Heatmap: Cluster_379 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
LOC_Os01g24690.1	0.25	0.15	0.35	0.05	0.0	0.01	0.23	0.16	0.39	0.18	0.23	0.28	0.26	0.22	0.1	0.06	0.32	0.19	1.0	0.09	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.11	0.11	0.22	0.26	0.53	0.83
LOC_Os01g25610.1	0.19	0.14	0.22	0.01	0.0	0.02	0.16	0.11	0.25	0.14	0.19	0.43	0.18	0.18	0.08	0.05	0.26	0.15	0.59	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.33	0.37	0.58	1.0
LOC_Os01g39780.1	0.3	0.3	0.89	0.29	0.11	0.03	0.38	0.32	0.34	0.14	0.3	0.36	0.13	0.16	0.27	0.3	0.51	0.16	0.8	0.14	0.06	0.06	0.06	0.04	0.01	0.07	0.16	0.05	0.04	0.02	0.03	0.08	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.04	0.05	0.05	0.06	0.13	0.14	0.18	0.51	0.71	1.0
LOC_Os01g61814.1	0.19	0.15	0.49	0.01	0.0	0.0	0.2	0.13	0.39	0.14	0.19	0.34	0.15	0.17	0.04	0.03	0.31	0.14	0.11	0.11	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.09	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.02	0.04	0.03	0.05	0.11	0.12	0.27	0.33	0.7	1.0
LOC_Os01g62350.1	0.15	0.1	0.66	0.04	0.01	0.02	0.16	0.11	0.16	0.13	0.2	0.14	0.16	0.18	0.05	0.03	0.3	0.12	0.2	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.13	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.1	0.08	0.17	0.23	0.59	1.0
LOC_Os01g64090.1	0.11	0.07	0.19	0.01	0.0	0.02	0.12	0.09	0.25	0.05	0.09	0.22	0.13	0.16	0.04	0.03	0.22	0.12	0.34	0.07	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.23	0.37	0.71	1.0
LOC_Os02g01332.1	0.09	0.1	0.09	0.01	0.0	0.0	0.13	0.09	0.07	0.07	0.1	0.09	0.09	0.13	0.02	0.01	0.17	0.07	0.18	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.12	0.23	0.64	1.0
LOC_Os02g07490.1	0.08	0.05	0.09	0.03	0.02	0.01	0.14	0.12	0.07	0.06	0.06	0.15	0.05	0.1	0.04	0.03	0.15	0.06	0.05	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.09	0.37	0.79	1.0
LOC_Os02g21660.1	0.14	0.09	0.26	0.01	0.0	0.03	0.1	0.07	0.19	0.1	0.12	0.17	0.13	0.14	0.03	0.02	0.2	0.1	0.15	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.19	0.23	0.69	1.0
LOC_Os02g28810.1	0.15	0.1	0.5	0.01	0.0	0.01	0.14	0.09	0.14	0.1	0.11	0.18	0.13	0.14	0.05	0.03	0.26	0.1	0.4	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.16	0.2	0.59	1.0
LOC_Os02g48660.1	0.24	0.14	0.29	0.01	0.0	0.01	0.22	0.16	0.24	0.12	0.2	0.26	0.25	0.25	0.05	0.03	0.34	0.2	0.13	0.13	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.08	0.14	0.05	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.08	0.07	0.03	0.05	0.05	0.08	0.13	0.12	0.26	0.33	0.67	1.0
LOC_Os03g14530.1	0.11	0.11	0.2	0.0	0.0	0.0	0.13	0.11	0.17	0.11	0.15	0.24	0.17	0.21	0.03	0.02	0.27	0.19	0.23	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.23	0.37	0.68	1.0
LOC_Os03g18500.1	0.26	0.15	0.36	0.07	0.02	0.01	0.29	0.26	0.26	0.17	0.21	0.24	0.2	0.23	0.14	0.1	0.44	0.17	0.37	0.18	0.04	0.04	0.04	0.04	0.26	0.13	0.19	0.04	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05	0.07	0.05	0.06	0.19	0.1	0.17	0.42	1.0	0.99
LOC_Os03g63400.1	0.15	0.1	0.35	0.02	0.0	0.02	0.13	0.09	0.2	0.08	0.13	0.13	0.12	0.15	0.03	0.01	0.25	0.09	0.27	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.21	0.36	0.68	1.0
LOC_Os04g39700.1	0.18	0.12	0.41	0.01	0.0	0.01	0.16	0.1	0.14	0.08	0.14	0.17	0.15	0.18	0.07	0.05	0.29	0.12	0.82	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.23	0.29	0.6	1.0
LOC_Os04g42270.2	0.29	0.15	0.49	0.01	0.0	0.01	0.27	0.18	0.44	0.16	0.22	0.43	0.22	0.23	0.12	0.08	0.43	0.19	0.56	0.14	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.1	0.14	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.16	0.16	0.32	0.3	0.63	1.0
LOC_Os04g50990.1	0.22	0.14	0.37	0.02	0.0	0.01	0.26	0.17	0.37	0.08	0.16	0.06	0.15	0.18	0.05	0.03	0.38	0.15	0.21	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.1	0.25	0.35	0.66	1.0
LOC_Os04g51630.1	0.16	0.1	0.3	0.01	0.0	0.01	0.18	0.13	0.12	0.11	0.13	0.28	0.18	0.19	0.06	0.03	0.24	0.12	0.14	0.15	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.11	0.17	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.1	0.11	0.23	0.29	0.71	1.0
LOC_Os05g08410.1	0.23	0.16	0.45	0.06	0.02	0.29	0.29	0.25	0.17	0.15	0.2	0.21	0.13	0.15	0.05	0.05	0.31	0.13	0.19	0.14	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.1	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.1	0.13	0.39	0.81	1.0
LOC_Os05g30530.1	0.21	0.15	0.44	0.05	0.02	0.03	0.28	0.21	0.19	0.1	0.16	0.17	0.14	0.16	0.11	0.08	0.26	0.13	0.23	0.14	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.1	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.12	0.08	0.18	0.36	0.65	1.0
LOC_Os05g31000.1	0.21	0.12	0.27	0.0	0.0	0.0	0.21	0.15	0.15	0.13	0.18	0.17	0.14	0.18	0.07	0.05	0.28	0.15	0.21	0.12	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.07	0.14	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.12	0.1	0.21	0.37	0.8	1.0
LOC_Os05g45270.1	0.14	0.1	0.23	0.03	0.0	0.0	0.16	0.12	0.12	0.09	0.14	0.14	0.11	0.11	0.07	0.04	0.19	0.1	0.59	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.08	0.16	0.28	0.62	1.0
LOC_Os05g49030.1	0.31	0.23	0.74	0.04	0.03	0.16	0.29	0.21	0.48	0.19	0.24	0.32	0.21	0.22	0.22	0.15	0.39	0.2	0.88	0.16	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.1	0.15	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.17	0.18	0.36	0.37	0.71	1.0
LOC_Os06g37440.1	0.21	0.08	0.29	0.01	0.0	0.01	0.18	0.13	0.17	0.16	0.15	0.28	0.17	0.18	0.05	0.03	0.23	0.14	0.28	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.15	0.26	0.35	0.64	1.0
LOC_Os07g22600.1	0.26	0.14	0.32	0.02	0.01	0.03	0.22	0.19	0.3	0.15	0.17	0.29	0.19	0.22	0.07	0.08	0.31	0.16	0.42	0.18	0.05	0.06	0.06	0.05	0.23	0.13	0.15	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.12	0.17	0.25	0.23	0.47	1.0
LOC_Os07g36090.3	0.2	0.16	0.17	0.02	0.0	0.03	0.21	0.19	0.15	0.15	0.19	0.15	0.14	0.15	0.07	0.06	0.25	0.13	0.39	0.16	0.07	0.05	0.06	0.03	0.02	0.14	0.15	0.07	0.06	0.04	0.03	0.05	0.07	0.05	0.07	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.09	0.13	0.1	0.15	0.27	0.79	1.0
LOC_Os07g42450.1	0.22	0.13	0.12	0.02	0.0	0.01	0.12	0.09	0.12	0.07	0.11	0.16	0.13	0.13	0.03	0.02	0.18	0.1	0.3	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.07	0.22	0.26	0.68	1.0
LOC_Os07g42950.1	0.22	0.14	0.47	0.02	0.0	0.02	0.2	0.14	0.19	0.14	0.21	0.24	0.19	0.21	0.04	0.02	0.36	0.15	0.24	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.09	0.11	0.23	0.29	0.59	1.0
LOC_Os07g46750.1	0.26	0.2	0.49	0.01	0.0	0.02	0.31	0.22	0.41	0.16	0.23	0.32	0.29	0.31	0.09	0.06	0.39	0.25	0.32	0.17	0.05	0.05	0.04	0.04	0.17	0.1	0.14	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.06	0.03	0.05	0.04	0.05	0.19	0.22	0.37	0.38	0.71	1.0
LOC_Os08g03640.1	0.2	0.12	0.52	0.07	0.01	0.01	0.14	0.11	0.08	0.11	0.14	0.16	0.14	0.14	0.05	0.03	0.21	0.1	0.41	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.14	0.29	0.64	1.0
LOC_Os09g32520.1	0.11	0.13	0.37	0.05	0.01	0.18	0.28	0.19	0.26	0.06	0.15	0.18	0.23	0.24	0.06	0.03	0.29	0.17	0.16	0.11	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.07	0.11	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.05	0.06	0.03	0.04	0.03	0.05	0.13	0.07	0.17	0.46	0.78	1.0
LOC_Os09g32526.1	0.23	0.22	0.51	0.22	0.01	0.07	0.29	0.3	0.2	0.23	0.26	0.29	0.18	0.19	0.12	0.12	0.29	0.22	0.09	0.18	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.17	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.18	0.19	0.53	1.0	0.49
LOC_Os09g39220.1	0.11	0.06	0.19	0.0	0.0	0.01	0.1	0.08	0.07	0.06	0.09	0.16	0.1	0.1	0.05	0.06	0.22	0.1	0.1	0.1	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.09	0.1	0.19	0.25	1.0	0.91
LOC_Os09g39780.2	0.16	0.16	0.26	0.01	0.0	0.01	0.14	0.1	0.08	0.03	0.09	0.01	0.1	0.11	0.09	0.06	0.23	0.09	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.1	0.08	0.1	0.12	0.25	0.73
LOC_Os10g37690.1	0.17	0.11	0.1	0.03	0.0	0.0	0.16	0.15	0.09	0.17	0.17	0.2	0.14	0.17	0.09	0.07	0.22	0.1	0.3	0.1	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.08	0.13	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.14	0.17	0.18	0.21	0.57	1.0
LOC_Os11g06750.1	0.33	0.15	0.4	0.01	0.0	0.02	0.26	0.19	0.32	0.18	0.18	0.31	0.21	0.22	0.09	0.06	0.4	0.17	0.36	0.14	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.08	0.11	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.14	0.16	0.27	0.32	0.64	1.0
LOC_Os11g11390.1	0.13	0.1	0.19	0.02	0.01	0.11	0.16	0.12	0.12	0.12	0.13	0.33	0.14	0.15	0.04	0.03	0.23	0.11	0.12	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.25	0.3	0.64	1.0
LOC_Os11g38959.1	0.18	0.12	0.27	0.02	0.0	0.01	0.23	0.18	0.26	0.14	0.15	0.27	0.18	0.19	0.09	0.04	0.3	0.14	0.37	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.25	0.31	0.72	1.0
LOC_Os12g03880.1	0.33	0.21	0.53	0.02	0.0	0.0	0.33	0.26	0.25	0.16	0.22	0.22	0.2	0.21	0.02	0.01	0.51	0.13	0.63	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.12	0.16	0.34	0.54	1.0
LOC_Os12g07740.1	0.2	0.12	0.25	0.02	0.01	0.12	0.25	0.21	0.11	0.18	0.17	0.14	0.16	0.19	0.05	0.04	0.29	0.1	0.24	0.13	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.08	0.12	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.14	0.09	0.12	0.38	0.71	1.0
LOC_Os12g21798.1	0.15	0.09	0.25	0.04	0.01	0.11	0.16	0.12	0.12	0.11	0.15	0.28	0.18	0.19	0.09	0.05	0.2	0.13	0.24	0.12	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.07	0.13	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.09	0.21	0.35	0.75	1.0
LOC_Os12g41190.1	0.18	0.17	0.19	0.02	0.01	0.0	0.25	0.22	0.25	0.15	0.21	0.23	0.23	0.24	0.09	0.06	0.37	0.16	0.58	0.19	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.09	0.19	0.03	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.2	0.2	0.29	0.34	0.64	1.0
LOC_Os12g43670.1	0.15	0.21	0.17	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.25	0.05	0.12	0.25	0.29	0.32	0.03	0.02	0.36	0.26	0.09	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.19	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.26	0.54	1.0	0.95
LOC_Os12g43830.1	0.16	0.13	0.34	0.0	0.01	0.0	0.19	0.13	0.13	0.08	0.13	0.17	0.11	0.12	0.06	0.03	0.26	0.1	0.3	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.16	0.32	0.49	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)