Heatmap: Cluster_276 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.76 1.3 0.14 1.97 1.43 0.13 0.08 2.26 2.17 2.43 -2.9 -0.53 -2.28 -2.52 - - -2.84 - -3.55 - - -2.45 -0.55 - -1.48 -1.45 -1.44 -3.27 -2.8 -2.36 -3.2 -2.67 -2.31
0.75 0.73 0.74 0.31 0.66 0.8 -0.48 1.36 0.97 1.28 -0.3 -1.1 -0.47 -0.57 -0.62 -0.19 -0.86 -0.23 -0.11 -0.58 -0.42 -1.26 -0.27 -1.22 -0.16 -0.22 -0.06 -1.38 -0.85 -0.4 -0.97 -1.33 -0.32
0.77 0.79 0.52 0.48 0.57 0.45 0.08 1.57 1.12 1.3 0.17 0.35 -0.04 0.19 -0.02 0.02 -1.93 0.17 0.26 0.23 0.19 -0.21 -2.77 -1.15 -0.09 -1.89 -1.13 -3.57 -3.02 -3.04 -3.23 -3.29 -3.02
0.65 0.55 0.46 0.45 0.68 0.98 -0.37 1.42 1.45 1.25 -0.34 -0.16 -0.81 -0.57 0.06 -0.13 -1.65 -0.4 -0.39 -0.31 -0.42 -0.26 -0.52 -1.41 -0.72 -0.69 -0.68 -1.24 -0.83 -0.78 -1.04 -1.18 -0.88
0.78 0.81 0.84 0.6 0.49 0.81 -0.64 0.48 -0.36 0.57 0.04 0.51 -0.52 0.91 -0.47 0.5 -1.98 -0.02 -0.23 0.3 0.06 0.5 -0.32 -0.69 0.49 -4.53 -4.11 -1.21 -1.12 -1.0 -1.32 -0.93 -0.82
0.51 0.27 1.04 1.16 0.49 0.71 0.18 0.97 0.71 1.57 -0.56 0.17 -0.19 -0.43 -0.38 -0.52 -1.46 -0.63 -0.64 -0.62 -0.41 -0.24 -0.48 -0.59 -0.02 -0.85 -0.94 -1.07 -0.96 -0.77 -1.15 -1.14 -0.69
0.22 -0.24 0.47 0.59 0.72 1.22 -0.54 1.41 1.09 1.58 -0.53 -0.29 -0.32 -0.42 -0.71 -0.61 -0.76 -0.57 -0.84 -0.72 -0.67 -0.2 -0.08 -0.7 -0.54 -0.33 -0.19 -1.0 -0.71 -0.57 -0.89 -1.01 -0.59
0.67 0.72 0.65 0.83 0.92 1.47 -0.47 1.71 1.53 1.57 -1.1 -0.23 -1.57 -0.89 -0.84 -1.56 -1.65 -1.5 -1.4 -1.39 -1.4 -0.8 -0.95 -1.56 -1.47 -0.35 -0.26 -1.01 -0.62 -0.5 -0.92 -1.06 -0.47
0.35 0.98 -0.29 -0.13 -0.1 0.33 -0.27 0.44 0.59 0.79 -0.31 0.0 -0.27 0.01 -0.39 -0.56 -1.69 -0.78 -0.84 -0.83 -0.9 0.16 0.78 0.66 -0.82 -0.46 -0.55 0.02 0.35 0.31 0.01 -0.61 0.22
0.2 0.85 0.92 1.77 1.14 0.92 -0.22 1.94 1.94 2.22 -2.79 -0.07 -2.15 -1.27 -2.99 -3.19 -2.0 -4.0 -4.44 -4.14 -4.25 -0.89 -1.61 -1.83 -0.64 -0.63 -0.51 -2.36 -1.42 -1.03 -2.76 -2.26 -1.07
0.61 0.47 0.65 0.32 0.4 0.18 0.64 0.38 0.13 0.9 -0.01 0.36 0.04 0.16 0.22 0.01 -1.09 -0.24 -0.13 -0.14 -0.27 0.38 -0.25 -0.17 -0.08 -0.56 -0.55 -1.21 -0.86 -0.77 -0.9 -1.1 -0.92
1.0 1.27 0.48 0.43 0.25 0.52 0.33 1.18 0.73 1.04 -0.96 0.13 0.01 -0.1 -0.58 -1.02 -2.33 -1.31 -1.09 -1.33 -1.19 0.17 0.52 0.58 -0.48 -0.99 -1.12 -0.96 -0.38 -0.4 -0.98 -1.47 -0.43
0.8 0.94 1.0 1.06 0.98 0.99 -0.4 1.4 1.12 1.38 -1.03 -0.11 -2.27 -0.97 -0.88 -1.54 -1.96 -0.89 -1.27 -1.16 -1.29 -0.71 -1.18 -2.02 -1.03 -0.23 -0.29 -0.51 -0.13 -0.23 -0.59 -0.78 -0.24
0.74 0.52 0.55 0.3 -0.04 -0.06 -0.31 0.89 0.63 0.12 -0.57 -0.36 0.38 -0.27 -0.37 -0.88 -0.54 -0.58 -0.84 -0.91 -0.66 0.15 0.44 0.1 0.57 -0.11 -0.11 -0.2 -0.11 -0.18 0.04 -0.38 -0.63
1.19 1.68 0.67 0.68 0.3 0.6 -0.31 0.92 0.79 0.84 -0.93 -0.75 -0.2 -0.52 -0.88 -1.17 -1.25 -1.23 -1.17 -1.02 -1.19 -0.13 0.44 -0.06 -0.54 -0.29 -0.42 -0.71 -0.39 -0.33 -0.7 -1.08 -0.48
0.85 0.77 0.2 -0.12 0.72 0.82 0.88 1.41 1.07 0.65 -1.42 -0.77 0.29 -1.43 -0.65 -1.28 -1.7 -3.13 -1.29 -1.36 -1.4 -0.17 -0.28 0.58 -0.66 -0.45 -0.66 -0.12 0.19 0.21 -0.53 -0.78 -0.07
0.64 0.7 0.38 0.21 0.33 0.39 0.13 0.93 0.92 1.05 -0.26 0.08 0.14 0.13 -0.53 -0.08 -1.62 -0.51 -0.38 -0.37 -0.46 0.29 0.13 -0.0 -0.55 -0.85 -0.94 -0.93 -0.56 -0.41 -0.77 -1.21 -0.44
0.93 1.16 0.38 -0.04 0.38 0.26 0.1 0.82 1.05 0.1 -0.36 0.09 0.11 -0.16 -0.88 -0.84 -0.9 -0.58 -0.53 -0.42 -0.4 0.28 0.65 -0.11 -0.01 -0.57 -0.67 -0.86 -0.4 -0.44 -0.91 -1.26 -0.35
0.32 0.63 0.39 0.14 0.36 0.35 0.01 0.82 0.82 0.04 -0.54 -0.19 0.03 -0.62 0.22 -0.38 -0.7 -0.16 -0.4 -0.99 -0.31 -0.11 0.47 -0.09 -0.53 -0.08 -0.07 -0.34 -0.1 0.06 -0.18 -0.89 -0.2
0.57 0.56 0.44 0.43 0.4 -0.09 0.95 0.73 0.45 -0.03 -1.08 0.17 -0.37 -0.09 -0.26 -0.64 -0.05 -0.55 -1.16 -0.74 -0.93 0.24 0.61 -0.45 -0.38 -0.01 -0.19 -0.5 0.01 -0.11 -0.45 -0.67 0.09
0.49 0.84 0.23 0.34 0.16 0.28 -0.29 0.45 0.62 0.67 -0.24 -0.36 0.21 -0.27 -0.16 -0.33 -0.88 -0.4 -0.46 -0.43 -0.49 0.09 0.35 0.07 0.23 -0.97 -1.06 -0.07 0.09 -0.05 -0.07 -0.52 -0.43
0.5 0.93 0.24 0.27 0.25 0.23 -0.3 0.53 0.73 1.0 -0.24 -0.35 0.21 -0.07 -0.18 -0.65 -0.88 -0.5 -0.4 -0.28 -0.39 0.31 0.62 -0.24 -0.02 -0.34 -0.55 -0.81 -0.36 -0.26 -0.62 -1.1 -0.35
0.31 -0.53 0.89 0.81 0.87 0.94 -0.26 1.17 0.66 1.36 -0.71 -0.38 -0.44 -0.37 -0.06 -0.94 -1.37 -0.66 -1.01 -0.67 -0.87 -0.19 0.03 0.19 -0.17 -0.49 -0.45 -0.56 -0.6 -0.58 -0.41 -0.44 -0.84
0.75 0.5 0.15 0.02 0.24 0.13 0.22 1.04 0.6 0.18 -0.15 -0.09 -0.22 0.6 -0.5 0.33 -0.99 -0.16 -0.07 0.24 -0.01 0.25 0.1 -0.54 0.24 -1.04 -1.01 -0.9 -0.64 -0.47 -0.78 -0.79 -0.41
0.71 0.22 0.48 0.47 0.73 0.83 -0.61 1.85 1.61 1.68 -0.34 -0.14 -0.61 -0.04 -0.25 -0.32 -2.59 -0.15 -0.57 -0.69 -0.3 -0.05 -1.44 -0.76 -0.28 -5.63 -4.94 -1.33 -0.91 -1.04 -1.13 -1.68 -1.52
0.41 0.62 0.53 0.54 0.44 -0.21 0.08 0.71 0.46 0.93 -0.3 -0.08 -0.27 0.01 -0.1 -0.23 -0.7 -0.13 -0.32 -0.4 -0.35 0.04 -0.33 -0.31 -0.2 -0.43 -0.43 -0.54 -0.18 -0.14 -0.54 -0.44 -0.18
0.66 0.78 0.54 0.69 0.76 0.41 -0.37 1.06 1.27 1.15 -1.0 -0.72 -1.55 -0.9 -0.61 -1.4 -0.91 -0.84 -1.12 -1.0 -0.88 -0.67 -0.67 -1.6 -0.75 -0.47 -0.48 -0.05 0.31 0.55 0.01 -0.12 0.36
0.65 0.6 0.64 0.39 0.32 0.27 0.41 0.75 0.5 0.85 -0.18 0.09 0.37 -0.04 -0.53 -0.12 -1.1 -0.25 -0.09 -0.24 -0.14 0.15 0.19 0.08 -0.05 -0.43 -0.44 -1.3 -0.93 -0.85 -1.35 -1.54 -0.78
0.41 0.37 0.48 0.52 0.64 0.93 -0.33 1.02 0.82 1.49 -0.1 -0.29 -0.13 -0.55 -0.37 0.0 -0.89 -0.12 -0.22 -0.27 -0.19 -0.42 -0.44 -0.34 -0.1 -0.67 -0.63 -1.09 -0.88 -0.82 -0.97 -1.2 -0.96
0.62 0.53 0.86 0.88 0.76 0.48 -0.41 1.14 1.28 1.67 -0.98 -0.77 -0.17 -0.32 -1.19 -1.21 -0.69 -0.78 -0.93 -1.08 -0.96 -0.55 -0.33 -0.78 -0.12 -1.06 -1.11 -0.34 -0.35 -0.42 -0.65 -0.63 -0.25
1.2 0.92 1.08 0.92 0.82 0.61 -0.23 1.32 1.05 1.14 -1.37 -0.58 -0.63 -0.99 -0.57 -1.49 -1.45 -1.33 -1.36 -1.49 -1.15 -0.52 -0.75 -0.54 -0.63 -0.86 -0.82 -0.41 -0.07 -0.08 -0.36 -0.4 -0.4
0.86 0.53 0.86 0.68 0.93 1.14 -0.58 1.5 1.51 1.5 -0.79 -0.77 -1.33 -0.85 -1.26 -1.12 -1.79 -0.98 -1.15 -0.99 -1.07 -0.77 -0.45 -1.18 -1.59 -0.92 -0.91 -0.61 -0.04 0.03 -0.71 -1.1 -0.07
0.37 -0.08 0.47 0.58 1.25 1.46 -0.1 1.66 1.81 1.42 -0.59 -0.47 -2.29 -0.71 -0.79 -0.78 -1.15 -0.75 -1.17 -0.89 -0.81 -0.8 -1.48 -2.13 -0.79 -1.21 -1.12 -0.98 -0.66 -0.41 -0.87 -0.82 -0.21
0.81 0.5 1.07 0.87 1.04 0.83 0.1 1.15 1.04 1.21 -0.18 0.0 -0.63 -0.48 0.14 -0.24 -1.22 -0.43 -0.56 -0.43 -0.26 -0.08 -0.21 -0.57 -0.56 -0.07 -0.27 -3.02 -3.09 -2.82 -2.64 -2.98 -2.59
0.39 -0.8 0.76 0.78 1.17 1.3 -1.61 2.22 1.79 1.75 -0.48 0.21 -3.65 -0.33 -0.83 -1.11 -3.03 -0.68 -1.29 -1.06 -1.0 -1.75 -2.29 -2.88 -1.92 -0.8 -1.0 -0.77 -1.54 -1.33 -0.88 -0.54 -0.49
0.73 0.79 0.53 0.35 0.63 0.63 -0.03 1.4 1.17 0.61 -0.65 -0.16 -0.44 -0.15 -0.79 -0.86 -1.08 -0.86 -0.63 -0.75 -0.68 -0.07 0.06 -0.9 -0.23 -0.53 -0.45 -0.34 -0.14 -0.33 -0.75 -0.84 -0.42
0.46 0.94 0.36 0.57 0.08 0.33 -0.46 0.37 0.53 0.64 -0.82 -0.02 -0.14 -0.16 -0.46 -1.34 -0.62 -0.72 -1.23 -0.91 -0.75 0.05 0.52 0.15 -0.43 -0.18 -0.2 -0.11 0.15 0.2 0.04 -0.16 0.18
0.37 0.32 0.54 0.18 0.81 0.62 0.47 1.0 0.7 0.79 -0.2 0.68 0.51 0.39 0.26 -0.31 -0.42 0.06 -0.5 -0.41 -0.1 0.69 -3.17 1.3 -0.42 -0.48 -0.29 - - - - - -
0.14 0.3 0.64 0.58 0.69 1.17 -0.38 1.21 0.8 1.14 -0.41 -0.64 -0.59 -1.22 -0.9 -0.45 -1.13 -0.47 -0.54 -0.8 -0.66 -0.58 -0.82 -0.6 -0.51 -0.56 -0.53 -0.19 0.17 0.13 0.13 -0.32 -0.16
0.55 0.58 0.24 -0.05 0.35 0.78 0.27 1.15 1.15 0.42 -0.46 0.23 -0.41 -0.29 -0.56 -0.72 -1.28 -0.07 -0.66 -0.44 -0.47 0.24 -0.11 -0.74 -0.16 -0.69 -0.76 -0.47 -0.2 -0.16 -0.49 -0.51 -0.04
0.51 0.25 0.63 0.66 0.56 0.93 0.0 1.29 1.02 1.51 -0.58 -0.28 -1.77 0.17 -0.72 -0.75 -1.3 -0.6 -0.88 -0.35 -0.61 -0.42 -0.67 -1.19 -1.42 -0.38 -0.36 -0.87 -0.2 -0.06 -0.64 -0.82 0.1
0.89 1.12 0.71 0.35 0.36 0.19 -0.06 1.05 0.91 1.24 -0.71 -0.07 -0.06 0.02 -0.8 -0.72 -1.26 -0.89 -0.89 -0.94 -0.87 0.12 0.23 -0.76 -0.31 -0.83 -0.9 -0.82 -0.27 -0.18 -0.61 -0.9 -0.23
0.83 0.57 0.57 0.02 0.31 0.08 -0.02 0.68 0.78 -0.27 -0.34 -0.13 0.17 -0.44 0.0 -0.51 -1.11 -0.47 -0.28 -0.39 -0.17 -0.01 0.22 0.45 -0.08 -0.13 -0.27 -0.4 -0.13 -0.22 -0.52 -0.83 -0.19
0.31 -0.14 0.46 0.53 0.55 0.79 0.09 1.53 1.26 1.86 -0.23 0.2 -1.12 0.27 -0.35 -0.69 -1.32 -0.54 -0.73 -0.52 -0.5 0.02 -0.33 -1.35 -0.95 -0.11 -0.08 -1.95 -1.43 -1.13 -1.69 -2.05 -1.16
0.58 0.57 0.48 0.33 0.7 1.01 0.11 1.26 1.35 1.12 -1.04 -0.17 0.21 -0.48 -1.08 -0.85 -1.23 -1.19 -1.16 -1.37 -1.18 -0.02 0.08 0.23 -0.69 -0.46 -0.42 -0.94 -0.5 -0.35 -0.86 -1.19 -0.29
0.89 0.72 0.92 0.97 0.55 0.51 -1.03 1.76 0.76 1.82 -1.45 -1.02 -2.07 -1.19 -0.39 -1.44 -1.57 -1.03 -1.6 -0.86 -1.08 -0.86 -0.99 -1.83 -1.26 -0.49 -0.47 -0.24 -0.09 0.12 -0.1 -0.15 -0.14
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1.48 1.65 2.05 2.08 1.68 0.28 0.96 2.0 1.84 2.04 -7.85 -2.14 - -5.3 - - -7.69 - - - - -5.14 -3.1 - -2.18 -6.11 -5.84 - - - - - -
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1.18 1.9 0.51 0.83 0.22 0.64 -0.52 1.01 0.99 1.41 -1.05 -0.44 0.17 -0.34 -0.74 -1.41 -1.08 -1.49 -1.42 -1.35 -1.37 -0.0 0.31 -0.13 -0.78 -0.35 -0.41 -1.42 -1.16 -1.09 -1.5 -1.88 -1.23
0.82 0.86 0.79 1.01 0.85 0.94 -0.31 1.1 0.85 1.21 -1.03 -0.37 -0.83 -0.87 -0.12 -1.34 -1.27 -1.34 -1.51 -1.29 -1.42 -0.45 -0.45 -1.03 -0.29 -0.27 -0.3 -0.4 -0.13 -0.12 -0.42 -0.56 -0.24
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0.57 0.44 0.88 0.81 0.98 1.16 -1.68 1.63 1.37 1.79 -1.21 -1.88 -2.93 -1.84 -2.13 -1.79 -1.28 -1.28 -1.97 -1.57 -1.4 -2.52 -1.32 -2.88 -1.82 -0.78 -0.75 0.21 0.58 0.46 0.07 -0.07 0.37
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0.17 0.16 0.55 0.3 0.43 0.09 -0.01 0.22 0.14 0.46 0.32 0.29 0.34 0.11 0.3 0.52 -0.72 0.08 0.23 0.03 0.21 0.22 0.2 0.27 0.3 -0.63 -0.67 -1.26 -1.15 -1.16 -1.4 -1.57 -1.11
0.5 0.42 0.41 -0.06 -0.09 -0.01 0.34 0.28 0.43 0.25 0.12 0.08 0.05 0.11 -0.05 -0.34 -1.37 -0.19 -0.07 -0.35 -0.31 0.19 0.29 0.12 -0.12 -0.5 -0.65 -0.13 0.04 -0.09 -0.13 -0.47 -0.06
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0.9 0.82 1.03 1.08 0.98 1.71 -0.99 1.7 1.46 1.86 -0.87 -0.89 -2.73 -1.35 -1.03 -1.94 -1.88 -1.53 -1.38 -1.25 -1.37 -1.59 -0.58 -3.24 -1.73 -0.24 -0.27 -1.29 -1.14 -1.06 -1.37 -1.39 -1.19
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0.19 -0.04 0.51 0.51 0.71 0.87 -0.25 1.41 1.38 1.3 -0.52 0.05 -0.51 -0.2 -0.31 -1.28 -1.49 -1.1 -1.14 -0.38 -0.55 -0.33 0.35 0.75 -0.11 -1.92 -1.92 -0.74 -0.72 -0.79 -0.9 -0.84 -0.55
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.