Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00106820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.73)
0.68 1.0 0.02 0.33 0.26 0.03 0.17 0.04 0.37 0.29 0.68 0.66 0.55 0.43 0.45 0.45 0.54 0.48 0.43 0.29 0.63 0.48
AMTR_s00001p00138970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.116)
0.47 1.0 0.0 0.06 0.24 0.18 0.17 0.0 0.37 0.26 0.83 0.44 0.31 0.17 0.1 0.27 0.93 0.39 0.38 0.21 0.33 0.28
AMTR_s00001p00212220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.220)
0.01 1.0 0.0 0.02 0.15 0.0 0.2 0.0 0.2 0.2 0.52 0.55 0.29 0.27 0.19 0.07 0.98 0.32 0.19 0.14 0.21 0.14
AMTR_s00001p00257310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.349)
0.38 1.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.41 0.29 0.19 0.09 0.21 0.43 0.35 0.24 0.26 0.36 0.34
AMTR_s00001p00260900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.377)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.81 0.36 0.1 0.13 0.13 0.24 0.42 0.31 0.16 0.26 0.28 0.25
AMTR_s00004p00261980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.259)
0.14 1.0 0.18 0.24 0.14 0.01 0.09 0.06 0.12 0.1 0.46 0.39 0.28 0.15 0.18 0.32 0.62 0.27 0.28 0.32 0.3 0.23
AMTR_s00008p00095900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.34)
1.0 0.78 0.32 0.14 0.1 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.57 0.38 0.2 0.16 0.07 0.28 0.65 0.27 0.24 0.21 0.68 0.16
AMTR_s00008p00186080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.107)
1.0 0.1 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.95 0.66 0.25 0.0 0.01 0.0 0.36 0.05 0.02 0.0 0.0 0.03
AMTR_s00010p00011430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.1)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.09 0.0 0.12 0.11 0.75 0.3 0.07 0.08 0.08 0.15 0.95 0.2 0.18 0.1 0.12 0.27
AMTR_s00012p00053550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.14)
0.51 1.0 0.0 0.02 0.23 0.01 0.11 0.06 0.07 0.06 0.61 0.42 0.33 0.28 0.17 0.49 0.26 0.2 0.24 0.15 0.24 0.24
AMTR_s00012p00164920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.100)
0.98 0.94 0.44 0.04 0.37 0.05 0.04 0.03 0.08 0.07 1.0 0.79 0.56 0.45 0.51 0.58 0.68 0.66 0.49 0.48 0.49 0.51
AMTR_s00016p00079730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.43)
0.9 0.8 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.3 0.0 0.0 0.0 0.27 0.06 0.27 0.0 0.0 0.35
AMTR_s00016p00169310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.129)
0.58 1.0 0.04 0.01 0.3 0.01 0.09 0.0 0.27 0.27 0.78 0.79 0.36 0.22 0.31 0.22 0.64 0.37 0.39 0.2 0.14 0.38
AMTR_s00016p00244350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.271)
0.53 0.78 0.0 0.0 0.11 0.0 0.13 0.0 0.38 0.23 0.6 1.0 0.14 0.12 0.06 0.53 0.53 0.47 0.59 0.1 0.42 0.23
AMTR_s00018p00055280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.17)
0.52 0.91 0.86 0.08 0.08 0.01 0.71 0.19 0.52 0.46 0.85 1.0 0.21 0.34 0.11 0.04 1.0 0.28 0.09 0.08 0.06 0.55
AMTR_s00018p00217640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.140)
0.7 1.0 0.26 0.22 0.34 0.02 0.05 0.02 0.06 0.06 0.71 0.57 0.38 0.29 0.2 0.35 0.52 0.53 0.45 0.28 0.52 0.28
AMTR_s00019p00231640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.320)
0.0 0.88 0.0 0.07 0.31 0.01 0.32 0.08 0.37 0.4 0.94 1.0 0.43 0.4 0.24 0.44 0.48 0.64 0.86 0.23 0.33 0.2
AMTR_s00021p00246310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.267)
0.31 0.46 0.14 0.1 0.45 0.0 0.54 0.16 0.3 0.36 1.0 0.96 0.57 0.41 0.32 0.29 0.7 0.82 0.58 0.18 0.3 0.37
AMTR_s00023p00185370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.123)
0.92 0.74 0.0 0.04 0.13 0.0 0.27 0.05 0.3 0.35 1.0 0.64 0.57 0.21 0.15 0.32 1.0 0.44 0.45 0.26 0.36 0.67
AMTR_s00024p00172770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.129)
0.13 1.0 0.27 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.57 0.45 0.12 0.1 0.11 0.15 0.37 0.28 0.32 0.11 0.33 0.21
AMTR_s00024p00172850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.130)
0.3 1.0 0.28 0.01 0.11 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.74 0.68 0.28 0.16 0.17 0.16 0.49 0.36 0.44 0.16 0.27 0.3
AMTR_s00024p00234030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.256)
0.34 1.0 0.45 0.2 0.15 0.12 0.09 0.01 0.07 0.08 0.4 0.19 0.23 0.16 0.16 0.16 0.51 0.05 0.08 0.1 0.03 0.24
AMTR_s00025p00081070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.62)
0.0 0.91 0.36 0.0 0.32 0.01 0.35 0.17 0.34 0.29 0.68 0.82 0.54 0.31 0.2 0.31 1.0 0.67 0.57 0.24 0.29 0.26
AMTR_s00026p00027920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.5)
0.02 0.58 0.15 0.03 0.35 0.01 0.41 0.05 0.27 0.25 0.73 0.75 0.53 0.39 0.33 0.63 1.0 0.47 0.46 0.41 0.3 0.28
AMTR_s00029p00104950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.105)
0.96 1.0 0.58 0.33 0.47 0.11 0.11 0.06 0.13 0.12 0.68 0.41 0.39 0.16 0.38 0.28 0.66 0.31 0.26 0.19 0.2 0.37
AMTR_s00029p00164640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.212)
1.0 0.94 0.33 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.23 0.16 0.06 0.08 0.13 0.5 0.18 0.15 0.11 0.17 0.16
AMTR_s00031p00119810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.52)
0.67 1.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.05 0.0 0.1 0.07 0.57 0.49 0.15 0.13 0.07 0.44 0.51 0.39 0.26 0.13 0.38 0.17
AMTR_s00031p00154540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.69)
0.57 1.0 0.0 0.05 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.6 0.33 0.35 0.25 0.5 0.48 0.55 0.36 0.29 0.43 0.32
AMTR_s00037p00235150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.155)
0.46 0.84 0.2 0.13 0.28 0.2 0.43 0.17 0.31 0.28 0.86 0.75 0.32 0.22 0.25 0.19 1.0 0.28 0.2 0.22 0.2 0.53
AMTR_s00039p00011800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.1)
0.77 1.0 0.68 0.08 0.09 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.53 0.46 0.12 0.05 0.05 0.23 0.68 0.31 0.21 0.12 0.26 0.18
AMTR_s00039p00206760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.174)
0.5 1.0 0.35 0.04 0.27 0.03 0.06 0.02 0.12 0.11 0.58 0.53 0.32 0.3 0.33 0.38 0.58 0.52 0.34 0.28 0.46 0.23
0.29 1.0 0.0 0.04 0.08 0.01 0.03 0.0 0.06 0.04 0.56 0.48 0.21 0.26 0.21 0.33 0.46 0.34 0.34 0.2 0.41 0.25
AMTR_s00040p00227600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.270)
1.0 0.48 0.26 0.01 0.11 0.0 0.09 0.0 0.24 0.15 0.55 0.65 0.2 0.08 0.04 0.07 0.56 0.17 0.11 0.1 0.15 0.25
AMTR_s00045p00178420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.216)
0.65 1.0 0.4 0.07 0.15 0.0 0.12 0.0 0.14 0.15 0.7 0.61 0.49 0.43 0.23 0.3 0.64 0.41 0.44 0.4 0.34 0.39
AMTR_s00045p00191080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.240)
0.0 0.88 0.0 0.08 0.34 0.01 0.17 0.0 0.39 0.29 0.77 0.97 0.33 0.17 0.24 0.5 1.0 0.46 0.33 0.08 0.12 0.25
AMTR_s00047p00230470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.197)
0.9 1.0 0.71 0.15 0.18 0.01 0.16 0.1 0.3 0.26 0.75 0.7 0.38 0.3 0.12 0.16 0.82 0.48 0.37 0.28 0.13 0.35
AMTR_s00048p00053570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.18)
0.0 0.51 0.35 0.1 0.26 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.49 0.45 0.22 0.12 0.16 0.38 1.0 0.28 0.3 0.23 0.36 0.27
AMTR_s00048p00146310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.94)
0.44 1.0 0.43 0.12 0.31 0.03 0.22 0.1 0.32 0.3 0.59 0.51 0.64 0.46 0.34 0.5 0.67 0.5 0.34 0.31 0.42 0.46
AMTR_s00048p00181490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.135)
0.47 1.0 0.95 0.17 0.11 0.11 0.44 0.01 0.25 0.3 0.43 0.62 0.24 0.14 0.13 0.09 0.7 0.1 0.1 0.05 0.05 0.17
AMTR_s00056p00059990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.40)
0.0 1.0 0.4 0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.68 0.62 0.31 0.11 0.27 0.42 0.98 0.41 0.39 0.27 0.37 0.36
AMTR_s00057p00193960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.219)
0.32 1.0 0.24 0.22 0.22 0.01 0.34 0.13 0.45 0.38 0.75 0.7 0.68 0.46 0.31 0.41 0.96 0.53 0.44 0.43 0.51 0.45
AMTR_s00058p00211230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.223)
0.3 1.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.72 0.75 0.2 0.05 0.05 0.37 0.3 0.4 0.43 0.1 0.16 0.19
AMTR_s00058p00217340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.235)
0.31 0.53 0.32 0.11 0.28 0.31 0.17 0.17 0.49 0.38 0.99 1.0 0.58 0.48 0.55 0.46 0.97 0.56 0.51 0.33 0.4 0.63
AMTR_s00059p00143240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.127)
0.7 0.77 0.6 0.08 0.07 0.49 0.04 0.0 0.04 0.06 1.0 0.88 0.36 0.04 0.03 0.21 0.62 0.64 0.62 0.22 0.09 0.39
AMTR_s00059p00177230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.185)
0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.09 0.05 0.03 0.03 0.07 0.34 0.09 0.07 0.08 0.18 0.05
AMTR_s00061p00074900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.51)
0.29 1.0 0.45 0.09 0.37 0.02 0.27 0.01 0.36 0.32 0.66 0.71 0.39 0.33 0.35 0.48 0.84 0.34 0.33 0.34 0.25 0.4
AMTR_s00066p00195180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.253)
1.0 0.63 0.04 0.09 0.18 0.0 0.02 0.0 0.06 0.07 0.6 0.42 0.36 0.19 0.16 0.25 0.53 0.28 0.33 0.27 0.25 0.25
AMTR_s00066p00201540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.271)
0.87 0.84 0.69 0.0 0.13 0.0 0.28 0.0 0.32 0.25 0.62 0.91 0.32 0.1 0.07 0.07 1.0 0.16 0.04 0.05 0.08 0.19
AMTR_s00085p00155370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.95)
0.0 1.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.34 0.4 0.09 0.09 0.31 0.7 0.24 0.32 0.22 0.2 0.19
AMTR_s00092p00120100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.83)
0.48 0.81 0.08 0.1 0.07 0.0 0.22 0.02 0.56 0.49 0.94 0.89 0.3 0.19 0.21 0.1 1.0 0.38 0.26 0.36 0.19 0.24
AMTR_s00098p00137480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.36)
0.47 1.0 0.12 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.56 0.55 0.31 0.43 0.17 0.2 0.21 0.15 0.07 0.05 0.04 0.22
AMTR_s00099p00054090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.37)
0.21 0.61 0.16 0.09 0.23 0.03 0.05 0.0 0.06 0.07 0.69 0.98 0.49 0.28 0.28 0.31 1.0 0.43 0.44 0.26 0.55 0.38
AMTR_s00101p00121930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.96)
0.57 1.0 0.25 0.21 0.16 0.03 0.13 0.11 0.21 0.2 0.5 0.45 0.37 0.35 0.42 0.27 0.47 0.33 0.27 0.35 0.33 0.32
0.5 0.66 0.0 0.01 0.09 0.01 0.19 0.03 0.3 0.25 1.0 0.76 0.26 0.14 0.05 0.3 0.73 0.18 0.23 0.07 0.22 0.56
AMTR_s00119p00121460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.95)
0.79 1.0 0.57 0.31 0.25 0.03 0.12 0.22 0.15 0.11 0.86 0.54 0.37 0.33 0.21 0.3 0.82 0.6 0.46 0.39 0.12 0.31
AMTR_s00120p00109410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.50)
0.32 1.0 0.28 0.02 0.16 0.03 0.12 0.02 0.06 0.06 0.4 0.3 0.27 0.18 0.09 0.33 0.32 0.28 0.22 0.24 0.32 0.22
AMTR_s00126p00086110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.39)
0.79 0.75 0.22 0.0 0.17 0.0 0.18 0.21 0.16 0.18 0.54 1.0 0.22 0.13 0.06 0.38 0.48 0.43 0.2 0.1 0.27 0.27
AMTR_s00131p00065190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.38)
0.58 1.0 0.43 0.3 0.11 0.01 0.11 0.0 0.26 0.23 0.78 0.68 0.38 0.29 0.18 0.29 0.86 0.41 0.32 0.27 0.31 0.35
AMTR_s00144p00054940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.25)
0.68 1.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.04 0.0 0.22 0.1 0.36 0.47 0.22 0.17 0.12 0.43 0.37 0.34 0.32 0.13 0.25 0.19
AMTR_s00145p00084930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00145.31)
0.66 1.0 0.57 0.17 0.09 0.01 0.02 0.0 0.06 0.04 0.26 0.2 0.15 0.03 0.06 0.08 0.42 0.18 0.13 0.09 0.11 0.13
AMTR_s00156p00091480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.46)
0.34 1.0 0.27 0.25 0.16 0.0 0.07 0.01 0.07 0.06 0.53 0.4 0.23 0.19 0.2 0.2 0.35 0.31 0.37 0.43 0.39 0.29
AMTR_s00170p00032020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00170.11)
0.0 0.98 0.0 0.26 0.07 0.0 0.03 0.0 0.48 0.19 0.85 0.66 0.21 0.14 0.2 0.51 1.0 0.86 0.5 0.29 0.7 0.14
AMTR_s00226p00014390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00226.4)
0.04 0.99 0.0 0.07 0.38 0.0 0.35 0.0 0.53 0.38 1.0 0.75 0.3 0.32 0.37 0.39 0.44 0.55 0.8 0.17 0.31 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)