Heatmap: Cluster_168 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.19 0.29 0.13 0.2 0.15 0.24 0.26 0.26 0.27 1.0 0.27 0.3 0.18 0.23 0.33 0.29 0.11 0.31 0.3 0.27 0.29 0.22 0.25 0.15 0.21 0.24 0.22 0.1 0.14 0.14 0.12 0.1 0.15
0.01 0.02 0.0 0.07 0.02 0.07 0.0 0.12 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.13 0.08 0.17 0.06 0.17 0.11 0.32 0.13 0.24 1.0 0.25 0.26 0.04 0.06 0.0 0.25 0.01 0.18 0.64 0.03 0.33 0.09 0.11 0.12 0.15 0.03 0.05 0.27 0.17 0.21 0.08 0.06 0.29
0.2 1.0 0.08 0.14 0.15 0.25 0.35 0.36 0.53 0.66 0.74 0.55 0.13 0.0 0.0 0.17 0.25 0.68 0.45 0.34 0.0 0.18 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.69 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.06 0.06 1.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.12 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.17 0.02 0.09 0.08 0.07 0.29 0.1 0.24 1.0 0.01 0.18 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.04 0.05 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01
0.02 0.01 0.05 0.09 0.07 0.17 0.0 0.22 0.27 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.05 0.71 0.0 0.38 0.02 0.07 0.0 0.04 0.01 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.07 0.09 0.12 0.13 0.23 0.02 0.23 0.19 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.09 0.1 0.34 0.19 0.33 0.02 0.14 0.11 1.0 0.13 0.05 0.0 0.08 0.03 0.03 0.02 0.06 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01
0.08 0.11 0.02 0.06 0.05 0.02 0.02 0.18 0.3 1.0 0.07 0.05 0.1 0.0 0.46 0.13 0.11 0.04 0.09 0.07 0.1 0.02 0.03 0.0 0.2 0.05 0.09 0.07 0.12 0.05 0.07 0.04 0.19
0.06 0.02 0.06 0.07 0.17 0.08 0.14 0.62 0.36 1.0 0.04 0.1 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.04 0.19 0.29 0.08 0.06 0.11
0.36 0.26 0.24 0.2 0.3 0.05 0.22 0.18 0.06 1.0 0.05 0.21 0.06 0.06 0.18 0.0 0.04 0.0 0.02 0.11 0.11 0.19 0.05 0.15 0.08 0.04 0.04 0.19 0.05 0.03 0.05 0.04 0.17
0.07 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.67 0.0 0.01 0.02 0.08 0.0 0.03 0.03 0.0 0.04
0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.12 0.25 0.16 0.23 0.16 0.26 0.32 0.28 1.0 0.24 0.33 0.1 0.23 0.16 0.16 0.08 0.11 0.14 0.15 0.21 0.23 0.15 0.1 0.34 0.19 0.18 0.1 0.17 0.09 0.13 0.12 0.15
0.03 0.03 0.02 0.07 0.08 0.16 0.01 0.24 0.19 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.06 0.13 0.04 0.03 0.04 0.06
0.3 0.51 0.26 0.36 0.45 0.49 0.89 0.54 0.41 1.0 0.18 0.69 0.26 0.25 0.87 0.17 0.12 0.17 0.2 0.28 0.22 0.25 0.31 0.45 0.3 0.37 0.38 0.04 0.05 0.06 0.04 0.04 0.07
0.7 0.62 0.47 0.37 0.31 0.38 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.25 0.04 0.0 0.15 0.37 0.18 0.26 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.22 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.07 0.15 0.08 0.11 0.0 0.18 0.09 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.06 0.04 0.0 0.12 0.02 0.07 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.11 0.15 0.08 0.11 0.06 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.16 0.02 1.0 0.08 0.08 0.04 0.75 0.35 0.44 0.02 0.26 0.22 0.59 0.32 0.14 0.01 0.08 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.22 0.11 0.15 0.1 0.13 0.03 0.25 0.16 1.0 0.04 0.07 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.03 0.0 0.05 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02
0.02 0.06 0.03 0.08 0.09 0.3 0.04 0.28 0.25 1.0 0.07 0.07 0.0 0.02 0.08 0.06 0.01 0.04 0.07 0.05 0.09 0.03 0.03 0.0 0.02 0.07 0.09 0.04 0.09 0.07 0.04 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 1.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.07 0.03 0.01 0.04 0.04 0.06 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.05 0.55 0.01 0.08 0.1 0.0 0.14 0.24 0.16 1.0 0.0 0.05 0.01 0.09 0.02 0.02 0.01 0.33 0.14 0.1 0.08 0.03 0.0 0.09 0.02 0.12 0.09 0.3 0.32 0.3 0.17 0.17 0.38
0.0 0.0 0.03 0.05 0.03 0.05 0.01 0.42 0.15 1.0 0.11 0.03 0.0 0.1 0.14 0.22 0.0 0.2 0.19 0.31 0.18 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.1 0.2 0.1 0.06 0.03 0.14 0.1 1.0 0.0 0.03 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.02 1.0 0.0 0.5 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 1.0 0.0 0.01 0.0 0.36 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.2 0.29 1.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01
0.17 0.53 0.08 0.09 0.03 0.0 0.36 0.2 0.21 1.0 0.01 0.26 0.0 0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.66 0.06 0.1 0.15 0.28 0.26 0.35 0.21 1.0 0.04 0.34 0.05 0.17 0.03 0.08 0.08 0.04 0.13 0.02 0.02 0.09 0.41 0.01 0.36 0.13 0.1 0.0 0.08 0.1 0.01 0.01 0.35
0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.0 0.41 0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.12 0.04 0.87 0.11 0.03 0.0 0.0 1.0 0.15 0.03 0.0 0.03 0.03 0.42 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.04 0.03 0.04 0.0 0.02 0.0
0.03 0.1 0.01 0.01 0.02 0.02 0.35 0.1 0.07 1.0 0.08 0.91 0.04 0.75 0.09 0.04 0.03 0.04 0.03 0.05 0.08 0.07 0.02 0.02 0.15 0.06 0.08 0.05 0.25 0.23 0.09 0.06 0.23
0.12 0.07 0.1 0.11 0.14 0.15 0.13 0.26 0.23 1.0 0.0 0.07 0.0 0.39 0.04 0.05 0.02 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.22 0.04 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.03 0.12
0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.01 0.0 0.37 0.16 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.15 0.01 0.02 0.02 0.0 0.05 0.08 0.04 1.0 0.06 0.06 0.01 0.04 0.04 0.05 0.01 0.05 0.04 0.04 0.05 0.06 0.01 0.0 0.03 0.05 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.05 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.0 0.42 0.19 1.0 0.0 0.13 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.15 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.02
0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.12 0.42 0.02 0.09 1.0 0.21 0.96 0.48 0.75 0.09 0.04 0.04 0.19 0.09 0.2 0.34 0.28 0.15 0.22 0.43 0.02 0.03 0.03 0.02 0.06 0.05 0.01 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.14 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03
0.11 0.08 0.17 0.28 0.22 0.17 0.19 0.23 0.33 1.0 0.21 0.19 0.07 0.26 0.3 0.31 0.06 0.2 0.23 0.31 0.25 0.06 0.02 0.09 0.14 0.13 0.11 0.1 0.09 0.08 0.1 0.08 0.1
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.14 0.11 0.24 1.0 0.1 0.43 0.07 0.19 0.03 0.01 0.19 0.02 0.02 0.03 0.02 0.2 0.06 0.06 0.07 0.05 0.07 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.13
0.12 0.35 0.1 0.16 0.14 0.16 0.36 0.21 0.2 1.0 0.04 0.04 0.0 0.04 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.11 0.16 0.15 0.39 0.05 0.2 0.19 1.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04
0.02 0.04 0.04 0.09 0.1 0.21 0.16 0.17 0.1 1.0 0.04 0.16 0.06 0.08 0.04 0.07 0.02 0.08 0.09 0.06 0.11 0.02 0.03 0.05 0.05 0.06 0.05 0.05 0.04 0.04 0.04 0.05 0.05
0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.07 0.0 0.33 0.17 1.0 0.19 0.06 0.0 0.05 0.07 0.33 0.03 0.16 0.11 0.07 0.13 0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.16 0.1 0.08 0.17 0.18 0.08
0.0 0.01 0.08 0.15 0.11 0.11 0.03 0.22 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.19 0.07 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.04 0.06 0.11 0.33 0.01 0.22 0.25 1.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.06 0.15 0.12 0.08 0.07 0.18 0.22 1.0 0.01 0.1 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.05 0.02 0.01 0.02
0.1 0.07 0.05 0.03 0.06 0.11 0.04 0.25 0.15 1.0 0.06 0.04 0.0 0.24 0.0 0.09 0.01 0.06 0.03 0.03 0.02 0.06 0.0 0.36 0.01 0.02 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.08 0.15 0.12 0.12 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.01 0.11 0.08 0.06 0.14 0.2 0.14 0.17 0.14 1.0 0.15 0.11 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.23 0.03 0.05 0.07 0.0 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)