Heatmap: Cluster_70 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo114089 (PACid_15416238)
0.22 0.2 0.27 0.39 0.41 0.4 0.4 0.45 0.4 0.38 0.31 0.24 0.06 0.07 0.0 0.05 0.24 0.02 0.33 0.02 0.09 0.0 0.25 0.25 0.22 1.0 0.31 0.21 0.28 0.26 0.2 0.19
Smo116855 (PACid_15405740)
0.21 0.2 0.27 0.37 0.37 0.34 0.37 0.43 0.38 0.38 0.31 0.27 0.07 0.06 0.0 0.07 0.21 0.21 0.33 0.01 0.07 0.0 0.22 0.21 0.18 1.0 0.29 0.22 0.25 0.22 0.17 0.15
Smo117320 (PACid_15404695)
0.25 0.34 0.3 0.42 0.47 0.48 0.43 0.47 0.31 0.42 0.3 0.28 0.37 0.15 0.25 0.34 0.18 0.12 0.45 0.0 0.0 0.0 0.26 0.29 0.05 0.81 1.0 0.72 0.25 0.23 0.2 0.24
Smo117402 (PACid_15405471)
0.4 0.62 0.65 0.55 0.7 0.69 0.42 0.62 0.25 0.34 0.54 0.4 0.0 0.14 0.15 0.0 0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.55 0.68 0.02 0.0 0.22 0.28
Smo125279 (PACid_15405458)
0.45 0.28 0.68 0.57 0.68 0.62 0.55 0.78 0.8 0.61 0.96 0.54 0.0 0.29 0.25 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0 0.52 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo135166 (PACid_15411947)
0.44 0.41 0.36 0.3 0.37 0.37 0.39 0.32 0.28 0.41 0.42 0.39 0.15 0.19 0.3 0.16 0.16 0.1 0.19 0.04 0.0 0.19 0.14 0.14 0.09 1.0 0.6 0.73 0.19 0.18 0.08 0.1
Smo140340 (PACid_15405936)
0.6 0.64 0.57 0.67 0.73 0.63 0.67 0.67 0.65 0.64 0.67 0.65 0.16 0.22 0.39 0.26 0.45 0.34 0.36 0.15 0.25 0.28 0.27 0.21 0.61 0.84 0.98 1.0 0.4 0.43 0.33 0.24
Smo150191 (PACid_15411806)
0.26 0.23 0.23 0.32 0.41 0.41 0.3 0.45 0.28 0.36 0.27 0.26 0.14 0.11 0.02 0.15 0.06 0.04 0.15 0.02 0.08 0.02 0.14 0.14 0.12 0.84 1.0 0.77 0.06 0.06 0.09 0.13
Smo163608 (PACid_15408994)
0.59 0.59 0.6 0.56 0.59 0.57 0.56 0.61 0.56 0.63 0.62 0.54 0.4 0.36 0.42 0.45 0.29 0.19 0.42 0.24 0.34 0.42 0.32 0.33 0.35 1.0 0.85 0.87 0.38 0.4 0.24 0.24
Smo230764 (PACid_15416202)
0.29 0.26 0.31 0.31 0.4 0.25 0.22 0.26 0.3 0.63 0.36 0.39 0.19 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.2 1.0 0.52 0.97 0.01 0.01 0.01 0.01
Smo27842 (PACid_15407916)
0.41 0.4 0.28 0.41 0.53 0.44 0.33 0.44 0.4 0.53 0.44 0.39 0.09 0.12 0.17 0.1 0.07 0.02 0.09 0.02 0.0 0.0 0.09 0.1 0.07 1.0 0.67 0.73 0.08 0.08 0.05 0.05
Smo402260 (PACid_15402772)
0.29 0.2 0.27 0.27 0.26 0.23 0.29 0.3 0.2 0.28 0.35 0.2 0.04 0.19 0.29 0.03 0.02 0.02 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.02 0.04 0.64 0.63 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02
Smo403579 (PACid_15407984)
0.37 0.36 0.32 0.42 0.44 0.42 0.31 0.36 0.43 0.41 0.38 0.42 0.01 0.07 0.03 0.01 0.01 0.13 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.75 1.0 0.85 0.01 0.0 0.01 0.0
Smo403932 (PACid_15411144)
0.17 0.22 0.24 0.22 0.17 0.3 0.29 0.44 0.29 0.36 0.34 0.3 0.01 0.0 0.02 0.01 0.11 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.25 0.1 0.06 1.0 0.16 0.28 0.13 0.18 0.08 0.06
Smo405613 (PACid_15414685)
0.45 0.34 0.35 0.37 0.3 0.39 0.35 0.35 0.35 0.34 0.35 0.31 0.07 0.07 0.14 0.08 0.15 0.13 0.13 0.14 0.19 0.25 0.11 0.09 0.47 0.49 0.89 1.0 0.14 0.13 0.12 0.13
Smo405957 (PACid_15416980)
0.55 0.34 0.61 0.46 0.62 0.5 0.42 0.65 0.54 0.85 0.56 0.6 0.01 0.53 0.28 0.01 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.82 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo407730 (PACid_15421140)
0.73 0.61 0.66 0.66 0.71 0.57 0.52 0.65 0.69 0.74 0.75 0.78 0.65 0.3 0.18 0.49 0.24 0.26 0.31 0.04 0.3 0.3 0.34 0.39 0.26 1.0 0.85 0.71 0.26 0.25 0.29 0.39
Smo407845 (PACid_15421930)
0.54 0.44 0.45 0.35 0.57 0.33 0.42 0.5 0.52 0.58 0.71 0.46 0.03 0.13 0.05 0.12 0.08 0.11 0.19 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.08 0.53 1.0 0.91 0.06 0.06 0.05 0.05
Smo407856 (PACid_15421952)
0.33 0.23 0.13 0.21 0.14 0.2 0.18 0.25 0.28 0.29 0.35 0.3 0.03 0.19 0.04 0.13 0.03 0.02 0.12 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.12 1.0 0.73 0.6 0.05 0.06 0.05 0.07
Smo410255 (PACid_15404079)
0.1 0.09 0.22 0.3 0.3 0.28 0.28 0.43 0.29 0.25 0.19 0.13 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.03 0.05 0.01 0.15 0.01 0.07 0.03 0.42 1.0 0.44 0.29 0.09 0.05 0.12 0.06
Smo410480 (PACid_15405719)
0.5 0.48 0.53 0.52 0.62 0.56 0.49 0.54 0.53 0.54 0.61 0.52 0.35 0.22 0.13 0.22 0.07 0.13 0.09 0.08 0.08 0.0 0.16 0.17 0.27 1.0 0.74 0.53 0.06 0.08 0.08 0.1
Smo412048 (PACid_15408410)
0.36 0.45 0.46 0.41 0.38 0.46 0.46 0.56 0.54 0.5 0.55 0.56 0.05 0.26 0.3 0.08 0.05 0.16 0.11 0.01 0.18 0.0 0.06 0.13 0.36 1.0 0.69 0.53 0.06 0.07 0.03 0.07
Smo412240 (PACid_15410016)
0.4 0.47 0.6 0.42 0.47 0.49 0.51 0.54 0.44 0.46 0.48 0.43 0.02 0.32 0.37 0.01 0.01 0.02 0.03 0.15 0.12 0.24 0.01 0.03 0.13 0.7 1.0 0.83 0.01 0.01 0.01 0.0
Smo415080 (PACid_15417334)
0.55 0.65 0.45 0.59 0.49 0.6 0.53 0.48 0.48 0.56 0.36 0.51 0.26 0.19 0.26 0.29 0.23 0.28 0.4 0.45 0.01 0.17 0.27 0.24 0.06 0.75 1.0 0.9 0.24 0.24 0.25 0.25
Smo416451 (PACid_15423143)
0.12 0.14 0.25 0.25 0.39 0.16 0.19 0.37 0.41 0.41 0.31 0.31 0.04 0.03 0.01 0.02 0.1 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.05 1.0 0.31 0.16 0.16 0.11 0.23 0.2
Smo416810 (PACid_15403763)
0.67 0.44 0.39 0.3 0.23 0.35 0.48 0.44 0.67 0.64 0.64 1.0 0.11 0.75 0.31 0.32 0.08 0.09 0.32 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.08 0.88 0.21 0.13 0.18 0.23 0.18 0.14
Smo416934 (PACid_15404591)
0.47 0.44 0.47 0.48 0.5 0.48 0.54 0.48 0.46 0.49 0.44 0.43 0.34 0.25 0.35 0.33 0.25 0.2 0.37 0.07 0.16 0.29 0.28 0.25 0.24 0.89 0.98 1.0 0.26 0.3 0.27 0.27
Smo418014 (PACid_15403505)
0.71 0.69 0.88 0.92 0.81 0.64 0.57 0.58 0.61 0.73 0.79 0.71 0.53 0.47 0.26 0.48 0.26 0.17 0.31 0.01 0.2 0.03 0.32 0.32 0.16 1.0 0.85 0.78 0.16 0.22 0.23 0.36
Smo419760 (PACid_15412019)
0.47 0.36 0.28 0.37 0.41 0.32 0.34 0.49 0.5 0.46 0.52 0.54 0.09 0.21 0.21 0.12 0.04 0.01 0.06 0.05 0.13 0.14 0.06 0.07 0.35 1.0 0.97 0.92 0.04 0.05 0.05 0.05
Smo419769 (PACid_15412027)
0.43 0.32 0.23 0.3 0.29 0.27 0.28 0.39 0.39 0.38 0.42 0.47 0.1 0.16 0.14 0.1 0.1 0.08 0.08 0.03 0.13 0.05 0.11 0.1 0.26 0.84 1.0 0.88 0.09 0.09 0.11 0.08
Smo423335 (PACid_15420865)
0.42 0.39 0.25 0.31 0.32 0.46 0.22 0.44 0.31 0.31 0.35 0.35 0.04 0.22 0.15 0.04 0.02 0.0 0.04 0.04 0.04 0.12 0.03 0.02 0.28 0.93 1.0 0.78 0.03 0.02 0.03 0.01
Smo423776 (PACid_15401658)
0.26 0.27 0.22 0.3 0.37 0.31 0.3 0.42 0.38 0.32 0.31 0.29 0.17 0.15 0.13 0.2 0.17 0.02 0.15 0.08 0.03 0.25 0.21 0.22 0.18 0.93 1.0 0.73 0.18 0.16 0.19 0.19
Smo424143 (PACid_15422165)
0.63 0.57 0.7 0.67 0.87 0.66 0.59 0.73 0.67 0.54 0.7 0.76 0.2 0.39 0.39 0.23 0.2 0.3 0.2 0.23 0.3 0.1 0.19 0.19 0.28 1.0 0.84 0.68 0.17 0.26 0.21 0.18
Smo424808 (PACid_15405160)
0.45 0.36 0.24 0.31 0.25 0.32 0.37 0.54 0.5 0.46 0.45 0.48 0.17 0.2 0.14 0.26 0.18 0.05 0.3 0.01 0.09 0.05 0.22 0.25 0.47 1.0 0.69 0.77 0.2 0.23 0.18 0.17
Smo429326 (PACid_15416109)
0.37 0.24 0.24 0.4 0.42 0.46 0.38 0.57 0.49 0.44 0.42 0.41 0.0 0.1 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.09 1.0 0.64 0.72 0.0 0.01 0.01 0.0
Smo431867 (PACid_15403707)
0.43 0.33 0.26 0.34 0.29 0.28 0.29 0.42 0.38 0.41 0.42 0.48 0.11 0.18 0.17 0.13 0.11 0.03 0.11 0.07 0.13 0.09 0.12 0.12 0.42 0.93 1.0 0.89 0.09 0.1 0.11 0.09
Smo432445 (PACid_15403499)
0.44 0.33 0.25 0.34 0.34 0.31 0.33 0.45 0.51 0.45 0.46 0.53 0.13 0.18 0.13 0.13 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.09 0.1 0.11 0.42 1.0 0.88 0.86 0.1 0.11 0.08 0.04
Smo437462 (PACid_15418280)
0.28 0.33 0.34 0.31 0.39 0.45 0.45 0.48 0.37 0.4 0.32 0.3 0.24 0.19 0.16 0.28 0.15 0.18 0.4 0.12 0.04 0.01 0.17 0.18 0.21 0.62 1.0 0.75 0.18 0.18 0.24 0.41
Smo438416 (PACid_15421012)
0.37 0.39 0.41 0.39 0.44 0.4 0.49 0.42 0.41 0.42 0.45 0.38 0.19 0.17 0.38 0.22 0.23 0.19 0.26 0.29 0.1 0.17 0.17 0.16 0.19 0.87 0.91 1.0 0.21 0.21 0.18 0.17
Smo439256 (PACid_15422500)
0.82 0.72 0.61 0.68 0.79 0.74 0.63 0.65 0.66 0.76 0.62 0.64 0.58 0.37 0.59 0.61 0.34 0.38 0.67 0.34 0.22 0.45 0.39 0.42 0.32 1.0 0.99 0.91 0.41 0.41 0.27 0.26
Smo439331 (PACid_15423182)
0.6 0.63 0.64 0.65 0.67 0.67 0.59 0.6 0.57 0.56 0.58 0.52 0.45 0.52 0.77 0.55 0.43 0.37 0.56 0.33 0.29 0.61 0.46 0.46 0.32 0.78 1.0 0.94 0.36 0.36 0.39 0.43
Smo440203 (PACid_15403255)
0.46 0.42 0.42 0.48 0.49 0.44 0.51 0.57 0.58 0.61 0.59 0.54 0.27 0.32 0.4 0.27 0.22 0.14 0.25 0.18 0.08 0.16 0.25 0.24 0.21 0.94 0.97 1.0 0.25 0.25 0.28 0.31
Smo441010 (PACid_15404636)
0.53 0.43 0.42 0.41 0.43 0.44 0.43 0.49 0.49 0.52 0.51 0.53 0.36 0.3 0.3 0.44 0.24 0.11 0.43 0.19 0.19 0.25 0.3 0.35 0.38 1.0 0.83 0.84 0.27 0.28 0.27 0.29
Smo441720 (PACid_15410156)
0.83 0.58 0.54 0.49 0.33 0.57 0.49 0.69 0.57 0.77 0.78 0.78 0.1 0.75 0.43 0.11 0.08 0.14 0.23 0.03 0.1 0.25 0.08 0.06 0.24 1.0 0.95 0.7 0.09 0.06 0.14 0.11
Smo443456 (PACid_15413848)
0.37 0.45 0.48 0.41 0.4 0.43 0.46 0.42 0.45 0.56 0.54 0.44 0.14 0.26 0.3 0.22 0.22 0.26 0.48 0.0 0.09 0.02 0.19 0.19 0.19 0.94 1.0 0.84 0.19 0.23 0.22 0.4
Smo48406 (PACid_15422067)
0.35 0.28 0.37 0.35 0.42 0.29 0.26 0.25 0.43 0.27 0.39 0.3 0.14 0.17 0.18 0.19 0.09 0.08 0.24 0.0 0.13 0.07 0.12 0.09 0.21 1.0 0.65 0.61 0.11 0.1 0.11 0.09
Smo65258 (PACid_15403968)
0.15 0.12 0.28 0.32 0.39 0.24 0.3 0.44 0.33 0.34 0.3 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.16 1.0 0.3 0.5 0.03 0.06 0.01 0.0
Smo65428 (PACid_15405489)
0.27 0.26 0.57 0.5 0.49 0.5 0.36 0.72 0.56 0.44 0.38 0.35 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 1.0 0.27 0.8 0.02 0.04 0.01 0.0
Smo70988 (PACid_15402066)
0.28 0.34 0.63 0.62 0.66 0.58 0.53 0.75 0.63 0.61 0.56 0.48 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.05 1.0 0.55 0.93 0.02 0.05 0.01 0.0
Smo85507 (PACid_15420647)
0.19 0.13 0.2 0.18 0.25 0.15 0.14 0.15 0.23 0.32 0.25 0.23 0.03 0.02 0.06 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.22 0.01 0.02 0.11 1.0 0.52 0.78 0.01 0.01 0.0 0.0
Smo87307 (PACid_15402586)
0.31 0.33 0.28 0.33 0.28 0.32 0.35 0.36 0.37 0.39 0.36 0.34 0.06 0.18 0.25 0.07 0.11 0.19 0.07 0.0 0.01 0.0 0.08 0.06 0.15 0.79 1.0 0.77 0.13 0.1 0.12 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)