Heatmap: Cluster_124 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100467 (PACid_15422619)
-1.08 -0.07 0.03 -0.37 0.01 0.42 -0.36 -0.24 0.14 0.07 -0.11 -0.86 0.49 -0.79 0.2 0.44 -0.52 -0.39 0.57 -0.17 -3.63 -2.38 -0.58 -0.23 -1.16 1.57 1.39 1.17 -0.55 -0.55 -0.77 -0.28
Smo103062 (PACid_15405987)
-1.62 -1.5 -0.68 0.17 0.63 0.55 0.78 0.43 -0.42 -0.14 -0.69 -1.14 -0.41 0.66 -2.18 0.74 -0.94 -0.41 0.79 -3.14 -1.67 -4.98 0.06 -0.44 -0.47 1.37 1.25 1.35 -0.73 -0.85 0.23 -0.41
Smo105057 (PACid_15411897)
-0.64 -2.13 -0.49 -1.6 0.88 1.04 1.32 1.68 1.07 0.69 0.28 -0.06 -2.84 -1.71 -0.02 -1.22 -1.07 -0.76 -0.91 -0.68 0.81 - -1.0 -1.69 -0.55 -1.5 0.79 0.65 -0.13 -0.29 0.29 -0.57
Smo107569 (PACid_15421437)
-0.32 -0.47 -0.51 -0.08 0.09 0.14 0.13 0.5 0.34 0.29 0.12 -0.04 -0.0 -0.26 0.26 -0.13 -0.91 -0.77 0.01 0.14 -0.18 -0.98 -0.49 -0.32 0.29 0.86 0.87 0.66 -0.59 -0.5 -0.27 -0.17
Smo111808 (PACid_15413450)
0.49 0.37 0.12 0.08 0.06 0.01 -0.22 0.08 0.36 0.76 0.58 0.51 1.04 0.48 -0.51 0.75 -0.84 -0.71 0.2 -0.17 -1.69 -2.99 -0.21 -0.05 -2.64 0.57 -0.54 -0.53 -0.5 -0.35 -0.55 -0.32
Smo117311 (PACid_15404673)
-0.62 -0.93 -1.28 -0.8 -0.14 0.5 0.87 1.15 0.88 0.75 0.43 -0.07 -2.16 -2.08 0.13 -1.6 -0.71 -0.71 -0.26 -0.02 0.69 -1.29 -0.89 -0.92 -0.43 0.49 1.02 0.94 -0.1 -0.15 -0.25 -0.22
Smo121129 (PACid_15415333)
0.01 -0.07 -0.13 0.07 0.18 0.07 0.01 0.24 0.3 0.16 0.16 0.12 -0.54 -0.27 0.18 -0.03 -0.3 -0.73 0.14 -0.5 0.09 -0.62 -0.26 -0.3 0.31 0.61 0.54 0.65 -0.3 -0.17 -0.44 -0.49
Smo147086 (PACid_15401937)
0.43 0.26 0.13 0.11 0.21 0.21 0.1 0.19 0.46 0.45 0.32 0.2 0.44 0.37 -0.47 0.71 -0.37 -0.59 -0.22 -0.32 -1.97 -0.95 0.4 0.61 -0.52 -0.08 -0.67 -0.64 -0.52 -0.41 -0.47 -0.31
Smo15379 (PACid_15413610)
0.09 0.12 0.06 0.07 0.1 0.26 0.12 0.45 0.21 0.08 0.06 0.31 -1.04 -1.39 -1.3 -0.97 0.15 -0.03 -0.53 0.72 -0.99 -0.13 -0.23 -0.34 0.82 -0.25 0.87 0.8 -0.03 -0.1 -0.78 -0.76
Smo165923 (PACid_15417215)
0.17 0.29 0.23 -0.21 -0.08 -0.32 -0.3 -0.37 0.15 0.13 0.32 0.0 0.56 0.8 0.2 1.11 -0.9 -0.46 0.38 -0.22 -2.84 -1.75 -0.04 0.12 -3.63 0.65 -0.39 -0.76 -0.02 0.27 -0.28 0.44
Smo172683 (PACid_15413542)
0.19 -0.11 -0.12 -0.07 0.5 -0.13 0.06 0.1 -0.27 0.11 -0.17 -0.35 -0.09 1.49 0.33 0.21 -0.76 -0.25 0.21 0.94 -0.64 -0.81 0.19 0.33 -1.32 -0.02 -0.16 0.01 -0.68 -0.88 -0.59 -0.63
Smo181756 (PACid_15418460)
-0.01 -0.13 -0.25 -0.02 -0.05 -0.22 0.06 0.2 0.51 0.38 0.45 0.21 -0.17 -0.13 0.49 0.43 -0.17 -2.53 0.25 -0.4 -3.66 -2.16 0.02 0.1 -1.01 0.74 0.36 0.18 -0.1 -0.01 0.27 0.43
Smo227430 (PACid_15404647)
-0.23 -0.15 -0.13 -0.05 -0.11 -0.06 -0.09 0.17 0.1 0.07 0.03 -0.2 0.08 0.23 0.64 0.15 -0.9 -1.35 -0.11 0.39 -0.39 -1.15 -0.27 -0.13 -0.15 0.98 1.02 0.89 -0.75 -0.6 -0.59 -0.48
Smo230263 (PACid_15412377)
-0.23 0.09 0.03 0.02 0.12 0.19 0.2 0.09 -0.08 -0.28 -0.49 -0.67 -0.18 0.29 0.19 0.82 -0.64 -1.16 0.69 0.27 -2.1 -3.07 -0.2 -0.27 -0.81 0.6 1.05 1.1 -0.2 -0.01 -0.43 -0.7
Smo231918 (PACid_15420545)
0.24 0.06 -0.03 0.11 0.11 0.01 0.04 0.19 0.19 0.19 0.23 0.26 -0.03 -0.03 0.13 0.24 -0.26 -0.92 0.4 -0.24 -3.07 -4.78 -0.01 0.13 -1.71 0.91 0.33 0.4 -0.06 -0.02 0.12 0.02
Smo235078 (PACid_15403064)
-0.58 -0.6 -0.48 -0.41 -0.15 -0.52 -0.23 0.01 0.02 -0.04 -0.13 -0.45 0.66 0.65 0.07 0.74 -0.09 -0.35 0.61 -0.59 -3.09 -1.3 -0.09 0.11 -2.2 1.04 0.74 0.71 0.03 0.04 0.1 0.11
Smo270384 (PACid_15419638)
-0.27 -0.29 -0.3 -0.31 -0.27 -0.17 -0.32 -0.03 -0.2 -0.24 -0.06 -0.32 0.19 0.35 0.23 0.3 -0.57 -0.26 -0.13 -0.18 -0.51 -0.61 -0.04 0.13 -1.39 1.24 0.79 0.7 -0.44 -0.41 0.47 0.32
Smo270839 (PACid_15423253)
-0.24 0.01 -0.13 -0.02 -0.08 -0.13 0.1 0.05 0.36 0.27 0.1 -0.06 0.2 0.9 0.22 0.4 -0.24 -0.43 -0.48 1.09 -2.62 -1.75 0.06 0.08 0.62 -0.3 -0.36 -0.63 -0.53 -0.42 -0.02 0.1
Smo36605 (PACid_15410728)
-0.2 -0.09 -0.08 0.04 0.12 0.13 0.12 0.23 0.11 0.24 0.13 0.01 -0.47 -0.27 0.3 -0.24 -0.33 -0.01 -0.25 0.04 -0.45 -0.08 -0.19 -0.04 -0.55 0.42 0.63 0.58 -0.29 -0.23 -0.05 -0.14
Smo403785 (PACid_15409635)
-0.36 -0.06 -0.03 -0.03 0.15 0.08 0.13 0.31 0.09 0.04 -0.05 -0.36 -0.73 -2.22 0.29 -0.03 -0.67 -0.74 1.18 0.88 -2.85 - 0.18 0.4 -0.91 1.17 0.75 0.86 -0.25 0.08 -1.27 -1.18
Smo405518 (PACid_15413928)
-0.3 -0.26 -0.2 0.24 0.28 0.31 0.11 0.19 -0.03 -0.08 -0.2 -0.28 0.39 -0.02 0.35 0.49 -0.25 -0.67 0.3 0.75 -3.3 -1.49 -0.08 -0.3 -0.84 0.55 0.68 0.76 -0.19 -0.23 -0.5 -0.52
Smo407261 (PACid_15417467)
-0.13 -1.03 -1.61 -0.49 -0.37 0.11 0.39 0.94 0.62 0.69 0.54 -0.08 -0.9 -2.35 -0.71 -1.45 -0.75 -1.43 -0.43 0.67 -1.86 -1.21 -0.59 -0.73 -0.17 1.59 1.39 1.05 -0.23 -0.22 -0.23 -0.32
Smo409897 (PACid_15405606)
0.16 0.19 -0.18 0.11 0.21 0.2 -0.03 -0.21 -0.06 -0.21 -0.01 -0.23 -0.12 -0.23 0.4 0.18 -0.18 -0.18 0.13 -0.06 0.08 -1.17 0.12 0.15 0.35 0.31 0.33 0.19 -0.31 -0.25 -0.21 -0.34
Smo412197 (PACid_15409364)
-0.36 -0.42 -0.31 -0.16 0.16 0.31 0.46 0.54 0.51 0.45 0.19 -0.05 -1.12 -1.49 0.2 -0.68 -0.45 -0.74 -0.07 0.84 -0.88 -0.22 -0.34 -0.32 -1.14 1.15 0.74 0.82 -0.27 -0.22 -0.62 -0.79
Smo412218 (PACid_15409939)
-0.12 -0.42 -1.61 -0.42 -0.13 0.54 0.55 1.39 0.56 0.26 0.12 0.24 -2.21 -2.21 -0.53 -2.2 -0.96 -1.71 -0.93 0.53 -2.22 -0.44 -1.25 -1.44 0.28 0.97 1.49 1.55 -0.92 -0.86 -0.02 0.03
Smo413362 (PACid_15413822)
-0.05 0.19 -0.06 0.26 0.61 0.24 0.14 0.36 0.22 0.31 0.17 0.1 0.51 0.28 0.74 0.76 -0.34 -1.75 0.42 -0.56 -4.48 -2.58 -0.16 -0.08 -5.09 0.67 -0.11 0.15 -0.3 -0.06 -0.34 -0.64
Smo416107 (PACid_15420844)
-0.14 0.14 -0.37 -0.18 -0.33 0.05 0.03 0.47 0.28 0.52 0.72 -0.26 -0.71 0.65 0.24 -0.78 -1.34 -2.89 -0.29 0.9 -0.28 -1.35 -1.33 -1.64 1.25 1.44 0.86 1.13 -1.93 -2.09 -2.82 -2.72
Smo417213 (PACid_15402229)
-0.94 -1.09 -0.76 -0.49 0.04 -0.05 0.27 0.81 0.77 0.63 0.34 -0.05 0.39 0.09 -0.17 0.68 -0.92 -1.16 -0.23 -0.16 -0.29 -1.5 -0.25 0.28 -0.13 0.87 0.61 0.46 -0.26 0.01 -1.17 -0.91
Smo421607 (PACid_15417246)
-1.45 -1.54 -1.12 -0.63 -0.51 -0.23 -0.34 -0.14 -0.38 -0.9 -0.47 -0.94 -0.9 -0.46 1.51 -0.69 -1.07 -1.56 -0.16 0.59 -0.78 -3.69 -1.49 -0.48 -0.82 2.09 1.96 2.05 -1.33 -0.8 -1.45 -0.93
Smo423905 (PACid_15402977)
-0.27 -0.27 -0.07 -0.24 -0.01 -0.17 0.18 0.17 0.16 0.2 0.16 -0.22 0.12 0.35 -0.03 0.5 -0.57 -0.52 0.03 -1.08 -1.96 0.5 -0.2 -0.14 -3.34 1.13 0.87 0.74 -0.43 -0.44 -0.26 -0.02
Smo425163 (PACid_15402859)
-0.96 -1.41 -1.54 -1.03 -0.17 0.33 0.66 0.59 0.31 0.15 -0.25 -0.51 -3.28 -3.6 -1.41 -2.13 -0.75 -1.46 -0.85 0.76 -0.47 -0.52 -0.72 -1.35 1.74 0.14 1.83 1.69 -0.22 0.06 -0.16 -0.52
Smo427022 (PACid_15407816)
0.34 0.28 0.29 0.16 0.06 0.12 -0.15 -0.13 0.1 0.0 0.04 -0.01 0.34 -0.03 0.14 0.69 -0.23 -0.5 0.44 -0.45 -0.32 -0.82 0.11 0.22 -0.29 -0.21 -0.67 -0.74 -0.21 -0.02 0.06 0.18
Smo432044 (PACid_15422780)
- - 2.8 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.65 - - - - - - - - - - - -
Smo438111 (PACid_15418796)
-0.76 -0.02 -0.09 0.07 0.13 0.05 0.32 0.39 0.28 0.23 0.13 0.03 -0.45 -0.54 -0.25 -0.32 -0.25 -0.69 0.33 0.91 -0.84 -0.77 -0.22 -0.3 0.66 0.75 0.16 -0.11 -0.08 -0.24 -0.35 -0.18
Smo438933 (PACid_15402558)
-0.02 -0.07 -0.46 -0.26 0.04 0.15 -0.04 -0.07 -0.13 -0.26 -0.23 -0.4 0.19 -0.41 0.34 0.47 -0.31 -0.14 0.32 0.28 -0.87 -0.63 -0.26 -0.29 0.79 0.89 0.63 0.45 -0.22 -0.27 -0.76 -0.4
Smo439574 (PACid_15402527)
-0.24 -0.22 -0.28 -0.18 -0.13 -0.23 -0.22 0.12 0.06 0.04 0.12 0.12 0.56 -0.22 -0.32 0.79 -0.37 -1.1 0.09 0.47 -0.9 -0.58 -0.27 -0.14 -0.84 1.29 0.53 0.45 -0.32 -0.27 -0.28 -0.22
Smo439578 (PACid_15402528)
-0.28 -0.53 -0.51 -0.18 0.11 0.23 0.26 0.56 0.46 0.22 0.03 -0.16 -0.13 -0.03 0.57 -0.34 -0.63 -1.34 0.02 -0.11 -1.33 -0.88 -0.58 -0.23 0.47 1.06 0.91 0.77 -0.54 -0.38 -0.52 -0.56
Smo441683 (PACid_15409505)
-0.74 -2.13 -1.35 -1.08 -0.22 0.68 0.94 0.66 0.81 0.77 0.35 -0.25 -3.16 -3.38 -0.9 -2.18 -0.74 0.24 -0.92 0.43 0.53 -0.08 -0.92 -1.7 1.16 -0.39 1.06 0.52 0.1 0.54 -0.05 -0.14
Smo444031 (PACid_15413615)
0.25 -0.18 -0.2 -0.22 -0.37 -0.19 -0.34 -0.04 0.38 0.49 0.64 0.52 0.52 0.33 -0.09 0.86 -0.26 -0.83 0.64 -0.57 -3.24 -2.15 -0.14 0.04 -2.07 0.75 -0.99 -0.8 0.06 0.2 0.21 0.48
Smo448250 (PACid_15404400)
-0.25 -0.91 -0.85 -0.7 -0.05 0.11 0.32 0.47 0.33 0.17 0.19 -0.22 0.04 -0.13 0.1 0.15 -0.8 -0.96 -0.18 0.65 -0.25 -0.2 -0.75 -0.02 -0.19 0.99 0.94 0.78 -0.42 -0.39 -0.41 -0.57
Smo50459 (PACid_15406067)
-0.26 0.11 0.03 0.24 0.31 0.38 0.33 0.21 0.03 -0.1 -0.22 -0.21 -1.11 -1.1 0.56 -0.51 -0.22 -2.2 0.23 0.8 -1.18 -0.53 -0.29 -0.38 -0.39 0.57 0.98 1.18 -0.24 -0.23 -0.55 -0.78
Smo61771 (PACid_15418588)
-0.34 -0.91 -0.62 -0.45 -0.22 -0.65 0.15 0.13 0.6 0.92 0.9 0.43 0.48 0.13 0.22 1.0 -1.04 -0.96 1.12 -7.13 -4.31 - -0.7 -0.38 -3.0 0.22 -0.81 -0.64 0.24 0.43 0.48 1.19
Smo65256 (PACid_15403966)
-0.18 -0.22 0.0 -0.01 0.21 0.08 -0.0 0.06 0.09 0.02 -0.03 -0.23 0.38 0.34 -0.09 0.46 -0.45 -0.63 0.08 0.66 -1.52 -0.59 0.19 0.58 -0.28 0.35 0.2 0.06 -0.7 -0.52 -0.01 -0.06
Smo65425 (PACid_15405486)
0.72 0.59 -0.05 -0.04 0.13 0.1 -0.37 -0.5 -0.1 -0.35 -0.13 -0.43 -0.11 0.35 -0.11 0.24 0.02 -0.4 0.38 1.13 -0.44 -0.24 -0.36 -0.5 0.69 -0.44 -0.03 0.15 -0.31 -0.15 -0.81 -0.95
Smo68072 (PACid_15411413)
-0.38 -0.46 -0.42 -0.12 -0.36 -0.24 -0.36 -0.02 0.21 0.42 0.51 0.33 0.52 0.82 0.52 1.32 0.14 0.42 -0.1 0.19 -1.89 -0.68 0.08 0.32 -2.95 -0.19 -1.6 -1.27 0.1 -0.05 -0.29 -0.28
Smo70574 (PACid_15421233)
-0.29 0.15 0.21 0.23 0.21 0.26 0.1 -0.01 0.08 -0.03 -0.1 -0.3 -0.27 -0.47 0.63 0.15 -0.04 -0.51 0.02 1.13 -3.89 -1.73 0.08 0.07 -1.06 0.02 0.65 0.94 -0.31 -0.03 -0.77 -0.67
Smo74017 (PACid_15406699)
0.38 0.15 0.14 -0.05 0.14 0.24 -0.1 0.11 0.25 0.34 0.4 0.19 0.84 0.21 -1.1 0.49 -0.53 -0.91 0.19 -0.17 -2.09 -3.72 0.07 0.1 -1.75 0.87 0.24 0.14 -0.06 -0.04 -0.44 -0.48
Smo74381 (PACid_15409187)
-0.12 -0.31 -0.34 -0.2 -0.23 -0.27 -0.23 0.06 0.04 0.12 0.23 -0.14 0.27 0.12 0.49 0.33 -0.6 -0.77 0.14 1.21 -1.53 -0.14 -0.5 -0.41 0.41 0.34 0.14 -0.09 -0.51 -0.38 0.54 -0.07
Smo74793 (PACid_15412297)
-0.12 -0.14 -0.13 0.06 -0.22 -0.27 -0.03 0.09 0.18 0.08 0.11 0.1 0.39 -0.55 -0.19 0.4 -0.28 -0.92 0.29 0.64 -3.87 -3.43 -0.13 0.09 -2.85 1.07 0.28 0.48 -0.14 -0.17 0.66 0.53
Smo74913 (PACid_15413679)
-0.56 -0.93 -0.69 -0.39 0.17 0.16 0.77 1.04 0.92 0.78 0.51 0.23 -2.64 -1.82 -0.09 -2.05 -0.24 -0.62 -0.93 0.25 -1.98 -2.21 -0.9 -0.93 -0.25 0.79 1.31 1.42 -0.02 -0.01 -0.6 -1.06
Smo77880 (PACid_15421679)
-0.32 -0.34 -0.27 -0.22 -0.26 0.1 0.12 0.08 0.42 -0.03 -0.24 -0.18 -0.23 -0.88 0.64 0.09 -0.91 -1.11 0.39 1.03 -0.09 -2.0 -0.22 0.07 1.04 0.96 0.62 0.31 -0.52 -0.29 -1.42 -1.03
Smo78052 (PACid_15418509)
-0.84 -0.33 -0.16 0.06 0.12 0.12 0.17 -0.27 -0.08 -0.32 -0.46 -0.62 -0.2 0.32 -0.23 0.45 -0.2 -0.84 1.03 1.03 -1.69 -0.76 -0.46 -0.7 0.07 0.21 0.88 0.9 -0.43 -0.29 -0.2 0.03
Smo78536 (PACid_15422184)
-0.09 -0.16 -0.01 0.01 0.06 0.19 -0.01 0.22 0.12 0.08 0.16 -0.09 0.09 -0.4 -0.02 0.52 -0.3 -1.19 0.46 0.68 -0.6 -1.5 0.27 0.34 0.27 0.38 -0.15 -0.2 -0.01 0.02 -0.59 -0.49
Smo81932 (PACid_15412096)
-0.31 -0.2 -0.24 0.03 0.08 -0.02 -0.05 0.45 0.33 0.33 0.11 -0.08 0.19 -0.14 -0.04 0.26 -0.79 -1.3 0.06 0.6 -3.55 -6.19 -0.14 0.01 -2.59 1.16 0.76 0.55 -0.33 -0.26 0.54 0.16
Smo84056 (PACid_15414126)
-0.01 -0.22 -0.14 0.03 0.26 0.47 0.36 0.48 0.39 0.19 -0.07 -0.08 -0.8 -1.58 -0.79 -0.65 -0.34 -0.38 -0.01 0.49 0.18 -1.44 -0.38 -0.46 0.27 0.53 0.74 0.84 0.02 0.21 -0.78 -0.59
Smo84695 (PACid_15418727)
0.0 -0.2 -0.13 -0.14 -0.43 -0.11 -0.1 0.34 0.39 0.38 0.38 0.26 0.93 0.51 0.11 0.91 0.14 -0.2 0.2 -0.33 -2.93 -1.52 0.1 0.59 -3.96 -1.09 -1.92 -1.68 0.11 0.25 0.26 0.58
Smo90224 (PACid_15411058)
0.36 0.22 -0.01 0.12 0.09 -0.0 -0.05 -0.04 -0.1 0.03 -0.0 -0.19 0.75 0.49 -0.36 0.81 -0.21 -0.41 0.49 0.09 -1.99 -1.58 0.37 0.65 -1.09 -0.57 -1.01 -0.99 0.09 0.12 0.13 0.14
Smo90273 (PACid_15411173)
-1.09 -0.64 -0.29 0.08 0.14 -0.03 -0.21 -0.14 -0.15 -0.05 -0.28 -0.58 0.43 0.69 -0.35 0.61 -0.77 -0.75 0.24 -0.45 -0.71 -0.2 -0.19 -0.22 -0.02 1.25 1.01 1.01 -0.85 -0.74 -0.41 -0.12
Smo91864 (PACid_15418606)
-0.35 -0.23 -0.17 0.02 -0.1 -0.02 -0.02 0.41 0.06 -0.19 -0.03 -0.24 -0.26 -0.23 -0.11 -0.14 -0.35 -0.4 0.23 -0.03 -0.23 -0.04 0.17 0.04 -0.41 0.7 0.84 0.75 -0.15 -0.01 -0.42 -0.34
Smo92089 (PACid_15415521)
-0.16 -0.35 -0.17 -0.3 -0.31 -0.3 -0.17 0.24 0.22 0.28 0.39 0.12 0.05 0.16 0.05 0.28 -0.52 -0.46 0.12 0.54 -0.91 0.33 -0.17 -0.06 -0.39 0.71 -0.16 -0.26 -0.18 -0.22 0.15 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.