Heatmap: Cluster_383 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-0.09 0.05 0.03 -0.08 0.34 0.28 -0.18 0.4 0.42 0.67 0.22 -0.16 -0.37 0.67 -0.77 0.44 -0.75 0.39 -0.05 0.62 -0.04 0.15 -0.14 0.2 0.05 -0.89 -0.63 -0.72 -0.35 -0.36 -0.58 -0.43 -0.42
1.23 -0.08 2.21 0.21 0.34 -0.67 0.23 1.18 0.41 -0.15 -1.42 -1.88 -4.01 1.33 1.58 -0.32 -2.93 -0.05 -1.9 -1.19 -1.3 2.2 -5.7 -2.34 -2.89 -0.61 -0.96 -2.15 -2.33 -2.86 -2.51 -2.69 -2.99
-0.28 -0.41 -0.4 0.05 0.05 0.88 0.59 0.25 1.18 -1.12 0.05 0.08 -0.41 0.02 -0.02 -0.55 0.21 -0.34 0.34 0.34 -0.58 0.4 -0.22 -0.44 -0.65 -0.99 -1.2 -0.33 -0.05 0.23 -0.56 -0.02 0.65
0.13 0.43 -0.11 -0.0 -0.65 0.44 0.92 -0.56 -0.61 -1.14 -0.19 0.84 -1.08 0.74 0.15 -0.26 0.28 -0.51 -0.09 0.03 -0.17 0.19 0.24 -1.77 -0.02 -3.71 -1.5 0.08 0.52 0.73 0.12 -0.35 0.48
0.25 0.46 0.01 0.05 0.13 0.15 -0.31 -1.85 0.43 -0.12 0.16 0.27 -0.94 0.31 -2.68 0.27 0.06 -0.25 -1.27 -0.54 -1.87 1.5 -6.45 -2.37 0.82 -1.89 -2.13 -0.06 0.46 1.15 -0.11 0.11 1.18
-0.23 -0.02 -0.11 -0.1 -0.0 0.23 -0.02 -0.11 -0.15 0.27 0.15 -0.31 -0.28 0.01 -0.56 0.51 -0.11 0.61 0.08 -0.17 0.36 -0.08 0.03 0.27 -0.53 -0.51 -0.29 -0.2 0.29 0.13 0.16 -0.15 -0.02
-0.02 -0.32 0.09 -0.03 0.43 0.96 0.14 0.53 0.56 0.56 0.13 0.15 -0.47 0.18 0.17 0.22 -0.71 0.21 0.38 0.25 0.16 0.02 -0.79 -0.28 -0.59 -0.84 -0.65 -0.79 -0.48 -0.37 -0.58 -0.57 -0.06
-0.4 -0.22 -1.03 -1.65 -1.28 -0.1 1.2 -0.64 0.3 -0.3 0.06 1.11 1.12 0.76 -0.39 -0.28 -1.92 0.23 -0.67 -0.33 -0.12 0.28 -1.9 -0.76 0.58 -1.47 -1.04 0.24 0.01 0.36 0.01 0.5 0.62
-0.13 -0.59 0.0 -0.34 0.04 0.3 0.73 0.28 -0.09 0.6 0.21 0.46 -0.65 0.68 -0.96 1.19 -1.05 0.29 -0.18 0.04 0.08 -0.06 -0.37 -0.28 -0.59 -0.56 -0.58 -0.35 -0.11 -0.07 -0.26 -0.33 -0.1
-0.06 -0.16 -0.11 -0.15 0.66 0.98 -0.57 0.75 0.59 0.49 -0.32 -0.03 -0.62 0.44 0.28 -0.48 -1.06 -0.03 -0.58 -0.36 -0.41 -0.0 -0.01 -0.05 -0.4 -0.92 -0.87 0.15 0.34 0.01 -0.08 -0.22 0.19
0.49 0.14 0.86 0.29 0.44 0.33 -0.39 0.17 -0.2 -0.18 -0.23 0.02 -1.47 0.71 -0.12 0.24 -0.54 0.22 0.03 0.13 -0.15 1.11 0.37 0.33 -0.96 -0.28 -0.42 -0.92 -0.7 -0.77 -0.88 -0.89 -0.38
0.03 -0.61 0.44 0.19 0.04 -0.51 0.76 0.17 -0.21 0.96 0.11 0.62 -0.51 0.35 0.13 0.57 -0.79 0.35 -0.02 0.12 -0.06 0.49 -0.28 0.22 -0.13 -0.89 -0.77 -0.85 -0.57 -0.44 -0.68 -0.64 -0.46
0.39 -0.08 0.03 0.56 1.22 0.64 1.49 -0.53 -0.44 0.71 -0.8 1.64 0.18 3.26 - - 0.42 - - - - -0.29 -0.5 - 0.21 -5.38 -6.87 -5.02 - - -4.38 - -
-0.38 -0.3 0.43 0.62 0.54 1.01 -0.51 -0.23 -0.39 0.58 0.65 -0.66 -1.12 -1.2 1.65 0.3 -1.27 0.54 0.64 0.81 0.83 -0.69 -3.18 -1.13 -0.58 -0.53 -0.48 -0.64 -1.1 -1.1 -0.52 -0.53 -0.79
-0.62 0.02 -0.77 0.91 0.1 1.48 -1.52 -0.13 0.29 0.45 0.3 -0.98 -2.57 -1.01 2.05 0.8 -1.18 0.88 0.88 0.64 1.23 -0.74 -1.37 -0.71 -0.78 -0.75 -0.63 -1.86 -3.1 -2.19 -1.78 -1.34 -2.94
-1.14 -0.98 -0.67 0.16 -0.38 1.24 -0.44 -0.52 -0.69 0.77 0.57 -0.29 -1.38 1.53 -0.54 1.31 -1.39 1.44 1.18 1.51 1.1 -1.15 -1.9 -2.47 -1.07 -1.79 -1.97 -0.79 -1.34 -2.17 -1.2 -1.18 -1.65
0.31 -0.38 0.17 -0.52 -0.1 -0.19 -0.59 0.11 -0.02 -0.51 0.62 -0.06 -2.08 0.68 0.65 0.84 -0.43 1.06 0.85 0.84 0.87 0.82 -1.58 -3.36 -0.59 -0.5 -0.25 -0.92 -0.95 -0.6 -0.77 -0.7 -0.58
-0.67 -0.77 -1.6 -1.05 -0.1 1.25 0.99 -0.43 0.76 0.04 0.44 1.36 -0.26 -0.13 1.25 0.62 -0.31 0.83 -0.11 -0.72 -0.14 0.87 -2.27 -1.68 1.06 -3.21 -2.48 -1.77 0.33 -0.8 -1.6 -3.43 -1.5
0.11 -0.82 0.3 0.07 -0.12 0.26 -1.44 1.07 0.64 0.28 0.1 -3.12 -5.48 1.86 0.62 2.17 -6.76 1.43 1.14 1.69 1.29 -3.08 -7.5 -9.75 -3.82 -6.5 -6.67 - - - - - -
0.34 0.6 0.11 0.31 0.03 0.45 0.42 -0.42 -0.42 -0.26 0.15 0.61 -0.97 0.92 0.57 0.08 0.08 0.38 0.04 0.56 0.28 0.2 - -1.19 0.15 - - -0.39 -0.12 0.03 -0.17 -0.02 -0.11
-0.35 -0.85 0.5 0.32 0.25 0.06 0.45 0.37 -0.48 -0.12 -0.34 0.05 -2.55 1.61 1.5 0.73 -2.53 0.03 0.57 0.97 0.57 1.15 -3.05 -3.18 -1.33 -0.67 -0.91 -1.23 -0.94 -0.6 -0.99 -1.27 -1.67
-0.17 -0.35 -0.02 0.59 0.71 1.4 -0.04 0.58 0.94 1.11 -0.51 -0.99 -1.97 -0.53 2.0 0.4 -1.52 0.15 0.26 0.55 0.67 -1.24 -2.1 -1.5 -1.37 -0.87 -0.72 -1.39 -1.46 -1.32 -1.42 -1.59 -1.16
-0.44 -0.47 -0.14 -0.25 -0.09 0.29 0.32 0.4 0.31 0.53 -0.19 0.39 0.29 0.52 -0.25 0.1 -1.43 -0.3 -0.25 -0.04 0.01 0.47 0.28 0.66 -0.03 -0.47 -0.55 -0.38 -0.01 -0.16 -0.22 -0.43 -0.31
0.16 -0.52 -0.06 0.13 -0.04 0.38 0.81 -0.86 0.36 -0.01 -0.13 -0.06 0.39 0.14 -0.72 -0.1 -0.73 -0.51 0.28 -0.68 -0.12 0.27 0.5 -0.84 0.49 -0.42 -0.23 -0.15 0.3 0.34 -0.08 -0.25 0.03
-0.26 0.08 -0.13 -0.12 -0.23 -0.42 0.35 -0.02 0.24 0.72 -0.23 0.18 0.36 0.58 -0.23 -0.01 -1.55 -0.62 -0.61 -0.6 -0.54 0.19 0.2 0.4 -0.7 -0.15 -0.42 -0.25 0.63 0.59 -0.04 -0.38 0.56
0.06 -0.26 0.4 0.38 0.69 1.04 -0.22 0.38 -0.05 0.18 -0.08 -0.49 0.24 -0.21 0.01 0.13 -2.11 -0.19 -0.43 -0.59 -0.59 -0.16 0.37 0.17 0.09 -1.09 -0.85 0.07 0.01 -0.01 0.05 0.11 0.03
-0.98 -0.96 -0.49 -0.18 0.0 1.61 -1.0 0.33 0.41 1.35 0.31 -0.44 -2.4 0.51 1.16 1.23 -2.13 0.94 0.53 0.76 0.61 -0.98 -2.07 -1.17 -2.15 -0.89 -1.12 -1.42 -0.97 -0.6 -1.31 -1.24 -0.07
-0.32 -0.85 -0.0 -0.41 0.38 1.02 0.63 0.4 0.03 -0.58 0.02 0.33 -1.77 1.79 0.02 0.3 -1.31 0.38 0.04 0.19 0.39 0.11 -1.06 -1.7 -0.88 -1.53 -1.33 -0.25 -0.03 -0.21 0.11 -0.4 -0.19
-1.69 -2.16 -0.49 0.29 0.91 1.6 -0.35 0.36 0.38 1.02 0.36 -0.26 -0.48 -0.19 0.1 1.01 -0.99 0.44 0.51 0.2 0.25 -0.9 -2.2 0.46 -0.17 -0.84 -0.77 -0.75 -0.61 -0.77 -0.75 -0.77 -0.69
-0.01 -0.3 -0.48 -0.46 0.04 0.64 0.32 -0.09 0.09 0.3 -0.1 0.86 -1.4 0.35 0.49 -0.36 -0.39 0.0 -0.91 -0.15 0.47 -0.05 -0.21 -0.82 -1.05 -1.92 -1.31 0.47 0.52 0.72 0.22 -0.08 0.48
-0.96 -0.54 1.05 -0.03 -0.43 -3.69 -1.43 1.69 0.61 0.18 -3.02 0.83 -1.57 1.09 -4.54 - -0.89 -0.49 -2.44 -1.32 -2.93 2.59 -1.7 1.28 -0.64 0.09 0.07 -0.2 -0.33 -0.65 -1.11 -2.25 -0.34
-0.07 -2.08 0.45 -0.01 0.65 -0.87 -0.68 0.87 0.08 -0.83 0.12 -0.25 -0.27 -0.21 0.81 0.44 -0.8 0.81 0.34 0.68 0.4 1.93 -3.02 -0.54 -0.69 0.19 -0.02 -0.73 -1.89 -1.75 -0.97 -0.51 -1.97
-0.47 -1.01 -0.3 -0.37 0.01 -0.06 -0.52 0.78 0.26 0.4 0.32 0.42 -0.09 0.51 0.08 0.05 -0.75 0.42 0.09 -0.18 0.37 0.51 -0.54 -0.57 0.11 -0.66 -0.57 -0.2 -0.0 0.21 -0.31 -0.29 0.33
0.02 0.44 -0.02 0.07 0.4 0.96 -0.15 0.69 0.36 0.3 -0.19 -0.18 -0.3 -0.05 0.78 0.39 -0.87 -0.3 -0.47 -0.5 -0.04 -0.03 -0.39 0.35 -0.27 -1.07 -0.92 -0.64 0.05 0.09 -0.26 -0.49 -0.23
-0.18 0.13 -0.42 -0.81 -0.35 0.07 0.02 -0.17 -0.31 -0.51 0.39 -0.04 0.34 0.41 -0.41 0.45 -0.15 0.61 -0.31 0.28 0.24 0.57 0.27 -0.05 -0.19 -0.54 -0.31 -0.09 -0.09 0.07 -0.13 -0.2 0.16
-0.36 -0.12 0.14 0.52 -0.09 1.86 -1.99 0.7 0.39 1.85 0.68 -0.59 -0.83 -2.49 -0.01 0.3 -0.43 1.13 0.86 -0.32 0.5 -1.69 -1.53 -2.66 -0.63 -3.32 -2.68 -0.45 -0.78 -1.07 -0.81 -1.05 -0.63
-1.9 -3.58 -1.72 -0.6 0.49 -0.55 1.06 -3.1 -2.72 -2.73 -0.82 2.22 -0.37 2.75 1.48 1.48 -0.46 0.4 0.71 1.04 0.02 -1.29 -0.32 -2.11 -0.85 -6.89 -4.82 - - - - - -
-0.14 -0.42 0.29 0.21 0.26 0.34 0.44 0.57 0.29 0.43 -0.32 0.27 0.72 -0.11 -0.83 0.25 -0.69 -0.23 -0.29 -0.24 -0.3 0.49 0.11 -0.0 0.58 -0.8 -0.81 -0.55 -0.22 -0.27 -0.46 -0.53 -0.15
-0.44 -0.37 -0.75 -0.17 -0.34 0.82 2.13 -1.61 -2.52 0.48 -0.07 -1.99 0.25 -2.01 -1.29 -0.75 1.02 -0.12 -0.46 -0.64 -0.49 -0.17 -1.83 -7.66 -1.16 -2.94 -1.7 -0.66 1.18 1.6 0.1 -0.81 1.52
-0.44 0.27 0.12 -0.0 0.22 0.62 0.22 0.59 0.28 0.14 0.26 0.42 0.06 -0.13 -0.42 -0.42 0.05 0.52 -0.33 -0.53 -0.24 0.21 -0.16 0.47 -0.17 -0.61 -0.26 -0.54 -0.2 -0.24 -0.54 -0.58 -0.12
-0.05 -0.25 0.24 0.16 0.16 0.11 -0.15 0.44 0.26 0.65 -0.13 -0.02 0.31 -0.12 -0.06 -0.08 -0.69 -0.02 0.06 -0.14 0.03 0.26 -0.07 -0.08 0.15 -0.35 -0.27 -0.27 -0.28 -0.12 -0.19 -0.23 0.0
-0.84 -1.09 -1.79 -0.16 0.11 -1.28 1.37 - -2.85 -0.64 - 1.64 -0.05 2.77 - - 0.2 - - - - 0.71 3.23 - 1.4 -5.83 -5.88 - -4.28 -4.57 - -4.26 -4.41
-0.37 -0.52 -0.56 -0.63 -0.14 0.02 -0.28 0.38 0.43 -0.06 -0.19 0.0 0.46 -0.14 0.54 -0.0 -0.86 0.35 0.02 0.09 0.29 0.15 -0.01 0.35 -0.45 -0.38 -0.34 0.03 0.25 0.3 0.07 -0.36 0.21
-0.15 -0.2 0.23 0.23 -0.19 0.43 0.98 0.02 -0.2 1.53 0.21 0.2 -0.35 0.09 -0.85 0.55 -1.47 0.34 0.46 0.32 0.15 -0.05 0.24 -0.58 0.1 -1.38 -1.43 -1.17 -0.49 -0.27 -1.09 -1.1 -0.28
-0.85 -4.12 0.31 -0.21 0.47 -2.37 -5.43 -0.12 -1.02 -2.47 0.83 -7.12 -4.02 1.79 -0.34 2.56 -2.44 1.98 1.52 2.32 1.43 -3.62 -7.24 -4.67 -5.08 -3.43 -3.22 - -5.06 -6.6 - -8.27 -4.68
-0.45 -1.26 0.28 0.19 -0.53 -3.72 1.36 -1.11 -3.31 -1.87 -0.46 1.07 -0.45 2.22 -0.92 0.63 -0.56 0.09 0.73 0.6 0.49 0.72 0.15 1.02 -0.03 -0.66 -0.86 -1.39 -1.5 -1.71 -2.4 -2.6 -1.49
0.18 -0.9 -0.07 0.12 1.32 0.84 1.07 0.14 0.28 0.22 -1.77 2.24 -0.23 2.9 -3.52 -2.25 -3.21 -1.19 -2.41 -4.26 -3.69 0.42 -7.45 -5.0 0.87 -3.73 -3.91 -2.54 -1.08 -1.57 -1.99 -2.38 -2.6
0.22 -1.48 0.54 0.5 0.3 -0.51 0.53 -0.24 -1.15 -0.34 0.32 0.14 -1.17 0.22 0.64 0.74 -1.53 1.19 1.03 0.74 0.95 0.43 -1.69 -1.69 -0.29 -0.39 -0.46 -1.27 -0.5 -0.43 -1.02 -0.91 -0.94
-0.1 0.06 -0.46 -0.08 0.18 0.94 0.45 0.26 0.39 0.66 0.2 0.36 -0.12 0.47 -0.59 0.14 -0.55 0.52 0.05 -0.16 0.02 0.5 0.12 -0.15 -0.47 -1.62 -1.35 -0.67 -0.43 -0.23 -0.52 -0.6 -0.24
-0.16 -0.75 0.25 0.35 0.42 1.44 0.2 0.63 0.76 0.6 0.23 -1.8 -0.88 0.07 0.07 0.75 -1.06 0.38 0.04 0.74 0.16 -0.16 -0.77 -3.24 -0.78 -0.9 -0.84 0.03 -0.37 -0.79 -0.19 -0.65 -0.88
-0.47 -0.41 -0.43 -0.46 0.02 0.68 0.06 0.45 0.22 0.65 0.18 0.57 0.19 0.91 -0.66 0.04 0.09 0.75 -0.16 0.02 -0.2 0.41 -0.11 -0.21 -0.38 -1.14 -0.66 -0.56 -0.14 -0.17 -0.34 -0.5 -0.92
-0.56 -0.27 -0.39 -0.23 -0.55 0.26 0.88 -0.35 0.36 0.07 0.06 0.66 0.26 -0.14 -0.14 0.31 -0.63 0.35 0.05 -0.35 -0.66 0.21 0.6 -0.51 0.41 -0.64 -0.49 -0.25 -0.4 0.31 -0.23 -0.1 0.16
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-0.39 -0.55 0.12 -0.44 -0.1 -0.58 0.26 0.6 0.3 0.56 0.07 0.18 0.02 0.37 0.72 0.87 -0.49 0.25 -0.08 0.72 -0.06 0.45 -1.52 -0.16 0.04 -1.33 -1.29 -0.58 -0.59 -0.26 -0.13 -0.09 -0.3
-0.1 -0.37 0.03 0.12 0.19 -0.11 0.37 0.27 0.23 0.56 -0.11 0.39 0.02 -0.07 0.03 -0.04 -1.05 0.04 -0.11 -0.09 -0.18 0.1 0.19 -0.27 0.14 -0.28 -0.32 -0.16 0.15 -0.0 -0.25 -0.42 0.21
-0.28 -0.2 -0.31 -0.54 -0.16 0.05 0.23 -0.08 -0.02 -0.08 0.14 0.33 0.09 0.54 -0.31 -0.1 -0.03 0.55 0.19 0.15 -0.1 -0.15 -0.02 0.22 -0.01 -0.74 -0.77 -0.41 0.37 0.31 -0.02 -0.21 0.31
-1.58 -2.48 -1.79 -1.54 -1.74 -5.66 1.33 -3.89 -5.22 -2.9 0.27 1.38 -0.77 2.22 -1.34 1.31 -0.48 0.88 0.17 0.64 0.63 0.86 0.27 1.1 0.44 -0.1 -0.24 -1.42 -1.36 -2.39 -1.84 -2.78 -1.36
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0.08 -1.78 0.8 0.23 1.17 0.14 0.55 0.87 -0.37 -1.23 0.49 -0.32 -0.36 0.6 -1.79 1.54 -0.93 1.52 1.05 1.29 0.91 -0.41 -2.75 -1.03 0.57 -2.31 -1.9 -6.29 -7.12 -7.1 -8.34 -9.86 -4.18
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.