Heatmap: Cluster_485 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.3 0.03 0.04 0.05 1.0 0.81 0.05 0.7 0.56 0.85 0.62 0.06 0.06 0.41 0.03 0.07 0.07 0.2 0.11 0.12 0.16 0.18 0.13
0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.04 0.01 0.12 0.0 1.0 0.4 0.01 0.01 0.13 0.05 0.17 0.02 0.0 0.08 0.02 0.02 0.01 0.15 0.22 0.22 0.13 0.17 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.35 0.01 1.0 0.66 0.01 0.15 0.09 0.18 0.26 0.02 0.01 0.01 0.19 0.0 0.0 0.12 0.02 0.01 0.15 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.04 0.03 0.15 1.0 0.92 0.18 0.68 0.87 0.64 0.91 0.03 0.06 0.03 0.09 0.01 0.02 0.18 0.03 0.0 0.17 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.07 0.0 1.0 0.27 0.22 0.14 0.23 0.16 0.17 0.02 0.1 0.0 0.16 0.01 0.01 0.24 0.02 0.0 0.21 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.35 0.07 0.25 0.02 1.0 0.44 0.11 0.4 0.33 0.32 0.45 0.05 0.04 0.14 0.35 0.11 0.12 0.49 0.16 0.14 0.42 0.47 0.1
0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.27 0.31 0.18 0.02 0.81 1.0 0.09 0.28 0.39 0.32 0.41 0.28 0.06 0.01 0.3 0.14 0.15 0.07 0.04 0.05 0.11 0.11 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.05 0.01 0.94 1.0 0.0 0.32 0.27 0.3 0.28 0.01 0.0 0.0 0.07 0.03 0.03 0.06 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.15 0.05 1.0 0.31 0.04 0.11 0.12 0.13 0.17 0.05 0.08 0.06 0.23 0.07 0.07 0.18 0.15 0.08 0.21 0.09 0.13
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.13 0.35 0.92 0.52 0.03 0.65 0.65 0.75 0.66 0.08 0.2 0.03 0.32 0.2 0.2 0.36 0.12 0.06 0.29 0.37 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.15 0.0 1.0 0.44 0.02 0.23 0.18 0.24 0.26 0.06 0.02 0.04 0.0 0.05 0.03 0.32 0.1 0.04 0.18 0.1 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.25 0.11 0.14 0.02 0.88 1.0 0.04 0.3 0.47 0.38 0.37 0.01 0.01 0.0 0.12 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.07 0.1 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.11 0.0 0.7 1.0 0.03 0.18 0.26 0.26 0.27 0.02 0.01 0.0 0.18 0.02 0.03 0.13 0.03 0.02 0.19 0.17 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.26 0.11 0.17 0.0 0.97 1.0 0.01 0.42 0.66 0.34 0.53 0.02 0.0 0.0 0.05 0.07 0.07 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01
0.08 0.08 0.11 0.15 0.11 0.17 0.13 0.08 0.08 0.17 0.09 0.16 0.13 0.16 1.0 0.1 0.27 0.06 0.07 0.06 0.09 0.19 0.1 0.04 0.15 0.15 0.18 0.17 0.13 0.2 0.2 0.2 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.03 0.01 0.84 1.0 0.02 0.34 0.43 0.42 0.38 0.02 0.02 0.0 0.02 0.03 0.03 0.08 0.09 0.05 0.07 0.05 0.08
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.06 1.0 0.05 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.09 0.04 0.03 0.02 0.07 0.07 0.05 0.08 0.11 0.11 0.05 0.08
0.03 0.02 0.1 0.11 0.08 0.05 0.04 0.08 0.04 0.07 1.0 0.28 0.7 0.17 0.27 0.81 0.15 0.54 0.36 0.35 0.31 0.36 0.44 0.21 0.8 0.19 0.16 0.3 0.39 0.37 0.33 0.35 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.68 0.06 0.36 0.9 0.18 0.52 0.41 0.49 0.41 0.1 0.13 0.06 0.51 0.02 0.03 0.17 0.14 0.22 0.18 0.2 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.16 0.15 0.01 0.48 1.0 0.01 0.11 0.26 0.14 0.14 0.17 0.02 0.03 0.2 0.07 0.07 0.12 0.08 0.06 0.11 0.15 0.09
0.02 0.07 0.06 0.06 0.09 0.06 0.06 0.03 0.02 0.01 0.82 0.42 0.2 0.31 0.93 1.0 0.08 0.54 0.46 0.52 0.48 0.25 0.08 0.1 0.3 0.15 0.15 0.54 0.17 0.1 0.34 0.45 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.2 0.23 0.57 0.92 0.09 0.84 0.97 0.91 0.8 0.09 0.14 0.02 0.12 0.06 0.1 0.19 0.05 0.09 0.35 0.38 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.89 1.0 0.01 0.37 0.69 0.33 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.15 0.23 0.14 0.82 0.69 0.11 0.71 0.87 1.0 0.85 0.16 0.07 0.08 0.12 0.08 0.13 0.02 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.02 0.0 0.53 1.0 0.04 0.26 0.52 0.27 0.35 0.02 0.04 0.0 0.17 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.03 0.33 0.0 0.93 1.0 0.02 0.36 0.22 0.2 0.27 0.01 0.03 0.01 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.06 0.05 0.12 0.31 0.67 0.12 0.73 1.0 0.92 0.98 0.07 0.02 0.04 0.07 0.29 0.26 0.4 0.13 0.09 0.43 0.4 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.01 0.22 0.0 0.46 1.0 0.02 0.45 0.27 0.22 0.28 0.02 0.0 0.02 0.2 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.18 0.05 0.47 1.0 0.01 0.29 0.36 0.37 0.24 0.06 0.09 0.2 0.25 0.08 0.09 0.18 0.19 0.14 0.15 0.09 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.03 0.07 0.0 0.83 1.0 0.03 0.44 0.53 0.56 0.54 0.19 0.09 0.0 0.1 0.1 0.06 0.12 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.09 0.0 0.26 1.0 0.02 0.28 0.37 0.15 0.25 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.02 0.19 0.01 0.0 0.17 0.15 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.94 0.4 0.06 0.16 0.86 1.0 0.08 0.53 0.88 0.67 0.62 0.15 0.04 0.01 0.18 0.04 0.07 0.13 0.15 0.18 0.23 0.24 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.11 0.0 0.95 1.0 0.03 0.2 0.31 0.31 0.33 0.02 0.0 0.0 0.14 0.03 0.04 0.2 0.03 0.03 0.24 0.26 0.04
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.23 0.0 0.87 1.0 0.08 0.24 0.26 0.28 0.31 0.01 0.03 0.0 0.21 0.02 0.02 0.2 0.01 0.0 0.35 0.03 0.02
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.07 0.04 0.03 0.01 0.67 0.22 0.07 0.03 0.69 1.0 0.04 0.33 0.68 0.33 0.56 0.05 0.03 0.16 0.06 0.03 0.04 0.26 0.14 0.15 0.26 0.34 0.05
0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.08 0.02 0.02 0.05 0.36 0.2 0.14 0.14 1.0 0.75 0.05 0.37 0.46 0.47 0.51 0.34 0.1 0.08 0.2 0.08 0.07 0.42 0.05 0.03 0.36 0.25 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.1 0.37 0.11 1.0 0.31 0.15 0.39 0.37 0.34 0.39 0.23 0.18 0.08 0.49 0.07 0.06 0.27 0.11 0.09 0.25 0.19 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.05 0.13 0.01 1.0 0.76 0.04 0.35 0.45 0.35 0.57 0.01 0.09 0.0 0.26 0.03 0.04 0.18 0.05 0.01 0.48 0.18 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.1 0.01 1.0 0.16 0.02 0.09 0.08 0.05 0.08 0.03 0.01 0.01 0.11 0.04 0.04 0.09 0.2 0.13 0.08 0.04 0.03
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 1.0 0.04 0.01 0.03 0.03 0.03 0.02 0.07 0.0 0.02 0.01 0.07 0.06 0.06 0.09 0.13 0.15 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01 0.25 0.0 0.83 1.0 0.05 0.21 0.38 0.25 0.28 0.0 0.03 0.0 0.26 0.01 0.02 0.11 0.02 0.0 0.12 0.02 0.01
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.44 0.05 0.39 0.16 1.0 0.54 0.13 0.17 0.43 0.15 0.56 0.11 0.04 0.09 0.39 0.14 0.21 0.61 0.19 0.14 0.48 0.5 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.05 0.25 0.11 1.0 0.37 0.08 0.13 0.33 0.27 0.42 0.01 0.05 0.02 0.32 0.11 0.1 0.29 0.07 0.15 0.21 0.24 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.44 0.0 0.7 1.0 0.01 0.0 0.2 0.25 0.26 0.04 0.06 0.0 0.21 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.05 0.03 1.0 0.33 0.13 0.25 0.27 0.34 0.34 0.02 0.05 0.02 0.13 0.01 0.0 0.18 0.01 0.0 0.18 0.08 0.0
0.08 0.06 0.09 0.1 0.15 0.19 0.23 0.06 0.05 0.05 0.45 0.4 0.4 0.27 1.0 0.73 0.36 0.55 0.42 0.29 0.42 0.71 0.47 0.39 0.54 0.25 0.25 0.62 0.24 0.22 0.52 0.55 0.31
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.03 0.0 1.0 0.3 0.02 0.25 0.3 0.23 0.33 0.0 0.04 0.01 0.05 0.12 0.12 0.38 0.29 0.14 0.28 0.25 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.25 0.06 0.8 0.62 0.11 0.54 0.43 0.38 0.56 0.03 0.02 0.0 0.28 0.06 0.05 0.19 0.12 0.18 0.33 0.28 0.14
0.02 0.01 0.04 0.06 0.09 0.05 0.1 0.21 0.21 0.29 0.85 0.87 0.05 0.57 0.94 0.69 0.12 1.0 0.97 0.87 0.74 0.14 0.22 0.04 0.08 0.38 0.46 0.61 0.44 0.1 0.51 0.26 0.05
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.19 0.0 1.0 0.28 0.18 0.32 0.34 0.43 0.24 0.06 0.01 0.11 0.2 0.25 0.3 0.57 0.28 0.23 0.59 0.57 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.02 0.0 0.94 1.0 0.01 0.74 0.64 0.19 0.42 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.12 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.04 0.07 0.02 0.02 0.07 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.23 0.0 1.0 0.71 0.04 0.54 0.35 0.33 0.28 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.48 0.0 0.83 1.0 0.03 0.45 0.19 0.07 0.15 0.04 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.01 0.0 0.92 1.0 0.02 0.34 0.58 0.7 0.6 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.03 0.14 0.12 0.08 0.12 0.08 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)