Heatmap: Cluster_200 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo104256 (PACid_15410513)
-0.92 -0.48 -0.36 -0.52 -0.28 0.15 -0.17 0.34 -0.01 -0.23 -0.67 -0.37 0.5 0.71 1.43 0.45 -0.78 -2.86 0.08 -1.48 -0.81 -0.5 -0.01 0.29 0.52 0.97 0.64 0.99 -0.7 -0.33 -0.98 -1.45
Smo107911 (PACid_15402172)
-0.37 -0.29 -0.29 0.07 -0.07 -0.05 -0.24 -0.25 0.09 -0.31 -0.26 -0.43 0.46 0.7 1.04 0.69 0.14 0.03 0.62 -2.25 -1.59 -0.76 0.37 0.45 -0.49 -0.28 0.04 -0.11 0.16 -0.04 -0.23 -0.1
Smo110457 (PACid_15407397)
-0.4 0.0 0.07 -0.05 0.42 0.4 0.49 0.18 0.33 0.31 0.05 -0.29 0.17 1.21 1.03 0.92 -0.9 -1.01 0.49 -6.52 -6.82 -6.1 -0.95 -0.44 -1.87 0.39 0.96 0.8 -0.52 -0.38 -1.43 -1.04
Smo111716 (PACid_15412651)
-0.25 -0.04 -0.01 0.08 -0.11 0.06 0.03 0.12 0.1 0.08 -0.01 -0.04 0.33 1.24 0.91 0.23 -0.35 -0.51 -0.18 -1.16 -1.07 -2.25 -0.2 -0.02 0.3 0.54 0.37 0.28 -0.55 -0.41 -0.56 -0.62
Smo113076 (PACid_15413331)
-0.79 0.29 -0.81 0.19 0.26 0.31 0.05 -0.16 0.45 0.15 -0.72 -0.73 -1.59 2.98 1.93 -0.08 -1.19 -1.21 -2.36 -1.31 -2.84 -2.38 -0.27 -0.17 -3.46 -0.3 -0.15 -0.27 -1.1 -1.39 -1.9 -2.51
Smo121590 (PACid_15418482)
0.03 0.23 0.36 0.12 0.14 0.28 -0.04 -0.05 -0.2 -0.22 -0.13 -0.43 0.51 0.99 1.01 0.69 -0.29 -0.36 0.85 -2.45 -1.93 -3.03 0.02 0.19 -1.09 0.22 0.35 0.54 -0.63 -0.27 -1.37 -1.29
Smo129201 (PACid_15417070)
0.08 -0.04 -0.13 0.13 -0.01 0.05 -0.05 -0.08 -0.02 -0.07 -0.21 -0.25 0.4 1.27 0.73 0.59 -0.46 -0.19 0.13 -0.96 -1.04 -0.19 -0.16 -0.08 -0.01 0.12 0.06 -0.03 -0.57 -0.46 -0.33 -0.35
Smo138440 (PACid_15422831)
-0.12 -0.02 -0.43 0.27 0.16 0.18 0.62 0.4 0.49 0.15 0.07 -0.22 0.36 1.07 0.98 0.94 -0.73 -1.52 0.52 -5.27 -3.46 -1.17 -0.92 -0.52 -1.94 0.35 0.84 0.47 -0.62 -0.25 -1.42 -0.74
Smo140664 (PACid_15408237)
0.07 -0.13 -0.19 -0.01 -0.09 -0.06 0.1 0.15 0.41 0.33 0.36 0.17 -0.24 1.0 1.23 -0.26 -0.1 -0.21 0.21 -3.34 -1.6 -3.05 -0.47 -0.3 -0.42 0.21 0.11 0.18 0.04 0.15 -0.15 -0.18
Smo143610 (PACid_15416998)
0.23 -0.03 -0.02 0.05 0.01 0.21 0.07 0.09 0.14 0.07 -0.06 -0.13 0.3 0.94 1.01 0.61 -0.26 -0.21 0.33 -0.64 -2.36 -0.7 -0.22 0.01 -0.62 0.26 -0.28 -0.03 -0.1 0.07 -1.19 -1.01
Smo146083 (PACid_15421235)
-0.3 -0.38 -0.17 0.12 0.21 0.2 0.34 0.36 0.36 0.14 0.03 -0.14 0.1 1.22 0.88 0.13 -0.52 -0.71 -0.09 -2.39 -1.06 -2.19 -0.57 -0.44 0.47 -0.11 0.52 0.35 -0.51 -0.4 -0.13 -0.03
Smo152133 (PACid_15417480)
0.2 -0.12 -0.03 -0.1 -0.01 -0.09 -0.14 0.04 -0.02 0.06 0.0 -0.13 0.84 1.55 1.04 0.9 -0.62 -0.9 -0.15 -3.48 -1.79 -4.0 -0.42 -0.26 -0.84 0.87 0.32 0.34 -0.58 -0.55 -0.7 -0.78
Smo165748 (PACid_15415775)
-0.38 -0.75 -0.53 -0.45 -0.22 -0.5 -0.29 0.12 0.13 0.1 0.32 0.04 0.63 1.05 0.52 0.98 -0.91 -0.58 0.24 -0.52 -1.5 -2.33 -0.24 0.29 -0.97 0.68 0.51 -0.24 -0.3 -0.16 -0.18 0.67
Smo165776 (PACid_15415853)
0.51 0.33 0.06 -0.08 -0.07 -0.18 -0.26 -0.22 -0.02 -0.02 0.04 -0.02 0.8 1.09 1.48 1.19 -0.48 -1.04 0.35 -4.46 -3.7 -4.81 -0.14 0.1 -2.0 0.53 -0.42 -0.29 -0.21 -0.03 -0.91 -0.69
Smo166118 (PACid_15414115)
-0.12 -0.15 -0.08 0.02 -0.04 -0.09 0.06 0.31 0.37 0.43 0.42 0.21 0.27 0.78 0.63 0.3 -0.64 -0.93 -0.26 -1.46 -1.26 -2.32 0.0 0.3 0.74 0.48 -0.17 -0.05 -0.54 -0.45 -0.33 -0.24
Smo187173 (PACid_15409121)
-0.53 -0.07 -0.07 -0.11 -0.0 -0.51 -0.56 -0.48 -0.11 -0.23 -0.14 -0.45 -0.37 1.83 1.3 0.47 -1.11 -1.4 -0.62 -0.11 -0.49 -0.37 -0.35 -0.72 0.47 1.33 0.41 0.1 -0.96 -0.78 -0.88 -0.9
Smo230609 (PACid_15415353)
-0.35 -0.26 -0.01 0.12 0.09 0.08 -0.0 -0.11 -0.08 -0.11 -0.23 -0.41 1.33 1.28 1.15 1.2 -0.52 -1.3 -0.11 -3.36 -0.8 -4.58 0.01 -0.1 0.3 0.36 0.02 -0.11 -0.53 -0.41 -1.5 -1.37
Smo232123 (PACid_15417349)
0.46 0.87 -0.1 -0.09 -0.0 -0.08 -0.88 -0.51 -0.34 -0.11 -0.13 -0.43 0.14 2.64 2.01 1.31 -1.51 -0.89 -1.85 -0.08 -1.05 -1.54 -0.81 -1.05 -1.34 -1.68 -2.63 -3.18 -1.39 -1.72 -1.04 -1.53
Smo232457 (PACid_15419728)
-0.03 -0.12 -0.23 0.01 0.0 0.07 0.12 0.11 0.17 0.05 -0.01 -0.09 -0.26 0.91 1.13 0.17 -0.23 -0.88 -0.4 -3.03 -0.66 -2.11 0.15 0.13 0.43 0.02 0.42 0.45 -0.37 -0.33 0.04 -0.15
Smo233033 (PACid_15419513)
-0.74 -0.61 -0.33 0.01 0.2 -0.04 -0.3 0.34 -0.17 -0.17 -0.14 -0.45 0.93 1.44 1.32 1.17 -1.35 -1.86 0.7 -4.0 -1.03 -5.04 -0.88 -0.39 -0.97 0.95 0.81 0.94 -0.98 -0.84 -1.33 -2.27
Smo233415 (PACid_15422466)
-0.22 -0.37 -0.2 -0.15 -0.08 -0.01 0.2 0.06 0.16 0.03 0.04 -0.13 0.26 1.2 1.08 -0.13 0.03 0.21 -0.2 -1.69 -2.06 -1.94 -0.04 -0.06 0.01 0.12 0.47 0.32 -0.27 -0.2 -0.36 -0.21
Smo233613 (PACid_15401702)
-0.28 -0.16 -0.24 -0.01 -0.1 -0.07 0.04 0.16 0.22 0.22 0.23 0.17 0.29 1.17 0.7 0.4 -0.71 -0.85 -0.17 -1.03 -0.93 -2.93 -0.29 -0.08 0.08 0.83 0.48 0.44 -0.61 -0.53 -0.53 -0.37
Smo268319 (PACid_15413419)
-0.08 0.4 0.19 0.39 0.2 -0.06 -0.15 -0.18 -0.07 -0.19 -0.26 -0.16 1.04 0.96 1.18 1.44 -0.07 -1.06 -0.52 -0.72 -2.34 -2.0 -0.46 -0.42 -0.87 0.18 0.07 0.33 -0.72 -0.48 -1.12 -1.17
Smo271544 (PACid_15401632)
0.12 -0.02 -0.16 0.05 -0.07 -0.13 0.02 -0.06 0.04 0.1 0.03 0.11 0.26 0.86 0.97 0.27 -0.41 -1.01 0.15 -0.69 -1.47 -0.5 -0.17 -0.03 -0.38 0.87 0.3 0.39 -0.35 -0.26 -0.8 -0.86
Smo34445 (PACid_15403319)
-0.9 -0.45 -0.47 0.2 0.04 0.07 0.12 -0.16 -0.24 -0.68 -0.72 -0.92 0.57 0.89 0.77 1.08 0.33 0.19 1.04 -4.77 -3.02 - 0.01 0.14 0.05 -0.12 0.52 0.36 0.1 0.25 -0.59 -0.45
Smo404036 (PACid_15407000)
-0.05 -0.05 -0.13 0.01 0.11 0.02 0.24 0.28 0.22 0.14 -0.01 -0.15 1.1 1.05 0.84 0.42 -0.64 -0.4 -0.05 -1.67 -1.36 -0.73 -0.4 -0.24 -0.17 0.44 0.13 0.06 -0.54 -0.48 -0.87 -0.88
Smo405511 (PACid_15413918)
0.1 -0.08 0.06 -0.06 -0.06 0.05 0.0 0.1 0.13 0.22 -0.04 -0.02 0.48 1.15 0.69 0.82 -0.59 -0.87 -0.04 -1.37 -1.31 -0.44 -0.65 -0.4 -0.11 0.41 0.13 -0.02 -0.43 -0.58 0.05 -0.3
Smo410831 (PACid_15408665)
-0.44 -0.2 -0.15 0.21 0.26 0.25 0.31 0.1 0.2 -0.07 -0.06 -0.28 1.38 1.49 1.1 0.88 -0.5 -1.06 -0.88 -1.98 -1.15 0.01 -0.86 -0.52 0.24 -1.43 -0.14 0.11 -0.57 -0.53 -1.26 -1.61
Smo415650 (PACid_15421755)
-0.25 0.19 -0.08 -0.08 0.18 0.02 -0.41 -0.22 -0.25 -0.05 -0.32 -0.47 0.85 0.64 0.92 1.11 -0.35 -1.46 1.29 -7.62 -6.38 - -0.2 -0.45 -3.11 1.16 0.84 0.97 -0.38 -0.11 -1.87 -1.53
Smo420762 (PACid_15415280)
-0.11 0.06 0.03 -0.06 -0.12 -0.16 -0.35 -0.19 -0.05 -0.03 -0.2 -0.19 1.12 1.1 0.84 1.25 -0.51 -0.4 0.17 -3.57 -2.12 - 0.14 0.16 0.45 -0.22 -0.06 0.1 -0.26 -0.03 -0.89 -0.61
Smo425072 (PACid_15402184)
-0.26 -0.22 -0.05 -0.13 0.14 0.01 -0.12 -0.18 -0.07 -0.29 -0.4 -0.45 0.73 1.0 1.27 0.9 -0.03 -0.19 0.76 -3.08 -2.82 -2.65 0.2 0.24 -1.78 0.38 0.02 0.26 0.04 -0.02 -0.81 -0.66
Smo425605 (PACid_15406557)
-0.69 -0.36 -0.08 0.33 0.39 0.39 0.02 -0.06 -0.1 -0.52 -0.29 -0.54 1.66 1.47 1.33 0.64 -1.26 -0.56 -1.9 -0.19 0.14 -0.89 -1.36 -0.94 0.36 -0.54 0.43 0.42 -1.65 -1.48 -2.09 -1.67
Smo430900 (PACid_15401451)
-0.29 -0.35 -0.23 -0.31 -0.04 -0.39 -0.17 -0.32 -0.41 -0.4 -0.18 -0.64 0.46 0.94 1.17 0.87 0.14 0.05 0.59 -4.7 -1.41 -6.05 0.24 0.21 -1.73 0.31 0.51 0.58 0.11 0.19 -0.21 -0.05
Smo438826 (PACid_15401833)
-0.19 -0.1 -0.3 -0.1 -0.02 -0.04 0.01 -0.1 -0.23 -0.3 -0.35 -0.36 0.47 1.33 1.07 0.94 -0.98 -1.12 0.02 -0.64 -0.98 -1.41 -0.18 0.0 -0.15 0.16 0.33 0.16 -0.72 -0.59 0.33 0.14
Smo438930 (PACid_15402555)
-0.16 -0.07 0.03 0.07 -0.08 0.06 -0.14 -0.11 0.09 0.05 0.07 -0.17 0.58 0.6 0.72 0.52 -0.31 -0.48 0.07 -0.37 -0.86 -1.28 -0.23 -0.13 -0.22 0.47 0.28 0.55 -0.3 0.01 -0.78 -0.43
Smo441959 (PACid_15411774)
0.12 0.4 0.28 0.21 0.11 0.2 0.11 -0.33 -0.14 -0.06 -0.08 -0.12 0.38 0.96 0.86 0.8 -0.16 -0.13 -0.03 -2.52 -1.17 -3.08 0.14 -0.01 0.16 -0.21 0.29 0.33 -0.44 -0.41 -0.9 -1.04
Smo445158 (PACid_15417296)
-0.4 -0.42 -0.24 0.03 -0.12 0.23 0.18 0.25 0.42 0.41 0.16 0.07 0.8 1.33 1.18 0.38 -0.61 -1.06 -0.85 -1.65 -1.15 -2.08 -1.14 -1.12 0.03 0.91 0.3 0.76 -0.67 -0.62 -1.31 -1.24
Smo448010 (PACid_15402818)
-0.33 -0.29 -0.1 -0.18 -0.13 -0.11 -0.17 -0.15 0.11 -0.1 -0.03 -0.41 0.2 1.01 1.14 0.95 -0.65 -0.97 0.83 - -1.73 -1.39 -0.88 -0.64 -0.26 1.18 0.63 0.74 -0.28 -0.02 -0.94 -1.13
Smo73397 (PACid_15406255)
0.23 -0.12 -0.21 -0.06 -0.09 -0.13 -0.15 0.28 0.38 0.39 0.4 0.34 0.55 0.81 0.99 -0.07 -0.41 -1.14 -0.17 -1.51 -1.24 -2.51 -0.48 -0.22 0.31 0.79 0.09 0.17 -0.36 -0.28 -0.57 -0.52
Smo74563 (PACid_15410717)
-0.27 0.21 0.16 0.18 0.03 0.14 0.06 -0.02 0.02 0.1 0.06 0.01 0.45 0.76 0.47 0.6 -0.33 -0.53 0.26 -0.87 -0.91 -0.4 0.04 0.02 -1.29 0.19 0.13 0.2 -0.38 -0.17 -0.39 -0.42
Smo78836 (PACid_15402261)
-0.32 -0.15 -0.14 0.23 0.25 0.44 0.3 0.16 0.18 -0.12 -0.17 -0.33 0.35 1.18 0.95 0.08 -0.04 -0.3 -0.14 -1.01 -1.42 -1.29 -0.17 -0.15 -0.02 -0.58 0.4 0.65 -0.31 -0.05 -0.83 -1.21
Smo80581 (PACid_15406168)
-0.54 -0.36 -0.16 0.05 -0.1 -0.21 -0.15 -0.24 -0.16 -0.19 -0.23 -0.42 0.72 1.2 1.03 0.81 -0.26 -0.87 -0.01 -0.96 -0.65 -2.0 -0.09 -0.09 0.44 0.81 0.42 0.59 -0.43 -0.26 -1.4 -1.42
Smo81843 (PACid_15411390)
-0.11 0.19 0.13 0.12 0.21 0.3 -0.05 -0.07 -0.14 -0.21 -0.34 -0.33 0.67 0.8 0.85 0.92 -0.35 -0.54 0.23 -2.14 -1.69 -1.68 0.12 0.13 -0.17 0.28 0.07 0.24 -0.28 -0.22 -0.46 -0.61
Smo86169 (PACid_15420657)
-0.69 -0.44 -0.29 -0.15 0.14 0.13 0.13 0.23 0.17 -0.38 -0.35 -0.71 0.01 0.62 1.14 0.22 -0.06 -0.55 0.45 -1.12 0.26 -0.69 0.0 0.1 -0.14 0.22 0.4 0.66 -0.19 0.0 -0.81 -1.04
Smo89794 (PACid_15411807)
0.14 0.0 0.09 0.19 0.05 0.08 0.05 0.24 0.32 0.43 0.38 0.22 0.55 0.75 0.32 0.46 -0.76 -1.6 -0.02 -1.14 -0.6 -1.3 -0.24 0.08 -0.07 0.62 -0.08 0.22 -0.31 -0.3 -0.84 -1.17
Smo93701 (PACid_15423431)
-0.16 0.0 0.05 0.04 0.02 0.03 -0.07 0.04 -0.03 -0.01 -0.04 -0.29 0.54 0.87 0.91 0.82 -0.17 -0.22 0.01 -2.01 -1.19 -1.87 0.41 0.43 -0.42 0.31 0.05 0.13 -0.51 -0.39 -0.57 -0.55
Smo96415 (PACid_15407597)
-0.19 -0.06 -0.15 -0.06 -0.24 -0.31 -0.48 -0.28 -0.21 0.19 0.08 -0.09 0.22 2.21 1.57 0.84 -1.33 -1.66 -0.64 -2.52 -1.76 -0.15 -0.61 -1.03 -0.05 1.01 0.24 -0.75 -0.95 -0.91 -1.13 -1.4
Smo96478 (PACid_15407754)
-0.74 -0.85 -1.44 -0.97 -0.39 -0.67 -0.38 -0.29 -0.2 0.04 0.07 -0.6 -1.11 2.38 1.14 1.08 -1.24 -0.73 -0.43 -0.82 -2.05 -0.82 -1.43 -0.85 -0.44 1.27 1.11 0.83 -0.83 -0.73 -0.73 -1.07
Smo97810 (PACid_15413781)
0.02 -0.03 0.22 0.16 0.18 0.12 0.03 0.2 0.16 0.2 0.09 0.01 0.32 1.51 0.87 0.47 -0.79 -1.25 0.31 -2.08 -1.7 -1.09 -0.51 -0.4 -1.73 0.66 0.49 0.45 -0.66 -0.56 -0.95 -0.98
Smo98103 (PACid_15411285)
-0.68 -0.52 -0.31 -0.21 0.04 -0.05 -0.01 0.02 -0.07 0.01 -0.16 -0.42 0.63 1.16 0.94 1.18 -0.8 -0.62 0.17 -1.8 -0.76 -1.49 -0.46 -0.1 -0.63 0.49 0.36 -0.2 -0.28 -0.21 0.18 0.2
Smo98964 (PACid_15417514)
-0.74 -0.57 -0.5 -0.16 -0.03 -0.04 -0.21 -0.24 -0.12 -0.37 -0.23 -0.55 0.55 1.06 1.22 0.51 -0.62 -0.56 0.33 -1.11 -0.28 -1.03 -0.34 -0.02 0.38 0.68 0.79 0.66 -0.56 -0.27 -0.99 -0.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.