Heatmap: Cluster_5 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.61 -0.23 0.63 -0.06 0.37 -0.76 0.25 0.97 0.74 -0.04 -0.28 0.1 -0.55 -0.27 0.79 0.04 -1.34 -0.07 0.23 -0.1 0.0 -0.12 0.0 -0.19 0.2 -0.29 -0.52 -0.38 -0.34 -0.54 -0.34 -0.66 -0.51
0.39 0.33 -0.38 -0.68 -0.58 -0.87 0.71 -0.84 -0.29 -0.91 -0.93 1.04 1.92 0.87 -0.4 -0.31 -0.04 -1.07 -1.0 -1.77 -1.19 1.21 1.67 0.04 1.71 -1.01 -0.96 -2.88 -2.4 -2.41 -2.61 -2.92 -2.1
-0.31 0.19 -0.69 -0.93 -0.89 -1.84 0.1 -0.36 -0.24 -0.17 -1.28 0.33 1.28 0.37 -0.8 -1.37 0.03 -1.68 -1.42 -1.63 -1.48 0.86 1.29 0.72 0.08 -0.26 -0.28 0.18 0.55 0.79 0.4 0.06 0.54
0.47 0.56 0.25 0.09 0.2 0.22 0.38 0.66 0.54 0.51 0.1 0.4 -0.29 0.36 0.18 -0.09 -0.82 -0.05 0.09 -0.18 -0.24 0.56 -0.1 -0.45 0.33 -0.99 -0.99 -0.93 -0.73 -0.55 -0.79 -0.98 -0.69
-0.0 -0.78 -0.04 -0.89 -0.33 -1.19 0.4 0.41 0.45 -0.11 -0.3 0.33 -0.31 0.68 0.4 -0.16 -0.07 -0.27 -0.11 -0.12 -0.17 0.53 -0.21 -0.4 -0.54 -0.5 -0.7 0.0 0.48 0.65 0.31 0.07 0.27
-0.28 -1.51 -1.14 -1.99 -0.9 -2.29 0.52 -0.55 -0.19 -1.94 0.12 0.56 0.45 0.15 0.27 -0.28 0.33 -0.22 -0.27 0.32 0.3 0.71 0.84 0.24 0.5 0.27 0.03 0.1 0.25 0.07 0.1 -0.11 0.1
0.86 0.89 0.51 -0.06 0.31 0.64 0.91 0.04 0.51 1.11 0.76 -1.54 0.87 0.55 -0.19 0.83 -0.41 1.37 0.56 0.58 0.39 -1.42 -2.4 -4.86 0.55 - - - - - - - -
-0.01 -0.32 0.21 -0.03 0.28 -0.27 0.51 0.18 0.48 -0.48 0.17 0.11 0.87 -0.22 -0.1 0.06 -0.15 0.32 -0.09 -0.3 0.2 0.24 0.3 0.58 0.64 -0.29 -0.44 -1.06 -0.61 -0.47 -0.84 -1.04 -0.91
0.42 0.52 0.4 0.47 -0.42 0.06 0.59 0.09 0.12 0.59 0.12 0.75 1.52 1.13 -0.02 -0.56 -0.08 -0.28 -0.41 -0.23 -0.35 0.96 -0.07 -2.78 1.95 - - - - - - - -
-1.06 -1.01 -0.7 -0.11 -0.62 -2.38 0.76 -1.14 -0.01 -0.27 0.39 0.76 -0.48 -0.19 0.7 0.12 -0.36 0.25 0.5 0.73 0.55 0.4 0.23 -0.44 0.48 -1.02 -1.25 -0.4 0.2 0.4 -0.11 0.03 0.21
0.56 0.05 0.36 -0.02 -0.06 -0.6 0.22 0.24 0.18 -0.33 -0.46 -0.11 0.49 -0.58 -0.28 0.15 -0.39 -0.19 -0.12 -0.22 -0.27 0.3 0.5 -1.05 0.34 -0.28 -0.24 -0.18 0.18 0.42 -0.1 -0.2 0.28
0.43 -0.12 1.01 1.04 1.71 0.55 -0.16 1.3 0.62 0.21 -1.57 1.63 0.12 1.37 -0.17 -2.22 -0.27 -5.13 -5.23 -3.23 - 0.49 1.11 -1.8 0.91 -2.94 -2.76 -3.5 -2.85 -3.62 -3.0 -4.73 -2.29
0.5 0.38 0.66 1.11 1.65 0.7 -1.09 1.27 0.91 0.68 -2.94 1.14 -0.71 0.63 -1.6 -4.1 0.48 - -6.85 -5.32 -4.56 1.64 1.28 -4.26 0.44 -2.49 -2.12 -1.94 -1.93 -2.08 -1.44 -1.35 -2.22
0.43 0.46 -0.68 -0.96 -1.4 -0.87 0.52 -0.72 -0.89 -0.21 -0.81 0.18 0.32 -0.13 -0.38 -0.95 -0.21 -1.0 -0.05 -0.34 -0.16 0.58 -0.45 0.16 -0.18 0.34 0.17 0.5 0.82 0.88 0.42 -0.16 0.79
-0.82 -0.75 -0.34 -0.66 0.09 -1.71 0.43 -0.76 -0.44 -0.73 0.0 0.92 0.47 0.02 0.3 -0.17 -0.15 0.1 0.38 0.23 0.41 0.74 0.6 -0.3 0.97 -0.87 -0.84 -0.45 -0.2 0.12 -0.18 -0.2 0.12
0.44 0.3 0.57 0.43 0.14 -0.42 0.05 0.46 0.38 0.26 -0.68 0.02 0.33 -0.05 0.14 -0.93 -0.5 -0.96 -0.61 -0.67 -0.64 0.46 0.32 -0.07 0.36 -0.1 -0.18 -0.34 -0.12 0.19 -0.18 -0.2 -0.14
0.08 0.64 0.17 -0.16 -0.24 -1.11 -0.2 0.19 -0.08 -0.09 -1.17 -0.52 -0.84 -0.74 -0.49 -1.26 -0.0 -1.24 -0.64 -0.67 -0.72 -0.72 0.2 -0.35 -0.72 -0.24 -0.28 0.87 1.13 1.09 0.96 0.66 0.95
0.02 -0.74 -0.88 -0.6 -1.15 -1.64 -0.41 -0.6 -0.42 -0.69 0.47 -0.27 -0.39 0.32 1.08 0.27 -0.36 0.9 0.58 0.15 0.41 -0.04 -0.63 -0.94 -0.09 -0.21 -0.3 0.38 0.44 0.59 0.42 0.04 0.27
1.11 0.77 0.15 0.4 -0.33 -0.06 -4.5 0.63 1.03 0.63 0.44 -2.28 -0.76 -3.44 -0.12 -0.04 -0.17 -2.2 -1.08 -1.15 -0.46 -0.63 -1.76 -0.45 0.29 0.23 0.05 0.23 0.47 0.19 0.61 0.26 0.4
0.84 1.28 0.36 0.66 -0.54 -0.57 0.93 -0.53 0.01 -0.13 -0.96 0.12 -0.28 -0.1 -0.8 -1.2 -0.62 -1.43 -1.24 -1.12 -1.08 0.19 0.45 0.79 -0.52 -0.52 -0.66 0.14 0.33 0.46 0.05 0.0 0.34
-0.36 -0.68 0.3 0.2 0.16 -0.62 0.37 0.17 -0.41 0.28 -0.25 0.39 0.64 0.14 -0.01 -0.09 -0.5 -0.47 -0.48 -0.33 -0.53 0.73 0.23 0.8 0.44 -0.86 -0.91 -0.02 0.12 -0.06 -0.25 -0.2 -0.1
0.8 -0.65 0.22 -0.8 0.25 -0.85 0.54 -0.29 -0.46 -1.88 -0.65 0.15 -0.02 0.38 0.27 -0.73 -0.29 -0.75 -0.73 -0.98 -0.99 0.48 0.91 0.44 0.62 0.19 -0.03 0.35 0.31 0.11 0.18 0.19 -0.24
0.3 0.26 -0.14 -0.53 -0.37 0.24 0.8 -0.65 -0.12 -1.46 -0.26 0.47 0.91 -0.13 -0.44 -0.26 -0.15 -0.7 -0.88 -1.01 -1.34 0.97 1.46 1.3 1.38 -0.12 0.01 -1.75 -1.32 -1.38 -1.39 -1.42 -1.81
0.94 1.58 -0.84 -0.56 -1.97 -0.79 0.77 - - -3.8 1.89 0.81 1.2 - - 0.05 -4.67 - 1.69 -0.28 1.21 0.82 - 2.52 0.44 -4.49 -4.61 - - - - - -3.09
0.02 0.36 -0.58 -0.73 -0.71 -0.66 0.25 -0.02 -0.2 -0.79 -0.52 0.23 0.43 -0.03 -0.22 -0.82 -0.23 -0.52 -0.5 -0.44 -0.77 0.31 0.67 0.16 -0.29 0.3 0.21 0.28 0.59 0.61 0.4 0.14 0.61
-1.53 -0.08 -1.82 -1.16 -1.33 -0.47 1.02 -1.43 -1.93 -1.45 -0.28 -0.71 0.39 0.12 -0.61 0.89 -0.27 0.02 1.09 0.82 0.22 -0.38 -0.99 0.74 -1.6 -3.69 -2.97 0.93 1.22 0.43 -0.16 0.13 1.35
0.29 1.09 -0.0 0.1 -0.12 -0.82 0.55 0.06 0.81 -0.59 -0.43 -0.04 0.63 0.02 -0.73 -0.87 0.06 -0.76 -0.62 -0.61 -0.78 0.4 0.61 0.81 -0.0 -0.67 -0.93 -0.34 0.17 0.26 -0.29 -0.65 -0.13
0.91 1.33 -0.68 -0.5 -0.98 -0.63 0.12 -0.3 -0.1 0.6 -0.7 -0.08 1.39 0.13 -2.31 -0.83 0.46 -0.46 -0.89 -1.66 -1.51 -0.45 0.57 1.38 1.19 -0.02 -0.04 -1.5 -0.71 -0.41 -1.27 -2.18 0.04
-0.38 0.03 -0.23 0.03 0.11 0.06 0.16 0.23 0.49 0.21 -0.39 0.39 0.71 0.37 -0.19 -0.73 -0.39 -0.9 -0.31 -0.68 -0.37 0.35 0.69 0.41 0.01 -0.64 -0.89 -0.01 0.29 -0.01 -0.09 -0.25 -0.03
0.29 0.26 -0.29 -0.6 -0.29 -0.2 0.25 -0.15 -0.36 -0.52 -0.09 0.12 0.51 -0.62 0.21 -0.36 -0.71 -0.7 -0.51 -0.44 -0.31 0.26 0.69 0.42 0.28 0.17 0.08 0.12 0.1 0.17 0.19 0.29 0.18
-0.66 -0.17 -0.5 -0.34 -0.32 -2.58 0.68 -0.75 0.37 -1.27 0.12 0.74 -0.01 0.38 1.1 0.29 -0.46 0.24 0.17 0.3 0.2 0.6 0.24 -0.3 0.5 -0.57 -0.68 -0.37 -0.0 -0.08 -0.43 -0.44 -0.18
0.51 0.89 0.05 0.09 -0.23 -0.03 -0.3 0.32 0.25 0.35 -0.17 -0.46 -0.69 -0.39 -0.09 -0.66 -0.12 -0.43 -0.38 -0.28 -0.37 0.01 0.24 -0.8 -0.53 0.21 0.1 -0.07 0.42 0.51 -0.05 -0.37 0.61
1.06 1.04 0.4 -0.03 -0.19 -0.68 0.66 0.16 0.01 -0.02 -0.33 0.11 0.26 0.0 0.57 -0.41 0.07 -0.61 -0.48 -0.58 -0.5 0.39 0.57 0.44 0.36 -0.33 -0.32 -0.88 -0.57 -0.89 -1.0 -1.04 -1.07
0.23 -0.46 0.15 -0.38 0.15 -0.98 0.96 0.04 0.03 -1.16 -0.37 0.62 1.04 0.01 -0.18 0.52 0.02 -0.32 -0.26 -0.47 -0.34 0.74 0.69 1.23 0.39 -1.0 -1.02 -1.02 -0.74 -0.69 -0.94 -1.11 -0.55
0.43 1.12 -0.23 0.02 -0.54 -0.43 0.13 -0.23 -0.1 -0.05 -0.59 -0.14 0.29 -0.11 -0.63 -0.86 0.3 -0.99 -0.92 -1.05 -0.86 0.08 0.64 0.14 -0.3 0.29 0.17 -0.01 0.49 0.66 -0.01 -0.26 0.53
0.25 0.34 0.41 0.13 0.89 -0.22 -0.18 0.56 0.95 0.06 0.13 -0.0 0.51 -0.56 -0.54 -0.47 0.43 0.0 0.19 -0.57 0.11 -0.22 0.37 -0.94 1.18 -1.09 -0.84 -1.07 -0.96 -0.58 -1.09 -1.11 -0.56
-0.13 -0.55 -0.06 -0.31 0.04 -0.08 0.04 0.03 0.08 -0.25 -0.25 0.74 1.62 -0.49 0.27 -0.43 0.16 -0.35 -0.41 -0.42 -0.41 0.88 0.89 0.68 1.1 -0.36 -0.28 -1.57 -1.3 -1.22 -1.55 -1.43 -1.38
-0.66 -0.41 -0.84 -1.19 -0.52 -1.22 0.43 -0.3 -0.16 -0.68 -0.25 0.39 0.43 0.08 0.35 0.15 -0.49 0.11 0.18 -0.05 0.11 0.48 1.09 0.13 0.19 -0.1 -0.39 0.07 0.19 0.26 0.05 -0.14 0.15
-1.07 -1.87 -0.9 -1.1 0.22 -0.9 0.69 -0.98 -1.04 -1.85 0.73 -0.33 0.58 0.16 0.38 -0.46 -0.13 -0.58 0.38 -0.19 -0.09 0.21 0.13 -0.28 0.16 -0.06 -0.35 0.72 1.02 0.54 0.38 0.12 0.47
1.73 1.19 - - 0.13 - 2.4 - - - - 2.43 - 2.44 - - 0.88 - - - - 1.5 - - 2.47 - - - - - - - -
-0.15 -0.32 -0.99 -1.6 -0.64 -1.46 0.4 -0.45 0.05 -1.73 -0.96 0.08 0.51 -1.06 -0.01 0.47 -0.15 -0.73 0.12 0.07 -0.13 0.72 0.98 0.16 0.28 -0.34 -0.57 0.18 0.6 0.68 0.4 0.52 0.31
0.66 0.15 -0.05 0.6 0.65 -1.69 1.32 -0.26 0.99 -3.31 -4.13 -0.62 -1.32 -2.02 -4.18 -4.13 -0.53 -5.27 - -8.14 - -0.2 2.26 0.8 -0.79 -1.26 -1.42 0.32 0.32 0.8 0.97 0.47 0.99
0.58 0.39 0.38 -0.26 -0.19 -0.8 -0.06 0.26 0.19 -0.3 -0.97 -0.38 -0.2 -0.13 -0.82 -1.0 0.0 -1.1 -0.88 -1.15 -0.92 -0.16 0.32 -0.7 -0.55 0.35 0.29 0.41 0.97 1.07 0.39 0.32 0.57
0.51 0.59 0.44 0.21 0.16 0.06 0.72 0.63 0.36 0.31 -0.31 0.34 -0.24 0.07 -0.07 -0.41 -0.62 -0.57 -0.17 -0.62 -0.2 0.43 -0.26 -0.36 -0.25 -0.83 -1.0 -0.08 -0.12 -0.1 -0.26 -0.09 -0.29
0.62 0.27 0.58 -0.27 0.12 -0.54 0.12 0.75 0.49 -0.41 -0.48 0.01 0.55 -0.42 0.83 0.46 -1.16 -0.63 -0.51 -0.49 -0.52 0.37 0.83 0.91 0.41 -0.67 -0.67 -1.02 -0.57 -0.5 -0.97 -1.3 -0.72
0.02 -0.47 0.33 0.43 0.37 -0.35 0.74 -0.0 -0.08 -0.08 -0.05 0.16 0.53 0.11 -0.09 -0.02 -1.15 -0.21 0.08 -0.08 -0.08 0.18 0.0 0.44 -0.23 -0.79 -0.85 -0.33 0.02 0.1 -0.1 -0.26 0.15
0.49 0.59 0.08 -0.4 -0.32 -0.25 0.17 -0.06 -0.14 -0.5 -0.85 -0.19 0.45 0.19 -0.46 -1.01 0.35 -1.16 -1.3 -1.12 -1.22 0.53 1.1 0.61 -0.27 0.19 0.11 -0.09 0.27 0.44 -0.09 -0.33 0.44
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-0.15 0.08 -0.42 -0.58 -0.08 -0.83 0.56 0.42 0.63 -0.36 0.01 0.21 1.12 0.19 0.2 0.8 -0.74 -0.06 0.05 -0.29 0.0 0.48 0.74 1.23 0.71 -1.39 -1.49 -1.31 -1.19 -1.14 -1.39 -1.56 -1.33
-0.52 -0.55 -0.85 -1.0 -0.66 -1.2 0.78 -0.47 -0.87 -0.57 -0.19 0.86 0.76 -0.55 0.25 -0.16 -0.35 0.12 0.02 0.3 0.57 0.89 1.14 0.39 0.1 0.14 -0.18 -0.48 -0.26 -0.15 -0.7 -0.75 -0.01
-0.45 -0.2 -0.3 -0.43 -0.15 -0.78 0.03 -0.36 -0.39 -0.47 0.85 0.34 0.93 -0.19 1.02 0.33 -0.28 0.27 0.79 0.73 0.52 0.29 0.25 -0.66 0.62 -1.69 -1.87 -0.6 -0.47 -0.52 -0.68 -0.83 -0.61
-0.25 -0.7 -0.6 -0.89 0.18 -0.37 0.3 0.11 0.04 -0.26 0.15 0.09 -0.21 -0.74 -0.12 0.4 -0.12 0.02 0.45 0.15 0.15 -0.39 0.26 -0.53 -0.61 0.19 0.11 0.17 0.47 0.39 0.28 -0.02 0.42
0.8 0.92 0.71 0.8 0.63 0.18 -0.32 0.96 1.19 0.6 -0.77 -0.39 -0.74 -0.52 -0.07 -0.92 -0.55 -0.9 -0.88 -0.97 -1.06 0.04 0.19 -1.11 -0.02 -0.73 -0.96 -0.22 -0.16 0.02 -0.26 -0.29 -0.44
-0.3 0.28 -0.11 0.21 -0.33 -1.31 0.01 0.11 0.19 0.55 -0.59 0.08 0.44 -0.15 -0.07 -0.13 -1.01 -0.76 -0.74 -0.49 -0.71 0.49 0.58 0.17 -0.28 -0.89 -0.97 0.18 0.53 0.85 0.28 0.13 0.63
-0.3 0.29 -0.16 0.12 -0.33 -0.39 0.36 -0.24 -0.3 0.31 -0.74 0.13 0.49 0.37 -0.21 -0.03 -0.4 -0.31 -0.57 -0.41 -0.45 0.35 0.52 0.71 -0.18 -0.77 -0.66 -0.23 0.5 0.43 0.1 -0.19 0.36
0.01 0.3 0.27 0.54 0.32 0.91 -0.78 0.88 0.82 1.59 -0.46 -0.07 1.2 -0.31 -0.27 -0.89 -0.55 -0.38 -0.82 -1.31 -0.87 0.65 -0.24 -0.56 0.98 -1.08 -1.33 -1.34 -0.9 -0.93 -1.18 -1.46 -1.14
0.03 -0.89 0.23 -0.8 -0.18 -1.4 0.49 0.39 0.19 -0.2 -0.12 0.2 0.63 0.47 0.34 0.67 -0.68 0.04 -0.0 0.28 0.08 0.75 0.26 0.94 0.17 -0.54 -0.59 -0.82 -0.56 -0.58 -0.71 -1.02 -0.68
-1.21 -1.71 -0.59 -0.37 -1.19 -1.3 0.22 -0.43 0.12 -1.29 1.13 1.77 -0.33 0.54 1.54 0.85 -1.04 1.29 1.07 0.49 1.02 -0.12 -3.09 -1.14 0.96 -1.48 -1.61 -1.92 -4.18 -3.25 -2.1 -1.02 -1.87
0.48 -0.11 0.08 0.89 -0.96 -0.97 1.92 -2.66 -2.81 - 0.83 2.2 1.22 2.16 - -2.9 -0.1 0.33 -1.84 - - 0.23 -0.61 - 2.29 -5.01 - - - -2.81 - - -
0.95 1.07 0.48 0.36 -0.19 -0.6 -0.63 0.07 0.06 0.57 -0.61 -0.38 -0.48 -1.45 -0.56 -0.81 -0.33 -1.06 -0.04 -0.67 -0.71 -0.96 -0.46 -0.94 -0.29 -0.22 -0.3 0.47 0.73 0.71 0.3 0.46 0.83

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.