Heatmap: Cluster_492 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.1 0.01 0.01 0.01 0.64 0.1 0.34 0.12 0.61 0.71 0.45 0.6 0.96 0.94 1.0 0.09 0.12 0.07 0.32 0.13 0.14 0.05 0.1 0.13 0.07 0.1 0.14
0.06 0.1 0.05 0.06 0.05 0.03 0.22 0.04 0.02 0.04 0.79 0.18 0.55 0.26 0.64 0.82 0.69 1.0 0.99 0.85 0.79 0.36 0.32 0.3 0.47 0.52 0.53 0.43 0.79 0.9 0.54 0.48 0.65
0.14 0.14 0.1 0.13 0.1 0.08 0.24 0.09 0.06 0.12 0.6 0.32 0.67 0.33 0.58 0.93 0.52 0.75 1.0 0.76 0.89 0.38 0.52 0.47 0.44 0.37 0.37 0.36 0.35 0.37 0.38 0.39 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.01 0.18 0.02 0.48 0.65 0.41 0.62 1.0 0.74 0.87 0.04 0.06 0.0 0.13 0.08 0.11 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.07
0.06 0.09 0.04 0.04 0.07 0.03 0.14 0.07 0.1 0.05 0.73 0.22 0.74 0.24 0.42 1.0 0.39 0.69 0.85 0.76 0.76 0.27 0.35 0.18 0.37 0.17 0.17 0.15 0.22 0.24 0.2 0.17 0.22
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.06 0.94 0.31 0.5 0.28 0.64 0.93 0.55 0.93 1.0 0.83 0.94 0.22 0.22 0.12 0.47 0.45 0.49 0.56 0.54 0.58 0.5 0.54 0.43
0.04 0.11 0.01 0.02 0.01 0.01 0.61 0.0 0.0 0.01 0.7 0.67 0.81 0.74 0.75 0.62 0.8 0.54 0.76 0.64 0.7 0.56 0.71 0.78 0.55 0.56 0.58 0.86 0.95 1.0 0.98 0.97 0.99
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.49 0.09 0.34 0.11 0.3 0.77 0.42 0.46 1.0 0.91 0.92 0.1 0.17 0.14 0.21 0.17 0.17 0.1 0.11 0.15 0.16 0.16 0.15
0.14 0.1 0.08 0.06 0.11 0.06 0.27 0.11 0.12 0.11 0.5 0.58 0.53 0.45 0.6 0.68 0.56 0.38 0.74 0.5 0.66 0.34 0.57 0.16 0.48 0.6 0.62 0.82 0.79 0.67 1.0 0.76 0.75
0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.25 0.03 0.02 0.01 0.77 0.39 0.7 0.42 0.32 0.76 0.45 0.37 1.0 1.0 0.97 0.35 0.46 0.52 0.31 0.27 0.33 0.47 0.46 0.58 0.45 0.37 0.46
0.03 0.04 0.03 0.05 0.06 0.05 0.18 0.03 0.02 0.03 0.86 0.26 0.75 0.25 0.39 0.75 0.55 0.66 1.0 0.81 0.89 0.24 0.3 0.27 0.31 0.31 0.35 0.44 0.5 0.5 0.49 0.46 0.5
0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.1 0.01 0.01 0.01 0.6 0.24 0.32 0.29 0.39 0.68 0.53 0.78 0.97 0.88 1.0 0.24 0.17 0.16 0.38 0.26 0.31 0.13 0.14 0.14 0.11 0.11 0.15
0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.07 0.74 0.08 0.46 0.04 0.08 0.55 0.63 0.59 1.0 0.56 0.71 0.04 0.13 0.07 0.36 0.3 0.3 0.08 0.11 0.13 0.07 0.08 0.18
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.7 0.1 0.36 0.11 0.49 0.63 0.5 0.56 0.89 1.0 0.91 0.06 0.15 0.04 0.3 0.22 0.21 0.02 0.03 0.05 0.04 0.05 0.02
0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.56 0.09 0.12 0.18 0.31 0.77 0.47 0.5 0.64 0.89 1.0 0.12 0.09 0.11 0.22 0.24 0.23 0.16 0.19 0.19 0.13 0.12 0.27
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.15 0.02 0.01 0.02 0.5 0.18 0.29 0.25 0.54 0.72 0.52 0.49 0.85 1.0 0.78 0.18 0.36 0.07 0.28 0.4 0.36 0.25 0.31 0.41 0.33 0.33 0.4
0.18 0.29 0.1 0.14 0.14 0.17 0.6 0.14 0.13 0.24 0.66 0.71 0.63 0.43 0.59 0.72 0.72 0.55 0.82 0.93 0.9 0.41 0.74 0.56 0.56 0.67 0.6 0.85 0.93 0.87 0.9 1.0 0.87
0.06 0.06 0.03 0.04 0.05 0.09 0.01 0.03 0.11 0.08 0.68 0.06 0.23 0.16 0.13 1.0 0.28 0.85 0.31 0.54 0.33 0.15 0.19 0.05 0.25 0.09 0.09 0.05 0.02 0.04 0.07 0.07 0.1
0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.76 0.07 1.0 0.07 0.36 0.99 0.6 0.75 0.91 0.8 0.83 0.12 0.15 0.07 0.48 0.18 0.25 0.03 0.04 0.07 0.04 0.05 0.06
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.81 0.24 0.82 0.2 0.37 0.78 0.48 0.78 1.0 0.98 0.99 0.16 0.16 0.22 0.46 0.34 0.35 0.23 0.31 0.35 0.33 0.35 0.32
0.17 0.16 0.14 0.13 0.15 0.12 0.2 0.16 0.14 0.16 0.74 0.3 0.71 0.31 0.59 0.79 0.61 0.8 0.97 0.79 1.0 0.34 0.41 0.36 0.47 0.32 0.35 0.6 0.59 0.62 0.61 0.56 0.61
0.09 0.07 0.06 0.06 0.07 0.07 0.15 0.07 0.06 0.06 0.73 0.19 0.27 0.18 0.54 0.77 0.44 0.66 0.92 0.92 1.0 0.17 0.21 0.1 0.32 0.32 0.33 0.23 0.27 0.3 0.28 0.32 0.33
0.05 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.17 0.02 0.04 0.01 0.83 0.17 0.65 0.4 0.29 0.83 0.61 0.92 1.0 0.79 0.9 0.24 0.31 0.34 0.42 0.33 0.35 0.44 0.5 0.47 0.37 0.4 0.52
0.07 0.06 0.03 0.02 0.02 0.03 0.15 0.02 0.02 0.03 0.79 0.21 0.33 0.2 0.26 0.95 0.47 0.79 1.0 0.86 0.96 0.18 0.36 0.19 0.27 0.37 0.36 0.4 0.48 0.52 0.42 0.4 0.5
0.1 0.09 0.09 0.08 0.11 0.1 0.16 0.09 0.12 0.04 0.74 0.19 0.62 0.16 0.23 0.71 0.64 0.92 1.0 0.93 0.99 0.23 0.25 0.22 0.33 0.37 0.43 0.55 0.67 0.59 0.63 0.65 0.56
0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.32 0.0 0.01 0.0 0.47 0.35 0.44 0.38 0.46 1.0 0.31 0.58 0.69 0.74 0.65 0.39 0.36 0.37 0.33 0.15 0.17 0.32 0.43 0.41 0.32 0.3 0.4
0.06 0.06 0.05 0.04 0.06 0.07 0.32 0.03 0.03 0.02 0.75 0.54 0.72 0.36 0.72 0.89 0.67 0.82 0.94 0.93 1.0 0.42 0.58 0.52 0.6 0.47 0.53 0.64 0.77 0.89 0.75 0.74 0.83
0.07 0.08 0.07 0.06 0.07 0.13 0.19 0.08 0.08 0.09 0.7 0.22 0.25 0.22 0.6 0.5 0.33 0.89 0.89 1.0 0.98 0.2 0.21 0.25 0.31 0.2 0.24 0.17 0.19 0.22 0.19 0.19 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.4 0.06 0.16 0.09 0.11 1.0 0.21 0.67 0.21 0.72 0.42 0.12 0.21 0.07 0.3 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.06 0.05
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.56 0.01 0.01 0.01 0.85 0.58 0.59 0.53 0.61 0.85 0.61 0.66 1.0 0.97 0.95 0.51 0.69 0.34 0.57 0.35 0.36 0.52 0.61 0.72 0.53 0.47 0.56
0.06 0.05 0.05 0.06 0.05 0.1 0.06 0.06 0.07 0.08 0.82 0.22 0.58 0.17 0.36 0.54 0.49 1.0 0.86 0.88 0.91 0.14 0.19 0.18 0.5 0.42 0.46 0.27 0.33 0.34 0.38 0.42 0.35
0.12 0.15 0.09 0.08 0.08 0.16 0.08 0.18 0.2 0.24 0.85 0.23 0.62 0.17 0.36 0.72 0.55 1.0 0.83 0.81 0.95 0.17 0.24 0.17 0.58 0.25 0.29 0.13 0.15 0.18 0.13 0.13 0.2
0.04 0.05 0.04 0.02 0.05 0.02 0.57 0.01 0.02 0.0 0.53 0.41 0.63 0.66 0.44 0.57 0.67 0.43 1.0 0.73 0.75 0.52 0.69 0.44 0.39 0.49 0.52 0.59 0.89 0.79 0.68 0.53 0.73
0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.04 0.39 0.06 0.07 0.05 0.69 0.64 0.66 0.55 0.61 0.92 0.46 0.76 0.88 1.0 0.9 0.35 0.43 0.64 0.4 0.27 0.29 0.44 0.58 0.66 0.44 0.5 0.67
0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.13 0.03 0.01 0.01 0.67 0.16 0.52 0.11 0.58 0.73 0.53 0.75 0.99 1.0 1.0 0.22 0.27 0.12 0.21 0.3 0.36 0.29 0.39 0.44 0.33 0.35 0.39
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.02 0.43 0.07 0.41 0.8 0.62 1.0 0.92 0.87 1.0 0.02 0.06 0.0 0.39 0.02 0.04 0.11 0.07 0.08 0.07 0.09 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.49 0.15 0.37 0.1 0.33 0.72 0.46 0.59 0.96 0.77 1.0 0.17 0.08 0.12 0.29 0.12 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.05 0.02 0.04 0.03 0.77 0.11 0.78 0.07 0.23 0.87 0.4 0.75 1.0 0.67 0.83 0.09 0.09 0.15 0.3 0.14 0.17 0.07 0.07 0.1 0.07 0.08 0.07
0.1 0.09 0.09 0.11 0.09 0.06 0.55 0.0 0.09 0.03 0.44 0.61 0.83 0.97 0.35 0.76 0.74 0.69 1.0 0.74 0.87 0.61 0.93 0.66 0.6 0.66 0.65 0.79 0.98 0.82 0.68 0.51 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.05 0.57 0.05 0.2 1.0 0.51 0.71 0.9 0.78 0.75 0.02 0.06 0.06 0.34 0.11 0.13 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02
0.09 0.07 0.07 0.05 0.07 0.07 0.35 0.05 0.05 0.05 0.68 0.41 0.79 0.39 0.3 0.97 0.61 0.74 1.0 0.71 0.89 0.39 0.56 0.44 0.58 0.47 0.47 0.51 0.58 0.56 0.52 0.55 0.64
0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.66 0.09 0.64 0.08 0.3 1.0 0.45 0.66 0.91 0.71 0.76 0.09 0.21 0.15 0.19 0.14 0.16 0.16 0.19 0.22 0.18 0.18 0.2
0.12 0.12 0.06 0.04 0.05 0.03 0.2 0.04 0.05 0.04 0.76 0.35 0.73 0.46 0.65 0.96 0.54 0.79 1.0 0.97 0.94 0.41 0.57 0.54 0.39 0.45 0.46 0.57 0.71 0.71 0.63 0.55 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.36 0.0 0.3 0.0 0.01 0.54 0.42 0.49 1.0 0.44 0.89 0.0 0.2 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.19 0.1 0.08 0.05 0.11 0.1 0.34 0.09 0.07 0.06 0.56 0.33 0.43 0.39 0.53 1.0 0.26 0.64 0.72 0.71 0.78 0.32 0.27 0.38 0.29 0.16 0.15 0.24 0.32 0.31 0.29 0.29 0.33
0.06 0.05 0.06 0.02 0.08 0.05 0.17 0.05 0.06 0.13 0.56 0.28 0.52 0.42 0.28 0.54 0.54 0.95 1.0 0.72 0.9 0.22 0.46 0.21 0.36 0.26 0.29 0.36 0.41 0.51 0.42 0.36 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.71 0.09 0.39 0.18 0.12 1.0 0.25 0.75 0.33 0.59 0.39 0.18 0.2 0.08 0.24 0.07 0.08 0.03 0.01 0.02 0.04 0.05 0.06
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.11 0.0 0.01 0.01 0.64 0.17 0.57 0.16 0.26 1.0 0.27 0.51 0.76 0.65 0.62 0.17 0.19 0.19 0.22 0.06 0.07 0.18 0.27 0.32 0.21 0.2 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.44 0.38 0.48 0.32 0.67 0.42 0.36 0.34 0.81 1.0 0.8 0.32 0.48 0.34 0.38 0.26 0.23 0.4 0.35 0.48 0.37 0.42 0.49
0.15 0.11 0.1 0.16 0.16 0.14 0.35 0.22 0.15 0.12 0.63 0.56 0.6 0.35 0.81 0.6 0.68 0.89 0.97 1.0 0.81 0.48 0.69 0.45 0.7 0.44 0.48 0.62 0.72 0.77 0.64 0.68 0.76
0.08 0.08 0.02 0.02 0.03 0.09 0.17 0.02 0.06 0.03 0.56 0.24 0.51 0.35 0.12 0.59 0.38 0.54 1.0 0.89 0.71 0.33 0.16 0.26 0.28 0.19 0.21 0.33 0.37 0.44 0.32 0.27 0.41
0.06 0.1 0.06 0.06 0.06 0.05 0.29 0.04 0.05 0.02 0.59 0.32 0.85 0.31 0.59 0.76 0.75 0.63 0.95 0.92 0.91 0.52 0.63 0.65 0.34 0.59 0.6 0.91 0.94 0.96 0.98 0.98 1.0
0.16 0.11 0.11 0.07 0.07 0.11 0.23 0.11 0.07 0.08 0.77 0.25 0.79 0.27 0.3 0.8 0.52 0.73 1.0 0.79 0.86 0.27 0.47 0.34 0.39 0.26 0.32 0.42 0.59 0.61 0.48 0.49 0.52
0.05 0.03 0.03 0.02 0.02 0.04 0.53 0.05 0.02 0.01 0.62 0.6 0.65 0.43 0.66 1.0 0.61 0.93 0.98 0.67 1.0 0.4 0.65 0.53 0.48 0.31 0.37 0.56 0.67 0.72 0.55 0.62 0.86
0.05 0.03 0.06 0.05 0.09 0.04 0.3 0.03 0.02 0.02 0.72 0.26 0.87 0.26 0.38 1.0 0.66 0.72 1.0 0.74 0.88 0.27 0.42 0.43 0.36 0.37 0.35 0.22 0.21 0.23 0.25 0.3 0.25
0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.01 0.01 0.02 0.63 0.18 0.54 0.16 0.26 0.71 0.45 0.69 1.0 0.9 0.92 0.19 0.2 0.2 0.25 0.29 0.31 0.47 0.52 0.51 0.5 0.48 0.61
0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.13 0.01 0.01 0.01 0.53 0.14 1.0 0.21 0.24 0.59 0.48 0.51 0.75 0.62 0.67 0.2 0.26 0.13 0.39 0.16 0.22 0.11 0.15 0.21 0.16 0.15 0.15
0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.12 0.04 0.12 0.73 0.08 0.69 0.02 0.2 1.0 0.49 0.8 0.9 0.94 0.84 0.12 0.05 0.06 0.83 0.06 0.05 0.05 0.04 0.03 0.04 0.06 0.09
0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.15 0.02 0.03 0.05 0.62 0.24 0.34 0.2 0.48 0.69 0.43 0.91 0.86 0.96 1.0 0.16 0.19 0.3 0.21 0.22 0.29 0.21 0.24 0.27 0.22 0.21 0.31
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.62 0.11 0.77 0.12 0.37 0.9 0.43 0.67 1.0 0.72 0.83 0.12 0.18 0.13 0.27 0.23 0.24 0.19 0.22 0.31 0.24 0.23 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.04 0.34 0.07 0.17 0.34 0.42 0.57 0.69 0.66 1.0 0.0 0.03 0.0 0.29 0.03 0.04 0.08 0.09 0.04 0.06 0.09 0.06
0.04 0.03 0.07 0.07 0.12 0.11 0.19 0.07 0.05 0.04 0.9 0.39 0.53 0.22 0.57 0.58 0.68 0.99 0.82 0.73 0.97 0.33 0.27 0.42 0.5 0.59 0.59 0.82 0.8 0.99 0.75 0.89 1.0
0.11 0.09 0.05 0.06 0.05 0.04 0.15 0.04 0.04 0.04 0.82 0.15 0.42 0.17 0.7 0.76 0.53 0.74 1.0 0.79 0.85 0.18 0.23 0.12 0.31 0.41 0.42 0.41 0.46 0.5 0.44 0.42 0.47
0.05 0.05 0.04 0.04 0.04 0.09 0.06 0.05 0.05 0.06 0.73 0.16 0.6 0.12 0.43 0.61 0.55 0.8 1.0 0.76 0.98 0.12 0.17 0.13 0.33 0.25 0.27 0.26 0.32 0.44 0.34 0.37 0.39
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.66 0.25 0.38 0.3 0.65 0.93 0.55 0.67 0.95 1.0 0.93 0.18 0.23 0.18 0.3 0.31 0.33 0.27 0.34 0.36 0.34 0.35 0.34
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.01 0.0 0.69 0.19 0.67 0.45 0.18 0.9 0.34 0.57 1.0 0.92 0.93 0.22 0.23 0.17 0.24 0.13 0.15 0.2 0.26 0.27 0.22 0.26 0.2
0.05 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.03 0.01 0.02 0.56 0.14 1.0 0.14 0.35 0.97 0.44 0.63 0.62 0.58 0.59 0.17 0.17 0.18 0.5 0.26 0.28 0.09 0.1 0.15 0.11 0.14 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.6 0.14 0.53 0.17 0.25 1.0 0.49 0.57 0.86 0.67 0.79 0.14 0.17 0.15 0.27 0.19 0.22 0.11 0.17 0.17 0.14 0.15 0.18
0.06 0.05 0.06 0.03 0.05 0.06 0.08 0.08 0.07 0.05 0.82 0.16 0.96 0.21 0.58 0.82 0.72 0.83 0.95 0.92 1.0 0.21 0.28 0.2 0.45 0.37 0.44 0.12 0.15 0.19 0.14 0.15 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.54 0.53 0.55 0.37 0.58 0.77 0.66 0.64 1.0 0.99 0.89 0.37 0.65 0.65 0.37 0.29 0.32 0.47 0.48 0.68 0.47 0.53 0.74

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)