Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
-0.45 4.82 -1.01 - - 0.34 - - - - -2.24 - - -0.22 - - - 0.09 - -1.99 - -0.36 -1.47 -0.4 - - 0.16 - - - - 2.27 - - 1.92 - - - - -1.44 -0.71 - - -2.95 0.18 1.07 - - -
-0.96 5.12 - - - - - - 0.01 - -4.62 - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.32 4.14 - -0.68 - - - - -1.37 - -4.84 1.82 - 2.66 - 2.87 - - - - -2.76 -1.88 -1.36 0.81 - - - - - - - 1.84 - - - 1.09 - 1.21 - -2.72 -0.38 - - - - 0.47 - - -
1.4 4.77 -1.23 - - - - - 2.88 - - 1.03 - - - - - - - - - -1.32 - - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.52 4.76 - -1.45 - 0.49 - - - - - - - 3.55 - - -2.1 - - - -1.43 -2.05 - -0.05 - 1.25 - - - - - 1.37 - - - - - - - -2.14 -2.31 - -1.12 - - - - - -
1.64 5.51 - - - - - - - - -2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.61 4.44 -0.26 -1.28 2.83 - -1.64 - -0.05 -1.26 -1.81 - - - - - - -1.46 - - -3.75 - -2.04 -3.51 - -0.15 - - 0.57 0.24 0.09 2.74 - - - - 0.11 - - -3.09 -1.86 -1.02 -3.09 1.37 - - - - -
- 4.87 - - 0.75 - - - 0.34 - -2.93 - - - - - - -2.72 - - -1.66 - -1.01 -0.88 - 1.38 - - - - - 1.31 2.53 - - - - - - 0.1 -1.6 - 1.46 -2.24 - - - - -
-0.39 4.33 1.42 - - - - - 1.66 - -4.04 0.3 - 1.09 - - -1.83 -2.88 - -3.19 -0.69 -0.92 -3.33 0.38 - - - - - 0.99 - 3.2 1.27 - - - - - - -2.51 -1.95 - -1.68 -2.6 - - - - 0.31
-0.48 4.81 - - - - - - - - -2.78 0.6 0.87 2.67 - - -0.09 - - -1.93 -2.54 -0.7 -2.25 -1.58 - - - - - 1.19 - 1.81 - - - - - - - - 0.37 - -1.06 -1.98 - - - - -
1.53 4.75 - -0.19 - - - - - - 0.95 - - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - 1.67 -
-2.15 3.99 - -2.82 0.6 - - - - - -2.76 3.17 -1.06 3.72 - - -2.87 -1.75 - -2.51 -1.02 - - -0.41 1.22 - - - - - - 0.57 - - - - - - - -3.46 -1.37 - - -1.34 -0.31 - - - 0.13
- 5.48 - - - - - - - 1.94 -1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.23 5.34 - - - - - - - - -0.27 - - - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.08 4.6 0.2 - 2.07 - - - 1.72 - - - - - - - - - - - -1.35 - - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.07 4.26 -2.62 - -0.68 3.35 -2.92 - -1.18 - -3.85 2.26 - -0.3 - 2.6 -2.48 0.41 - - - -3.4 -2.15 - - - -0.3 - - - 0.56 1.06 - - - - - - - -2.63 -3.32 - - - - - - - -
-0.88 4.32 -0.76 -1.14 -0.77 0.2 - -3.12 1.95 - -2.16 2.29 -0.43 0.01 - - -3.85 -1.52 - -1.51 -2.21 -3.71 -3.09 0.58 - -0.28 0.86 - - - - 1.68 - - - - - 0.79 - -0.19 0.04 -0.82 0.8 -1.61 - - - - -
0.05 4.47 - - - - - - -1.36 - -4.47 0.24 - 0.44 - - -2.01 -2.3 - -0.71 -2.0 - -1.65 -0.35 3.23 - - - 0.4 - - -0.03 - - - 1.93 - - - -2.96 -2.58 -2.3 -1.3 -1.48 - 1.91 - - -
-3.27 4.53 - - - - - - 1.02 -2.84 -4.22 - - 4.23 - - - - - - - -2.79 - -2.1 - 0.48 0.46 - - - - 0.58 - - - - - - - - - - -1.8 - - - - - -
0.67 4.11 0.17 - - 2.28 - -1.66 -0.52 - -0.83 - - 3.3 - - - - - -3.17 - - -2.4 - 2.82 - - - - - - 1.57 - - - - - - - -1.48 -1.15 - - - - - - 0.74 -
- 5.35 - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.6 - - - - - - - - -0.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.36 4.82 - - - 0.99 - -1.43 - - -6.65 - - - - - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - 1.96 - - - - 1.9 - - - -2.08 - - - - 2.15 - 2.4 -
-0.82 4.79 - - - - - - - - -2.24 0.84 - 1.43 - - - - - - -1.37 - 0.08 - - - - - - - - 2.85 - - - 2.46 - - - 0.16 -0.39 - - - - - - - -
0.58 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.35 5.21 - - - - - - - - -4.83 - - - - - - - - - - - - 0.4 - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.86 5.58 - - - - - - - - -0.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.87 4.14 0.15 - - 0.93 - - - - 0.21 1.5 - - - - -2.07 -0.45 3.59 -2.0 -2.72 -0.08 -3.08 -1.06 - 0.52 0.58 - - 0.98 - 1.99 - - - - - - - - - - -2.35 - - - - - -
2.18 5.13 - - 0.84 - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - -1.11 - - - - - - - 0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.48 3.35 -1.42 -2.7 2.19 0.57 -1.62 -2.13 1.25 - -1.71 -1.27 -1.26 3.39 - - -0.29 -2.07 0.57 -1.11 -0.96 -2.4 -1.59 -0.05 - 0.1 - - - -0.75 - 1.83 - - -0.91 -0.19 -2.01 1.12 - -2.96 -1.13 -1.85 -0.38 -0.77 - -3.06 -0.23 - -
-2.39 5.17 - - - - - - - - - - - 2.18 - - - - - -4.43 - 0.15 - 0.9 - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.29 - - - - - - - - - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.03 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - -1.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.08 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.5 - 1.17 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.06 4.3 - - 0.54 - - - - - - - - 4.46 - - - -2.03 - - -1.0 -2.22 - 0.23 - - - - - - - -0.46 - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - -
-4.3 4.68 - - - -0.2 - -1.6 - - -5.92 - - 3.85 - - - - - -0.14 -2.84 - -1.92 -0.29 - - 1.42 - - - - 0.23 - - - - - - - - -3.28 - -1.86 - - 0.39 - - -
- 4.94 - - - - - - - - - - - 3.32 - - -0.83 -1.05 - -2.46 - - - -0.24 - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.16 - - 2.86 - 0.37 - - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.6 - - - - - - - - -1.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.14 4.35 -0.55 - - 2.91 -1.72 - - - -2.61 - - 3.11 - - -2.65 - - - - -2.54 - -0.74 - - - - - - - 2.82 - - 1.52 - - - - - -1.89 - - - - - - - -
1.49 4.37 -1.51 - -0.07 - - - 1.36 - - - - 2.61 - 1.79 - -1.18 - 0.86 -2.8 -0.67 -0.4 0.75 - 0.29 0.49 - - - - 1.22 - - - 0.63 - - - - -2.7 - - - - - - - -
3.26 5.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.8 4.77 - 1.58 - 2.08 3.39 1.48 -1.49 - -2.29 - - - - - - -2.19 - -3.46 - -3.78 - -2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.04 4.9 - - - 1.3 - - 3.32 - - - - - - - -0.24 - - - -1.35 - - 0.89 - - - - - - - 0.2 - - - - - - - - -1.48 - - - - - - - -
-3.64 4.61 - - - - - - - - - - - 3.39 2.66 - - - - - -2.34 -1.13 -0.79 -0.14 - - - - 2.04 - - 0.32 - - - - - - - - - - - -2.05 - - - - -
-0.45 4.6 - - - - - - - - - - - 4.05 - - - - - - -2.53 - - -0.91 - - - - - 2.17 - 0.89 - - - - - - - - -2.89 - -1.76 - - - - - -
-4.66 4.28 - -1.97 - 1.88 -3.04 - -1.73 -1.9 -1.97 - - 1.29 - - - -2.39 - -6.8 -0.25 -1.74 - - - - - - - - 0.95 1.42 0.22 - 1.39 - - 2.62 - -1.02 0.82 0.08 1.55 -2.71 - - - - -
-0.94 4.3 0.26 - 1.08 0.43 - - - - -3.82 - - 3.9 - - - -2.84 - - -1.59 - - 0.08 2.17 - - - - - - 0.86 - - - - - - - - -1.84 - 0.03 - - - - - -
-1.97 5.21 1.5 - - - - - - - -0.8 0.5 - - - - - - - - - -1.47 - -1.28 - - - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - 1.66 - - -
- 3.74 - 0.7 1.83 - -0.47 0.7 - -2.31 -4.56 - - 2.01 - - - - - -0.14 -3.03 -2.14 -5.25 - - - - - 0.74 -3.33 - 0.96 - - - - - - - -1.26 -0.9 -2.4 0.29 -0.51 - - 3.64 1.73 -
-1.75 4.71 -1.26 - - - - - 1.79 - -4.18 -0.5 - - - - - -3.04 - - - - - -1.45 - 0.82 - - - - - 2.0 - - - - - - - - - - 0.25 -3.19 3.08 0.88 - - -
0.83 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.58 - - - - - - - - - - - - 2.06 - - - -
-0.98 5.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.12 - - - 0.19 - - - - -3.96 - - 4.01 - - - -2.83 - -2.45 - - -3.15 - 1.72 2.7 - - - - - 0.85 - - - - - - - -0.95 - - - - 0.13 -0.6 - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - 0.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.47 5.36 - - - 2.8 - - - - -2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.0 4.47 - -1.18 0.99 0.9 - - 1.6 - -2.86 - - - - - - - - -2.34 -3.09 -0.46 - -1.04 - - - - - - - 1.1 - - 1.7 0.93 - - 1.54 0.8 0.55 0.76 -0.67 - - 0.65 - - -
-2.84 5.0 1.41 - - - - -0.73 - - -4.63 - - 3.29 - - - - - - - -2.86 - 1.04 - - - - - - - - - - - - - - - -1.39 -0.69 - -1.67 -1.41 - - - - -
0.48 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.09 3.5 -2.71 -2.56 -0.72 1.45 -0.15 - -0.4 - -5.43 - - 4.13 - - -0.83 -2.94 - -2.21 -1.18 -3.4 -3.55 -1.44 - - - - - - - 1.5 0.24 - - - - - - -3.2 0.81 - -0.85 -0.8 - - - 0.64 1.97
- 5.01 - - - 2.04 - - - - -0.9 - - 1.27 - - -0.79 - - -2.12 - - - -0.57 - - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.5 4.16 - - - - - - 1.76 - -1.6 - - 4.4 - - - - - - - - -0.39 -0.87 - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - -1.0 - - - - - - - -
-3.06 4.69 - -0.68 -0.05 1.65 0.92 - - - -3.58 - - 2.06 - - - -3.59 - 0.71 - -2.7 -1.82 0.12 - 0.58 0.52 - - - - 2.02 - - - - - - - - - - - 0.15 - -0.4 - - -
0.07 4.65 -1.43 - - 2.71 - - 1.34 - -4.13 - - 0.53 - - - - - - -2.74 -1.0 - 0.57 - 1.1 - - - - 0.66 2.57 - - - - - - - -9.19 - - - -2.97 - - - - -
-1.07 4.87 - - - - -1.15 - - - -4.76 - - 3.29 - - -2.21 -2.29 - - - - -0.79 - - - - - - 2.24 - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.33 4.72 -1.96 - - 0.06 - - 0.01 - - -1.09 - 0.8 - - - 0.48 - -3.23 -2.88 - - 1.16 - - - - 1.45 0.76 - 1.62 - 0.91 - - - - - - -0.95 - - - 1.31 0.94 - - -
-0.58 5.58 - - - - - - - - -1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.59 - - - - - - - - -0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.22 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - -0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - -
1.78 5.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.26 4.76 -0.16 - -1.84 1.73 - - -0.05 - -3.85 - - 1.58 - - - -0.95 - 0.16 -2.69 -1.65 -3.15 0.3 2.05 0.48 - - - - - 0.42 - - - - - - - -2.71 -1.47 - - 0.34 - - - - -
1.3 5.2 - - - - - - - - - 3.02 - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.82 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - -0.61 - -2.0 - - - - - - - - - - - 1.68 - - - - - - - - -0.58 - - - - - - - -
0.18 5.24 - - - - - - - - - - - 2.08 - - - - - - -0.54 - -1.1 -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - -0.63 -0.61 1.35 - - - - - - -
- 4.45 - - - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - 0.22 - - -0.93 - - - - 3.8 - - - - - - - 2.38 - - - -1.35 - -0.11 - - - - - -
-3.27 4.69 -3.25 -0.95 - 0.73 - - - - -0.19 0.82 - 3.19 - - -1.76 -3.23 - - -2.17 -1.61 -2.61 -0.22 1.26 - - - - 0.32 - 1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.11 4.2 - - -0.43 -0.59 - - -0.39 - -2.22 -0.42 - 4.11 - - -0.88 -1.13 - -1.6 -2.26 -2.34 -3.48 0.04 - 0.11 - - - - - 1.35 - - 0.54 0.22 - - - - - -2.43 -0.3 - - - - - -
-2.83 4.62 -0.54 0.35 -0.18 2.39 - - - - - - - 3.29 - - - -2.94 - - -3.51 - - -0.09 - 0.45 - - - - - 1.63 - - - - - - - - -2.93 - - - - -0.52 - - -
-1.71 5.03 - -0.79 - - - -1.64 - - - - - 0.73 - - - - - -0.61 -1.89 - - - - 1.31 - - 2.14 - - 2.43 - - - - - - - - - - - -1.66 - - - - -
-1.4 5.01 - - - 1.29 - - - - -2.8 0.45 - - - - - - - - -1.56 - - -0.33 - - - - - - - 2.57 - - - - - 2.42 - - - - - - - - - - -
- 5.14 - - - - -1.12 - - - -0.21 - 0.73 - - - -0.08 -1.74 - - -1.16 - - -0.64 - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - -
-1.11 4.24 - - 0.52 1.23 - - - - - - 0.01 3.82 - 1.33 - -1.58 - -0.02 - -2.05 - -1.3 - -0.13 0.99 - - - - 0.99 - - - - - - - - - - - -1.17 - - -0.13 - -
- 5.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.08 1.27 - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.05 - - - - - 0.75 - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.23 4.15 -0.65 -15.97 - 2.36 - -3.4 - - -6.17 -2.3 -0.07 3.68 - 0.45 -1.0 -3.25 - -4.66 -2.1 -2.8 -4.79 -0.51 - 1.75 - - - -0.7 - 1.72 - - - - - - - - -2.62 -1.66 -1.98 -3.34 -17.64 - - - -
-2.86 5.01 - - - - - - - - 0.09 - - 3.65 - - - -1.24 - - - - - -1.12 - - - - - - - 1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.73 - - - - - -2.0 - - -1.13 - - 2.58 - - -2.0 -0.5 - - -0.88 - - -0.9 - - - - - - 1.07 2.27 - - - - 1.34 - - - -0.98 -0.58 -0.87 -1.54 - 1.17 - - -
-2.45 4.28 - - - 2.23 - - - - - - 0.02 4.18 - - - - - -3.34 -2.58 -2.54 - -0.92 - - - - - 1.14 - 0.86 - - - - - - - -2.41 - - - -1.49 - - - - -
-2.59 4.65 - - - -0.22 -2.94 - 1.14 - -2.13 - 0.61 -1.08 2.36 - - - - -0.1 -1.55 -3.1 -1.32 -0.45 - 2.78 - - - - - 1.54 - - - - - - - -0.9 -3.41 - -2.16 -2.96 - - - - -
-1.02 5.06 - - - - - - - - - - - - - - - -3.08 - -0.12 - - - 1.22 - 2.58 - - - - - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.59 4.06 - - -0.54 1.05 -1.12 - 1.65 -0.61 -1.01 -1.52 2.55 1.82 - - -3.33 -1.99 - -1.65 -0.63 -2.44 -1.33 -2.52 1.39 - - - - - - 3.16 - - - - - - - -1.17 -1.87 -2.43 -1.68 -4.19 - - - - -
-1.18 5.07 - - - - - - - - -4.4 1.66 - - - - - - - -4.76 - - - -0.04 - - 1.99 - - - - 2.59 - - - - - - - - - - -0.52 - - - - - -
0.72 4.7 - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - -0.59 - -0.4 4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.