Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00220750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.229)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.78 0.57 0.28 0.13 0.13 0.41 0.94 1.0 0.98 0.51 0.43 0.15
AMTR_s00001p00253330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.328)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.69 0.8 0.35 0.14 0.08 0.52 0.64 1.0 0.95 0.37 0.4 0.18
AMTR_s00002p00128010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.85)
0.21 0.0 0.27 0.18 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.76 0.34 0.07 0.11 0.57 0.77 0.91 1.0 0.63 0.33 0.13
AMTR_s00002p00236530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.279)
0.25 0.0 0.0 0.21 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.64 0.39 0.22 0.15 0.58 0.99 0.95 1.0 0.46 0.72 0.29
AMTR_s00002p00269800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.559)
0.28 0.53 0.15 0.49 0.22 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.54 0.58 0.38 0.27 0.27 0.63 1.0 0.74 0.81 0.67 0.5 0.31
AMTR_s00005p00062400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.9)
0.32 0.0 0.0 0.17 0.15 0.11 0.1 0.04 0.09 0.09 0.54 0.6 0.35 0.15 0.16 0.65 0.72 1.0 0.71 0.32 0.31 0.24
AMTR_s00006p00260480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.222)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.31 0.08 0.02 0.02 0.15 0.74 0.91 1.0 0.3 0.81 0.04
AMTR_s00006p00263990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.263)
0.21 0.35 0.09 0.19 0.18 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.7 1.0 0.32 0.24 0.16 0.78 0.4 0.96 0.74 0.3 0.6 0.16
AMTR_s00007p00031450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.11)
0.0 0.0 0.14 0.04 0.19 0.0 0.1 0.07 0.1 0.12 0.78 0.87 0.25 0.08 0.13 0.22 1.0 0.92 0.73 0.3 0.44 0.19
AMTR_s00007p00156370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.117)
0.0 0.61 0.16 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.48 0.21 0.13 0.08 0.63 0.77 0.98 1.0 0.43 0.63 0.12
AMTR_s00008p00202090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.120)
0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.69 0.11 0.05 0.05 0.36 0.94 1.0 0.65 0.13 0.39 0.05
AMTR_s00010p00141760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.104)
0.02 0.14 0.04 0.04 0.17 0.21 0.04 0.0 0.03 0.03 0.5 0.48 0.27 0.14 0.1 0.24 0.69 1.0 0.69 0.42 0.69 0.12
AMTR_s00010p00259680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.427)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.15 0.0 0.07 0.08 0.3 0.16 0.21 0.09 0.01 0.03 0.7 1.0 0.55 0.3 0.48 0.03
AMTR_s00010p00259870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.430)
0.11 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.68 0.54 0.31 0.14 0.05 0.29 0.83 1.0 0.87 0.17 0.46 0.12
AMTR_s00012p00077460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.34)
0.06 0.19 0.09 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.41 0.33 0.25 0.01 0.12 0.26 0.87 1.0 0.76 0.3 0.12 0.17
AMTR_s00012p00224800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.174)
0.03 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.24 0.13 0.0 0.01 0.1 1.0 0.61 0.38 0.06 0.23 0.03
AMTR_s00013p00209880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.145)
0.15 0.33 0.16 0.25 0.14 0.09 0.02 0.0 0.04 0.03 0.54 0.55 0.27 0.21 0.14 0.31 0.7 1.0 0.95 0.47 0.29 0.15
AMTR_s00013p00233820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.185)
0.05 0.0 0.03 0.17 0.14 0.11 0.11 0.09 0.14 0.11 0.58 0.58 0.3 0.17 0.1 0.31 1.0 0.79 0.84 0.35 0.59 0.16
AMTR_s00015p00199070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.53)
0.08 0.02 0.0 0.03 0.1 0.0 0.07 0.08 0.11 0.11 0.89 1.0 0.4 0.18 0.18 0.44 0.8 0.66 0.67 0.36 0.64 0.31
AMTR_s00017p00235750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.195)
0.65 0.52 0.68 0.41 0.22 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.86 0.73 0.45 0.2 0.2 0.68 0.91 0.94 1.0 0.65 0.58 0.29
AMTR_s00019p00144790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.131)
0.23 0.0 0.5 0.0 0.12 0.0 0.16 0.02 0.11 0.1 0.67 0.54 0.3 0.12 0.07 0.13 0.8 1.0 0.99 0.46 0.5 0.32
AMTR_s00021p00220150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.206)
0.45 0.47 0.03 0.28 0.1 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.38 0.59 0.26 0.14 0.15 0.53 0.79 0.94 1.0 0.5 0.4 0.12
AMTR_s00022p00167130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.175)
0.3 0.26 0.08 0.18 0.15 0.01 0.07 0.04 0.07 0.05 0.56 0.53 0.47 0.15 0.17 0.63 1.0 0.56 0.56 0.24 0.23 0.15
AMTR_s00022p00222930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.281)
0.11 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.25 0.36 0.02 0.02 0.13 1.0 0.59 0.62 0.08 0.15 0.16
AMTR_s00022p00249930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.381)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.53 0.13 0.05 0.07 0.2 0.73 0.82 1.0 0.37 0.54 0.08
AMTR_s00023p00012750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.05 0.04 0.72 0.93 0.26 0.09 0.09 0.27 1.0 0.96 0.76 0.27 0.77 0.23
AMTR_s00023p00031940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.9)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.24 0.15 0.16 0.05 0.02 0.08 0.76 1.0 0.57 0.32 0.4 0.03
AMTR_s00023p00232870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.190)
0.0 0.54 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.51 0.28 0.1 0.08 0.42 0.8 0.8 1.0 0.38 0.63 0.17
AMTR_s00025p00248100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.402)
0.07 0.35 0.01 0.06 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.32 0.19 0.28 0.1 0.23 0.61 1.0 0.76 0.37 0.47 0.08
AMTR_s00029p00083110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.76)
0.11 0.07 0.03 0.15 0.04 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.31 0.36 0.15 0.06 0.05 0.35 0.89 0.85 1.0 0.51 0.25 0.07
AMTR_s00029p00114850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.125)
0.42 0.1 0.39 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.76 0.58 0.37 0.11 0.04 0.36 1.0 0.87 0.97 0.46 0.72 0.17
AMTR_s00032p00091590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.57)
0.26 0.18 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.38 0.17 0.09 0.06 0.52 1.0 0.66 0.61 0.31 0.26 0.1
AMTR_s00032p00177900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.154)
0.22 0.23 0.34 0.12 0.16 0.03 0.03 0.0 0.05 0.04 0.76 0.59 0.48 0.43 0.26 0.56 0.81 0.83 1.0 0.23 0.34 0.27
AMTR_s00032p00205750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.196)
0.05 0.0 0.32 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.7 0.33 0.08 0.05 0.33 0.94 0.83 0.85 0.31 1.0 0.13
AMTR_s00033p00195130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.156)
0.01 0.0 0.21 0.01 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.53 0.67 0.24 0.14 0.04 0.41 1.0 0.92 0.55 0.22 0.42 0.26
AMTR_s00036p00178030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.88)
0.0 0.58 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06 0.13 0.17 0.18 0.75 0.83 0.19 0.22 0.15 0.28 0.22 0.18 1.0 0.41 0.33 0.2
AMTR_s00038p00234220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.234)
0.13 0.22 0.0 0.06 0.05 0.0 0.29 0.0 0.13 0.14 0.7 0.55 0.24 0.24 0.06 0.56 0.89 1.0 0.87 0.5 0.53 0.11
AMTR_s00039p00227400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.209)
0.2 0.03 0.17 0.29 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.5 0.29 0.14 0.11 0.16 0.31 1.0 0.85 0.44 0.17 0.06
AMTR_s00044p00116170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.90)
0.0 0.44 0.0 0.04 0.07 0.03 0.16 0.0 0.14 0.16 0.41 0.32 0.22 0.15 0.03 0.22 0.66 1.0 0.9 0.48 0.61 0.07
AMTR_s00048p00222810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.208)
0.06 0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.02 0.01 0.05 0.05 0.64 0.34 0.24 0.19 0.07 0.46 0.82 1.0 0.89 0.24 0.4 0.07
AMTR_s00048p00223180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.210)
0.03 0.41 0.05 0.06 0.16 0.0 0.05 0.06 0.03 0.04 0.59 0.65 0.39 0.19 0.15 0.51 0.95 1.0 0.86 0.31 0.65 0.22
AMTR_s00050p00032750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.4)
0.06 0.01 0.18 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.69 0.24 0.01 0.04 0.6 0.88 1.0 1.0 0.3 0.42 0.12
AMTR_s00050p00221590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.87)
0.0 0.0 0.03 0.11 0.12 0.0 0.05 0.13 0.07 0.06 0.73 0.65 0.27 0.16 0.06 0.41 1.0 0.6 0.62 0.25 0.29 0.14
AMTR_s00052p00157970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.66)
0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.56 0.34 0.13 0.06 0.04 0.05 1.0 0.89 0.85 0.38 0.39 0.05
AMTR_s00056p00141960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.116)
0.07 0.02 0.66 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.65 0.29 0.14 0.13 0.36 0.41 1.0 0.65 0.27 0.77 0.14
AMTR_s00057p00193080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.217)
0.0 0.37 0.17 0.23 0.14 0.0 0.12 0.08 0.12 0.12 0.81 0.78 0.51 0.34 0.16 0.51 0.79 0.91 1.0 0.53 0.73 0.2
AMTR_s00058p00093170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.50)
0.14 0.06 0.01 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.38 0.35 0.13 0.09 0.21 0.71 0.71 1.0 0.49 0.47 0.12
AMTR_s00058p00171240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.156)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.8 0.73 0.35 0.12 0.04 0.59 0.93 1.0 0.76 0.34 0.37 0.27
AMTR_s00059p00121300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.95)
0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.38 0.37 0.22 0.1 0.03 0.17 1.0 0.81 0.6 0.2 0.43 0.13
AMTR_s00061p00050140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.26)
0.11 0.3 0.05 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.56 0.12 0.04 0.03 0.18 0.74 1.0 0.75 0.33 0.39 0.05
AMTR_s00061p00142700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.123)
0.15 0.0 0.09 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.33 0.13 0.02 0.03 0.17 1.0 0.77 0.67 0.18 0.2 0.06
AMTR_s00062p00065360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.38)
0.0 0.01 0.0 0.05 0.06 0.0 0.23 0.08 0.17 0.16 0.57 0.33 0.29 0.15 0.04 0.34 1.0 0.93 0.7 0.32 0.28 0.14
AMTR_s00065p00038950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.17)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.17 0.0 0.09 0.09 0.64 0.67 0.29 0.09 0.06 0.35 0.89 0.89 1.0 0.32 0.65 0.16
AMTR_s00066p00184560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.232)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.43 0.44 0.26 0.14 0.25 0.49 0.95 0.81 1.0 0.48 0.76 0.13
AMTR_s00067p00113950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.91)
0.21 0.0 0.0 0.18 0.1 0.0 0.06 0.0 0.05 0.06 0.57 0.8 0.24 0.11 0.05 0.46 0.87 1.0 0.79 0.25 0.41 0.16
AMTR_s00070p00046580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.20)
0.01 0.16 0.36 0.07 0.11 0.27 0.1 0.0 0.05 0.05 0.47 0.38 0.31 0.17 0.09 0.37 0.76 1.0 0.61 0.44 0.87 0.2
AMTR_s00071p00183090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.187)
0.0 0.56 0.0 0.07 0.14 0.0 0.06 0.0 0.07 0.07 0.67 1.0 0.15 0.13 0.1 0.28 0.23 0.61 0.78 0.13 0.46 0.08
AMTR_s00075p00091010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00075.28)
0.02 0.16 0.09 0.12 0.06 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.55 0.57 0.25 0.14 0.19 0.25 0.84 1.0 0.84 0.31 0.31 0.12
AMTR_s00077p00042300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.24)
0.0 0.53 0.13 0.0 0.11 0.0 0.21 0.02 0.16 0.14 0.66 0.96 0.36 0.17 0.15 0.42 0.65 1.0 0.95 0.31 0.96 0.15
AMTR_s00078p00106750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.78)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.53 0.47 0.06 0.03 0.02 0.01 0.63 1.0 0.66 0.08 0.23 0.01
AMTR_s00081p00136350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.52)
0.12 0.0 0.17 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.79 0.36 0.13 0.05 0.25 0.91 0.89 1.0 0.23 0.4 0.2
AMTR_s00101p00041820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.13)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.11 0.0 0.06 0.04 0.05 0.04 0.6 0.37 0.21 0.13 0.09 0.18 0.81 1.0 0.93 0.28 0.38 0.08
AMTR_s00106p00104330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.74)
0.0 0.1 0.01 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.08 0.07 0.59 0.48 0.31 0.17 0.13 0.4 1.0 0.65 0.66 0.16 0.58 0.24
AMTR_s00106p00119930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.91)
0.11 0.14 0.11 0.02 0.15 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.38 0.3 0.14 0.09 0.14 0.7 1.0 0.78 0.48 0.38 0.27 0.16
AMTR_s00120p00054610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.17)
0.04 0.02 0.01 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.58 0.23 0.11 0.07 0.11 0.76 0.94 1.0 0.68 0.34 0.03
AMTR_s00131p00066980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.39)
0.04 0.28 0.13 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.49 0.32 0.24 0.14 0.61 1.0 0.97 0.87 0.52 0.52 0.19
AMTR_s00133p00054340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.19)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.23 0.15 0.03 0.02 0.14 1.0 0.99 0.92 0.31 0.64 0.09
AMTR_s00145p00079180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00145.28)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.64 0.31 0.24 0.05 0.09 0.75 0.84 1.0 0.29 0.43 0.11
AMTR_s00147p00104660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.61)
0.12 0.0 0.0 0.05 0.06 0.06 0.07 0.0 0.2 0.11 0.51 0.43 0.19 0.08 0.08 0.22 1.0 0.67 0.62 0.5 0.34 0.09
AMTR_s00176p00057350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00176.30)
0.07 0.04 0.03 0.04 0.24 0.0 0.19 0.02 0.15 0.16 0.47 0.41 0.27 0.25 0.2 0.44 1.0 0.88 0.78 0.71 0.7 0.16
AMTR_s00216p00022320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00216.3)
0.0 0.0 0.35 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.52 0.19 0.11 0.03 0.15 0.85 1.0 0.92 0.25 0.52 0.06
AMTR_s02459p00002170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02459.1)
0.0 0.0 0.51 0.07 0.05 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.83 0.95 0.2 0.11 0.05 0.43 0.38 1.0 0.93 0.19 0.89 0.07
AMTR_s05169p00002110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05169.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.86 0.98 0.18 0.17 0.06 0.28 0.43 1.0 0.59 0.17 0.51 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)