Heatmap: Cluster_356 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.15 0.23 0.05 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.82 0.13 0.46 0.01 0.02 0.13 0.02 0.02 0.01 0.02 0.4 0.0 0.0 0.2 0.58 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.49 0.31 0.08 0.39 0.03 0.27 0.25 0.19 0.04 0.1 0.12 0.0 0.53 0.18 0.31 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.07
0.15 0.66 0.02 0.02 0.02 0.0 0.38 0.03 0.01 0.0 0.02 1.0 0.0 0.59 0.01 0.0 0.06 0.03 0.01 0.01 0.0 0.82 0.01 0.14 0.21 0.7 0.73 0.02 0.14 0.06 0.01 0.01 0.08
0.04 0.12 0.05 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.94 0.08 0.6 0.06 0.06 0.14 0.01 0.03 0.04 0.07 0.04 0.3 0.04 0.21 0.21 0.23 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01
0.14 0.16 0.18 0.17 0.19 0.38 0.62 0.17 0.12 0.34 0.32 1.0 0.12 0.7 0.37 0.39 0.15 0.27 0.33 0.34 0.28 0.34 0.21 0.14 0.18 0.63 0.6 0.15 0.19 0.22 0.15 0.14 0.29
0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.74 0.35 0.77 0.04 0.0 0.16 0.06 0.02 0.08 0.05 0.25 0.57 0.31 0.5 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.34 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.14 0.29 0.33 0.14 0.18 0.14 0.03 0.1 0.04 0.11 0.41 0.04 0.35 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.05 0.17 0.02 0.0 0.02 0.0 0.88 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.15 0.35 0.0 0.01 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.31 0.06 0.12 0.3 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.32 0.01 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.19 0.09 0.07 0.18 0.1 0.0 0.0 0.02 0.02 0.1 0.68 0.08 0.16 0.36 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.19 0.01 0.05 0.03 0.08 0.59 0.14 0.09 0.14 0.15 1.0 0.14 0.29 0.06 0.23 0.27 0.15 0.23 0.14 0.13 0.07 0.4 0.24 0.15 0.46 0.5 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.5 0.04 0.01 0.01 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.37 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02 0.97 0.06 0.88 0.03 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.28 0.1 0.06 1.0 0.8 0.48 0.91 0.31 0.06 0.16 0.54
0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.51 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.17 0.36 0.13 0.07 0.13 0.12 0.06 0.06 0.07 0.1 0.35 0.12 0.28 0.34 0.46 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.09
0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.56 1.0 0.43 0.47 0.1 0.32 0.3 0.15 0.21 0.09 0.09 0.22 0.22 0.08 0.46 0.38 0.49 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.08 0.09 0.11 0.15 0.13 0.94 0.1 0.13 0.07 0.44 1.0 0.21 0.5 0.44 0.36 0.41 0.26 0.29 0.23 0.27 0.32 0.48 0.28 0.32 0.7 0.69 0.08 0.13 0.22 0.11 0.1 0.19
0.04 0.18 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.01 0.04 0.3 0.27 0.16 0.1 0.05 0.01 0.04 0.18
0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.32 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.01 0.03 0.05 0.49 0.4 0.3 0.2 0.13 0.02 0.1 0.33
0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.27 0.48 0.12 0.14 0.22 0.0 0.01 0.05 0.01 0.19 0.62 0.01 0.56 0.26 0.4 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.11
0.18 0.35 0.04 0.02 0.06 0.03 0.13 0.03 0.05 0.03 0.02 1.0 0.1 0.94 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.71 0.37 0.06 0.44 0.31 0.44 0.0 0.05 0.19 0.02 0.01 0.09
0.15 0.36 0.01 0.0 0.02 0.01 0.63 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.18 0.07 0.07 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.08 0.05 0.0 0.47 0.45 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.01 0.0 0.0 0.14 1.0 0.32 0.46 0.08 0.14 0.31 0.1 0.14 0.11 0.13 0.3 0.5 0.22 0.23 0.34 0.35 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.02
0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.7 0.0 0.0 0.0 0.15 0.84 0.12 0.48 0.08 0.06 0.1 0.06 0.09 0.04 0.04 0.03 0.18 1.0 0.32 0.17 0.21 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.13 0.32 0.0 0.06 0.13 0.02 0.0 0.06 0.02 0.0 0.14 0.09 0.72 0.37 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.83 0.07 0.0 0.15 0.17 0.29 0.06 0.01 0.2 0.0 0.62 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.01 0.0 0.0 0.09 0.67 0.18 0.06 0.04 0.05 0.37 0.01 0.03 0.02 0.04 0.09 1.0 0.09 0.41 0.22 0.4 0.0 0.08 0.16 0.01 0.01 0.06
0.01 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.67 0.0 0.01 0.01 0.02 1.0 0.13 0.28 0.01 0.05 0.11 0.0 0.0 0.01 0.01 0.09 0.25 0.07 0.17 0.16 0.18 0.03 0.04 0.02 0.01 0.0 0.04
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.99 0.15 0.62 0.19 0.27 0.2 0.23 0.13 0.15 0.19 0.26 0.62 0.52 0.29 0.27 0.36 0.02 0.05 0.18 0.11 0.08 0.03
0.24 0.27 0.12 0.07 0.01 0.01 1.0 0.03 0.04 0.02 0.04 0.97 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.3 0.02 0.0 0.06 0.82 0.88 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03
0.04 0.17 0.01 0.0 0.01 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.34 0.84 0.08 0.28 0.19 0.26 0.26 0.18 0.25 0.16 0.31 0.04 0.36 0.18 0.25 0.01 0.05 0.15 0.05 0.01 0.03
0.03 0.18 0.0 0.01 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.24 0.77 0.01 0.21 0.18 0.28 0.27 0.22 0.23 0.28 0.4 0.08 0.25 0.12 0.14 0.01 0.11 0.11 0.01 0.0 0.07
0.34 0.78 0.1 0.08 0.02 0.05 1.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.19 0.12 0.05 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.04 0.25 0.52 0.84 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.01 0.0 0.0 0.21 1.0 0.23 0.3 0.14 0.13 0.13 0.0 0.09 0.11 0.06 0.24 0.41 0.19 0.38 0.17 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.81 0.12 0.26 0.01 0.05 0.12 0.04 0.03 0.01 0.02 0.07 0.18 0.04 0.17 0.25 0.25 0.03 0.08 0.04 0.03 0.0 0.01
0.04 0.16 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.97 0.48 0.56 0.02 0.16 0.41 0.1 0.1 0.05 0.07 0.44 0.37 0.07 0.61 0.54 0.68 0.03 0.08 0.12 0.06 0.05 0.07
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.02 0.28 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.06 0.09 0.04 0.09 0.35 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.9 0.4 0.65 0.41 0.06 0.33 0.3 0.24 0.2 0.21 0.09 0.33 0.05 0.49 0.44 0.53 0.04 0.24 0.28 0.05 0.01 0.26
0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.42 0.08 0.07 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.17 0.05 0.16 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.66 0.04 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.86 0.04 0.14 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.16 0.0 0.09 0.45 0.6 0.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.05
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.28 0.87 0.4 0.47 0.33 0.23 0.33 0.2 0.2 0.16 0.16 0.09 0.44 1.0 0.29 0.32 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.93 0.05 0.09 0.02 0.25 1.0 0.37 0.55 0.18 0.32 0.11 0.07 0.17 0.16 0.18 0.12 0.15 0.2 0.91 0.45 0.6 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.04
0.04 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.21 0.91 0.05 0.36 0.02 0.05 0.04 0.06 0.1 0.07 0.08 0.29 0.02 0.02 0.25 0.54 0.56 0.22 0.17 0.14 0.22 0.21 0.25
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.06 0.0 0.0 0.01 1.0 0.09 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.35 0.15 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.26 0.01 0.01 0.01 0.01 0.88 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.25 0.36 0.02 0.01 0.17 0.05 0.01 0.0 0.03 0.16 0.65 0.17 0.37 0.22 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.36 0.01 0.01 0.0 0.0 0.23 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.07 0.39 0.03 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.45 0.06 0.21 0.79 0.65 0.16 0.31 0.1 0.03 0.05 0.21
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.94 0.32 0.29 0.57 0.74 0.6 0.24 0.38 0.25 0.39 0.38 0.09 0.55 0.41 0.75 0.75 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02
0.1 0.13 0.04 0.04 0.06 0.1 0.96 0.04 0.05 0.04 0.34 1.0 0.09 0.65 0.22 0.43 0.16 0.27 0.24 0.22 0.23 0.39 0.17 0.15 0.19 0.16 0.16 0.1 0.14 0.17 0.1 0.1 0.14
0.24 0.46 0.13 0.21 0.18 0.27 1.0 0.12 0.18 0.43 0.72 0.81 0.28 0.64 0.37 0.82 0.45 0.88 0.79 0.52 0.9 0.47 0.39 0.26 0.47 0.84 0.85 0.08 0.1 0.15 0.1 0.08 0.19
0.25 0.86 0.07 0.02 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.08 0.06 0.03 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.42 1.0 0.24 0.78 0.81 0.46 0.53 0.2 0.34 0.76 0.13
0.18 0.42 0.01 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.2 1.0 0.39 0.43 0.04 0.08 0.31 0.07 0.1 0.08 0.1 0.39 0.35 0.17 0.47 0.56 0.67 0.03 0.06 0.09 0.05 0.03 0.12
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.1 0.3 0.16 0.3 0.15 0.14 0.17 0.22 0.13 0.05 0.17 0.11 0.25 0.35 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.51 0.0 0.0 0.06 0.01 0.27 0.0 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.0 0.05 0.46 0.93 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.16 0.05 0.01 0.03 0.04 1.0 0.02 0.0 0.08 0.19 0.52 0.07 0.24 0.41 0.19 0.06 0.21 0.17 0.13 0.13 0.05 0.31 0.02 0.17 0.53 0.59 0.03 0.05 0.11 0.0 0.01 0.1
0.16 0.5 0.05 0.05 0.02 0.05 0.45 0.02 0.01 0.06 0.05 1.0 0.11 0.27 0.05 0.04 0.11 0.01 0.01 0.01 0.01 0.54 0.07 0.02 0.45 0.48 0.48 0.04 0.12 0.13 0.02 0.02 0.13
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.09 0.31 0.02 0.02 0.09 0.05 0.01 0.04 0.03 0.01 0.13 0.02 0.25 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.11 0.03 0.01 0.0 0.0 0.64 0.01 0.0 0.0 0.02 1.0 0.27 0.48 0.01 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.52 0.51 0.04 0.26 0.38 0.29 0.05 0.04 0.08 0.11 0.07 0.25
0.09 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.03 0.03 0.32 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.82 0.01 0.02 0.0 0.59 0.98 0.52 0.34 0.32 0.53 0.46 0.45 0.41 0.38 0.5 0.48 0.92 0.94 0.23 1.0 0.75 0.04 0.12 0.13 0.06 0.04 0.13
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.16 0.62 0.17 0.18 0.21 0.07 0.09 0.09 0.07 0.17 0.34 0.19 0.26 0.16 0.2 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01
0.39 0.99 0.15 0.09 0.12 0.28 0.69 0.16 0.25 0.18 0.49 0.64 0.12 0.28 0.28 0.26 0.33 0.53 0.3 0.39 0.32 0.17 0.37 0.07 0.39 0.81 1.0 0.01 0.04 0.1 0.01 0.01 0.19
0.21 0.46 0.03 0.03 0.01 0.02 0.77 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.05 0.4 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.08 0.06 0.11 0.74 0.61 0.02 0.11 0.15 0.01 0.02 0.35
0.01 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.99 0.01 0.01 0.01 0.12 0.52 0.38 0.68 0.48 1.0 0.23 0.13 0.08 0.04 0.05 0.16 0.82 0.96 0.26 0.38 0.31 0.14 0.14 0.18 0.12 0.16 0.16
0.02 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.05 0.03 0.0 0.17 0.88 0.18 0.71 0.1 0.06 0.49 0.0 0.07 0.0 0.0 0.19 1.0 0.11 0.84 0.68 0.82 0.09 0.3 0.4 0.12 0.19 0.58
0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.14 0.81 0.08 0.12 0.04 0.14 0.05 0.08 0.06 0.07 0.34 0.15 0.15 0.2 0.27 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.01
0.05 0.14 0.03 0.02 0.02 0.04 0.58 0.02 0.03 0.02 0.6 0.7 0.23 0.17 0.27 0.26 0.28 0.4 0.43 0.31 0.42 0.22 0.46 0.14 0.37 0.67 1.0 0.01 0.09 0.08 0.01 0.0 0.18
0.1 0.32 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.87 0.07 0.66 0.07 0.1 0.08 0.08 0.07 0.1 0.02 0.11 0.08 0.01 0.11 0.43 0.66 0.0 0.04 0.41 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.17 0.0 0.04 0.11 0.06 0.0 0.13 0.03 0.04 0.02 0.05 0.0 0.32 0.25 0.31 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02
0.05 0.03 0.05 0.06 0.04 0.05 1.0 0.01 0.01 0.04 0.07 0.63 0.04 0.28 0.27 0.09 0.17 0.06 0.09 0.08 0.09 0.21 0.3 0.04 0.18 0.32 0.45 0.19 0.19 0.14 0.15 0.14 0.27
0.25 0.49 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.61 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.0 0.04 0.44 0.64 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.03
0.3 0.8 0.17 0.14 0.09 0.31 0.91 0.08 0.1 0.17 0.09 1.0 0.19 0.53 0.18 0.23 0.27 0.05 0.05 0.06 0.07 0.21 0.88 0.23 0.3 0.6 0.63 0.04 0.08 0.1 0.04 0.02 0.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.64 0.05 0.25 0.0 0.06 0.02 0.0 0.03 0.0 0.06 0.16 0.24 0.33 0.1 0.25 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.23 0.35 0.14 0.04 0.21 0.08 0.05 0.03 0.03 0.11 0.36 0.43 0.17 0.31 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.01 0.19 1.0 0.1 0.58 0.18 0.19 0.18 0.14 0.12 0.11 0.13 0.18 0.33 0.12 0.22 0.34 0.46 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.03 0.09 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.17 0.0 0.16 0.24 0.18 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)