Heatmap: Cluster_170 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo110107 (PACid_15405009)
0.52 0.47 0.46 0.55 0.47 0.9 0.72 0.54 0.32 0.61 0.43 0.43 0.5 0.24 1.0 0.54 0.36 0.36 0.48 0.03 0.01 0.06 0.37 0.42 0.2 0.57 0.44 0.45 0.36 0.42 0.36 0.36
Smo125776 (PACid_15409354)
0.63 0.76 0.77 0.93 0.83 0.92 1.0 0.92 0.9 0.85 0.82 0.75 0.39 0.43 0.78 0.36 0.61 0.44 0.51 0.92 0.31 0.26 0.48 0.41 0.37 0.58 0.71 0.83 0.57 0.6 0.34 0.34
Smo126642 (PACid_15411474)
0.19 0.27 0.3 0.33 0.33 0.37 0.42 0.32 0.34 0.31 0.29 0.22 0.14 1.0 0.82 0.51 0.99 0.58 0.12 0.0 0.16 0.01 0.24 0.37 0.13 0.13 0.12 0.15 0.5 0.51 0.24 0.19
Smo13182 (PACid_15406133)
0.7 0.81 0.9 0.81 0.61 0.88 0.8 0.69 0.69 0.64 0.62 0.49 0.44 0.31 0.69 0.5 0.69 1.0 0.56 0.0 0.03 0.15 0.69 0.53 0.13 0.43 0.81 0.83 0.55 0.61 0.37 0.4
Smo143797 (PACid_15417915)
0.48 0.5 0.48 0.5 0.49 0.54 0.51 0.38 0.43 0.43 0.48 0.41 0.22 0.36 1.0 0.29 0.61 0.39 0.25 0.49 0.4 0.25 0.27 0.28 0.35 0.18 0.22 0.26 0.38 0.47 0.27 0.18
Smo15078 (PACid_15411299)
0.4 0.44 0.48 0.52 0.5 0.52 0.64 0.47 0.56 0.5 0.52 0.44 0.15 0.18 1.0 0.27 0.65 0.49 0.21 0.01 0.04 0.0 0.32 0.32 0.02 0.09 0.13 0.12 0.35 0.38 0.51 0.43
Smo161430 (PACid_15401681)
0.58 0.74 0.81 0.77 0.77 0.72 0.89 0.89 0.95 1.0 0.91 0.86 0.67 0.5 0.96 0.53 0.44 0.3 0.42 0.39 0.48 0.23 0.53 0.51 0.38 0.91 0.38 0.42 0.54 0.58 0.45 0.46
Smo234188 (PACid_15423242)
0.24 0.19 0.25 0.24 0.28 0.25 0.35 0.29 0.49 0.48 0.43 0.47 0.07 0.04 0.89 0.11 0.36 0.21 0.15 0.24 0.18 1.0 0.18 0.09 0.04 0.04 0.03 0.05 0.37 0.34 0.29 0.17
Smo267868 (PACid_15414436)
0.27 0.28 0.32 0.32 0.3 0.4 0.63 0.39 0.62 0.49 0.43 0.36 0.2 0.14 1.0 0.18 0.74 0.38 0.51 0.33 0.12 0.78 0.08 0.13 0.04 0.1 0.06 0.12 0.46 0.53 0.17 0.11
Smo2945 (PACid_15413917)
0.43 0.62 0.76 0.87 0.87 0.66 0.96 0.9 1.0 0.96 0.78 0.76 0.2 0.43 0.96 0.41 0.6 0.53 0.42 0.0 0.0 0.0 0.58 0.45 0.01 0.63 0.19 0.22 0.57 0.57 0.67 0.71
Smo33809 (PACid_15403364)
0.83 0.71 0.81 0.74 0.78 0.86 0.84 0.68 0.75 0.77 0.85 0.77 0.37 0.37 1.0 0.42 0.78 0.5 0.48 0.0 0.01 0.06 0.63 0.52 0.03 0.23 0.43 0.55 0.66 0.83 0.52 0.43
Smo38281 (PACid_15413733)
0.54 0.53 0.53 0.59 0.51 0.66 0.68 0.44 0.73 0.65 0.59 0.6 0.25 0.46 0.98 0.23 0.81 1.0 0.17 0.08 0.02 0.17 0.33 0.32 0.01 0.03 0.05 0.03 0.62 0.62 0.58 0.65
Smo403928 (PACid_15411128)
0.66 0.75 0.79 0.89 0.68 0.84 0.72 1.0 0.76 0.76 0.91 0.83 0.3 0.59 0.61 0.33 0.25 0.11 0.44 0.97 0.19 0.24 0.34 0.42 0.48 0.51 0.49 0.46 0.25 0.23 0.28 0.22
Smo405136 (PACid_15410837)
0.32 0.45 0.51 0.53 0.6 0.66 0.59 0.4 0.42 0.37 0.39 0.33 0.23 0.25 0.9 0.26 0.88 0.62 0.09 0.11 0.06 1.0 0.32 0.41 0.08 0.06 0.1 0.11 0.46 0.57 0.35 0.24
Smo405848 (PACid_15416198)
0.38 0.51 0.7 0.72 0.85 0.82 0.87 0.71 1.0 0.76 0.79 0.51 0.04 0.19 0.86 0.1 0.41 0.45 0.28 0.51 0.04 0.2 0.24 0.2 0.06 0.23 0.18 0.26 0.3 0.37 0.29 0.43
Smo405992 (PACid_15417071)
0.36 0.29 0.24 0.22 0.29 0.36 0.34 0.38 0.4 0.39 0.34 0.34 0.05 0.05 1.0 0.14 0.42 0.44 0.37 0.41 0.05 0.92 0.18 0.04 0.08 0.15 0.42 0.39 0.32 0.38 0.14 0.15
Smo406756 (PACid_15418375)
0.57 0.65 0.68 0.56 0.58 0.62 0.69 0.47 0.63 0.62 0.73 0.61 0.2 0.38 1.0 0.53 0.54 0.59 0.39 0.07 0.06 0.48 0.17 0.19 0.05 0.2 0.26 0.24 0.46 0.55 0.27 0.23
Smo406781 (PACid_15418419)
0.41 0.29 0.27 0.35 0.34 0.35 0.41 0.25 0.46 0.41 0.39 0.32 0.08 0.09 1.0 0.12 0.35 0.3 0.76 0.03 0.03 0.69 0.04 0.06 0.01 0.13 0.15 0.12 0.19 0.25 0.24 0.24
Smo407674 (PACid_15420563)
0.3 0.53 0.61 0.61 0.61 0.73 0.39 0.28 0.34 0.26 0.25 0.23 0.26 0.05 0.23 0.14 0.68 1.0 0.06 0.19 0.1 0.53 0.2 0.08 0.05 0.05 0.12 0.17 0.32 0.43 0.28 0.2
Smo409213 (PACid_15423097)
0.59 0.6 0.6 0.69 0.63 0.6 0.62 0.6 0.56 0.64 0.58 0.63 0.55 0.53 1.0 0.73 0.51 0.42 0.7 0.14 0.3 0.53 0.4 0.48 0.4 0.6 0.49 0.56 0.5 0.5 0.54 0.67
Smo410628 (PACid_15407061)
0.29 0.3 0.38 0.42 0.32 0.39 0.38 0.33 0.3 0.44 0.44 0.35 0.49 0.64 0.56 0.46 0.52 1.0 0.18 0.07 0.02 0.03 0.93 0.56 0.03 0.05 0.07 0.07 0.41 0.43 0.29 0.26
Smo413732 (PACid_15416716)
0.75 0.76 0.59 0.8 0.63 0.94 0.85 0.88 0.83 0.85 0.93 0.69 0.36 0.46 1.0 0.29 0.61 0.24 0.39 0.0 0.0 0.12 0.42 0.3 0.11 0.26 0.21 0.27 0.45 0.42 0.75 0.66
Smo414690 (PACid_15419084)
0.35 0.41 0.43 0.47 0.43 0.58 0.56 0.35 0.43 0.37 0.34 0.25 0.28 1.0 0.76 0.82 0.68 0.53 0.18 0.01 0.01 0.07 0.31 0.29 0.03 0.09 0.12 0.18 0.39 0.49 0.52 0.28
Smo416379 (PACid_15422462)
0.59 0.78 1.0 0.79 0.69 0.7 0.69 0.41 0.45 0.47 0.5 0.44 0.68 0.84 0.65 0.72 0.66 1.0 0.36 0.01 0.11 0.0 0.56 0.68 0.17 0.19 0.36 0.42 0.42 0.39 0.24 0.26
Smo419187 (PACid_15407354)
0.78 0.84 0.75 0.72 0.66 0.78 0.89 0.54 0.89 0.8 0.74 0.82 0.34 0.44 0.78 0.31 1.0 0.75 0.24 0.23 0.27 0.49 0.38 0.23 0.08 0.08 0.13 0.19 0.72 0.74 0.52 0.46
Smo419447 (PACid_15409662)
0.4 0.69 1.0 0.93 0.95 0.86 0.91 0.84 0.85 0.98 0.78 0.57 0.23 0.22 0.72 0.19 0.49 0.37 0.88 0.0 0.0 0.0 0.45 0.24 0.0 0.2 0.25 0.38 0.18 0.31 0.27 0.2
Smo420092 (PACid_15409940)
0.49 0.62 0.9 0.81 0.9 0.82 0.97 0.79 0.88 0.88 0.81 0.6 0.16 0.23 0.73 0.27 0.86 1.0 0.23 0.56 0.16 0.95 0.56 0.35 0.07 0.32 0.22 0.35 0.55 0.68 0.54 0.5
Smo424757 (PACid_15404462)
0.38 0.46 0.53 0.48 0.45 0.44 0.42 0.24 0.35 0.36 0.37 0.36 0.08 0.25 0.77 0.05 0.87 1.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.05 0.08 0.12 0.45 0.46 0.3 0.24
Smo429380 (PACid_15416221)
0.67 0.76 0.62 0.71 0.71 0.71 0.81 0.77 0.75 0.84 0.71 0.78 0.05 0.55 0.48 0.13 0.41 0.51 0.68 0.65 0.17 0.17 0.46 0.28 0.65 0.7 0.95 1.0 0.37 0.36 0.25 0.28
Smo430475 (PACid_15420154)
0.47 0.55 0.69 0.68 0.6 0.63 0.56 0.44 0.49 0.43 0.43 0.38 0.24 0.61 0.61 0.62 0.62 1.0 0.2 0.01 0.0 0.01 0.46 0.46 0.0 0.13 0.16 0.16 0.35 0.41 0.29 0.22
Smo44115 (PACid_15408131)
0.63 0.6 0.49 0.43 0.34 0.39 0.58 0.61 0.81 0.75 0.8 0.71 0.24 0.18 1.0 0.36 0.38 0.29 0.39 0.03 0.02 0.05 0.31 0.36 0.0 0.39 0.16 0.15 0.43 0.48 0.43 0.47
Smo443341 (PACid_15412991)
0.29 0.43 0.5 0.46 0.5 0.51 0.44 0.3 0.34 0.34 0.35 0.31 0.45 1.0 0.14 0.34 0.61 0.47 0.07 0.03 0.01 0.11 0.49 0.33 0.04 0.11 0.09 0.14 0.36 0.46 0.22 0.2
Smo443554 (PACid_15414632)
0.47 0.61 0.75 0.66 0.72 0.79 0.65 0.61 0.58 0.51 0.62 0.39 0.83 0.79 0.51 1.0 0.54 0.77 0.44 0.23 0.12 0.27 0.9 0.92 0.07 0.21 0.3 0.44 0.47 0.49 0.33 0.27
Smo444337 (PACid_15415912)
0.53 0.61 0.6 0.49 0.57 0.66 0.79 0.48 0.74 0.69 0.7 0.59 0.53 0.82 0.79 0.47 1.0 0.89 0.07 0.01 0.0 0.01 0.22 0.12 0.0 0.07 0.09 0.12 0.52 0.57 0.27 0.21
Smo445643 (PACid_15421034)
0.41 0.53 0.56 0.46 0.48 0.46 0.57 0.39 0.44 0.44 0.49 0.37 0.46 0.64 0.71 0.51 0.87 0.87 0.15 0.03 0.02 0.04 1.0 0.97 0.01 0.08 0.1 0.17 0.52 0.59 0.44 0.34
Smo48156 (PACid_15420012)
0.64 0.62 0.59 0.51 0.74 0.75 0.51 0.6 0.54 0.42 0.45 0.44 0.53 0.37 1.0 0.6 0.5 0.6 0.62 0.03 0.15 0.41 0.41 0.4 0.04 0.26 0.36 0.36 0.45 0.48 0.48 0.47
Smo52561 (PACid_15412772)
0.49 0.51 0.59 0.51 0.49 0.56 0.52 0.47 0.44 0.52 0.41 0.42 0.54 0.35 1.0 0.52 0.32 0.4 0.55 0.0 0.0 0.12 0.46 0.47 0.19 0.42 0.39 0.38 0.33 0.39 0.22 0.33
Smo54741 (PACid_15420092)
0.57 0.77 0.81 0.72 0.77 0.82 0.81 0.68 0.9 0.82 0.74 0.71 0.33 0.69 1.0 0.38 0.72 0.76 0.32 0.15 0.06 0.14 0.47 0.33 0.13 0.29 0.63 0.69 0.63 0.7 0.3 0.32
Smo61378 (PACid_15415588)
0.63 0.59 0.59 0.56 0.54 0.62 0.72 0.41 0.53 0.54 0.6 0.53 0.29 0.2 1.0 0.35 0.53 0.44 0.23 0.62 0.19 0.59 0.24 0.23 0.17 0.15 0.27 0.3 0.35 0.43 0.2 0.19
Smo64465 (PACid_15402644)
0.71 0.86 0.59 0.68 0.64 0.77 0.82 0.77 0.74 0.8 0.71 0.51 0.23 0.32 1.0 0.37 0.61 0.3 0.51 0.13 0.0 0.09 0.35 0.28 0.09 0.39 0.79 0.66 0.51 0.42 0.41 0.53
Smo67913 (PACid_15415251)
0.36 0.41 0.38 0.36 0.39 0.4 0.37 0.34 0.35 0.39 0.37 0.3 0.21 0.56 1.0 0.33 0.53 0.73 0.4 0.01 0.08 0.03 0.58 0.48 0.03 0.1 0.15 0.16 0.38 0.44 0.34 0.34
Smo71657 (PACid_15402571)
0.44 0.68 0.63 0.57 0.5 0.58 0.53 0.46 0.48 0.34 0.34 0.41 0.6 0.41 0.78 0.58 0.57 1.0 0.55 0.1 0.0 0.0 0.64 0.5 0.02 0.39 0.74 0.79 0.49 0.39 0.48 0.5
Smo74030 (PACid_15406723)
0.64 0.72 0.87 0.84 0.76 0.73 0.82 0.59 0.85 0.77 0.71 0.62 0.16 0.37 1.0 0.34 0.89 0.24 0.13 0.02 0.0 0.0 0.27 0.2 0.01 0.15 0.16 0.24 0.6 0.66 0.46 0.24
Smo74114 (PACid_15407384)
0.5 0.47 0.5 0.37 0.46 0.4 0.45 0.29 0.49 0.42 0.51 0.4 0.07 0.02 1.0 0.09 0.66 0.34 0.1 0.7 0.18 0.71 0.02 0.01 0.08 0.08 0.13 0.19 0.39 0.45 0.19 0.1
Smo75450 (PACid_15412815)
0.43 0.63 0.73 0.67 0.7 0.65 0.54 0.34 0.41 0.4 0.37 0.34 0.98 1.0 0.16 0.81 0.8 0.85 0.29 0.03 0.11 0.06 0.94 0.67 0.13 0.12 0.23 0.25 0.53 0.61 0.49 0.51
Smo77069 (PACid_15415675)
0.84 0.83 0.83 0.84 0.94 0.91 0.85 0.87 0.86 1.0 0.84 0.86 0.56 0.71 0.86 0.57 0.44 0.28 0.57 0.64 0.73 0.7 0.48 0.43 0.99 0.53 0.56 0.55 0.47 0.53 0.3 0.3
Smo78419 (PACid_15421371)
0.5 0.61 0.64 0.78 0.84 0.83 0.74 0.67 0.75 0.7 0.64 0.53 0.59 0.5 1.0 0.66 0.56 0.41 0.78 0.27 0.22 0.33 0.59 0.59 0.41 0.31 0.43 0.41 0.48 0.54 0.35 0.34
Smo78641 (PACid_15422958)
0.29 0.36 0.52 0.35 0.55 0.51 0.39 0.39 0.36 0.19 0.26 0.28 0.08 0.24 0.88 0.1 0.34 0.57 0.91 0.29 0.19 1.0 0.2 0.1 0.19 0.18 0.41 0.46 0.24 0.25 0.17 0.11
Smo80116 (PACid_15402938)
0.68 0.9 0.88 0.81 0.87 0.84 0.94 0.66 0.88 0.94 0.94 0.84 0.78 1.0 0.67 0.6 0.95 0.95 0.32 0.25 0.33 0.63 0.66 0.42 0.11 0.26 0.23 0.28 0.61 0.72 0.48 0.49
Smo81473 (PACid_15408279)
0.72 0.72 0.74 0.66 0.66 0.68 0.78 0.7 0.99 0.9 0.94 0.83 0.31 0.47 1.0 0.45 0.9 0.45 0.23 0.09 0.14 0.11 0.25 0.16 0.05 0.18 0.17 0.21 0.69 0.78 0.33 0.27
Smo83012 (PACid_15411085)
0.52 0.74 0.72 0.89 0.86 1.0 0.75 0.66 0.78 0.66 0.59 0.49 0.12 0.23 0.87 0.3 0.89 0.54 0.25 0.82 0.15 0.67 0.29 0.1 0.12 0.4 0.55 0.7 0.53 0.66 0.47 0.3
Smo85451 (PACid_15419991)
0.6 0.72 0.81 0.82 0.79 0.76 0.81 0.68 0.79 0.71 0.68 0.63 0.31 0.6 0.98 0.35 1.0 0.71 0.39 0.38 0.13 0.46 0.54 0.39 0.06 0.4 0.48 0.67 0.77 0.91 0.57 0.46
Smo85778 (PACid_15422243)
0.44 0.61 0.59 0.67 0.65 0.66 0.54 0.41 0.45 0.46 0.44 0.38 0.3 1.0 0.21 0.31 0.63 0.74 0.35 0.0 0.02 0.0 0.62 0.4 0.25 0.18 0.31 0.39 0.36 0.4 0.3 0.26
Smo86022 (PACid_15419800)
0.6 0.61 0.58 0.56 0.57 0.64 0.59 0.64 0.74 0.72 0.86 0.66 0.08 0.09 1.0 0.26 0.91 0.67 0.13 0.17 0.08 0.58 0.48 0.53 0.03 0.23 0.28 0.3 0.55 0.64 0.54 0.44
Smo89194 (PACid_15407072)
0.52 0.68 0.77 0.7 0.62 0.65 0.76 0.67 0.85 0.91 0.88 0.8 0.27 0.27 1.0 0.34 0.52 0.37 0.64 0.07 0.0 0.0 0.26 0.34 0.03 0.34 0.23 0.2 0.42 0.45 0.47 0.4
Smo8958 (PACid_15409007)
0.81 0.86 0.82 0.78 0.72 0.87 0.75 0.61 0.65 0.61 0.59 0.6 0.63 0.53 1.0 0.63 0.67 1.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.49 0.53 0.0 0.42 0.58 0.61 0.65 0.66 0.65 0.71
Smo89766 (PACid_15411742)
0.44 0.53 0.54 0.57 0.72 0.74 0.7 0.67 0.56 0.53 0.45 0.45 0.46 0.33 1.0 0.59 0.4 0.52 0.78 0.19 0.12 0.33 0.58 0.65 0.07 0.39 0.33 0.36 0.47 0.48 0.36 0.41
Smo91996 (PACid_15419415)
0.81 0.73 0.73 0.71 0.74 0.68 0.74 0.63 0.78 0.8 0.73 0.76 0.35 0.4 1.0 0.41 0.62 0.46 0.45 0.02 0.08 0.06 0.4 0.43 0.07 0.46 0.46 0.53 0.55 0.57 0.49 0.54
Smo92818 (PACid_15421295)
0.73 0.62 0.65 0.56 0.51 0.56 0.65 0.75 0.94 1.0 0.94 0.78 0.21 0.18 0.88 0.28 0.61 0.49 0.28 0.3 0.31 0.76 0.2 0.16 0.04 0.46 0.22 0.19 0.57 0.55 0.39 0.41
Smo96441 (PACid_15407667)
0.16 0.23 0.26 0.43 0.61 0.97 0.71 0.49 0.29 0.24 0.18 0.14 0.19 0.06 0.06 0.27 0.4 1.0 0.28 0.25 0.58 0.58 0.5 0.37 0.18 0.14 0.21 0.19 0.25 0.24 0.16 0.17
Smo97331 (PACid_15409914)
0.42 0.58 0.64 0.47 0.56 0.56 0.51 0.34 0.49 0.44 0.52 0.43 0.52 0.76 0.86 0.36 1.0 0.77 0.2 0.0 0.06 0.04 0.57 0.16 0.05 0.12 0.25 0.31 0.64 0.77 0.38 0.33
Smo98457 (PACid_15413735)
0.22 0.44 0.4 0.36 0.3 0.31 0.34 0.19 0.28 0.29 0.3 0.3 0.09 1.0 0.47 0.75 0.55 0.36 0.12 0.06 0.1 0.3 0.21 0.14 0.11 0.09 0.14 0.12 0.4 0.34 0.09 0.1
Smo98891 (PACid_15416813)
0.41 0.71 0.7 0.53 0.52 0.49 0.34 0.22 0.2 0.27 0.29 0.27 0.14 0.83 0.19 0.25 1.0 0.61 0.21 0.02 0.01 0.02 0.67 0.26 0.07 0.22 0.21 0.31 0.42 0.45 0.13 0.1
Smo99375 (PACid_15415907)
0.53 0.54 0.58 0.59 0.6 0.55 0.68 0.42 0.62 0.58 0.56 0.55 0.25 0.15 1.0 0.27 0.84 0.67 0.22 0.78 0.48 0.35 0.2 0.14 0.48 0.28 0.24 0.3 0.62 0.57 0.32 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)