Heatmap: Cluster_69 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-4.86 -8.86 -6.83 -6.1 -5.14 - -4.44 - -7.57 - -3.72 -0.2 0.41 0.56 -4.48 -6.07 -1.15 - -5.01 -6.07 -5.31 -0.43 1.67 -3.15 -0.45 -1.23 -1.2 1.81 1.62 2.1 2.21 1.43 2.24
- -4.66 - -5.15 -5.67 - -0.47 - - - -0.57 -0.16 -1.73 0.06 -1.36 -4.45 -0.24 -3.29 -0.26 0.21 -0.97 0.16 -0.68 -3.03 -1.01 -0.81 -0.12 1.71 2.06 1.83 1.77 1.67 1.99
-3.89 -3.59 -7.88 -4.69 -5.51 - -0.17 -7.94 -8.5 -8.52 -1.19 -0.13 -0.31 0.32 -0.36 -0.52 0.12 0.15 -0.32 -0.58 -0.28 0.29 0.45 -0.56 -0.59 -0.19 0.03 1.35 1.61 1.6 1.5 1.12 1.6
-1.84 -2.28 -2.25 -2.89 -2.46 -3.97 -0.22 -3.61 -2.48 -3.73 -0.32 -0.12 -0.11 0.34 -0.64 -0.38 0.26 -1.65 -0.89 -0.35 -0.48 0.33 -0.21 0.1 -0.05 0.23 0.21 1.25 1.47 1.49 1.19 1.06 1.6
-3.12 -5.24 -4.13 -4.35 -3.76 -4.44 -0.96 -3.72 -4.16 -4.36 -0.99 -0.82 -1.54 0.07 -0.23 -1.07 0.05 -0.77 -1.19 -0.61 -0.81 -0.69 -0.38 -1.62 -1.52 -0.24 0.06 1.77 1.66 2.03 1.69 1.37 2.16
-3.04 -4.73 -7.8 -4.26 -4.25 -3.65 -0.68 - -6.89 -2.8 -1.72 -0.53 -1.59 0.68 -0.22 -1.1 -0.07 -2.08 -1.11 -0.66 -0.58 -0.53 -0.69 -0.56 -1.74 0.19 0.61 1.67 1.71 2.04 1.52 1.31 1.93
-2.36 -2.57 -2.81 -3.66 -2.59 -2.94 0.41 -2.62 -3.54 -2.99 -1.54 -0.25 -0.13 0.21 -0.38 -0.78 -0.1 -0.79 -0.98 -1.42 -1.68 0.16 0.07 -0.91 -0.74 0.0 0.03 1.63 1.79 1.65 1.34 1.2 1.7
-2.83 -3.14 -3.05 -3.51 -2.85 -2.9 -0.38 -3.24 -3.28 -3.31 -0.83 0.52 0.27 0.35 0.42 -0.63 0.33 -0.65 -1.05 -0.58 -0.81 0.61 0.3 -0.02 -0.15 0.12 0.2 1.15 1.37 1.36 1.31 1.12 1.13
-1.29 -1.3 -1.6 -1.64 -1.29 -1.06 -0.27 -1.21 -1.43 -1.27 -0.43 0.1 -0.66 0.18 -0.29 -0.3 -0.21 -0.58 -0.6 -0.68 -0.58 0.03 -0.21 -0.59 -0.32 -0.1 -0.01 0.93 1.47 1.59 1.09 0.92 1.54
-6.68 -6.41 -7.7 -7.9 -5.26 - -0.47 -8.07 -6.8 - -0.71 -0.86 -0.12 -1.27 -0.81 -0.78 -0.26 -0.76 -0.88 -0.63 -0.76 -0.74 0.16 0.15 -1.63 -0.07 0.09 1.62 1.84 1.87 1.72 1.58 1.85
-3.64 -2.49 -4.58 -3.84 -4.81 -5.53 -0.39 - -9.13 -9.82 -0.54 -0.41 0.11 -0.54 -0.36 -0.45 0.38 0.02 -0.3 0.12 -0.15 -0.1 0.31 -0.05 -0.66 0.47 0.48 1.23 1.58 1.41 1.3 1.13 1.47
-3.29 -3.29 -3.52 -4.31 -4.48 -3.87 0.29 -4.06 -4.5 -4.27 -1.85 0.34 -0.2 -0.39 -0.61 -1.36 -0.12 -2.28 -1.1 -1.15 -1.31 -0.09 0.13 -0.89 -0.18 -0.04 0.38 1.38 1.57 1.97 1.52 1.36 1.93
-6.57 -7.25 -7.68 -9.64 -9.18 - -0.53 -7.07 - -7.96 -1.18 -0.1 -0.62 -0.52 -0.68 0.03 0.61 -0.91 0.29 0.28 0.07 -0.22 0.36 -0.19 -0.69 -0.17 0.06 1.34 1.65 1.67 1.21 1.19 1.74
-4.51 -4.34 -3.88 -5.59 -5.09 -4.25 -0.26 -5.0 -5.31 -7.98 -1.09 0.05 -0.29 -0.1 0.35 -0.31 0.2 -1.28 -0.39 0.04 -0.3 -0.04 0.06 -0.27 0.01 0.23 0.35 1.43 1.74 1.5 1.42 1.08 1.26
-2.89 -3.15 -3.17 -3.79 -4.12 -4.44 -0.16 -3.55 -4.25 -4.71 -0.84 0.09 -0.7 -0.56 -0.45 -0.76 0.45 -1.18 -0.69 -0.67 -1.18 0.14 -0.17 -0.55 0.22 0.2 0.36 1.33 1.74 1.82 1.12 1.21 1.81
-2.1 -2.45 -2.56 -3.1 -2.61 -2.73 0.4 -2.9 -2.77 -2.94 -0.58 0.48 0.05 0.61 -0.11 -0.44 0.14 -0.7 -0.39 -0.56 -0.53 0.16 0.51 0.07 -0.47 0.09 0.3 1.07 1.28 1.28 1.13 0.83 1.37
-3.43 -2.9 -3.64 -3.96 -4.2 -3.18 0.03 -4.13 -5.27 -3.73 -0.31 0.36 0.1 0.35 -0.22 -0.33 0.07 0.0 0.0 0.21 0.48 0.37 0.06 -0.71 -0.46 0.19 0.35 0.97 1.34 1.35 1.27 0.98 1.04
-1.26 -1.07 -1.37 -0.84 -1.02 -0.91 0.19 -1.33 -1.3 -1.8 -0.55 -0.09 -0.35 -0.23 -0.72 -0.63 -0.11 -0.73 -0.88 -0.69 -0.42 -0.37 0.03 0.05 -0.81 -0.08 0.07 1.39 1.45 1.19 1.15 0.98 1.45
-5.17 -5.6 -5.59 -5.83 -7.84 - 0.24 -6.09 -7.97 -7.66 -0.94 0.09 -0.33 0.03 -0.6 -0.36 -0.04 -1.26 -0.45 -0.0 0.07 -0.01 1.28 -0.7 -0.44 0.12 0.11 1.52 1.47 1.5 1.28 0.8 1.65
-3.79 -4.15 -4.56 -4.41 -4.45 -3.81 -0.08 -4.25 -4.82 -4.71 0.11 0.39 -0.44 0.31 0.37 0.02 0.13 -0.27 0.13 0.16 0.19 0.01 0.5 -0.38 -0.69 0.32 0.39 1.04 1.16 1.28 1.03 0.69 1.54
-1.43 -1.38 -1.73 -1.98 -1.64 -1.57 -0.18 -1.63 -1.73 -1.86 -0.48 -0.19 -0.28 -0.08 -0.68 0.03 0.06 -0.24 -0.26 -0.33 -0.27 0.02 0.17 -0.45 -0.17 -0.28 -0.07 1.26 1.38 1.31 1.21 1.05 1.32
-2.62 -2.57 -2.82 -3.1 -2.96 -2.33 0.66 -3.1 -3.57 -3.28 -0.56 0.03 -0.49 0.09 -0.52 -0.25 0.02 -0.34 -0.37 -0.02 -0.21 0.09 0.91 -0.16 -0.51 0.01 0.09 1.27 1.42 1.35 1.11 0.79 1.39
-3.38 -2.68 -4.93 -5.09 -5.69 -6.15 0.25 -8.49 -6.7 -6.07 -0.56 -0.14 -0.03 -0.36 -0.01 -0.05 0.48 -0.61 -0.2 -0.11 -0.24 0.03 0.25 -0.76 0.37 0.47 0.6 1.07 1.46 1.41 0.96 1.06 1.54
- -6.04 -5.63 -7.23 -8.31 - -0.22 -7.88 -5.37 - -1.27 -1.34 -1.61 -1.22 -1.44 -1.19 0.18 -0.79 -0.55 -0.75 -0.59 -0.75 -0.38 -0.27 -1.09 -0.04 0.06 2.04 1.82 1.88 1.77 1.76 1.7
-6.35 -6.47 -8.18 -6.85 -5.93 - -0.69 -5.5 -8.06 - -2.27 -1.27 -1.29 -1.33 -2.27 -1.32 0.48 -1.6 -0.68 -1.18 -1.56 -1.13 -1.03 -0.42 -1.26 0.23 0.41 2.04 1.93 2.03 1.87 1.88 1.67
-6.2 -4.89 -6.16 -4.02 -5.96 -3.77 0.01 -8.27 - - -1.31 -0.27 -0.18 0.4 -0.62 -0.38 0.17 -0.61 -1.32 -0.45 -1.18 -0.05 0.08 0.86 -0.81 0.09 0.11 1.52 1.55 1.66 1.37 1.47 1.43
-2.09 -2.49 -2.75 -2.1 -2.15 -1.38 -0.29 -1.6 -1.65 -1.36 -0.24 0.04 -0.93 0.25 -0.31 -1.24 -0.04 -0.87 -0.42 -0.41 -0.18 0.13 -0.53 -1.02 -0.93 -0.05 0.11 1.19 1.67 1.61 1.29 1.1 1.61
-10.17 -8.93 -10.67 -10.8 -8.83 - -0.84 -6.72 - -6.51 -0.57 -0.31 -0.54 -0.28 0.29 -0.0 0.17 -0.63 0.17 0.38 0.23 -0.31 -0.05 -0.87 -0.94 -0.21 -0.04 1.33 1.53 1.72 1.31 1.3 1.8
-4.53 -5.75 -5.35 -5.56 -5.68 -5.36 -0.51 -5.25 -5.06 -4.97 -0.16 -0.26 -0.84 -0.43 -0.03 -0.18 0.44 -0.05 -0.07 0.13 0.23 -0.3 -0.36 -0.38 -0.4 -0.26 -0.09 1.47 1.51 1.51 1.34 1.31 1.7
-3.3 -2.75 -3.5 -3.73 -3.61 -3.99 -0.03 -4.78 -3.89 -3.84 -0.6 -0.03 0.41 -0.19 -0.1 -0.49 0.51 -0.63 -0.56 -0.38 -0.47 0.24 0.31 0.03 -0.2 0.4 0.36 1.12 1.52 1.47 1.19 0.99 1.36
-1.57 -1.71 -1.37 -1.84 -1.64 -2.25 0.44 -2.14 -2.61 -2.47 -0.45 0.41 0.11 0.12 -0.0 -0.48 0.14 -0.52 -0.41 -0.21 -0.41 0.41 0.5 0.08 -0.16 0.1 0.1 0.93 1.27 1.13 0.88 0.83 1.12
-1.75 -2.14 -2.43 -3.62 -2.38 -1.63 0.33 -2.56 -2.73 -3.77 -0.37 -0.09 -0.71 -0.11 -1.16 -0.5 -0.03 -0.1 -1.09 -0.57 -0.94 0.08 -0.49 -0.51 -1.49 -0.92 -0.3 1.25 1.8 1.94 1.48 1.02 1.77
-5.67 -7.24 -5.55 -8.65 -5.9 -8.9 -0.7 -5.46 -6.47 -7.54 -1.13 -0.22 -0.84 -0.37 -0.42 -0.62 0.3 -2.43 -0.35 -0.44 -0.47 -0.17 -0.32 -0.9 -1.23 -0.02 0.25 1.38 2.01 1.95 1.47 1.38 1.96
-3.22 -3.08 -4.08 -4.21 -4.25 -4.23 0.2 -5.2 -4.99 -4.31 -0.08 0.18 0.13 -0.24 -0.27 -0.14 0.2 -0.59 -0.1 -0.11 -0.15 0.63 0.46 -0.01 0.27 0.27 0.32 0.95 1.15 1.35 1.21 1.15 1.11
-5.62 -5.77 -7.43 -7.02 -7.25 -7.67 -0.21 -8.38 -9.22 -6.62 -0.48 0.29 -0.2 0.03 0.17 -0.42 0.4 -0.52 -0.1 -0.27 -0.09 0.35 0.35 -0.46 0.14 0.25 0.32 1.09 1.57 1.55 1.0 0.97 1.5
-5.37 -4.27 -4.4 -4.9 -5.36 -5.31 0.45 -3.18 -4.53 -3.97 -0.97 0.28 -0.43 0.41 0.28 -0.17 0.04 -1.08 0.36 0.19 0.2 -0.11 0.29 0.13 -1.36 0.19 0.29 1.32 1.31 1.17 1.37 1.01 1.26
-4.11 -4.46 -4.33 -4.26 -4.32 -4.18 -0.4 -5.32 -5.45 -4.63 -0.14 -0.37 -0.4 -0.25 -0.21 0.19 0.09 -0.05 0.11 -0.09 -0.01 -0.27 -0.45 -0.32 -0.36 -0.15 0.01 1.42 1.59 1.53 1.33 1.22 1.63
-8.2 -5.93 - - -7.56 - -0.2 -8.26 -6.59 -7.92 -0.61 0.03 -0.26 -0.16 -0.27 -0.73 0.25 -0.89 -0.61 -0.5 -0.72 0.14 0.36 -0.49 -0.65 0.4 0.6 1.24 1.69 1.66 1.13 1.2 1.91
-3.64 -3.3 -3.7 -3.72 -3.16 -2.55 -0.09 -3.57 -4.41 -4.79 -0.65 -0.08 -0.16 -0.5 0.33 -0.51 0.11 -0.59 -0.97 -0.52 -0.48 -0.11 0.38 0.27 -0.23 0.23 0.35 1.36 1.51 1.35 1.36 1.26 1.48
-2.45 -2.68 -3.6 -3.99 -3.95 -4.66 0.16 -5.53 -4.67 -5.37 -0.99 0.05 0.01 0.04 -0.76 -0.69 -0.01 -1.22 -1.0 -0.66 -0.88 0.46 0.45 -0.33 -0.28 0.01 0.16 1.42 1.59 1.62 1.36 1.08 1.76
-2.65 -3.02 -3.94 -3.76 -3.92 -4.83 -0.4 -5.1 -4.74 -3.59 -0.46 0.32 0.19 -0.34 0.13 -0.81 0.17 -0.45 -0.62 -0.6 -0.34 0.25 0.88 0.45 -0.26 0.16 0.28 1.14 1.35 1.32 1.34 1.13 1.33
-5.9 -4.76 -6.34 -6.57 -9.1 -6.91 -0.13 -3.92 -6.78 - -0.59 0.11 -1.04 0.18 0.31 -0.78 -0.01 -0.75 -0.0 -0.46 -0.71 0.0 0.27 -0.46 -0.88 0.14 0.25 1.34 1.63 1.5 1.32 1.36 1.82
-1.49 -1.92 -2.63 -2.55 -2.69 -1.81 -0.07 -2.07 -2.7 -1.88 -1.21 0.11 0.23 -0.35 -0.32 -0.7 0.22 -1.48 -0.94 -1.05 -1.12 -0.05 0.46 -0.29 -0.29 0.5 0.62 1.24 1.34 1.5 1.39 1.09 1.45
-4.51 -4.6 -3.88 -4.23 -4.82 -3.92 -1.09 - - - -1.67 -0.76 -3.44 -2.12 -1.67 -1.33 -0.29 -2.6 -2.15 -2.77 -3.85 -1.38 1.62 -2.17 -2.09 -0.68 -0.58 1.73 2.2 2.22 1.45 1.72 2.34
-3.26 -2.83 -3.74 -3.42 -3.7 -3.04 -0.13 -4.41 -4.16 -3.23 -0.5 0.2 0.4 0.05 -0.47 -0.24 0.28 -0.44 -0.43 -0.54 -0.37 0.39 0.49 0.18 -0.37 0.13 0.28 1.09 1.47 1.45 1.14 0.91 1.43
- -5.53 -6.8 -7.34 -8.26 - -0.38 - - -6.99 -0.76 0.1 -0.18 0.42 -0.67 -0.53 -0.03 -0.6 0.17 -0.07 0.04 0.37 0.02 -0.95 -0.65 0.29 0.51 1.26 1.82 1.57 1.23 1.04 1.49
-3.5 -3.57 -3.61 -3.47 -3.52 -3.65 0.41 -4.63 -5.03 -4.98 -0.9 0.18 -0.69 -0.02 0.13 -0.9 0.23 -1.1 -0.53 -0.54 -0.63 -0.2 0.04 -0.66 0.02 -0.15 0.07 1.42 1.61 1.71 1.2 1.23 1.74
-4.76 -4.85 -5.86 -6.75 -6.23 -7.03 0.07 -6.82 -8.57 -4.84 -0.71 0.05 0.09 -0.11 0.02 -0.21 0.17 -0.96 0.04 0.18 -0.09 0.45 0.7 0.12 -0.39 0.45 0.25 1.17 1.26 1.28 1.2 1.14 1.35
-2.85 -2.94 -4.27 -4.88 -4.37 -4.9 -0.34 -5.46 -5.34 -6.16 -0.99 -0.52 -0.45 -0.96 -1.0 -1.38 -0.16 -1.16 -0.66 -1.02 -0.56 -0.32 -0.32 -0.28 -1.22 0.1 0.14 1.7 1.9 1.76 1.76 1.46 1.89
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-2.3 -2.43 -2.14 -2.05 -1.55 -1.47 0.1 -1.79 -1.97 -1.99 -0.59 0.43 -0.05 0.21 -0.36 -0.49 0.02 -0.52 -0.76 -0.64 -0.64 0.45 0.19 -0.11 -0.14 0.25 0.39 1.24 1.45 1.13 1.09 0.9 1.17
- - -7.82 -7.58 -9.23 -7.97 -1.05 - -9.25 - -1.03 -0.06 -0.46 -0.14 -0.07 -0.15 0.07 -0.01 -0.0 0.55 0.03 -0.1 0.4 -0.3 -1.25 -0.61 -0.42 1.33 1.51 1.61 1.38 1.43 1.78
-4.81 -4.06 -6.54 -6.18 -6.48 -7.84 0.6 -11.91 -7.32 -7.08 -1.07 1.63 -0.64 0.87 -0.33 -0.64 0.3 -1.61 -0.85 -0.71 -0.79 0.41 0.36 -0.31 -0.51 0.01 0.16 1.39 1.35 1.23 1.18 1.1 1.25
-4.5 -4.04 -6.26 -4.83 -4.52 - 0.26 -4.82 -5.94 -7.39 -0.86 -0.02 -0.89 -0.0 -1.11 -0.67 -0.24 -1.39 -0.68 -0.49 -0.58 -0.11 -0.05 0.01 -0.77 0.05 0.25 1.51 1.83 1.83 1.42 1.27 1.76
-2.11 -2.67 -1.85 -2.12 -2.24 -2.47 -0.04 -4.49 -4.27 -3.24 -0.34 0.09 -0.63 0.05 -0.25 -0.66 0.21 -0.56 -0.24 -0.6 -0.23 -0.33 -0.32 0.39 -0.55 0.56 0.54 1.15 1.27 1.5 1.25 1.08 1.53
-4.52 -4.16 -5.83 -5.25 -5.64 -4.79 0.4 -5.54 -5.7 -5.71 -0.84 0.43 -0.5 -0.36 -0.48 -0.66 0.15 -0.93 -0.46 -0.31 -0.35 0.15 0.59 -1.33 -0.8 0.21 0.5 1.11 1.33 1.7 1.6 1.24 1.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.