Heatmap: Cluster_346 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.1 4.99 - - - 0.23 1.5 0.88 0.82 - -2.95 1.76 - - - - - -2.46 - - - - - -0.61 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.39 0.91 - -
-1.8 4.88 0.02 -1.94 - - - - -0.39 -3.04 -0.35 - - -0.96 - - -2.98 - 3.27 -3.46 -3.16 - -2.98 -3.21 1.71 - - - - - - - - - - - - - - - -2.93 -2.51 - -3.49 0.17 -0.3 - - -
-1.08 5.28 - - - - - - 3.19 - -2.61 - - - - - - - - - - - -1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.41 5.39 - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.93 5.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.32 5.46 - - - - - - 1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.42 - - - - - -
-0.24 5.33 - - - - - - -0.5 - -1.82 - -0.03 - - - -2.1 -1.16 - -0.08 - -2.45 - 0.4 - - - - - 1.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.13 5.59 - - - - - - - - -1.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.52 5.05 - - - 1.78 - -0.82 2.33 - -1.02 - - - - - - - - - - -1.58 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - - - -
0.09 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.16 0.57 - - - - - - - -4.21 - 2.52 0.21 - - - -1.24 - - - - - 0.37 - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.83 - - - - - -
0.78 5.43 - - - - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.11 5.09 - - - - -0.63 -0.04 -0.48 - -6.86 0.02 - - - - - - - -0.96 -1.87 - - -0.05 - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - - - - 2.17 0.96 - - -
0.08 4.68 1.62 0.19 0.46 1.09 1.81 2.16 -1.07 - -2.89 -3.44 -0.87 0.33 - - -2.63 -1.47 - -1.29 -5.2 - - -1.33 - - -0.37 - - - - -0.52 - - - - - - - - -3.86 -3.95 -2.5 -0.56 -1.5 - - - -
-0.56 5.44 - 2.27 - - - - - - -2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.61 4.92 - - - - -2.07 - 0.92 - -2.06 - - - 2.27 - -1.66 -2.96 - -3.03 - - - - - - - - - 1.4 - - - - - - - - - - - - - 1.2 0.51 0.51 - - 0.76
-0.71 4.9 0.33 - - - -1.09 -1.08 2.25 - -0.96 - - - - - - -2.57 - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.78 - - - - -
0.45 4.97 -1.12 1.46 1.67 - 0.56 -0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 1.92 - - -
-0.33 5.25 - - - - - - 1.02 - -2.24 - - - - - - -2.97 - - - 0.95 -2.67 - - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.73 - -1.77 -1.56 -0.57 - 2.55 - - - - - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.08 5.48 - - - - - - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.3 - - - - - - 1.62 - - - 0.91 - - - - - - -5.21 - - - 0.77 - - - - - - - 1.24 - - - - - - - -0.82 - - - -3.48 - - - - -
-2.31 5.3 - - - - - - - - -3.02 - - 3.13 - - - - - - -1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.31 5.02 - - - 2.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - - - - 2.5 - - - - -
- 5.11 -0.41 - - 2.63 - - 1.5 - -3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.91 4.9 - -1.21 - -0.16 -1.05 1.87 - - -1.13 - 0.17 - - - -2.28 -3.37 - -4.2 - - -2.58 - - - - - - 1.41 2.25 - - - - - - - - - - - - -1.69 - - 1.05 0.68 -
-0.33 5.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.3 5.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.46 - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.49 5.32 - 0.39 - 0.79 - -1.61 0.67 - -1.53 - - 1.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.31 - - - - -
0.63 5.19 - - - - - - 2.31 - 0.33 - 2.05 - - - - - - - - -0.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.58 4.72 - 0.24 - 2.5 -0.37 -2.17 -0.25 -0.72 -3.32 -0.03 - 0.15 - - -2.89 -2.93 - -3.09 -3.74 -2.88 - -0.46 - 1.44 - - - - - -0.39 - - - - 0.44 - - - -2.07 - - 0.38 - - - 1.04 -
1.15 5.35 - - - - - - 1.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.33 5.42 - - - - - - - - -0.34 - - - - - - - - 0.55 - - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.53 4.9 - - - - 3.0 0.65 - - - - - 1.9 - - - 1.19 - - - - -2.16 0.64 - - - - - - - 0.37 - - - - - - - -1.46 - - - - - - - - -
- 5.55 - - - - -0.8 - - - -2.66 - - - - - - - - 0.22 -1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.69 5.34 - - - - - - - - - 2.51 - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.66 5.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.84 5.06 -0.09 - - - -0.95 -0.94 - -1.18 -6.18 - - - - 3.45 -1.08 - - -2.68 - - - -0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.02 - - - - -
-0.61 5.33 - - - - - -1.76 - - -0.19 - - - - - - - - -2.92 - - - -2.54 - - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - - - -2.45 - 2.01 - - -
0.61 5.15 - - - 1.84 - - - - -2.89 - - 2.27 - - - - - - - - - -0.57 - - - - - - - 0.74 - - - - - - - - 0.23 - - - - - - - -
0.53 5.27 - - - - - - 1.44 - -1.45 - - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.6 - - - - -
-0.89 5.2 - - - - - - 1.03 - - - - 3.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.15 5.42 - - - - - 0.58 - - -1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - 1.29 - - - - - - -
-3.02 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.32 - -1.42 - 0.83 - - - - - - - 0.77 - - - - - - - - - -0.84 - - - - - - -
-3.28 5.37 - - - - - - - - -4.0 1.03 - - - - - - - -3.51 - - - -2.6 - - - - - - - 1.03 - - - - 0.74 - - - -2.85 -1.88 - -0.04 - - - - -
0.43 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.42 - 2.23 - - - - - - - - - - - - - -2.36 - 0.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.54 5.19 - - - - - - - - -1.89 - - 0.82 - - -1.27 -1.8 - -3.8 - - - - - 1.98 2.01 - - - - - - - - - - - - - -0.68 - - -1.71 - - - - -
- 5.51 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.2 5.3 - - - - - - 0.68 - -0.47 - - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.24
-0.4 5.32 - - - - - - - - -3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.86 2.2 - - -
-2.42 5.46 - - - - - - - - -3.87 - - 1.55 - - -0.07 - - - -2.11 - - - - - - - - - - -0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.01 5.27 - 1.11 - - - - - - - - - 2.82 - - -0.47 - - -1.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.22 5.27 - 1.35 -0.02 - 2.18 0.38 - - -3.95 - - - - - - - - - - - -0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.67 5.42 - - - - - - - - - - - 2.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.66 5.49 - - - - - - - - -1.23 - - 1.27 - - - - - - - - - -0.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.79 5.1 - - - - - -1.62 0.06 - -1.76 -0.55 2.31 - - - -0.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 - - - - - -1.19 -1.66 - 0.52 - - -
0.41 4.84 -1.02 -2.58 -5.7 -1.42 2.22 2.24 -0.35 -4.17 -1.74 -2.01 -0.76 -1.98 -1.46 -0.82 -0.08 -1.15 -1.21 -1.39 -5.18 -5.72 -4.86 -5.86 -4.78 -1.69 -2.53 -5.83 -4.49 - -6.34 -4.48 -3.33 - -5.99 -3.76 -5.95 -4.41 -4.66 -4.97 -4.32 -4.36 -3.98 -1.06 -1.14 -1.51 -2.12 -1.94 -2.25
1.03 5.44 - - - - - - 1.66 - -2.06 - - - - - - - - -3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.38 - - - 2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.36 5.04 - - - - - -0.38 - - -4.17 0.38 - 2.18 - - 2.26 -3.97 - -5.11 - - - -1.39 - - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - -2.08 - - - - -
-1.72 4.83 -2.57 -2.03 - 2.81 - - - - -1.6 0.34 - 1.86 - - 0.2 -1.23 - -2.07 - - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.04 - - - -
-0.88 5.56 - - - - - -0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.0 - - - - -
1.04 5.03 - 0.69 -1.65 - 0.06 -2.26 1.5 -0.92 -1.31 - - - - - - - - - - - -1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.3 0.65 1.32 0.84 - -
0.95 4.75 -0.15 -1.93 -1.86 1.25 -1.81 - - - -0.15 - 1.74 2.66 - - -2.4 -2.47 - -0.89 - - - -2.41 - - - - - - - -1.5 - - - - - - - - -2.06 - - -2.67 - -0.31 - 0.93 0.02
-2.26 5.59 - - - - - -0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.34 5.5 - - - - - - - - - - - - - - -1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.65 - - - - - - -
0.18 5.39 - - - 1.85 - -0.75 - - - - - - - - - - - -0.53 - - - -0.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.45 - - - - -
-1.49 5.5 - - - - - - - - -3.06 - - - - - - - - - - - 0.02 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.48 - - - - - - - - -2.57 - - 1.68 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.71 5.48 - - - - - - 2.08 - -4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.16 4.94 - - - 1.11 - - -0.0 - - - - - - - - -3.81 - - -1.7 - - - - 2.83 - 0.93 - - - 1.01 - - - - - - 1.45 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.