Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00125420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.98)
1.0 0.54 0.75 0.6 0.52 0.0 0.1 0.02 0.05 0.08 0.39 0.46 0.46 0.36 0.34 0.45 0.44 0.39 0.4 0.34 0.22 0.49
AMTR_s00006p00254430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.178)
1.0 0.48 0.54 0.8 0.53 0.01 0.02 0.1 0.03 0.03 0.42 0.39 0.36 0.21 0.24 0.19 0.19 0.27 0.26 0.21 0.1 0.27
AMTR_s00010p00199710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.189)
0.88 1.0 0.82 0.5 0.9 0.18 0.2 0.12 0.18 0.15 0.31 0.31 0.24 0.37 0.89 0.13 0.33 0.1 0.06 0.04 0.02 0.34
AMTR_s00013p00072460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.31)
1.0 0.49 0.38 0.36 0.5 0.0 0.08 0.0 0.22 0.18 0.18 0.18 0.2 0.24 0.1 0.36 0.21 0.09 0.21 0.18 0.3 0.25
AMTR_s00016p00250460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.299)
1.0 0.78 0.23 0.34 0.66 0.0 0.18 0.14 0.39 0.34 0.39 0.36 0.28 0.34 0.19 0.21 0.18 0.37 0.3 0.14 0.22 0.18
AMTR_s00016p00260310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.379)
0.95 0.77 0.67 1.0 0.45 0.01 0.04 0.04 0.05 0.05 0.3 0.1 0.69 0.35 0.13 0.19 0.53 0.15 0.2 0.61 0.48 0.54
AMTR_s00018p00203080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.123)
1.0 0.34 0.89 0.43 0.43 0.02 0.32 0.27 0.29 0.32 0.42 0.58 0.55 0.48 0.43 0.52 0.31 0.31 0.41 0.33 0.25 0.46
AMTR_s00022p00229870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.306)
1.0 0.41 0.07 0.57 0.41 0.0 0.05 0.01 0.11 0.1 0.29 0.29 0.25 0.25 0.2 0.26 0.37 0.32 0.23 0.16 0.13 0.28
AMTR_s00023p00095420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.47)
0.27 0.51 0.4 0.41 0.47 0.01 0.08 0.05 0.11 0.1 0.34 0.22 0.36 0.32 1.0 0.13 0.39 0.23 0.19 0.44 0.11 0.36
AMTR_s00025p00154170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.173)
0.98 0.92 0.24 1.0 0.74 0.04 0.03 0.04 0.01 0.01 0.43 0.66 0.62 0.23 0.4 0.58 0.35 0.45 0.42 0.26 0.02 0.55
AMTR_s00030p00199250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.136)
1.0 0.48 0.57 0.51 0.56 0.0 0.09 0.27 0.15 0.13 0.45 0.38 0.5 0.34 0.31 0.29 0.44 0.49 0.28 0.34 0.42 0.34
AMTR_s00030p00237270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.203)
0.53 1.0 0.54 0.56 0.63 0.2 0.17 0.25 0.17 0.2 0.44 0.49 0.56 0.77 0.62 0.55 0.29 0.41 0.39 0.37 0.24 0.76
AMTR_s00030p00240050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.209)
1.0 0.28 0.8 0.49 1.0 0.01 0.19 0.17 0.26 0.25 0.58 0.4 0.8 0.46 0.38 0.48 0.4 0.32 0.43 0.19 0.2 0.46
AMTR_s00044p00081180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.50)
0.92 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.49 0.16 0.43 0.12 0.13 0.18 0.32 0.19 0.22 0.29 0.13 0.33
AMTR_s00045p00230960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.335)
1.0 0.29 0.71 0.44 0.36 0.01 0.17 0.18 0.18 0.2 0.46 0.58 0.45 0.39 0.28 0.98 0.31 0.58 0.42 0.4 0.25 0.45
AMTR_s00048p00220260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.203)
1.0 0.42 0.7 0.75 0.5 0.02 0.08 0.23 0.09 0.07 0.62 0.69 0.77 0.43 0.69 0.52 0.43 0.6 0.69 0.88 0.83 0.82
AMTR_s00053p00168120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.115)
1.0 0.0 0.0 0.84 0.23 0.0 0.03 0.0 0.18 0.1 0.22 0.78 0.16 0.08 0.08 0.16 0.38 0.07 0.09 0.03 0.07 0.16
AMTR_s00057p00212410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.265)
1.0 0.86 0.64 0.71 0.91 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.21 0.35 0.29 0.85 0.58 0.38 0.26 0.23 0.18 0.08 0.35
AMTR_s00058p00158800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.137)
0.95 0.98 0.24 0.35 0.46 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.12 0.41 1.0 0.19 0.02 0.01 0.02 0.07 0.01 0.18
AMTR_s00062p00109550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.85)
0.0 0.5 0.64 0.59 0.62 0.01 0.07 0.0 0.11 0.09 0.49 0.5 0.49 0.32 1.0 0.33 0.5 0.26 0.33 0.37 0.15 0.33
AMTR_s00062p00144860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.129)
0.0 1.0 0.0 0.91 0.34 0.0 0.18 0.09 0.26 0.26 0.55 0.64 0.49 0.33 0.31 0.51 0.38 0.3 0.26 0.2 0.1 0.38
AMTR_s00065p00211190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.210)
0.6 0.8 0.0 1.0 0.76 0.0 0.05 0.03 0.07 0.06 0.51 0.37 0.64 0.23 0.16 0.78 0.7 0.25 0.5 0.34 0.29 0.87
AMTR_s00066p00069810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.48)
0.0 0.0 1.0 0.01 0.64 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.24 0.29 0.08 0.53 0.22 0.06 0.06 0.04 0.08 0.05 0.1 0.15
AMTR_s00067p00201450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.217)
0.54 1.0 0.67 0.77 0.66 0.05 0.09 0.19 0.14 0.14 0.51 0.69 0.51 0.61 0.49 0.19 0.3 0.61 0.6 0.23 0.17 0.44
AMTR_s00071p00182060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.185)
1.0 0.52 0.32 0.65 0.97 0.0 0.1 0.09 0.27 0.21 0.52 0.63 0.52 0.4 0.47 0.27 0.55 0.48 0.29 0.36 0.26 0.67
AMTR_s00073p00050630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.10)
0.69 1.0 0.81 0.49 0.69 0.08 0.1 0.41 0.31 0.26 0.47 0.53 0.77 0.55 0.41 0.4 0.15 0.34 0.46 0.35 0.1 0.58
AMTR_s00073p00104680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.27)
0.21 0.73 0.35 0.42 0.4 0.0 0.15 0.17 0.13 0.18 0.51 0.49 0.56 0.34 0.41 1.0 0.42 0.52 0.55 0.54 0.25 0.51
AMTR_s00077p00134130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.128)
0.49 0.12 0.09 0.28 1.0 0.12 0.31 0.05 0.35 0.22 0.56 0.55 0.67 0.84 0.64 0.22 0.64 0.24 0.21 0.15 0.08 0.39
AMTR_s00078p00173950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.166)
1.0 0.47 0.21 0.43 0.21 0.0 0.05 0.05 0.26 0.16 0.39 0.4 0.38 0.42 0.43 0.91 0.33 0.44 0.33 0.3 0.22 0.33
AMTR_s00079p00118940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.46)
0.78 0.24 0.52 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.32 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.05 0.0 0.43 1.0 0.01 0.09 0.0 0.08 0.07 0.47 0.38 0.66 0.85 0.9 0.39 0.25 0.23 0.22 0.35 0.13 0.25
AMTR_s00081p00108570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.38)
0.78 0.67 0.0 0.83 1.0 0.01 0.54 0.0 0.58 0.5 0.7 0.71 0.69 0.35 0.58 0.21 0.94 0.22 0.44 0.52 0.26 0.56
AMTR_s00092p00128890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.92)
1.0 0.65 0.07 0.5 0.64 0.0 0.02 0.04 0.12 0.12 0.31 0.25 0.32 0.35 0.66 0.38 0.23 0.24 0.26 0.23 0.21 0.21
AMTR_s00099p00065170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.45)
0.49 0.0 1.0 0.23 0.91 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.38 0.39 0.33 0.59 0.25 0.39 0.16 0.34 0.31 0.11 0.11 0.24
AMTR_s00137p00068430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00137.31)
0.12 0.12 0.57 0.2 1.0 0.22 0.1 0.18 0.13 0.13 0.34 0.51 0.59 0.68 0.41 0.89 0.14 0.44 0.51 0.28 0.34 0.34
AMTR_s00140p00102290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.49)
1.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00144p00096650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.52)
0.55 1.0 0.64 0.48 0.48 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.49 0.53 0.72 0.24 0.4 0.33 0.31 0.33 0.4 0.54 0.06 0.83
AMTR_s00145p00103920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00145.42)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.11 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00149p00074840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.54)
0.14 1.0 0.48 0.72 0.53 0.01 0.12 0.16 0.1 0.11 0.46 0.49 0.38 0.29 0.25 0.32 0.46 0.3 0.38 0.33 0.24 0.38
AMTR_s00156p00035290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.12)
0.61 0.7 0.75 0.85 1.0 0.04 0.18 0.15 0.57 0.51 0.69 0.53 0.64 0.49 0.27 0.5 0.97 0.42 0.39 0.28 0.32 0.26
AMTR_s00169p00059210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00169.35)
0.0 0.77 0.0 1.0 0.17 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.37 0.4 0.56 0.13 0.18 0.0 0.25 0.2 0.39 0.36 0.07 0.16
AMTR_s00180p00024800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00180.10)
1.0 0.39 0.67 0.28 0.69 0.09 0.32 0.04 0.23 0.26 0.2 0.22 0.37 0.39 0.25 0.13 0.22 0.2 0.14 0.1 0.1 0.25
AMTR_s00217p00027050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00217.9)
1.0 0.47 0.53 0.87 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00264p00014380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00264.3)
0.29 0.16 0.11 0.28 0.54 0.07 0.28 0.04 0.3 0.31 0.39 0.45 0.74 0.74 1.0 0.82 0.59 0.21 0.23 0.57 0.26 0.64
AMTR_s05433p00006310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05433.1)
1.0 0.49 0.73 0.57 0.67 0.0 0.13 0.06 0.35 0.29 0.4 0.65 0.78 0.47 0.64 0.44 0.37 0.32 0.42 0.56 0.51 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)