Heatmap: Cluster_161 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo104974 (PACid_15415922)
-0.02 0.25 0.07 -0.0 0.15 0.16 -0.23 -0.32 -0.37 -0.38 -0.48 -0.47 0.95 1.4 -0.08 1.14 -0.31 -0.32 0.12 -1.53 -0.81 -3.33 0.28 0.33 0.19 -0.1 -0.06 -0.11 -0.5 -0.38 -0.5 -0.2
Smo108317 (PACid_15422760)
-0.17 0.05 0.28 0.22 0.21 0.27 0.44 0.32 0.67 0.64 0.49 0.05 -0.42 0.62 0.57 0.68 0.01 -0.47 -0.63 -3.29 -2.02 -1.77 0.19 0.01 -3.31 -0.49 -0.01 0.61 0.02 0.29 -1.04 -0.85
Smo111811 (PACid_15413458)
0.19 -0.05 -0.04 -0.1 -0.01 0.15 -0.23 -0.36 -0.35 -0.34 -0.43 -0.37 1.69 2.09 0.22 1.57 -0.66 -0.63 -0.16 -6.42 -5.63 -4.79 0.74 -0.01 -1.24 -1.72 -1.05 -0.55 -0.37 -0.29 -1.14 -0.52
Smo112135 (PACid_15411093)
-0.28 -0.28 -0.27 -0.19 -0.26 -0.27 -0.25 0.07 0.1 0.28 0.23 0.13 1.14 1.11 0.9 1.1 -0.26 -0.41 0.13 -0.55 -1.61 -5.47 -0.34 -0.07 -0.48 0.56 -0.76 -0.65 -0.08 -0.06 -0.42 -0.61
Smo115983 (PACid_15403609)
0.22 -0.35 -0.26 -0.29 -0.01 -0.03 -0.01 0.03 0.12 0.28 0.42 0.17 0.87 1.04 0.44 0.99 -0.95 -0.25 0.58 -8.38 -1.67 -3.99 -0.57 -0.54 -1.77 0.75 0.15 0.26 -0.16 -0.13 -0.33 -0.11
Smo118638 (PACid_15410086)
-0.91 -1.15 -0.47 -0.36 -0.0 -0.26 0.32 -0.28 -0.72 -0.79 -0.77 -0.9 2.44 2.21 0.26 0.38 -0.93 -0.73 0.17 -0.07 -2.25 -2.35 -1.02 -1.08 -0.56 1.18 -0.06 -0.27 -1.12 -0.86 -2.21 -2.4
Smo125797 (PACid_15409394)
0.13 -0.06 -0.16 -0.15 -0.36 -0.29 -0.48 -0.27 -0.18 -0.01 -0.17 0.03 1.32 1.29 -0.42 1.07 -0.2 -0.48 0.39 -1.12 0.76 -5.84 -0.15 0.03 0.56 -0.48 -1.09 -0.92 -0.2 -0.19 -0.55 -0.3
Smo140818 (PACid_15409714)
-0.02 -0.11 -0.27 -0.2 -0.35 -0.23 -0.34 -0.2 -0.07 0.01 0.11 0.14 0.41 1.1 0.98 0.59 -0.29 -0.0 0.02 -1.46 -0.89 -0.81 0.32 0.61 -1.17 0.67 -0.47 -0.5 -0.35 -0.25 -0.23 -0.05
Smo142584 (PACid_15413511)
0.15 -0.13 -0.16 -0.13 -0.23 -0.14 -0.21 0.16 0.21 0.34 0.41 0.3 0.81 0.78 0.29 0.52 -0.28 -0.41 0.02 -1.53 -1.17 -1.82 -0.02 0.03 -0.28 0.57 -0.56 -0.61 -0.12 -0.1 0.07 0.15
Smo143457 (PACid_15415599)
0.19 0.39 0.22 0.02 -0.05 -0.05 -0.04 -0.02 -0.15 0.02 -0.12 -0.02 0.52 1.38 0.18 0.32 -0.08 -0.31 0.2 -0.51 -2.32 -2.24 0.42 0.53 -1.05 0.06 -0.22 -0.43 -0.36 -0.37 -0.19 -0.2
Smo146421 (PACid_15401928)
-0.31 -0.15 -0.21 -0.04 -0.18 -0.14 -0.1 0.03 0.11 0.08 0.09 -0.01 0.64 1.09 0.37 0.7 -0.58 -0.48 0.06 -2.11 -0.53 -1.23 0.2 0.43 -0.46 0.5 0.16 0.16 -0.45 -0.41 -0.21 -0.11
Smo146904 (PACid_15405646)
-0.27 -0.24 -0.17 -0.14 0.05 0.0 -0.05 0.08 -0.04 -0.0 -0.0 -0.28 0.67 0.73 0.66 0.76 -0.5 -0.67 0.33 -1.88 -1.64 -2.88 0.07 0.31 -0.15 0.78 0.55 0.71 -0.31 -0.24 -0.64 -0.93
Smo148632 (PACid_15409332)
0.23 -0.14 -0.33 -0.0 -0.2 0.01 -0.48 0.07 0.42 0.35 0.49 0.41 0.86 0.9 0.34 0.36 -0.98 -0.26 -0.04 -1.96 -0.64 -1.55 -0.16 0.69 -1.81 1.26 -0.93 -1.18 -0.5 -0.6 -0.45 0.12
Smo161472 (PACid_15401804)
-0.46 -0.12 -0.09 0.3 0.05 0.2 0.13 0.11 0.09 0.07 -0.1 -0.16 1.15 1.31 0.3 0.41 -0.53 -0.62 0.82 -3.88 -2.39 -3.14 -0.18 -0.0 -0.18 0.0 0.4 0.21 -0.42 -0.24 -0.64 -0.6
Smo164029 (PACid_15407294)
0.15 -0.18 -0.43 -0.46 -0.67 -0.6 -0.57 -0.37 -0.06 0.23 0.24 0.44 1.33 1.03 0.31 1.09 -0.54 -0.79 0.18 -1.18 0.06 -0.74 0.31 0.44 0.34 -0.48 -1.82 -2.39 -0.12 -0.13 -0.31 0.01
Smo165154 (PACid_15411230)
-0.07 -0.21 -0.15 0.12 -0.12 0.06 0.08 0.47 0.44 0.63 0.48 0.36 1.07 1.04 0.62 0.61 -0.73 -1.01 -0.14 -1.64 -1.9 -2.87 -0.35 -0.18 -1.52 0.93 -0.57 -0.54 -0.39 -0.42 -0.49 -0.41
Smo166561 (PACid_15417174)
0.04 -0.38 -0.31 -0.51 -0.22 -0.35 0.01 0.07 0.22 0.26 0.22 -0.15 1.03 1.34 0.46 1.17 -1.35 -1.27 0.31 -5.58 -9.0 - -0.03 0.6 -3.28 0.54 0.15 -0.25 -0.44 -0.26 0.15 0.67
Smo167350 (PACid_15418544)
0.18 -0.15 -0.27 -0.25 -0.08 -0.16 -0.22 0.03 0.2 0.23 0.26 0.25 0.4 0.81 0.36 0.71 -0.6 -0.58 0.26 -1.13 -0.92 -0.99 0.06 0.25 -1.02 0.42 0.04 -0.21 -0.2 -0.04 0.19 -0.13
Smo168478 (PACid_15422173)
0.26 0.04 -0.27 -0.21 -0.28 -0.01 -0.32 -0.2 -0.04 0.16 0.0 -0.03 0.84 1.77 0.37 0.87 -0.89 -0.25 0.48 -5.45 -1.79 -6.48 0.63 0.67 -2.0 0.02 -0.49 -0.62 -0.24 -0.21 -0.39 -0.23
Smo170181 (PACid_15403728)
-0.03 -0.21 -0.13 -0.15 -0.22 -0.26 0.1 0.37 0.55 0.54 0.55 0.26 1.29 1.52 0.44 0.6 -1.25 -0.6 0.07 -4.73 -3.53 -2.73 -0.37 0.08 -2.44 0.41 -0.57 -0.93 -0.33 -0.21 -0.06 -0.08
Smo170305 (PACid_15405092)
0.2 0.14 0.1 0.09 0.2 0.06 0.03 0.14 0.14 0.32 0.12 0.11 0.5 0.81 0.2 0.62 -0.34 -0.77 0.14 -0.53 -0.83 -1.12 0.14 0.29 -1.7 -0.26 -0.3 -0.25 -0.15 -0.15 -0.11 -0.15
Smo170418 (PACid_15405896)
-0.52 -0.96 -0.52 0.01 0.07 -0.19 -0.0 0.54 0.33 0.44 0.49 -0.17 1.61 1.7 -2.21 0.36 -1.62 -1.37 0.56 -9.28 -2.67 -8.15 -0.66 -0.36 -0.17 1.05 0.05 -0.61 -0.49 -0.65 0.38 -0.08
Smo173572 (PACid_15415678)
-0.18 -0.75 -0.68 -0.63 -0.64 -0.47 -1.11 -0.37 -0.6 -0.1 0.14 -0.26 2.1 2.22 -2.85 2.01 -3.5 -2.17 -2.06 - -4.24 -4.92 -0.25 1.52 0.21 -0.34 -0.15 -0.7 -1.24 -1.1 -0.7 -0.55
Smo179181 (PACid_15407699)
-0.12 -0.02 -0.06 0.03 -0.05 -0.0 0.01 0.01 -0.02 0.01 -0.08 -0.25 0.85 1.1 1.04 0.87 -0.39 -0.7 0.33 -0.01 -1.12 -1.85 0.16 0.34 -0.82 -0.37 -0.42 -0.63 -0.4 -0.39 -0.45 -0.35
Smo227210 (PACid_15403099)
-0.23 -0.4 -0.24 -0.29 -0.41 -0.26 -0.19 0.02 0.21 0.23 0.24 0.07 0.61 0.44 0.73 0.63 -0.33 -0.56 0.39 -0.21 -0.7 -0.95 0.19 0.52 -0.47 0.29 -0.67 -0.54 -0.25 -0.18 0.09 0.24
Smo230913 (PACid_15417613)
-0.33 -0.13 0.11 0.17 0.01 0.08 0.39 0.26 0.45 0.39 0.4 -0.03 -0.15 0.66 0.59 0.92 0.2 -1.26 -0.44 -0.85 -2.12 -2.09 0.39 0.21 -2.2 -0.62 -0.23 0.38 0.25 0.51 -0.77 -0.58
Smo231716 (PACid_15419036)
-0.31 -0.33 -0.07 -0.08 -0.26 -0.36 0.35 0.32 0.34 0.57 0.36 0.26 1.06 0.68 0.58 0.69 -0.56 -0.42 0.33 -3.82 -3.02 -5.32 -0.1 0.12 -2.47 0.75 -0.46 -0.68 -0.03 -0.21 0.18 0.28
Smo233612 (PACid_15401701)
-0.18 -0.1 -0.09 -0.14 -0.2 -0.21 -0.37 -0.15 -0.2 -0.14 -0.14 -0.22 1.1 1.19 0.65 0.98 -0.4 -0.5 0.4 -3.41 -1.68 -5.3 0.27 0.53 -0.42 0.63 0.01 0.08 -0.25 -0.21 -0.54 -0.35
Smo267191 (PACid_15409039)
-0.11 -0.33 -0.35 -0.24 -0.24 -0.3 -0.26 -0.04 0.1 0.22 0.2 0.1 0.87 1.03 1.03 0.85 -0.5 -0.67 0.12 -3.01 -1.55 -2.53 0.23 0.6 -0.39 0.63 -0.37 -0.29 -0.52 -0.4 -0.3 0.13
Smo270191 (PACid_15418112)
-0.54 -0.81 -0.31 -0.33 -0.38 -0.81 -0.05 0.01 -0.02 0.04 0.19 -0.06 2.16 2.1 -0.6 0.55 -1.16 -0.14 0.24 -6.77 -3.62 - -1.07 -0.43 -1.17 0.98 0.27 -0.14 -0.81 -0.81 -0.63 -0.54
Smo271043 (PACid_15420161)
-0.1 -0.26 -0.24 -0.1 0.0 -0.09 -0.05 0.15 0.16 0.16 0.1 0.12 0.74 0.91 0.82 0.79 -0.56 -0.6 0.3 -1.35 -1.0 -2.59 -0.46 -0.4 -0.65 0.76 -0.11 -0.02 -0.17 -0.13 -0.1 -0.13
Smo271067 (PACid_15420213)
-0.03 -0.05 -0.42 -0.32 -0.29 -0.34 -0.28 -0.08 -0.1 0.09 0.04 0.14 1.11 0.73 0.26 0.69 -0.28 -0.63 0.62 -1.04 0.16 -3.51 0.3 0.48 0.33 -0.03 -0.8 -0.88 0.2 0.29 -0.62 -0.57
Smo38723 (PACid_15417347)
-2.05 -2.62 -3.28 -3.08 -2.93 -2.48 -3.06 -2.58 -2.97 -2.77 -2.32 -3.14 2.12 2.77 -1.16 1.15 -2.07 -0.0 -0.19 -3.87 -2.6 -4.91 0.89 2.94 -0.66 -1.6 -2.24 -2.82 -0.56 0.02 -0.78 -0.23
Smo402947 (PACid_15408048)
-0.49 -0.46 -0.19 -0.06 -0.2 0.1 0.28 0.37 0.4 0.2 0.32 -0.23 0.62 0.63 0.73 0.5 -0.66 -0.44 -0.07 -1.13 -1.96 -0.97 0.19 0.46 -1.36 0.56 0.16 -0.25 -0.41 -0.02 -0.26 0.13
Smo414970 (PACid_15421181)
0.2 -0.05 -0.17 0.05 -0.17 -0.36 -0.58 -0.08 -0.36 -0.02 0.17 0.28 1.04 1.02 -0.53 1.08 -0.63 -0.34 0.22 -2.3 0.6 - -0.25 0.4 0.48 -0.1 -0.35 0.07 -0.48 0.23 -0.71 -0.93
Smo420505 (PACid_15413607)
-0.34 -0.2 -0.18 -0.01 0.04 0.06 0.18 0.38 0.53 0.28 0.26 0.01 0.36 0.26 0.81 0.71 -0.08 -0.95 0.06 -0.25 -0.8 -2.36 0.07 0.22 -1.08 0.49 -0.32 -0.01 -0.06 0.05 -0.59 -0.84
Smo424064 (PACid_15421432)
-0.04 -0.28 -0.3 -0.41 -0.48 -0.4 -0.27 0.1 0.17 0.49 0.45 0.31 1.54 1.56 -0.2 1.47 -1.05 -0.43 -0.53 -1.49 -1.99 -1.02 0.19 0.59 -1.78 0.03 -1.43 -1.24 -0.76 -0.72 -0.31 -0.26
Smo424236 (PACid_15422905)
-0.19 0.07 -0.14 0.35 0.26 0.28 0.05 0.29 0.18 0.31 0.19 0.17 1.07 0.97 0.46 1.21 -0.42 -1.69 0.3 -2.82 -1.82 - -0.25 -0.24 -0.57 0.62 -0.42 -0.55 -0.46 -0.37 -0.6 -0.7
Smo437354 (PACid_15417489)
0.14 -0.85 -0.98 -1.4 -1.09 -1.12 -1.3 -0.39 -0.14 0.15 0.5 -0.1 1.99 1.63 -1.55 1.79 -1.15 -0.54 -0.22 -2.83 -0.6 -5.97 0.39 1.12 0.47 -0.1 -2.07 -2.97 -0.16 -0.74 -0.48 -0.07
Smo437417 (PACid_15418155)
-0.18 -0.21 -0.24 -0.03 -0.03 -0.04 -0.07 -0.09 0.12 0.12 0.11 -0.09 1.05 0.9 0.28 0.88 -0.61 -0.49 0.6 - -2.22 -2.88 -0.22 0.04 -0.87 0.91 0.49 0.56 -0.28 -0.01 -0.8 -0.76
Smo440462 (PACid_15404890)
-0.15 -0.17 -0.15 -0.03 0.01 -0.12 -0.07 0.05 0.1 0.14 0.04 -0.06 1.09 1.0 0.04 0.92 -0.55 -1.02 0.11 -2.73 -1.69 -4.01 0.13 0.29 0.17 0.62 0.12 0.14 -0.26 -0.19 -0.38 -0.36
Smo441749 (PACid_15410226)
-0.17 -0.17 0.02 0.16 0.11 -0.09 0.3 0.48 0.45 0.56 0.4 0.17 1.51 1.05 -0.22 1.3 -0.74 -1.7 -0.25 -2.32 -1.8 -3.06 -0.96 -0.45 -1.29 0.69 -0.55 -0.31 -0.62 -0.69 -0.23 -0.54
Smo443112 (PACid_15411402)
-0.49 -1.26 -1.6 -1.43 -1.27 -1.09 -1.47 -0.69 -0.69 -0.38 -0.06 -0.88 2.25 2.54 -0.02 1.13 -2.83 -0.94 -0.7 -1.99 -3.23 -7.84 0.42 1.94 0.34 0.72 -1.44 -2.73 -1.59 -1.54 -1.66 -1.35
Smo443347 (PACid_15412996)
-0.18 -0.0 -0.01 0.18 0.16 -0.13 -0.03 0.16 0.1 0.14 0.05 -0.06 1.35 1.3 0.55 0.99 -0.8 -1.49 -0.27 -2.69 -2.05 -2.39 -0.45 -0.1 -1.46 0.69 0.38 0.54 -0.69 -0.44 -1.03 -0.66
Smo445677 (PACid_15421100)
-0.11 -0.16 -0.19 -0.02 -0.06 -0.06 0.07 0.22 0.32 0.45 0.35 0.3 1.5 1.09 0.18 1.14 -0.84 -1.32 0.09 -2.41 -2.52 -2.43 -0.27 -0.01 -1.49 0.67 -0.25 -0.25 -0.61 -0.47 -0.56 -0.58
Smo55684 (PACid_15422229)
0.23 0.16 0.06 0.05 -0.03 -0.08 -0.04 -0.15 -0.14 -0.11 -0.14 -0.13 0.99 1.0 0.94 1.18 -0.73 -0.9 -0.27 -3.03 - - -0.29 0.09 -5.27 0.59 0.84 0.95 -0.46 -0.29 -0.7 -0.73
Smo66385 (PACid_15407739)
0.29 0.16 0.23 0.13 0.15 0.12 -0.63 -0.35 -0.2 0.02 -0.17 -0.03 1.25 2.2 0.08 1.03 -0.31 -0.48 0.18 -5.42 -1.2 -3.64 -0.11 -0.1 -0.66 -1.17 -0.98 -0.57 -0.41 -0.3 -1.06 -0.77
Smo73281 (PACid_15405437)
-0.12 -0.27 -0.36 -0.32 -0.39 -0.43 -0.73 -0.33 0.01 -0.05 0.04 -0.13 1.29 0.8 0.74 1.01 -0.38 -0.83 0.78 -1.06 -0.6 -1.42 0.15 0.55 0.54 0.33 -1.06 -1.01 -0.03 -0.06 -0.8 -0.64
Smo74069 (PACid_15406788)
0.16 0.05 -0.11 0.04 -0.05 -0.03 -0.21 0.12 0.31 0.45 0.5 0.43 0.77 1.35 0.35 0.92 -0.72 -1.08 0.46 -2.79 -1.37 -2.92 0.24 0.39 -2.01 -0.01 -0.82 -0.85 -0.42 -0.41 -0.28 -0.16
Smo76972 (PACid_15419602)
-0.5 -0.5 -0.28 -0.12 -0.03 -0.0 -0.16 0.07 -0.24 -0.28 -0.47 -0.67 0.83 0.81 0.42 0.72 -0.31 -0.66 0.36 -2.17 -1.73 -3.3 0.26 0.3 -0.47 1.24 0.76 0.76 -0.18 -0.2 -0.62 -0.45
Smo77786 (PACid_15420973)
-0.9 -0.76 -0.28 -0.35 -0.41 -0.17 -0.08 0.06 0.43 0.56 0.66 0.32 -0.31 1.38 0.95 1.2 0.23 -0.35 -0.77 -1.69 -5.54 -2.26 0.45 -0.58 -3.87 -1.23 -0.88 -0.13 0.85 1.12 -0.25 -1.05
Smo84536 (PACid_15417798)
-0.44 -0.35 -0.56 -0.21 -0.31 -0.35 -0.36 -0.04 -0.14 -0.22 -0.32 -0.44 1.13 1.16 0.62 1.27 -0.18 -0.56 1.0 -5.16 -2.8 -3.03 0.39 -0.26 -0.31 0.68 0.24 0.34 -0.04 0.02 -0.96 -0.9
Smo88332 (PACid_15405593)
-0.12 -0.12 -0.1 -0.1 -0.01 -0.22 -0.11 0.0 -0.03 -0.18 0.01 -0.29 0.83 0.78 0.43 1.14 -0.57 -0.49 0.18 -3.7 -2.46 -3.86 0.07 0.52 -0.7 0.9 0.57 0.47 -0.48 -0.25 -0.42 -0.32
Smo89681 (PACid_15411041)
-0.13 -0.42 -0.39 -0.59 -0.41 -0.09 -0.3 -0.31 -0.09 -0.11 0.25 -0.29 1.49 2.16 -1.74 1.46 -0.43 -0.01 0.45 -5.94 1.39 -6.27 -0.95 -1.32 -3.63 -1.21 -0.83 -1.0 -0.05 -0.45 -0.39 -0.5
Smo93021 (PACid_15418241)
0.01 -0.03 0.01 0.01 -0.28 -0.02 -0.28 -0.18 -0.25 -0.09 -0.19 -0.14 1.28 1.34 0.36 1.22 -0.49 -0.32 0.36 -1.49 -0.15 -3.19 0.03 0.28 0.53 -1.09 -1.09 -0.99 -0.35 -0.34 -0.47 -0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.