Heatmap: Cluster_208 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101075 (PACid_15422469)
0.33 0.02 0.24 -0.09 -0.01 0.22 0.53 0.76 0.84 1.03 0.81 0.7 -0.14 -0.56 0.08 0.22 -0.44 -1.0 0.1 - -4.58 -5.03 -0.31 -0.53 -1.29 0.09 -0.01 -0.21 -0.1 0.11 0.12 -0.02
Smo104859 (PACid_15415109)
0.54 0.39 0.43 0.4 0.35 0.31 0.39 0.52 0.46 0.63 0.45 0.53 0.03 -0.23 -0.68 0.08 -0.31 -0.87 0.28 -8.88 -6.26 -8.55 0.09 -0.04 -4.0 -0.07 -0.18 -0.03 0.27 0.3 0.09 0.01
Smo109200 (PACid_15402579)
0.76 0.78 0.44 0.62 0.54 0.62 0.47 0.37 0.46 0.65 0.39 0.52 0.13 -0.44 0.23 0.2 -0.38 -0.17 0.17 -3.11 -4.04 -2.74 -0.52 -0.62 -3.34 -0.61 -0.36 -0.3 -0.33 -0.1 -0.19 -0.38
Smo115839 (PACid_15402741)
0.02 0.24 0.28 0.3 0.09 0.03 0.39 0.5 0.5 0.62 0.51 0.4 0.54 0.49 -0.07 0.4 -0.5 -1.05 -0.14 -2.96 -2.79 -1.4 -0.02 -0.13 -2.23 0.47 0.33 0.35 -0.36 -0.27 -0.38 -0.84
Smo120998 (PACid_15418639)
0.52 0.16 0.22 0.26 0.24 0.2 0.26 0.64 0.72 0.91 0.86 0.82 0.51 -0.5 -1.1 -0.14 -0.84 -0.27 -0.81 -3.76 -1.84 -3.58 -0.43 -0.48 -1.49 0.8 -0.27 -0.51 -0.52 -0.49 0.0 0.58
Smo132777 (PACid_15407651)
0.21 0.29 0.18 0.33 -0.06 0.26 0.36 0.5 0.52 0.77 0.6 0.48 0.25 0.04 0.47 0.07 -0.66 -0.32 -0.31 -2.09 -0.93 -0.9 -0.35 -0.26 -1.25 -0.04 -0.46 -1.07 -0.73 -0.6 0.27 0.54
Smo136199 (PACid_15414979)
0.27 0.26 0.46 0.23 0.5 0.38 0.47 0.67 0.83 0.83 0.8 0.65 -0.33 -0.51 0.4 -0.04 -0.47 -1.67 -0.1 - - - -0.25 -0.25 - 0.23 -0.37 -0.5 -0.12 -0.06 0.07 0.54
Smo14013 (PACid_15408077)
0.38 0.52 0.56 0.45 0.37 0.54 0.39 0.29 0.4 0.36 0.27 0.15 0.01 -0.12 -0.04 0.0 -0.29 -0.38 -0.22 -2.29 -1.93 -3.81 -0.02 -0.1 -1.19 -0.36 0.13 0.32 -0.06 0.14 -0.16 -0.12
Smo141341 (PACid_15408863)
0.46 0.43 0.37 0.48 0.47 0.16 0.45 0.51 0.53 0.58 0.54 0.38 -0.37 -0.17 -0.17 -0.15 -0.64 -1.49 -0.02 -2.56 -2.77 -4.1 -0.28 -0.11 -2.45 0.32 0.04 -0.12 -0.26 -0.12 0.34 0.71
Smo149865 (PACid_15413971)
0.48 0.54 0.43 0.33 0.39 0.41 0.37 0.36 0.32 0.53 0.39 0.41 0.15 -0.31 -0.16 0.42 -0.46 -0.51 0.21 -0.92 -2.8 -1.93 -0.32 -0.33 -2.18 0.11 -0.09 0.05 -0.21 -0.09 -0.35 -0.21
Smo152221 (PACid_15418237)
-0.06 0.32 0.4 0.37 0.28 0.2 0.55 0.47 0.48 0.69 0.52 0.46 0.67 0.5 0.26 0.86 -0.52 -1.19 -0.42 -2.83 -3.29 -3.76 -1.08 -1.09 -1.08 0.14 0.27 0.27 -0.3 -0.2 -0.64 -0.59
Smo164705 (PACid_15412739)
-0.26 0.04 0.25 0.12 0.08 0.05 0.36 0.43 0.42 0.51 0.34 0.23 0.32 0.43 0.12 0.41 -0.83 -1.1 -0.72 -3.24 -2.06 -1.65 0.12 0.19 -1.83 0.78 0.68 0.53 -0.57 -0.6 -0.09 0.1
Smo170452 (PACid_15405988)
0.22 -0.02 0.16 0.29 0.55 0.53 0.48 0.6 0.61 0.63 0.55 0.3 0.17 -0.09 0.19 0.09 -0.65 -0.99 -0.08 -2.4 -2.04 -0.57 -0.23 -0.15 -1.87 0.5 0.09 0.06 -0.46 -0.38 -0.63 -0.38
Smo171237 (PACid_15407276)
0.26 0.28 0.3 0.27 0.36 0.28 0.33 0.43 0.42 0.53 0.4 0.28 0.11 -0.44 0.49 0.12 -0.49 -0.76 0.19 -1.38 -1.37 -0.43 -0.33 -0.23 -1.92 0.07 -0.3 -0.19 -0.15 0.01 -0.06 -0.04
Smo171350 (PACid_15408091)
-0.01 0.06 0.19 0.31 0.25 0.18 0.35 0.61 0.49 0.51 0.51 0.32 0.18 0.23 -0.06 0.3 -0.57 -1.04 -0.11 -7.13 -1.76 -0.53 -0.18 -0.07 -0.03 0.49 0.18 0.3 -0.44 -0.3 -0.69 -0.68
Smo173762 (PACid_15417140)
0.25 0.07 -0.12 0.32 0.37 0.25 0.18 0.48 0.5 0.41 0.32 0.31 0.29 0.08 -0.06 0.29 -0.77 -1.21 0.12 -2.46 -2.91 -2.15 -0.34 0.04 0.06 0.89 0.49 0.66 -0.36 -0.29 -1.21 -0.95
Smo178439 (PACid_15406978)
0.3 0.02 0.17 0.09 0.12 0.05 0.16 0.48 0.69 0.57 0.76 0.59 0.11 0.02 -0.06 0.05 -0.5 -0.45 -0.2 -1.17 -1.24 -0.97 -0.17 -0.05 -2.02 0.38 -0.38 -0.48 -0.16 -0.28 0.01 0.31
Smo230371 (PACid_15413206)
0.2 0.31 0.41 0.19 0.19 0.21 0.28 0.36 0.67 0.62 0.46 0.45 0.19 -0.12 0.48 0.1 -0.34 -1.19 -0.04 -2.52 -2.54 -0.62 -0.18 -0.1 -3.82 0.33 -0.23 -0.14 -0.31 -0.2 0.04 0.18
Smo233605 (PACid_15401686)
0.49 0.61 0.5 0.34 0.25 0.61 0.21 0.3 0.14 0.29 0.11 0.01 0.1 -0.45 -0.02 0.2 -0.22 0.06 0.38 -1.01 -3.85 -3.62 -0.03 -0.08 -0.83 -0.3 0.2 0.24 -0.19 -0.03 -0.36 -0.31
Smo403428 (PACid_15407109)
0.1 0.19 0.2 0.25 0.45 0.27 0.6 0.69 0.69 0.85 0.65 0.54 -0.44 -1.19 0.05 -0.28 -0.43 -0.87 0.01 -1.64 -2.5 -4.96 -0.43 -0.35 -1.18 0.3 0.07 0.16 0.05 0.05 0.12 -0.1
Smo405717 (PACid_15415422)
1.12 0.44 -0.01 0.04 0.39 0.1 0.12 0.66 0.91 1.09 0.6 0.78 0.18 -0.28 -0.3 0.31 -0.8 -0.72 -0.06 -2.65 - - -0.84 -0.62 -5.21 0.12 0.44 -0.24 -0.5 -0.47 -0.2 0.03
Smo406741 (PACid_15418344)
1.01 0.73 0.18 0.27 0.17 0.17 0.12 0.3 0.6 0.68 1.0 0.94 -0.66 0.5 -0.42 0.07 -0.62 -0.36 -1.14 -9.94 - -6.95 -0.11 -0.83 -2.79 1.16 0.23 0.4 -0.69 -0.56 -0.88 -1.11
Smo409045 (PACid_15421624)
-0.07 0.12 0.35 0.11 0.34 -0.18 0.65 0.46 0.61 0.82 0.77 0.61 0.48 0.46 -0.86 1.0 -0.99 -2.02 -0.29 -3.95 -2.01 -6.35 -0.56 -0.12 -0.46 0.83 -0.25 0.35 -0.31 -0.32 -1.03 -1.12
Smo409669 (PACid_15403935)
0.47 0.43 0.22 0.38 0.22 0.3 0.71 0.35 0.64 0.76 0.58 0.56 0.17 -0.33 0.62 0.09 -0.65 -0.39 -0.44 -3.61 -4.11 -2.3 -0.65 -0.48 -3.11 0.04 0.18 -0.08 -0.46 -0.24 0.1 0.1
Smo410074 (PACid_15402623)
0.31 0.45 0.45 0.68 0.37 0.7 0.58 0.44 1.06 1.05 1.01 0.63 0.83 -0.29 0.8 -0.35 -0.32 -0.78 -1.54 -6.4 - -1.25 -1.62 -1.44 - -0.55 -0.95 -0.85 -1.35 -0.7 -0.05 0.29
Smo412517 (PACid_15412243)
0.37 0.24 0.04 0.14 0.13 0.18 0.34 0.34 0.44 0.55 0.57 0.32 -0.11 0.07 0.68 0.52 -0.63 -0.95 0.08 -5.69 -2.95 -0.4 -0.53 -0.56 -3.06 0.46 0.36 0.4 -0.24 -0.24 -0.19 -0.14
Smo413913 (PACid_15418225)
0.73 0.34 0.22 0.13 0.24 0.36 0.3 0.28 0.54 0.58 0.44 0.4 -0.17 -0.23 0.52 0.36 -0.67 -0.28 0.32 -2.84 -1.63 -2.49 -0.27 -0.36 -2.24 -0.16 -0.16 -0.18 -0.08 -0.03 -0.03 0.11
Smo417188 (PACid_15401593)
0.16 0.09 0.07 0.15 0.18 0.25 0.29 0.41 0.42 0.58 0.41 0.43 0.04 0.0 0.25 0.1 -0.67 -0.68 0.05 -1.39 -0.49 -1.18 -0.32 -0.27 -0.8 0.36 0.05 -0.02 -0.36 -0.25 -0.14 0.17
Smo419713 (PACid_15411923)
-0.28 -0.13 0.69 0.45 0.4 0.73 0.22 -0.01 0.15 -0.11 -0.06 -0.33 1.34 0.99 0.94 0.57 -1.98 -2.16 -0.97 - -2.81 -5.89 -1.15 -0.63 -0.26 0.16 1.31 1.35 -1.54 -1.29 -1.97 -2.44
Smo42309 (PACid_15403762)
0.06 0.17 0.08 0.13 0.11 0.12 0.15 0.22 0.22 0.19 0.14 0.11 0.18 0.15 0.47 0.33 -0.35 -0.69 0.16 -1.17 -0.43 -0.12 -0.29 -0.35 -0.4 0.42 0.19 0.32 -0.2 -0.12 -0.52 -0.57
Smo425064 (PACid_15402163)
0.74 0.37 0.39 0.27 0.33 0.29 0.53 0.28 0.43 0.56 0.5 0.68 0.57 -0.35 -0.25 0.03 -0.14 -0.31 0.18 -7.82 - - -0.06 -0.18 -2.36 -0.29 -0.29 -0.18 0.14 0.17 -0.3 -0.04
Smo427034 (PACid_15407849)
0.27 0.08 0.28 0.42 0.29 0.13 0.49 0.57 0.84 0.87 0.87 0.6 0.75 -0.02 0.26 0.08 -0.71 -1.56 -0.01 -6.22 -3.56 -2.11 -0.84 -0.63 -3.95 0.52 0.1 0.08 -0.47 -0.68 -0.36 -0.22
Smo430080 (PACid_15417120)
-0.09 -0.01 -0.03 0.11 0.34 0.22 0.29 0.61 0.55 0.69 0.52 0.45 0.13 -0.46 0.49 0.2 -0.32 -0.41 0.21 -1.18 -1.95 -2.61 -0.33 -0.25 -1.54 0.42 0.03 -0.21 0.04 -0.1 -0.16 -0.07
Smo431495 (PACid_15422993)
0.48 0.36 0.22 0.59 0.46 0.11 0.49 0.44 0.65 0.85 0.6 0.64 -0.17 -0.14 0.25 0.06 -0.41 -2.13 0.12 - -6.09 - -0.12 -0.24 -7.61 0.15 -0.31 -0.32 -0.0 -0.01 0.23 0.29
Smo437729 (PACid_15420506)
-0.02 0.29 0.23 0.48 0.4 0.15 0.33 0.63 0.46 0.38 0.49 0.12 0.96 0.69 0.7 0.69 -1.1 -1.89 -0.64 -3.58 -2.61 -5.1 -0.76 -0.85 -1.51 0.31 0.61 0.59 -0.9 -0.83 -0.47 -0.36
Smo439526 (PACid_15402413)
-0.0 0.35 0.39 0.61 0.55 0.43 0.37 0.21 0.3 0.19 0.12 -0.05 0.63 1.0 0.34 0.74 -0.91 -1.62 -0.74 -2.38 -2.82 -2.68 -0.77 -1.3 -1.07 0.04 1.01 0.99 -0.82 -0.57 -1.08 -0.87
Smo440732 (PACid_15407115)
0.18 0.33 0.3 0.33 0.13 0.05 0.35 0.55 0.64 0.78 0.91 0.78 -0.23 -0.75 -0.4 -0.05 -0.71 -0.62 -0.06 -1.8 -0.86 -2.6 -0.54 -0.49 -0.65 0.62 -0.12 -0.08 -0.27 -0.29 -0.19 0.04
Smo443333 (PACid_15412965)
0.2 0.15 0.27 0.45 0.47 0.36 0.79 0.74 0.47 0.58 0.31 0.16 0.65 0.46 -1.18 0.9 -1.11 -1.02 -0.71 -6.96 -5.01 -7.67 0.01 0.07 -2.39 -0.18 0.38 0.3 -0.66 -0.63 0.29 -0.26
Smo444239 (PACid_15415133)
0.02 0.02 -0.24 -0.13 0.04 -0.13 0.21 0.66 0.67 0.8 0.59 0.33 0.91 0.89 -1.01 1.28 -1.92 -2.57 0.41 -5.25 -1.47 -11.42 -1.41 -0.3 -1.51 0.8 0.62 0.48 -0.79 -0.69 -0.83 -0.62
Smo444771 (PACid_15419068)
-0.43 -0.09 -0.16 0.09 0.16 0.18 0.37 0.63 0.4 0.55 0.43 0.05 -0.01 -0.46 0.81 0.14 -0.43 -0.58 0.09 -1.4 -2.18 -1.46 -0.09 0.1 -1.31 0.74 0.26 0.29 -0.27 -0.09 -0.3 -0.01
Smo444888 (PACid_15419806)
0.04 0.45 0.38 0.33 0.03 0.28 0.3 0.11 0.13 0.31 0.17 -0.0 0.14 0.3 0.58 0.08 -0.49 -2.87 -0.07 -2.03 -0.7 0.02 -0.22 -0.27 0.08 0.21 0.64 0.51 -0.83 -0.69 -0.64 -0.39
Smo4662 (PACid_15417400)
0.25 0.61 0.28 0.38 0.25 0.25 0.35 0.27 0.31 0.22 0.27 0.14 0.02 -0.42 0.35 0.42 -0.02 -0.04 -0.1 -1.3 -1.96 -2.58 0.01 -0.23 -1.93 -0.53 -0.06 -0.17 0.13 0.26 0.0 0.21
Smo50691 (PACid_15407622)
0.37 0.14 0.18 0.41 0.46 0.39 0.35 0.67 0.79 0.62 0.63 0.48 -0.21 -0.44 -0.03 -0.06 -0.27 -0.77 0.06 -2.5 - - -0.08 -0.08 -4.01 0.12 0.33 0.03 -0.05 -0.01 -0.08 -0.04
Smo62477 (PACid_15419210)
0.19 0.77 0.5 0.63 0.5 0.63 0.51 0.5 0.65 0.84 0.53 0.33 -0.04 -0.62 0.36 0.06 -0.3 -1.17 -0.13 - - - -0.19 -0.19 -4.36 -0.76 -0.11 -0.27 -0.38 0.0 0.16 0.25
Smo68846 (PACid_15417424)
0.29 0.13 -0.11 0.26 0.4 0.23 0.41 0.35 0.48 0.37 0.34 0.34 0.12 -0.56 0.62 0.21 -0.04 -0.62 -0.0 -2.55 -2.76 -0.59 0.02 -0.07 -2.87 0.8 0.14 -0.2 -0.22 -0.22 -0.23 -0.33
Smo70140 (PACid_15418195)
0.48 0.33 0.52 0.41 0.48 0.52 0.16 0.36 0.59 0.57 0.44 0.22 -0.0 -0.54 0.19 -0.19 -0.35 -0.35 -0.02 -1.72 -1.52 -1.4 -0.22 -0.16 -1.64 -0.44 -0.09 0.18 -0.31 -0.15 -0.03 -0.04
Smo70262 (PACid_15419062)
0.74 0.33 0.25 0.24 0.4 0.33 0.45 0.28 0.54 0.66 0.39 0.47 -0.45 -0.7 0.37 -0.3 -0.02 -0.27 0.18 -2.87 -2.74 -2.59 -0.06 -0.21 -1.7 -0.42 -0.02 -0.02 0.06 -0.06 0.07 0.1
Smo7061 (PACid_15421441)
0.45 0.57 -0.53 0.57 0.45 0.13 0.6 0.46 0.39 0.32 0.37 0.08 0.41 -0.49 0.02 0.31 -0.2 0.33 0.25 - - - -0.09 -0.27 - -0.11 0.15 0.04 0.25 0.3 -0.08 -0.14
Smo74096 (PACid_15406851)
-0.64 -0.18 0.68 -0.35 -0.22 0.72 -0.24 -0.05 0.79 0.16 -1.5 0.07 1.38 0.94 1.09 0.58 -1.75 -1.51 0.56 -3.45 -2.66 - -1.51 -1.54 -0.78 -0.07 1.65 0.33 -0.44 -0.3 -1.04 -1.51
Smo74731 (PACid_15412146)
0.24 0.02 0.02 -0.0 0.14 0.19 0.27 0.51 0.36 0.36 0.36 0.16 -0.39 -0.59 0.58 -0.37 -0.1 -0.5 -0.14 -0.68 -2.07 -1.09 -0.21 -0.08 -2.61 0.84 0.48 0.46 0.03 0.03 -0.07 -0.22
Smo76597 (PACid_15416551)
0.45 0.47 0.27 0.41 0.54 0.35 0.44 0.46 0.61 0.61 0.5 0.48 0.05 -0.33 0.17 0.11 -0.16 -0.5 0.22 -3.01 -3.7 -4.19 -0.14 -0.23 -2.73 -0.53 -0.18 -0.12 -0.04 0.01 -0.08 -0.01
Smo77895 (PACid_15421702)
0.56 0.24 -0.01 -0.0 -0.14 -0.08 0.21 0.48 0.58 0.76 0.75 0.76 0.0 0.45 -0.01 0.29 -0.88 -1.53 -0.41 -2.29 -2.37 -1.94 -0.58 -0.43 -1.32 0.65 0.06 0.14 -0.19 -0.21 -0.07 0.35
Smo82283 (PACid_15409760)
0.34 0.63 0.63 0.43 0.41 0.57 0.66 0.16 0.15 0.35 0.11 0.25 -0.08 0.29 0.24 0.19 -0.08 -0.43 -0.24 -2.67 -1.82 -1.08 -0.29 -0.15 -2.15 -0.24 0.11 0.2 -0.32 -0.13 -0.42 -0.45
Smo82676 (PACid_15412825)
-0.01 -0.01 0.01 0.06 0.49 -0.31 0.03 0.12 0.19 0.34 0.27 0.29 0.5 0.32 0.33 0.93 -1.16 -4.12 -0.24 -1.66 -4.06 0.01 -0.3 -0.23 -1.11 1.28 0.85 0.74 -0.78 -0.68 -0.86 -1.12
Smo85338 (PACid_15419206)
-0.07 -0.06 0.16 0.16 0.42 0.47 0.51 0.47 0.41 0.57 0.36 0.17 -0.04 -0.35 -0.3 0.13 -0.67 -0.76 -0.08 -1.08 -1.47 -0.5 -0.25 -0.08 -1.32 0.78 0.26 0.33 -0.33 -0.18 -0.3 -0.22
Smo91042 (PACid_15412468)
-0.05 0.11 0.21 0.21 0.35 0.22 0.35 0.66 0.44 0.54 0.42 0.22 0.19 -0.26 0.52 0.08 -0.69 -0.98 0.02 -4.87 -2.27 -1.02 -0.18 -0.02 -0.43 0.58 0.48 0.69 -0.31 -0.31 -1.26 -0.9
Smo91570 (PACid_15416323)
0.0 0.14 0.28 0.31 0.27 0.18 0.55 0.29 0.47 0.58 0.32 0.14 0.7 0.91 -0.6 1.01 -0.87 -1.05 0.32 -3.75 -3.48 -4.49 -0.7 -0.66 -1.86 0.43 0.37 0.56 -0.37 -0.18 -0.69 -0.7
Smo97360 (PACid_15410005)
-0.01 0.18 0.19 0.25 0.13 0.18 0.3 0.46 0.49 0.51 0.32 0.28 0.12 0.31 0.09 0.51 -0.64 -1.37 0.2 -2.24 -1.07 -0.78 -0.47 -0.44 -0.4 0.58 0.26 0.41 -0.41 -0.36 -0.43 -0.58
Smo99818 (PACid_15419539)
-0.21 -0.05 0.35 0.09 0.08 0.1 0.75 0.6 0.44 0.84 0.88 0.86 -0.04 -0.13 -0.43 0.87 -0.94 -1.65 0.17 -4.85 -3.21 -6.65 -0.17 -0.2 -4.14 1.21 -1.0 -0.62 0.27 0.5 -0.61 -0.84
Smo99910 (PACid_15420313)
0.45 0.36 0.35 0.38 0.32 0.33 0.38 0.38 0.54 0.6 0.7 0.54 0.1 -0.48 -0.06 0.28 -0.13 -0.42 0.17 - - -4.51 0.06 -0.18 -8.23 -0.12 -0.15 -0.22 -0.05 -0.08 0.12 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.