Heatmap: Cluster_250 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.05 -0.03 -0.36 -0.43 0.42 0.54 -0.6 -0.32 0.2 -0.13 0.08 -1.06 -1.19 -0.33 -0.2 -0.28 0.37 0.25 0.08 -0.0 0.04 -0.79 -0.4 -1.35 -0.74 0.26 0.64 -0.12 0.38 0.67 0.41 0.65 0.42
0.74 0.41 0.97 0.85 0.35 0.34 0.05 1.27 1.23 2.01 -1.61 -2.0 -1.8 -2.32 - -3.41 0.41 - -2.35 - -2.38 -0.11 -3.44 0.98 -2.28 2.12 1.57 - -2.36 -2.99 -5.41 -3.38 -4.26
- - - -4.8 - - - -0.36 - - - - 0.75 1.22 - - 2.69 - - - - -3.2 -0.9 -1.77 - 3.34 3.41 - - - - - -
-0.03 0.31 0.14 0.38 0.36 0.76 -0.91 0.8 1.1 1.51 -0.52 -0.64 -2.08 -0.08 -0.63 -0.23 -0.3 -0.04 -0.07 0.01 -0.84 -1.1 -2.85 -1.2 -0.59 0.64 0.74 -1.03 -0.3 0.17 -0.16 -1.12 0.14
-0.29 -0.03 -0.5 0.19 0.37 1.35 0.44 -0.81 -1.44 -0.61 -1.03 -0.04 -0.57 0.16 0.12 -1.67 0.34 -0.36 -0.72 -2.07 -1.61 0.18 -0.38 -1.04 0.08 1.15 1.01 0.13 0.15 0.16 0.37 -0.06 0.51
-0.4 -0.21 -0.18 0.35 -0.15 0.55 -1.44 1.06 1.54 1.06 -1.15 -1.37 -3.61 -0.6 -0.69 -1.75 0.38 1.01 -1.34 0.07 -0.72 -1.67 -1.43 -1.73 -0.91 1.34 1.28 -0.57 -0.09 -0.41 -0.74 0.07 0.07
1.27 0.18 0.91 0.57 1.24 2.3 -3.66 0.44 1.61 0.96 -2.67 - - -1.64 - - -0.65 - - - - - - -2.89 - 1.57 2.06 -0.11 -0.52 -0.4 -0.69 -2.62 -0.29
0.11 -0.27 0.21 0.3 0.61 1.27 -0.41 0.58 0.61 0.73 -0.24 -0.07 -1.28 -0.04 -0.13 -0.57 -0.07 -0.1 -0.46 -0.26 -0.31 -0.34 -0.86 -1.05 -0.8 0.42 0.55 -0.39 -0.14 -0.08 -0.26 -0.47 -0.08
-0.42 -0.83 0.05 -0.12 0.25 0.46 -0.02 -1.17 -1.51 -2.27 0.19 -2.22 -0.74 -0.66 -0.8 -0.17 0.66 1.34 1.0 0.26 0.61 -0.8 -0.57 -0.52 0.0 1.2 1.21 -0.35 -0.1 -0.22 -0.43 -0.68 -0.32
-0.18 -0.4 -0.82 -0.83 0.11 0.72 0.26 -0.88 -1.0 0.1 0.14 0.61 -0.35 0.04 0.4 0.2 -0.17 0.28 -0.19 0.23 0.05 0.11 0.23 0.09 0.45 0.7 0.75 -0.83 -0.55 -0.41 -1.03 -0.93 0.13
-0.59 -0.61 -0.66 0.18 0.33 1.16 -0.35 0.19 -0.07 -0.22 -0.66 0.54 -0.97 -0.05 -1.22 -0.43 -0.28 -0.81 -0.87 -0.86 -1.07 0.55 0.16 -0.98 -0.29 0.6 0.56 -0.58 0.54 0.89 -0.87 -0.7 1.55
0.76 0.49 0.5 0.09 0.08 0.53 0.75 -0.1 0.17 -2.27 0.2 0.14 -0.54 0.65 0.3 -0.36 0.85 0.13 -0.15 0.01 0.19 0.25 -1.26 -3.29 -1.55 1.2 1.29 -1.95 -1.67 -1.36 -2.25 -2.59 -1.43
-0.25 -0.41 -0.39 -0.25 -0.24 0.36 -0.71 -0.29 -0.37 -0.27 -0.25 -0.49 -0.64 -0.06 0.32 0.06 -0.0 0.43 0.04 -0.11 -0.4 -0.35 -0.55 -0.66 -0.67 0.69 0.79 0.25 0.56 0.51 0.11 0.18 0.81
-0.79 -0.81 -0.5 -0.6 0.82 0.22 -0.17 -0.29 -1.04 -0.84 -0.84 0.37 -0.4 0.3 0.96 -0.92 0.08 -1.07 -0.83 -0.37 -0.31 0.36 0.02 -0.04 -0.48 0.96 1.16 0.28 -0.02 0.17 0.13 -0.02 0.32
0.12 0.21 0.72 0.9 0.47 1.36 -0.77 0.58 0.18 2.1 -0.6 -0.69 -1.19 -1.58 0.17 -0.81 -0.22 -0.09 -0.58 -0.62 -0.57 -1.09 -0.69 -1.44 0.01 -0.01 0.31 -1.31 -0.85 -0.56 -0.8 -0.63 -0.49
-0.83 -0.25 -0.29 -0.49 -0.05 0.46 1.02 -1.42 -0.83 -0.33 1.21 -0.46 -1.65 0.08 -0.24 1.1 -0.87 1.19 0.77 1.01 0.94 -1.7 -4.26 -2.42 -1.42 1.24 1.23 -1.08 -1.4 -1.72 -1.34 -1.47 -0.85
0.04 -0.2 0.38 0.44 0.24 1.01 -0.54 0.87 0.54 1.44 -0.25 -0.19 -1.39 -0.43 0.08 -1.17 -1.05 -0.62 -1.03 -0.63 -0.63 -0.91 -1.43 -1.56 -1.6 0.87 0.77 -0.44 0.37 0.12 -0.11 -0.09 0.31
-0.1 -0.12 -0.41 -0.45 -0.42 0.13 -0.05 -0.6 -0.73 0.62 0.11 0.1 0.02 -0.21 -0.33 -0.17 -0.26 -0.07 0.03 -0.35 0.13 -0.16 -0.29 -0.13 -0.58 0.51 0.71 -0.21 0.52 0.62 -0.14 0.22 0.47
0.31 0.01 0.14 0.38 0.16 1.6 1.27 -0.24 -0.66 1.78 -0.49 0.56 -1.29 -0.42 -1.32 -1.91 -0.69 -1.11 -1.19 -0.62 -1.01 -0.49 -1.09 -1.81 -0.81 0.73 0.73 -0.73 -0.34 -0.1 -0.41 -0.42 0.03
- - - - - - -4.66 - - - -0.43 -1.32 1.75 -1.32 - -0.73 1.41 1.08 -0.86 -3.73 -1.12 0.05 1.49 0.11 2.15 1.98 2.14 0.4 -3.48 -4.64 -2.21 1.05 -2.62
-0.59 -0.78 -0.49 -0.22 -0.08 0.86 0.8 -0.27 -0.44 0.65 0.16 0.95 -1.14 0.31 -0.07 -1.84 -0.46 -0.56 -0.74 -0.21 -0.84 0.13 0.03 -1.62 -0.16 0.47 0.83 -0.07 0.69 0.72 -0.06 -0.2 -0.76
0.15 -0.02 0.02 0.04 0.21 1.01 -0.3 0.79 0.85 0.91 -0.96 0.41 -2.68 0.29 0.18 -0.97 -2.08 -0.41 -1.2 -0.62 -0.85 -0.24 -1.26 -2.34 -1.18 0.81 0.75 0.06 0.18 0.21 -0.03 -0.16 0.52
0.16 0.22 0.22 0.72 0.66 1.41 -0.01 0.89 0.69 1.41 -0.18 -0.3 -1.98 -0.16 0.03 -1.37 0.17 0.07 -0.79 -0.27 -0.39 -0.58 -1.16 -3.05 -0.7 0.13 0.59 -0.95 -0.67 -0.62 -0.83 -1.0 -0.7
0.31 -0.32 0.18 -0.06 0.64 0.16 -0.94 1.31 1.22 0.91 -2.56 1.04 -2.75 0.87 -3.08 -3.05 -1.11 - -5.7 -2.59 -2.64 0.18 1.06 0.74 -1.34 1.17 0.23 -1.94 -0.34 -0.96 -1.89 -2.21 1.57
0.13 0.04 -0.07 0.13 0.29 0.69 0.04 0.06 -0.04 -0.24 -0.24 -0.04 -0.62 -0.2 0.16 -0.47 0.26 -0.16 -0.39 -0.79 -0.61 0.08 0.27 -0.27 -0.32 0.92 0.92 -0.68 0.08 0.05 -0.5 -0.69 0.16
0.31 -0.34 0.69 0.48 0.33 0.54 -1.83 -0.14 -0.17 0.05 0.37 -1.43 -0.66 -1.11 -1.02 0.03 0.48 0.46 -0.01 -0.06 0.26 -1.58 -1.16 -2.04 -0.46 0.2 0.25 0.34 0.68 0.49 0.11 0.03 0.56
0.26 -0.3 0.28 0.11 0.02 0.64 -0.08 0.82 -0.06 0.9 0.22 -0.1 -1.38 -0.35 -0.35 -0.26 -0.01 0.44 0.06 0.33 0.25 -0.23 -0.52 -2.75 -0.1 0.6 0.53 -0.96 -0.74 -0.04 -0.6 -0.86 -0.04
-0.47 -1.01 0.1 0.58 0.55 1.87 0.0 -0.0 0.04 1.1 -0.27 0.39 -1.16 0.32 -0.22 -0.66 -1.06 -0.57 -0.35 -0.44 -0.35 -0.62 -1.01 -0.66 -1.03 0.37 0.44 0.11 -0.46 -0.21 -0.2 -0.44 -0.09
-0.54 -1.54 0.15 0.17 0.17 1.08 -1.21 0.02 0.22 0.88 1.47 0.22 -1.3 0.03 -0.76 -0.04 -0.5 0.9 0.63 0.21 0.65 -3.0 -5.07 -5.2 -0.84 1.49 1.44 -1.88 -2.16 -1.89 -1.27 -1.09 -1.43
-1.83 -2.01 -0.07 0.31 0.32 0.73 -0.85 -0.78 -1.28 0.02 0.96 0.54 -0.74 0.46 -0.71 -0.78 0.0 1.03 1.01 0.04 0.65 -0.21 -0.2 -0.68 -0.07 1.22 1.09 -1.74 -0.92 -0.67 -1.83 -1.58 -0.41
-0.03 -0.16 0.23 0.65 0.27 0.67 -0.73 0.61 0.62 0.95 0.15 -1.24 -1.02 -1.61 -0.77 -0.38 0.27 -0.26 -0.04 -0.21 -0.13 -1.02 -0.79 -1.18 -0.92 0.08 0.43 -0.09 0.3 0.52 0.16 0.02 0.39
0.03 -0.49 0.6 -0.38 0.17 0.29 -0.93 1.14 1.6 0.84 -0.13 -0.76 -3.21 -1.78 -1.78 -1.27 0.64 -0.37 -1.38 -0.65 -0.73 -1.46 -0.87 -1.27 -1.14 1.22 1.2 -0.85 -0.38 0.05 0.91 -0.33 0.13
0.04 0.33 -0.51 -0.1 0.01 0.97 0.09 0.89 1.32 1.13 -2.27 0.56 -3.69 0.55 -2.99 -3.63 -3.49 -2.91 -2.9 -3.28 -3.04 -0.34 -1.01 -1.96 -2.55 1.54 1.14 -0.41 1.16 0.91 -0.24 -0.93 0.53
-0.4 -0.38 0.0 0.81 0.66 1.13 0.56 -0.11 -0.52 0.26 -0.96 0.59 -1.22 -0.02 -0.44 -0.88 -0.09 -1.33 -2.02 -1.5 -1.58 0.3 0.32 -0.67 -0.16 1.43 1.53 -0.8 -0.38 -0.28 -1.03 -0.96 -0.12
0.33 -0.19 0.19 0.37 0.37 0.47 -1.49 0.13 -0.27 -0.43 0.41 -1.56 -1.46 -1.37 -1.05 -0.53 0.73 0.64 0.37 0.17 0.43 -1.72 -1.33 -2.79 -0.94 0.22 0.34 0.28 0.54 0.46 0.41 0.45 0.69
-0.45 -0.57 -0.48 -0.24 0.01 0.32 0.05 -0.74 -0.74 -0.36 0.31 0.19 -0.31 0.13 0.73 0.31 0.18 0.5 0.03 0.15 0.09 -0.16 -0.56 -0.32 0.32 0.78 0.66 -0.32 -0.17 -0.44 -0.38 -0.17 -0.29
0.08 0.52 0.17 0.37 -0.38 -0.24 -1.14 0.7 -2.04 -0.14 -1.1 -0.86 -1.71 -0.38 -0.55 -3.64 0.08 -3.48 -3.58 -0.33 -0.92 -2.26 0.32 -1.35 -1.35 1.56 1.87 0.73 0.57 0.58 0.59 0.52 0.47
-0.21 0.22 -0.4 -0.57 -0.55 0.35 0.35 -0.41 -0.77 -0.0 -0.16 -0.05 -0.51 0.15 -0.93 0.44 0.04 -0.04 -0.61 -0.65 -0.48 -0.31 0.05 -1.65 0.12 0.56 0.71 -0.17 0.78 0.81 -0.01 -0.26 0.92
0.12 0.0 0.79 0.52 -0.09 0.59 -2.68 0.43 -0.18 1.19 0.13 -1.2 -0.38 -1.63 -0.54 -0.72 -0.71 -0.11 0.65 0.36 0.52 -1.46 -2.6 -2.36 -0.11 1.63 1.67 -1.4 -1.02 -0.86 -1.03 -1.42 -0.57
-0.48 -0.47 -0.46 0.22 0.06 0.94 -0.17 0.74 0.25 1.08 -0.05 -0.37 -1.28 -0.17 0.2 -0.43 -0.11 -0.33 -0.36 0.13 -0.22 -0.56 -0.73 -1.04 -0.71 0.9 1.09 -0.37 -0.21 -0.16 -0.27 -0.42 -0.06
0.34 0.14 0.29 0.5 0.2 -0.18 -0.38 0.72 0.95 0.47 -1.74 -1.39 0.02 -0.36 -0.26 -1.14 -0.01 -0.85 -0.53 -0.09 0.08 -0.56 0.53 -0.08 -0.03 1.02 0.95 -1.02 -0.47 -0.2 -0.81 -0.36 -0.33
1.43 0.67 1.51 0.64 0.39 0.9 -1.2 0.61 0.14 0.46 -2.54 -1.26 -2.0 -2.22 -2.28 -1.43 -0.89 -3.63 -1.51 -1.92 -1.65 -1.26 -0.89 -1.34 -1.67 1.61 1.64 0.15 0.14 -0.16 -0.01 -0.19 -0.59
-0.11 0.29 0.17 0.12 0.54 1.22 -0.11 0.94 0.77 1.61 -0.95 -0.39 -1.18 -0.53 0.04 -0.89 -0.06 -0.1 -0.6 -0.21 -0.53 -0.51 -0.63 -1.65 -0.88 0.08 0.35 -0.81 -0.34 -0.05 -0.48 -0.74 -0.01
0.27 -0.75 -0.64 -1.08 0.45 0.32 -2.14 -0.14 -0.32 0.09 -0.53 - -1.77 -0.37 -0.69 -2.78 0.04 -0.62 0.08 -0.79 -0.76 -0.94 -0.82 -2.95 -2.66 1.33 1.75 0.9 1.16 0.97 0.27 0.45 1.1
-0.12 0.12 -0.35 -0.1 0.05 0.69 0.23 -0.13 -0.06 -0.13 -0.07 0.06 -1.27 0.41 0.18 -0.16 -0.41 0.24 0.01 -0.16 0.12 -0.3 -0.4 -0.27 -0.7 0.89 0.87 -0.46 -0.3 -0.04 -0.28 -0.25 0.13
0.35 0.16 0.2 -0.04 0.42 0.85 -0.07 0.49 0.69 0.01 -0.24 0.55 -2.73 -0.25 0.69 -0.51 -0.47 -0.02 -0.69 0.18 -0.75 -0.81 -0.17 -3.4 -0.85 0.42 0.68 -0.31 0.03 -0.01 0.07 -0.18 -0.18
-0.08 -0.01 -0.5 -0.79 -0.27 -0.33 -0.06 -0.02 -0.4 -0.43 0.57 0.36 0.03 0.28 -0.85 0.1 -0.05 0.3 -0.07 -0.23 -0.15 0.12 0.27 -1.61 -0.1 0.58 0.63 -0.18 0.46 0.45 -0.19 -0.6 0.49
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-1.91 -2.54 -3.8 - -3.99 -1.89 -2.7 - -2.5 - 0.61 -1.68 -2.73 1.23 -0.35 - 1.81 -0.28 0.1 0.55 -2.74 0.12 - -2.93 - 2.92 2.34 0.13 -0.68 0.55 -0.88 0.31 -0.18
0.41 0.22 0.22 0.32 0.24 0.7 -1.41 0.2 0.66 0.75 0.25 -1.19 -1.81 -1.81 0.96 -0.32 -0.55 0.53 0.19 0.48 0.24 -1.05 -1.31 -1.53 -1.52 0.57 0.74 -0.23 -0.42 -0.09 -0.22 -0.23 -0.48
0.19 0.07 -0.03 -0.04 0.08 1.02 -0.45 -0.44 -0.55 0.9 0.6 0.46 -0.11 -0.35 -1.55 -0.25 0.1 0.23 -0.07 -0.03 0.15 -1.01 -0.74 -3.25 0.59 1.17 1.11 -1.31 -0.82 -0.36 -0.82 -0.87 -0.48
-1.62 -2.04 -0.4 0.41 0.38 0.54 -1.19 0.11 0.16 0.68 0.47 0.55 -2.05 -0.28 -0.04 -1.28 -0.37 -0.31 0.01 -0.39 -0.42 -0.09 -0.21 -0.93 -0.55 1.47 1.63 -0.25 -0.73 0.08 -0.39 -0.16 -0.11
0.6 0.22 0.51 0.09 0.6 1.14 -0.82 1.16 0.71 1.31 -2.25 -1.37 -1.75 -1.4 -0.94 -2.3 -0.74 -1.83 -1.98 -1.73 -1.91 -1.12 -0.95 -1.88 -2.25 1.07 1.11 0.05 0.49 0.62 0.45 0.09 0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.