Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
-1.2 4.12 - - - 4.24 - - - - -0.14 - - - - - - - - -3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.58 - - 3.42 - -
1.89 4.58 0.85 - - 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.39 4.14 2.94 - - 4.11 - - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.12 - - 2.49 3.08 - - - -0.05 -1.73 - - - - - - 0.56 - -0.09 -0.05 - - - - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - -0.89 2.76 - - - -
-0.63 3.39 0.71 2.11 - 4.51 - - - - -2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - -
1.55 4.13 - - 2.94 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.9 2.85 -0.34 -0.36 - 3.67 - - - - -1.26 - - - - - 0.64 1.11 - -0.07 - - - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - - - - -
1.47 3.72 - - 1.31 4.36 - - - - -1.99 - - - - - - - - - -1.39 - - - - - - - - - - 0.32 - - - - - 2.75 - -1.52 - -0.03 - - - - - - -
-0.3 2.21 1.59 -0.88 -3.29 1.58 2.51 1.82 -1.43 -1.81 -1.62 -2.14 1.69 2.59 - - -1.15 1.67 - -1.46 -3.35 -2.73 -2.19 -2.49 -0.37 - -1.72 - -1.57 - -1.12 -2.47 -0.03 - - - -2.44 -2.04 - -4.23 -3.0 -5.34 -3.17 -0.62 0.22 0.93 2.14 -1.56 -1.37
- 5.24 3.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.12 4.11 0.4 - - 4.15 - - 2.8 - -1.86 1.3 - - - - - - - - - - - -0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.84 4.09 - 2.02 - 3.14 - - - - -1.25 - - 4.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.98 3.92 -1.99 -0.68 -0.3 3.07 - -3.04 - -3.41 -1.93 - 1.89 3.04 - - -1.46 -0.28 - 1.46 - - - -2.53 - 1.55 - - - - - -0.28 - - - - - - - - - - -2.62 0.58 -0.2 -0.17 - - -
1.68 4.04 - - - 3.96 - - 1.62 - -3.33 2.2 - - - - - - - - - -0.02 - -1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.25
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.76 4.27 - - - 3.37 - - - - -0.35 - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.32
-0.82 4.97 - 1.88 - 3.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.03 4.8 3.56 - - - - - - - 0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.09 4.58 - - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.28 - 0.99 - 2.0 - - - - -2.79 - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.7 - - 2.53
1.54 3.7 - - - 3.25 - - -0.73 - - - - 3.96 - - - -4.79 - - -2.74 -1.51 -2.55 -1.57 - - - - - - - -0.91 1.05 - - - - - 0.82 -1.52 0.11 -1.93 -1.56 - - - - - -
- 5.3 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.28 4.73 -0.42 - - 3.5 - - - - - 1.23 - 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.39 4.56 - - - 4.0 - - - - - 1.71 - - - - - - - - -0.43 - - 1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.43 - - - - -
-1.28 4.14 - - - 4.4 - - - - -0.78 - - 3.09 - - - - - -0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.61 2.95 - - - - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.52 4.01 -2.5 - - 3.56 - -1.46 - -1.7 -0.24 0.31 - 3.86 - - -0.35 -2.2 - - - - - - - - - - - - - -1.16 - - - - - - - - - - - - 0.51 - - - -
- 4.52 - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.46 4.14 0.06 - - 4.71 - - - - -1.9 - 0.6 - - - - -1.17 - -2.31 - - - -0.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.41 4.13 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.64 2.55 3.83 - - 3.6 - - - -0.22 0.73 - - - - - 0.36 -2.15 - -2.14 - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.05 - - - - -
-3.68 3.84 3.0 - - -1.75 - - - - -0.67 - 0.24 1.74 - - 2.95 -0.69 - -2.59 -2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.97 - - -2.28 - -0.08 2.27 1.73 1.68
-1.76 3.94 - - - - -0.1 - - - -1.45 - - - - - - 1.6 - 1.12 -0.44 - - 1.37 - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - - - - 1.13 3.67 2.03 - - -
1.22 3.84 - - - 4.78 - - - - 2.18 - - - - - - - - -1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.89 3.8 - - - 3.73 - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.65 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.96 - - - - - 0.95 - - - 3.3 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - 1.41 - - - - - -
- 4.43 - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - -0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.07 2.52 1.92 - - - - - - 0.97 -0.93 - - - - - - -3.37 - - -0.59 - 1.37 - - - - - - 2.67 - - - - 2.5 - 3.34 2.19 - -1.46 -1.02 -0.2 0.03 - - - - - -
- 4.57 - - - - - - - - - - - 4.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.17 4.46 0.59 - - 4.34 - - 1.31 - -0.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.35 - - - - - -
-0.13 3.83 -2.55 0.48 0.85 -0.35 -2.76 -2.88 -1.78 - -3.8 - - 4.28 - - -3.08 - - -1.66 -2.29 -1.17 -0.78 - - - 0.13 - - - 0.13 1.57 - - - - - - - - -0.53 - - -2.23 - - - 0.96 -
- 4.69 - - - 3.84 - - 0.84 - -2.69 - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.77 3.42 - 1.27 - 4.36 - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - -1.11 - - -0.42 - - - - -
1.88 4.61 3.87 - - - - - 2.04 - - - - - - - - -0.28 - 0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.32 4.54 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.65 3.98 3.42 - - 0.66 - - 0.96 - -0.31 1.99 - 1.09 - - -0.55 - - -4.72 -1.18 -1.46 -2.13 - - - - - - - - - - - 1.35 - - - 1.8 - - - - - 0.97 - - 0.79 -
0.49 4.01 2.85 1.42 2.25 - - - - - 0.67 - 2.64 1.59 - - - -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.34 -
0.07 4.46 - 1.78 - 3.62 -0.27 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.21 4.27 -1.48 - - - - - - - - - -22.41 4.71 - - - - - - 1.05 -11.93 -1.17 -2.33 - - - - - - - - - - - - - - - -26.62 - - - - - - - - -
-1.18 4.3 1.11 -1.06 1.05 4.03 - -1.25 - - -2.8 - - -0.04 - - - -2.59 - -0.72 - - 0.2 - - - - - - - - - 1.01 - - - - - - -1.22 -2.23 - - -0.65 - 0.24 - - -
4.22 4.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.71 3.31 -2.74 - 0.24 2.84 -3.8 -3.8 1.25 - -2.76 -2.73 -0.92 4.25 0.53 - -1.96 0.69 - -3.2 -1.1 - - -3.09 - - - -0.58 -0.64 - - -1.5 - - - - -0.47 - - -3.67 - -3.21 - - - - - - -
1.02 3.66 - 0.43 - 4.38 - - - - -1.42 - 2.45 - - - 0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.3 -
1.78 3.41 1.98 - - - - - 1.58 - 2.08 3.04 - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - -0.05 - - - - - - - -
- 5.21 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.31 4.72 - - 1.96 3.26 - - - - - - - - - - - - - -4.34 - - -0.86 - - 2.51 - - - - - 0.68 - - - - - - - - -1.32 - - - - - - - -
-0.34 4.32 - - - 4.16 - - - - -4.13 0.08 - 3.07 - - - -0.33 - -2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.96 4.64 0.87 0.88 - 2.47 - 0.59 1.04 - -3.83 0.64 - -0.31 - - - -3.05 - - -1.9 - - -2.06 - 0.63 - - - - - - - - - - - - - - - -1.43 - -2.06 - - - 2.06 -
-0.49 3.43 - - - 2.4 - -0.08 - - -3.99 - - 4.79 - - -0.71 -1.21 - -0.52 - - -0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.26 - - - - -
1.96 4.27 - - - 3.88 - - 3.05 - -2.96 0.26 - - - - - - - - - - -2.28 -0.82 - - - - - - - -0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.53 4.03 - - - 4.05 - - - - -2.0 - - - - - - - - - - - - 2.17 - - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 3.25 - 0.9 - 3.59 -3.2 -1.61 - - -4.4 - 0.59 -0.99 - - -0.83 0.17 - -1.4 - - -3.26 - 4.21 - - 0.25 - - - -1.9 - - - - - - - -3.87 - - - -2.05 - - - - -
- 4.46 - - - - - - - - -2.49 - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.6 - - - - -
- 3.48 4.1 - - - - - - - -0.46 - 2.82 3.39 - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.2 4.81 - 2.62 - 3.43 - - - 1.31 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.97 4.32 -0.49 - 1.15 4.23 - - - - -1.13 1.31 - - - - - - - - - - - -1.35 - 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.92 4.16 - - - - 2.03 2.6 - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-5.17 4.21 - -1.42 - 3.99 - - - - -2.28 -1.98 - -14.55 0.9 0.76 - 0.65 - -0.27 - -1.38 - -1.37 - 1.07 - - - - - - - - - - - - - -1.04 -0.78 1.1 -0.38 -1.0 -1.02 - - - -
0.82 4.41 - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.37 - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.27 4.66 - - - 4.08 - - 2.32 -0.54 - - - - - - - - - - - - -1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.64 3.62 - - - 4.42 - 0.55 - 1.3 2.14 - - - - - - -1.74 - - - - - 0.54 - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.