Heatmap: Cluster_252 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-0.37 -0.56 -0.13 0.16 -0.27 -0.18 1.12 -0.94 -0.69 -0.02 -0.9 0.49 -0.18 -0.49 -0.7 -0.44 -0.27 -1.58 -1.69 -1.05 -0.65 -0.09 0.55 -0.13 0.65 0.42 0.25 0.33 0.48 0.63 0.39 0.21 0.97
-0.84 -0.5 -1.49 -0.99 -1.17 -0.31 -0.06 -0.83 -1.07 -0.39 0.33 0.31 0.42 0.46 0.41 -0.01 0.76 0.57 0.01 0.05 0.31 0.75 0.47 -0.01 0.07 0.9 1.09 -1.15 -0.63 -0.32 -0.82 -0.86 -0.41
-3.39 -2.73 -4.56 - - - - - - - -1.39 -0.0 -0.11 0.81 0.71 -0.91 0.03 -0.01 -1.7 -1.09 -1.25 -0.77 2.39 2.08 1.57 2.18 2.16 -0.53 -5.11 -5.12 -3.5 -1.3 -4.9
-0.58 -0.56 -0.83 -1.15 -0.93 -0.43 0.69 -0.72 -0.64 -0.51 0.09 0.52 0.26 -0.15 0.46 0.71 0.26 0.21 -0.12 0.15 0.26 0.36 0.13 -0.28 0.46 0.21 0.45 -0.37 -0.12 0.23 -0.22 -0.69 0.24
0.0 0.86 -0.53 -0.08 -0.28 -0.24 0.34 -0.97 -0.6 -0.25 0.37 -0.07 -0.22 0.45 -0.2 -1.02 0.4 -0.16 -0.19 -0.45 -0.27 0.04 0.13 -0.96 0.23 0.68 0.75 -0.31 -0.01 0.19 -0.03 -0.06 0.21
0.6 1.18 -0.16 -0.36 0.07 -0.06 0.04 -1.4 -0.92 0.04 -0.71 -0.07 -0.74 0.33 -1.82 -2.76 -0.04 -1.43 -1.05 -0.27 -0.5 -0.32 -0.42 -1.49 -0.5 0.81 0.61 0.78 0.53 0.72 0.71 0.53 0.66
-1.06 -1.68 -1.74 -1.44 -1.19 -0.1 0.69 -3.55 -3.21 -2.69 -1.15 0.13 0.33 -0.0 0.67 -0.95 0.29 -0.61 -0.68 -1.3 -1.21 0.52 0.31 0.17 0.58 1.17 1.12 0.63 0.55 0.51 0.82 0.31 0.85
-1.99 -2.32 -3.13 -3.86 -3.22 -3.16 -0.99 -4.06 -2.94 -3.07 1.0 0.68 -0.79 0.54 0.75 -0.45 1.25 0.77 0.48 0.23 0.35 0.8 0.53 -2.84 0.55 0.91 1.21 -0.36 0.18 0.19 0.38 -0.16 0.17
-0.39 -1.46 -2.65 -1.76 -2.13 -1.44 -0.2 -1.59 -1.48 -2.83 -1.48 0.59 -1.85 -1.1 -0.1 -3.19 1.18 -0.86 -0.81 -0.03 0.15 0.23 0.58 - -0.07 1.32 1.74 0.57 1.02 0.86 1.09 0.65 0.58
0.04 -0.1 -0.27 -0.49 -0.4 -0.03 -0.29 -0.05 -0.13 -0.33 -0.68 0.76 0.01 -0.53 -0.11 -0.78 0.48 -0.84 -0.82 -1.02 -0.89 1.02 -0.6 0.54 -0.3 0.88 1.0 0.15 0.07 0.03 -0.12 0.29 0.06
-1.39 -1.41 -1.94 -0.97 -1.48 -1.02 -0.41 -0.95 -1.37 -1.03 -0.18 0.03 -0.24 0.45 0.75 0.07 1.14 0.09 0.68 0.53 0.52 -0.02 0.04 -1.56 0.45 0.71 0.76 -0.71 -0.32 0.87 -0.46 -0.08 0.94
-0.06 -0.25 -0.47 -0.95 -0.77 -0.4 0.0 -0.23 -0.67 0.23 0.03 0.35 0.05 0.25 0.41 0.02 -0.02 -0.07 -0.61 -0.06 -0.28 0.38 0.28 -0.12 0.14 0.27 0.35 -0.07 0.4 0.44 -0.21 -0.15 0.38
0.44 0.67 0.06 -0.0 -0.28 -0.28 -0.07 -0.42 -0.43 -0.27 0.05 -0.24 -0.71 -0.21 -0.49 -0.66 0.02 1.07 0.53 0.36 -0.16 -0.49 -0.43 -0.9 -0.25 0.7 0.77 -0.65 -0.04 0.05 -0.34 -0.28 0.3
0.04 -0.14 -0.31 -0.42 -0.42 -1.64 0.35 -1.03 -1.34 -1.08 -0.78 0.17 0.27 -0.03 0.65 0.23 0.53 -0.21 -0.08 0.03 -0.38 0.92 1.05 0.34 0.82 0.69 0.65 -0.71 -0.59 -0.63 -0.52 -0.47 -0.68
-0.28 -0.52 -0.23 -0.56 -0.24 -0.06 0.18 -0.14 -0.42 -0.04 -0.33 0.38 -0.17 0.18 0.85 -0.15 -0.2 0.02 -0.15 0.12 -0.01 0.23 0.34 0.2 -0.04 0.24 0.24 -0.27 0.17 0.06 -0.35 -0.34 0.28
-0.9 -0.75 -1.06 -0.69 -0.66 0.05 -0.13 -0.88 -0.61 -0.46 -0.05 0.16 -0.43 -0.02 0.4 -0.18 0.07 0.03 0.07 0.17 0.15 -0.27 0.15 -0.67 -0.92 0.89 0.97 0.08 0.32 0.73 0.34 0.22 0.68
-1.44 -1.63 -5.65 -4.46 -3.83 -2.27 1.5 -7.6 -3.47 -2.63 -3.57 1.67 0.28 0.95 -5.1 -4.78 0.25 - -6.72 -3.61 -4.75 1.29 1.45 -2.55 0.89 1.27 1.7 -1.11 0.73 1.57 -0.86 -0.78 1.0
-0.12 -0.19 -0.22 -0.29 -0.17 -0.36 -0.11 -0.05 -0.55 -0.36 0.4 0.13 -0.15 0.05 0.71 0.2 0.49 0.52 0.34 0.1 0.41 0.38 0.3 -0.79 0.56 0.33 0.47 -1.0 -0.62 -0.52 -1.02 -1.11 -0.3
-3.66 -3.0 -4.13 -4.43 -4.6 -4.43 -1.33 -4.25 -5.45 - -0.39 0.17 1.45 0.78 -1.06 -0.79 0.84 -0.36 -0.47 -0.66 -0.87 1.47 1.87 1.99 1.52 1.1 1.09 -1.41 -1.49 -1.1 -1.56 -1.08 -0.46
-3.13 -2.86 -4.39 -4.64 -4.44 -3.56 -1.68 -4.2 -5.49 -6.52 -1.03 0.2 1.38 0.79 -0.64 -0.96 1.35 -0.42 -0.64 -0.58 -0.66 1.37 1.87 1.74 1.19 1.1 1.11 -1.09 -1.38 -0.65 -1.04 -0.61 -0.08
-1.66 -0.77 -4.97 -5.59 -6.32 -3.76 2.43 -5.94 -5.6 -6.84 -2.49 2.54 -1.75 2.01 -1.5 -1.32 0.98 -1.81 -2.35 -1.46 -2.77 1.74 0.33 -2.85 -0.03 1.59 1.6 -2.6 -1.83 -5.07 -2.31 -4.14 -7.38
-0.56 -0.42 -0.86 -0.82 -1.03 -0.34 -0.36 -1.07 -1.57 0.0 0.81 0.06 -0.06 -0.22 0.8 0.33 0.47 1.03 0.66 0.72 0.72 0.41 0.08 0.33 -0.12 0.5 0.57 -1.21 -0.72 -0.58 -1.03 -1.13 -0.89
0.22 -0.19 -0.06 -0.19 -0.38 -0.25 0.02 0.26 -0.09 -0.08 0.18 0.34 0.35 0.06 0.68 -0.01 0.54 -0.47 -0.03 -0.1 0.3 0.24 0.59 0.44 -0.01 0.92 1.03 -1.88 -1.45 -1.53 -2.03 -2.46 -1.36
-5.56 -7.91 -4.27 -3.2 -4.71 -3.05 -3.7 -3.91 -4.69 -1.67 1.18 -0.9 -1.45 -0.65 0.31 -2.05 0.24 2.44 1.57 1.24 2.01 -1.08 -2.8 -1.91 0.11 0.77 1.25 -0.26 -0.88 -0.59 -0.1 0.25 -0.59
- - - - - - -9.04 -9.85 - - 1.14 -1.85 -0.9 -1.86 -0.52 -2.59 1.46 2.41 1.16 0.6 1.69 -1.33 -3.02 -3.57 0.39 1.72 2.15 -0.35 -1.14 -0.62 -0.3 -0.14 -0.87
-0.73 -1.32 -1.06 -0.73 -1.05 -1.42 1.5 -1.68 -2.41 -1.16 -1.16 1.08 0.54 1.14 -1.29 -2.35 0.82 -1.16 -1.95 -1.63 -1.78 1.24 0.8 -1.17 0.62 1.05 1.49 -1.13 0.41 0.53 -0.28 -1.41 -0.01
-1.09 -0.8 -1.0 -0.87 -0.45 0.15 -0.16 -1.23 -0.93 -1.18 0.02 -0.0 -0.09 0.72 0.27 -0.11 0.54 0.02 -0.05 0.13 -0.16 0.33 -0.12 -0.41 -0.81 0.69 0.8 0.32 0.04 0.62 0.51 0.02 0.6
-0.01 0.08 -0.73 -0.55 -0.92 -0.82 0.92 -1.01 -1.61 -1.17 -0.06 0.46 0.22 0.28 0.41 -0.36 0.24 -0.14 -0.61 -0.64 -0.56 0.7 0.24 0.14 0.12 0.65 0.8 -0.02 0.1 -0.03 0.03 -0.13 0.3
0.17 0.31 -0.41 -0.61 -1.05 -0.62 1.18 -0.99 -1.14 -0.86 -0.24 0.89 0.57 0.57 0.37 0.03 0.55 0.16 -0.19 -0.19 -0.18 0.94 1.05 -1.0 0.66 0.78 0.96 -4.05 -1.3 -1.3 -2.92 -4.0 -1.64
-0.28 -0.41 -0.56 -0.7 -0.67 -0.22 -0.27 -0.5 -0.79 0.02 -0.21 0.33 0.21 0.33 0.12 0.05 0.14 -0.08 -0.07 -0.11 -0.05 0.29 0.06 0.03 -0.02 0.68 0.74 -0.17 0.2 0.28 0.08 -0.19 0.3
-0.09 -0.69 0.07 -0.33 -0.19 -0.46 0.45 -0.43 -0.85 -0.17 -0.55 0.23 -0.05 -0.01 0.04 -0.45 -0.4 -0.38 -0.59 -0.51 -0.41 -0.04 -0.04 0.03 0.15 0.27 0.25 0.44 0.59 0.69 0.5 0.31 0.67
-0.56 -1.0 -0.85 -0.64 -0.31 -0.46 0.49 -1.34 -1.34 -1.03 -0.12 0.24 -0.38 0.24 0.17 0.27 0.01 0.43 -0.11 -0.44 -0.13 -0.24 0.3 0.89 -0.37 0.82 0.71 0.38 0.41 0.15 0.17 0.12 0.05
0.01 0.74 -0.2 -0.09 -0.32 -0.15 0.1 -0.87 -0.8 0.04 0.03 0.07 -0.82 -0.31 0.5 -0.19 0.36 -0.05 -0.34 0.04 -0.19 0.18 -0.85 -0.79 -0.31 0.63 0.7 -0.0 0.3 0.37 -0.18 0.05 0.29
-0.41 -0.7 -0.09 -0.28 -0.12 -0.1 -0.2 -1.17 -0.73 -2.04 0.02 -0.26 0.6 -1.05 -0.28 -0.27 1.06 -0.15 -0.76 -0.88 -0.81 0.36 0.14 0.72 1.08 0.64 0.78 0.2 -0.39 0.12 -0.22 0.11 0.39
-0.28 -0.3 -0.64 -0.57 -0.61 0.62 0.12 -0.55 -0.61 -0.02 0.28 0.43 -0.65 0.71 -0.26 -0.25 -0.19 -0.12 -0.65 -0.72 -0.54 1.15 -0.12 -2.53 0.47 0.48 0.63 -1.0 0.57 0.72 -0.43 -0.51 0.55
-0.4 0.15 -1.26 -1.18 -1.28 -0.32 0.26 -0.58 -0.6 -0.17 -0.39 0.15 -0.01 0.55 0.07 -0.48 0.98 -0.49 -0.52 -0.43 -0.78 0.57 0.6 0.49 0.13 0.78 0.9 -0.63 -0.04 0.54 -0.47 -0.41 0.26
0.25 0.43 -0.24 -0.83 -0.87 -0.16 -0.62 -1.09 -1.26 -0.05 -0.66 -0.89 -0.84 -0.73 0.44 -0.73 0.22 -0.56 -1.02 -0.28 -0.54 -0.27 0.03 -0.97 -0.05 0.66 0.7 0.47 0.7 1.03 0.75 0.72 1.02
0.35 0.42 -0.01 -0.42 -0.57 -0.75 1.61 -0.13 -0.92 0.12 -0.1 0.89 0.52 0.9 -0.14 -1.33 0.53 -0.77 -0.15 0.03 0.1 1.04 - 0.42 -0.26 1.38 1.32 -5.73 - -6.92 -7.97 -7.92 -7.86
-1.18 -1.43 -0.88 -0.37 0.05 0.19 0.56 -1.38 -1.33 -1.1 -0.01 0.42 -0.01 0.06 0.34 0.11 0.79 0.55 0.25 0.12 0.39 0.39 -0.13 0.21 0.39 0.58 0.74 -0.49 -0.28 -0.24 -0.43 -0.51 -0.35
-0.76 -1.05 -1.15 -2.11 -1.91 -1.83 0.6 -1.67 -1.74 -0.51 -0.69 1.14 0.16 1.62 -0.58 0.01 -0.91 -0.54 -0.29 0.39 -0.1 0.93 0.66 1.49 0.41 1.24 1.01 -1.93 -1.16 -0.28 -1.53 -1.7 -0.54
-0.4 -0.24 -0.58 -0.68 -0.34 -0.14 0.19 -1.02 -0.96 -1.71 0.09 0.67 -1.2 0.18 -0.15 0.33 -0.37 0.19 0.28 0.25 0.14 0.27 0.66 0.54 -0.76 0.77 0.62 -0.23 0.28 0.28 0.02 -0.02 -0.3
-0.15 0.01 -0.69 -0.58 -0.42 -0.25 0.37 -0.44 -0.69 -0.3 -0.01 0.56 -0.18 0.25 0.12 -0.2 0.37 -0.1 -0.13 -0.15 -0.03 0.46 0.44 0.17 0.43 0.6 0.74 -0.55 -0.21 -0.13 -0.34 -0.64 -0.1
-0.18 0.14 -0.21 0.24 -0.18 0.47 0.55 -0.77 -0.58 -0.37 -0.39 0.54 -0.48 0.0 -0.17 -0.23 0.09 -0.1 -0.66 -0.5 -0.5 0.22 -0.37 0.19 0.22 0.48 0.64 -0.29 -0.14 0.35 0.07 -0.04 0.35
-1.27 -1.15 -1.64 -2.11 -2.67 -1.96 1.91 -1.72 -1.84 -1.39 -1.73 1.06 0.34 -0.08 -0.63 -2.33 0.98 -1.2 -1.55 -1.8 -1.76 1.12 -0.36 -0.15 1.37 1.34 1.39 -0.47 0.14 0.25 -0.62 -0.11 0.59
0.08 -0.21 -0.42 -0.75 -0.68 -0.68 -0.15 -0.59 -0.55 -1.03 -0.64 0.45 -0.7 -0.64 0.5 -0.41 0.12 0.07 -0.09 -0.71 0.1 0.17 -0.64 0.18 0.64 0.27 0.19 0.49 0.71 0.58 0.4 0.53 0.56
0.11 -0.31 -0.5 -0.85 -1.07 -1.09 0.82 -2.29 -2.21 -2.44 0.35 0.09 -0.2 0.73 0.44 0.73 0.45 -0.22 0.27 -0.68 -0.21 0.91 -1.22 -1.38 -0.15 1.28 0.98 -1.32 0.09 0.13 -1.0 -1.01 1.12
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-1.11 -1.5 -0.49 -0.33 -0.04 0.47 -0.35 -0.6 -0.62 -0.44 0.41 1.0 -0.24 0.63 -0.21 0.14 0.71 0.32 0.26 0.15 0.19 0.63 0.01 -0.63 0.84 0.91 1.26 -2.52 -1.41 -0.64 -2.29 -2.78 -0.63
-0.95 -1.62 -0.57 -0.45 0.11 0.11 0.06 -1.89 -1.87 -2.16 -0.72 0.74 0.36 0.64 -0.13 -0.52 0.95 -0.04 -0.85 -1.17 -0.7 0.88 -0.08 1.12 0.55 0.89 1.02 -0.16 -0.34 -0.13 -0.04 -0.08 -0.45
0.19 0.16 0.18 0.19 -0.15 -0.06 0.34 -0.01 -0.41 -0.17 -1.99 0.94 -0.21 -0.57 -0.24 -0.64 0.56 -0.49 -1.19 -0.74 -0.81 0.94 -0.25 -0.57 0.6 0.78 0.75 -0.49 -0.18 0.08 -0.58 -0.36 0.36
-2.8 -1.07 -4.42 -4.88 -5.67 -6.45 0.84 -4.65 -6.41 -5.47 0.67 1.04 0.27 -0.47 -0.86 1.48 0.59 0.82 0.74 0.86 0.86 1.49 -0.26 -0.23 1.61 0.41 0.76 -1.6 -2.57 -1.8 -0.58 -0.67 -2.08
-0.36 -0.88 -0.26 -0.48 -0.72 -0.34 1.07 -0.9 -0.84 -2.06 0.78 0.83 0.24 0.31 0.29 0.43 0.68 0.44 1.02 0.7 0.91 0.8 -0.09 -1.43 -0.62 1.14 1.18 - -3.37 -5.21 -6.04 -6.64 -5.77
0.02 0.6 -1.3 -1.5 -2.24 -1.49 0.08 -2.45 -2.18 -1.9 -1.33 -0.02 0.01 -0.05 0.66 -1.93 2.01 -1.68 -1.91 -1.52 -1.51 0.7 0.95 -0.93 0.9 1.56 1.74 -1.38 -1.12 0.27 -0.44 -0.8 0.38
-4.73 -5.11 -7.67 -8.82 -7.78 -7.25 0.59 - -8.13 - -0.77 0.69 1.15 0.87 1.12 -0.82 1.57 -1.79 -0.66 -0.71 -1.02 1.37 1.53 0.19 1.32 1.29 1.47 -1.88 -1.71 -0.28 -1.11 -1.44 -0.18
0.26 0.52 -0.61 -0.42 -0.29 -0.09 0.61 -0.29 -0.21 0.16 0.15 -0.1 -0.17 -0.48 -0.22 -0.93 0.15 -0.85 0.08 -0.31 0.0 0.14 0.58 -0.62 -0.12 0.15 0.26 -0.1 0.25 0.5 0.4 -0.14 0.09
-0.78 -0.71 -0.57 -0.57 -0.55 -0.03 0.26 -0.71 -0.54 -0.28 -0.4 0.17 -0.69 0.21 -0.34 -0.71 0.26 -0.24 -0.73 -0.44 -0.55 -0.2 0.01 0.2 -0.76 0.83 0.8 0.65 0.59 0.69 0.6 0.6 0.58
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-0.68 -1.12 -1.53 -1.79 -1.94 -1.08 -2.02 -1.42 -1.52 -2.02 -0.01 1.21 -1.65 0.37 -2.16 -2.78 1.36 -1.26 -1.76 -1.83 -0.87 0.34 0.33 -3.77 0.1 0.8 0.9 0.68 1.04 1.36 0.93 0.81 1.48
-0.5 -0.53 -1.19 -1.22 -1.63 -1.13 0.12 -1.24 -1.16 -1.37 0.67 0.67 0.17 0.43 -1.16 -0.23 0.58 0.36 0.4 0.1 0.46 0.06 0.45 0.32 0.17 0.93 1.05 -0.42 -0.22 0.08 -0.08 0.03 -0.46
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-1.27 -1.13 -1.92 -1.66 -1.74 -1.37 -0.81 -0.67 -1.29 -0.3 0.7 1.24 -0.26 0.31 1.6 -0.03 0.65 1.09 0.75 -0.97 0.92 0.7 -0.13 -0.6 0.86 0.28 0.49 -1.38 -0.91 -0.54 -1.08 -1.48 -0.87
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.