACid_15402746)
-0.87 -0.79 -0.52 -0.39 -0.01 0.0 -0.13 -0.06 -0.24 -0.37 -0.44 -0.61 0.43 -0.04 0.75 0.49 -0.67 -0.95 0.8 -0.49 -0.68 -0.78 0.03 0.47 0.26 1.31 0.76 0.66 -0.32 -0.19 -0.72 -0.58
Smo165311 (PACid_15412634)
-0.05 0.27 0.71 0.28 0.2 0.32 0.48 0.72 0.52 0.57 0.64 0.44 -0.7 -0.25 -0.05 -0.46 -0.27 -0.59 -0.32 -3.2 -2.59 -3.67 -0.17 -0.22 -1.22 0.3 0.55 0.62 -0.28 -0.37 -0.13 -0.05
Smo167876 (PACid_15422335)
0.02 0.04 0.18 0.05 0.18 0.08 0.15 0.3 0.28 0.28 0.24 0.04 0.21 -0.54 -0.83 0.4 -0.01 -0.24 0.12 -4.54 -2.19 -3.67 0.39 0.16 -2.52 0.55 0.69 0.77 0.17 0.3 -0.06 -0.1
Smo172580 (PACid_15412742)
0.16 -0.3 -0.32 -0.13 -0.1 -0.3 -0.01 0.3 0.22 0.43 0.39 0.22 0.25 0.35 -0.13 0.44 -0.92 -2.06 1.3 -3.58 -2.71 -7.47 0.14 0.42 -2.25 1.35 0.42 0.81 -0.12 0.07 -1.06 -1.1
Smo172788 (PACid_15414331)
-0.58 -0.37 -0.61 -0.4 -0.01 -0.09 -0.05 0.17 0.05 0.02 -0.08 -0.38 0.16 -0.42 0.69 0.37 -0.07 0.06 0.82 -5.08 -8.6 - 0.36 0.49 -3.17 1.07 0.85 0.65 0.29 0.18 0.14 0.12
Smo177626 (PACid_15405604)
-0.38 -0.1 -0.18 0.01 0.23 0.07 0.38 0.35 0.3 0.34 0.05 -0.14 0.42 -0.12 0.35 0.59 -0.1 -0.35 0.28 -7.74 -3.0 - 0.24 0.33 -3.47 0.75 0.66 0.82 0.09 0.27 -0.8 -0.53
Smo227218 (PACid_15403101)
-0.39 -0.36 -0.44 -0.16 -0.14 -0.02 -0.29 -0.07 -0.25 -0.37 -0.36 -0.63 0.53 0.23 0.76 0.46 -0.28 -0.63 0.15 -0.0 -1.15 -1.93 0.2 0.46 0.63 0.69 0.67 0.78 -0.34 -0.26 -0.47 -0.31
Smo230853 (PACid_15416941)
0.11 -0.29 -0.36 -0.16 -0.13 -0.29 -0.37 0.01 -0.05 0.08 0.01 -0.15 0.45 0.26 0.12 0.39 -0.58 -0.91 0.87 -5.6 -4.0 -6.67 0.07 0.16 -0.13 1.14 1.14 0.94 -0.36 -0.4 -0.11 0.03
Smo26351 (PACid_15423524)
-0.27 -0.28 -0.13 0.21 0.08 0.09 -0.15 0.59 -0.07 0.31 0.32 -0.41 0.33 0.14 0.27 0.67 -0.4 -1.12 0.68 -2.73 - - 0.25 0.34 -1.32 0.38 0.51 0.48 0.13 0.17 0.31 0.01
Smo33372 (PACid_15421989)
-0.02 0.0 -0.1 0.1 -0.01 -0.25 0.03 0.24 0.14 0.28 0.3 0.24 0.28 -0.06 0.44 0.4 -0.16 -1.33 0.54 - -9.85 -8.05 -0.19 -0.22 -8.25 0.79 0.53 0.63 0.21 0.22 0.52 0.5
Smo33943 (PACid_15404196)
0.33 -0.0 0.02 0.23 -0.0 0.06 0.05 0.43 0.21 0.41 0.32 0.18 -0.59 0.29 -2.43 -0.09 -0.25 -0.2 0.5 -7.47 -3.98 - 0.1 -0.1 -1.1 1.29 0.71 0.52 0.21 0.04 -0.04 -0.1
Smo3415 (PACid_15412837)
-0.11 0.06 -0.03 -0.02 0.04 -0.19 0.01 -0.02 -0.07 0.13 -0.08 -0.02 0.23 0.06 0.55 0.4 0.07 -0.51 0.48 - -4.75 -3.97 -0.15 -0.14 -3.43 0.79 0.9 0.88 0.29 0.28 0.18 0.04
Smo34350 (PACid_15402580)
-0.28 0.01 -0.11 0.19 0.14 0.01 0.3 0.17 0.13 -0.25 -0.21 -0.26 0.22 -1.13 -0.12 0.79 -0.16 -0.41 0.54 -6.11 - - 0.14 0.16 -1.35 1.34 0.9 1.1 0.43 0.14 -0.83 -1.04
Smo36531 (PACid_15410004)
0.0 0.06 -0.1 0.15 0.13 0.15 0.13 0.14 0.25 0.38 0.09 0.09 0.21 -0.5 0.03 0.31 -0.03 -0.34 0.51 -7.1 -3.58 -8.24 0.14 0.1 -1.69 0.63 0.73 0.69 0.14 0.15 -0.08 0.03
Smo36854 (PACid_15412348)
-0.03 -0.27 -0.1 -0.11 0.11 -0.06 -0.07 0.18 0.42 0.38 0.33 -0.02 0.2 -0.33 -0.84 0.35 -0.61 -0.92 1.29 -2.44 -4.31 -7.65 0.56 0.39 -3.9 1.13 0.28 0.55 0.03 -0.05 -0.23 0.13
Smo402766 (PACid_15406623)
-0.09 -0.1 0.02 -0.11 -0.01 -0.27 -0.09 -0.24 -0.19 0.01 0.01 -0.29 0.5 0.79 0.73 0.77 -0.2 -1.16 0.32 - - - 0.05 -0.23 -4.36 1.03 1.2 1.28 -0.29 -0.12 -0.59 -0.56
Smo403400 (PACid_15407048)
-0.27 -0.37 -0.28 -0.18 -0.12 -0.11 -0.26 0.16 0.0 -0.04 0.1 -0.1 0.41 -0.11 -0.65 0.35 -0.42 -0.94 0.79 -2.84 -2.34 -5.0 0.15 0.36 -0.08 1.47 0.94 0.78 -0.03 -0.07 -0.24 -0.24
Smo407400 (PACid_15418892)
0.08 0.16 0.16 0.48 0.25 0.19 0.13 0.37 0.21 0.22 0.45 0.13 -0.64 -0.44 -1.83 -0.2 -0.21 -0.97 -0.55 -8.13 -1.11 -4.07 0.36 0.46 -1.0 0.63 1.16 1.33 -0.14 -0.02 -0.51 -0.68
Smo409073 (PACid_15421703)
-0.28 -0.14 -0.11 0.14 0.27 0.06 -0.09 0.45 0.41 0.46 0.17 0.05 0.01 -0.88 -1.33 0.36 -0.03 -0.71 0.39 -8.63 - - 0.23 0.15 -3.11 1.24 0.86 0.91 0.35 0.37 -0.37 -0.16
Smo410069 (PACid_15402602)
-0.25 -0.25 -0.36 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.21 0.11 0.02 -0.07 0.31 -0.1 -0.12 0.59 -0.43 -0.62 0.8 -3.57 -4.43 -8.66 0.41 0.74 -0.8 0.95 0.6 0.49 0.05 0.04 -0.05 -0.04
Smo412830 (PACid_15414686)
-0.14 0.08 -0.16 0.07 -0.03 -0.13 -0.07 0.05 -0.01 0.03 0.16 -0.08 -0.17 -0.33 0.39 0.1 -0.27 -1.01 0.94 -2.26 -0.88 -2.18 -0.26 -0.15 0.2 1.18 1.06 0.77 -0.4 -0.32 -0.6 -0.54
Smo414611 (PACid_15418860)
-0.14 0.01 0.04 0.34 0.21 0.25 0.13 0.27 0.41 0.35 0.31 0.12 0.13 -0.58 0.03 0.39 -0.05 -0.99 0.36 -5.09 -3.25 -4.3 -0.07 0.02 -0.37 0.86 0.63 0.9 0.02 0.18 -0.71 -1.12
Smo415005 (PACid_15417156)
-0.14 -0.47 -0.31 -0.23 0.26 -0.33 0.64 0.46 0.32 0.4 0.23 0.08 -0.08 -0.72 -0.38 -0.0 0.02 -0.5 0.43 - -2.52 -7.35 -0.15 0.01 -1.63 1.22 0.9 0.97 0.19 0.05 0.03 -0.29
Smo420431 (PACid_15412866)
0.09 0.45 0.4 -0.0 0.14 0.16 0.17 0.24 0.19 0.27 0.33 0.06 0.11 -0.67 -0.54 0.1 -0.11 -0.12 0.13 -3.8 -3.72 -4.2 -0.07 -0.38 -2.75 0.49 0.86 0.92 0.3 0.31 0.09 -0.05
Smo420540 (PACid_15413715)
0.11 0.08 0.14 0.17 0.11 0.05 0.0 0.01 0.34 0.35 0.36 0.2 -0.27 0.01 -3.23 -0.2 0.06 -0.51 0.16 -7.99 -4.95 -7.04 0.46 0.38 -3.36 0.86 0.77 0.99 0.2 0.29 -0.02 0.26
Smo425580 (PACid_15405975)
-0.01 -0.05 -0.19 -0.11 0.02 -0.05 0.05 0.38 0.36 0.27 0.06 0.05 0.14 -0.55 -1.46 0.56 -0.17 -0.42 0.64 -5.57 -3.49 - 0.11 0.07 -0.83 1.13 1.13 1.05 0.15 0.06 -0.77 -0.83
Smo428314 (PACid_15413182)
-0.32 -0.26 -0.35 -0.08 0.07 -0.06 -0.13 0.17 -0.18 -0.05 -0.07 -0.53 0.52 -0.14 0.58 0.71 -0.65 -0.9 0.35 -1.12 -0.98 -1.29 0.01 0.24 -0.35 1.45 0.71 0.67 -0.34 -0.23 -0.81 -0.6
Smo439080 (PACid_15421033)
0.1 0.33 0.45 0.27 0.29 0.31 0.39 0.42 0.43 0.47 0.48 0.19 -0.42 -0.34 -0.09 -0.15 0.2 -0.18 -0.08 -5.51 -3.37 -4.46 -0.09 -0.02 -1.35 0.46 0.3 0.26 0.2 0.31 -0.24 -0.2
Smo440313 (PACid_15404012)
-0.14 -0.1 -0.12 0.08 0.03 0.05 0.04 0.11 0.13 0.04 -0.09 -0.04 0.29 -0.49 -0.41 0.3 -0.05 -0.15 0.17 -0.84 -1.21 -1.6 0.12 0.17 0.1 0.64 0.51 0.66 0.0 0.03 -0.16 -0.01
Smo442298 (PACid_15409395)
0.21 -0.05 -0.11 -0.1 -0.04 -0.13 -0.32 -0.03 0.16 0.19 -0.02 -0.11 0.04 0.37 -0.08 0.36 -0.69 -0.75 0.95 -4.13 -1.27 -4.47 0.31 0.57 0.13 1.25 0.52 0.66 -0.33 -0.18 -1.13 -0.69
Smo443353 (PACid_15413031)
-0.32 -0.41 -0.5 -0.24 -0.09 0.02 0.24 0.26 0.28 0.35 0.01 -0.07 0.49 -0.4 0.32 0.46 -0.58 -0.97 0.8 -1.42 -1.46 -2.66 -0.09 0.2 -0.09 1.21 0.65 0.66 -0.27 -0.17 -0.62 -0.62
Smo44690 (PACid_15412256)
0.13 0.14 0.03 0.23 0.49 0.42 0.25 0.36 0.17 0.32 0.1 0.1 -0.03 -0.32 0.32 0.22 0.12 -0.5 0.32 -5.3 -4.67 - -0.02 0.16 -1.46 0.71 0.45 0.6 0.18 0.21 -0.43 -0.85
Smo48160 (PACid_15420045)
-0.3 -0.21 -0.07 -0.14 0.26 -0.16 -0.15 0.04 -0.42 0.14 -0.15 -0.38 0.8 -0.13 0.44 0.96 0.09 -0.66 0.98 - - - 0.17 0.21 -4.6 0.88 0.59 0.65 0.25 0.36 -0.35 -0.29
Smo54861 (PACid_15420886)
-0.04 -0.07 -0.24 -0.03 0.11 -0.01 -0.25 0.15 -0.05 0.02 -0.13 -0.13 0.36 -0.23 0.1 0.56 -0.16 -0.52 0.68 -3.22 -1.17 -3.82 0.08 0.27 -0.26 1.03 0.65 0.63 -0.12 0.03 -0.25 -0.17
Smo57616 (PACid_15405645)
-0.27 -0.23 -0.32 -0.33 -0.15 -0.19 -0.36 -0.3 -0.07 -0.42 -0.21 -0.44 1.05 0.16 0.39 1.01 -0.47 -0.79 0.57 -3.59 - -3.22 0.09 0.24 -3.32 1.47 1.05 1.26 -0.18 -0.07 -0.96 -0.64
Smo68090 (PACid_15411459)
-0.23 -0.46 -0.44 -0.38 0.22 -0.11 0.14 -0.1 -0.14 -0.36 -0.16 -0.16 0.09 0.04 -0.57 0.64 0.23 0.57 0.48 -7.4 -4.39 - 0.1 -0.25 -2.27 1.0 1.07 1.23 0.21 0.29 -0.07 0.01
Smo7270 (PACid_15423000)
-0.44 -0.13 -0.07 -0.11 0.4 0.19 0.1 -0.03 -0.13 -0.09 -0.25 -0.33 0.61 -0.07 0.74 0.77 0.1 -0.17 0.69 -2.93 -6.14 -5.26 0.34 0.34 -1.74 0.35 0.7 0.68 0.35 0.25 -0.81 -0.92
Smo75016 (PACid_15409644)
-0.17 -0.29 -0.04 0.25 0.54 0.3 0.43 0.56 0.74 0.62 0.34 0.29 0.27 -0.37 0.59 0.13 -0.14 -0.42 0.22 - -6.09 -3.48 -0.25 -0.4 -2.07 0.77 0.42 0.45 0.13 0.18 -1.0 -1.22
Smo75453 (PACid_15412819)
-0.56 -0.64 -0.37 -0.32 -0.12 -0.2 -0.1 -0.05 -0.13 -0.25 -0.15 -0.51 0.48 -0.2 -0.4 0.46 0.07 0.06 0.47 -2.18 -2.37 -2.74 0.43 0.49 -1.85 1.79 0.69 0.99 0.31 0.27 -0.57 -1.21
Smo75978 (PACid_15416667)
-0.19 -0.41 -0.41 -0.35 -0.18 -0.48 -0.24 -0.02 0.19 0.01 -0.01 -0.17 0.35 -0.18 0.27 0.59 -0.16 -0.21 0.35 -4.89 - - 0.07 -0.25 -4.56 1.08 1.08 1.15 0.32 0.31 0.27 0.45
Smo76242 (PACid_15414259)
0.18 0.48 0.49 0.59 0.5 0.65 0.48 0.39 0.42 0.46 0.39 0.31 -0.49 -0.92 -0.55 -0.06 0.38 -0.44 0.3 -7.02 -3.92 -6.2 0.15 -0.05 -2.37 0.69 0.04 0.06 -0.02 0.15 -0.49 -0.71
Smo76400 (PACid_15415664)
0.1 0.29 0.03 0.28 0.3 0.01 0.33 0.26 0.17 0.33 0.18 0.16 0.07 -0.31 -0.27 0.12 -0.09 -0.72 0.35 -5.54 -7.51 -5.67 0.12 0.01 -4.65 0.57 0.81 0.7 0.14 0.07 0.3 0.17
Smo76601 (PACid_15417151)
-0.64 -0.44 -0.44 -0.27 0.09 -0.43 -0.02 0.02 -0.38 -0.06 -0.11 -0.38 0.71 0.1 -0.31 0.96 -0.28 -0.56 0.65 -4.8 -8.52 - 0.33 0.36 -6.22 1.07 1.09 1.0 0.25 0.32 0.02 0.02
Smo77552 (PACid_15419404)
-0.14 -0.26 -0.46 -0.14 0.14 0.02 0.08 0.18 0.31 0.23 0.27 0.03 0.41 -0.28 0.52 0.61 -0.46 -0.87 0.37 -0.92 -2.91 -1.71 -0.23 -0.08 -1.66 1.39 0.55 0.89 -0.06 -0.02 -1.0 -0.9
Smo81383 (PACid_15407496)
-0.41 -0.67 -0.69 -0.26 -0.26 -0.32 -0.49 -0.03 -0.05 0.25 -0.13 -0.27 0.95 0.36 0.96 0.78 -0.9 -1.44 0.85 - -4.65 - 0.42 0.69 -3.25 1.6 0.78 0.81 -0.31 -0.11 -1.1 -0.85
Smo86052 (PACid_15419869)
-0.25 -0.33 -0.32 0.06 0.19 -0.09 -0.16 -0.16 0.16 -0.16 0.03 -0.47 0.05 -0.59 0.25 -0.01 0.13 0.22 0.55 -1.72 -2.4 - 0.03 0.03 -0.36 0.84 1.01 0.89 0.22 0.17 -0.13 0.15
Smo91208 (PACid_15413989)
-0.04 -0.24 0.17 0.18 0.13 0.23 0.03 0.25 0.39 0.3 0.25 0.02 0.0 -0.38 0.15 0.22 0.38 -0.41 0.73 - -4.6 -3.36 0.26 0.45 -2.11 0.7 0.45 0.86 0.29 0.34 -1.47 -1.46
Smo93421 (PACid_15421188)
-0.04 -0.36 -0.69 -0.18 -0.06 -0.14 -0.31 -0.19 0.05 -0.08 -0.24 -0.15 0.41 0.21 0.3 0.55 -0.55 -0.88 0.75 -3.86 -1.57 -2.12 0.01 0.35 -0.17 1.51 0.67 0.57 0.09 0.1 -0.36 -0.41
Smo93596 (PACid_15422092)
-0.23 -0.35 -0.33 -0.39 -0.27 -0.28 -0.33 0.12 -0.02 0.15 -0.04 -0.01 0.62 -0.07 0.49 0.75 -0.41 -0.9 0.3 -5.24 -6.96 -3.53 0.18 0.36 -3.3 1.86 0.65 0.84 -0.09 0.0 -0.36 -0.38
Smo96774 (PACid_15410188)
-0.09 0.17 -0.02 0.31 0.36 0.4 0.35 0.45 0.18 0.12 -0.0 -0.21 -0.25 -0.75 -0.35 0.2 -0.05 -0.27 0.07 -5.27 -2.51 -1.38 0.07 0.18 -0.69 0.78 0.64 0.97 0.13 0.03 -0.47 -0.5
Smo98787 (PACid_15416073)
0.13 0.02 -0.2 -0.13 -0.08 -0.1 0.16 0.35 0.18 0.12 -0.03 0.24 0.13 -0.32 0.13 0.27 -0.16 -0.5 0.37 -3.44 -2.11 -1.79 0.2 0.2 -0.5 1.01 0.51 0.55 -0.02 0.01 -0.15 -0.06
Smo99131 (PACid_15414311)
-0.2 -0.34 -0.14 -0.02 0.05 -0.32 -0.38 -0.11 -0.26 -0.16 -0.26 -0.4 0.73 -0.44 -0.07 0.71 -0.23 -1.25 0.97 - - - 0.37 0.78 -4.42 1.41 0.84 0.77 0.16 0.24 -0.14 -0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.